3LZ2A

Structure determination of turkey egg white lysozyme using laue diffraction
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVYGRCELAAAMKRLGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTHATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSKNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIASGGNGMNAWVAWRNRCKGTDVHAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords TURKEY EGG WHITE LYSOZYME
publication title Structure determination of turkey egg-white lysozyme using Laue diffraction data.
pubmed doi rcsb
source organism Meleagris gallopavo
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1991-09-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3lz2A00
1GFRA 2MEIA 1IC7Y 1HFYA 1B7RA 1C10A 2HU3A 1GE1A 4NSIA 1GAZA 1BWJA 1LZ6A 4N0JA 1HEWA 3AW6A 4XJDA 4E3UA 153LA 1D0MA 1B7LA 2DQAA 2YBLA 3P4ZA 1LPIA 2ZIKA 4H9BA 4WO9A 1YAPA 4KT3A 5L9JA 3N9AA 5B07A 3EMSA 1LZDA 208LA 5IELA 1CKGA 1GB3A 4R6CA 1GB7A 4WM1A 4WM4A 5KXSA 1IY3A 1GFUA 1V7SA 4LT3A 1JUGA 5DL9A 3W3EA 1B7SA 1C08C 1D0LA 1OUCA 4HPIA 2Z39A 4XJBA 1LTMA 3AZ7A 5E4PA 3N9CA 4NGYA 1E8LA 5APEA 3GXKA 2H9KA 4YENA 1EL1A 1GFAA 3D9AC 4PHIA 5LYMA 1QIOA 3P68A 1LZ8A 1LZTA 4R0FA 3WPLA 4H9HA 1GF6A 4N5RA 1LSAA 2LYOA 4A7DA 5KXXA 1O23A 1GF3A 3P66A 4G4HA 3HFMY 4DDAA 2ZNWY 4UWUA 1VFBC 2F4AA 2HTXA 1HEPA 4BAPA 2DBTA 2W1MA 1GBSA 3WH1A 1B7PA 1W6ZA 1PZYA 1DKJA 1TDYA 2N5ZA 3HBHA 4I8SA 4H8YA 4NGKA 4WLXA 4B4EA 1JSFA 5I4XA 1IP7A 5A3EA 4RLNA 1DKKA 1CNSA 1OUFA 1DI3A 1GDWA 2B5ZA 2HUBA 3TXDA 2YBNA 3A92A 4XJIA 1HEMA 3CT5A 4RLMA 1KIRC 4TUNA 5E9RA 1NDGC 4Z41A 1GHLA 4TSBA 4NHTA 1GBOA 4NHPA 1IWXA 5KXPA 1WTNA 4XN6A 3B0KA 2BQKA 5FDJA 5T3FA 4DD0A 4NFVA 1OUHA 2AUBA 2MEHA 4NHIA 4Z98A 1GB6A 4B49A 1FN5A 132LA 1QDRA 2BQDA 1XGRC 1D6QA 1YQVY 1GEZA 3CT0A 3LYZA 1WQPA 4MCKA 4NSHA 4WLTA 3IJUA 1RI8B 1UA6Y 4TWSA 4HSFA 6LYTA 5KXWA 1GE3A 1FBIX 4AGAA 3EXDA 4LYTA 5KXYA 1VEDA 3CSQA 1REYA 3WVXA 4B4IA 2NWDX 1LSEA 1V7TA 1BVXA 1LZBA 4WM2A 3ZEKA 4DD3A 1OUAA 3LYMA 4DWXA 2GV0A 1ALCA 1A4VA 1B7QA 4LYZA 4Z46A 1LHKA 4NY5A 1JJ0A 1AT6A 3AZ6A 2D4JA 1RE2A 1GF9A 1LJGA 4UWVA 3TXFA 4N1CC 4DC4A 4NHSA 4NGIA 4NHQA 4DYGA 5FCPA 1G7HC 3HBDA 2Z37A 3E3DA 2ZILA 1YIKA 4GLAA 1SQ2L 1I20A 2DQGY 4W96A 3A8ZA 1XGQC 3CT1A 1BB6A 4WM5A 4WO6A 1LYZA 5L3HA 3W6CA 5I5QA 1F6RA 1HEOA 1GAYA 2MECA 1YAOA 4UWNA 1GFKA 4W94A 4WG1A 1UBZA 5F9UA 1GD6A 1IP2A 3P64A 1GB9A 1IWTA 1QUSA 4FDYA 1B5XA 1QUTA 1NKHA 3RZ4A 2BPUA 1W08A 3LHMA 3CSRA 4EMNA 3A67Y 2F30A 3A3QA 2MEBA 5KY1A 4DT3A 1LZ1A 3LZTA 1JHLA 1H6MA 1LKSA 4C3WA 2DQFC 2A7FA 2YSSC 1GB8A 1HENA 1NHEA 3ATOA 4H9EA 3SP3A 4LYCA 1JKBA 4NGLA 1YL1X 4WM3A 4H9IA 3T36A 3D3DA 1TEWA 2MEAA 4G49A 1HMLA 2G4QA 2HEBA 1LSGA 4HPEA 1UICA 1LZSA 3WPKA 5I4YA 4ETBA 2EIZC 2BQNA 4NGZA 4IJ4A 1IP6A 1UIFA 1B7NA 1OUDA 1OUJA 3M18B 4RW1A 2ZWBA 4J1AA 1AT5A 2BQMA 3P65A 2YDGA 1WVVA 1XGUC 1CKFA 1DPXA 4GLVA 1UUZC 5KKIA 3QNGA 6LYZA 5LIOA 1KIQC 1GF8A 1HELA 1XGPC 4DD9A 1N4FA 133LA 2BQEA 4NGVA 3WL2A 1AM7A 1QDTA 5IDDA 3IWRA 4I0CA 4XADA 5KXLA 4H93A 1XEJA 4J7VA 4OWCA 1B0DA 5KJ9A 1LSZA 2HU1A 1I56A 4HTKA 3W6DA 1LMPA 1LSNA 1NMMA 4DD2A 1UIEA 1IC4Y 1B7OA 5EBHA 2BQLA 2W1YA 2LHMA 4BADA 1EQ5A 1LJKA 1TBYA 1GE4A 2X0AA 2BQOA 2HEDA 1LHMA 1GB2A 1J1OY 4Z3MA 1JTTL 1DZBX 4KPMA 3RT5X 1GE2A 1GF4A 5LYZA 1LHIA 2VB1A 1GF0A 3QE8A 4ZFPA 2XJWA 1C7PA 4IATA 3WUMA 4GN3A 4WOAA 5C6JA 5FSTA 1JWRA 2YBIA 5LA8A 4BAFA 2MEGA 4PGJB 1UIHA 3AZ4A 1BB5A 4NEBA 4H8XA 2Z2FA 1BB3A 1F10A 1YAQA 1VDPA 5B59A 3ZVQA 4YM8A 1IO5A 5LA5A 5HMJA 5HNLA 3RW8A 1XSFA 1LYYA 8LYZA 1LMTA 1VDQA 2DQIY 4LT1A 4NSGA 1JIYA 3B0OA 5APCA 5F81A 1FLWA 1DI5A 3B0IA 5HQ1A 4PRQA 4WL7A 2PC2A 5J7CA 1GB0A 1QTEA 2G4PA 2MEEA 4TX7A 4WLDA 4HTQA 2BQHA 3WUAA 2DQDY 5APFA 5HMVA 1FLQA 1UACY 3EBAB 1YILA 5LAFA 1HEQA 1RCMA 1IY4A 5KXNA 1DXJA 4L41A 3LZ2A 1GF7A 2C8PA 1F0WA 1WQRA 4CFOA 4LYBA 1LYSA 3WYHA 2XTHA 2ZNXY 1IR8A 2YVBA 5F16A 2CDSA 4QGZA 1JITA 4EOFA 1GFJA 4OOOA 3AGGG 1G7LC 4ETEA 4CFPA 1CJ7A 4P2EA 4FJRA 1XGTC 2H9JA 4XJFA 1BWHA 1BVKC 1LMQA 1UIBA 2HEAA 1OUBA 4DDBA 2ZYPA 4H92A 2YBMA 4TTDA 5B06A 3WXUA 3A95A 4C5FA 1GFEA 5LVJA 4PRUA 3ULRA 2A7DA 5KXKA 1LZYA 2BQIA 3F6ZA 3AW7A 1HFZA 2BAAA 4GN5C 154LA 1HNLA 1IWVA 1HSXA 2Y8PA 2HEFA 2ZQ4A 3IJVA 3LYOA 3ATNA 1LJ4A 4HJZA 1DPWA 1Z55A 4IASA 1ZMYL 5KKJA 1YANA 5B1FA 1GPQC 3J4GA 4H94A 1IP5A 4KL7A 1BQLY 3BKHA 5LVIA 2IHLA 5KXMA 1JJ3A 5F9XA 1B2KA 1D6PA 1G7IC 5B1GA 1LMNA 1MLCE 2WARA 1B5VA 1LSYA 2EPEA 4H91A 1T6VL 1QTKA 4ETAA 1NWGA 1LOZA 3A94A 1JPOA 3WPJA 1HC0A 3FE0A 3KAMA 1J1XY 2Q0MX 1ZVYB 4GCEA 3WXTA 1JEFA 2LYZA 1LZ5A 2BLYA 1WQQA 3A6BY 1IP1A 1DI4A 1XEIA 4M6DA 1D9UA 4G9SA 1JISA 1LHHA 3B6LA 3RNXA 4ZEEA 1B5YA 4NGWA 1OQMA 4NIJA 1IWWA 3OJPA 4NGJA 3RU5A 1FKVA 4NG1A 4DDCA 5AMYA 1LZRA 4D9ZA 4ETDA 1D0KA 5ILCA 1CKHA 1UIAA 1LSMA 3G3BB 4GCBA 3AJNA 1GE0A 1C46A 3GXRA 4GCCA 4O34A 2CWIA 3J6KA 1NBYC 2CJLA 4YEOA 4H90A 1NQIA 4ETCA 4NWEA 1GBWA 1CJ8A 1UC0A 3AZ5A 1FLUA 2I25L 5FELA 5LVKA 2LYMA 1LJ3A 1UCOA 3W6EA 2D4IA 1LJFA 1UIGA 3MGWA 3W6BA 4ANRA 4X3BA 5DN5A 5C6LA 5KXTA 134LA 1TAYA 2BQAA 5LXWA 1LMAA 2ZYCA 2DQEY 4LGKA 3BKVA 1EQ4A 4XJHA 1YAMA 4H8ZA 2HEEA 1REMA 4MSTA 4H9AA 4HV2A 4BS7A 4QEQA 5I54A 1IR9A 3M3UA 3WW5A 5I4WA 4H9CA 2XBSA 1NF5A 4XENA 5D5FA 4WM6A 3TXGA 1FLYA 1YROA 3A3RX 1QSAA 1UIDA 4LYOA 2C8OA 4OWEA 1B5WA 135LA 1CJ9A 4QDNA 1NBZC 4MR1A 1VAUA 3TXIA 9LYZA 1LSBA 1LYOA 4WLYA 1OP9B 3TMWA 1HHLA 4ZIXA 4PPOA 1GBXA 2Z38A 4N1EI 4DD1A 1WQNA 4HJYA 4G4CA 3WMKA 1T3PA 1KXYA 1WVUA 1KXXA 1C43A 1B9OA 1LZ4A 5HNCA 1CJ6A 2BLXA 4HP0A 4KXIA 3AGIA 4OWHA 3T6UA 1OUIA 2H5ZA 4NG8A 2FYDA 3TMXA 1G7JC 2D91A 4H1PA 1OUEA 4GCDA 4WMGA 3WU8A 2ZQ3A 2BQFA 1WQMA 5B05A 4CJ2A 1JJ1A 194LA 193LA 1OUGA 1CKDA 1LSFA 5D5CA 1HSWA 1YL0X 3WUNA 1VATA 1AZFA 1YKZX 2DQHY 4YOPA 1LJJA 1B5UA 5FHWA 1IORA 4PJ2C 1CKCA 4HTNA 4LZTA 1BGIA 4ET8A 4XJGA 5LVHA 1F6SA 1IX0A 5C6IA 4HV1A 3WW6A 1GB5A 1IOTA 1IWZA 1GFHA 1YKXX 3G3AB 4CHXA 7LYZA 3QY4A 1H87A 5LVGA 4H9FA 2IFFY 1LSDA 4GCFA 5FEKA 2MEDA 3ZVQB 1JKAA 5ILFA 1A2YC 5M1YA 4N8ZA 1JSEA 1WQOA 3A6CY 4II8A 3TXEA 1JTPL 2G4NA 2FBDA 4OWAA 1QSWA 2YBHA 4CGEA 3A93A 2Z18A 1LSPA 1IOSA 1LZGA 1REXA 4N9RA 4RW2A 2EKSC 1LJNA 3A96A 5DLAA 2MEFA 1GEVA 4YEMA 3N9EA 2DKVA 1VDSA 3LN2A 5LINA 1IP4A 1BHZA 3AYQA 1XEKA 5KXZA 1GXXA 1IIZA 3A90A 4GN4A 1LKRA 2YBJA 1BWIA 1FKQA 1JKCA 2F2NA 1B5ZA 4OW1A 2I26L 1C45A 1ZVHL 1IWYA 2W1LA 2BQBA 1VDTA 1FDLY 3CSZA 1P2CC 1GBZA 4HJVA 4WG7A 4WL6A 1KXWA 5IHGA 1IEEA 2Z12A 5F14A 2DQCY 1QQYA 1GF5A 1GDXA 5DN4A 2XBRA 2BQJA 1LZ9A 3WULA 4YF2A 2Z2EA 1IC5Y 5L3IA 4LFXA 4J1BA 4XYYA 1NDMC 2D4KA 1RFPA 4QY9A 3A91A 3TXKA 3HBEX 2CGIA 4U3XB 3WVYA 1LJIA 3WU7A 1PS5A 3OK0A 4DD7A 1LJEA 1IWUA 4NGOA 5KXOA 5LYTA 3AB6A 1GWDA 1IR7A 2BQCA 1LZCA 2D6BA 3EO5A 2RSCA 1SLYA 3TXBA 2EQLA 3AGHA 1AKIA 3TMVA 5K7OA 3TMUA 4ML7A 5I53A 1IVMA 4B4JA 4AXTA 1LMOA 1GFVA 1TCYA 5KXRA 5LAGA 4NSJA 1BB7A 2DQJY 4NWHA 1DQJC 3B72A 3WU9A 4LFPA 3K3TA 4J0LA 4OOTA 207LA 4LT0A 1RJCB 1GBYA 1HERA 1LAAA 2LZ2A 2FBBA 1G7MC 1LHJA 1LMCA 2LZTA 1BB4A 1WTMA 1XFPL 2BQGA 2ZIJA 3A34A 2FYCA 4LT2A 4B0DA 1EQEA 5DM9A 5A3ZA 1GXV2 5II3A 1ZV5L 4ET9A 4M4OA 1LHLA 4LYMA 1JKDA 1INUA 1LZAA 2F4GA 1HFXA 2W1XA 1LJHA 4B1AA 1LZEA 1LZNA 2Z19A 2HECA 1HMKA 1B7MA 2I6ZA 1JTOL 1REZA 3CB7A 3TXJA 1J1PY 1GFTA 4TSCA 1I1ZA 3W6FA 3W6AA 1KIPC 5HLLA 3LYTA 3CQLA 4RDSA 3TXHA 1MELL 3FI7A 1LSCA 1HF4A 1LCNA 1YKYX 3VWOA 4OWBA 1IOQA 1IP3A 4G4BA 1GFGA 5APDA 1IOCA 5JENB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GFRA 2HU3A 1HFYA 1B7RA 242LA 1GE1A 3P4ZA 187LA 2ZIKA 3FADA 4H9BA 1YAPA 1L32A 2Q9DA 222LA 1LW9A 1EPYA 4WM4A 4LT3A 1JUGA 1B7SA 4XJBA 1LTMA 3AZ7A 3N9CA 4NGYA 1G07A 5APEA 3GXKA 244LA 4PHIA 1QIOA 3P68A 1L98A 4R0FA 189LA 1GF6A 1L12A 1LGWA 1O23A 4E97A 1SWZA 233LA 3HFMY 2W1MA 1W6ZA 1C6BA 1DKJA 4I7SA 4NGKA 4WLXA 4I8SA 4H8YA 1JSFA 1L20A 1IP7A 4RLNA 1DKKA 1L79A 1GDWA 4W58A 4TUNA 5E9RA 4Z41A 1GHLA 4GRVA 4TSBA 4NHTA 5KXPA 3HDEA 3DN3A 4DD0A 4NFVA 2MEHA 2B70A 1GB6A 1QTDA 4MCKA 4NSHA 3IJUA 5KXWA 4AGAA 5KXYA 1QS9A 4B4IA 2NWDX 1LSEA 4DWXA 1LZBA 1L19A 4WM2A 3SB5A 3ZEKA 3LYMA 1A4VA 1B7QA 1L29A 4Z46A 1AT6A 2D4JA 1GF9A 3TXFA 4DC4A 1P64A 4W52A 147LA 4GLAA 249LA 5LINA 1I20A 1XGQC 1CV0A 1LYZA 3C82A 4W94A 4WG1A 3P64A 1GB9A 1QUTA 3RZ4A 2BPUA 122LA 4EMNA 3A67Y 2B72A 4DT3A 4C3WA 1GB8A 2RBRA 4LYCA 1L03A 2G4QA 2HUMA 228LA 2EIZC 2BQNA 1UIFA 1B7NA 5I14A 3GUNA 1L04A 1L83A 3P65A 1L97A 4GLVA 1UUZC 5LIOA 1KIQC 2XQOA 1GF8A 4K5YA 4DD9A 1LYGA 3DN8A 4I0CA 4OWCA 1B0DA 1QTHA 2B7XA 1OVJA 1OWZA 4OO9A 1IC4Y 1B7OA 1P5CA 1GE4A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GFR A;  2MEI A;  1IC7 Y;  1HFY A;  1B7R A;  1C10 A;  2HU3 A;  1GE1 A;  4NSI A;  1GAZ A;  1BWJ A;  1LZ6 A;  4N0J A;  1HEW A;  3AW6 A;  4XJD A;  4E3U A;  153L A;  1D0M A;  1B7L A;  2DQA A;  2YBL A;  3P4Z A;  1LPI A;  2ZIK A;  4H9B A;  4WO9 A;  1YAP A;  4KT3 A;  5L9J A;  3N9A A;  5B07 A;  3EMS A;  1LZD A;  208L A;  5IEL A;  1CKG A;  1GB3 A;  4R6C A;  1GB7 A;  4WM1 A;  4WM4 A;  5KXS A;  1IY3 A;  1GFU A;  1V7S A;  4LT3 A;  1JUG A;  5DL9 A;  3W3E A;  1B7S A;  1C08 C;  1D0L A;  1OUC A;  4HPI A;  2Z39 A;  4XJB A;  1LTM A;  3AZ7 A;  5E4P A;  3N9C A;  4NGY A;  1E8L A;  5APE A;  3GXK A;  2H9K A;  4YEN A;  1EL1 A;  1GFA A;  3D9A C;  4PHI A;  5LYM A;  1QIO A;  3P68 A;  1LZ8 A;  1LZT A;  4R0F A;  3WPL A;  4H9H A;  1GF6 A;  4N5R A;  1LSA A;  2LYO A;  4A7D A;  5KXX A;  1O23 A;  1GF3 A;  3P66 A;  4G4H A;  3HFM Y;  4DDA A;  2ZNW Y;  4UWU A;  1VFB C;  2F4A A;  2HTX A;  1HEP A;  4BAP A;  2DBT A;  2W1M A;  1GBS A;  3WH1 A;  1B7P A;  1W6Z A;  1PZY A;  1DKJ A;  1TDY A;  2N5Z A;  3HBH A;  4I8S A;  4H8Y A;  4NGK A; 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 1GF5 A;  1GDX A;  5DN4 A;  2XBR A;  2BQJ A;  1LZ9 A;  3WUL A;  4YF2 A;  2Z2E A;  1IC5 Y;  5L3I A;  4LFX A;  4J1B A;  4XYY A;  1NDM C;  2D4K A;  1RFP A;  4QY9 A;  3A91 A;  3TXK A;  3HBE X;  2CGI A;  4U3X B;  3WVY A;  1LJI A;  3WU7 A;  1PS5 A;  3OK0 A;  4DD7 A;  1LJE A;  1IWU A;  4NGO A;  5KXO A;  5LYT A;  3AB6 A;  1GWD A;  1IR7 A;  2BQC A;  1LZC A;  2D6B A;  3EO5 A;  2RSC A;  1SLY A;  3TXB A;  2EQL A;  3AGH A;  1AKI A;  3TMV A;  5K7O A;  3TMU A;  4ML7 A;  5I53 A;  1IVM A;  4B4J A;  4AXT A;  1LMO A;  1GFV A;  1TCY A;  5KXR A;  5LAG A;  4NSJ A;  1BB7 A;  2DQJ Y;  4NWH A;  1DQJ C;  3B72 A;  3WU9 A;  4LFP A;  3K3T A;  4J0L A;  4OOT A;  207L A;  4LT0 A;  1RJC B;  1GBY A;  1HER A;  1LAA A;  2LZ2 A;  2FBB A;  1G7M C;  1LHJ A;  1LMC A;  2LZT A;  1BB4 A;  1WTM A;  1XFP L;  2BQG A;  2ZIJ A;  3A34 A;  2FYC A;  4LT2 A;  4B0D A;  1EQE A;  5DM9 A;  5A3Z A;  1GXV 2;  5II3 A;  1ZV5 L;  4ET9 A;  4M4O A;  1LHL A;  4LYM A;  1JKD A;  1INU A;  1LZA A;  2F4G A;  1HFX A;  2W1X A;  1LJH A;  4B1A A;  1LZE A;  1LZN A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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