3WH1A

Crystal structure of a family gh19 chitinase from bryum coronatum in complex with (glcnac)4 at 1.0 a resolution
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
204
structure length
203
Chain Sequence
SWTSFVTPAVFEGWFPNRNPFYTYDGLVSASNGYPEFGTTGSLDDQKRELAAFLGNINQASGGLQFIQEQNPSDYCDTSSTQYPCAAGKQYYGRGPIQLSWNYNYGEAGADLGLDLLNNPDLVAQDSTVAWRTALWFWMKRDCHGAITASPPSFSGTIRIINGGLECNQPAGSIGNMQMENRVTYYTQFCQTLGVDPGTDLRC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a "loopless" GH19 chitinase in complex with chitin tetrasaccharide spanning the catalytic center
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chitinase A
molecule tags Hydrolase
source organism Bryum coronatum
total genus 74
structure length 203
sequence length 204
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3wh1A01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 3wh1A02
1HFYA 1JSEA 1GB6A 1LSGA 1TCYA 3LYZA 1D0LA 1FLYA 1KXXA 1QSWA 1RJCB 1V7TA 2HEEA 4WM2A 1MLCE 5E9RA 5LA5A 4PGJB 4GCBA 3TXKA 5LIOA 5T3FA 4W94A 1D6PA 1GB5A 1LZNA 2BLYA 2WARA 1GB7A 4HJZA 4ETBA 1PZYA 1LSAA 3LZ2A 4P2EA 5LAGA 1B5YA 1B7OA 2BQCA 1DXJA 5I4XA 1IWXA 2H5ZA 1GB3A 5APCA 2I6ZA 2G4NA 1LZYA 4HTKA 4E3UA 4WO6A 3RU5A 4ZEEA 3OJPA 1ZV5L 1YANA 2FYDA 1QSAA 1OUEA 3ATNA 1LYYA 3A3QA 1IP5A 1LMCA 1OUCA 1NDGC 1GF7A 1CJ7A 1IOSA 1IC4Y 1G7HC 1DKKA 1LJGA 4DDBA 1NMMA 2PC2A 4G4CA 4J1BA 1JWRA 1HEWA 4LFXA 132LA 3LZTA 4LYCA 4OWEA 1BGIA 3WXTA 1LJFA 1UIGA 4Z46A 2MEDA 3W6AA 5FHWA 1LZEA 133LA 4NIJA 1GXXA 1IC5Y 5APFA 4ZFPA 1B2KA 5KKIA 1BVXA 1GF9A 4J1AA 1HEQA 1D9UA 2LYMA 1OP9B 4TX7A 2W1LA 154LA 2DQJY 1FLQA 1CNSA 1J1OY 1RCMA 2DQEY 2LHMA 1QUSA 5B06A 4NGVA 2ZYPA 1TDYA 4TSBA 3G3AB 1JTTL 1WTNA 3N9CA 4KT3A 3W6CA 5HQ1A 2HEDA 4G9SA 5LINA 1LKRA 4L41A 1CKDA 4CFOA 1GXV2 2BQLA 2W1XA 3N9AA 4QDNA 4XADA 4XJDA 5FSTA 2YSSC 3W6FA 4IJ4A 4KXIA 4N5RA 4LT0A 2W1MA 2D4IA 4G4HA 2LZ2A 4BAPA 4N0JA 4TTDA 4ETDA 1REMA 3MGWA 4OWCA 1IEEA 1JSFA 1J1PY 2YVBA 1JTPL 3EXDA 1FBIX 1BWHA 2BQEA 1IP7A 5F9UA 4M4OA 4NGKA 4DD9A 1YAOA 3KAMA 2DKVA 1B5XA 4H9HA 4NWHA 4DD0A 1BVKC 1GB9A 2CDSA 1RFPA 3WUMA 1LJ3A 4CHXA 1KXWA 4FJRA 4B0DA 3FE0A 4ET9A 2MEFA 1IVMA 1AM7A 1OUIA 4C5FA 3WVYA 4GLVA 4NSGA 1B7SA 1VEDA 2BQJA 3A95A 3BKVA 4WM1A 1UIBA 2Q0MX 1IC7Y 1HEPA 1ZVHL 1DI3A 1QQYA 5I53A 3ULRA 1DQJC 1GPQC 1G7MC 1BWIA 2YBIA 3GXKA 3WPLA 1WQQA 3A90A 3EMSA 1KIQC 3HBDA 4GLAA 135LA 3P64A 1GAZA 1F6SA 5B07A 2CWIA 2DQCY 5KXZA 3WPKA 2HU1A 1LMPA 3D3DA 4QY9A 1WQRA 1XSFA 2BQGA 2G4QA 3AZ4A 5LYTA 4EOFA 1XFPL 4HPIA 1UUZC 2XBRA 4ET8A 1JISA 5L9JA 1HF4A 4LYOA 1OUHA 1LJNA 4H8YA 3WXUA 1B7NA 2F4AA 4NGZA 1LZ1A 2A7FA 5LVHA 1DPWA 1IP2A 5D5FA 4B4JA 1YKXX 5LVGA 4W96A 1XEKA 2EKSC 2GV0A 4YOPA 1VDSA 2HTXA 4ML7A 1YKYX 4H90A 1IIZA 5KXRA 1WQNA 4XENA 1IOCA 1J1XY 1HEOA 4YM8A 1F6RA 4NGWA 2MEHA 1FKQA 4BADA 1IWVA 1SQ2L 1FLUA 5FEKA 4MR1A 1YAQA 1LZDA 4XN6A 2ZQ4A 3N9EA 1D0KA 1GF8A 2H9JA 3A67Y 4NHSA 4DD2A 5KXYA 3ZEKA 1IY4A 4DD3A 4DT3A 4G4BA 5C6LA 1D0MA 1VDTA 1GFAA 1YAMA 3HFMY 1AZFA 3CT5A 3WPJA 4NY5A 1T3PA 1W08A 1UIDA 1B5ZA 1LZ5A 1YROA 9LYZA 2YBJA 2HEAA 4WMGA 4PRUA 1OUAA 5KXMA 5L3HA 3TMWA 1IP4A 1LJIA 2DQIY 1XGRC 1GWDA 3WH1A 5I4YA 1TEWA 1HMKA 3A8ZA 1IWTA 1C43A 1GBXA 1CKCA 1GE3A 3A6BY 4LGKA 1JJ0A 4J7VA 1LZ6A 2Y8PA 4NSHA 5J7CA 5LYZA 1JHLA 4H9IA 4R6CA 1QUTA 4GCCA 2ZNXY 2DBTA 3TMVA 3AGGG 1W6ZA 2ZIJA 2FBBA 1LHHA 3W6DA 2MEIA 2N5ZA 3BKHA 3LYMA 1HSWA 3HBHA 5EBHA 5LAFA 2MEGA 1N4FA 1LMTA 2IHLA 4NSIA 4FDYA 4LT1A 4UWUA 4NHQA 1NHEA 3W6BA 2BQMA 3WU9A 5F81A 4HTNA 4NGOA 3D9AC 1IR8A 1LZ9A 1RE2A 4PHIA 1WQMA 3TXHA 1IOTA 1OUBA 1XGQC 2D91A 1YKZX 4HP0A 1G7JC 1LSMA 4XJGA 5B59A 1QTEA 1DI4A 1GDXA 1NDMC 1T6VL 1UACY 1VAUA 1XGUC 4GCEA 3WYHA 1CJ9A 1B9OA 1JKDA 5F9XA 1GDWA 5IDDA 2DQFC 2EIZC 5A3EA 5HNCA 2Z38A 1IY3A 1YL1X 1LMAA 2NWDX 2F2NA 2BQBA 5DM9A 1CJ6A 3LYTA 5M1YA 3A92A 1GFHA 1OUGA 1MELL 3ATOA 4NG8A 3VWOA 4DYGA 1DKJA 4HPEA 3WU8A 1F0WA 4CJ2A 1IWWA 4G49A 4MCKA 1LSBA 1LZGA 1WQPA 1BB5A 5A3ZA 2BAAA 1LSYA 5LA8A 1B7QA 5ILFA 1UIEA 5C6IA 5HNLA 1XGTC 5LVKA 1HNLA 3P68A 1LSFA 1LMNA 1LSDA 3LN2A 5HMJA 2LYZA 3ZVQA 153LA 1P2CC 1LZBA 2YBMA 4Z3MA 4NEBA 5I4WA 1JIYA 4WG1A 4N1CC 1VATA 2DQDY 4H92A 207LA 4HV1A 3IWRA 1GF6A 4ETCA 2BQKA 4WM6A 3J4GA 4LFPA 1SLYA 1B7RA 4TWSA 2HECA 1XEIA 1AT6A 1FKVA 1KXYA 4RDSA 4UWVA 4XJBA 5IELA 4LYZA 1HFXA 4GN5C 5K7OA 2B5ZA 1H87A 1YQVY 1IWYA 5DL9A 1UIAA 2Z2FA 4NFVA 4IATA 4ANRA 1HENA 1GFRA 1GBZA 4WM3A 4N8ZA 1LHMA 4NGIA 3TXDA 2H9KA 4OWBA 4GCDA 208LA 1LYZA 5FDJA 2ZIKA 3QNGA 5KY1A 3A3RX 2HUBA 2BPUA 4NHTA 2D4JA 1LSCA 1IORA 3IJVA 3CSQA 2BQIA 4R0FA 2A7DA 2D4KA 4TUNA 4N9RA 1GFUA 2F30A 1CKHA 1LMOA 1LZAA 3WU7A 1C46A 4RLMA 1UBZA 1DZBX 4I0CA 3AJNA 3B72A 1IWZA 1VFBC 1TAYA 2BQFA 1GBYA 4H1PA 1REYA 4B1AA 2ZYCA 4WL6A 1LJEA 5E4PA 2MEAA 1ZMYL 3TXBA 1OUFA 3TMUA 2ZWBA 1E8LA 5LXWA 1GF4A 4LYTA 2Z12A 1KIRC 5KXKA 1QIOA 1GEVA 1HELA 3CQLA 3EO5A 3CSRA 4PRQA 5DN5A 4YENA 1LJJA 7LYZA 1GF0A 3EBAB 1HHLA 4RLNA 4XJIA 4DD1A 4HV2A 1IP3A 1IP6A 1B0DA 1EL1A 1OUDA 1A2YC 5FELA 5I5QA 4DDCA 6LYTA 3WL2A 1OUJA 2DQHY 1NKHA 3F6ZA 3RNXA 3WULA 1HC0A 2HEBA 4QGZA 1LJHA 2BLXA 1JKAA 4MSTA 4NHIA 3WMKA 5I54A 1B5UA 4YEOA 1LMQA 3GXRA 1LSEA 2EPEA 1GBSA 3AGIA 1INUA 4U3XB 1LZRA 3J6KA 3WVXA 5KXSA 5IHGA 4KPMA 2MEEA 4J0LA 4B49A 1LHJA 2Z19A 5II3A 1NBZC 2VB1A 1I1ZA 1JUGA 1HSXA 3OK0A 3TXJA 1LJKA 2IFFY 4HJVA 1IO5A 4I8SA 4QEQA 1AKIA 1UC0A 2LZTA 1GE4A 1YAPA 3AZ5A 4HTQA 4D9ZA 4CGEA 5D5CA 2FYCA 194LA 4H8XA 4HJYA 1JKBA 1GD6A 2AUBA 1F10A 5LYMA 1JJ1A 2YBHA 4H9CA 3WUAA 5B1GA 1GE2A 4LZTA 3QY4A 5B05A 1AT5A 1LZ8A 1OQMA 5DLAA 4DDAA 1YILA 3RT5X 2CGIA 3TXFA 5KXTA 2BQNA 3M18B 1B7PA 1ALCA 1REZA 3AW6A 6LYZA 5JENB 1GFJA 1VDPA 3E3DA 5L3IA 4WLYA 1UA6Y 1B5WA 5F16A 1BB7A 1NF5A 1TBYA 1BWJA 4C3WA 4H91A 2BQHA 4UWNA 3WW6A 1GFEA 4GN4A 4CFPA 2DQAA 5HLLA 1LZTA 2EQLA 4GN3A 3WUNA 1HFZA 4GCFA 1LYSA 1JTOL 2FBDA 1JITA 2W1YA 1GBOA 2CJLA 4A7DA 1EQEA 4IASA 1D6QA 4OW1A 1LPIA 1H6MA 1IX0A 5KXOA 1REXA 5ILCA 1BQLY 2MEBA 3AW7A 1CKGA 4XJFA 4WLTA 1GF3A 3RW8A 3WW5A 4BS7A 1I20A 2XJWA 5KKJA 134LA 1LSPA 1BB6A 3AYQA 3TMXA 1LZCA 1WQOA 1CKFA 1G7LC 1YL0X 2DQGY 4WL7A 1GB8A 1NWGA 2YBNA 5KXNA 1FLWA 4II8A 4YF2A 5KXWA 4H8ZA 3CB7A 4H9EA 1NBYC 4N1EI 2C8OA 2Z2EA 4NWEA 3AB6A 5LVIA 4H9BA 4OWHA 1C08C 5HMVA 1ZVYB 4OOOA 1GE0A 2Z39A 4LYMA 4PJ2C 1GEZA 5F14A 1UICA 2HU3A 5B1FA 2BQDA 4H9FA 3W6EA 4NHPA 1WTMA 1GAYA 4LYBA 4WO9A 4WLXA 3B0OA 4Z41A 1B7MA 4H9AA 3AZ6A 3QE8A 4NGLA 1JEFA 1GF5A 2Z37A 4O34A 1CJ8A 4AGAA 8LYZA 4XJHA 1GFVA 4WG7A 1O23A 1IR9A 1GBWA 1DPXA 3IJUA 3W3EA 1XGPC 1IR7A 3CSZA 1B5VA 1LYOA 5APDA 1IWUA 1LZ4A 1GB0A 2YDGA 1JPOA 4B4IA 2MECA 4PPOA 4WM5A 4X3BA 4NSJA 1C7PA 1FN5A 4LT3A 4BAFA 2C8PA 5LVJA 1GFKA 1EQ5A 1IOQA 4M6DA 3HBEX 1EQ4A 3A93A 3CT0A 5KXXA 1LKSA 3FI7A 1QDTA 5KJ9A 1BB4A 1LZSA 4KL7A 3AGHA 4WOAA 2XBSA 2HEFA 1LAAA 3B0KA 3A91A 1GE1A 3A6CY 3G3BB 4HSFA 2I26L 1I56A 2BQAA 5DN4A 4OOTA 1LSZA 5KXPA 1IP1A 3TXEA 4DC4A 1GFGA 1A4VA 193LA 3K3TA 4WM4A 3M3UA 1JKCA 2ZQ3A 4OWAA 1C10A 3P65A 4Z98A 1C45A 3RZ4A 1HMLA 1QDRA 1G7IC 1WVUA 1DI5A 4WLDA 2RSCA 2BQOA 1LHLA 3A94A 1VDQA 2XTHA 4B4EA 4DWXA 1RI8B 1UCOA 3TXGA 4ETEA 2G4PA 2Z18A 5C6JA 3A34A 1PS5A 3AZ7A 5APEA 1LHKA 2ZILA 4NGYA 1B7LA 4RW1A 4RW2A 4DD7A 5KXLA 3B6LA 3LHMA 4LT2A 3T36A 4ETAA 2D6BA 1FDLY 1LCNA 1WVVA 1BB3A 1LTMA 4AXTA 2F4GA 1XEJA 1GFTA 1Z55A 2ZNWY 5FCPA 1GHLA 4NGJA 1YIKA 4NG1A 1BHZA 2YBLA 1GB2A 1V7SA 2LYOA 3LYOA 3P66A 3A96A 3B0IA 1KIPC 1LOZA 1LJ4A 5AMYA 2I25L 4H94A 2X0AA 3TXIA 4TSCA 1NQIA 3T6UA 4ZIXA 3ZVQB 1HERA 1HEMA 4EMNA 3CT1A 4YEMA 1QTKA 1LHIA 3P4ZA 1UIHA 1LSNA 4H93A 3SP3A 4XYYA 1UIFA 1JJ3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GB6A 3QNGA 4YF2A 1QSWA 1LYEA 5T3FA 1D6PA 1GB5A 1LZNA 3QAKA 4I7PA 1LSAA 3LZ2A 5I4XA 1GB3A 3NYAA 4WO6A 3RU5A 1YANA 3ATNA 1LYYA 213LA 127LA 1GF7A 1L42A 3PDSA 2PC2A 1JWRA 251LA 4LFXA 132LA 3WXTA 1UIGA 1LZEA 1GXXA 1IC5Y 4ZFPA 3HDFA 1GF9A 2B72A 2LYMA 2DQJY 1TDYA 1LGWA 3G3AB 4KT3A 1WTNA 2HEDA 5LINA 1CKDA 1GXV2 2BQLA 1QTHA 4IJ4A 4N5RA 4ETDA 4TTDA 1PQDA 1REMA 3MGWA 1IEEA 1L32A 1SSWA 1JTPL 1FBIX 4H9HA 4NWHA 1BVKC 1GB9A 2CDSA 1RFPA 4B0DA 1CVKA 1PQIA 1AM7A 4C5FA 3WVYA 1G0JA 1VEDA 2Q0MX 1L81A 3ULRA 1BWIA 3A90A 206LA 118LA 1SX7A 135LA 2O7AA 1GAZA 1P3NA 1CV6A 1F6SA 2CWIA 1L26A 3WPKA 1XSFA 3AZ4A 2B6ZA 209LA 1JISA 1L11A 1HF4A 1OUHA 1B7NA 2F4AA 4NGZA 199LA 1YKXX 1L84A 4ML7A 1WQNA 1C6CA 217LA 1G0MA 4BADA 1DYEA 1D0KA 1GF8A 3EMLA 169LA 4NHSA 5KXYA 1L16A 3HFMY 1DYFA 1C6GA 1L0JA 1T3PA 1UIDA 176LA 9LYZA 2YBJA 156LA 4PRUA 1IP4A 232LA 3WH1A 1HMKA 1IWTA 1C43A 1GE3A 1L44A 5J7CA 1LZ6A 4NSHA 155LA 5LYZA 1JHLA 1L91A 3TMVA 3W6DA 2N5ZA 196LA 170LA 5LAFA 2IHLA 4UWUA 3WU9A 3D9AC 1IR8A 4XJGA 5B59A 1YKZX 4HP0A 1DI4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1HFY A;  1JSE A;  1GB6 A;  1LSG A;  1TCY A;  3LYZ A;  1D0L A;  1FLY A;  1KXX A;  1QSW A;  1RJC B;  1V7T A;  2HEE A;  4WM2 A;  1MLC E;  5E9R A;  5LA5 A;  4PGJ B;  4GCB A;  3TXK A;  5LIO A;  5T3F A;  4W94 A;  1D6P A;  1GB5 A;  1LZN A;  2BLY A;  2WAR A;  1GB7 A;  4HJZ A;  4ETB A;  1PZY A;  1LSA A;  3LZ2 A;  4P2E A;  5LAG A;  1B5Y A;  1B7O A;  2BQC A;  1DXJ A;  5I4X A;  1IWX A;  2H5Z A;  1GB3 A;  5APC A;  2I6Z A;  2G4N A;  1LZY A;  4HTK A;  4E3U A;  4WO6 A;  3RU5 A;  4ZEE A;  3OJP A;  1ZV5 L;  1YAN A;  2FYD A;  1QSA A;  1OUE A;  3ATN A;  1LYY A;  3A3Q A;  1IP5 A;  1LMC A;  1OUC A;  1NDG C;  1GF7 A;  1CJ7 A;  1IOS A;  1IC4 Y;  1G7H C;  1DKK A;  1LJG A;  4DDB A;  1NMM A;  2PC2 A;  4G4C A;  4J1B A;  1JWR A;  1HEW A;  4LFX A;  132L A;  3LZT A;  4LYC A;  4OWE A;  1BGI A;  3WXT A;  1LJF A;  1UIG A;  4Z46 A;  2MED A;  3W6A A;  5FHW A;  1LZE A;  133L A;  4NIJ A;  1GXX A;  1IC5 Y;  5APF A;  4ZFP A;  1B2K A;  5KKI A;  1BVX A;  1GF9 A;  4J1A A;  1HEQ A;  1D9U A;  2LYM A;  1OP9 B;  4TX7 A;  2W1L A;  154L A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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