3WXTA

Crystal structure of hen egg-white lysozyme
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Grease matrix as a versatile carrier of proteins for serial crystallography
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3wxtA00
1OUDA 3G3AB 4OWBA 2ZQ4A 3HBHA 4LYCA 4ML7A 1BB3A 1IWUA 1H6MA 3A3RX 1GAZA 2F2NA 1W08A 4OWEA 1HEMA 2DQCY 1XGQC 2PC2A 1CJ7A 1GE1A 1LJFA 1KXXA 2A7DA 4ETEA 1BB4A 1FLUA 4UWVA 4BADA 1V7TA 3TMUA 3WVXA 2BQCA 1GB3A 1OUBA 1G7LC 1GE3A 5ILFA 4WL6A 1A2YC 5L9JA 1WTNA 1QUSA 3A93A 2BQLA 4NHSA 2YSSC 1YKZX 1IO5A 5F14A 1YQVY 3WUAA 4GCDA 2D4JA 3W6FA 2C8PA 1HFZA 1LSMA 4P2EA 1IIZA 5EBHA 1LSYA 1J1PY 4H90A 4NWHA 3ULRA 3RZ4A 4LGKA 1WVUA 5FELA 2EQLA 5C6LA 4EOFA 1GWDA 4NFVA 3W3EA 2EIZC 4NGWA 1LZYA 3B72A 2BQMA 1DQJC 4HP0A 5II3A 4NHIA 4DDBA 1GF6A 1LHMA 2D6BA 1ZV5L 4CHXA 3AGGG 5HNLA 4HJVA 4RW2A 4Z3MA 5B05A 4H91A 1LZ9A 4Z41A 1LZTA 4GN4A 3OJPA 3TXDA 5FHWA 1GE4A 1GFRA 1VAUA 4GCFA 4XJHA 4KL7A 4LYBA 5B1FA 3WW5A 1WQMA 1IOQA 1UACY 3A6CY 4LYZA 4N8ZA 3RW8A 1IC7Y 2LYOA 3CSZA 2W1YA 1DPWA 3B6LA 3ATNA 2HECA 4XJBA 1DKKA 3A90A 2DQFC 4LYMA 3LYTA 2H9KA 1HSWA 2MEDA 4XJFA 4DYGA 1DI5A 3J6KA 2MEFA 1GHLA 3TXBA 1IWYA 1LZ8A 5L3HA 4ETAA 1DZBX 2A7FA 3W6EA 1LZBA 1B7RA 2ZYCA 1GB2A 4CFOA 1E8LA 1GFTA 2MEBA 4R6CA 1LJ3A 1NF5A 1B5YA 1FDLY 3A34A 4YEMA 1GXV2 1DI3A 2Z37A 1IWVA 1GB8A 1BWHA 3TXKA 8LYZA 2C8OA 2LYMA 1IOSA 5DN4A 4B0DA 1GFGA 3A3QA 2BQAA 3A6BY 3CSRA 1AM7A 1GF5A 2BQFA 4N9RA 3RT5X 4HTNA 4BAFA 1JHLA 3OK0A 4NG1A 1LZEA 1REYA 1JEFA 1Z55A 1WTMA 3CB7A 4NGJA 5KXYA 1CKFA 1FBIX 3M3UA 3TXHA 1GBXA 1JKBA 2DQIY 3W6BA 3WXTA 1GF0A 1LZNA 1P2CC 1ALCA 4KPMA 3FE0A 4WG7A 4PRQA 2MEIA 1NQIA 3P64A 4KT3A 4LT1A 4W96A 1LHHA 2BQNA 1HEPA 4DT3A 1TDYA 5LAGA 2DKVA 4HSFA 4TSBA 1B5UA 3AZ5A 4QGZA 5HMJA 2FBBA 4UWNA 4IATA 1B7OA 5IELA 1OUFA 3D3DA 4XN6A 4RW1A 5LVGA 4YM8A 2DBTA 1LSCA 1GBSA 2F4GA 1KXWA 2HEEA 4TX7A 1INUA 5LA5A 4J0LA 3TXEA 5KXPA 1OQMA 2D91A 1XGPC 2HEDA 4J1BA 1LMQA 2ZNXY 3CT1A 3LYZA 2G4NA 3WMKA 1GB7A 4HTKA 1LMNA 5APFA 3A67Y 5F16A 4B1AA 1IP2A 1TBYA 4NHTA 3AZ7A 4XJGA 5HNCA 2HEBA 1LMOA 4D9ZA 4NGLA 5ILCA 1LHKA 1QTKA 5E9RA 3T36A 4RLNA 3WU7A 5LINA 5D5FA 4DD0A 4WL7A 4HJZA 1B0DA 1NHEA 1IC5Y 1LZGA 4Z46A 2YBHA 1KIPC 1XGRC 4A7DA 4B4JA 1OUEA 5KKIA 4NEBA 1B5ZA 1GF3A 1LJ4A 1LSAA 4R0FA 1JTOL 2Z19A 4ETCA 2Z38A 1FLYA 2FYCA 1IP4A 4GCCA 5FSTA 1G7JC 2BQIA 4DD2A 1GDWA 1B7SA 3AW6A 1LJNA 2IHLA 4PRUA 1LJGA 1G7HC 1PZYA 4LT0A 4G9SA 1DPXA 1UC0A 2DQGY 2ZWBA 1WQNA 1VDPA 5B1GA 4NWEA 1B5XA 4XENA 2HU3A 1JJ1A 1J1XY 5FCPA 3WU9A 1B7QA 2BQDA 4NHPA 1NBZC 4GCBA 4H8XA 1KXYA 4J1AA 5F9XA 1JITA 1D0KA 3TXFA 5A3ZA 1JJ0A 3A91A 1VFBC 4II8A 3LYOA 5LIOA 1F0WA 2BPUA 1LZ1A 1OUAA 4LYOA 1HEWA 1YKYX 2BQBA 2N5ZA 1LSFA 2YBLA 1LZAA 1BQLY 1GFJA 4ANRA 4GN3A 4ZFPA 2DQJY 3TXGA 2G4QA 1B5VA 1B7LA 3D9AC 3AJNA 5KXOA 4AXTA 1UIGA 1HC0A 4NSGA 2Q0MX 1IP7A 1C45A 4NG8A 2CWIA 1REZA 2ZIKA 208LA 4ZIXA 3A95A 3A94A 4GCEA 5LVIA 1GF8A 3P4ZA 4OOOA 5DL9A 1HMLA 1YANA 3A96A 4LFPA 5F81A 4EMNA 1LSGA 3IWRA 4H9HA 4LT2A 4YF2A 5DN5A 4WO9A 2YVBA 1YIKA 1CJ8A 1GDXA 4WLYA 4MCKA 1CKGA 1LCNA 2I26L 5APCA 1LMAA 1B5WA 1SLYA 2X0AA 1OUCA 3KAMA 4G4BA 3TXIA 1GF4A 3WXUA 1IOTA 1KIRC 1IEEA 1OUIA 2YBIA 1GFKA 2LZTA 5KXKA 4J7VA 3TXJA 2BQKA 1REMA 2DQAA 2MEEA 2MECA 4WG1A 2HEFA 1BB6A 3RNXA 3EXDA 4N5RA 3A92A 1LJIA 1JPOA 5KKJA 3N9CA 4PJ2C 4H9AA 4QEQA 2ZIJA 4UWUA 1HHLA 1LZ4A 1JISA 4LZTA 1NWGA 3AGIA 1F6RA 1GFVA 1IWWA 1B7MA 1G7IC 134LA 1GF9A 4X3BA 5IHGA 5I4WA 1D6PA 1EQ5A 2Z2EA 4NSIA 3W6DA 4TWSA 4PGJB 1D0MA 1FN5A 4NHQA 1V7SA 1OUHA 135LA 3B0KA 1GFAA 1LZCA 5E4PA 1UIEA 5KXWA 4DDAA 5LAFA 2I25L 3AW7A 1GAYA 1LMCA 1YL0X 3CQLA 1HELA 1NKHA 1HEOA 1VDSA 1EQEA 2Y8PA 2D4KA 2Z12A 3AZ4A 3F6ZA 3P66A 4YOPA 4H9FA 4XYYA 1TEWA 1QDTA 4H8ZA 2W1XA 2WARA 4DD1A 1A4VA 4FJRA 1BB5A 5KY1A 1ZMYL 1VEDA 1LMPA 1EQ4A 1LKRA 2W1LA 7LYZA 3N9EA 4L41A 1LSNA 3FI7A 1JKDA 3WPJA 194LA 5B06A 1C43A 1JTPL 1LMTA 4NIJA 1NBYC 5KXRA 1IR8A 4WMGA 1BHZA 3WH1A 3AYQA 1UIAA 3WU8A 1XSFA 1AT5A 1LTMA 3BKHA 4N1EI 5AMYA 1HEQA 5DLAA 5APDA 5A3EA 4IASA 1BB7A 3TMVA 4ET8A 1UIBA 4C5FA 1LJHA 4ZEEA 6LYZA 4TSCA 1YL1X 4NGZA 4H93A 2ZNWY 4TUNA 5HLLA 1GBWA 1HMKA 1C7PA 1F6SA 4H8YA 5LVHA 3WPLA 133LA 4OWCA 1I1ZA 1HFXA 3AGHA 4LT3A 4I8SA 4M6DA 2BLYA 2DQHY 1YAOA 1GD6A 1PS5A 1XFPL 3LHMA 2XBRA 4C3WA 1QQYA 2DQEY 1C08C 1GFHA 1FLWA 1XEJA 4Z98A 4ETDA 1LHIA 2HU1A 3EO5A 4OWHA 2MEGA 1LHLA 5LVKA 1LSZA 4DD7A 1J1OY 5M1YA 1IVMA 1G7MC 2EPEA 1LKSA 1RJCB 4MR1A 3WW6A 1HF4A 1MELL 3N9AA 3HFMY 5IDDA 3TMWA 4XJIA 3W6CA 3WVYA 4B4EA 4HPEA 1REXA 3CT0A 2YBNA 4DWXA 5LYMA 2BQJA 1OUGA 3IJVA 4HV1A 4DD9A 1NDMC 5F9UA 1HENA 3WYHA 1BVXA 1UIDA 1WVVA 4DD3A 1T3PA 1UIHA 1VDTA 1T6VL 1IWXA 1KIQC 3AZ6A 2BLXA 1B9OA 4QY9A 2H9JA 1WQPA 1GEZA 1QTEA 1HNLA 1BVKC 1LSPA 5APEA 3GXKA 1FKVA 1LYSA 1LJJA 1DXJA 2HEAA 3W6AA 5JENB 1GFUA 1IR7A 5LA8A 1LZ6A 2EKSC 1LJKA 1D6QA 1W6ZA 2G4PA 4GN5C 4TTDA 4U3XB 4RDSA 4OW1A 2W1MA 5T3FA 1LAAA 4N1CC 4RLMA 2ZILA 1I20A 4NGYA 4PHIA 3WUMA 2B5ZA 1H87A 5B07A 3LZTA 2ZQ3A 4WM4A 3TMXA 4OWAA 4NSHA 2BQEA 4WM5A 1QSAA 4FDYA 4GLVA 5LXWA 3VWOA 4H9EA 1GB5A 2HTXA 3B0IA 4IJ4A 4NGKA 3ZVQA 154LA 3WUNA 1AKIA 1TCYA 2BAAA 1GE2A 1IR9A 1B7PA 1C10A 1GB6A 1HSXA 4O34A 1JIYA 5KXZA 1IC4Y 4BS7A 1B7NA 4LFXA 1IY3A 1YAPA 4H9CA 1XEIA 4B49A 5B59A 4AGAA 3M18B 2YBMA 4I0CA 1GEVA 3G3BB 5D5CA 6LYTA 2RSCA 3HBDA 1JTTL 1GE0A 1QIOA 4WM6A 5KXMA 4OOTA 4WM1A 1UA6Y 2Z2FA 193LA 3BKVA 3EBAB 4NSJA 4ETBA 1LOZA 2VB1A 3P65A 4XADA 1IWZA 4WLTA 5L3IA 2MEAA 2LHMA 2F4AA 1NMMA 1LJEA 1FLQA 3ZEKA 1LZRA 1C46A 5KXLA 1RI8B 1GBOA 4M4OA 1CKDA 1TAYA 2Z18A 1NDGC 4XJDA 2FBDA 5FEKA 5HQ1A 1QUTA 2XTHA 1IX0A 2XBSA 5KJ9A 4H9IA 1VDQA 4CGEA 4WM3A 1GBYA 1GB9A 1GFEA 4G4HA 2H5ZA 2LYZA 132LA 1EL1A 1IWTA 1JKAA 1RE2A 4H1PA 4DC4A 4WOAA 1JSEA 1LSDA 5KXXA 5C6IA 3WULA 4N0JA 1GF7A 1XGUC 1OUJA 2NWDX 1F10A 1HERA 3ATOA 1WQRA 3SP3A 5HMVA 1FKQA 1LSEA 1GPQC 1RCMA 4QDNA 1CKCA 1LSBA 2FYDA 3E3DA 4HPIA 1CKHA 3HBEX 1B2KA 1QSWA 1IP1A 1YAMA 3QE8A 1IP3A 1JSFA 1ZVHL 4WM2A 1D0LA 1LZDA 1IP6A 2YBJA 5I53A 1LZSA 4LYTA 5FDJA 2AUBA 3QY4A 2DQDY 5I4YA 1O23A 2CJLA 4BAPA 1ZVYB 3RU5A 3WPKA 4CFPA 2YDGA 2CDSA 4H9BA 5I54A 2CGIA 3WL2A 1LHJA 3LYMA 4NY5A 5I5QA 1IOCA 3LN2A 1BGIA 5LVJA 207LA 1CNSA 1SQ2L 4B4IA 153LA 4WO6A 1N4FA 4G4CA 5KXNA 1XGTC 1WQQA 3MGWA 2ZYPA 4NGIA 2HUBA 4NGVA 5DM9A 1XEKA 1IY4A 4HJYA 4E3UA 1BWJA 5C6JA 2I6ZA 4W94A 1UICA 4WLXA 4MSTA 2MEHA 2F30A 1JJ3A 1LYZA 3T6UA 1OP9B 9LYZA 1GXXA 1YAQA 1D9UA 1UUZC 2XJWA 4CJ2A 3CSQA 3K3TA 4ET9A 4DDCA 4GLAA 1JWRA 3CT5A 1QDRA 1IORA 2D4IA 1CJ9A 3A8ZA 2LZ2A 1GB0A 1LZ5A 1UCOA 4KXIA 4YEOA 1AT6A 1IP5A 4H92A 1LYYA 3P68A 5LYTA 1JKCA 1JUGA 1LYOA 3AB6A 3J4GA 2BQHA 1UIFA 1YKXX 1I56A 1DI4A 2BQOA 1DKJA 3LZ2A 1RFPA 1WQOA 5KXSA 2IFFY 4YENA 4G49A 5I4XA 1GBZA 1LPIA 5LYZA 1YROA 3EMSA 5J7CA 2GV0A 4HTQA 3ZVQB 4H94A 5K7OA 4WLDA 4PPOA 1HFYA 1AZFA 3B0OA 2Z39A 4HV2A 3QNGA 1VATA 1YILA 1CJ6A 2BQGA 1BWIA 1MLCE 3IJUA 3GXRA 4NGOA 1UBZA 5KXTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OWBA 4LYCA 3G3WA 239LA 1L36A 1PQMA 2RAYX 1CJ7A 1B6IA 1KXXA 1L48A 1FLUA 4BADA 4IAPA 3TMUA 3WVXA 1G7LC 5ILFA 1L00A 4WL6A 1WTNA 3A93A 258LA 1IO5A 155LA 1L57A 1L42A 1HFZA 1IIZA 3G3XA 1LW9A 4NWHA 4NFVA 5II3A 2D6BA 4HJVA 4RW2A 5B05A 1LZ9A 1L35A 2HUMA 1KNIA 146LA 3HU9A 3GUNA 3OJPA 1GE4A 1GFRA 3WW5A 1PQOA 3A6CY 1CTWA 3CSZA 2B73A 2HECA 250LA 2RB2X 4XJFA 2MEFA 1IWYA 1ZWNA 2A7FA 1LZBA 1B7RA 4CFOA 252LA 1E8LA 2MEBA 1FDLY 1GXV2 1C63A 1BWHA 2C8OA 2LYMA 2BQAA 3CSRA 1AM7A 1GF5A 2BQFA 142LA 1OVHA 4BAFA 1C6MA 2RB0X 4NG1A 1L06A 1JEFA 3HH3A 1GBXA 1JKBA 1C6LA 4ARJA 3FE0A 4WG7A 2MEIA 3F8VA 1NQIA 3P64A 1LHHA 2BQNA 110LA 2B6TA 4HSFA 1L73A 1OUFA 1P36A 3SBBC 4RW1A 2F4GA 1GBSA 3TXEA 4HTKA 168LA 4XJGA 113LA 2HEBA 4NGLA 225LA 3HT6A 226LA 4RLNA 3CDRA 4DD0A 182LA 4WL7A 4HJZA 1B0DA 4Z46A 171LA 1OUEA 4R0FA 2Z19A 139LA 5FSTA 1B7SA 1KY1A 2IHLA 1LJGA 140LA 2ZWBA 2A4TA 1L44A 3ODUA 3WU9A 1OYUA 3C8SA 1NBZC 4J1AA 219LA 3TXFA 5A3ZA 1VFBC 4II8A 1F0WA 2BPUA 1HEWA 243LA 6LZMA 3C81A 4EJ4A 1BQLY 1GFJA 174LA 166LA 3AJNA 1C6FA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1OUD A;  3G3A B;  4OWB A;  2ZQ4 A;  3HBH A;  4LYC A;  4ML7 A;  1BB3 A;  1IWU A;  1H6M A;  3A3R X;  1GAZ A;  2F2N A;  1W08 A;  4OWE A;  1HEM A;  2DQC Y;  1XGQ C;  2PC2 A;  1CJ7 A;  1GE1 A;  1LJF A;  1KXX A;  2A7D A;  4ETE A;  1BB4 A;  1FLU A;  4UWV A;  4BAD A;  1V7T A;  3TMU A;  3WVX A;  2BQC A;  1GB3 A;  1OUB A;  1G7L C;  1GE3 A;  5ILF A;  4WL6 A;  1A2Y C;  5L9J A;  1WTN A;  1QUS A;  3A93 A;  2BQL A;  4NHS A;  2YSS C;  1YKZ X;  1IO5 A;  5F14 A;  1YQV Y;  3WUA A;  4GCD A;  2D4J A;  3W6F A;  2C8P A;  1HFZ A;  1LSM A;  4P2E A;  1IIZ A;  5EBH A;  1LSY A;  1J1P Y;  4H90 A;  4NWH A;  3ULR A;  3RZ4 A;  4LGK A;  1WVU A;  5FEL A;  2EQL A;  5C6L A;  4EOF A;  1GWD A;  4NFV A;  3W3E A;  2EIZ C;  4NGW A;  1LZY A;  3B72 A;  2BQM A;  1DQJ C;  4HP0 A;  5II3 A;  4NHI A;  4DDB A;  1GF6 A;  1LHM A;  2D6B A;  1ZV5 L;  4CHX A;  3AGG G;  5HNL A;  4HJV A;  4RW2 A;  4Z3M A;  5B05 A;  4H91 A;  1LZ9 A;  4Z41 A;  1LZT A;  4GN4 A;  3OJP A;  3TXD A;  5FHW A;  1GE4 A;  1GFR A;  1VAU A;  4GCF A;  4XJH A;  4KL7 A;  4LYB A; 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 1D0L A;  1LZD A;  1IP6 A;  2YBJ A;  5I53 A;  1LZS A;  4LYT A;  5FDJ A;  2AUB A;  3QY4 A;  2DQD Y;  5I4Y A;  1O23 A;  2CJL A;  4BAP A;  1ZVY B;  3RU5 A;  3WPK A;  4CFP A;  2YDG A;  2CDS A;  4H9B A;  5I54 A;  2CGI A;  3WL2 A;  1LHJ A;  3LYM A;  4NY5 A;  5I5Q A;  1IOC A;  3LN2 A;  1BGI A;  5LVJ A;  207L A;  1CNS A;  1SQ2 L;  4B4I A;  153L A;  4WO6 A;  1N4F A;  4G4C A;  5KXN A;  1XGT C;  1WQQ A;  3MGW A;  2ZYP A;  4NGI A;  2HUB A;  4NGV A;  5DM9 A;  1XEK A;  1IY4 A;  4HJY A;  4E3U A;  1BWJ A;  5C6J A;  2I6Z A;  4W94 A;  1UIC A;  4WLX A;  4MST A;  2MEH A;  2F30 A;  1JJ3 A;  1LYZ A;  3T6U A;  1OP9 B;  9LYZ A;  1GXX A;  1YAQ A;  1D9U A;  1UUZ C;  2XJW A;  4CJ2 A;  3CSQ A;  3K3T A;  4ET9 A;  4DDC A;  4GLA A;  1JWR A;  3CT5 A;  1QDR A;  1IOR A;  2D4I A;  1CJ9 A;  3A8Z A;  2LZ2 A;  1GB0 A;  1LZ5 A;  1UCO A;  4KXI A;  4YEO A;  1AT6 A;  1IP5 A;  4H92 A;  1LYY A;  3P68 A;  5LYT A;  1JKC A;  1JUG A;  1LYO A;  3AB6 A;  3J4G A;  2BQH A;  1UIF A;  1YKX X;  1I56 A;  1DI4 A;  2BQO A;  1DKJ A;  3LZ2 A;  1RFP A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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