3W6EA

Crystal structure of catalytic domain of chitinase from ralstonia sp. a-471 (e162q)
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
158
structure length
158
Chain Sequence
PPTNPPTTVTKPAEVPSRIWTYVMNADNAYGKGGDFALLLSAVIKKESYFGDGLSGSPSAGDGLMQVQPNTRNAYLSQFSAKYGHAYNHSSEQDQVYMGSLILNEKIVRFGSIYSGLLHYNGGDYWYPGATDSYGRPILADQYANTVYAQYKSYGGRY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of the Catalytic Domain of a Novel Glycohydrolase Family 23 Chitinase from Ralstonia sp. A-471 Reveals a Unique Arrangement of the Catalytic Residues for Inverting Chitin Hydrolysis
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme-like chitinolytic enzyme
molecule tags Hydrolase
source organism Ralstonia
total genus 59
structure length 158
sequence length 158
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-02-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3w6eA00
2YSSC 4LYCA 1DI5A 1UIAA 1BQLY 2D4IA 4PPOA 1FDLY 1IP2A 1LZEA 1UIBA 3CSZA 3HBHA 1IP7A 4NIJA 4H8XA 1BGIA 3AZ4A 5KXSA 1TEWA 1KIQC 2X0AA 4H9IA 4WO9A 1WVUA 2ZYCA 4HPIA 2HEFA 2YVBA 5I53A 4H8ZA 5KXMA 1JTPL 3EO5A 1GEZA 1H6MA 1LZGA 1VDPA 3CSQA 1GHLA 5C6IA 4OWBA 5FELA 1GE2A 4R6CA 3TXIA 3WW5A 5KKIA 1GB3A 1OUCA 1VFBC 4XENA 3LN2A 1LJIA 1GFVA 4OOTA 1G7IC 2XTHA 3M18B 5HQ1A 2I26L 1BB7A 1LSPA 3QY4A 5DL9A 5APFA 4XJFA 1I20A 1G7JC 4XN6A 1UIEA 4WLXA 1GF3A 1LKSA 3LZ2A 1NMMA 1DQJC 1LZTA 2LYZA 1IWVA 1QTEA 1LJ3A 2BLXA 3LHMA 4PHIA 4XADA 2FYDA 4H9CA 1GBWA 2W1LA 1GBXA 4L41A 4KXIA 1FKVA 1HEMA 2HTXA 1HSWA 2Z12A 1HELA 5FDJA 5HMJA 3GXRA 1YL0X 1BB5A 1BB6A 2Y8PA 4HP0A 2Z37A 1NHEA 3T6UA 3TXGA 1KIRC 5LINA 4QY9A 1IC7Y 4MCKA 1Z55A 3WU7A 2Z38A 2HEAA 2Q0MX 4XJHA 3B0KA 1WVVA 3G3BB 4NGOA 5II3A 4TSCA 1NBYC 1HEQA 1LMCA 1GFKA 1IEEA 4N9RA 4ETCA 1GB9A 1C45A 3WMKA 5M1YA 1DZBX 1D0LA 2XBSA 4E3UA 1LJJA 1HF4A 4HV2A 4WG1A 1NKHA 1BVXA 4GCBA 1GF4A 134LA 1CNSA 1MELL 2YBHA 1G7LC 1IP3A 2DQFC 1D0MA 1YKXX 4MSTA 5A3EA 1LJEA 1HERA 3M3UA 3ATOA 1HHLA 4IJ4A 3TMWA 5C6LA 5LVKA 3A6BY 2DQAA 2YBLA 5FCPA 4I8SA 4IASA 1VDSA 4WLTA 1LZRA 4G4BA 4QDNA 4HTQA 1V7TA 3A91A 1LYYA 1REMA 5D5CA 2B5ZA 1GDXA 3A34A 1QUSA 1HC0A 1LMAA 2W1MA 1FLWA 3AW6A 5J7CA 1LZ1A 1LHHA 1XGQC 1B7OA 1IP6A 4XJDA 4H94A 1BWIA 3WW6A 4R0FA 9LYZA 3W3EA 4DDCA 1N4FA 2DQEY 1LJHA 1CKGA 1JHLA 1JJ3A 1YANA 1LJNA 5DN5A 1A2YC 4NWHA 3AZ5A 4J7VA 1QUTA 3AZ6A 4GCDA 4IATA 2A7FA 2BQJA 3N9EA 1IWYA 4WM2A 1GF0A 1YL1X 1WTNA 3TMXA 1QQYA 3A8ZA 3CT5A 1OUAA 1BWHA 4H9BA 1GF8A 4TSBA 4WLDA 3WVYA 6LYTA 4YENA 4D9ZA 3TMVA 5I4YA 1UIDA 5KXPA 5KXYA 1JJ1A 4XYYA 2ZIKA 2G4PA 1ZVHL 3HBEX 4WO6A 132LA 4B1AA 4B4JA 2D91A 4WLYA 1GEVA 1IVMA 1GB5A 1YIKA 2LYOA 4FJRA 1GB8A 2BQEA 4OWAA 3TXBA 4W96A 4DYGA 3WPLA 4II8A 4NHIA 5ILFA 4O34A 3B0IA 4PRQA 2ZQ3A 2DQDY 3HBDA 1YAPA 1JIYA 3A92A 4H93A 3WVXA 1LSMA 1IOSA 1VEDA 4H9HA 4N1CC 4WL6A 5I4WA 1GF6A 4H90A 4RLNA 3EBAB 1I1ZA 1H87A 1WQQA 2HUBA 1VAUA 3ULRA 3LYMA 3A3RX 1UACY 1JKBA 1GE4A 1CJ8A 1YAOA 3AYQA 4HTKA 1D9UA 8LYZA 3AW7A 5KXLA 1D6PA 1I56A 2AUBA 4EMNA 1UBZA 1WQPA 4TUNA 2BQDA 1SLYA 2BQHA 5KY1A 1LMNA 1GBZA 4GN3A 4LYBA 1CKFA 4MR1A 1YKYX 2IFFY 2XJWA 1C43A 1LSDA 4G9SA 193LA 1UIFA 5LAFA 2FBDA 1JSEA 1JTOL 5I54A 1HFXA 2DBTA 4X3BA 5ILCA 1DXJA 1CJ6A 4H9FA 5F9XA 1DKJA 3WU8A 3A96A 1GB6A 1B7QA 3WPKA 1LHJA 4I0CA 3N9AA 3TMUA 4J0LA 3WUMA 3B6LA 4DT3A 4WM6A 3ATNA 1LSNA 3CT0A 1GFTA 1JISA 1LZ4A 2GV0A 1AZFA 5LA5A 4H9AA 4Z46A 2G4NA 1UICA 1NDMC 5KJ9A 5DLAA 4LZTA 1IOCA 2ZILA 5JENB 3LYZA 3EXDA 1DKKA 5FSTA 1RI8B 4DDAA 1XSFA 4OOOA 1GE0A 1YAMA 1BB3A 1FLQA 1B7PA 5DN4A 1RFPA 1T6VL 2WARA 4NHTA 3SP3A 3WPJA 1GE3A 1WQMA 1XGTC 1HSXA 1G7HC 1IWXA 1B2KA 4CHXA 4C3WA 3A6CY 4NGIA 4PGJB 2ZWBA 1LJGA 4HJVA 4UWVA 3D9AC 1LYSA 1YQVY 3E3DA 4H1PA 4H8YA 3B72A 3W6FA 4DD1A 1ZVYB 5K7OA 1CKHA 1LSYA 4NHQA 3TXHA 3OJPA 5HLLA 1LKRA 3A90A 3AZ7A 1IC4Y 1GB0A 3ZVQB 2NWDX 4KT3A 3WULA 1OUFA 1LHKA 5E4PA 4B49A 1HMKA 4ML7A 4QGZA 1IOQA 5DM9A 4AXTA 4BAFA 2H9JA 2W1YA 5A3ZA 3WUAA 2C8PA 4HV1A 4NG1A 2YBMA 5AMYA 2MEIA 1WQOA 1HNLA 1B7LA 3IJVA 4TX7A 3W6EA 2BQOA 4YEMA 2CJLA 1O23A 1LSZA 2F30A 4DD3A 1LHIA 5KKJA 2MECA 3A93A 4LYOA 3WUNA 4NGLA 1GWDA 4NSHA 5EBHA 3TXDA 3TXKA 4ANRA 5HNCA 5KXRA 1BVKC 2BQKA 1IWZA 4CFPA 3P66A 4J1AA 1GPQC 1WQRA 1IWWA 1INUA 1LSEA 1NDGC 2C8OA 5E9RA 1RCMA 4DD9A 2ZNWY 1OUJA 1LZ6A 1LZ5A 4HJZA 4J1BA 2F4GA 4N5RA 1LMTA 4NGWA 1JUGA 1GFEA 1WQNA 4QEQA 1LAAA 4TTDA 2D4KA 3ZVQA 4P2EA 1LZ9A 2MEEA 2HU3A 3CQLA 1OUIA 3P68A 4YF2A 2YBIA 1E8LA 1B0DA 1VATA 5LXWA 1IO5A 5KXOA 1T3PA 4UWUA 4N8ZA 2ZQ4A 4LT1A 4WM1A 3LYOA 1XEKA 4ETAA 2Z19A 2BQCA 2EKSC 2FYCA 2DKVA 3AB6A 1GAZA 1GBSA 1XEIA 1CJ7A 1C7PA 4CJ2A 4RDSA 3AJNA 5IHGA 1EQ5A 1BB4A 4NGJA 4G49A 1HEOA 1J1XY 4LFXA 1MLCE 5T3FA 1TBYA 2H5ZA 1QIOA 2BQAA 5APDA 1XEJA 1FN5A 1IC5Y 5I4XA 4KPMA 1REXA 5LVHA 2HEBA 1LSGA 2CDSA 1UUZC 4G4CA 1GFRA 1GB7A 1J1OY 1KXYA 1FLUA 3RW8A 4YOPA 1F0WA 5I5QA 3LZTA 3A95A 1IWUA 1GE1A 1QTKA 2BQIA 3VWOA 3IWRA 4OWCA 1ALCA 5LYTA 5KXWA 4N1EI 5L3IA 1B7SA 2HECA 2HEDA 4NHPA 3J6KA 1GXXA 4NSGA 1IOTA 2CWIA 3HFMY 1WTMA 3A67Y 2XBRA 4RLMA 1DI4A 2H9KA 4ZFPA 1B5YA 1GFGA 4NGYA 1GBYA 3AGGG 1AM7A 3K3TA 4LT2A 4HSFA 4OWHA 3A94A 4M6DA 5L3HA 3QNGA 4NSJA 4NG8A 5FHWA 1LSFA 5B06A 4TWSA 4ZIXA 4H92A 4BADA 2FBBA 3RT5X 2N5ZA 2Z2EA 2RSCA 1EL1A 1JITA 4AGAA 3N9CA 1LZNA 5LVIA 3BKVA 4A7DA 2HEEA 1JTTL 3FE0A 4LYZA 1NF5A 1W6ZA 4DD0A 2LZTA 5B1GA 5LVGA 1QDTA 3IJUA 1GF9A 1LZBA 1JEFA 1OUEA 2HU1A 1VDQA 4LYMA 1C46A 4GN4A 4WG7A 5KXNA 5F81A 5LA8A 4XJBA 1TDYA 2BQBA 1LMQA 1JJ0A 4XJIA 3RNXA 1GFUA 1BHZA 1RJCB 3P65A 5KXKA 2MEFA 1QDRA 4XJGA 3CB7A 1B5UA 1LSAA 4B0DA 4PRUA 2DQIY 1KXWA 1D0KA 1PS5A 2BQLA 1B5VA 1BWJA 1LCNA 1B7MA 4GCCA 2YDGA 4ETDA 1XGPC 1LOZA 2ZIJA 1IR8A 3F6ZA 1IP4A 1XFPL 5APCA 1P2CC 1AT6A 4RW1A 1LHMA 4KL7A 2MEGA 5FEKA 2ZNXY 1YKZX 4CGEA 4NWEA 2I6ZA 4GN5C 2BAAA 1KXXA 3WXTA 4DWXA 1DPWA 4YM8A 3QE8A 1LZCA 1DI3A 1VDTA 5KXXA 1F6RA 1AT5A 1QSAA 2G4QA 1DPXA 4NGVA 3AGHA 5APEA 135LA 2F4AA 1TCYA 4WM5A 4BS7A 194LA 6LYZA 1GB2A 4Z3MA 5F9UA 2Z18A 1QSWA 1B7NA 3LYTA 1OUGA 4U3XB 4NEBA 5D5FA 3T36A 1OUBA 1REZA 3MGWA 1IR9A 2BQMA 5KXTA 1C10A 5KXZA 1ZMYL 3RZ4A 4LYTA 1AKIA 4GCFA 3W6CA 3P4ZA 3WU9A 1REYA 1UA6Y 1XGUC 4Z98A 5LYZA 154LA 5B1FA 4DD7A 1JSFA 1UIHA 4C5FA 1EQEA 1LZSA 2A7DA 1JKCA 2DQJY 1NQIA 1B5ZA 2PC2A 4NGZA 4DC4A 1IY3A 5F14A 5IELA 1IWTA 5IDDA 1UCOA 3A3QA 2VB1A 1GFAA 4NFVA 1KIPC 2DQHY 1IP5A 1GBOA 2I25L 1GFJA 1SQ2L 4WL7A 1JKAA 1HFYA 1LSCA 2YBNA 4LT0A 2BQGA 1GD6A 1LJ4A 1PZYA 4NSIA 4ETEA 2D4JA 1XGRC 1JWRA 1FLYA 1CKCA 1EQ4A 4G4HA 1CJ9A 4OWEA 1F10A 1G7MC 2F2NA 5C6JA 3AGIA 4B4EA 1GAYA 1W08A 4EOFA 1LZAA 5LVJA 1IP1A 1B5WA 4WM3A 1LSBA 5B59A 4WM4A 1IIZA 2CGIA 2EPEA 5B07A 1HMLA 1LMOA 1HFZA 2DQGY 3P64A 4NY5A 2DQCY 1V7SA 4Z41A 5LIOA 1F6SA 3W6DA 4PJ2C 207LA 1YILA 3WH1A 1OUHA 1YROA 4ET8A 1RE2A 4H91A 1NBZC 3TXJA 1OP9B 1TAYA 1OUDA 3CT1A 4OW1A 2W1XA 4HTNA 1GXV2 3W6AA 3ZEKA 1FKQA 4YEOA 4BAPA 1FBIX 1B7RA 2LHMA 4W94A 1A4VA 2BQFA 2EIZC 4M4OA 1NWGA 1UIGA 3EMSA 1LJKA 4N0JA 1LZ8A 4GLVA 1LZYA 4H9EA 3WYHA 2Z2FA 4NHSA 2EQLA 3TXEA 4WOAA 2D6BA 5HNLA 5B05A 1IX0A 1GF7A 7LYZA 3D3DA 4FDYA 1IORA 1UC0A 5LAGA 3CSRA 1C08C 4UWNA 4CFOA 5LYMA 3KAMA 3WXUA 153LA 4HJYA 3W6BA 3FI7A 1CKDA 1ZV5L 1LTMA 2LYMA 2MEDA 3GXKA 1LZDA 1LYOA 3RU5A 5L9JA 1OQMA 1IR7A 2YBJA 4ET9A 1D6QA 4LFPA 1HENA 1GF5A 1GFHA 2BPUA 2MEAA 4HPEA 1LYZA 2ZYPA 1JPOA 4LT3A 4ZEEA 4DDBA 1LPIA 4B4IA 133LA 4NGKA 2MEBA 3WL2A 3OK0A 4WMGA 2BLYA 2MEHA 2LZ2A 3TXFA 1LJFA 4LGKA 2IHLA 1YAQA 5HMVA 1B5XA 1B9OA 1HEPA 2BQNA 3J4GA 4RW2A 1LHLA 3BKHA 5F16A 3B0OA 3G3AB 1GDWA 1JKDA 4GCEA 2Z39A 4DD2A 4GLAA 4ETBA 1IY4A 1LMPA 1HEWA 1J1PY 208LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LYCA 1BQLY 1UIBA 1IP2A 4NIJA 4H8XA 4WO9A 1XJUA 5KXMA 1JTPL 1H6MA 3CSQA 3V2YA 4R6CA 1CV6A 1OUCA 1VFBC 1CTWA 1L54A 1GFVA 3M18B 1BB7A 4XJFA 1UIEA 4WLXA 1L20A 1NMMA 2LYZA 2BLXA 144LA 4KXIA 1FKVA 2HTXA 5FDJA 1BB5A 3WU7A 1WVVA 1NBYC 1OVKA 219LA 1DYEA 178LA 249LA 3NY8A 4HV2A 1NKHA 3PDSA 1GF4A 4PK0A 1G7LC 1YKXX 3DN4A 1LJEA 1HERA 1L58A 3ATOA 169LA 3M3UA 177LA 3A6BY 180LA 1LZRA 4QDNA 1GDXA 1HC0A 118LA 226LA 9LYZA 1OWYA 1C64A 3W3EA 1LI6A 103LA 2Q9EA 2DQEY 1C6TA 4J7VA 1QUTA 3AZ6A 1G0PA 3DN3A 3CT5A 4H9BA 1BWHA 1QTDA 3DN8A 3WVYA 3HDFA 4YENA 5I4YA 5KXPA 222LA 1D3FA 1P46A 1YIKA 245LA 2LYOA 4LDLA 1GB8A 4W96A 4II8A 191LA 1C62A 1SWZA 1C60A 1JIYA 4W51A 4WL6A 4GBRB 1H87A 113LA 1DYDA 3LYMA 3G3XA 1UACY 2B6ZA 8LYZA 1D6PA 120LA 3HTBA 4EMNA 2Q9DA 4TUNA 2BQDA 1SLYA 197LA 2BQHA 5KY1A 1LMNA 1GBZA 176LA 253LA 4GN3A 1C6FA 2IFFY 1C43A 1LSDA 4G9SA 2FBDA 3SB7A 1JSEA 237LA 1CJ6A 4H9FA 1L10A 1T6HA 1L26A 1B7QA 4DT3A 4I0CA 3TMUA 3WUMA 3K2RA 3ATNA 1LSNA 2GV0A 3C7YA 4ARLA 3NYAA 2ZILA 1L03A 1QT5A 1L04A 2O7AA 4CHXA 3A6CY 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2YSS C;  4LYC A;  1DI5 A;  1UIA A;  1BQL Y;  2D4I A;  4PPO A;  1FDL Y;  1IP2 A;  1LZE A;  1UIB A;  3CSZ A;  3HBH A;  1IP7 A;  4NIJ A;  4H8X A;  1BGI A;  3AZ4 A;  5KXS A;  1TEW A;  1KIQ C;  2X0A A;  4H9I A;  4WO9 A;  1WVU A;  2ZYC A;  4HPI A;  2HEF A;  2YVB A;  5I53 A;  4H8Z A;  5KXM A;  1JTP L;  3EO5 A;  1GEZ A;  1H6M A;  1LZG A;  1VDP A;  3CSQ A;  1GHL A;  5C6I A;  4OWB A;  5FEL A;  1GE2 A;  4R6C A;  3TXI A;  3WW5 A;  5KKI A;  1GB3 A;  1OUC A;  1VFB C;  4XEN A;  3LN2 A;  1LJI A;  1GFV A;  4OOT A;  1G7I C;  2XTH A;  3M18 B;  5HQ1 A;  2I26 L;  1BB7 A;  1LSP A;  3QY4 A;  5DL9 A;  5APF A;  4XJF A;  1I20 A;  1G7J C;  4XN6 A;  1UIE A;  4WLX A;  1GF3 A;  1LKS A;  3LZ2 A;  1NMM A;  1DQJ C;  1LZT A;  2LYZ A;  1IWV A;  1QTE A;  1LJ3 A;  2BLX A;  3LHM A;  4PHI A;  4XAD A;  2FYD A;  4H9C A;  1GBW A;  2W1L A;  1GBX A;  4L41 A;  4KXI A;  1FKV A;  1HEM A;  2HTX A;  1HSW A;  2Z12 A;  1HEL A;  5FDJ A;  5HMJ A;  3GXR A;  1YL0 X;  1BB5 A;  1BB6 A;  2Y8P A;  4HP0 A;  2Z37 A;  1NHE A;  3T6U A;  3TXG A;  1KIR C; 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 1LMO A;  1HFZ A;  2DQG Y;  3P64 A;  4NY5 A;  2DQC Y;  1V7S A;  4Z41 A;  5LIO A;  1F6S A;  3W6D A;  4PJ2 C;  207L A;  1YIL A;  3WH1 A;  1OUH A;  1YRO A;  4ET8 A;  1RE2 A;  4H91 A;  1NBZ C;  3TXJ A;  1OP9 B;  1TAY A;  1OUD A;  3CT1 A;  4OW1 A;  2W1X A;  4HTN A;  1GXV 2;  3W6A A;  3ZEK A;  1FKQ A;  4YEO A;  4BAP A;  1FBI X;  1B7R A;  2LHM A;  4W94 A;  1A4V A;  2BQF A;  2EIZ C;  4M4O A;  1NWG A;  1UIG A;  3EMS A;  1LJK A;  4N0J A;  1LZ8 A;  4GLV A;  1LZY A;  4H9E A;  3WYH A;  2Z2F A;  4NHS A;  2EQL A;  3TXE A;  4WOA A;  2D6B A;  5HNL A;  5B05 A;  1IX0 A;  1GF7 A;  7LYZ A;  3D3D A;  4FDY A;  1IOR A;  1UC0 A;  5LAG A;  3CSR A;  1C08 C;  4UWN A;  4CFO A;  5LYM A;  3KAM A;  3WXU A;  153L A;  4HJY A;  3W6B A;  3FI7 A;  1CKD A;  1ZV5 L;  1LTM A;  2LYM A;  2MED A;  3GXK A;  1LZD A;  1LYO A;  3RU5 A;  5L9J A;  1OQM A;  1IR7 A;  2YBJ A;  4ET9 A;  1D6Q A;  4LFP A;  1HEN A;  1GF5 A;  1GFH A;  2BPU A;  2MEA A;  4HPE A;  1LYZ A;  2ZYP A;  1JPO A;  4LT3 A;  4ZEE A;  4DDB A;  1LPI A;  4B4I A;  133L A;  4NGK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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