3W3EA

Structure of vigna unguiculata chitinase with regulation activity of the plant cell wall
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
242
structure length
242
Chain Sequence
AEVGSVIGASLFDQLLKHRNDQACEGKGFYSYNAFITAARSFAAFGTTGDSNTRKREVAAFLAQTSHETTGGAATSPDGPYAWGYCFVTERDKSNRYCDGSGPCSAGKSYYGRGPIQLTHNYNYNAAGRALGVDLINNPDLVARDAVVSFKTALWFWMTPQGNKPSCHDVITNRWTPSAADKAANRVPGFGVITNIINGGLECGKGPTPASGDRIGFYKRYCDVFGVSYGPNLNCRDQRPFG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Three-dimensional structure analysis of Vigna unguiculata chitinase with regulation activity of the yield threshold of cell wall
rcsb
molecule keywords Cotyledoneous yieldin-like protein
molecule tags Hydrolase
total genus 88
structure length 242
sequence length 242
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3w3eA01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 3w3eA02
4NGKA 4TUNA 1HMLA 1B7QA 1GFKA 4WG7A 3T36A 1GF9A 1WQPA 2FYCA 3WVYA 1UA6Y 3ATOA 2MEBA 4G49A 2B5ZA 4PGJB 4RW1A 4TSBA 1FLUA 4RLNA 4NHPA 1DI5A 2XBRA 1LZEA 3B0KA 4O34A 4NHTA 1WTMA 1UIBA 1GFTA 3EMSA 4ML7A 1TDYA 1YAQA 4WO6A 1AKIA 1LJKA 1GEVA 1LJGA 1WQNA 1T6VL 2CJLA 1CKHA 5FDJA 1IVMA 4NGVA 4N8ZA 1DPWA 1YL1X 4EOFA 154LA 4GCCA 3WW6A 2W1YA 1W08A 1UUZC 1AZFA 4PRUA 5F9UA 1SQ2L 4NSIA 5KXNA 1LZSA 3WVXA 1LHKA 4H92A 4H9CA 1BWIA 1DXJA 1LHLA 5I4WA 4H9IA 1VEDA 3WULA 2Z19A 1VDPA 3BKHA 1GFRA 4NGLA 3IJVA 1GF6A 2YBJA 1GDWA 1TAYA 1LKRA 3CSZA 1LZRA 4ZEEA 1IP6A 5KXOA 5B59A 1LMTA 4OOTA 1FDLY 4NG8A 4OWBA 2Z37A 1LJNA 1IORA 4H93A 1E8LA 1H87A 1IWVA 1GB2A 4NGJA 1LJ4A 2HEEA 1EL1A 1NHEA 1JTPL 1GB0A 5D5CA 3AB6A 3RW8A 4XJIA 5HNLA 4G4BA 4HV1A 1LSDA 4WLXA 3D9AC 1HEQA 1IO5A 4TSCA 1QSWA 2EPEA 2G4NA 3K3TA 5F14A 4LYCA 4N1CC 1IC7Y 4B1AA 6LYZA 1ZVHL 1GE1A 1BB6A 2XBSA 4RLMA 1NMMA 1RJCB 3TXFA 1LSBA 4GLVA 1WVVA 4H9FA 1IOSA 4G4CA 1JKAA 1UICA 1QUSA 1T3PA 2IHLA 3LZTA 3W6CA 4BAFA 4DD2A 1HELA 2HECA 4WL7A 4LT2A 4XJFA 1JISA 4WL6A 1IWXA 1HC0A 4C5FA 3IJUA 4LYBA 4OWEA 1GWDA 1J1PY 1LMAA 8LYZA 1JKBA 2DQAA 4HPIA 1C45A 1IP3A 1C08C 1GBYA 1HHLA 4FJRA 1IR7A 1GXXA 4H9HA 4H8ZA 1JSEA 4IJ4A 2BQDA 3N9CA 4U3XB 2BQIA 1LSCA 1LZBA 2MEGA 3WPJA 4NFVA 2RSCA 3ULRA 1LHHA 1PZYA 2MEDA 3LZ2A 2LYOA 4WM4A 4Z46A 3N9AA 4BADA 4OWHA 1B0DA 4GCDA 1IP7A 3M3UA 1REYA 1D0KA 1W6ZA 5C6IA 4ETCA 1ZVYB 2MEHA 3HFMY 4KT3A 4ZIXA 1LYSA 3AW7A 4NGZA 5HQ1A 1GPQC 2ZYCA 4HSFA 1C43A 1IWYA 1CJ6A 3MGWA 4NGIA 5EBHA 2FYDA 3A67Y 5L3HA 2D4IA 4MCKA 4BAPA 4PHIA 1XFPL 4NGWA 4XADA 4HTNA 4A7DA 1WQOA 1GE4A 4RW2A 3RT5X 3WXTA 1GE2A 3TXBA 4WM2A 4CFPA 1WQQA 5FCPA 2N5ZA 1OUCA 4NHIA 1YKXX 1HEWA 4H9EA 1P2CC 1NQIA 3T6UA 4X3BA 2FBDA 3AZ6A 1XEJA 5LAGA 1QDRA 2ZYPA 1XGPC 5HMJA 1GBXA 1CJ9A 3AGGG 4R0FA 2YBLA 4YF2A 2BAAA 4NGOA 1GB7A 1REMA 1LMQA 5KY1A 2HUBA 1H6MA 1LJJA 4D9ZA 4HJYA 4PJ2C 3WU8A 4GLAA 5HMVA 1JUGA 1LCNA 1AT5A 1VDTA 1WQRA 3ATNA 5I54A 5KXRA 1YIKA 1B5YA 2YBMA 3W6BA 1XGUC 1WQMA 1OUGA 5B1GA 1FKQA 1QTKA 1NBZC 3EBAB 4ETEA 1N4FA 1DI4A 1CJ8A 2NWDX 5APCA 1BGIA 1BQLY 1GB8A 1LSGA 1RCMA 2W1LA 3EO5A 3TXHA 4H9AA 3WPKA 1UCOA 4B4JA 2AUBA 1JITA 1QQYA 2Z12A 3LYZA 4GCEA 1FN5A 1ZMYL 4HPEA 1MLCE 5DN5A 4B4EA 3A92A 3TXDA 4II8A 2DQEY 1LZDA 2BQHA 1ALCA 4LYMA 5LA8A 3P68A 1C7PA 1HSXA 1LSMA 1LZTA 1UBZA 2C8PA 2Z2FA 1DKJA 208LA 3D3DA 3TXEA 1GBOA 3FE0A 3AYQA 3TXJA 2F4GA 2HEFA 4MSTA 4XENA 1BHZA 1LSNA 1IR8A 1F0WA 4LT1A 2MEAA 2BLYA 2BQCA 3TXIA 1BB4A 4ETDA 5LXWA 5KXLA 4ET8A 4H90A 4WO9A 3TMWA 1HNLA 1YANA 2BQMA 5FELA 1XSFA 1GF8A 2F30A 4LZTA 4NEBA 153LA 1KXXA 2YBIA 2A7DA 1TBYA 1GF3A 7LYZA 1HFZA 2ZIKA 4YEOA 1V7SA 1YAPA 4ANRA 4HJVA 4LT0A 1YKYX 4NWHA 2HEDA 3TMXA 1LOZA 4WMGA 3P4ZA 1WTNA 1C46A 1GF5A 1FLWA 2HTXA 1JKCA 2CWIA 1LTMA 1JKDA 3GXKA 1KXYA 1LZYA 1IR9A 4HTQA 4OOOA 1MELL 4HV2A 5T3FA 5I5QA 1G7MC 4NHQA 4AGAA 3A94A 1TEWA 2XJWA 5LVKA 4MR1A 5KKIA 5I4XA 3B6LA 5J7CA 3AGIA 3N9EA 5ILFA 4AXTA 3TXGA 1FBIX 5DM9A 5APDA 2GV0A 5A3EA 1DPXA 3A96A 4HTKA 1DKKA 1B7MA 1GFAA 4TX7A 1B7PA 3M18B 1F6RA 1LHJA 4TWSA 1GDXA 1JJ3A 3A6BY 193LA 2F4AA 1NDMC 3CQLA 1IP5A 4UWUA 5ILCA 4ET9A 5L9JA 132LA 5F81A 5FHWA 1LSZA 2LYZA 2G4PA 1D6PA 2CDSA 2DQGY 1YILA 1B5ZA 4DDCA 4L41A 1IWUA 4NGYA 4RDSA 4XN6A 1LSYA 3P64A 3CSQA 133LA 2Q0MX 3OJPA 5KXSA 1FLYA 1D9UA 3TMUA 5LVJA 1VDQA 1VDSA 2D91A 1Z55A 1LZ8A 1IP1A 1D0LA 5LYTA 3HBHA 1OUFA 2CGIA 1JTTL 1IC5Y 1GF0A 1LYYA 2ZNWY 3RU5A 4OWCA 5LINA 1XEIA 2YSSC 1LZCA 4NG1A 4UWVA 4W96A 1DZBX 3LYOA 1XGTC 5JENB 3B0IA 1LPIA 4GN3A 1PS5A 1LJHA 5B06A 3KAMA 3B72A 3CT1A 4WOAA 3QY4A 4GCFA 4IATA 1HSWA 4B4IA 1A4VA 5KKJA 4CFOA 1VFBC 1B2KA 5LYZA 3WMKA 2I26L 4DDBA 1LSFA 4J1AA 1JJ0A 4LFPA 2EQLA 1NF5A 1YL0X 1JSFA 1BB7A 1GBWA 1LKSA 1B5XA 2Z18A 3CB7A 4LYZA 1RE2A 1LMNA 3WYHA 1BVXA 2DQFC 4IASA 3WUAA 2BQAA 1LSEA 1OP9B 1LZ5A 4J1BA 4DD7A 3WH1A 2I25L 1A2YC 1GB6A 4EMNA 1EQ4A 1LMCA 3J4GA 1UIAA 1I20A 4DWXA 4CGEA 2H9JA 2DKVA 3AGHA 2W1MA 1GE0A 2WARA 4PPOA 2W1XA 2ZQ4A 1IOQA 1DQJC 3A3RX 3P66A 1QSAA 3A8ZA 5KXTA 2Y8PA 3VWOA 2BQGA 1LYOA 3QNGA 1V7TA 1GBSA 1OUJA 3W6DA 4H8XA 3G3AB 5DLAA 4PRQA 1INUA 3W6EA 2DQHY 2HU3A 5APFA 4TTDA 5KXPA 4Z41A 2XTHA 1LZ1A 3AJNA 5KXKA 1UIGA 1LJ3A 4H94A 1GFHA 3LYTA 1BWHA 1QIOA 4UWNA 4DYGA 2YDGA 1AT6A 1NDGC 2ZILA 4QDNA 2H9KA 5KXYA 1QTEA 4G9SA 1HEOA 4WLYA 2D4JA 5M1YA 1CKGA 4FDYA 2BQLA 2YBNA 4XJHA 207LA 1B7SA 1QDTA 1IWTA 1GXV2 2ZNXY 4KXIA 5FSTA 5IELA 2EKSC 3OK0A 4NSHA 1LYZA 3J6KA 6LYTA 5KXXA 4YEMA 4CHXA 3HBDA 4Z3MA 5C6JA 1YAMA 1CKDA 5A3ZA 2X0AA 1G7LC 2BQNA 4BS7A 3W6AA 1UACY 2BQJA 1LMOA 2LHMA 3LN2A 4DD0A 1LAAA 4J0LA 2DQIY 9LYZA 2DBTA 4H1PA 1IP4A 3CT5A 1DI3A 1OUDA 5B05A 5I4YA 1IP2A 3G3BB 2ZQ3A 4B0DA 3AZ4A 4GN5C 1KXWA 4NSGA 1LZNA 1OQMA 4W94A 4GCBA 4QGZA 3WPLA 1GD6A 5LAFA 1D0MA 5II3A 1GB9A 1LZGA 1UC0A 1HF4A 3BKVA 5C6LA 3AZ7A 1GB5A 1GFVA 4M6DA 1G7IC 134LA 1GFJA 1HMKA 1NWGA 1YKZX 3A3QA 2BQFA 3P65A 4WM6A 4XYYA 1REXA 3WU7A 4OWAA 1GFGA 1GF7A 2BQOA 4N5RA 1YROA 1IWWA 4GN4A 4KPMA 3WU9A 1TCYA 3IWRA 1LJFA 1NKHA 1LMPA 5LA5A 2DQDY 2MEIA 4I8SA 3F6ZA 1IIZA 1IX0A 3CSRA 1BB5A 5LVGA 1IEEA 2LYMA 4NSJA 4ETBA 1YAOA 2LZTA 5DN4A 2DQCY 1GEZA 1BVKC 4H9BA 4DD1A 5KXZA 1I1ZA 5AMYA 2BPUA 1FLQA 1GFUA 1JPOA 1RFPA 4B49A 5E4PA 4LFXA 3WW5A 4LYTA 4KL7A 1OUEA 4E3UA 1HFXA 2D6BA 4R6CA 3GXRA 1JIYA 4N1EI 2BQBA 4WLTA 4DD3A 4NWEA 3HBEX 3LHMA 2PC2A 1UIFA 3A95A 1HEMA 1B7LA 1BWJA 1LZ9A 5E9RA 2MEEA 5LVHA 1JEFA 1GAZA 1LSPA 1HEPA 2C8OA 1KIQC 3A93A 3A91A 4LT3A 4NHSA 5B07A 2LZ2A 3ZVQA 2YBHA 4WM5A 1OUAA 1GHLA 4WM1A 3EXDA 4M4OA 1B9OA 1GFEA 1UIDA 1IY3A 4Z98A 1RI8B 4YOPA 5F9XA 2BQKA 1OUHA 4N0JA 2Z38A 2Z39A 5LVIA 1LJIA 2IFFY 4XJDA 3WL2A 4DC4A 1IC4Y 5FEKA 2D4KA 4CJ2A 1SLYA 4XJGA 1GBZA 3SP3A 3WXUA 4OW1A 1GE3A 4ZFPA 2EIZC 3ZVQB 2Z2EA 1B7RA 1KIRC 3AW6A 2YVBA 3A90A 1I56A 1FKVA 2VB1A 4LYOA 1CJ7A 4H8YA 3ZEKA 5KXMA 1REZA 1NBYC 5LIOA 1JTOL 3QE8A 5DL9A 5K7OA 2FBBA 4N9RA 3RZ4A 1OUBA 1LZ6A 2MEFA 1JJ1A 3AZ5A 4H91A 1JWRA 1F10A 2F2NA 1QUTA 4YM8A 5IHGA 1XGQC 2H5ZA 1IOTA 194LA 1O23A 3WUNA 1LHMA 1XGRC 2BQEA 1CNSA 2DQJY 2HEAA 1CKCA 3W6FA 1JHLA 4YENA 135LA 1HENA 3A6CY 5IDDA 4DD9A 1LJEA 1ZV5L 1LZ4A 1LSAA 3B0OA 4G4HA 4WLDA 3LYMA 4XJBA 3W3EA 1IWZA 1UIHA 1VATA 3A34A 1KIPC 3WUMA 5D5FA 1YQVY 2A7FA 1C10A 4DDAA 1IOCA 4DT3A 1J1XY 1GAYA 5APEA 1LHIA 4WG1A 2ZIJA 4QEQA 3TMVA 2I6ZA 2HU1A 3TXKA 4C3WA 5L3IA 1CKFA 1J1OY 4NY5A 1OUIA 5KJ9A 4ETAA 1B7NA 5HNCA 1G7JC 1GB3A 1HFYA 3FI7A 1F6SA 3E3DA 2BLXA 1VAUA 1IY4A 2MECA 4HJZA 1EQ5A 1B5UA 5I53A 4LGKA 4NIJA 1GF4A 1B7OA 4QY9A 1B5VA 1B5WA 1G7HC 3CT0A 4HP0A 1D6QA 2G4QA 1LZAA 1XEKA 2HEBA 1UIEA 5B1FA 1BB3A 1EQEA 4I0CA 1HERA 1WVUA 4J7VA 4P2EA 1AM7A 5F16A 3RNXA 4WM3A 5HLLA 5KXWA 5LYMA 2ZWBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
235LA 1G0JA 147LA 183LA 1T8GA 1UA6Y 4TSBA 120LA 1KW7A 1LYEA 4ML7A 2RBNA 1YAQA 1L13A 1LJKA 1L31A 1WQNA 1L12A 151LA 3GUNA 1L99A 1YL1X 1SQ2L 5KXNA 3CDOA 1GF6A 1GDWA 4ZEEA 5KXOA 4OOTA 1LJNA 1IORA 1C6JA 107LA 1P2LA 3HH5A 3RW8A 1GB0A 4XJIA 4WLXA 178LA 2EPEA 3K3TA 4N1CC 1IC7Y 1L30A 1ZVHL 1IOSA 2IHLA 123LA 1D2WA 1P56A 1GWDA 1C45A 3OE0A 1P5CA 1GXXA 4IJ4A 1C6GA 125LA 1JSEA 3N9CA 4U3XB 1LZBA 3ULRA 1LHHA 2MEDA 3C7YA 2LYOA 4BADA 4OWHA 3M3UA 4ETCA 1REYA 1CUPA 1W6ZA 5C6IA 3GUKA 3HFMY 1L24A 5HQ1A 2ZYCA 1C43A 1IWYA 3MGWA 213LA 3A67Y 5L3HA 4PHIA 1L88A 3RT5X 3WXTA 1L47A 1L18A 3T6UA 233LA 4EJ4A 2BAAA 141LA 1REMA 4D9ZA 4GLAA 218LA 4EPIA 1LCNA 1AT5A 3ATNA 5I54A 1L80A 1DI4A 2NWDX 1RCMA 1BQLY 3EO5A 4B4JA 1KY1A 1QQYA 175LA 1MLCE 3TXDA 2DQEY 1ALCA 5LA8A 3P68A 4GBRB 3D3DA 1DKJA 1GBOA 3FE0A 3TXJA 2F4GA 2HEFA 4XENA 1L04A 1LSNA 1F0WA 5KXLA 2B6XA 2BQMA 1GF8A 1KXXA 7LYZA 1TBYA 140LA 1CU3A 1YKYX 2HEDA 3JR6A 1LOZA 4WMGA 3DN4A 3P4ZA 1C46A 1GF5A 1JKCA 1LZYA 1L33A 1TEWA 5LVKA 2B73A 1P46A 2Q9DA 2RBRA 2RAZX 3N9EA 5DM9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4NGK A;  4TUN A;  1HML A;  1B7Q A;  1GFK A;  4WG7 A;  3T36 A;  1GF9 A;  1WQP A;  2FYC A;  3WVY A;  1UA6 Y;  3ATO A;  2MEB A;  4G49 A;  2B5Z A;  4PGJ B;  4RW1 A;  4TSB A;  1FLU A;  4RLN A;  4NHP A;  1DI5 A;  2XBR A;  1LZE A;  3B0K A;  4O34 A;  4NHT A;  1WTM A;  1UIB A;  1GFT A;  3EMS A;  4ML7 A;  1TDY A;  1YAQ A;  4WO6 A;  1AKI A;  1LJK A;  1GEV A;  1LJG A;  1WQN A;  1T6V L;  2CJL A;  1CKH A;  5FDJ A;  1IVM A;  4NGV A;  4N8Z A;  1DPW A;  1YL1 X;  4EOF A;  154L A;  4GCC A;  3WW6 A;  2W1Y A;  1W08 A;  1UUZ C;  1AZF A;  4PRU A;  5F9U A;  1SQ2 L;  4NSI A;  5KXN A;  1LZS A;  3WVX A;  1LHK A;  4H92 A;  4H9C A;  1BWI A;  1DXJ A;  1LHL A;  5I4W A;  4H9I A;  1VED A;  3WUL A;  2Z19 A;  1VDP A;  3BKH A;  1GFR A;  4NGL A;  3IJV A;  1GF6 A;  2YBJ A;  1GDW A;  1TAY A;  1LKR A;  3CSZ A;  1LZR A;  4ZEE A;  1IP6 A;  5KXO A;  5B59 A;  1LMT A;  4OOT A;  1FDL Y;  4NG8 A;  4OWB A;  2Z37 A;  1LJN A;  1IOR A;  4H93 A;  1E8L A;  1H87 A;  1IWV A;  1GB2 A;  4NGJ A;  1LJ4 A;  2HEE A;  1EL1 A;  1NHE A;  1JTP L;  1GB0 A; 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 3ZVQ B;  2Z2E A;  1B7R A;  1KIR C;  3AW6 A;  2YVB A;  3A90 A;  1I56 A;  1FKV A;  2VB1 A;  4LYO A;  1CJ7 A;  4H8Y A;  3ZEK A;  5KXM A;  1REZ A;  1NBY C;  5LIO A;  1JTO L;  3QE8 A;  5DL9 A;  5K7O A;  2FBB A;  4N9R A;  3RZ4 A;  1OUB A;  1LZ6 A;  2MEF A;  1JJ1 A;  3AZ5 A;  4H91 A;  1JWR A;  1F10 A;  2F2N A;  1QUT A;  4YM8 A;  5IHG A;  1XGQ C;  2H5Z A;  1IOT A;  194L A;  1O23 A;  3WUN A;  1LHM A;  1XGR C;  2BQE A;  1CNS A;  2DQJ Y;  2HEA A;  1CKC A;  3W6F A;  1JHL A;  4YEN A;  135L A;  1HEN A;  3A6C Y;  5IDD A;  4DD9 A;  1LJE A;  1ZV5 L;  1LZ4 A;  1LSA A;  3B0O A;  4G4H A;  4WLD A;  3LYM A;  4XJB A;  3W3E A;  1IWZ A;  1UIH A;  1VAT A;  3A34 A;  1KIP C;  3WUM A;  5D5F A;  1YQV Y;  2A7F A;  1C10 A;  4DDA A;  1IOC A;  4DT3 A;  1J1X Y;  1GAY A;  5APE A;  1LHI A;  4WG1 A;  2ZIJ A;  4QEQ A;  3TMV A;  2I6Z A;  2HU1 A;  3TXK A;  4C3W A;  5L3I A;  1CKF A;  1J1O Y;  4NY5 A;  1OUI A;  5KJ9 A;  4ETA A;  1B7N A;  5HNC A;  1G7J C;  1GB3 A;  1HFY A;  3FI7 A;  1F6S A;  3E3D A;  2BLX A;  1VAU A;  1IY4 A;  2MEC A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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