3ULRA

Lysozyme contamination facilitates crystallization of a hetero-trimericcortactin:arg:lysozyme complex
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Lysozyme contamination facilitates crystallization of a heterotrimeric cortactin-Arg-lysozyme complex.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase, protein binding
source organism Gallus gallus
molecule keywords Lysozyme C
total genus 51
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-11-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3ulrA00
2CGIA 2HTXA 3W6BA 1JJ1A 1OUHA 1BB4A 2LYMA 1JHLA 4DD2A 2XBSA 1KIPC 1WTNA 4QDNA 4X3BA 2MEBA 1GFHA 4WLYA 1B5UA 2W1XA 2LZTA 4H92A 2BQAA 2BLXA 1GE4A 4HJZA 4TX7A 2FBDA 1KIQC 2DQCY 1GEZA 1LZAA 3FI7A 1TCYA 4NGOA 1LCNA 4RLNA 1GPQC 1JTPL 4YF2A 5B06A 1TEWA 1GE3A 4GLVA 1FKQA 2HU1A 1LZEA 5LVHA 1IIZA 5D5FA 4OW1A 4HV2A 4XJIA 2DQGY 1J1PY 1J1OY 1C08C 2C8OA 4WM3A 3B0KA 1OUEA 2XTHA 1HEWA 1IR7A 3QNGA 1IOTA 5KY1A 4M6DA 4IASA 5LAFA 3AW6A 3D9AC 5KXSA 4XN6A 3CSRA 4P2EA 3M18B 1LJHA 5DN5A 4YEMA 4WMGA 154LA 3A6BY 3LYTA 3TXDA 1HMLA 1NDGC 1BHZA 2FYCA 2H5ZA 3AZ4A 4R0FA 4TSCA 4B1AA 1LJ3A 4GCFA 1B7QA 3RU5A 1HHLA 1B5YA 1W08A 5APDA 3WULA 3WXUA 1JSEA 1IR9A 4RW2A 4B4EA 1A4VA 3CT0A 1LJFA 5LAGA 1LMCA 1REZA 1JTTL 1OUFA 4ETCA 2BQCA 1ZVYB 2Z19A 4HPEA 3A90A 4J1BA 2XBRA 1B7PA 1LHMA 4ET9A 1LZRA 1LZ1A 1XEJA 1GF6A 1I56A 4CHXA 3QE8A 2MECA 1LSFA 4UWUA 1T3PA 1HNLA 1NHEA 4GCCA 1DPXA 4ETDA 4AGAA 1LSNA 4OWBA 2A7FA 2I25L 7LYZA 3TMVA 1IWZA 2VB1A 5E4PA 5I4YA 1LMQA 2BLYA 2EPEA 5LXWA 4H9IA 1LZ5A 4H91A 4HTNA 2BQHA 2MEGA 5DLAA 4DD1A 2DQHY 3TXEA 4Z46A 3IJUA 1B7RA 3TMWA 1JKAA 4NSJA 1JTOL 1QUTA 5F14A 1GFUA 4H9BA 4LYOA 4ZEEA 5KXZA 1VDSA 4ZIXA 1GE1A 3KAMA 1HC0A 1YANA 4H93A 5LVKA 4TWSA 3RT5X 4DD7A 4NG8A 2I26L 1B5VA 3EBAB 3WXTA 4WG7A 2BQNA 4GCBA 4RLMA 1LYSA 1EQEA 1CKHA 1DI3A 4CJ2A 1WQPA 3LYMA 2DQEY 4GCEA 2BQJA 5KXXA 1LSDA 5APCA 4YOPA 5HNCA 3W6DA 1UC0A 3D3DA 1YAQA 4KL7A 4WM1A 4XENA 1GBXA 1UIFA 1GF7A 2AUBA 4NHSA 3CSZA 3P66A 1IY3A 1UIBA 4LFPA 4DD0A 3A93A 1FLUA 4GN5C 3ATNA 4ET8A 1LMOA 1OUAA 1ZVHL 4NGKA 4H8ZA 1DZBX 1VAUA 3LN2A 5J7CA 1GF8A 2Z12A 1MLCE 4PHIA 3WVYA 1KIRC 1IR8A 4N9RA 5L3HA 3WU9A 1GHLA 1F6RA 1HF4A 5APFA 4MCKA 1NWGA 1GBZA 5C6LA 1JEFA 3N9CA 4ETBA 2BQMA 3ZEKA 3E3DA 2N5ZA 4DDCA 1GF9A 1O23A 1XSFA 3J4GA 2YDGA 3J6KA 8LYZA 4NHTA 1D0KA 5I53A 1GF5A 2Z38A 4WM5A 4EMNA 3AZ7A 6LYZA 3B6LA 4NG1A 4CFOA 4LYCA 5LINA 2ZILA 1LHKA 1B7MA 1LYOA 1HFZA 4WL6A 3AGIA 5KXKA 4Z98A 4M4OA 5KXNA 5KXOA 2LZ2A 5LA8A 1GDWA 1QTKA 1LMPA 3ATOA 2LYOA 1IP7A 5I54A 3A3RX 1YKXX 2Z37A 1DXJA 4L41A 5F9XA 2BPUA 3TXKA 2ZNXY 5F81A 1JKBA 1IWYA 3LHMA 4LYZA 1XGTC 4H8XA 4H1PA 4WL7A 3P4ZA 1VDQA 4IATA 1UACY 3WUAA 5HQ1A 3WH1A 1LZTA 4RDSA 4W94A 1JISA 1P2CC 1FLQA 3N9AA 2G4PA 1GB8A 5C6IA 4H9EA 5K7OA 1GE0A 1GD6A 1IO5A 1YKYX 1LZSA 1IWWA 1LSMA 1V7SA 1JJ3A 2YBJA 1GBSA 1PZYA 1LOZA 3OJPA 5HLLA 1YL1X 4CGEA 4LZTA 1UA6Y 3CSQA 4LT3A 1BWIA 4HV1A 1INUA 5HMJA 1C10A 2HEFA 133LA 132LA 135LA 3P68A 1TDYA 1G7MC 1XEKA 1ALCA 4D9ZA 1HSXA 3A96A 3HBDA 3VWOA 2MEIA 3WPLA 2BQIA 3TMXA 1GXXA 3CQLA 5KXYA 5FELA 2ZIJA 3TXIA 4ANRA 5LVIA 4TSBA 1A2YC 4ML7A 5B07A 4ZFPA 2FBBA 5B05A 3ZVQA 1BB7A 1GXV2 1REYA 1IC5Y 5FDJA 2HUBA 1YL0X 1KXWA 1UIGA 4ETEA 3AYQA 3MGWA 1NQIA 1ZV5L 1BWHA 4WM2A 4C5FA 4N8ZA 5AMYA 1CKFA 3A92A 5FHWA 4LT2A 1LSEA 1GF4A 1IWTA 5DL9A 3G3BB 1XFPL 4OOTA 3CT5A 1YQVY 1XGUC 1C45A 2D91A 2I6ZA 4NHPA 3WUMA 4LGKA 1JIYA 4I0CA 4N0JA 3SP3A 208LA 1LJJA 1HEMA 2EQLA 5FSTA 1OUCA 1WVUA 3RZ4A 5C6JA 1LZ4A 3B0IA 1LSYA 1EQ4A 1YAMA 1B7LA 1WQRA 3GXKA 5KXWA 3TXBA 4NY5A 4NSGA 1XGRC 5A3EA 1LYZA 1LJIA 1SQ2L 3HBEX 4G4BA 3TXGA 1NDMC 2YBMA 1CNSA 1GB9A 2Q0MX 1LJKA 2BQBA 1LKSA 4NGJA 1LZNA 3LYOA 4DD9A 1REMA 1RI8B 4OWCA 2ZIKA 2MEHA 1HMKA 1XGPC 4J0LA 4LYMA 4YENA 4UWVA 1LSAA 4NEBA 3AW7A 3HBHA 3M3UA 4OWEA 4WLXA 2DQFC 1OP9B 1GB6A 3WMKA 2G4QA 1IP5A 2HEBA 1EQ5A 3B0OA 1IP4A 1B0DA 1JWRA 1H87A 1HEPA 5KKIA 1B5ZA 2X0AA 2BQOA 4PRUA 1HELA 2ZWBA 5IHGA 4WO9A 1GB0A 2BQLA 4WM6A 1B9OA 2D6BA 3WL2A 4G4HA 1V7TA 3A91A 4QY9A 4PGJB 5L9JA 1GFEA 5HNLA 1I1ZA 3T6UA 1VDPA 4E3UA 4J1AA 4PPOA 1W6ZA 1UIAA 1GEVA 4LYBA 1FKVA 1EL1A 3WPKA 1JSFA 4DD3A 1OQMA 2Y8PA 4AXTA 1IC4Y 2A7DA 1G7LC 2YVBA 4TTDA 5DM9A 3W6FA 1BB3A 1WQNA 2BQGA 1B7OA 3LYZA 4NFVA 1DPWA 1GAYA 1F6SA 2Z2EA 2G4NA 4OWHA 5T3FA 1HFXA 1LHJA 2MEAA 1IOQA 1CJ8A 1GB2A 4XYYA 1F10A 1T6VL 4QEQA 4BADA 1QUSA 1LMNA 9LYZA 1N4FA 4DYGA 4WLTA 1LSPA 1Z55A 1RE2A 4G4CA 1DI5A 1GF3A 4XJBA 1AM7A 4NSHA 2YBNA 2B5ZA 2BQEA 4B0DA 1NBYC 1B7NA 2YBHA 1HEOA 1LHIA 2EKSC 3A34A 2DKVA 1HENA 2Z18A 4IJ4A 2BAAA 1FN5A 1UCOA 1GFAA 3ZVQB 1DI4A 4NGYA 5I5QA 1CJ7A 5L3IA 1RCMA 4GCDA 4OOOA 4OWAA 1OUBA 3TXFA 3WUNA 3A8ZA 5LVGA 1GFTA 1KXXA 1LZDA 5KXRA 2HEDA 1GF0A 1LSBA 2W1YA 1UIDA 1IP2A 1LJ4A 4H9HA 3G3AB 2H9JA 2Z2FA 3TXHA 4C3WA 2YBLA 3QY4A 1G7JC 2LYZA 4HTKA 1C7PA 2Z39A 1IOCA 5HMVA 3OK0A 5KXMA 1D0MA 4KT3A 1YAPA 1DKJA 5F16A 5LVJA 1VEDA 1YIKA 1LZ6A 3BKHA 4H9FA 4B4IA 2CDSA 1YAOA 4YM8A 2F30A 3A6CY 1RJCB 4NSIA 4O34A 1HFYA 4PRQA 3K3TA 3EXDA 5FEKA 4N1CC 3EO5A 5APEA 1D6QA 2D4IA 4II8A 134LA 2HECA 3P64A 3B72A 2W1MA 4HPIA 1UBZA 1NKHA 1AT5A 5B1FA 4Z41A 1GBWA 1IP1A 4YEOA 5LYMA 4W96A 1JUGA 1QDTA 2CWIA 194LA 2YSSC 4H90A 3A3QA 4U3XB 1IWUA 2DQAA 5I4WA 4QGZA 4XADA 4WM4A 1OUGA 1NF5A 1JPOA 4LT1A 1H6MA 4N5RA 5KXTA 207LA 4NGWA 2F4AA 3AGHA 4BAPA 1JJ0A 1MELL 1KXYA 2HU3A 4NGZA 4ETAA 4KPMA 1GB7A 1IEEA 1REXA 4DDAA 5LYZA 2D4KA 1HSWA 2F2NA 1TAYA 2HEAA 5LIOA 3T36A 4CFPA 1YROA 2H9KA 1OUIA 1WQMA 1DQJC 1GBOA 1JKCA 1IVMA 1GWDA 1WVVA 2CJLA 5I4XA 4XJGA 3LZTA 3WU8A 4H94A 1LSCA 1HERA 2ZQ4A 3N9EA 4HP0A 5B1GA 1LKRA 1TBYA 1LZ8A 1B2KA 1BB5A 4NGLA 3RNXA 3WW6A 2RSCA 4KXIA 4NGVA 4NWEA 4GLAA 1D0LA 4J7VA 1UICA 1D6PA 1AZFA 1XEIA 1FDLY 1IC7Y 1VFBC 2ZQ3A 4Z3MA 2F4GA 3BKVA 4NIJA 1QDRA 1VDTA 1VATA 1LMTA 3HFMY 1LZCA 4N1EI 1FLYA 1ZMYL 1UUZC 4LT0A 4WLDA 3W3EA 4G49A 4B49A 1QSWA 2DQJY 2PC2A 3FE0A 4LFXA 4UWNA 1LHHA 1BWJA 1G7IC 2IHLA 5FCPA 1IP3A 3TMUA 1XGQC 2LHMA 1GFKA 3AB6A 5LYTA 4DT3A 1G7HC 1FBIX 4WG1A 3W6EA 1J1XY 1GB5A 1IY4A 1LSZA 3LZ2A 1AT6A 3W6AA 1LHLA 4GN4A 1LJEA 1BGIA 1GAZA 1NMMA 3CB7A 1GB3A 2HEEA 1GE2A 1GFJA 1IWXA 1JKDA 1PS5A 2YBIA 3A94A 4FJRA 1B5XA 3A67Y 2DQDY 1LZ9A 1LAAA 1OUDA 2W1LA 4B4JA 5KKJA 4XJDA 3WPJA 1WQOA 4XJFA 2BQDA 2MEEA 4XJHA 1GFGA 5KXPA 1CJ9A 1OUJA 1BB6A 4FDYA 2XJWA 4BAFA 193LA 1AKIA 1BVKC 2C8PA 1QIOA 3EMSA 3GXRA 5IDDA 5A3ZA 1UIHA 5B59A 3ULRA 5F9UA 1RFPA 1I20A 1LPIA 2DBTA 2NWDX 4DDBA 1BVXA 1YILA 4G9SA 2ZNWY 2D4JA 4HSFA 3AZ5A 4NHQA 1C43A 1LZYA 1GBYA 2BQFA 3IWRA 1LTMA 1LZBA 4GN3A 2EIZC 4A7DA 4TUNA 1QQYA 4H8YA 4MR1A 3F6ZA 4NWHA 5DN4A 6LYTA 3AZ6A 1IOSA 4I8SA 1CKDA 1GFRA 3AGGG 4MSTA 2GV0A 1NBZC 5LA5A 153LA 1CKCA 1LMAA 3WVXA 1F0WA 5IELA 4LYTA 1B5WA 3AJNA 1CJ6A 2IFFY 5ILCA 1LJGA 3WW5A 4H9AA 4R6CA 1IWVA 1D9UA 1LSGA 1E8LA 3W6CA 2BQKA 1LYYA 1YKZX 1UIEA 5II3A 5KXLA 3IJVA 2MEFA 4HJVA 4HTQA 4DC4A 3CT1A 5M1YA 1CKGA 5D5CA 1FLWA 2MEDA 4RW1A 3WU7A 5KJ9A 3P65A 4NGIA 3TXJA 1IORA 1BQLY 2WARA 4NHIA 5E9RA 1LJNA 3RW8A 1GFVA 1WTMA 1HEQA 2ZYPA 3A95A 4DWXA 3WYHA 2FYDA 1SLYA 1WQQA 4HJYA 4WOAA 5JENB 4H9CA 4WO6A 1C46A 1QSAA 4EOFA 4PJ2C 1JITA 4BS7A 2DQIY 1LZGA 2ZYCA 5EBHA 1GDXA 1DKKA 1IP6A 1B7SA 5ILFA 1QTEA 1IX0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
109LA 3SBBC 2LYMA 1OUHA 1JHLA 4QDNA 4WLYA 1GFHA 2W1XA 1L34A 2LZTA 4H92A 2BLXA 1GE4A 4HJZA 4EKRA 1GEZA 1GPQC 1GE3A 1L37A 1LGWA 4W57A 4E97A 1J1OY 3HT9A 1OUEA 2OE7X 1HEWA 1IR7A 1OV5A 1L58A 3D9AC 4P2EA 1L15A 3TXDA 2QB0B 4R0FA 260LA 3G3XA 3RU5A 1W08A 196LA 1B5YA 198LA 3CDVA 1A4VA 3CT0A 1REZA 2F32A 2BQCA 4HPEA 2XBRA 1B7PA 1I56A 1QT5A 1L38A 4UWUA 128LA 3F9LA 1ZWNA 1IWZA 2VB1A 1L24A 2OTZX 2BLYA 1OYUA 1SSYA 181LA 1C6KA 4DD1A 1L56A 2DQHY 3TMWA 4LYOA 4ZEEA 1VDSA 3KAMA 1D3FA 1QTHA 1CV5A 1YANA 5LVKA 4TWSA 3WXTA 1EQEA 1CKHA 3CDTA 2BQJA 5HNCA 4YOPA 3W6DA 1CUPA 4WM1A 1L99A 4XENA 1D9WA 3CSZA 145LA 173LA 4LFPA 1FLUA 3ATNA 3HH3A 3DN0A 1QSBA 3LN2A 1GF8A 1L68A 3DMZA 4PHIA 1L79A 1IR8A 4N9RA 1GHLA 1L75A 1GBZA 1L90A 3N9CA 3E3DA 2N5ZA 1GF9A 4I7PA 8LYZA 127LA 1LYIA 1LHKA 1B7MA 4WL6A 3AGIA 4DAJA 112LA 4M4OA 5KXNA 5KXOA 1L36A 2LZ2A 5I54A 3NYAA 1L51A 3PBLA 1L42A 2ZNXY 1JKBA 4LYZA 4H8XA 4WL7A 3P4ZA 1VDQA 5HQ1A 3WUAA 1LZTA 4RDSA 1C6LA 4W94A 1GB8A 118LA 1L35A 2B6TA 4LT3A 5HMJA 1INUA 151LA 135LA 1ALCA 1L57A 3GUMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2CGI A;  2HTX A;  3W6B A;  1JJ1 A;  1OUH A;  1BB4 A;  2LYM A;  1JHL A;  4DD2 A;  2XBS A;  1KIP C;  1WTN A;  4QDN A;  4X3B A;  2MEB A;  1GFH A;  4WLY A;  1B5U A;  2W1X A;  2LZT A;  4H92 A;  2BQA A;  2BLX A;  1GE4 A;  4HJZ A;  4TX7 A;  2FBD A;  1KIQ C;  2DQC Y;  1GEZ A;  1LZA A;  3FI7 A;  1TCY A;  4NGO A;  1LCN A;  4RLN A;  1GPQ C;  1JTP L;  4YF2 A;  5B06 A;  1TEW A;  1GE3 A;  4GLV A;  1FKQ A;  2HU1 A;  1LZE A;  5LVH A;  1IIZ A;  5D5F A;  4OW1 A;  4HV2 A;  4XJI A;  2DQG Y;  1J1P Y;  1J1O Y;  1C08 C;  2C8O A;  4WM3 A;  3B0K A;  1OUE A;  2XTH A;  1HEW A;  1IR7 A;  3QNG A;  1IOT A;  5KY1 A;  4M6D A;  4IAS A;  5LAF A;  3AW6 A;  3D9A C;  5KXS A;  4XN6 A;  3CSR A;  4P2E A;  3M18 B;  1LJH A;  5DN5 A;  4YEM A;  4WMG A;  154L A;  3A6B Y;  3LYT A;  3TXD A;  1HML A;  1NDG C;  1BHZ A;  2FYC A;  2H5Z A;  3AZ4 A;  4R0F A;  4TSC A;  4B1A A;  1LJ3 A;  4GCF A;  1B7Q A;  3RU5 A;  1HHL A;  1B5Y A;  1W08 A;  5APD A;  3WUL A;  3WXU A;  1JSE A;  1IR9 A;  4RW2 A;  4B4E A;  1A4V A;  3CT0 A;  1LJF A;  5LAG A;  1LMC A; 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 2MEE A;  4XJH A;  1GFG A;  5KXP A;  1CJ9 A;  1OUJ A;  1BB6 A;  4FDY A;  2XJW A;  4BAF A;  193L A;  1AKI A;  1BVK C;  2C8P A;  1QIO A;  3EMS A;  3GXR A;  5IDD A;  5A3Z A;  1UIH A;  5B59 A;  3ULR A;  5F9U A;  1RFP A;  1I20 A;  1LPI A;  2DBT A;  2NWD X;  4DDB A;  1BVX A;  1YIL A;  4G9S A;  2ZNW Y;  2D4J A;  4HSF A;  3AZ5 A;  4NHQ A;  1C43 A;  1LZY A;  1GBY A;  2BQF A;  3IWR A;  1LTM A;  1LZB A;  4GN3 A;  2EIZ C;  4A7D A;  4TUN A;  1QQY A;  4H8Y A;  4MR1 A;  3F6Z A;  4NWH A;  5DN4 A;  6LYT A;  3AZ6 A;  1IOS A;  4I8S A;  1CKD A;  1GFR A;  3AGG G;  4MST A;  2GV0 A;  1NBZ C;  5LA5 A;  153L A;  1CKC A;  1LMA A;  3WVX A;  1F0W A;  5IEL A;  4LYT A;  1B5W A;  3AJN A;  1CJ6 A;  2IFF Y;  5ILC A;  1LJG A;  3WW5 A;  4H9A A;  4R6C A;  1IWV A;  1D9U A;  1LSG A;  1E8L A;  3W6C A;  2BQK A;  1LYY A;  1YKZ X;  1UIE A;  5II3 A;  5KXL A;  3IJV A;  2MEF A;  4HJV A;  4HTQ A;  4DC4 A;  3CT1 A;  5M1Y A;  1CKG A;  5D5C A;  1FLW A;  2MED A;  4RW1 A;  3WU7 A;  5KJ9 A;  3P65 A;  4NGI A;  3TXJ A;  1IOR A;  1BQL Y;  2WAR A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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