3LHMA

Crystal structures of the apo-and holomutant human lysozymes with an introduced ca2+ binding site
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLDDNIADDVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the apo- and holomutant human lysozymes with an introduced Ca2+ binding site.
pubmed rcsb
molecule keywords HUMAN LYSOZYME
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Homo sapiens
total genus 51
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1991-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3lhmA00
1IC5Y 2IFFY 1IP4A 1LJIA 5LVGA 1JWRA 1HENA 2ZILA 1WQNA 4YF2A 1LYOA 1IY3A 2MEEA 1GB3A 1HMLA 4TWSA 5E4PA 1GAYA 2Y8PA 4HSFA 2Z39A 2YBHA 2LYMA 1LSGA 1ZVYB 5APFA 1QIOA 2LZ2A 1GBWA 3B6LA 5LXWA 1LSMA 1LSFA 1PZYA 3WUMA 1J1PY 1DKKA 1GF6A 1HMKA 3RW8A 3P68A 1LZNA 2YDGA 4RW2A 1UCOA 2ZYCA 1LZ9A 1LKSA 1NMMA 2A7DA 4KPMA 5F16A 5KXOA 1BWHA 1JTOL 1HHLA 1XGQC 1T3PA 1UIFA 4O34A 4CJ2A 1IOQA 4DWXA 1LZAA 2DQCY 2Z12A 4MSTA 5KXMA 5JENB 4ZFPA 1OUAA 1RJCB 1LMOA 1G7MC 1OUGA 2DQFC 3J6KA 1BB7A 2F4GA 4GN4A 1UBZA 4NWEA 5M1YA 1TEWA 2MEDA 4DD7A 1QQYA 3BKVA 5DLAA 3HFMY 1IWXA 1UICA 2HUBA 1GXV2 4GCCA 5KXNA 3TMUA 5ILFA 4H9IA 4E3UA 1JIYA 2EPEA 2ZQ4A 3TMWA 2MEAA 5B05A 5KXTA 4ETAA 1GBOA 1GAZA 1ZV5L 1IWYA 3F6ZA 4NEBA 1BB5A 1JEFA 1JSEA 1HEPA 1HERA 1KXXA 1RFPA 3AJNA 1UIGA 4WLDA 3M3UA 1I56A 3TXBA 1LJNA 1QSWA 3P66A 1GFTA 1LZYA 1HNLA 1NDGC 4XADA 1B7NA 3A3RX 5F81A 5FEKA 2BAAA 1FBIX 5APCA 1B5UA 1WQPA 4OWCA 193LA 2YBNA 1JKCA 2H9KA 4BAPA 2BQJA 1IOSA 5IHGA 2D91A 4WM3A 2XTHA 3EMSA 3WW6A 3WPKA 5A3EA 4XYYA 3AGIA 4GLVA 1IWWA 4CGEA 4KXIA 5C6IA 3SP3A 1IP6A 2DQJY 3AZ4A 4LYCA 3A93A 3AW6A 4H90A 4NHQA 3K3TA 4LGKA 1WQOA 4B49A 4DD9A 1D0MA 2YBJA 1IP7A 1GF8A 1ALCA 1LHMA 1XGTC 4QEQA 4H9FA 4WG7A 1LOZA 4HTKA 3GXKA 1B7RA 1GB8A 1DPWA 1KIQC 3WVXA 2VB1A 2FYDA 5HMVA 1HC0A 1YAMA 2GV0A 4CFPA 2BQMA 1LAAA 1GBZA 1UIHA 1LZ6A 1LJFA 2MECA 4LYOA 1B0DA 4PRUA 3RNXA 4WLYA 4B1AA 3TXJA 1LTMA 1BWJA 5T3FA 1WTMA 1VDTA 1LMNA 4GLAA 4II8A 4TX7A 1FLYA 4XJIA 5KXLA 1IP1A 4NSJA 4W96A 5LVKA 2MEBA 2D4IA 1CKHA 1BB6A 5B59A 2BQIA 1TBYA 3TXDA 1MELL 4LFPA 3LN2A 1LZ4A 1LMPA 1CJ8A 1QDRA 4J0LA 1EQ5A 2LYOA 1WVVA 3W6BA 4NHTA 4ANRA 1IC4Y 1OP9B 4HV2A 1HELA 2W1YA 1OUEA 1LMQA 3WH1A 1D0KA 1A2YC 5D5CA 1F6SA 1JSFA 1IWTA 3ULRA 1IOCA 1HEOA 135LA 1LHLA 2XJWA 4UWVA 3E3DA 1T6VL 4N5RA 4BAFA 3AB6A 2EKSC 3A34A 2Z19A 1GFKA 3AYQA 4NFVA 1I1ZA 4WL7A 3WXTA 4DT3A 5C6LA 2I26L 1LHJA 4J1AA 1NWGA 3A6CY 4H8ZA 5FHWA 4ETCA 5C6JA 2MEFA 4TUNA 4LT0A 1AT6A 1OUJA 1QDTA 1XGRC 4GCEA 4IJ4A 2BQNA 1QTKA 2W1LA 4NGVA 1YQVY 3TMVA 1VFBC 5LA5A 1OUDA 1XEIA 1KXWA 3QY4A 1IY4A 2PC2A 1D0LA 1FDLY 1LZTA 1GPQC 1FLUA 4LT3A 1UACY 5LAGA 2F30A 3G3BB 1TDYA 3AGGG 4XJGA 4CHXA 1GE4A 5IELA 3RZ4A 132LA 1IR7A 4LT1A 2BQDA 1IVMA 5KJ9A 1VATA 2WARA 5LYTA 3WU7A 3TXGA 4R6CA 1ZMYL 3ATNA 1G7IC 3W6AA 4ETEA 1LCNA 3WXUA 4H1PA 2DKVA 1WQMA 3ATOA 5F14A 3CSZA 1LZRA 4C3WA 4Z98A 1FKQA 3RU5A 1EQ4A 1WVUA 2HEAA 1I20A 1GDXA 4ZEEA 2G4NA 2ZNWY 1MLCE 1JKBA 1GB0A 2IHLA 1LSBA 1UIAA 4NGJA 4QGZA 3A91A 1FN5A 3AGHA 4DYGA 4RLMA 3A92A 4ZIXA 1OUHA 3WVYA 5I4XA 1YAQA 2CWIA 2YBIA 4G4CA 4GN5C 4WO9A 1QUSA 1NDMC 2CGIA 1LZ5A 4NIJA 5AMYA 4B4EA 1YKZX 1B7LA 1GF0A 1LYYA 2EQLA 5LVIA 2MEIA 4EOFA 1XEJA 1KIRC 1V7TA 5DN4A 1Z55A 5LA8A 2N5ZA 1XGPC 3W6DA 2ZYPA 1GF7A 5KXKA 4BADA 1VDQA 2ZNXY 1DKJA 1J1OY 4R0FA 1D6QA 4MCKA 5A3ZA 1UIBA 4OW1A 4EMNA 5I5QA 3D9AC 1RCMA 3CT0A 2HEEA 4OWBA 1HFXA 2BQKA 1PS5A 2Z2FA 1B9OA 1IWVA 3WU9A 1TAYA 1VDSA 1OUCA 1SQ2L 2I25L 1REZA 3TMXA 3ZVQB 1F0WA 2HU1A 5E9RA 1B7SA 2C8OA 4NGOA 4YEMA 1G7LC 4M4OA 1BVKC 2Q0MX 2HEDA 3A90A 4YEOA 4J1BA 3N9CA 2AUBA 4DDAA 2RSCA 4H91A 208LA 4NHSA 4ET8A 4NHPA 1B2KA 2DQEY 4LYTA 4B0DA 4J7VA 5B1GA 4LZTA 1LJGA 1LSNA 5L3HA 1LMCA 1N4FA 2X0AA 1CJ6A 2CJLA 4OWAA 1CKGA 3A8ZA 3TXHA 1V7SA 1JTPL 4H9HA 1GF4A 4G9SA 1AT5A 1HF4A 4NGLA 4WMGA 4M6DA 1LZSA 3W6CA 4NHIA 5KY1A 1LZEA 1UC0A 1QTEA 2W1MA 4WM4A 1SLYA 1E8LA 3M18B 1YIKA 1YL0X 4H93A 1LZBA 4H8YA 1GFHA 4QY9A 2BQBA 4XENA 4DDCA 3CT5A 4H8XA 1C7PA 1IX0A 4LT2A 5EBHA 4PRQA 1JUGA 1GFJA 4CFOA 194LA 1IP2A 4TTDA 3LZ2A 4KT3A 4IASA 3WW5A 4GN3A 2I6ZA 4HTNA 4LYZA 1IP3A 1JJ1A 1TCYA 5HNLA 4NSHA 3TXKA 1HSWA 3P4ZA 1GB2A 1LJHA 1LSPA 1AZFA 1JPOA 2MEHA 3WPJA 3WMKA 1DXJA 5HLLA 5I54A 1HFZA 3FE0A 1JKAA 1GEZA 3A6BY 2F2NA 2YBLA 4H9AA 1GFUA 5B07A 1B7PA 1IWZA 1LSCA 4N8ZA 2BQAA 2ZQ3A 4H92A 5HQ1A 1VDPA 2DQIY 1DI5A 2HEBA 4PGJB 4NGYA 3T36A 3ZEKA 4ML7A 5KXWA 2DQHY 1J1XY 1GE1A 3CSQA 4OWEA 4ETBA 3EXDA 1INUA 1DI4A 1NHEA 1UA6Y 1O23A 1EL1A 2FBBA 4YENA 5B06A 1GF5A 1HFYA 4WLXA 1IEEA 2XBRA 4LYMA 3LYMA 5APDA 1IWUA 3LYTA 1B5ZA 2BQOA 4U3XB 5KXRA 2DQGY 2B5ZA 2ZIJA 4B4IA 4RLNA 4DD3A 5KKIA 2BQLA 1VEDA 3WULA 5I4YA 1OUFA 2BQCA 3B0IA 4D9ZA 3FI7A 1LKRA 1LSDA 2DBTA 2HTXA 5F9UA 1XGUC 1GD6A 154LA 1UIDA 1GE2A 4MR1A 3G3AB 4G4BA 4WG1A 4DD0A 1GDWA 1QUTA 4LFXA 4ET9A 153LA 1IR8A 4NG8A 1LSYA 1FKVA 134LA 1YANA 4NG1A 1BGIA 4NWHA 5HMJA 2FBDA 3T6UA 5KXXA 3N9EA 2A7FA 4PHIA 3B0KA 3RT5X 1JKDA 1G7HC 2XBSA 1B7MA 1LJ3A 4TSBA 3A67Y 1LSZA 3MGWA 1B5XA 4GCFA 4X3BA 5IDDA 3GXRA 4XN6A 1NKHA 4WL6A 3WU8A 5DM9A 1JJ0A 1YAOA 3B0OA 4HJYA 1UIEA 2BPUA 4HPIA 5LINA 1REMA 4WM1A 2G4QA 2W1XA 1JISA 1WQQA 3A95A 3IJVA 4N0JA 4NY5A 3W6EA 5LYZA 1B5WA 4RW1A 2Z37A 3LHMA 1CNSA 1LJKA 3CT1A 3EBAB 4H9BA 1GB6A 2LZTA 1XFPL 3BKHA 5FELA 1HEQA 1LJEA 1W08A 4H9EA 3KAMA 4PPOA 1IC7Y 1LPIA 4PJ2C 1GB5A 3W3EA 1IR9A 1GFRA 3CQLA 4I0CA 1GBXA 1LJ4A 3CSRA 4N1EI 1YL1X 3N9AA 2D6BA 8LYZA 5KXYA 1F10A 1YILA 2LHMA 5KXPA 4C5FA 1IIZA 2YSSC 4XJBA 1LHKA 3LYZA 4NGKA 4WLTA 3AW7A 1D9UA 3D3DA 5ILCA 4G49A 4HPEA 1C10A 1RI8B 4AGAA 1WQRA 3AZ6A 1C43A 5D5FA 1HEWA 3QE8A 3P65A 4KL7A 1GFGA 3AZ5A 3CB7A 2FYCA 2BLXA 2ZIKA 1GBYA 3WYHA 5I4WA 5DL9A 1CKCA 4HV1A 5K7OA 2D4JA 1GE0A 1BB3A 5KXSA 1H6MA 1JTTL 2DQDY 4OWHA 1HEMA 1REXA 1CJ7A 2H9JA 5LVJA 4P2EA 1YROA 1LSAA 2D4KA 4DDBA 4ETDA 3HBDA 4Z46A 1LZ8A 1B5VA 4FDYA 1GHLA 6LYTA 2DQAA 3J4GA 1YKXX 3WL2A 1AKIA 1NF5A 1H87A 1GWDA 1CJ9A 4H94A 9LYZA 1EQEA 3LZTA 1CKFA 4IATA 4YOPA 1LMAA 2BQGA 5J7CA 2H5ZA 5FCPA 5II3A 1LSEA 4OOOA 4FJRA 2YVBA 1C45A 1GEVA 3WUNA 1B7QA 1IO5A 1CKDA 1LYSA 3QNGA 4DC4A 4DD1A 6LYZA 1DI3A 2ZWBA 4WM6A 1LJJA 5B1FA 3IWRA 3AZ7A 4HTQA 2YBMA 5LVHA 1BVXA 2Z2EA 1C08C 2CDSA 4N9RA 1W6ZA 1UUZC 5LAFA 4B4JA 4AXTA 7LYZA 4A7DA 4NSIA 2NWDX 2BQEA 4HJZA 4HP0A 5FSTA 1D6PA 2F4AA 5APEA 1DPXA 1ZVHL 2LYZA 4NGZA 2Z38A 4OOTA 4WO6A 1C46A 1NQIA 1VAUA 1LZDA 4NGIA 1GBSA 4WM2A 1IOTA 3TXIA 4RDSA 3OJPA 5KKJA 1DQJC 2Z18A 2BLYA 5KXZA 1GE3A 1LZ1A 2HECA 4UWUA 3B72A 3P64A 3VWOA 1GXXA 1YAPA 3TXEA 3A96A 1BWIA 1GFEA 207LA 3IJUA 1LZGA 1OQMA 4XJHA 1GF9A 4BS7A 1XSFA 1FLQA 3LYOA 4L41A 4TSCA 1NBZC 1WTNA 1LZCA 3HBHA 4LYBA 4H9CA 5I53A 3A94A 4XJDA 2MEGA 2HEFA 1JJ3A 3WPLA 1BQLY 2C8PA 4N1CC 3ZVQA 3WUAA 4GCDA 5LIOA 1GFVA 4GCBA 3TXFA 1LHIA 1DZBX 4WM5A 4QDNA 1AM7A 1B7OA 2BQHA 1KIPC 3EO5A 4W94A 4Z41A 1KXYA 1P2CC 4Z3MA 3W6FA 2HU3A 1BB4A 1NBYC 5LYMA 3OK0A 4UWNA 1LYZA 5L9JA 4XJFA 1GB9A 5L3IA 1G7JC 1LMTA 1QSAA 5FDJA 5HNCA 1REYA 5F9XA 1XEKA 4NGWA 1FLWA 1RE2A 1A4VA 1OUIA 4YM8A 3A3QA 2G4PA 4G4HA 4WOAA 1GF3A 1IP5A 1GFAA 133LA 1OUBA 1GB7A 1F6RA 1YKYX 3HBEX 1B5YA 2BQFA 1JITA 4I8SA 1BHZA 2EIZC 4HJVA 1LHHA 4DD2A 1JHLA 5DN5A 1IORA 4NSGA 1HSXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IC5Y 1JWRA 1WQNA 1P2LA 1GB3A 1HMLA 4HSFA 2YBHA 5APFA 1GBWA 3B6LA 5LXWA 1LSMA 3WUMA 3L64A 1GF6A 1LGUA 1UCOA 1LZ9A 2A7DA 262LA 251LA 199LA 1LYFA 1G0KA 2Z12A 1RJCB 4ARPA 1C6CA 1G7MC 1LMOA 1OUGA 2NTHA 4I7KA 1BB7A 4GN4A 1UBZA 4DD7A 1QQYA 3BKVA 4GCCA 2ANXA 3TMUA 5ILFA 1L43A 1JIYA 2ZQ4A 4ETAA 1GAZA 1ZV5L 1IWYA 1BB5A 3AJNA 1KXXA 1KNIA 1L00A 173LA 1GFTA 4XADA 5F81A 5APCA 2B6YA 2D91A 1CTWA 3EMSA 1L34A 3WW6A 160LA 218LA 3AW6A 4H90A 4DD9A 1WQOA 1QS5A 3GUJA 169LA 1C6KA 1IP7A 244LA 1LOZA 4HTKA 3GXKA 1GB8A 3SB6A 1DPWA 1L63A 2VB1A 1HC0A 2RB1X 1GBZA 1L35A 1LJFA 2MECA 4WLYA 1VDTA 4GLAA 3LZMA 1FLYA 1C6JA 1L72A 5LVKA 3TXDA 4LFPA 1CJ8A 4J0LA 4ANRA 1IC4Y 1NHBA 168LA 1OUEA 2HULA 1L09A 1F6SA 1JSFA 2XJWA 1CU6A 2HUKA 3A34A 4WL7A 3WXTA 187LA 1LHJA 4ETCA 4LT0A 1OUJA 4IJ4A 2BQNA 1QTKA 1QSQA 2W1LA 3TMVA 1LYJA 219LA 1XEIA 1KXWA 1IY4A 1FDLY 1ZYTA 257LA 5LAGA 2F30A 1TDYA 1GE4A 1IR7A 4LT1A 1IVMA 5KJ9A 1VATA 220LA 256LA 1CV6A 3WU7A 4R6CA 1L76A 4H1PA 2DKVA 4Z98A 185LA 1EQ4A 2HEAA 2F47A 205LA 3SB7A 2G4NA 1MLCE 1L88A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1IC5 Y;  2IFF Y;  1IP4 A;  1LJI A;  5LVG A;  1JWR A;  1HEN A;  2ZIL A;  1WQN A;  4YF2 A;  1LYO A;  1IY3 A;  2MEE A;  1GB3 A;  1HML A;  4TWS A;  5E4P A;  1GAY A;  2Y8P A;  4HSF A;  2Z39 A;  2YBH A;  2LYM A;  1LSG A;  1ZVY B;  5APF A;  1QIO A;  2LZ2 A;  1GBW A;  3B6L A;  5LXW A;  1LSM A;  1LSF A;  1PZY A;  3WUM A;  1J1P Y;  1DKK A;  1GF6 A;  1HMK A;  3RW8 A;  3P68 A;  1LZN A;  2YDG A;  4RW2 A;  1UCO A;  2ZYC A;  1LZ9 A;  1LKS A;  1NMM A;  2A7D A;  4KPM A;  5F16 A;  5KXO A;  1BWH A;  1JTO L;  1HHL A;  1XGQ C;  1T3P A;  1UIF A;  4O34 A;  4CJ2 A;  1IOQ A;  4DWX A;  1LZA A;  2DQC Y;  2Z12 A;  4MST A;  5KXM A;  5JEN B;  4ZFP A;  1OUA A;  1RJC B;  1LMO A;  1G7M C;  1OUG A;  2DQF C;  3J6K A;  1BB7 A;  2F4G A;  4GN4 A;  1UBZ A;  4NWE A;  5M1Y A;  1TEW A;  2MED A;  4DD7 A;  1QQY A;  3BKV A;  5DLA A;  3HFM Y;  1IWX A;  1UIC A;  2HUB A;  1GXV 2;  4GCC A;  5KXN A;  3TMU A;  5ILF A;  4H9I A;  4E3U A;  1JIY A;  2EPE A;  2ZQ4 A;  3TMW A;  2MEA A;  5B05 A;  5KXT A;  4ETA A;  1GBO A;  1GAZ A;  1ZV5 L;  1IWY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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