3ZVQB

Crystal structure of proteolyzed lysozyme
Total Genus 13
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
13
sequence length
58
structure length
58
Chain Sequence
SRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Salt-Assisted Religation of Proteolyzed Glutathione-S-Transferase Follows Hofmeister Series.
pubmed rcsb
molecule keywords LYSOZYME C
molecule tags Hydrolase
total genus 13
structure length 58
sequence length 58
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-07-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3zvqB00
3TXIA 1LHKA 5KXZA 1AKIA 1LKRA 5I4YA 1FN5A 1IY4A 1HC0A 1PZYA 1RI8B 2MECA 4ETAA 1IWVA 1SLYA 2BQDA 2FYCA 1XEKA 2DQFC 5ILFA 1GAZA 4WM1A 1TAYA 3EMSA 1IR9A 4WMGA 2ZIJA 4II8A 2BQLA 1HMLA 3AGIA 4TTDA 4XJGA 1VEDA 2Z2EA 4ETCA 4KT3A 1IP4A 4OW1A 4LFXA 1C7PA 3J4GA 1JUGA 3TXKA 5I5QA 1B5UA 5LVIA 1GBSA 3QY4A 5HQ1A 1W08A 1XGTC 1JTTL 4MR1A 4DC4A 1LZTA 1LZYA 5FEKA 3CSQA 3WMKA 4ZFPA 3AJNA 4G4BA 5KXRA 3W6AA 4DYGA 4PRQA 4NGZA 1NWGA 1DXJA 1J1PY 5KXLA 1YKZX 1GFVA 1QQYA 3OK0A 4N1CC 1HSXA 2D4IA 2BAAA 2LZ2A 4HPIA 5B06A 1TEWA 1XFPL 2YDGA 5FELA 1KIRC 3WXTA 2FYDA 1T6VL 4YENA 3A6CY 2CDSA 1PS5A 4H92A 5LYMA 3A96A 4WOAA 3RU5A 3N9AA 4CFOA 1UIBA 2BQKA 1IP5A 1GBWA 1IX0A 2C8PA 1LJJA 1LMPA 2I26L 4RDSA 207LA 2Z19A 5JENB 4HP0A 2LYMA 1C45A 4WM3A 4XADA 2ZNXY 1LZ5A 1A4VA 4HSFA 2Z39A 1HERA 4G49A 1D6QA 2XTHA 2ZIKA 2D4JA 2ZNWY 2BQFA 1LSEA 1IP6A 1FBIX 1XGPC 4W94A 1B0DA 1LHHA 1GWDA 1ZVYB 2F30A 1LJ4A 1JSEA 1LSMA 2LHMA 1LJEA 193LA 1AZFA 2BPUA 4NSGA 3ZVQB 4BAFA 5I4XA 3LZ2A 4NGVA 1CJ6A 1CKFA 2W1MA 3P64A 5HNCA 3A90A 2B5ZA 4FJRA 1LYYA 3W6DA 5KKIA 2I6ZA 3A34A 4RLMA 4OOOA 1BB6A 2DQIY 5LAGA 5IHGA 1TCYA 1BGIA 4L41A 4PRUA 1BQLY 4UWNA 1V7TA 1T3PA 2YBLA 5I53A 3WUAA 4WO6A 1HELA 1GPQC 2BQCA 4BAPA 1IWTA 1QDRA 1UC0A 2H9JA 4ZEEA 3B72A 5LAFA 4LYTA 4ETBA 4H8ZA 5A3EA 2EPEA 1D0MA 1IR8A 1B2KA 135LA 4LYCA 1GFHA 3D3DA 1LMAA 5K7OA 4GCBA 2PC2A 4RLNA 1REYA 4NHSA 4J0LA 2BQJA 2CGIA 2HU3A 1CJ9A 4QGZA 2IFFY 4KXIA 1JSFA 1EQ5A 2YBNA 2Z12A 2MEHA 4NGJA 1DI3A 3CQLA 1GFAA 4Z98A 5LVGA 1IC7Y 1IOCA 5KXXA 2CJLA 2FBBA 2Q0MX 1I1ZA 2DQCY 1LSFA 3MGWA 1JKCA 4QEQA 1DZBX 4N8ZA 4WLXA 1NF5A 3F6ZA 3SP3A 4MSTA 3AZ5A 3CSRA 3HBDA 4WLDA 4NGYA 1IWWA 1XEJA 4ML7A 1WVVA 1GXXA 1NDGC 1VDSA 1JITA 1RFPA 4GN4A 5LA5A 1XEIA 1G7JC 1HNLA 1LJGA 3RT5X 1LZ1A 2DQGY 1QIOA 5KXNA 1QUTA 2F4AA 1REMA 2LYOA 5HMVA 1H87A 2GV0A 2MEAA 1LZSA 4NEBA 4H9AA 4DDAA 5DN4A 1GEVA 3EXDA 4B1AA 1HMKA 1EL1A 3P65A 1KIPC 2YSSC 5F9UA 1DPWA 1LZ9A 1LHJA 1OUDA 4UWUA 4NSJA 4NGKA 1AT6A 3AZ4A 4W96A 5L9JA 3W6EA 1AM7A 3WYHA 4CJ2A 5C6JA 5A3ZA 1OUGA 1IR7A 3P4ZA 4DD2A 1F6SA 3A92A 1JKDA 1LSGA 1JTPL 2LYZA 4H9IA 1FLWA 2F2NA 194LA 1GF4A 5D5FA 1UIAA 1NHEA 2BLYA 2XJWA 3ATNA 5E9RA 1YQVY 5KXPA 3TMXA 4RW1A 3CT1A 1KXYA 1GF7A 3FI7A 4DD3A 1ALCA 5E4PA 4YEMA 3AZ7A 1JHLA 1D9UA 3CSZA 4J1BA 1C08C 1GAYA 4GN5C 5II3A 1JPOA 2DQJY 1F0WA 1NQIA 2H9KA 5LVKA 3TMWA 1YL0X 6LYTA 5ILCA 4YF2A 4AXTA 1UIEA 2NWDX 4TUNA 1QSAA 4WL7A 4TSBA 3AGHA 4PJ2C 3TMUA 1DI4A 2HU1A 4N9RA 1YAQA 4X3BA 1LSNA 4H9EA 1KXXA 1IWYA 4GN3A 1NDMC 3WVXA 1LHMA 1VDPA 1N4FA 1OUHA 2BQHA 4WG1A 1YIKA 3B0KA 4GCFA 1HHLA 1B7NA 1GB6A 1UIDA 1GE2A 4A7DA 9LYZA 1WQMA 4MCKA 1JEFA 4GCDA 1JJ3A 1D0LA 4TX7A 1F6RA 4LYBA 3W6CA 2DQAA 3N9CA 3ZEKA 4PHIA 3TXGA 2EIZC 4FDYA 1EQ4A 2HEAA 4ETDA 5HLLA 2Z37A 4UWVA 1JISA 1OUCA 3AZ6A 4DD0A 1REXA 2BQGA 1JIYA 3HBEX 1EQEA 3E3DA 3A93A 3G3AB 3W6FA 1IO5A 4Z41A 3M18B 4HV1A 4WG7A 1FLYA 1GFTA 5M1YA 1SQ2L 2G4NA 1GB3A 4H91A 1QTKA 1IOQA 5DLAA 4B4EA 1YKXX 1CKCA 1GDWA 4NG8A 1CJ8A 4HPEA 1GB5A 1BWJA 1HFYA 1LMNA 1LZNA 1WQQA 2BLXA 1D0KA 2HTXA 2MEEA 4NHIA 1IWXA 1V7SA 5HMJA 2YBHA 1IWUA 1VDTA 1BVKC 4LT2A 1GDXA 1JTOL 2BQAA 1CJ7A 1FKVA 3N9EA 4RW2A 1BWIA 4XJDA 1B7PA 1O23A 1OUIA 1UACY 4NSHA 1VDQA 2Z38A 5F16A 5B1GA 4CHXA 1HENA 2BQEA 1BB3A 1QTEA 2A7FA 4H8YA 4YEOA 1LZBA 2X0AA 1GB9A 4G4CA 3G3BB 5KXKA 1LZGA 4C3WA 3B0IA 1LSYA 4WM4A 4DT3A 1I20A 1WTMA 3TXFA 5IDDA 1P2CC 3TMVA 5LIOA 2W1YA 2LZTA 1GFGA 3WPLA 1GB8A 1B5XA 2WARA 4J7VA 4HV2A 1DQJC 4QY9A 3QE8A 1B5ZA 1LJIA 3ATOA 4O34A 4E3UA 4G4HA 2FBDA 2MEDA 3WH1A 4NGOA 4HTNA 1UBZA 2D6BA 1G7IC 3A8ZA 1LTMA 2DQEY 4H8XA 1OQMA 2VB1A 4OWHA 5LYZA 3WPKA 1UIFA 4BADA 1HFXA 4DDBA 1B5WA 1B7RA 1B7SA 1CKDA 1LMTA 2XBRA 1UA6Y 1IP7A 3B0OA 1IIZA 1IY3A 4R0FA 4NHPA 4IJ4A 2Z2FA 2HUBA 3FE0A 7LYZA 1GE0A 2F4GA 5APCA 3WU9A 1ZV5L 2ZQ4A 3WVYA 4ET8A 4NG1A 4QDNA 3KAMA 1XGUC 1JKAA 2IHLA 4GCCA 1DKJA 4LYOA 1G7HC 1LZ8A 2ZILA 3AGGG 4ANRA 1GF5A 3J6KA 1IP3A 3A94A 4HJVA 4U3XB 5KJ9A 4LYMA 5L3IA 1GHLA 1BWHA 2ZQ3A 2MEIA 4ZIXA 4PGJB 1GFUA 2W1XA 1B7MA 3A6BY 1IP1A 1D6PA 1LSDA 1UICA 2BQIA 1YROA 1B7LA 1LHLA 3OJPA 4NIJA 4XJHA 3WXUA 4OWAA 1GE4A 1GF6A 1MELL 1ZVHL 2ZYPA 2Z18A 1B9OA 1REZA 4WM6A 1JJ1A 1W6ZA 2EQLA 2MEGA 1GFRA 1RCMA 3T36A 1VATA 5I4WA 1Z55A 2AUBA 1LPIA 5F14A 4WLTA 1HFZA 3EBAB 4LT3A 3AB6A 4LZTA 4I8SA 5B07A 1CKHA 3WW5A 5FDJA 2C8OA 3CB7A 3WL2A 1GF8A 3EO5A 1IP2A 1LSCA 5KXYA 4EMNA 2YBJA 3LN2A 1IOSA 1YKYX 1GB2A 1WQRA 3IJUA 1FLUA 4LT1A 3LYZA 4NGIA 4NGLA 3VWOA 4G9SA 4B49A 5J7CA 2EKSC 2N5ZA 1GF3A 8LYZA 1GBXA 4R6CA 5LVJA 1NBYC 1LYOA 5F9XA 1HEWA 1WQNA 4Z3MA 2D91A 1A2YC 4H1PA 5T3FA 1KIQC 1IC4Y 5HNLA 1OUJA 4YOPA 2ZWBA 1HEMA 1NKHA 3A3RX 1WQPA 3P66A 2RSCA 4J1AA 5LVHA 1FDLY 1WQOA 4H9CA 3LYOA 4PPOA 4ET9A 5LYTA 3W6BA 4I0CA 5KXTA 1GB7A 1LSZA 2HECA 1LJKA 4HTKA 1GF0A 1LAAA 1IOTA 3LZTA 4H94A 132LA 1YANA 4LGKA 4HTQA 1GBOA 1C46A 1IEEA 2HEBA 1BHZA 1BB4A 1UIHA 1FKQA 4KPMA 1LYSA 1DI5A 1E8LA 1ZMYL 3WPJA 4NGWA 2BQBA 1LJNA 1GXV2 2YBIA 4B4JA 1BB5A 4XENA 1LZ6A 1LMOA 1IORA 1LMQA 4N5RA 3ULRA 3WU8A 1DKKA 2G4PA 1JKBA 3WW6A 3RW8A 2G4QA 1HEPA 3TXDA 1OUBA 4HJYA 5DM9A 4AGAA 4NHQA 2MEBA 1GF9A 1LZEA 5I54A 5LA8A 5EBHA 1GFJA 2H5ZA 3D9AC 4NFVA 3WU7A 4P2EA 5APEA 4BS7A 4M6DA 1YL1X 3RNXA 3T6UA 1GE1A 2BQMA 1LZRA 3A91A 1OUFA 1WVUA 2MEFA 3GXKA 4ETEA 1LSBA 4XN6A 5LXWA 4KL7A 1DPXA 1HEOA 2DBTA 3AYQA 4LFPA 4NWEA 2YVBA 2BQOA 1BVXA 1BB7A 4OWEA 3B6LA 5D5CA 1LHIA 1VFBC 4H9FA 1GFEA 1J1OY 3IJVA 1AT5A 1JJ0A 154LA 3CT5A 4H90A 1IVMA 1QUSA 5KXWA 5L3HA 2D4KA 1KXWA 4CGEA 5B05A 4OOTA 1HF4A 1G7LC 1C43A 4M4OA 4H9HA 3GXRA 5C6LA 1H6MA 2BQNA 5F81A 4NHTA 1LZ4A 4GLAA 2W1LA 1CNSA 2ZYCA 5FCPA 4TSCA 4H93A 5DL9A 3CT0A 4YM8A 1LKSA 1B7OA 3A3QA 1GFKA 3HFMY 4WLYA 1B5VA 3IWRA 5FHWA 2A7DA 2CWIA 208LA 1OUAA 5C6IA 1YAMA 3QNGA 1TBYA 2I25L 5KXSA 3AW7A 4WO9A 1LZCA 5AMYA 4OWCA 1LJ3A 1XGQC 5KXOA 5B59A 1LYZA 1OUEA 3WUNA 1MLCE 1IC5Y 4TWSA 4NSIA 2DQHY 1HEQA 3BKHA 2HEEA 4GCEA 4N1EI 1B7QA 1QSWA 3ZVQA 1QDTA 1XSFA 3LYMA 4H9BA 2HEDA 4IASA 2XBSA 4XJFA 3A67Y 3M3UA 4DWXA 1OP9B 1INUA 4D9ZA 2DQDY 1UCOA 3HBHA 4XYYA 1CKGA 153LA 1NMMA 2YBMA 1VAUA 3AW6A 4IATA 4DD9A 1GBZA 5KXMA 4HJZA 2Y8PA 5APFA 4XJIA 4CFPA 4N0JA 4C5FA 1C10A 3LYTA 3TXBA 4B4IA 1WTNA 4DD1A 133LA 1GE3A 3RZ4A 1TDYA 5LINA 4GLVA 1JWRA 5KKJA 1LMCA 1RE2A 4Z46A 4NY5A 1LZDA 3TXEA 1G7MC 3A95A 1B5YA 1GD6A 1UUZC 1F10A 1IWZA 1YILA 4B0DA 4WM2A 134LA 5IELA 4OWBA 1LCNA 1YAPA 1LSAA 4WM5A 1GEZA 4DD7A 4DDCA 1UIGA 1LZAA 1YAOA 1LSPA 4WL6A 1LOZA 4XJBA 5DN5A 4NWHA 5APDA 5B1FA 1J1XY 1RJCB 3LHMA 3WUMA 3TXJA 3WULA 4EOFA 3P68A 1HSWA 2HEFA 3W3EA 1XGRC 1NBZC 1LJFA 1LJHA 2DKVA 4LT0A 5FSTA 4LYZA 3BKVA 3K3TA 6LYZA 1GBYA 1FLQA 5KY1A 3TXHA 1GB0A 1I56A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ZURA 5I4YA 1IY4A 1PZYA 2MECA 4ETAA 2BQDA 2FYCA 4DQ7A 1L46A 1D3MA 2ZIJA 2BQLA 2O79A 141LA 3TXKA 1L0KA 4LFXA 3J4GA 1D2YA 5I5QA 1B5UA 5LVIA 187LA 1L02A 1GBSA 1L20A 1W08A 4MR1A 1QUDA 1LZYA 4ZFPA 3CSQA 1DXJA 1J1PY 1YKZX 4N1CC 1L88A 2BAAA 152LA 5B06A 1XFPL 4ARPA 1QTBA 5FELA 3WXTA 4H92A 5LYMA 3A96A 1L04A 4WOAA 4CFOA 1IP5A 1GBWA 1IX0A 3GUNA 2C8PA 207LA 3G3VA 1LYFA 2ZNXY 1LZ5A 4HSFA 150LA 1D6QA 2XTHA 2ZIKA 2BQFA 2IGCA 2OTYX 1LHHA 1GWDA 1ZVYB 2F30A 1LJ4A 221LA 2BPUA 4BAFA 4NSGA 1CV6A 2W1MA 3P64A 1LYYA 1LYHA 1BB6A 2RAZX 5LAGA 1TCYA 4PRUA 142LA 5I53A 2YBLA 1UC0A 3B72A 5LAFA 4LYTA 4H8ZA 166LA 1L28A 1QTHA 1GFHA 3D3DA 5K7OA 2PC2A 143LA 2CGIA 2HU3A 1EQ5A 1G0QA 4Z98A 4E97A 1C6EA 2B72A 2Q0MX 2DQCY 3MGWA 1CV3A 1JKCA 1DZBX 4WLXA 3HBDA 4WLDA 1LYEA 4NGYA 1IWWA 5D5CA 1L39A 1G7JC 1LJGA 3RT5X 1LZ1A 2DQGY 1G06A 1QUGA 2GV0A 104LA 3HH3A 4H9AA 3HDEA 3P65A 1KIPC 4W58A 258LA 1LHJA 1L76A 3NY8A 1L71A 1OUGA 1IR7A 3A92A 1PQJA 1JTPL 145LA 4H9IA 2F2NA 1UIAA 1NHEA 2BLYA 3ATNA 5KXPA 3FI7A 4DD3A 5E4PA 1JHLA 1D9UA 1CV0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3TXI A;  1LHK A;  5KXZ A;  1AKI A;  1LKR A;  5I4Y A;  1FN5 A;  1IY4 A;  1HC0 A;  1PZY A;  1RI8 B;  2MEC A;  4ETA A;  1IWV A;  1SLY A;  2BQD A;  2FYC A;  1XEK A;  2DQF C;  5ILF A;  1GAZ A;  4WM1 A;  1TAY A;  3EMS A;  1IR9 A;  4WMG A;  2ZIJ A;  4II8 A;  2BQL A;  1HML A;  3AGI A;  4TTD A;  4XJG A;  1VED A;  2Z2E A;  4ETC A;  4KT3 A;  1IP4 A;  4OW1 A;  4LFX A;  1C7P A;  3J4G A;  1JUG A;  3TXK A;  5I5Q A;  1B5U A;  5LVI A;  1GBS A;  3QY4 A;  5HQ1 A;  1W08 A;  1XGT C;  1JTT L;  4MR1 A;  4DC4 A;  1LZT A;  1LZY A;  5FEK A;  3CSQ A;  3WMK A;  4ZFP A;  3AJN A;  4G4B A;  5KXR A;  3W6A A;  4DYG A;  4PRQ A;  4NGZ A;  1NWG A;  1DXJ A;  1J1P Y;  5KXL A;  1YKZ X;  1GFV A;  1QQY A;  3OK0 A;  4N1C C;  1HSX A;  2D4I A;  2BAA A;  2LZ2 A;  4HPI A;  5B06 A;  1TEW A;  1XFP L;  2YDG A;  5FEL A;  1KIR C;  3WXT A;  2FYD A;  1T6V L;  4YEN A;  3A6C Y;  2CDS A;  1PS5 A;  4H92 A;  5LYM A;  3A96 A;  4WOA A;  3RU5 A;  3N9A A;  4CFO A;  1UIB A;  2BQK A;  1IP5 A;  1GBW A;  1IX0 A;  2C8P A;  1LJJ A;  1LMP A;  2I26 L;  4RDS A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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