3ZVQA

Crystal structure of proteolyzed lysozyme
Total Genus 23
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
23
sequence length
70
structure length
70
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Salt-Assisted Religation of Proteolyzed Glutathione-S-Transferase Follows Hofmeister Series.
pubmed rcsb
molecule keywords LYSOZYME C
molecule tags Hydrolase
total genus 23
structure length 70
sequence length 70
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-07-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3zvqA00
1D0KA 1GWDA 1JSEA 3AW6A 3A93A 5A3ZA 8LYZA 6LYTA 1HF4A 1XEIA 3G3AB 1UCOA 4UWVA 2HTXA 3ULRA 1IOCA 1HNLA 4NFVA 153LA 4Z41A 1YANA 1HFZA 1TBYA 2H9JA 5LAFA 1AM7A 1REYA 1GAZA 2HEAA 1C45A 4XENA 2MEAA 1LYSA 4WO6A 1HEQA 3B0IA 4G4CA 1LAAA 3CB7A 1RJCB 1JEFA 1LSAA 2BQNA 4HJZA 4BAPA 5LYTA 2BQCA 1P2CC 4I8SA 2YBHA 1B0DA 1NMMA 1BVXA 1UIGA 3E3DA 4N1CC 3EMSA 2MEEA 5ILCA 1NKHA 4FJRA 1D6PA 2BQKA 1DQJC 4OWEA 4HP0A 1SLYA 4H93A 4J1AA 4B0DA 1RI8B 1XSFA 4H9HA 4LT2A 132LA 2F4AA 2D6BA 1UACY 1G7MC 1IOSA 1LSEA 4M6DA 1JPOA 1UIFA 1LZ5A 1GF3A 1GE3A 1XGQC 2DQGY 2LHMA 3CSZA 3AYQA 4ML7A 3N9CA 4WM1A 1IP6A 2DQJY 1XEKA 1DKKA 4RLMA 5KY1A 193LA 1CKFA 4RLNA 2BQGA 1NDMC 1CKGA 1FLQA 3A3QA 4WLYA 1UUZC 3W6AA 1OUAA 2ZNWY 2BQBA 4NSIA 1LSFA 1XGUC 2ZQ4A 1REMA 4NGZA 3A95A 1B7SA 1H87A 1LTMA 1UIBA 5KKIA 4PJ2C 1WQQA 1ZV5L 1HMKA 3TXIA 1IR8A 1HEWA 3W6DA 1G7IC 2Z2FA 5B1FA 1LSYA 4TTDA 3WXTA 1LZ8A 3G3BB 4MSTA 2FYDA 1JUGA 1JKBA 1YQVY 1LZ1A 5KXZA 1IY3A 5LA8A 1UIAA 4NHQA 3QY4A 4KT3A 2HU3A 5C6IA 1D0LA 1LYZA 3ZEKA 2MEHA 1LZAA 1T3PA 4TWSA 1G7JC 5APEA 1GF6A 4XADA 3W6EA 5KKJA 1BB6A 1IWWA 5KXNA 4B4EA 4H1PA 1GF8A 1DI5A 4NHIA 1LZGA 2Z19A 5FDJA 1LHIA 1IOTA 5KXOA 5D5CA 4AXTA 1VDSA 1REXA 4M4OA 1B7OA 5DLAA 1YIKA 1IWTA 5F14A 1FDLY 4LYZA 4OWAA 1HELA 1NQIA 1UIDA 4DD1A 4X3BA 1DI3A 1DKJA 4WM2A 1OUFA 3J4GA 1GF7A 1LJHA 4ZFPA 1GB9A 3B6LA 3B72A 5J7CA 1LSBA 1BB7A 2W1XA 2ZWBA 2LYMA 2ZIJA 4N9RA 3WPKA 3WUNA 1GB5A 4N1EI 3N9EA 4N8ZA 3WH1A 1FLYA 2BPUA 3RZ4A 3A6BY 4LGKA 1RCMA 1GFVA 2W1LA 4NGOA 1YAMA 4Z46A 2A7FA 4WLDA 2HU1A 9LYZA 2LZTA 5KXYA 3P66A 5HLLA 3AGHA 1CJ6A 2BQFA 5IHGA 1GB6A 5KXSA 3RT5X 1EL1A 3TXJA 4ETDA 1YAPA 1ZVHL 1JSFA 1LZ4A 1IP7A 4GCDA 4NSGA 1GBXA 1OUBA 1N4FA 4LFPA 1CNSA 4E3UA 1OP9B 1YL1X 1LJFA 2F30A 5KXTA 2YBNA 2Z38A 1REZA 4H9FA 1LMTA 4OW1A 4PGJB 4WO9A 1OUHA 5AMYA 3WL2A 4ETBA 2Z39A 3ZVQB 2W1MA 4QEQA 3FI7A 1WQOA 1D0MA 4B4IA 2ZNXY 4UWUA 1LJ3A 1LSMA 4TUNA 1OUEA 1GB2A 2HEEA 1GFAA 3W3EA 4H9CA 2DQAA 1SQ2L 1QQYA 1JJ1A 2BQJA 3T6UA 2N5ZA 2Q0MX 1IC4Y 1LMNA 1JITA 1VFBC 3A3RX 1IP4A 4CGEA 5LAGA 3OK0A 1XGPC 1LHHA 3B0KA 1QUTA 2G4NA 1EQEA 2LZ2A 1OUIA 1GEVA 2PC2A 4XJDA 1WQNA 1WQMA 3WU7A 3WXUA 4HJVA 4QGZA 1B5WA 1J1PY 3AZ7A 3LYTA 3W6FA 1B9OA 5JENB 1IWXA 2EQLA 2I26L 4PPOA 1GD6A 1OUGA 1RE2A 3WW5A 1LZYA 5I53A 4NWEA 133LA 5LYMA 1IP5A 5KXMA 4HV2A 5L3HA 1LYOA 2FYCA 4IJ4A 4NGYA 3A96A 4XYYA 1GF5A 1B7NA 1GEZA 5LVKA 1VEDA 1GF4A 4UWNA 3A91A 1GHLA 3VWOA 2XBSA 3WYHA 3A92A 1NHEA 3AZ5A 3D9AC 4GLAA 4NGJA 4WG7A 4BS7A 2XBRA 2YBMA 3TMWA 4GN4A 2AUBA 3TXHA 1LSDA 1GXV2 1HFYA 1WQRA 2ZQ3A 2A7DA 4WLXA 3GXKA 1QDRA 5K7OA 5KXKA 5APFA 2DQIY 4IATA 1WQPA 1JJ3A 1YL0X 4R0FA 3TXGA 1GBOA 1B5YA 4WL6A 1GE0A 1AT6A 2ZIKA 1LHKA 4HSFA 4QY9A 4NSHA 1GBZA 1GFTA 1A4VA 1LZSA 1OUDA 2DQCY 2Z18A 4DC4A 134LA 1QUSA 1GBSA 3LN2A 3TXBA 1XGTC 2HEDA 4HPIA 1LHLA 1CKHA 1JTOL 2BQIA 2HUBA 3F6ZA 1HFXA 4DD2A 4YM8A 1DXJA 5FCPA 5KXWA 4NHSA 1IORA 4D9ZA 4OWCA 1XGRC 4TX7A 1TAYA 2D4JA 1LJJA 4NGLA 4RDSA 1IO5A 2Z12A 5LVIA 3QNGA 1C43A 1JIYA 4H9EA 7LYZA 1LKSA 3P65A 4OOOA 5DM9A 4YF2A 5ILFA 4CJ2A 4KPMA 2BLYA 2WARA 3A67Y 5E9RA 5B06A 1GDXA 3AGGG 2C8PA 5L3IA 1CKCA 4CFOA 1B5UA 3WU9A 2G4QA 3P4ZA 3T36A 1LJNA 1TDYA 4HTNA 1LZNA 2BQOA 208LA 1QSAA 1JKCA 2B5ZA 4XJIA 1IC5Y 1BVKC 1C46A 1GFJA 3K3TA 1NF5A 1LSCA 1FBIX 2HEFA 4FDYA 4CHXA 2DBTA 4XJBA 1GFEA 3RW8A 1GBWA 4WM6A 2W1YA 2CGIA 4GCCA 1GFGA 4C5FA 4HJYA 5I4XA 2FBDA 4ETEA 1FLUA 2BAAA 2LYOA 1G7HC 5II3A 1LHMA 2GV0A 1JTPL 1I20A 1LJKA 4LYMA 4C3WA 4R6CA 4WM3A 4DYGA 4XJHA 1GE4A 2ZYPA 4KL7A 1IVMA 1IWVA 1B5VA 4J1BA 3P68A 135LA 5FELA 4NGVA 2BQLA 2I6ZA 4GN3A 4NGWA 2DQFC 5IDDA 1CJ9A 1UC0A 1GB8A 5L9JA 5C6JA 3WVYA 1EQ4A 2BQAA 4B1AA 4G49A 1B5ZA 1LZRA 1YKXX 1BWHA 1NBYC 2CJLA 1T6VL 2BLXA 4XN6A 3WULA 4H92A 4RW1A 1LKRA 1D6QA 1BGIA 1TCYA 1VDQA 5DN4A 5F9UA 1LJIA 4NIJA 3M3UA 1GB3A 4WLTA 4BAFA 4GLVA 2ZILA 5HMVA 3N9AA 1JHLA 3EBAB 4NHTA 4H9BA 4GN5C 1LMPA 1LSNA 1C7PA 3LYZA 4W94A 1HENA 1LMCA 1GXXA 1OQMA 4GCFA 1LZTA 1RFPA 4P2EA 1MELL 2DQDY 3BKHA 3A94A 1LJ4A 4DD7A 2YBJA 3IJVA 3EO5A 3AZ4A 4TSCA 1GFRA 3AGIA 1LSZA 4WG1A 1LZDA 2YBIA 1FN5A 4NEBA 5LVGA 2BQMA 1LMAA 3A6CY 4HPEA 4LYTA 3WU8A 1IWZA 1JISA 4U3XB 5KXLA 5KXXA 4OWBA 2D91A 4TSBA 1B7PA 1ZVYB 1B7MA 2ZYCA 4WMGA 4XJFA 3J6KA 5I4WA 4QDNA 1YKZX 2EPEA 3D3DA 1HMLA 5FEKA 2DQEY 1C10A 1IC7Y 2EKSC 4WL7A 3ZVQA 4YEMA 1UIHA 2YSSC 1WVVA 1ZMYL 2DKVA 2HEBA 1J1XY 1CKDA 3FE0A 1YILA 4PHIA 1QSWA 1Z55A 1V7TA 2IHLA 3EXDA 1JKDA 1O23A 2EIZC 3CT0A 3QE8A 5APCA 2Z2EA 4AGAA 1FKVA 1GDWA 4LYCA 1W08A 3CQLA 4DD0A 4G4HA 1WTMA 1LYYA 1LJGA 1XEJA 3HBDA 1LZEA 4DD3A 1DZBX 4RW2A 3WPJA 3KAMA 5I54A 1HERA 1G7LC 154LA 1UA6Y 1H6MA 1GE1A 1B7RA 1W6ZA 4OOTA 4DDBA 5M1YA 4LT0A 5LXWA 1IY4A 2MEGA 1KXYA 2RSCA 5KJ9A 3M18B 3P64A 2D4KA 4J7VA 5F16A 4BADA 4YEOA 1GBYA 3HBEX 5DN5A 2MEIA 1ALCA 1HSXA 5C6LA 5HNCA 4DWXA 4H8YA 1IP3A 3WW6A 3GXRA 1GPQC 3IWRA 1E8LA 3AZ6A 4I0CA 1BHZA 4ET8A 1YKYX 4IASA 4NHPA 4H9IA 5KXRA 2H9KA 4G9SA 1XFPL 1JJ0A 1KIQC 1VAUA 5HQ1A 1HSWA 2Z37A 1FLWA 3SP3A 1LZ9A 3OJPA 1IR7A 5F9XA 3AW7A 3CSRA 1GFUA 1CJ8A 4H90A 5EBHA 1WVUA 4NWHA 5HNLA 3HFMY 1INUA 5E4PA 1UIEA 3ATOA 5LA5A 3LHMA 4EOFA 1FKQA 3WUAA 1IWYA 5LVJA 4LYOA 5FHWA 1KIPC 2BQEA 1EQ5A 4EMNA 2XTHA 3LZ2A 1F10A 5LVHA 3TXEA 1GFKA 4ZIXA 1GF0A 4H94A 3MGWA 5B1GA 1DPWA 1IOQA 1QTEA 1VDTA 4L41A 1GF9A 3A90A 5I5QA 3AB6A 4G4BA 1JTTL 1IWUA 2H5ZA 3B0OA 1B7QA 4LT1A 4WM4A 1NBZC 1LJEA 4Z98A 3LYMA 1AT5A 1BQLY 2MEDA 2HECA 2YBLA 4ETAA 3BKVA 3TXKA 1NWGA 5I4YA 1UBZA 4O34A 1F6SA 5IELA 1GB7A 1NDGC 2DQHY 4YENA 1LPIA 3W6CA 4NY5A 4B4JA 4DT3A 1B2KA 2YVBA 1B5XA 2MEFA 3CSQA 3IJUA 3LYOA 4NGKA 4XJGA 4A7DA 1JKAA 1YROA 2F2NA 2CWIA 1IR9A 1IEEA 4KXIA 1D9UA 1VDPA 2YDGA 5LINA 1LSGA 5APDA 1BB5A 2Y8PA 4ANRA 3A8ZA 2FBBA 4LZTA 1AKIA 1KXWA 3TMUA 4PRQA 4CFPA 1OUCA 4NG1A 5F81A 5B05A 4W96A 1QTKA 4H8XA 1LCNA 1YAOA 4LT3A 4NG8A 5D5FA 3RU5A 194LA 1QIOA 1KIRC 4WOAA 1DPXA 5A3EA 4MCKA 4HTQA 1BWIA 1KXXA 2IFFY 4H9AA 5DL9A 1HHLA 4ETCA 3WVXA 3AJNA 5KXPA 1LOZA 2BQHA 1JWRA 1WTNA 4H91A 3HBHA 1CJ7A 1IP1A 4DD9A 1BWJA 1F6RA 1IP2A 1OUJA 3ATNA 3RNXA 207LA 5FSTA 3WPLA 3TMVA 3CT5A 1LZCA 2D4IA 1TEWA 4DDAA 4H8ZA 3WUMA 1UICA 2XJWA 1BB3A 1I56A 2F4GA 2MEBA 2NWDX 1DI4A 4WM5A 1AZFA 1J1OY 2BQDA 2VB1A 1LZBA 5B07A 5LYZA 1HC0A 4II8A 5T3FA 2C8OA 1GE2A 1PZYA 1GFHA 1GAYA 3LZTA 4GCBA 2G4PA 2X0AA 1F0WA 4NGIA 4MR1A 1IX0A 4B49A 3TMXA 4J0LA 4OWHA 3CT1A 5LIOA 3TXDA 1QDTA 4ZEEA 1B7LA 4N5RA 1I1ZA 1V7SA 1YAQA 4LYBA 4N0JA 1PS5A 4HV1A 1C08C 3W6BA 2CDSA 1LMOA 1LZ6A 1A2YC 3A34A 4LFXA 1IIZA 1LHJA 1LSPA 1LMQA 3WMKA 1BB4A 1MLCE 1HEMA 1GB0A 2LYZA 4ET9A 5B59A 6LYZA 2I25L 4NSJA 3TXFA 1HEPA 4HTKA 4PRUA 4GCEA 4YOPA 1VATA 5HMJA 4Z3MA 1HEOA 4DDCA 2MECA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1D0KA 2RB1X 1K28A 3G3AB 4UWVA 3ULRA 1HFZA 1TBYA 5LAFA 1AM7A 1GAZA 3HTDA 1L23A 4XENA 1LYSA 1G0QA 1L79A 2BQNA 3GUOA 2YBHA 3E3DA 4EPIA 4H93A 1UACY 1LSEA 1JPOA 1UIFA 1LZ5A 1L16A 3CSZA 1IVMA 3N9CA 1XEKA 1DKKA 126LA 4W52A 1L01A 2ZQ4A 1G06A 1LTMA 1PQMA 1LYGA 4PJ2C 1WQQA 1ZV5L 3TXIA 1L04A 1HEWA 5B1FA 1L07A 4K5YA 1JKBA 1UIAA 158LA 199LA 4NHQA 2HU3A 1LYFA 5C6IA 1D0LA 111LA 4ZPUA 5KKJA 5KXNA 1CV0A 1L08A 4NHIA 2Z19A 1CVKA 5KXOA 5D5CA 1B7OA 1IWTA 4LYZA 1HELA 4X3BA 1DKJA 1L89A 1GB9A 1LSBA 2LYMA 4YXAC 184LA 168LA 3WH1A 3RZ4A 3A6BY 1RCMA 1GFVA 4NGOA 1C6BA 2HU1A 1ZURA 1OV5A 2RAZX 3RT5X 1EL1A 4ETDA 4NSGA 3DN4A 1LI3A 163LA 2YBNA 1REZA 1QTDA 1LYDA 1WQOA 4B4IA 1OUEA 1GB2A 1GFAA 3C80A 1QQYA 3SB9A 2B6XA 2Q0MX 1DYCA 3HT9A 5LAGA 4XJDA 3WU7A 1WQMA 1P3NA 1B5WA 1J1PY 3AZ7A 1B9OA 3JR6A 3HDFA 159LA 2EQLA 1P2LA 3DNAA 1L48A 1OV7A 5LYMA 1IP5A 2OU9A 5L3HA 3L2XA 1LYOA 4IJ4A 4NGYA 4XYYA 4I7RA 1B7NA 1GEZA 5LVKA 3C7ZA 1L30A 155LA 2XBSA 3WYHA 4GLAA 1L13A 4NGJA 248LA 1C6QA 1LPYA 1WQRA 4WLXA 2RB2X 1P37A 4WL6A 1GE0A 2ZIKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1D0K A;  1GWD A;  1JSE A;  3AW6 A;  3A93 A;  5A3Z A;  8LYZ A;  6LYT A;  1HF4 A;  1XEI A;  3G3A B;  1UCO A;  4UWV A;  2HTX A;  3ULR A;  1IOC A;  1HNL A;  4NFV A;  153L A;  4Z41 A;  1YAN A;  1HFZ A;  1TBY A;  2H9J A;  5LAF A;  1AM7 A;  1REY A;  1GAZ A;  2HEA A;  1C45 A;  4XEN A;  2MEA A;  1LYS A;  4WO6 A;  1HEQ A;  3B0I A;  4G4C A;  1LAA A;  3CB7 A;  1RJC B;  1JEF A;  1LSA A;  2BQN A;  4HJZ A;  4BAP A;  5LYT A;  2BQC A;  1P2C C;  4I8S A;  2YBH A;  1B0D A;  1NMM A;  1BVX A;  1UIG A;  3E3D A;  4N1C C;  3EMS A;  2MEE A;  5ILC A;  1NKH A;  4FJR A;  1D6P A;  2BQK A;  1DQJ C;  4OWE A;  4HP0 A;  1SLY A;  4H93 A;  4J1A A;  4B0D A;  1RI8 B;  1XSF A;  4H9H A;  4LT2 A;  132L A;  2F4A A;  2D6B A;  1UAC Y;  1G7M C;  1IOS A;  1LSE A;  4M6D A;  1JPO A;  1UIF A;  1LZ5 A;  1GF3 A;  1GE3 A;  1XGQ C;  2DQG Y;  2LHM A;  3CSZ A;  3AYQ A;  4ML7 A;  3N9C A;  4WM1 A;  1IP6 A;  2DQJ Y;  1XEK A;  1DKK A;  4RLM A;  5KY1 A;  193L A;  1CKF A;  4RLN A;  2BQG A;  1NDM C;  1CKG A;  1FLQ A;  3A3Q A;  4WLY A;  1UUZ C;  3W6A A; 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 4LZT A;  1AKI A;  1KXW A;  3TMU A;  4PRQ A;  4CFP A;  1OUC A;  4NG1 A;  5F81 A;  5B05 A;  4W96 A;  1QTK A;  4H8X A;  1LCN A;  1YAO A;  4LT3 A;  4NG8 A;  5D5F A;  3RU5 A;  194L A;  1QIO A;  1KIR C;  4WOA A;  1DPX A;  5A3E A;  4MCK A;  4HTQ A;  1BWI A;  1KXX A;  2IFF Y;  4H9A A;  5DL9 A;  1HHL A;  4ETC A;  3WVX A;  3AJN A;  5KXP A;  1LOZ A;  2BQH A;  1JWR A;  1WTN A;  4H91 A;  3HBH A;  1CJ7 A;  1IP1 A;  4DD9 A;  1BWJ A;  1F6R A;  1IP2 A;  1OUJ A;  3ATN A;  3RNX A;  207L A;  5FST A;  3WPL A;  3TMV A;  3CT5 A;  1LZC A;  2D4I A;  1TEW A;  4DDA A;  4H8Z A;  3WUM A;  1UIC A;  2XJW A;  1BB3 A;  1I56 A;  2F4G A;  2MEB A;  2NWD X;  1DI4 A;  4WM5 A;  1AZF A;  1J1O Y;  2BQD A;  2VB1 A;  1LZB A;  5B07 A;  5LYZ A;  1HC0 A;  4II8 A;  5T3F A;  2C8O A;  1GE2 A;  1PZY A;  1GFH A;  1GAY A;  3LZT A;  4GCB A;  2G4P A;  2X0A A;  1F0W A;  4NGI A;  4MR1 A;  1IX0 A;  4B49 A;  3TMX A;  4J0L A;  4OWH A;  3CT1 A;  5LIO A;  3TXD A;  1QDT A;  4ZEE A;  1B7L A;  4N5R A;  1I1Z A;  1V7S A;  1YAQ A;  4LYB A;  4N0J A;  1PS5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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