3LZ2A

Structure determination of turkey egg white lysozyme using laue diffraction
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVYGRCELAAAMKRLGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTHATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSKNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIASGGNGMNAWVAWRNRCKGTDVHAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure determination of turkey egg-white lysozyme using Laue diffraction data.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TURKEY EGG WHITE LYSOZYME
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Meleagris gallopavo
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1991-09-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3lz2A00
3FI7A 1V7TA 3WW5A 1LMAA 1GFAA 1NHEA 4WL7A 1GB7A 1E8LA 1LTMA 3KAMA 1UUZC 4HSFA 4TX7A 1RI8B 4FDYA 1CJ9A 1WVUA 1LSYA 1XGPC 1WTNA 3A6BY 3TXIA 4NHIA 4NGKA 1HNLA 2H5ZA 2MEFA 5HNLA 3WMKA 2IHLA 4G9SA 4KL7A 4HJVA 5LVHA 3LYMA 5LYMA 3ZEKA 1IY3A 4ZFPA 4H8ZA 1LPIA 4LYZA 4WM6A 4C5FA 4MCKA 1G7JC 1LZ5A 1JEFA 1HC0A 1IIZA 1VAUA 1LJIA 1IOSA 3VWOA 134LA 1TBYA 3TMUA 2Z18A 4XJHA 3AW7A 1D6PA 4H8YA 4DD9A 2I6ZA 4CFPA 2DQGY 1GF5A 4P2EA 3D9AC 1REMA 3M3UA 2HU1A 1IOTA 1OUDA 4LYTA 4NHSA 2BQDA 4HV1A 4GN5C 1LMNA 4RLNA 4WO9A 3WPJA 2Z37A 1GBXA 5E4PA 1XGTC 3W6FA 2IFFY 1GB5A 1UICA 2DQCY 1WQOA 2YBIA 1HFXA 4LT2A 4XYYA 5F81A 2BPUA 4NGWA 1YL1X 2MEBA 1YANA 4LGKA 1F10A 1GWDA 1D0KA 4N0JA 1HEMA 1LYSA 5D5FA 4H94A 1LHIA 3ATOA 132LA 1D6QA 1LMQA 4W94A 5LVKA 1LSFA 1ZV5L 3WPKA 1IP5A 2MEDA 1IWTA 1VDSA 3WU7A 1CKHA 1LZ1A 4NSGA 4TSBA 2LZTA 4H8XA 1HMKA 2H9JA 2BAAA 2DBTA 1TDYA 4OW1A 5I4YA 1LAAA 5HNCA 1HFYA 1VDTA 4AXTA 5KXMA 1IORA 5LVGA 1DXJA 2GV0A 1GXXA 1ZMYL 2MEHA 3W6AA 4M4OA 2W1XA 4I0CA 135LA 5IDDA 4DD1A 1GAZA 4L41A 5KXYA 1P2CC 1GF8A 1YIKA 1LHMA 2NWDX 1B5UA 1IEEA 1AKIA 1DI5A 1NWGA 4OOTA 1YROA 4ETAA 1BB7A 1LCNA 1B7PA 4PRQA 2BQMA 1LOZA 1HMLA 2LYOA 1B7QA 4XJGA 1LSBA 4LT3A 4ZIXA 5HQ1A 2BLXA 4GCEA 4MSTA 1LZAA 2W1YA 3AYQA 3G3AB 1LHKA 1JWRA 4A7DA 1DI4A 1OUFA 2W1LA 1EQ4A 3M18B 1HF4A 3A3RX 1UA6Y 4N1EI 2DQAA 4NSIA 1GBOA 2DKVA 1HEQA 1T3PA 4WM3A 1J1PY 2FBDA 5F14A 5HLLA 4FJRA 1IC5Y 1F6SA 4H93A 6LYZA 4NG1A 4Z41A 5J7CA 5DM9A 1LJFA 3P66A 4UWUA 5F9UA 5IHGA 1NDGC 5KXPA 1OUGA 5KXXA 3AGHA 2PC2A 2YBLA 5LVIA 1XFPL 4G4CA 2F2NA 3OK0A 1LZ9A 1UIBA 4YM8A 3GXKA 3LZTA 1WVVA 4KXIA 1JTTL 4NWHA 4WOAA 5FELA 3W6DA 3RZ4A 1JHLA 4GLVA 4DDCA 1LHLA 1HEOA 1LZSA 5KKJA 3B0OA 1IP7A 1C7PA 1TEWA 1W6ZA 1LZ8A 3WPLA 3WXUA 1GF3A 2BQAA 2XBRA 1LZDA 1OP9B 4OWCA 5AMYA 5I4WA 2CJLA 4LZTA 1FN5A 4BS7A 1NBZC 1BB6A 1GB9A 1NDMC 1I56A 1YILA 2HUBA 1QSWA 4TUNA 1QIOA 1D0MA 1KXWA 2ZWBA 1DPWA 1B7NA 3AW6A 4H90A 5I5QA 5IELA 1LSMA 5LYTA 3A3QA 1I1ZA 4GCDA 2C8PA 5T3FA 1SQ2L 5KJ9A 4LT1A 1VATA 4PHIA 2WARA 5E9RA 1UIFA 1BB3A 5B1FA 6LYTA 4HJZA 2D4KA 1A2YC 1LZ4A 2Z2EA 5FHWA 3A67Y 3HBDA 4EMNA 4KT3A 3TXHA 1OUCA 5I4XA 4ETDA 1IC4Y 1UIAA 1QTKA 4NEBA 4OWBA 1LJ3A 1GBYA 1ZVHL 5LAFA 2XTHA 4WM1A 1DI3A 5A3ZA 1JKDA 1LSNA 3WVYA 4AGAA 1JSFA 1JKAA 1UIGA 2G4PA 4XADA 4NWEA 5HMJA 4H91A 5APDA 5B07A 3WL2A 1FDLY 1LHHA 3IJUA 1IOCA 5A3EA 3D3DA 5F9XA 4WL6A 4XJIA 4QGZA 1XSFA 4PRUA 1VDQA 1JTOL 1LSZA 5B05A 3ZVQA 3K3TA 2LYZA 3J4GA 1BWHA 1IWWA 1LSCA 3WULA 2EKSC 2ZYPA 4RW2A 1Z55A 4TSCA 1BB4A 2D6BA 1B5WA 1REZA 3A8ZA 4R6CA 4B4IA 2XBSA 4XJDA 1GB2A 1OUIA 5I53A 4WLDA 5II3A 1YKYX 1BVXA 5KKIA 4NSJA 3W6BA 5C6JA 4UWVA 2ZQ4A 1GD6A 1GFTA 1LSDA 3TMWA 5APFA 1FLUA 1LKRA 1WQPA 1GFHA 1JPOA 4NHPA 4DDAA 1GAYA 2ZIKA 4DD0A 3J6KA 1H6MA 1C46A 4WMGA 1LZBA 208LA 1FLYA 4GCBA 5DN5A 5KXKA 1GPQC 3OJPA 5KXNA 1GFKA 1IR9A 1B9OA 1BQLY 4II8A 2D4IA 1PZYA 3LN2A 4G4BA 1CKCA 1EL1A 1LYZA 1QUTA 3RT5X 1OUAA 4H9IA 4OWHA 4EOFA 1LZEA 1TCYA 2CDSA 2EQLA 4H9EA 5KXWA 1LKSA 2Z19A 1FLQA 1RJCB 4OOOA 5B59A 4PPOA 3A93A 1LJJA 193LA 1F0WA 1B7SA 3A95A 1C45A 4IASA 5LYZA 4LYCA 1BHZA 1NKHA 1VFBC 1UBZA 2C8OA 1IP4A 154LA 3WU9A 1IO5A 4WM5A 5HMVA 3HBEX 1XEJA 3QE8A 5L9JA 4YOPA 3LYOA 2I26L 3W6CA 4GLAA 1YAOA 3AZ4A 4NIJA 2LYMA 4QEQA 4XJBA 4ET8A 1WTMA 3IJVA 4NGOA 5I54A 2YBNA 5EBHA 3EMSA 2ZNWY 1REXA 5L3HA 4G4HA 1KIPC 194LA 4HPEA 5KXTA 1GF4A 1IP1A 1PS5A 4DC4A 2HEFA 1NQIA 1GEVA 2MECA 1GF9A 3CSQA 4NGJA 4XJFA 3TXKA 1GFRA 1LJEA 1YKXX 4LT0A 4BAPA 2HU3A 4DD3A 2BQKA 5LAGA 3IWRA 3AZ7A 4B1AA 2G4NA 3WUMA 4H9FA 3A92A 3P65A 4WG7A 1UCOA 5DL9A 4DT3A 4J7VA 4OWEA 4XN6A 1QDRA 5JENB 1J1OY 1XGRC 5C6IA 2DQHY 1YAPA 4YEOA 3TXEA 1IP2A 5L3IA 3E3DA 5LINA 4NGLA 3CB7A 2D91A 4PJ2C 2YSSC 5K7OA 5LXWA 1ALCA 1C43A 4CJ2A 5LVJA 4ETCA 4ET9A 4WM2A 1F6RA 1KXXA 3AGIA 4HPIA 1D9UA 1YL0X 2BQBA 2Z38A 8LYZA 4DD2A 2F30A 4XENA 4DD7A 4H92A 4H9AA 5KXOA 1B5VA 1JISA 1GF0A 1IWXA 5B06A 1QDTA 2BQNA 1B7OA 1SLYA 4Z46A 4BAFA 3AJNA 1UIHA 1AT5A 1DZBX 2CGIA 3N9EA 4R0FA 4GCCA 4ANRA 1QTEA 1BGIA 1WQQA 2G4QA 4UWNA 1CKDA 4NGYA 4ETEA 2MEGA 2ZQ3A 2Y8PA 3A91A 1RFPA 1LMCA 4NHQA 5KXRA 2DQJY 3W6EA 1FKQA 2HEEA 3MGWA 1W08A 4TTDA 2Z12A 3BKVA 1C08C 1QUSA 3T6UA 2BQHA 1YKZX 4CGEA 1B5XA 1GF6A 1OUEA 1V7SA 1T6VL 1B2KA 4NGIA 4WG1A 4WLXA 4B49A 1JKBA 3LYTA 3RU5A 1GDWA 1AT6A 1IX0A 1A4VA 2HTXA 2N5ZA 4KPMA 2YDGA 3TMXA 3TXJA 1GFJA 1CKGA 3P4ZA 1UC0A 1DKKA 1VDPA 2XJWA 5D5CA 1IR8A 1FBIX 1G7HC 1GBZA 4IATA 4QDNA 3A94A 1KIQC 4DDBA 3A34A 1GHLA 1NMMA 4N5RA 1CNSA 4WLYA 1IWVA 1H87A 4GN4A 1LZRA 4HTKA 3EO5A 2DQDY 3GXRA 5F16A 3WVXA 1UIEA 1G7MC 4NHTA 1AM7A 1BVKC 3AGGG 4NY5A 1NF5A 1JJ1A 1GE2A 3LYZA 1DPXA 1B7RA 1GE1A 1LMPA 2BQLA 1CJ6A 2EPEA 2X0AA 3WH1A 3TXDA 1LZ6A 1OUHA 1NBYC 1HFZA 4Z3MA 1CKFA 2BQEA 1YAMA 2B5ZA 2I25L 5DLAA 3QNGA 2EIZC 3W3EA 2DQEY 3WU8A 1GB6A 2FYDA 2VB1A 2RSCA 3CQLA 4YENA 1HHLA 1IR7A 2HEDA 2LZ2A 2YBHA 3B0KA 4WLTA 1WQNA 2MEEA 1OQMA 1QSAA 3ULRA 3A6CY 1KXYA 5FCPA 1XGUC 5ILFA 2Z39A 1EQEA 3AB6A 1JJ3A 2H9KA 1AZFA 4N8ZA 5DN4A 2BLYA 1B0DA 1J1XY 3CT5A 1HEPA 207LA 2MEAA 4J1BA 2A7DA 3B72A 1JITA 1LZCA 1XEKA 2MEIA 2BQJA 3WUAA 1WQRA 1FKVA 4CHXA 2FYCA 1LZYA 1IC7Y 1LJNA 1LMOA 2A7FA 3WW6A 4QY9A 5KY1A 1LJKA 3HBHA 1LJ4A 4WM4A 1JKCA 1HEWA 2BQFA 4LYBA 4LFXA 4HTQA 4W96A 2YVBA 3LZ2A 5KXSA 2BQIA 1GFUA 1GF7A 1LSEA 1JSEA 1B5ZA 1G7LC 2LHMA 1LMTA 1GE3A 1ZVYB 2FBBA 5M1YA 2ZIJA 4IJ4A 1GB0A 4O34A 3SP3A 3P68A 4HP0A 2YBJA 4C3WA 1XEIA 4B4JA 1IOQA 4NGZA 1INUA 5LIOA 5C6LA 1LSAA 2HEBA 4PGJB 1GFVA 3BKHA 4H9HA 1TAYA 3WUNA 5ILCA 1B5YA 1HELA 1VEDA 1XGQC 1BWIA 1GBSA 1MELL 1B7MA 1HENA 3N9CA 3HFMY 2ZILA 4DYGA 153LA 2HECA 3CT1A 2BQOA 1GE0A 1EQ5A 2AUBA 1DKJA 3TXGA 4M6DA 2DQIY 3F6ZA 1B7LA 4ETBA 1HERA 1GB8A 4E3UA 1IY4A 1UACY 1C10A 1QQYA 1LJHA 4LYOA 1DQJC 1JTPL 4LFPA 1GFGA 2BQGA 1LSGA 1YQVY 4J0LA 4ML7A 3TXBA 4B0DA 9LYZA 1N4FA 4N9RA 1CJ8A 1LJGA 1G7IC 1I20A 2YBMA 4B4EA 4NSHA 1LHJA 4DWXA 2HEAA 1RE2A 1JIYA 1FLWA 3CSRA 4WO6A 3A90A 4X3BA 3CT0A 3LHMA 5APEA 3CSZA 3N9AA 1LZGA 1RCMA 4CFOA 4D9ZA 1LZTA 1HSWA 1KIRC 1IWZA 4J1AA 1O23A 1IWYA 4YF2A 3EXDA 1GXV2 1LSPA 133LA 2W1MA 4GCFA 4H1PA 5APCA 3ATNA 2D4JA 1WQMA 3QY4A 2Q0MX 3EBAB 3G3BB 1BWJA 1LYOA 2ZNXY 3P64A 5FEKA 2F4GA 4OWAA 3WYHA 1CJ7A 4HJYA 1D0LA 3ZVQB 1YAQA 1LYYA 2BQCA 5LA5A 1GE4A 1BB5A 1JUGA 1IVMA 4ZEEA 3TMVA 5LA8A 5FDJA 1JJ0A 4NFVA 1GB3A 1GBWA 1GFEA 4HTNA 4NG8A 1UIDA 1GDXA 3FE0A 4N1CC 5KXZA 1IP3A 4LYMA 4RDSA 4U3XB 3TXFA 1OUJA 4NGVA 1GEZA 1REYA 4Z98A 4H9CA 3B6LA 3AZ6A 4H9BA 5KXLA 1MLCE 2CWIA 1IWUA 3A96A 2DQFC 2F4AA 3RNXA 1IP6A 3B0IA 7LYZA 3T36A 4TWSA 3RW8A 5B1GA 4RLMA 4YEMA 1HSXA 1LZNA 2ZYCA 5FSTA 4GN3A 4HV2A 4G49A 2Z2FA 1OUBA 4RW1A 3AZ5A 3WXTA 4BADA 4I8SA 4MR1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LMAA 1E8LA 1NHBA 3KAMA 3GUKA 3PBLA 4FDYA 1LSYA 262LA 1L88A 2H5ZA 2MEFA 4G9SA 4HJVA 5LYMA 1JEFA 1LJIA 3TMUA 1L77A 4CFPA 249LA 108LA 4EXMA 1IOTA 4LYTA 2O7AA 5E4PA 250LA 1L59A 4NGWA 2MEBA 1YANA 1GWDA 1L86A 1LYSA 1L05A 132LA 1D6QA 1L69A 1ZV5L 1L15A 3WU7A 1C6KA 1CU3A 4NSGA 1L18A 4TSBA 2LZTA 4H8XA 2BAAA 142LA 1VDTA 5LVGA 1LGUA 164LA 1L20A 176LA 2W1XA 4I0CA 1GAZA 3NYAA 5KXYA 1GF8A 1B5UA 3DN2A 1AKIA 4OOTA 1NWGA 3CDTA 2RB0X 4ETAA 1CX7A 1LOZA 7LZMA 107LA 1L03A 1L48A 2W1LA 130LA 1EQ4A 1UA6Y 244LA 1HEQA 1T3PA 4WM3A 2FBDA 232LA 1PQMA 1IC5Y 4H93A 4Z41A 1LJFA 4UWUA 1L56A 5IHGA 5KXPA 5KXXA 5LVIA 1L85A 1LZ9A 4ARQB 3LZTA 4WOAA 1HEOA 3B0OA 1C6NA 1LZ8A 3WPLA 3WXUA 4ZPUA 1LZDA 2CJLA 1FN5A 1GB9A 1I56A 1YILA 2ZWBA 1C6BA 1KXWA 1DPWA 5IELA 1L64A 1SQ2L 1ZWNA 1C6DA 2WARA 4PHIA 1BB3A 1C6LA 4KT3A 3TXHA 1OUCA 1IC4Y 4NEBA 5LAFA 1DI3A 5A3ZA 1L84A 4YXAC 1JKAA 1UIGA 4XADA 4NWEA 114LA 5APDA 1IOCA 1L09A 4XJIA 1XSFA 3NY8A 192LA 1BWHA 2RBRA 3DMXA 1BB4A 2D6BA 1B5WA 1EPYA 1XJUA 1G1VA 4WLDA 169LA 1P5CA 4UWVA 1GFTA 5APFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3FI7 A;  1V7T A;  3WW5 A;  1LMA A;  1GFA A;  1NHE A;  4WL7 A;  1GB7 A;  1E8L A;  1LTM A;  3KAM A;  1UUZ C;  4HSF A;  4TX7 A;  1RI8 B;  4FDY A;  1CJ9 A;  1WVU A;  1LSY A;  1XGP C;  1WTN A;  3A6B Y;  3TXI A;  4NHI A;  4NGK A;  1HNL A;  2H5Z A;  2MEF A;  5HNL A;  3WMK A;  2IHL A;  4G9S A;  4KL7 A;  4HJV A;  5LVH A;  3LYM A;  5LYM A;  3ZEK A;  1IY3 A;  4ZFP A;  4H8Z A;  1LPI A;  4LYZ A;  4WM6 A;  4C5F A;  4MCK A;  1G7J C;  1LZ5 A;  1JEF A;  1HC0 A;  1IIZ A;  1VAU A;  1LJI A;  1IOS A;  3VWO A;  134L A;  1TBY A;  3TMU A;  2Z18 A;  4XJH A;  3AW7 A;  1D6P A;  4H8Y A;  4DD9 A;  2I6Z A;  4CFP A;  2DQG Y;  1GF5 A;  4P2E A;  3D9A C;  1REM A;  3M3U A;  2HU1 A;  1IOT A;  1OUD A;  4LYT A;  4NHS A;  2BQD A;  4HV1 A;  4GN5 C;  1LMN A;  4RLN A;  4WO9 A;  3WPJ A;  2Z37 A;  1GBX A;  5E4P A;  1XGT C;  3W6F A;  2IFF Y;  1GB5 A;  1UIC A;  2DQC Y;  1WQO A;  2YBI A;  1HFX A;  4LT2 A;  4XYY A;  5F81 A;  2BPU A;  4NGW A;  1YL1 X;  2MEB A;  1YAN A;  4LGK A;  1F10 A;  1GWD A;  1D0K A;  4N0J A;  1HEM A;  1LYS A;  5D5F A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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