3W6AA

Crystal structure of cross-linked tetragonal hen egg white lysozyme soaked wiht 5mm [ru(benzene)cl2]2
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solid Artificial Metalloenzymes: Post-Engineering of Porous Protein Crystals by Organometallic Complexes
rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3w6aA00
3A93A 2CJLA 1GFEA 3HBHA 4TSCA 5LVIA 3CT0A 4N0JA 194LA 1GEZA 2BLXA 3D3DA 1GB0A 1HERA 2BQEA 1DKJA 2ZQ3A 1HEMA 2HEBA 1OUCA 1JUGA 2LZTA 3AZ7A 4G49A 4II8A 1GHLA 1HFZA 3TXJA 1LSYA 2DQJY 2VB1A 2D4JA 1D0KA 4RLNA 2MEFA 2Z19A 3IJVA 1J1OY 3BKHA 3IJUA 1LAAA 2HUBA 134LA 1VATA 4WLDA 3AW6A 4HTQA 2YBJA 3M3UA 1B5XA 3TMWA 3TXDA 1LZCA 1XFPL 4J7VA 4XN6A 5APDA 5KKJA 1N4FA 1OQMA 1DZBX 1LHLA 1JSEA 4E3UA 4ETCA 4NHQA 5C6IA 1FLQA 2MEGA 3WU9A 2ZIJA 2N5ZA 3AGHA 4GN5C 1NBYC 3TXFA 4DWXA 4H9AA 4HTKA 1B7QA 2Z2EA 1LMPA 1RE2A 1YAQA 1A4VA 1IWZA 1G7MC 1LHMA 4HP0A 5FDJA 1IWTA 1D0MA 4LYOA 1REZA 1VDSA 1LZ6A 4G4HA 4N1CC 4OWHA 5HQ1A 1LSDA 5E4PA 1UIAA 1LHHA 1IC7Y 1IORA 208LA 1WQOA 1I1ZA 1REXA 4XADA 1NHEA 4H91A 1VDPA 1ZVHL 2MEEA 3TXIA 3A3QA 3BKVA 2DQEY 4DDAA 1HSXA 1LJEA 5LVKA 4FJRA 9LYZA 4YEOA 5KXPA 1B7SA 1NQIA 2BQAA 1HELA 1REMA 4HSFA 4NG8A 1LHJA 4RDSA 3TXHA 5HNLA 5M1YA 6LYZA 4CFPA 1WVUA 1LMCA 1LJKA 3TMXA 1RI8B 3WPLA 4ETDA 4CJ2A 2BQFA 1JSFA 4RLMA 1E8LA 2WARA 1HEWA 4NG1A 2BLYA 1G7LC 4NEBA 4NGYA 1LYOA 1LMAA 1IP6A 1DKKA 1LMTA 1C7PA 1QUSA 1REYA 1GXXA 2D4KA 4Z98A 4GLVA 4DD3A 1GE3A 1J1XY 4NGOA 2G4QA 4KXIA 4PJ2C 3SP3A 4LYBA 4XJDA 1EL1A 3WXUA 1GFAA 5F14A 2BQLA 4NGZA 5APCA 2MEDA 4M4OA 1LJJA 4WO9A 4J1AA 1JISA 3CSZA 4OOOA 1LZSA 1GB8A 1EQ5A 4NGJA 1PS5A 4HPEA 4ML7A 1A2YC 4WO6A 1WQMA 1B7RA 1GDXA 2Z12A 4DD1A 3RZ4A 2LHMA 1LSZA 1B7MA 1WQNA 1LSBA 1XEIA 1CJ6A 4WM5A 5F16A 4XYYA 3WU7A 4TWSA 5KXZA 5LVGA 2D91A 1B5WA 3QE8A 4D9ZA 1CKDA 4NHSA 1BVKC 1QIOA 3CT5A 4OW1A 3CT1A 3LN2A 1ZMYL 1V7SA 1OUBA 1DQJC 1CNSA 4H94A 2HEDA 1IIZA 4EMNA 3TMVA 2LYOA 4WG7A 1TBYA 5A3ZA 1JTOL 1EQ4A 3CQLA 5F9UA 3MGWA 135LA 1QQYA 1VAUA 1GE2A 1IWYA 4NGIA 1JEFA 4TSBA 4DD9A 2H9KA 4N9RA 1UIBA 1JJ1A 4H1PA 3W6DA 3W3EA 5APEA 1ALCA 2LZ2A 2BQJA 3QNGA 4BAFA 1GE0A 1GF9A 4G9SA 1IVMA 4QEQA 3EXDA 1GBZA 4DD7A 5APFA 2B5ZA 5I4YA 1XEKA 2F4GA 3T36A 1FBIX 1GF7A 1QTKA 3EBAB 4H92A 4WM6A 4H9EA 1LSGA 4ZFPA 5KXXA 1D0LA 4DYGA 2BQHA 2FBDA 1BQLY 154LA 2F4AA 2Z18A 4H93A 4H8XA 4WLXA 5AMYA 5LA8A 1IY4A 2F30A 5LINA 2BQBA 4BAPA 2Z37A 1HNLA 2IHLA 1HEPA 3G3BB 4ETAA 5FCPA 1B5ZA 3F6ZA 3WVXA 3WPJA 1GAZA 1JITA 3E3DA 4G4BA 5F9XA 4B4JA 1CKHA 1UIGA 2LYZA 3W6CA 1C08C 3WW5A 1GFRA 1IOQA 5FEKA 1GBOA 5LIOA 5HMVA 1GPQC 2ZNWY 4CFOA 3WUMA 4UWUA 4LFPA 1AT5A 1HEOA 3A6BY 1IWUA 1GB5A 5DN5A 1XGUC 3HFMY 5LAGA 1GFKA 1UC0A 1TAYA 5DN4A 1LMQA 1LZEA 1YILA 4WM2A 1HEQA 1LTMA 5KXNA 4P2EA 2D4IA 1GXV2 1T3PA 4N5RA 1DI5A 2FBBA 1LZAA 1JKCA 1HMKA 1C10A 2W1MA 1JJ0A 2ZILA 4W94A 5KJ9A 1YQVY 4LFXA 4N1EI 132LA 3N9EA 4YF2A 2ZQ4A 4PHIA 1GFTA 4PPOA 4WM4A 1Z55A 1JTPL 5J7CA 1B5UA 5L3IA 3AZ4A 4ET9A 4HJYA 1D6QA 1QUTA 4B1AA 3TXKA 5KXLA 1HF4A 3WULA 5B07A 1UIEA 4BADA 5LA5A 3P65A 2YSSC 4XJGA 1QDTA 3N9CA 2HEFA 4GCBA 3AW7A 1FKQA 207LA 5B1GA 3WU8A 1BGIA 1WVVA 1IP5A 3P66A 4OWBA 4Z46A 1GF8A 4AXTA 2D6BA 3ZEKA 4MCKA 2DQCY 1ZVYB 2EKSC 2Q0MX 2I26L 1JKBA 5KXTA 7LYZA 1LZ1A 4H8YA 1YKXX 1GBWA 1B5VA 1LKSA 2EIZC 1AT6A 3D9AC 1C46A 3A91A 2IFFY 5FSTA 1EQEA 1JWRA 2BAAA 4WMGA 3WUAA 2XTHA 2BQMA 5KXOA 1JHLA 4WLTA 5LYTA 3W6AA 4DDBA 3AJNA 1JPOA 4N8ZA 4PRQA 3WUNA 1LZ5A 1LSEA 4DC4A 1LOZA 1CKGA 1GWDA 1LYYA 1LYSA 4H9FA 1IWXA 1GE1A 1LJ3A 3FE0A 1F6RA 2G4NA 4LZTA 1IP1A 1KXXA 4ANRA 4DD0A 2MEBA 2I25L 1FLWA 2MEAA 2Y8PA 1IX0A 1LZTA 1RCMA 3J6KA 3M18B 3KAMA 1J1PY 1H6MA 1BB6A 1NMMA 2XBSA 4NHPA 4XJFA 4NWHA 4DT3A 1HENA 2HEEA 1B9OA 1IP4A 1BWJA 2W1LA 4L41A 1IC5Y 2RSCA 2YBMA 3A92A 3OK0A 4UWVA 3RT5X 5LVJA 3P64A 4ET8A 3QY4A 2I6ZA 5KKIA 4Z3MA 1GF5A 2MEHA 4OOTA 4TX7A 5DLAA 2F2NA 2HECA 1CKCA 4UWNA 3WMKA 3A67Y 3HBDA 1GE4A 1YROA 4LYZA 3AYQA 3CSRA 4CHXA 4M6DA 4NSJA 1LSNA 4NGKA 2BQCA 3AZ6A 2CWIA 1KIQC 1W08A 1LSAA 1B7OA 5A3EA 1GBSA 3A3RX 1HFYA 2W1XA 5FHWA 5L3HA 1NWGA 5LAFA 1B7NA 4WOAA 5ILFA 4NHIA 1LZBA 2C8PA 1GFJA 4OWEA 1WQPA 1GB2A 1BWIA 4PGJB 3RW8A 2YBHA 2X0AA 1IWVA 4LT1A 4NSGA 1OUEA 3B72A 1YIKA 1LHKA 3LYZA 4NGLA 4A7DA 1GFUA 1LJFA 4HV2A 4ZIXA 5KXKA 3OJPA 2H9JA 3EO5A 4B4EA 1SLYA 2A7FA 4OWCA 1LZGA 5B1FA 2BPUA 2HEAA 4LGKA 1B7LA 1GEVA 3AB6A 4NWEA 2FYDA 1T6VL 1H87A 1W6ZA 3J4GA 4DD2A 5I4XA 1XGTC 3AGIA 1WQQA 4DDCA 1UIDA 1LZDA 2BQOA 5KY1A 2AUBA 3ZVQA 1BB3A 1OP9B 2ZYCA 3RU5A 1BVXA 1LYZA 1OUIA 1C45A 1TDYA 2DQDY 3TXBA 1LHIA 1YL0X 1LZ4A 1JTTL 1UUZC 3A8ZA 4ZEEA 2PC2A 4HJVA 5KXYA 3WW6A 4YOPA 2H5ZA 1LKRA 1UCOA 4G4CA 4NFVA 2DKVA 1BB7A 3CSQA 4IASA 1KXWA 5KXWA 2HU3A 1LPIA 4QY9A 1YKZX 2BQKA 1G7JC 3CB7A 3HBEX 3IWRA 6LYTA 1LZ8A 1NKHA 1OUJA 1NDGC 1IC4Y 1UBZA 1KIPC 2YBNA 4GCCA 1IOSA 1MELL 2XJWA 1ZV5L 4WG1A 1LJ4A 1IO5A 2DQGY 1GFGA 2DQIY 1GBXA 4H9CA 3WH1A 1DXJA 4MSTA 3AZ5A 1I56A 1IR9A 5D5FA 4H8ZA 3W6BA 153LA 5EBHA 1GB3A 3AGGG 4R0FA 3ZVQB 5K7OA 1FKVA 133LA 3LHMA 2NWDX 1TCYA 4YEMA 1AZFA 4NSHA 3RNXA 5DM9A 1JJ3A 5I4WA 4H9HA 5II3A 1GB9A 1IP2A 3TXGA 1BHZA 1LMNA 1INUA 4Z41A 1RFPA 4IATA 1UIFA 4YENA 4LT3A 1IEEA 1VFBC 1LJHA 1NDMC 4GN3A 1IP3A 3P4ZA 4NHTA 4QDNA 4C5FA 4NGWA 5KXRA 2DBTA 2Z2FA 1LZNA 2YBIA 3B0KA 3K3TA 4NY5A 1CKFA 2BQGA 4OWAA 3TXEA 3B0IA 1CJ7A 1V7TA 1GF6A 5ILCA 1YAPA 5IHGA 4B49A 4J0LA 1GFVA 1LJGA 1IOCA 1DI4A 1LSPA 1YAMA 1FDLY 2BQNA 3ATNA 5E9RA 1TEWA 1XSFA 5KXSA 2DQFC 3P68A 4LT0A 1GF4A 5HLLA 1B2KA 1OUDA 5IDDA 2BQIA 1BB4A 1NF5A 1SQ2L 4NGVA 4XENA 1BWHA 3ATOA 1GAYA 3A6CY 1B7PA 1IP7A 5B59A 2CDSA 5IELA 193LA 4GCEA 1IR8A 3A90A 2Z38A 1IY3A 1LSMA 2ZYPA 3FI7A 3LYOA 5I5QA 5KXMA 4NSIA 1UA6Y 3WL2A 2YDGA 1F6SA 1LCNA 1LSFA 2DQHY 1F0WA 1OUGA 4GCFA 4RW2A 5LXWA 1LZYA 8LYZA 5I54A 5LYMA 5I53A 4ETBA 4WLYA 4HJZA 4WL6A 1D9UA 1PZYA 4MR1A 4R6CA 4KT3A 3B0OA 4U3XB 3LYTA 1LZ9A 5LYZA 3WVYA 3LYMA 2ZIKA 4XJHA 4KL7A 3W6EA 3WXTA 1XEJA 1UICA 1I20A 4X3BA 4TUNA 5HMJA 4WL7A 4WM3A 1G7IC 1YL1X 3W6FA 4NIJA 1HSWA 1VEDA 1YANA 2Z39A 1HHLA 1KXYA 5FELA 1B0DA 4IJ4A 4LYCA 4B0DA 4I8SA 1O23A 4J1BA 2YBLA 3A34A 4PRUA 1GDWA 5B06A 1LSCA 1BB5A 1FLUA 1RJCB 1DPXA 4GCDA 3B6LA 1XGPC 1OUAA 1C43A 1QTEA 5T3FA 1JKAA 1GB6A 3LZTA 4W96A 3WYHA 5B05A 1XGQC 2EPEA 1FN5A 2C8OA 1WQRA 1GD6A 2LYMA 4WM1A 5C6JA 1B5YA 3TMUA 3ULRA 1GF3A 4GN4A 4LT2A 3A95A 1F10A 4B4IA 3GXKA 1LZRA 3EMSA 1VDQA 4FDYA 3A96A 4BS7A 1GB7A 2CGIA 4I0CA 4O34A 1MLCE 4LYTA 1YKYX 1AKIA 4LYMA 2HU1A 2ZNXY 5DL9A 5C6LA 3LZ2A 5L9JA 2YVBA 2FYCA 1HC0A 1HMLA 1QSAA 1UIHA 2ZWBA 2G4PA 2MEIA 3T6UA 4ETEA 1GF0A 4KPMA 4CGEA 1HFXA 1JKDA 3N9AA 1WTNA 1IR7A 1G7HC 1GBYA 1LJNA 1LJIA 1QDRA 5D5CA 2HTXA 4C3WA 4GLAA 4YM8A 1DI3A 1GFHA 3G3AB 4RW1A 4AGAA 1OUFA 1D6PA 1IWWA 2DQAA 4H9BA 5LVHA 1VDTA 1QSWA 3A94A 3GXRA 2EQLA 1UACY 4EOFA 2A7DA 3VWOA 1WTMA 5JENB 1YAOA 1IOTA 1LMOA 1OUHA 2W1YA 4XJIA 5HNCA 4TTDA 3WPKA 4HTNA 1AM7A 1CJ8A 2MECA 4QGZA 1JIYA 1DPWA 1CJ9A 1XGRC 2XBRA 1KIRC 4H9IA 2GV0A 4HPIA 4HV1A 1P2CC 1NBZC 4H90A 5F81A 4XJBA 1FLYA 2BQDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GFEA 3D3DA 1GB0A 1T8GA 3AZ7A 4LDLA 233LA 3NY9A 1LSYA 2VB1A 4RLNA 2MEFA 2RBRA 222LA 3HT7A 1LI6A 1J1OY 192LA 3IJUA 1LAAA 2HUBA 2YBJA 4I7LA 3TXDA 4XN6A 5APDA 5C6IA 3WU9A 3DN1A 205LA 2N5ZA 4GN5C 1L07A 1A4VA 237LA 5FDJA 1IWTA 1D0MA 6LZMA 1G1VA 5E4PA 3SB5A 1ZVHL 3BKVA 1HSXA 1QT7A 1LJEA 1B7SA 1L01A 4HSFA 3CDVA 4NG8A 115LA 4RDSA 5HNLA 228LA 1LMCA 3SB6A 4ETDA 4CJ2A 1G0GA 1JSFA 2BQFA 4RLMA 1E8LA 2WARA 1L72A 1QS9A 3DKEX 1LMAA 1C7PA 1L83A 4GLVA 2G4QA 1L31A 4LYBA 1EL1A 4YXAC 1GFAA 5F14A 2BQLA 206LA 2MEDA 4WO9A 1L36A 1A2YC 2Q9DA 120LA 2LHMA 1LSBA 4DKLA 5F16A 2D91A 1L15A 1DYFA 122LA 225LA 2HEDA 1IIZA 3TMVA 4WG7A 3HTDA 135LA 1VAUA 4NGIA 2H9KA 2LZ2A 2BQJA 234LA 1GE0A 218LA 5APFA 2F4GA 1SX2A 1FBIX 1GF7A 1QTKA 4OO9A 1D0LA 4H93A 4WLXA 5AMYA 5LA8A 2ANVA 1LW9A 149LA 1HNLA 5FCPA 4ETAA 1B5ZA 2QARC 226LA 2HUKA 3WW5A 1GFRA 5LIOA 177LA 1GPQC 1C69A 3WUMA 4LFPA 3A6BY 169LA 4LDEA 1GFKA 1TAYA 5DN4A 1YILA 1HEQA 5KXNA 2D4IA 1HMKA 1LI2A 2W1MA 1JJ0A 132LA 3N9EA 2ZQ4A 1GFTA 1L96A 1Z55A 5L3IA 108LA 1D6QA 1QUTA 4B1AA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3A93 A;  2CJL A;  1GFE A;  3HBH A;  4TSC A;  5LVI A;  3CT0 A;  4N0J A;  194L A;  1GEZ A;  2BLX A;  3D3D A;  1GB0 A;  1HER A;  2BQE A;  1DKJ A;  2ZQ3 A;  1HEM A;  2HEB A;  1OUC A;  1JUG A;  2LZT A;  3AZ7 A;  4G49 A;  4II8 A;  1GHL A;  1HFZ A;  3TXJ A;  1LSY A;  2DQJ Y;  2VB1 A;  2D4J A;  1D0K A;  4RLN A;  2MEF A;  2Z19 A;  3IJV A;  1J1O Y;  3BKH A;  3IJU A;  1LAA A;  2HUB A;  134L A;  1VAT A;  4WLD A;  3AW6 A;  4HTQ A;  2YBJ A;  3M3U A;  1B5X A;  3TMW A;  3TXD A;  1LZC A;  1XFP L;  4J7V A;  4XN6 A;  5APD A;  5KKJ A;  1N4F A;  1OQM A;  1DZB X;  1LHL A;  1JSE A;  4E3U A;  4ETC A;  4NHQ A;  5C6I A;  1FLQ A;  2MEG A;  3WU9 A;  2ZIJ A;  2N5Z A;  3AGH A;  4GN5 C;  1NBY C;  3TXF A;  4DWX A;  4H9A A;  4HTK A;  1B7Q A;  2Z2E A;  1LMP A;  1RE2 A;  1YAQ A;  1A4V A;  1IWZ A;  1G7M C;  1LHM A;  4HP0 A;  5FDJ A;  1IWT A;  1D0M A;  4LYO A;  1REZ A;  1VDS A;  1LZ6 A;  4G4H A;  4N1C C;  4OWH A;  5HQ1 A;  1LSD A;  5E4P A;  1UIA A;  1LHH A;  1IC7 Y;  1IOR A;  208L A;  1WQO A;  1I1Z A;  1REX A;  4XAD A;  1NHE A; 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 4I8S A;  1O23 A;  4J1B A;  2YBL A;  3A34 A;  4PRU A;  1GDW A;  5B06 A;  1LSC A;  1BB5 A;  1FLU A;  1RJC B;  1DPX A;  4GCD A;  3B6L A;  1XGP C;  1OUA A;  1C43 A;  1QTE A;  5T3F A;  1JKA A;  1GB6 A;  3LZT A;  4W96 A;  3WYH A;  5B05 A;  1XGQ C;  2EPE A;  1FN5 A;  2C8O A;  1WQR A;  1GD6 A;  2LYM A;  4WM1 A;  5C6J A;  1B5Y A;  3TMU A;  3ULR A;  1GF3 A;  4GN4 A;  4LT2 A;  3A95 A;  1F10 A;  4B4I A;  3GXK A;  1LZR A;  3EMS A;  1VDQ A;  4FDY A;  3A96 A;  4BS7 A;  1GB7 A;  2CGI A;  4I0C A;  4O34 A;  1MLC E;  4LYT A;  1YKY X;  1AKI A;  4LYM A;  2HU1 A;  2ZNX Y;  5DL9 A;  5C6L A;  3LZ2 A;  5L9J A;  2YVB A;  2FYC A;  1HC0 A;  1HML A;  1QSA A;  1UIH A;  2ZWB A;  2G4P A;  2MEI A;  3T6U A;  4ETE A;  1GF0 A;  4KPM A;  4CGE A;  1HFX A;  1JKD A;  3N9A A;  1WTN A;  1IR7 A;  1G7H C;  1GBY A;  1LJN A;  1LJI A;  1QDR A;  5D5C A;  2HTX A;  4C3W A;  4GLA A;  4YM8 A;  1DI3 A;  1GFH A;  3G3A B;  4RW1 A;  4AGA A;  1OUF A;  1D6P A;  1IWW A;  2DQA A;  4H9B A;  5LVH A;  1VDT A;  1QSW A;  3A94 A;  3GXR A;  2EQL A;  1UAC Y; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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