3TXEA

Hewl co-crystallization with carboplatin in aqueous media with paratone as the cryoprotectant
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Experience with exchange and archiving of raw data: comparison of data from two diffractometers and four software packages on a series of lysozyme crystals.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3txeA00
1DI4A 2G4QA 3D9AC 2FYDA 1B0DA 1LZNA 4GCCA 1B7QA 1TDYA 1IY3A 2MECA 1DI5A 1LTMA 4RDSA 1B5XA 2MEIA 4NWEA 2I25L 4MSTA 2BQDA 1YKYX 4ETEA 1HEQA 1LSEA 4FDYA 1IOQA 1VDQA 5KXSA 5LYMA 1IX0A 1GE4A 208LA 4O34A 1NMMA 1GXXA 1GFGA 1VEDA 1LCNA 1CJ6A 1Z55A 1LMNA 1JKCA 1JKAA 2BPUA 1LMCA 2H9KA 1GB3A 1ZVHL 1NDMC 3A67Y 2DQDY 4P2EA 4TX7A 3WUNA 5KXTA 4KT3A 5HNCA 1QSAA 2DQCY 4H8ZA 1I1ZA 4H1PA 5B1FA 4R0FA 3WUMA 4DD9A 2XBSA 4H91A 1GAYA 1IOTA 3TXEA 5KXLA 3A3QA 5KXRA 1I56A 1I20A 1NF5A 4AGAA 1GF8A 5KJ9A 1T3PA 1GB2A 4GCDA 1QDRA 3B72A 1AM7A 3LYMA 1JJ1A 1JPOA 1IC5Y 4HTQA 3TMWA 1IWYA 1EQEA 1REZA 4HV1A 5I53A 4GCEA 1UIAA 5DM9A 5FHWA 4XN6A 3W6CA 4DT3A 5JENB 5KKJA 4HV2A 1IOCA 3W6BA 5I4WA 2HU3A 1VDPA 3G3AB 1RCMA 2BLYA 4J1AA 1UC0A 4UWUA 1G7JC 4Z41A 1T6VL 4NFVA 3WL2A 1NKHA 1QTKA 1LZ5A 133LA 1IP5A 1ZVYB 2HEFA 4WL6A 3ULRA 3W6EA 1UUZC 4ZEEA 4CHXA 3B0OA 2ZNXY 1LJNA 4I8SA 3VWOA 4IATA 1JITA 3WPLA 3CT5A 4NSIA 3AGHA 3J4GA 1BWHA 1C46A 1KIQC 5F81A 1J1PY 1GB6A 207LA 2F4AA 4J7VA 5LXWA 4LYOA 1LYOA 1YKZX 2D6BA 1TBYA 1B7SA 2BQNA 1LSGA 3ATOA 4LT2A 4PJ2C 1IC7Y 4WLYA 3WMKA 1UICA 2W1MA 3G3BB 1JEFA 5KXWA 1LOZA 1F10A 4DDAA 3AB6A 1LJGA 4WM6A 1FLQA 2G4NA 2YDGA 4HSFA 2YBHA 1P2CC 3LN2A 2DBTA 1UIBA 5LA8A 1YILA 1D0LA 1XGUC 4QEQA 5KXOA 1JHLA 4NY5A 1F6RA 4N8ZA 4H93A 4LYMA 5KXZA 1IVMA 2VB1A 1GFKA 2YVBA 9LYZA 1LJ4A 1B7MA 1LJIA 1VATA 4NEBA 4WG7A 1IY4A 1LSPA 4YM8A 3EXDA 5APEA 3OJPA 4NGKA 5C6LA 4TSBA 1GBOA 1HFZA 5D5FA 1LHHA 4XJFA 5B1GA 1IR8A 1OQMA 4B49A 4RLNA 4NGYA 2BQHA 1KIRC 1LZ1A 2ZQ4A 1AT5A 3N9EA 4LGKA 1VFBC 1WTNA 1LZ8A 2N5ZA 3AW6A 3A96A 2Z12A 4GN3A 2MEHA 2G4PA 154LA 2BQBA 4LYTA 3AZ5A 3WU9A 4YEOA 4C3WA 4LFPA 4DD3A 3WPKA 5DLAA 3HBEX 2HECA 4B0DA 2HUBA 1CKHA 4XJHA 1GBZA 5DN5A 1WQQA 5B07A 3TXBA 4B4JA 2C8PA 5LVGA 3IJUA 3FI7A 3WU8A 2ZYCA 1OP9B 4WO9A 3RNXA 1BWJA 2BQMA 1HNLA 5DN4A 1DXJA 1GE1A 4M4OA 5IHGA 1GB7A 1LSBA 1LZGA 1GE0A 1XFPL 1RE2A 4LT0A 1FN5A 2MEGA 1REMA 1WQOA 1INUA 5A3ZA 3T6UA 5F9UA 1IP4A 1LKSA 2D4JA 1LZ4A 2EKSC 1FLUA 5AMYA 1V7TA 3CT0A 1RI8B 4PPOA 1KXXA 4WL7A 5I4XA 4WMGA 1FDLY 3P68A 4RW1A 1YAPA 3W6AA 1IEEA 2HEDA 2ZILA 4DD2A 4WLTA 4DD0A 1HMKA 1DKJA 4YENA 2Z2EA 3LYTA 4HJZA 4WO6A 1GF3A 4HP0A 4IASA 1JJ0A 2WARA 5E9RA 4BAFA 1IWTA 1YROA 1AZFA 1BWIA 4UWNA 1J1OY 1C45A 3CQLA 3W6FA 1LMOA 2Q0MX 1XEJA 5IELA 1YQVY 2BQOA 4QDNA 132LA 4NSGA 1W08A 1LZAA 4OOTA 4PHIA 5LVKA 3AZ7A 1NHEA 2HEAA 2MEDA 4NGVA 3LZTA 1B7LA 1G7HC 1OUEA 1QQYA 1JTOL 1GFAA 3AW7A 1B7PA 1KXYA 4NGWA 1GB9A 1D6QA 4KL7A 2PC2A 4B1AA 4M6DA 4DWXA 1LZTA 3A93A 1F0WA 1BB6A 1DPWA 5FELA 4G49A 4KPMA 193LA 1HFYA 4NHPA 2LYMA 3AGIA 1BVKC 4YOPA 4J0LA 1XGPC 3RT5X 4QY9A 1PS5A 1W6ZA 4CGEA 4OWAA 1HSWA 1GBXA 1LMAA 1WVVA 3E3DA 1QUSA 4ETAA 2LZTA 1GFEA 4NHTA 1IORA 3TMXA 1HELA 4H9HA 1BHZA 3HBDA 5LAGA 1NDGC 1LSYA 1F6SA 1FBIX 1LSFA 4WM4A 1PZYA 1HEPA 1LZSA 2LHMA 3GXKA 1IWXA 2DQGY 3N9CA 3N9AA 1LKRA 4GCBA 4DDCA 1IWUA 2IHLA 1A4VA 1LJEA 4ANRA 1HEOA 6LYZA 1DQJC 1KXWA 2MEFA 1A2YC 1ALCA 1FKQA 1TEWA 2ZYPA 4NGIA 1GAZA 2Z2FA 4OW1A 3K3TA 4TUNA 5D5CA 1B5YA 4U3XB 1JSEA 4DD7A 2ZIKA 5C6JA 1RFPA 3FE0A 1IP2A 4QGZA 2ZIJA 4ETBA 3TXJA 3P66A 2H5ZA 2Z37A 4PRQA 4WM5A 1BQLY 5F16A 2W1LA 1C43A 2BQAA 1GPQC 1CJ8A 3EMSA 1LSAA 1WTMA 4H9FA 4PRUA 1OUJA 1LZBA 1LYYA 1QTEA 5LIOA 5L3IA 3J6KA 1GE3A 2HTXA 1LSZA 3EBAB 4EMNA 4LFXA 1JJ3A 1YANA 4RW2A 3TXGA 4KXIA 1GB5A 1LJKA 4LYZA 1GFTA 4N9RA 2D4KA 3AGGG 4H9CA 1XEIA 4NWHA 1HEWA 2XJWA 1HHLA 1V7SA 1IOSA 2MEBA 1CKCA 4NHSA 1GHLA 3RU5A 1D6PA 4NGOA 4E3UA 1GF0A 4DD1A 5F9XA 4Z3MA 5LINA 1YL0X 1GWDA 3P65A 2DQJY 1UBZA 3BKVA 2F30A 2HEEA 2F2NA 1JSFA 1WQRA 5FCPA 3M3UA 3HBHA 1HENA 3TXIA 1GB8A 1GBSA 1MELL 1LAAA 1LMQA 2CJLA 4XYYA 3CT1A 3GXRA 4H8YA 2DQFC 4DC4A 1REXA 1IO5A 5L3HA 4D9ZA 1B2KA 1HMLA 1YAOA 4GLAA 2GV0A 1GFJA 3EO5A 4TTDA 1SQ2L 3MGWA 1TAYA 1EL1A 5I4YA 2HU1A 1B7RA 1LZCA 2HEBA 1LZ9A 1B9OA 1OUCA 2BQJA 2LYOA 2W1XA 2YBNA 1XGRC 3SP3A 3AZ6A 2XTHA 4BS7A 1GBWA 1LZDA 4GN4A 3TMVA 4X3BA 5C6IA 1GFUA 1WVUA 1YL1X 4OWHA 4TSCA 3A6BY 2CGIA 5LVIA 1DZBX 3WULA 5II3A 4XENA 1CNSA 2RSCA 1HERA 2X0AA 5ILCA 1QDTA 4G4HA 1LSCA 1EQ5A 4WG1A 3ZVQB 1JKDA 1CKDA 1LMTA 1DI3A 5FEKA 3WW6A 4LYCA 2XBRA 1CKGA 1E8LA 4XJBA 5B05A 1UIGA 1CJ7A 4BAPA 3A3RX 4NGJA 3A8ZA 2F4GA 4OWBA 1LPIA 3CB7A 5DL9A 3W3EA 5I54A 4LT1A 4R6CA 1IP1A 1NBYC 1B5ZA 1REYA 2BQFA 1JISA 2D91A 1IC4Y 4YEMA 5KXMA 3A90A 1UIHA 1B7OA 1LHIA 1GF6A 2BQIA 1GE2A 1G7LC 1TCYA 4Z98A 1GD6A 1YAQA 5FDJA 1DPXA 2B5ZA 1UIDA 5FSTA 5IDDA 3IJVA 1JIYA 1G7MC 1XGQC 4H9EA 1SLYA 3F6ZA 4ML7A 1QSWA 4L41A 2LYZA 4LYBA 1O23A 194LA 4NG1A 5HMVA 1B5WA 1JUGA 3ZEKA 3BKHA 1HSXA 1GEVA 5LVHA 1H6MA 2FBBA 2EPEA 1G7IC 4H94A 5HQ1A 1GFHA 1HFXA 5LYZA 3OK0A 2YBIA 3WVXA 3ZVQA 1UCOA 4GLVA 1WQPA 4II8A 2FBDA 4B4IA 2H9JA 3HFMY 2DQIY 3AYQA 3A95A 8LYZA 4HTKA 3TMUA 3M18B 1GDWA 2ZQ3A 1UACY 2CWIA 1IP6A 4NGZA 1LHMA 4HJVA 1LMPA 4XJGA 2BQKA 4PGJB 3LHMA 1WQMA 5KXNA 1MLCE 4GN5C 1BB5A 4NHQA 3TXHA 4CFPA 1HC0A 4NIJA 1WQNA 1FLYA 5B06A 1IIZA 3TXKA 1BGIA 5EBHA 2DKVA 3CSQA 1AT6A 1LZEA 1JWRA 4N5RA 4H9BA 3RZ4A 134LA 1LHLA 135LA 1BB7A 4HJYA 5APCA 4EOFA 1IP3A 1OUGA 2BAAA 2I26L 3LZ2A 4H9IA 4MR1A 1LHKA 5LA5A 1QUTA 1ZV5L 5KXPA 1LZ6A 2Z19A 1N4FA 2I6ZA 4N1EI 4J1BA 1BB3A 1QIOA 4NSJA 1DKKA 1UIEA 2MEAA 5KXYA 3P4ZA 5KXXA 1XGTC 1D9UA 4DYGA 2MEEA 1GF7A 4AXTA 4OOOA 2C8OA 1C10A 1LJ3A 4A7DA 2YSSC 2A7DA 2Y8PA 2YBMA 3WU7A 4YF2A 4ZFPA 5ILFA 4XJIA 153LA 5F14A 1BB4A 4ET9A 1GB0A 1IWVA 1FLWA 4H9AA 5LAFA 4TWSA 4LT3A 3LYZA 2A7FA 1YAMA 4B4EA 1OUDA 1OUHA 5HNLA 1OUFA 3CSZA 4G4CA 2IFFY 3A34A 1LHJA 2BQCA 4IJ4A 1LZYA 1YIKA 4DDBA 2W1YA 1HF4A 4WM1A 2BQGA 5B59A 4OWCA 6LYTA 5APDA 2FYCA 4LZTA 4C5FA 4N1CC 4H90A 1D0KA 1CKFA 1UA6Y 4FJRA 4MCKA 4WM2A 1GXV2 2DQEY 1C08C 3T36A 1VAUA 4ZIXA 1LJFA 1NQIA 3AJNA 4NG8A 3A92A 7LYZA 5HMJA 4G4BA 2D4IA 1FKVA 5A3EA 1GBYA 2DQAA 1B5UA 3B0IA 3LYOA 5HLLA 5K7OA 3AZ4A 3WW5A 5L9JA 3ATNA 4CJ2A 2BQLA 2BQEA 1HEMA 3QNGA 1B5VA 1IR9A 2ZWBA 1OUIA 1JTTL 1NBZC 3A94A 1GEZA 4WM3A 2Z38A 4WOAA 3W6DA 4W94A 3WVYA 5LVJA 5T3FA 3P64A 4CFOA 2ZNWY 4I0CA 4Z46A 2NWDX 1EQ4A 1XSFA 1LSNA 2YBLA 3QY4A 1IWZA 1GF9A 4WLDA 1KIPC 1GF5A 3B0KA 4HPEA 5KXKA 3WUAA 4OWEA 1C7PA 1NWGA 2BLXA 4H8XA 4ET8A 4NSHA 3WXTA 1H87A 1YKXX 4XJDA 5E4PA 5LYTA 4ETCA 3TXFA 4HPIA 3WXUA 3KAMA 2EIZC 4NHIA 1GDXA 3IWRA 1AKIA 5APFA 4G9SA 2Z18A 3QE8A 1B7NA 1JTPL 1GFVA 1ZMYL 1OUAA 3A91A 2DQHY 4H92A 3WYHA 3WH1A 1GFRA 1XEKA 4HTNA 4XADA 3WPJA 1CJ9A 1BVXA 1IR7A 1J1XY 5KY1A 1IP7A 5KKIA 2LZ2A 1LSMA 1LJJA 4WLXA 4BADA 3B6LA 4N0JA 4W96A 1VDTA 1LSDA 1RJCB 3A6CY 1LYSA 3CSRA 3RW8A 1JKBA 1LJHA 4ETDA 1GF4A 2AUBA 2CDSA 2YBJA 1IWWA 1OUBA 1VDSA 1LZRA 2Z39A 5M1YA 1UIFA 2EQLA 3D3DA 5I5QA 5J7CA 3TXDA 1LYZA 4NGLA 1D0MA 4UWVA 4RLMA 4GCFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2RBOA 3D9AC 1B0DA 1D3NA 1IY3A 4I7KA 1LYGA 3SN6R 3DN1A 5LYMA 4O34A 1L70A 2O7AA 2H9KA 1GB3A 1ZVHL 1NDMC 1P2RA 4EXMA 1KW5A 5KXTA 1C63A 1QSAA 2DQCY 3DMXA 4H1PA 1QUHA 4EKPA 1CUPA 1PQOA 1GAYA 1IOTA 1PQIA 3B72A 1JJ1A 1P56A 1L81A 3W6CA 1G07A 4HV2A 229LA 2O79A 3GUOA 3OE9A 3W6BA 2HU3A 3DN2A 3G3AB 4UWUA 1G7JC 4NFVA 1QTKA 2HEFA 1CX6A 213LA 1LJNA 3CT5A 4I7JA 207LA 2F4AA 3ATOA 4WLYA 3GUPA 3G3BB 230LA 5KXWA 3AB6A 2G4NA 3HWLA 2YBHA 2DBTA 1XGUC 1L14A 1IVMA 109LA 1B7MA 4NEBA 1IY4A 1LSPA 4ZPUA 4TSBA 1LHHA 4NGYA 1SX7A 3G3VA 1LZ1A 231LA 2N5ZA 3AW6A 3A96A 4GN3A 2G4PA 3AZ5A 233LA 4YEOA 1L35A 3HBEX 2HECA 5B07A 237LA 1L36A 3IJUA 1TLAA 103LA 2BQMA 1LSBA 1XFPL 1FN5A 4DKLA 1INUA 3T6UA 1CU6A 1LZ4A 1KS3A 5I4XA 1YAPA 3W6AA 1IEEA 2ZILA 2O4WA 1DKJA 2Z2EA 1QUGA 4I7SA 4IASA 246LA 4BAFA 4ARQB 3CDOA 1L25A 1BWIA 4UWNA 1C6KA 3W6FA 1QT3A 1C6LA 1XEJA 4EKQA 104LA 1NHEA 1B7LA 1G7HC 1OUEA 1GB9A 4KL7A 4B1AA 1L55A 162LA 1DPWA 1ZURA 2CUUA 1HFYA 4NHPA 2RBNA 1XGPC 1W6ZA 1EPYA 4OWAA 3HT8A 1C6MA 143LA 1L85A 4ETAA 4NHTA 3TMXA 3HBDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1DI4 A;  2G4Q A;  3D9A C;  2FYD A;  1B0D A;  1LZN A;  4GCC A;  1B7Q A;  1TDY A;  1IY3 A;  2MEC A;  1DI5 A;  1LTM A;  4RDS A;  1B5X A;  2MEI A;  4NWE A;  2I25 L;  4MST A;  2BQD A;  1YKY X;  4ETE A;  1HEQ A;  1LSE A;  4FDY A;  1IOQ A;  1VDQ A;  5KXS A;  5LYM A;  1IX0 A;  1GE4 A;  208L A;  4O34 A;  1NMM A;  1GXX A;  1GFG A;  1VED A;  1LCN A;  1CJ6 A;  1Z55 A;  1LMN A;  1JKC A;  1JKA A;  2BPU A;  1LMC A;  2H9K A;  1GB3 A;  1ZVH L;  1NDM C;  3A67 Y;  2DQD Y;  4P2E A;  4TX7 A;  3WUN A;  5KXT A;  4KT3 A;  5HNC A;  1QSA A;  2DQC Y;  4H8Z A;  1I1Z A;  4H1P A;  5B1F A;  4R0F A;  3WUM A;  4DD9 A;  2XBS A;  4H91 A;  1GAY A;  1IOT A;  3TXE A;  5KXL A;  3A3Q A;  5KXR A;  1I56 A;  1I20 A;  1NF5 A;  4AGA A;  1GF8 A;  5KJ9 A;  1T3P A;  1GB2 A;  4GCD A;  1QDR A;  3B72 A;  1AM7 A;  3LYM A;  1JJ1 A;  1JPO A;  1IC5 Y;  4HTQ A;  3TMW A;  1IWY A;  1EQE A;  1REZ A;  4HV1 A;  5I53 A;  4GCE A;  1UIA A;  5DM9 A;  5FHW A;  4XN6 A;  3W6C A;  4DT3 A;  5JEN B;  5KKJ A;  4HV2 A;  1IOC A;  3W6B A;  5I4W A;  2HU3 A;  1VDP A; 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 3A92 A;  7LYZ A;  5HMJ A;  4G4B A;  2D4I A;  1FKV A;  5A3E A;  1GBY A;  2DQA A;  1B5U A;  3B0I A;  3LYO A;  5HLL A;  5K7O A;  3AZ4 A;  3WW5 A;  5L9J A;  3ATN A;  4CJ2 A;  2BQL A;  2BQE A;  1HEM A;  3QNG A;  1B5V A;  1IR9 A;  2ZWB A;  1OUI A;  1JTT L;  1NBZ C;  3A94 A;  1GEZ A;  4WM3 A;  2Z38 A;  4WOA A;  3W6D A;  4W94 A;  3WVY A;  5LVJ A;  5T3F A;  3P64 A;  4CFO A;  2ZNW Y;  4I0C A;  4Z46 A;  2NWD X;  1EQ4 A;  1XSF A;  1LSN A;  2YBL A;  3QY4 A;  1IWZ A;  1GF9 A;  4WLD A;  1KIP C;  1GF5 A;  3B0K A;  4HPE A;  5KXK A;  3WUA A;  4OWE A;  1C7P A;  1NWG A;  2BLX A;  4H8X A;  4ET8 A;  4NSH A;  3WXT A;  1H87 A;  1YKX X;  4XJD A;  5E4P A;  5LYT A;  4ETC A;  3TXF A;  4HPI A;  3WXU A;  3KAM A;  2EIZ C;  4NHI A;  1GDX A;  3IWR A;  1AKI A;  5APF A;  4G9S A;  2Z18 A;  3QE8 A;  1B7N A;  1JTP L;  1GFV A;  1ZMY L;  1OUA A;  3A91 A;  2DQH Y;  4H92 A;  3WYH A;  3WH1 A;  1GFR A;  1XEK A;  4HTN A;  4XAD A;  3WPJ A;  1CJ9 A;  1BVX A;  1IR7 A;  1J1X Y;  5KY1 A;  1IP7 A;  5KKI A;  2LZ2 A;  1LSM A;  1LJJ A;  4WLX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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