3TXGA

Hewl co-crystallization with cisplatin in dmso media with paratone as the cryoprotectant
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Experience with exchange and archiving of raw data: comparison of data from two diffractometers and four software packages on a series of lysozyme crystals.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
total genus 44
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3txgA00
3N9EA 1LSGA 1IC5Y 4LT0A 2XBRA 1IEEA 1JKAA 1REZA 2DBTA 1GPQC 1E8LA 4DDBA 2ZQ3A 4H9AA 4IASA 4WO9A 1D0LA 2D4IA 1AT6A 5LINA 1BB5A 2A7FA 4H9HA 4N8ZA 2X0AA 3P65A 2W1LA 5FDJA 5KXLA 2Z18A 4N1EI 1OQMA 4N9RA 1JUGA 1C45A 1LMNA 1VDTA 4DD0A 1IR9A 1UIFA 2D4JA 4I8SA 4TWSA 3WU9A 3GXRA 4NY5A 2YBNA 208LA 3W6AA 4TTDA 1HF4A 3WU8A 1LJEA 1GWDA 3LYTA 1AKIA 1F6SA 1GB9A 2G4QA 3A67Y 1REYA 7LYZA 4ETEA 3WULA 5D5CA 4R6CA 4Z3MA 1QTKA 1GXV2 1WTMA 5F81A 1SQ2L 4H91A 1UCOA 1GE4A 2VB1A 3BKVA 4WM1A 5I5QA 5J7CA 1D9UA 1GFKA 1IWWA 1GBWA 1GF0A 2YBLA 4LFPA 1LSYA 4LYZA 3RNXA 1WVUA 5F9UA 1QUTA 4NGZA 2CGIA 2G4PA 2MEEA 1KIRC 2WARA 3OK0A 4GCCA 4KT3A 4HPIA 1JSFA 3A94A 5KXZA 1GB0A 2MEBA 1QSWA 4NIJA 1GB2A 1LHMA 3D9AC 2CDSA 1INUA 1CKFA 3VWOA 5IDDA 4NWHA 1LSBA 2W1MA 4TX7A 1GBZA 2D4KA 2BQHA 3LZTA 3WPKA 133LA 4DD9A 3RW8A 1T3PA 2FYDA 1JSEA 4H9IA 3AB6A 1UA6Y 4XENA 4G4CA 1B7LA 4M4OA 3T6UA 4DD7A 3TXFA 2ZYPA 2DKVA 1CJ6A 1LZBA 2I26L 1GE1A 1GHLA 1LJGA 4G9SA 4LFXA 4RLNA 4NWEA 4HJYA 1OP9B 3CT1A 5HMVA 4PRUA 1OUBA 5KXPA 5M1YA 4HPEA 3LYMA 2F2NA 1GAZA 1B5ZA 1J1PY 1MLCE 1HSWA 1OUIA 2MEIA 1VDPA 1WQMA 4Z98A 3N9AA 3WVXA 3W6FA 4XADA 1B7NA 4NGWA 5LVJA 3ATOA 4LT2A 5HNCA 1LMPA 4RDSA 2XBSA 1GF5A 1BVKC 1LHHA 1JTPL 2BQNA 1IIZA 4H8YA 3WH1A 5JENB 3WW6A 2FYCA 134LA 2EIZC 4AXTA 1AM7A 4HTKA 1BGIA 3LN2A 1CKHA 3WUMA 4GN5C 3TXEA 4DYGA 1LZAA 1IP6A 4RLMA 5KXMA 3W3EA 1WTNA 2ZIKA 1BB6A 5KXXA 4UWNA 3CB7A 2EPEA 2N5ZA 3RT5X 5II3A 4Z46A 2W1YA 1B7RA 1NMMA 1I56A 4NG1A 2BQJA 3AW7A 5AMYA 2YDGA 4OWHA 2NWDX 1H87A 1YAMA 2B5ZA 4KPMA 4U3XB 5EBHA 2G4NA 5FSTA 1LKSA 1LSZA 2Z12A 1IP2A 4KL7A 1GF3A 1C10A 1B7MA 1DKKA 1CJ8A 2ZILA 5KXSA 2HECA 1N4FA 3HBHA 1IOSA 4XJHA 4YOPA 3ZEKA 1J1OY 1REXA 1GAYA 4PHIA 1IWXA 2LYOA 1YROA 4OWCA 1JHLA 1LSAA 3P64A 1LHIA 1FKQA 1LZDA 3TXKA 2BQLA 2DQGY 4ET8A 1ZVHL 1JJ3A 1AZFA 4OWBA 1D0KA 1LJFA 1XGPC 1AT5A 2ZWBA 2DQDY 1LZTA 4WL6A 1GFVA 1OUCA 2CWIA 1DKJA 3KAMA 1I20A 1FBIX 1A2YC 1RI8B 1YANA 1IWVA 1UIBA 1XGRC 5F16A 3SP3A 1FLWA 3TXHA 1LPIA 4NHTA 4B49A 1QUSA 2HEAA 1UC0A 3WXTA 1G7MC 5KXRA 1LYSA 1GF6A 1B7QA 1JIYA 1OUAA 1LTMA 4WM2A 1LCNA 5DM9A 1LZCA 4B4IA 4RW2A 1VAUA 5LAFA 2LZTA 5KXNA 5T3FA 3E3DA 4YEOA 4Z41A 4XJDA 5LA5A 1IC4Y 3CSQA 4MCKA 5L3IA 1B5YA 4ZIXA 1W08A 4LGKA 5D5FA 1LMQA 1VATA 5LVGA 1G7HC 5IHGA 1LZYA 4H8XA 5FCPA 1VEDA 1LZ6A 5LAGA 5LVIA 1LJ4A 1C08C 1GE2A 5B59A 3QNGA 1LZ4A 1D6PA 1IP3A 5APDA 194LA 4GCBA 1CJ7A 1WQQA 5A3ZA 4NGIA 1KXYA 4NHSA 1OUFA 4H90A 5DL9A 3WPJA 1GF4A 1VDSA 2C8PA 4BS7A 1EQ5A 1LKRA 1WQNA 1LSEA 2BQCA 5B1GA 2BQMA 1GB8A 1J1XY 1IOCA 1JWRA 1RFPA 4MSTA 4NGKA 1LZSA 4WO6A 4GN3A 4NHIA 5K7OA 2BQIA 1GFUA 5I4XA 4J0LA 4N0JA 4FJRA 1TCYA 1C7PA 154LA 4HV1A 4KXIA 3TXDA 1F10A 1KXWA 3G3AB 3A6CY 1DI3A 1CKDA 2YSSC 1V7TA 4NGYA 1OUEA 2C8OA 3A90A 3TXIA 1KXXA 1NKHA 4EOFA 8LYZA 1BVXA 5KJ9A 1GEVA 1YL0X 4TUNA 4AGAA 4GLAA 4YM8A 5ILFA 1RJCB 4LT3A 4QDNA 4B0DA 1JKDA 1HELA 1PS5A 1ALCA 2IFFY 1JISA 3CT5A 3HFMY 4NGOA 1UBZA 4RW1A 2FBBA 1B5VA 5LXWA 2BPUA 1F0WA 4CFOA 1HEWA 1XFPL 2H5ZA 1YAOA 2LZ2A 5F14A 4DDCA 2HEBA 3ZVQB 4DWXA 4QY9A 1C46A 3WVYA 1EQ4A 1TAYA 2GV0A 1LZ8A 2BQEA 3FE0A 1UIGA 1B7PA 1DPWA 4H8ZA 1IOQA 1IWTA 3B72A 1BQLY 4P2EA 1NF5A 1NDGC 4C3WA 2DQJY 3J6KA 4WLYA 3ATNA 1MELL 1HEMA 4OWAA 1IP1A 4NFVA 5LA8A 3BKHA 4N5RA 3EXDA 1CNSA 3D3DA 5FEKA 4WM6A 1HFZA 3W6DA 5HLLA 4J1BA 1T6VL 2PC2A 1YQVY 2BQFA 1NQIA 2MECA 2Z37A 1JTTL 4QGZA 4NSHA 1TBYA 1DPXA 1LSNA 1GFJA 2BLYA 1LZGA 2LYZA 3P66A 1GE3A 1DXJA 4ETCA 1IP5A 1LZ5A 2LHMA 3WL2A 3GXKA 2RSCA 3A95A 2BQAA 5C6LA 2BAAA 3LYOA 1B0DA 5B07A 1NBZC 2BQGA 4HJVA 3ULRA 4G4BA 1LZ9A 1YKZX 1BB3A 2BQOA 3HBEX 1OUHA 2DQFC 4XJGA 4H9EA 2F4GA 4IATA 4O34A 3RU5A 1SLYA 3AJNA 3B6LA 4ML7A 1YILA 2HEFA 1LJ3A 3CSRA 4PRQA 5KXWA 1LOZA 3LYZA 1LYZA 1NBYC 3TMVA 1LHLA 4MR1A 1G7IC 1GF8A 4BAFA 2LYMA 4DD1A 2FBDA 5L9JA 3TMWA 1TEWA 4B4EA 4CFPA 4WLTA 2DQAA 3B0IA 3WXUA 4H93A 1DQJC 5LYMA 1IORA 2BQDA 1IVMA 1KIPC 2F30A 3N9CA 3A6BY 1O23A 2DQEY 4WM4A 1KIQC 1XEIA 3A8ZA 4CJ2A 1YKYX 1GBOA 1LYYA 2ZIJA 3AZ6A 2I25L 4H1PA 4HP0A 4PGJB 5APCA 1ZVYB 1LJIA 5KKJA 5DN4A 4QEQA 1HMKA 5HMJA 3T36A 1Z55A 4ANRA 1UACY 1QDRA 2YVBA 4G49A 5B05A 2I6ZA 2HU3A 1ZMYL 1UICA 3CT0A 4ETBA 1GB5A 1JPOA 4B1AA 5B1FA 4WG7A 1GBYA 1HEQA 1XGQC 4DD2A 1BWIA 1QTEA 1YKXX 1RCMA 2D91A 4NHPA 5C6JA 3W6CA 4LYBA 2DQIY 3TXBA 4II8A 2MEAA 2XTHA 4LYOA 1WQPA 3EMSA 1IR8A 132LA 1LMTA 5E9RA 4CGEA 4H92A 1GFRA 3W6BA 3K3TA 1HFXA 1XGUC 4CHXA 4NGVA 1D6QA 4IJ4A 4XJBA 2MEFA 4ET9A 1WVVA 1BB4A 2BLXA 3IJUA 5LVHA 1GB7A 2Z2FA 1G7LC 1IR7A 4HV2A 5LIOA 3WUAA 3WMKA 1GFGA 4XYYA 1EQEA 4NGLA 3WYHA 4B4JA 3B0OA 1YAPA 1NHEA 1HC0A 1FDLY 1P2CC 1WQOA 1C43A 1GDWA 1NDMC 3AZ4A 3EBAB 1QQYA 4DDAA 4LYCA 4PJ2C 2EKSC 3M3UA 1DI4A 1IY4A 5LYZA 3IWRA 1IP4A 1UUZC 2W1XA 2Z39A 1CKGA 5I53A 1LZ1A 4H94A 3WU7A 1A4VA 1NWGA 3LZ2A 1OUDA 4WG1A 5KXOA 1JKCA 3A3QA 3ZVQA 1GF7A 1CKCA 2HEEA 1VDQA 4TSBA 3WW5A 1OUGA 4OOTA 2XJWA 3TXGA 1LZNA 1GB6A 3WPLA 5F9XA 4HTQA 4E3UA 3HBDA 2H9KA 1GFEA 1FKVA 4X3BA 4ZFPA 1LJJA 1HMLA 1XGTC 1IO5A 4LT1A 1EL1A 2MEHA 4NHQA 4WLXA 5C6IA 4BADA 2DQCY 4GCEA 1HHLA 3EO5A 5ILCA 4N1CC 4HTNA 2BQKA 1DI5A 2H9JA 4WM5A 1LSPA 1LSCA 2YBIA 3WUNA 1REMA 4WLDA 1LMOA 5APEA 4YF2A 1H6MA 4LYTA 4A7DA 3P4ZA 4W96A 1ZV5L 2ZQ4A 1XSFA 1B5XA 1GXXA 1LHJA 3M18B 3RZ4A 2Q0MX 1RE2A 3CQLA 1LZEA 1JITA 1I1ZA 5B06A 5HQ1A 1HEPA 4TSCA 1HENA 3A91A 3AW6A 1IWUA 1GEZA 1IWYA 5DN5A 1GE0A 4EMNA 3W6EA 1IY3A 2YBJA 4GLVA 4HJZA 1HEOA 3AGIA 5L3HA 1GBXA 4OW1A 2HEDA 4OWEA 4DC4A 3AGHA 1IC7Y 1GD6A 4NSJA 4XJIA 1HFYA 4M6DA 4DD3A 5HNLA 2HTXA 1YL1X 4NSIA 4WM3A 3TXJA 2IHLA 5KXTA 2DQHY 1LJHA 3OJPA 3J4GA 4NGJA 1B7SA 4LYMA 2MEDA 4R0FA 5E4PA 4ETDA 2ZNXY 3LHMA 1JJ0A 2YBMA 1B2KA 1JKBA 1LSDA 3A3RX 4L41A 4XN6A 207LA 4LZTA 5KY1A 2MEGA 3QE8A 1PZYA 1JEFA 2HU1A 4FDYA 1LYOA 3F6ZA 5IELA 1XEKA 5APFA 5FELA 1YIKA 3G3BB 1B5WA 4UWVA 4WL7A 5LYTA 5I4WA 1JTOL 1HNLA 1LZRA 1V7SA 2CJLA 4NEBA 4D9ZA 5LVKA 1B7OA 1VFBC 1FLQA 1GFHA 1HERA 1LMCA 1FN5A 1UIEA 4C5FA 3TMUA 2EQLA 9LYZA 2BQBA 1QIOA 3P68A 2YBHA 4GCFA 4G4HA 1GFTA 4W94A 1FLUA 4BAPA 1BWHA 1CJ9A 3AYQA 1UIHA 4GCDA 1LJNA 2Z19A 3A93A 4WMGA 3FI7A 4H9CA 4HSFA 4DT3A 3IJVA 2ZNWY 1QDTA 4OOOA 1G7JC 5KXYA 1W6ZA 4ZEEA 2D6BA 1GFAA 4GN4A 4WOAA 1IOTA 1IX0A 1UIDA 2A7DA 4YENA 3QY4A 1DZBX 3AZ7A 4ETAA 2ZYCA 1BHZA 1D0MA 1FLYA 1XEJA 5FHWA 1JJ1A 4XJFA 3TMXA 3A96A 1LAAA 4J1AA 4NSGA 5A3EA 1BB7A 1B9OA 1B5UA 1LJKA 2Z38A 2Y8PA 5I4YA 1HSXA 3AGGG 3A92A 2Z2EA 153LA 2AUBA 4I0CA 4YEMA 1IP7A 3CSZA 1UIAA 5I54A 4H9FA 2F4AA 3B0KA 1QSAA 135LA 6LYZA 1GBSA 1LSMA 3MGWA 4H9BA 193LA 1GB3A 5DLAA 1IWZA 4UWUA 6LYTA 3AZ5A 1LHKA 1TDYA 5KXKA 3A34A 1LMAA 1OUJA 2HUBA 1BWJA 4PPOA 1GDXA 1LSFA 5KKIA 1GF9A 1WQRA 1YAQA 4J7VA 4NG8A 1F6RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L01A 1G0JA 1IEEA 1JKAA 197LA 108LA 1LYEA 4IASA 4H9AA 4WO9A 1AT6A 4H9HA 7LZMA 2W1LA 4S0WA 1LPYA 4N1EI 4N9RA 1C45A 1C63A 4DD0A 3K2RA 1CV1A 196LA 162LA 1L82A 208LA 3W6AA 1HF4A 3WU8A 1LJEA 3LYTA 2G4QA 1L98A 1REYA 4Z3MA 4H91A 1UCOA 4IAPA 1D9UA 1GFKA 1GF0A 2YBLA 4LFPA 1WVUA 1QUTA 3OK0A 4GCCA 1GB0A 2NTGA 1L47A 3D9AC 1L23A 4NWHA 1GBZA 4H9IA 2F32A 4I7LA 164LA 3T6UA 4DQJA 1LZBA 4RLNA 1GHLA 4HJYA 3CT1A 1P5CA 4LDEA 4PRUA 3ODUA 5M1YA 4HPEA 1C65A 158LA 2F2NA 1KNIA 2L78A 1L67A 2MEIA 1VDPA 4DQ5A 1GF5A 168LA 1G0PA 1JTPL 3CDTA 3WW6A 2EIZC 3LN2A 3WUMA 1DYFA 1LZAA 1IP6A 4RLMA 5KXMA 1WTNA 1CX6A 5KXXA 2EPEA 5II3A 2W1YA 4NG1A 4W51A 1L19A 2B5ZA 1LSZA 4KL7A 1CUQA 1N4FA 4XJHA 4OWCA 1JHLA 3P64A 4ARMA 1LZDA 2BQLA 1ZVHL 1D0KA 1L21A 1LJFA 3PBLA 4I7JA 1OUCA 147LA 5F16A 1C66A 1XGRC 3SP3A 1UC0A 3WXTA 3L64A 1LYSA 1OUAA 4WM2A 1QUGA 166LA 2Q9DA 3DN4A 1CU3A 4MCKA 1B5YA 174LA 5FCPA 1LJ4A 4EKPA 1WQQA 163LA 216LA 4NGIA 1KXYA 1OUFA 5DL9A 1EQ5A 1LSEA 5B1GA 102LA 1GB8A 1JWRA 1K28A 4WO6A 4GN3A 2BQIA 5I4XA 4N0JA 1C7PA 4KXIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3N9E A;  1LSG A;  1IC5 Y;  4LT0 A;  2XBR A;  1IEE A;  1JKA A;  1REZ A;  2DBT A;  1GPQ C;  1E8L A;  4DDB A;  2ZQ3 A;  4H9A A;  4IAS A;  4WO9 A;  1D0L A;  2D4I A;  1AT6 A;  5LIN A;  1BB5 A;  2A7F A;  4H9H A;  4N8Z A;  2X0A A;  3P65 A;  2W1L A;  5FDJ A;  5KXL A;  2Z18 A;  4N1E I;  1OQM A;  4N9R A;  1JUG A;  1C45 A;  1LMN A;  1VDT A;  4DD0 A;  1IR9 A;  1UIF A;  2D4J A;  4I8S A;  4TWS A;  3WU9 A;  3GXR A;  4NY5 A;  2YBN A;  208L A;  3W6A A;  4TTD A;  1HF4 A;  3WU8 A;  1LJE A;  1GWD A;  3LYT A;  1AKI A;  1F6S A;  1GB9 A;  2G4Q A;  3A67 Y;  1REY A;  7LYZ A;  4ETE A;  3WUL A;  5D5C A;  4R6C A;  4Z3M A;  1QTK A;  1GXV 2;  1WTM A;  5F81 A;  1SQ2 L;  4H91 A;  1UCO A;  1GE4 A;  2VB1 A;  3BKV A;  4WM1 A;  5I5Q A;  5J7C A;  1D9U A;  1GFK A;  1IWW A;  1GBW A;  1GF0 A;  2YBL A;  4LFP A;  1LSY A;  4LYZ A;  3RNX A;  1WVU A;  5F9U A;  1QUT A;  4NGZ A;  2CGI A;  2G4P A;  2MEE A;  1KIR C;  2WAR A;  3OK0 A;  4GCC A;  4KT3 A;  4HPI A;  1JSF A;  3A94 A;  5KXZ A;  1GB0 A;  2MEB A;  1QSW A;  4NIJ A;  1GB2 A;  1LHM A; 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 1JEF A;  2HU1 A;  4FDY A;  1LYO A;  3F6Z A;  5IEL A;  1XEK A;  5APF A;  5FEL A;  1YIK A;  3G3B B;  1B5W A;  4UWV A;  4WL7 A;  5LYT A;  5I4W A;  1JTO L;  1HNL A;  1LZR A;  1V7S A;  2CJL A;  4NEB A;  4D9Z A;  5LVK A;  1B7O A;  1VFB C;  1FLQ A;  1GFH A;  1HER A;  1LMC A;  1FN5 A;  1UIE A;  4C5F A;  3TMU A;  2EQL A;  9LYZ A;  2BQB A;  1QIO A;  3P68 A;  2YBH A;  4GCF A;  4G4H A;  1GFT A;  4W94 A;  1FLU A;  4BAP A;  1BWH A;  1CJ9 A;  3AYQ A;  1UIH A;  4GCD A;  1LJN A;  2Z19 A;  3A93 A;  4WMG A;  3FI7 A;  4H9C A;  4HSF A;  4DT3 A;  3IJV A;  2ZNW Y;  1QDT A;  4OOO A;  1G7J C;  5KXY A;  1W6Z A;  4ZEE A;  2D6B A;  1GFA A;  4GN4 A;  4WOA A;  1IOT A;  1IX0 A;  1UID A;  2A7D A;  4YEN A;  3QY4 A;  1DZB X;  3AZ7 A;  4ETA A;  2ZYC A;  1BHZ A;  1D0M A;  1FLY A;  1XEJ A;  5FHW A;  1JJ1 A;  4XJF A;  3TMX A;  3A96 A;  1LAA A;  4J1A A;  4NSG A;  5A3E A;  1BB7 A;  1B9O A;  1B5U A;  1LJK A;  2Z38 A;  2Y8P A;  5I4Y A;  1HSX A;  3AGG G;  3A92 A;  2Z2E A;  153L A;  2AUB A;  4I0C A;  4YEM A;  1IP7 A;  3CSZ A;  1UIA A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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