3TXBA

Hewl co-crystallization with cisplatin in aqueous media with glycerol as the cryoprotectant
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Experience with exchange and archiving of raw data: comparison of data from two diffractometers and four software packages on a series of lysozyme crystals.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3txbA00
1IC4Y 1LZ1A 1CKHA 5KXMA 5KXTA 2FYDA 3ATNA 1TAYA 2F4AA 3M3UA 3W6BA 4H9FA 1OUGA 3AGHA 3AGGG 4GCCA 3WPKA 2CGIA 1WVUA 4LYBA 2YBNA 5KXWA 1LJ4A 4TWSA 1BWHA 1HC0A 5F14A 193LA 2ZWBA 4IATA 1GAYA 3TMUA 5APDA 5KXKA 1OUCA 3T6UA 1P2CC 1D6QA 5LINA 5A3EA 3MGWA 4LYTA 3WMKA 5D5FA 3AZ6A 4H9IA 4LT3A 4OWAA 1WQQA 3B0OA 1DPWA 4NWHA 1GB9A 1UIHA 1A2YC 1WQMA 2BAAA 2YBIA 4J1BA 2H9JA 4NWEA 4WO9A 3TXBA 4CFOA 1LYZA 1LZ6A 1W6ZA 2C8OA 3CSZA 4G4BA 1WTNA 5B59A 1WTMA 1TDYA 1DQJC 5E4PA 1CKFA 1B7SA 2BLYA 4BAFA 1LJNA 1HEQA 2Z39A 3WL2A 4DC4A 1FLYA 1LSPA 1RJCB 3A91A 4ZEEA 1JKAA 4UWVA 2EPEA 4XJIA 208LA 1WQRA 1JSFA 1PZYA 3KAMA 4G4HA 4HP0A 5C6JA 4TTDA 1NHEA 1NWGA 1LYOA 3A95A 1WQNA 4H1PA 5HMJA 1INUA 4IASA 5APCA 3P66A 1A4VA 2BQCA 4OOOA 5F16A 5KXZA 3FE0A 3B0IA 4NY5A 4TSBA 2ZNWY 1LSZA 4BS7A 1ZMYL 3WVYA 1IP5A 1IX0A 2MEBA 3A96A 1XGTC 1YL1X 3B6LA 1KIRC 1YAMA 1JJ0A 3D9AC 4LZTA 4H9BA 4XJFA 3W3EA 5A3ZA 1LPIA 1GWDA 1TCYA 1QUTA 3CSQA 1GD6A 2BQAA 1IWUA 1KXWA 3IWRA 1REYA 4H92A 5I4XA 4WLXA 3CT0A 2D4JA 1LSFA 4HTNA 4PPOA 3CSRA 4NGVA 3CB7A 4HPEA 4WM4A 1VEDA 5LAGA 3RT5X 2BQNA 4RLNA 1GB0A 2MECA 1B7OA 2C8PA 1JKCA 2EKSC 4TX7A 5LVGA 4NSHA 5KY1A 1F0WA 1IP6A 2YBJA 1V7SA 2HEAA 2Z18A 1BGIA 1LHJA 1OP9B 1GFEA 4N0JA 2MEEA 1D0KA 1LOZA 1G7HC 4WLTA 3WXTA 2MEGA 2BQBA 5KXRA 5KXSA 5K7OA 1IR7A 1VDSA 4WG7A 1CKCA 3VWOA 4G49A 1D9UA 4W96A 2XBRA 1LJHA 1OUDA 4DD2A 4CGEA 1BB7A 4EOFA 3P65A 1LZCA 3QNGA 2DQCY 5HQ1A 3G3AB 5ILFA 3CT1A 3A34A 2D4KA 3A3QA 4PRQA 4GN5C 1W08A 4YEMA 2ZIKA 1B7PA 4H9CA 4NHIA 1TBYA 2H5ZA 4NSIA 2BQEA 1JPOA 1LSMA 1NQIA 1LZTA 2BQJA 1FLUA 2BQIA 2I26L 5I5QA 2BLXA 2YBLA 4N1CC 1IORA 4H8YA 4NGJA 1MELL 1JJ3A 2YBMA 3B0KA 2BQLA 4TUNA 1GB5A 1LMOA 5LYMA 2Z12A 1IOCA 3ZVQB 5IELA 3TMWA 1B5XA 1CJ7A 1JWRA 1HSXA 5DLAA 2ZYCA 1GEZA 5DM9A 1MLCE 1OUJA 2XJWA 1GB6A 3TXEA 3WU8A 1CJ9A 3ZVQA 4B0DA 4YF2A 2F4GA 2BQKA 1QTEA 4FDYA 3A3RX 3A94A 5LVKA 3TXDA 4LGKA 1GE2A 4KPMA 4QEQA 1LSCA 1VFBC 4HJYA 1UCOA 3N9EA 2CJLA 4PJ2C 1GHLA 5LVJA 2HUBA 4XENA 2HEDA 1LHHA 2W1YA 3A6BY 1DPXA 1ZVYB 1OUFA 3LYOA 5M1YA 1VDPA 1IWZA 1JTOL 1XEIA 3J4GA 5AMYA 1REMA 1LZAA 1F6SA 133LA 1HERA 1V7TA 1LHLA 1QTKA 4HPIA 3A6CY 4NG1A 3EMSA 4DYGA 4H9AA 1IOTA 4OWEA 4PGJB 2DQGY 1UUZC 4WM3A 4WLYA 1LAAA 1NMMA 3K3TA 5I4YA 1GBOA 5HNCA 1DI3A 1GDWA 1HELA 4ETDA 3W6CA 1GE4A 3LYZA 2W1XA 3WYHA 5LYZA 2I6ZA 1YKXX 2DQAA 2DKVA 1BB3A 1HFXA 1HEPA 1GF5A 1LSYA 1B7RA 1GFRA 1LZEA 1SQ2L 1ZV5L 1GF7A 1C45A 1GB3A 3M18B 1IP7A 2Z38A 3LZ2A 1QDTA 4I0CA 1SLYA 4NGWA 4WOAA 5KJ9A 4RDSA 2Y8PA 3GXKA 1GE0A 1GDXA 3N9CA 1LKSA 1UIDA 3A92A 4ANRA 4M4OA 1H6MA 1JITA 5KXPA 1JJ1A 3LYTA 1FKQA 3A93A 1TEWA 3HBHA 4DD7A 2FBDA 1LCNA 1GF3A 5APFA 1GE3A 1B5VA 1J1PY 1KXYA 1OUBA 2DQJY 3P64A 1BWJA 1EQ4A 3TXIA 5L9JA 1IVMA 4ETBA 5II3A 1LMQA 1IP2A 2YSSC 4OW1A 1IOQA 2DQEY 1BB6A 3OK0A 4C3WA 154LA 4ETAA 3G3BB 4G4CA 5J7CA 1C43A 1LMTA 4XJBA 2W1MA 4WM6A 3TXGA 4WL7A 4XN6A 1FKVA 1IWXA 1IEEA 3WXUA 2BQFA 1JTTL 4EMNA 5LVHA 5ILCA 5FSTA 1LHKA 4NGZA 2IFFY 4TSCA 1NDMC 1GB7A 1UACY 1BQLY 4KL7A 5IHGA 2LZ2A 3W6EA 4MCKA 4YOPA 1GFKA 4C5FA 4B4IA 1LMCA 4NHSA 4KT3A 1C08C 4N8ZA 2G4NA 4NHPA 2WARA 2ZYPA 1JISA 2BQOA 4XJHA 4LT1A 5F81A 3T36A 1GF4A 1IP3A 1IY3A 1GBWA 1LMNA 3LZTA 2BQDA 5B06A 1IP1A 4WG1A 3EO5A 4Z98A 4ETEA 1Z55A 1OUEA 2LHMA 6LYTA 5I4WA 3BKVA 2IHLA 4Z46A 1B2KA 1B9OA 1B7NA 1D0MA 1GF0A 4NG8A 4WM1A 4DDAA 1HEOA 1IR9A 1NBZC 4H90A 5F9XA 5FEKA 1DI4A 1DI5A 1CKGA 1C7PA 1OQMA 1GB2A 4DD3A 4WM2A 5LAFA 1LZ8A 1DKJA 1UIEA 4H8ZA 1LSBA 1G7JC 1F6RA 2XBSA 1J1XY 2Z19A 1DZBX 135LA 2XTHA 2ZIJA 5DN5A 4GCEA 5DN4A 4IJ4A 4Z3MA 5LVIA 3AGIA 4DD9A 2MEFA 2BQMA 4NHQA 1EL1A 1HMKA 1CJ6A 1UIBA 1GFUA 2Z2EA 2G4QA 4DWXA 2H9KA 3W6DA 4GCFA 3D3DA 4HJVA 1FDLY 4LFPA 1HENA 5KKIA 1I20A 2BPUA 2MEHA 1B5WA 1QQYA 2EQLA 4ML7A 5HLLA 1UIGA 4NFVA 4WM5A 1YILA 1IC5Y 1I1ZA 3WULA 1XGUC 2ZQ3A 4DDCA 5KXOA 4LYOA 1JHLA 4KXIA 3WW5A 3WPJA 1QUSA 4H8XA 4WMGA 4GCBA 1IWTA 2FYCA 2A7FA 1NF5A 134LA 3SP3A 2D4IA 3P4ZA 1LZRA 1JTPL 1YL0X 4I8SA 1IC7Y 4GLVA 2I25L 5FHWA 4ZIXA 1D6PA 1BHZA 1JIYA 3AZ5A 1BVXA 4LFXA 1OUHA 1LZ5A 3CQLA 4J0LA 5D5CA 5HMVA 2EIZC 2A7DA 2LYMA 1LJKA 4OWCA 1B0DA 1GBYA 1LJIA 4R6CA 4CFPA 1LJGA 1KIQC 1NKHA 1VAUA 2YVBA 1LSNA 5L3IA 1GF8A 3WU7A 3HBEX 4B4JA 4M6DA 1UBZA 4GN4A 3GXRA 1D0LA 1LZDA 4MSTA 2LYOA 1B5YA 1UC0A 1BB4A 2ZNXY 3AZ4A 1G7LC 2MEAA 4HV2A 3WVXA 3RZ4A 1WQPA 4MR1A 1LMPA 1GFGA 5E9RA 1HMLA 5EBHA 4XYYA 1AT5A 3WUNA 1GBZA 1WVVA 1KIPC 1YANA 4O34A 4CHXA 4PRUA 1RI8B 207LA 2N5ZA 1BVKC 1GFTA 1JUGA 5KXXA 8LYZA 2ZILA 1T3PA 4NHTA 2HU1A 1FLQA 1GF9A 1IOSA 4OWBA 4Z41A 1WQOA 1HFYA 3IJUA 1HSWA 1GFJA 4OOTA 1LZ4A 4H91A 3TMVA 2BQGA 4QGZA 4LYMA 5LA5A 1LYSA 1YROA 1GBXA 1LHMA 3AB6A 4UWUA 5KXNA 1LJJA 3AJNA 3P68A 3QE8A 1O23A 4GCDA 3ULRA 3J6KA 5FCPA 2YBHA 1N4FA 1PS5A 1UICA 4WLDA 1YAQA 1YKZX 1LJ3A 2CDSA 4XJDA 5HNLA 4X3BA 1YAPA 5APEA 1AZFA 1FBIX 1E8LA 1EQ5A 1GAZA 3IJVA 4DD1A 3EXDA 4GN3A 4OWHA 4RW2A 1XFPL 5KXLA 4B4EA 4UWNA 4N5RA 4II8A 4NSJA 2HEFA 1J1OY 2Q0MX 1C46A 2DBTA 3ATOA 4D9ZA 4DDBA 1UIFA 1JKDA 1YQVY 2ZQ4A 5KKJA 1YKYX 1LSDA 2X0AA 5KXYA 1G7IC 3WUAA 1GE1A 4G9SA 4NGLA 4E3UA 1GFVA 1HEMA 4QY9A 4DT3A 3TXFA 4YEOA 3N9AA 1GFHA 1LJEA 3HBDA 1IIZA 9LYZA 4CJ2A 2F30A 5LXWA 1XEJA 1T6VL 2FBBA 4NSGA 3W6AA 1ALCA 2DQIY 1LHIA 2Z2FA 1AT6A 2CWIA 3TXKA 2HECA 1AKIA 3LN2A 132LA 4HTKA 4HTQA 3WH1A 1VATA 1RE2A 1IWYA 4NGOA 3AYQA 4PHIA 1LSGA 1JKBA 2B5ZA 2G4PA 1GXXA 1UIAA 1I56A 1XGQC 4H9HA 3BKHA 4WO6A 4ZFPA 5B1FA 3RNXA 1HFZA 1VDTA 5C6LA 3QY4A 1LZYA 2HTXA 4NGYA 4LT0A 4ETCA 3LHMA 4NIJA 4J1AA 5I53A 1GEVA 2LYZA 4H94A 4U3XB 4R0FA 4B1AA 4ET8A 1QIOA 3W6FA 1JSEA 1RFPA 1YIKA 4H9EA 2F2NA 5FELA 1F10A 1CNSA 1XGPC 1LYYA 4A7DA 4NGKA 3WW6A 5B07A 2D91A 1GFAA 4GLAA 1B7MA 5DL9A 1DKKA 1LZNA 1IO5A 1HF4A 1LZ9A 4AXTA 1UA6Y 5JENB 4RW1A 2MEDA 3F6ZA 4DD0A 4HV1A 1LZGA 2HEEA 3AZ7A 1NDGC 4HJZA 4XJGA 1GBSA 5LA8A 1LZSA 1QSAA 1B5ZA 6LYZA 1JEFA 5FDJA 5C6IA 4YENA 1DXJA 4J7VA 4NEBA 4YM8A 1RCMA 1B7LA 4L41A 1H87A 4HSFA 1LTMA 4N9RA 1FN5A 5F9UA 3LYMA 1LSAA 2Z37A 1LMAA 1BWIA 1FLWA 2D6BA 1QSWA 3A8ZA 2PC2A 4BADA 1GPQC 5LYTA 153LA 3TXHA 1BB5A 5IDDA 3ZEKA 4NGIA 2W1LA 1AM7A 1IP4A 3TMXA 3AW6A 1XGRC 5B1GA 2AUBA 1OUIA 1NBYC 1LZBA 1IR8A 3B72A 1OUAA 4W94A 1CJ8A 2DQFC 4H93A 5L3HA 3FI7A 1KXXA 1IWWA 2HEBA 3E3DA 4FJRA 1B7QA 2GV0A 2RSCA 1LJFA 1REZA 1HNLA 2DQHY 5I54A 3A90A 5LIOA 1G7MC 1GXV2 1YAOA 4WL6A 3EBAB 1XEKA 5B05A 4BAPA 1IWVA 1GB8A 194LA 4AGAA 3RU5A 1EQEA 1REXA 1VDQA 3AW7A 1LSEA 1B5UA 1HHLA 1LKRA 4RLMA 3WPLA 4P2EA 4ET9A 2NWDX 7LYZA 3TXJA 5T3FA 1C10A 2YDGA 1CKDA 2HU3A 3CT5A 4XADA 1IY4A 1XSFA 3RW8A 3WU9A 3WUMA 3OJPA 4N1EI 4QDNA 3A67Y 4LT2A 1QDRA 4LYCA 1GF6A 2VB1A 2MEIA 1ZVHL 1HEWA 2LZTA 4B49A 3HFMY 4LYZA 2BQHA 2DQDY
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1CKHA 5KXMA 2FYDA 3ATNA 4EPIA 1TAYA 2F4AA 3W6BA 3AGHA 4GCCA 1L18A 1QTVA 5KXKA 1ZWNA 2B73A 2B74A 3WMKA 1T8GA 1WQQA 145LA 2BAAA 4WO9A 4NWEA 1P56A 3TXBA 150LA 151LA 1LZ6A 1W6ZA 3SBAA 5B59A 225LA 1LSPA 1JKAA 208LA 1B6IA 3KAMA 1NWGA 1LYOA 5APCA 3FE0A 4NY5A 3SB5A 3WVYA 1IX0A 3D9AC 3W3EA 5A3ZA 1L34A 4H9BA 1L66A 1TCYA 1GD6A 1IWUA 5I4XA 4HTNA 4DAJA 112LA 1L84A 5LAGA 4RLNA 1GB0A 1JKCA 3HH6A 1IP6A 1G0LA 1L27A 1BGIA 1LHJA 4N0JA 4W59A 4WLTA 1L60A 4DQ5A 2MEGA 1L99A 5K7OA 1C69A 223LA 3VWOA 182LA 1D9UA 1LJHA 4EOFA 3QNGA 3G3AB 1LLHA 1W08A 129LA 4NHIA 1L68A 1L07A 2I26L 1JPOA 1LZTA 2BLXA 3SN6R 4NGJA 3DMZA 1P6YA 3B0KA 1L61A 3ZVQB 1CJ7A 1L69A 1GEZA 1L04A 3ZVQA 1QTEA 120LA 1P64A 1GE2A 1JQUA 4PJ2C 4I7KA 1L80A 1DPXA 3J4GA 1F6SA 1HERA 1SSWA 1CV3A 4NG1A 3EMSA 4OWEA 1T8AA 4WLYA 1GBOA 4OO9A 1GE4A 3GULA 2W1XA 2I6ZA 1YKXX 1HFXA 1LZEA 1HEPA 3M18B 1GFRA 4NWHA 3DKEX 3LZ2A 127LA 1SLYA 103LA 5KJ9A 4RDSA 1LKSA 1JITA 5KXPA 3LYTA 2FBDA 1GF3A 1T97A 1C6EA 1KXYA 1OUBA 1BWJA 1EQ4A 5L9JA 5II3A 154LA 4G4CA 5J7CA 4WM6A 1L95A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1IC4 Y;  1LZ1 A;  1CKH A;  5KXM A;  5KXT A;  2FYD A;  3ATN A;  1TAY A;  2F4A A;  3M3U A;  3W6B A;  4H9F A;  1OUG A;  3AGH A;  3AGG G;  4GCC A;  3WPK A;  2CGI A;  1WVU A;  4LYB A;  2YBN A;  5KXW A;  1LJ4 A;  4TWS A;  1BWH A;  1HC0 A;  5F14 A;  193L A;  2ZWB A;  4IAT A;  1GAY A;  3TMU A;  5APD A;  5KXK A;  1OUC A;  3T6U A;  1P2C C;  1D6Q A;  5LIN A;  5A3E A;  3MGW A;  4LYT A;  3WMK A;  5D5F A;  3AZ6 A;  4H9I A;  4LT3 A;  4OWA A;  1WQQ A;  3B0O A;  1DPW A;  4NWH A;  1GB9 A;  1UIH A;  1A2Y C;  1WQM A;  2BAA A;  2YBI A;  4J1B A;  2H9J A;  4NWE A;  4WO9 A;  3TXB A;  4CFO A;  1LYZ A;  1LZ6 A;  1W6Z A;  2C8O A;  3CSZ A;  4G4B A;  1WTN A;  5B59 A;  1WTM A;  1TDY A;  1DQJ C;  5E4P A;  1CKF A;  1B7S A;  2BLY A;  4BAF A;  1LJN A;  1HEQ A;  2Z39 A;  3WL2 A;  4DC4 A;  1FLY A;  1LSP A;  1RJC B;  3A91 A;  4ZEE A;  1JKA A;  4UWV A;  2EPE A;  4XJI A;  208L A;  1WQR A;  1JSF A;  1PZY A;  3KAM A;  4G4H A;  4HP0 A;  5C6J A;  4TTD A;  1NHE A;  1NWG A;  1LYO A;  3A95 A;  1WQN A;  4H1P A;  5HMJ A;  1INU A;  4IAS A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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