3W3EA

Structure of vigna unguiculata chitinase with regulation activity of the plant cell wall
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
242
structure length
242
Chain Sequence
AEVGSVIGASLFDQLLKHRNDQACEGKGFYSYNAFITAARSFAAFGTTGDSNTRKREVAAFLAQTSHETTGGAATSPDGPYAWGYCFVTERDKSNRYCDGSGPCSAGKSYYGRGPIQLTHNYNYNAAGRALGVDLINNPDLVARDAVVSFKTALWFWMTPQGNKPSCHDVITNRWTPSAADKAANRVPGFGVITNIINGGLECGKGPTPASGDRIGFYKRYCDVFGVSYGPNLNCRDQRPFG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Three-dimensional structure analysis of Vigna unguiculata chitinase with regulation activity of the yield threshold of cell wall
rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Cotyledoneous yieldin-like protein
total genus 88
structure length 242
sequence length 242
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3w3eA01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 3w3eA02
2ZIJA 5KY1A 3D9AC 3TMXA 1OUCA 1XFPL 3GXKA 4LFPA 1HENA 4UWNA 5HNCA 5J7CA 4C3WA 5LYMA 1LJGA 1T6VL 1QTKA 1GF3A 1I1ZA 3ZVQA 1QUSA 1BWIA 1HC0A 1ZMYL 5ILCA 4HJYA 3EMSA 3HBDA 1GE2A 4WL6A 4ZIXA 1GBYA 4GCEA 4DD0A 1FBIX 5APCA 4XJDA 1GEVA 4ETAA 2LYZA 2HEFA 1LSEA 4X3BA 2CWIA 1LKRA 1RCMA 4NGYA 1C08C 1WQNA 4GCFA 5M1YA 3CT1A 4NG1A 3LHMA 1YKZX 4H9CA 1GEZA 4CJ2A 4H8YA 2HTXA 133LA 2HEBA 1NBZC 3A34A 3CB7A 4TWSA 4I8SA 1LSMA 1B9OA 1JJ3A 1HMLA 4WLDA 1BWHA 1OUJA 1BGIA 1GB5A 2D4JA 5I4YA 1EQ4A 3FE0A 3RW8A 1LJHA 3LYTA 4BADA 4YEMA 1D0LA 4P2EA 1UICA 1EQEA 3P65A 5DLAA 1JHLA 1IR9A 1B7RA 5L3HA 4N1CC 3HBEX 1JKAA 4M4OA 3A6CY 1LHMA 4GLVA 4DDAA 2Z37A 3D3DA 4YENA 1JEFA 1HELA 3AJNA 2I6ZA 5IDDA 2RSCA 3IJVA 4NHTA 1HEQA 1GFTA 1DPXA 4XJGA 3WVYA 4CFOA 3RZ4A 2VB1A 2HU1A 1RE2A 4N8ZA 1LKSA 3QNGA 1LZ4A 1C43A 1LJ4A 1H87A 2YVBA 4KL7A 4DC4A 2BQBA 5HQ1A 2EIZC 4HV1A 5LINA 2ZQ3A 3CSZA 1LMNA 2XBSA 1BB4A 1YIKA 1DQJC 4D9ZA 1B7SA 1TAYA 4XENA 1HERA 1GXXA 4LYZA 3IWRA 1GFHA 1SQ2L 4NGZA 3EXDA 4NHIA 1IP6A 1IP4A 2C8OA 2DQDY 2NWDX 5HMJA 5KXXA 1KIRC 1NMMA 3WULA 5KXRA 1J1OY 1TCYA 4LT1A 1BB5A 4OWEA 3LZ2A 5D5FA 5JENB 1F6RA 1D9UA 1JKCA 1IWWA 4LT0A 4PRUA 5FSTA 4PJ2C 2DQFC 1FKQA 2F4AA 2MEFA 3TXIA 5LA5A 1FLQA 2HEAA 3G3AB 1REXA 1OQMA 2YBIA 4DD7A 3TXEA 2Z18A 2YBMA 2D4IA 3WVXA 1YKYX 4ETCA 1JITA 4ETEA 1B5VA 1ZV5L 1BWJA 2DQJY 4OW1A 3A91A 3W6DA 5LIOA 3EO5A 2H9KA 1GE3A 1QDRA 5DN5A 1LHJA 1UCOA 1JTOL 2H9JA 1IP2A 2DQCY 4G4CA 1LMCA 2F30A 4IASA 4H9EA 5EBHA 1GB6A 4WO6A 4GCCA 1LSNA 5KXNA 5LA8A 4WM6A 1VDSA 1GBZA 1QUTA 2I25L 1FLUA 3AYQA 1IWTA 4TX7A 1J1XY 2BQLA 3LZTA 1GE1A 4HPEA 2YBNA 4NEBA 2EKSC 4HV2A 4XYYA 5B1GA 2MEEA 1YANA 2BQDA 1B5WA 5A3EA 5LVHA 1JTTL 1WVUA 2ZYPA 4GLAA 2ZILA 3TXGA 4WOAA 4B49A 5I4XA 3WUAA 4W94A 3W6BA 3P68A 1F6SA 1IOQA 4NSJA 3WU7A 3N9CA 1YAOA 2C8PA 1VEDA 1O23A 3WU9A 1J1PY 2BQCA 1GB9A 3TMUA 3WPLA 3FI7A 3WXTA 3AB6A 5IHGA 1IEEA 1LZYA 1DI5A 2ZWBA 2Z19A 1GD6A 2YDGA 5T3FA 1A4VA 2DQAA 1JISA 1AZFA 1GFVA 1LSYA 2W1MA 2MEBA 1LYOA 1INUA 4HP0A 1LMTA 2CDSA 5APDA 4LYOA 2FBBA 4HTKA 4WM5A 1UUZC 4XJBA 1WVVA 1FN5A 3OK0A 4LYTA 1GF6A 1LJNA 1VDQA 1G7JC 5E9RA 5B59A 4DD9A 1OUIA 1GFGA 1JTPL 1C45A 1LJIA 2W1XA 3ATOA 3F6ZA 1IR8A 4NSHA 3TXJA 3AZ4A 2BQJA 4LYCA 1XGTC 1LPIA 1GFEA 1GBWA 4N0JA 1B7OA 4AGAA 3KAMA 1OUBA 5KXOA 4EMNA 3ATNA 3AW6A 1QTEA 4Z41A 5B05A 4OWAA 3VWOA 5C6LA 1HFZA 4TUNA 3A8ZA 1JSFA 3WMKA 4H92A 4H9FA 4H94A 3WL2A 1MLCE 1GF4A 1GF5A 4OWHA 4LYBA 1LOZA 1REMA 4NGIA 2Z12A 1NBYC 1LCNA 2BQEA 1LZNA 1LZ8A 1REYA 4R6CA 3E3DA 1IP3A 4W96A 1AM7A 5FDJA 5LAGA 1B7PA 1WQPA 4WL7A 1IWZA 3W6FA 1NWGA 3GXRA 5KXWA 1JJ0A 1KIPC 3WH1A 3B0OA 4GN5C 1T3PA 4TSBA 3HFMY 4RLMA 2DQHY 2LHMA 1IX0A 1GB7A 3WUNA 1BQLY 7LYZA 4RDSA 2F4GA 1LJEA 1RJCB 4IATA 1IWYA 3M3UA 4MCKA 3SP3A 1CJ7A 1GAZA 4LZTA 2Z2FA 134LA 207LA 2XJWA 3B0IA 1E8LA 5B06A 1GF8A 3W6CA 5LVJA 4PRQA 4GN3A 1H6MA 1LSAA 1YILA 1LSPA 135LA 4NHPA 2Y8PA 1LHHA 1LJJA 1A2YC 1JPOA 1LHKA 3TMWA 1D0KA 4G9SA 4WG7A 1IWUA 3RU5A 4DD3A 5F14A 1UACY 4DYGA 1HEMA 1B0DA 1GBSA 3A96A 4H90A 4OWCA 5B07A 5I5QA 1BHZA 1UIBA 2MEGA 2ZNWY 3QE8A 3J4GA 3TXBA 3WU8A 1DXJA 1UA6Y 4J0LA 154LA 2I26L 4H9AA 4B1AA 1GB0A 1FKVA 4NGJA 1NHEA 3AZ7A 3CT0A 1B5XA 1HHLA 2LYOA 5KKIA 4WLXA 1GAYA 1IP7A 4N1EI 5KXLA 1D0MA 1HNLA 1IO5A 1BB6A 4XN6A 1IOSA 1LZRA 2LZTA 1Z55A 3P4ZA 5K7OA 4G4HA 4UWVA 2D6BA 2W1LA 1GFKA 4LT3A 4WO9A 5L3IA 1B5UA 1F0WA 4OOOA 1FLWA 5A3ZA 1HMKA 1GPQC 1B7LA 2ZQ4A 3A3QA 3B0KA 3CT5A 1C10A 2MEAA 3CQLA 3TMVA 1IY4A 1CJ6A 2PC2A 4WM4A 2MEHA 5F81A 1UIAA 1YKXX 4BS7A 5II3A 1G7LC 4GCBA 4LGKA 4LFXA 1CNSA 1IC4Y 1LZ1A 2BQOA 3AZ6A 1LZCA 4I0CA 4NWEA 5DM9A 3WPJA 1P2CC 1LZAA 4C5FA 3QY4A 1LZSA 4MR1A 4FJRA 3T36A 1GBOA 3CSQA 1GF0A 1ZVYB 4RW2A 4YOPA 2BQHA 3ZVQB 2W1YA 3RT5X 2Z2EA 4UWUA 4H1PA 4RW1A 1LSGA 1LZ5A 1B7NA 1LTMA 1XGUC 5I4WA 4KXIA 5LYZA 5IELA 2CJLA 4H93A 1UIGA 1G7HC 1YAPA 1MELL 2BQAA 1JIYA 2H5ZA 4U3XB 1G7MC 1XGPC 3ULRA 3WW6A 3CSRA 3LYMA 5HNLA 2Z39A 4LYMA 3G3BB 1D6QA 4HTQA 2YBLA 4QY9A 3B6LA 1IWVA 2FYDA 1B7MA 5FHWA 1IR7A 1QDTA 2EQLA 2F2NA 2GV0A 3A92A 4O34A 3A67Y 4QGZA 2FYCA 4WM2A 2G4NA 5KXYA 1NF5A 5HMVA 2A7FA 1BB7A 4NGWA 1C7PA 4GN4A 1OUGA 4J7VA 4DD1A 5C6IA 3A95A 5L9JA 5HLLA 1TBYA 3AGIA 3P66A 4E3UA 1JKDA 2WARA 4A7DA 1GB2A 1DKKA 5LVGA 4RLNA 1GXV2 1GF7A 4DDCA 1WQMA 5KXMA 4NHQA 3J6KA 1WTNA 3TXHA 3A6BY 1GDXA 2BPUA 3BKVA 1XSFA 2EPEA 3W6AA 2HU3A 1GB8A 1NQIA 4H9IA 1JSEA 3A94A 1GF9A 1OUDA 1AKIA 1QIOA 1DPWA 2LYMA 6LYZA 1LYSA 2Z38A 5LXWA 4H8ZA 1JWRA 1UIHA 1WQOA 2BQGA 2X0AA 4CGEA 4BAFA 1W6ZA 2N5ZA 2HEEA 1QSWA 1UBZA 4H9HA 3BKHA 4R0FA 1LMPA 5FCPA 1IIZA 5FELA 4WLYA 1LSCA 1GFAA 3WPKA 4B4JA 3LYOA 8LYZA 1GE0A 1VAUA 4WM1A 4NIJA 1HEOA 4DWXA 4QEQA 4ETDA 1TEWA 2MECA 1W08A 1B5ZA 5LVKA 5I53A 4H9BA 1CKHA 3EBAB 2D4KA 1JKBA 4J1BA 1DZBX 1I56A 1HEWA 4CHXA 4NY5A 2ZIKA 1YAQA 1V7TA 4LT2A 1WQQA 1OUAA 3A3RX 2XBRA 4PGJB 1F10A 3WW5A 4II8A 5KXSA 4M6DA 1GB3A 1GFRA 1XEJA 4DT3A 4B4EA 4XADA 1LSBA 1RFPA 1LZBA 1XEKA 1IOCA 4HSFA 4XJFA 3W6EA 3N9EA 5AMYA 4YF2A 4YM8A 1UIDA 2DQIY 3HBHA 3MGWA 3TXKA 1NDMC 1XGQC 1DI3A 4NGVA 1B2KA 1FDLY 4NHSA 1CJ9A 1XEIA 1LSDA 1FLYA 1CKFA 2BQNA 1SLYA 1UIEA 1IWXA 4NGOA 4IJ4A 1IP5A 1HFXA 4HTNA 1VFBC 1D6PA 1IVMA 1AT6A 1LZTA 2ZYCA 4H8XA 1V7SA 1GHLA 1ZVHL 1GE4A 2D91A 4ML7A 1JJ1A 5KKJA 4ZFPA 1DI4A 1GBXA 1YAMA 1IC7Y 3IJUA 4H91A 3TXFA 4DDBA 3P64A 1IORA 5D5CA 5DL9A 3W3EA 5KXKA 1OUFA 4ET8A 3N9AA 1CJ8A 5B1FA 1CKGA 1HSXA 1DKJA 3T6UA 1LZGA 1VDTA 1LZEA 2HUBA 5KXPA 2BQFA 1HF4A 4HJZA 3RNXA 2BQIA 1OUEA 3OJPA 4KT3A 1WQRA 1G7IC 6LYTA 1GFJA 4WM3A 1OUHA 2CGIA 2Q0MX 2BQMA 4OWBA 2ZNXY 1YROA 2BQKA 2DBTA 4Z98A 1N4FA 2IFFY 1LYYA 4N5RA 5E4PA 5F16A 2YBHA 4PPOA 1LZ6A 4HJVA 1GWDA 5KXTA 2AUBA 2B5ZA 1HFYA 1B7QA 3A93A 3K3TA 1EL1A 5F9UA 2BLXA 4KPMA 4TSCA 4NG8A 1UC0A 1VDPA 3A90A 1LSZA 1LMQA 5FEKA 4WG1A 1BB3A 4J1AA 4B0DA 5KJ9A 1ALCA 4YEOA 4ANRA 4PHIA 4GCDA 1BVKC 1OP9B 2MEDA 1HSWA 1BVXA 3M18B 4MSTA 4L41A 2DQGY 4NFVA 5LVIA 1CKCA 4B4IA 2DQEY 1UIFA 3WXUA 4ET9A 1KXWA 2BAAA 5LAFA 2HECA 9LYZA 1LMAA 3B72A 4FDYA 1LYZA 1WTMA 4WLTA 1LAAA 4WMGA 4XJIA 1LZ9A 1B5YA 1LJFA 1LHIA 1GFUA 4QDNA 4NWHA 1IOTA 4NSIA 1HEPA 1KIQC 4HPIA 5APEA 2G4PA 1IY3A 1LMOA 1KXYA 2A7DA 4NGLA 4CFPA 4OOTA 5KXZA 4XJHA 3AGGG 1CKDA 4Z46A 4NGKA 1JUGA 1PS5A 3LN2A 2LZ2A 4DD2A 4ZEEA 5I54A 4ETBA 1YL0X 2MEIA 208LA 1LJ3A 1NDGC 3AGHA 1XGRC 5APFA 4TTDA 1QQYA 4EOFA 1EQ5A 1LSFA 1LJKA 4G4BA 2G4QA 1GDWA 5LYTA 4NSGA 1C46A 1LHLA 2HEDA 2FBDA 1NKHA 1TDYA 1YL1X 2BLYA 1IC5Y 194LA 1IP1A 1VATA 2IHLA 2XTHA 2YBJA 3LYZA 1REZA 4N9RA 5C6JA 153LA 5DN4A 3AW7A 3WUMA 3WYHA 4AXTA 1QSAA 3TXDA 2DKVA 5ILFA 193LA 3ZEKA 4BAPA 132LA 1KXXA 1LZDA 3AZ5A 1AT5A 1RI8B 5F9XA 1PZYA 4G49A 1YQVY 2YSSC 4Z3MA 1I20A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TMXA 3SN6R 1LJGA 1C6QA 3ZVQA 1C61A 1QUSA 188LA 5ILCA 1FBIX 5APCA 1GEVA 242LA 2HEFA 1LKRA 1C08C 1QS5A 4GCFA 1YKZX 4ARPA 4H8YA 3HH6A 2HTXA 133LA 141LA 1L72A 1NBZC 2HEBA 3A34A 4I8SA 163LA 1JJ3A 3RW8A 3FE0A 4YEMA 1C66A 4P2EA 3P65A 147LA 3A6CY 4YENA 184LA 4NHTA 4XJGA 1GFTA 1DPXA 2HU1A 1LZ4A 1C43A 4ZPUA 2ZQ3A 1LMNA 2XBSA 1BB4A 1YIKA 1DQJC 4D9ZA 232LA 2O4WA 1PQDA 4XENA 1SQ2L 1L43A 2DQDY 2NWDX 1J1OY 166LA 4LT1A 2OE7X 3LZ2A 5JENB 1G07A 1JKCA 1L07A 2HEAA 1QT5A 3G3VA 4ETEA 3LZMA 1B5VA 1L95A 2RH1A 236LA 3EO5A 215LA 1JTOL 1IP2A 4WO6A 1LLHA 1CV6A 3AYQA 1IWTA 4HPEA 2YBNA 2EKSC 4XYYA 1YANA 1JTTL 2ZYPA 3TXGA 1L89A 1L51A 4NSJA 1L47A 158LA 1YAOA 2RAZX 1O23A 3FI7A 1IEEA 139LA 1GD6A 3DN4A 2YDGA 1A4VA 1C6KA 1GFVA 1L35A 1L29A 1LYOA 241LA 2CDSA 162LA 4LYOA 4DKLA 4XJBA 1FN5A 4LYTA 1LJNA 5B59A 1GFGA 3D4SA 3F6ZA 3HWLA 1IR8A 3VW7A 3AZ4A 4LYCA 1XEPA 138LA 4N0JA 4AGAA 3KAMA 1OUBA 4EMNA 5B05A 5C6LA 1L86A 1HFZA 1JSFA 4ARQB 1MLCE 1L74A 1GF5A 1JQUA 176LA 1L42A 3C83A 1QSQA 1LZ8A 244LA 3E3DA 4R6CA 1C67A 1AM7A 1L73A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2ZIJ A;  5KY1 A;  3D9A C;  3TMX A;  1OUC A;  1XFP L;  3GXK A;  4LFP A;  1HEN A;  4UWN A;  5HNC A;  5J7C A;  4C3W A;  5LYM A;  1LJG A;  1T6V L;  1QTK A;  1GF3 A;  1I1Z A;  3ZVQ A;  1QUS A;  1BWI A;  1HC0 A;  1ZMY L;  5ILC A;  4HJY A;  3EMS A;  3HBD A;  1GE2 A;  4WL6 A;  4ZIX A;  1GBY A;  4GCE A;  4DD0 A;  1FBI X;  5APC A;  4XJD A;  1GEV A;  4ETA A;  2LYZ A;  2HEF A;  1LSE A;  4X3B A;  2CWI A;  1LKR A;  1RCM A;  4NGY A;  1C08 C;  1WQN A;  4GCF A;  5M1Y A;  3CT1 A;  4NG1 A;  3LHM A;  1YKZ X;  4H9C A;  1GEZ A;  4CJ2 A;  4H8Y A;  2HTX A;  133L A;  2HEB A;  1NBZ C;  3A34 A;  3CB7 A;  4TWS A;  4I8S A;  1LSM A;  1B9O A;  1JJ3 A;  1HML A;  4WLD A;  1BWH A;  1OUJ A;  1BGI A;  1GB5 A;  2D4J A;  5I4Y A;  1EQ4 A;  3FE0 A;  3RW8 A;  1LJH A;  3LYT A;  4BAD A;  4YEM A;  1D0L A;  4P2E A;  1UIC A;  1EQE A;  3P65 A;  5DLA A;  1JHL A;  1IR9 A;  1B7R A;  5L3H A;  4N1C C;  3HBE X;  1JKA A;  4M4O A;  3A6C Y;  1LHM A;  4GLV A;  4DDA A;  2Z37 A;  3D3D A;  4YEN A;  1JEF A;  1HEL A;  3AJN A;  2I6Z A;  5IDD A;  2RSC A; 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 4TSC A;  4NG8 A;  1UC0 A;  1VDP A;  3A90 A;  1LSZ A;  1LMQ A;  5FEK A;  4WG1 A;  1BB3 A;  4J1A A;  4B0D A;  5KJ9 A;  1ALC A;  4YEO A;  4ANR A;  4PHI A;  4GCD A;  1BVK C;  1OP9 B;  2MED A;  1HSW A;  1BVX A;  3M18 B;  4MST A;  4L41 A;  2DQG Y;  4NFV A;  5LVI A;  1CKC A;  4B4I A;  2DQE Y;  1UIF A;  3WXU A;  4ET9 A;  1KXW A;  2BAA A;  5LAF A;  2HEC A;  9LYZ A;  1LMA A;  3B72 A;  4FDY A;  1LYZ A;  1WTM A;  4WLT A;  1LAA A;  4WMG A;  4XJI A;  1LZ9 A;  1B5Y A;  1LJF A;  1LHI A;  1GFU A;  4QDN A;  4NWH A;  1IOT A;  4NSI A;  1HEP A;  1KIQ C;  4HPI A;  5APE A;  2G4P A;  1IY3 A;  1LMO A;  1KXY A;  2A7D A;  4NGL A;  4CFP A;  4OOT A;  5KXZ A;  4XJH A;  3AGG G;  1CKD A;  4Z46 A;  4NGK A;  1JUG A;  1PS5 A;  3LN2 A;  2LZ2 A;  4DD2 A;  4ZEE A;  5I54 A;  4ETB A;  1YL0 X;  2MEI A;  208L A;  1LJ3 A;  1NDG C;  3AGH A;  1XGR C;  5APF A;  4TTD A;  1QQY A;  4EOF A;  1EQ5 A;  1LSF A;  1LJK A;  4G4B A;  2G4Q A;  1GDW A;  5LYT A;  4NSG A;  1C46 A;  1LHL A;  2HED A;  2FBD A;  1NKH A;  1TDY A;  1YL1 X;  2BLY A;  1IC5 Y; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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