3WULA

Crystal structure of hen egg-white lysozyme
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Grease matrix as a versatile carrier of proteins for serial crystallography
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3wulA00
1YL0X 1IP2A 2Y8PA 4H8ZA 4NY5A 5DN4A 2YBIA 1LSAA 1B7RA 4WMGA 3TMVA 5IELA 3IJUA 1CJ6A 1J1PY 4RW1A 1LJ4A 3QNGA 4M4OA 1AM7A 1D0LA 1PZYA 1CKGA 3TXJA 5B06A 5II3A 1QSAA 1REXA 4PPOA 4H8YA 5D5CA 4J7VA 2A7FA 4LT3A 4I8SA 4NSGA 1HERA 1D6QA 1DPWA 1TCYA 2HUBA 2W1YA 1LZ1A 2DKVA 1IVMA 3A6CY 4A7DA 3B6LA 3ATOA 5B1GA 2Z38A 1ZVYB 1GBZA 3CSRA 1IP1A 1D0MA 4PHIA 5KXSA 1LZBA 4WM4A 2BQOA 1D6PA 4NGOA 2ZIKA 1WVVA 1YL1X 3LZTA 2MEIA 1GWDA 4OOTA 1IWXA 3WVXA 1LSGA 1J1OY 1NF5A 3CT5A 4H9CA 2XTHA 1LZTA 3B0KA 2G4QA 1WTNA 4DWXA 1B0DA 1B7LA 2XJWA 4NGWA 1D9UA 1DKKA 2HEEA 4ETBA 3KAMA 2X0AA 4OWHA 5HLLA 1LMNA 1BHZA 4KXIA 1LYSA 3D9AC 2CWIA 2MEGA 1WQPA 3A6BY 4Z3MA 4ZEEA 5M1YA 5B07A 3ZEKA 1JTPL 5E4PA 3A34A 5K7OA 1G7IC 2MEAA 3G3BB 5KXOA 1C7PA 1DI4A 4HSFA 3WMKA 1GBSA 1W6ZA 3TXGA 4E3UA 2I26L 2ZQ4A 4LYZA 5D5FA 1B2KA 1GB9A 1NMMA 1FLQA 1KXXA 2F4AA 2ZILA 1LZ6A 5LIOA 4NGLA 1IP7A 2F30A 4GCFA 4NGIA 5HNCA 1HFYA 1XSFA 1GB2A 1GB8A 1JKAA 4NHIA 2HU3A 1HC0A 1OUGA 194LA 1B5ZA 4NEBA 4WM3A 3W3EA 2LHMA 1GDWA 2MEEA 1C43A 1RE2A 154LA 1V7TA 4J1AA 4KPMA 2VB1A 5I4WA 3WUAA 1FKVA 2BQKA 3AZ5A 1DI3A 4N1CC 4NGJA 1HMLA 1W08A 5FCPA 1HFXA 1GFAA 2HECA 2Z19A 2LZTA 3EO5A 5HNLA 1GBWA 1DI5A 3J4GA 1EQEA 3K3TA 1P2CC 1XGTC 2CJLA 1JIYA 4XJDA 1HEQA 2I25L 4LYCA 1F10A 2F4GA 4N1EI 4RLMA 1AT5A 2Z2EA 3WW6A 5A3EA 5FSTA 3CSQA 6LYZA 1IEEA 1WTMA 4XADA 4YF2A 2W1XA 4B49A 5KXKA 3WU7A 1CKDA 1LSEA 1LZ5A 4GLAA 4QEQA 2C8OA 4XJBA 2HTXA 1SLYA 1LKRA 1BB4A 1GDXA 1GFUA 1IWWA 4FJRA 1GBYA 5F81A 1GBOA 1LSPA 1UA6Y 4BS7A 1WQOA 2ZYPA 1B7NA 1J1XY 1LZNA 2BQHA 1LOZA 2YBLA 1XGQC 3G3AB 1LZ9A 5LAGA 1OUJA 3WPJA 1LMAA 1IR9A 1H87A 1UIEA 1IP5A 208LA 3GXRA 1IIZA 5T3FA 3ATNA 2YDGA 4XJHA 1WQQA 3LYZA 1EL1A 1G7MC 3WU9A 1HSXA 3N9AA 5KKJA 4UWNA 4TX7A 5LVJA 2BQAA 1IO5A 1GE4A 2IHLA 4RW2A 4U3XB 5LVGA 1B7MA 4OOOA 3TXEA 5L3IA 1CJ7A 4PJ2C 3RZ4A 2YVBA 4ML7A 8LYZA 1F0WA 2HEDA 2MEBA 2DQHY 1XEIA 4GN4A 1CKFA 4MR1A 2EKSC 3AW7A 2NWDX 1G7HC 2ZYCA 4NSHA 1LHIA 1GF3A 4H91A 1LMTA 4TSCA 5IDDA 5KXNA 1LJJA 1IC5Y 1JPOA 2D6BA 2Z12A 5KXLA 1FLYA 4ET9A 1LZCA 1IWTA 3OK0A 1YIKA 3J6KA 1IWUA 3A93A 3A91A 5FELA 2D4JA 4PRQA 4DC4A 6LYTA 2W1LA 5KKIA 3BKHA 3P64A 3W6AA 4HPIA 1UIBA 3QE8A 1BWJA 1GE2A 4DD9A 1IP3A 1D0KA 4HV1A 1BWHA 1HFZA 5APCA 4LZTA 4D9ZA 3HFMY 4YEOA 3RNXA 1QTEA 4HJVA 4KL7A 4H9EA 1QTKA 3WXUA 1IY3A 1LTMA 5LA8A 1GF9A 1UIAA 3VWOA 1HEOA 1LYOA 1I56A 3LHMA 4WLYA 2MECA 4G4HA 1JEFA 1QSWA 2ZWBA 3AGHA 4OWEA 1NDGC 3W6CA 4DT3A 1OUCA 4MSTA 4WO6A 2I6ZA 5DN5A 4NGYA 2H5ZA 1ZV5L 1QUTA 5LYMA 3HBEX 1LZGA 1BQLY 4DD1A 1WVUA 5APEA 1EQ4A 4LT0A 4C3WA 3A67Y 3WW5A 1JTOL 4J1BA 5LVIA 4B0DA 1IP4A 1C46A 1HHLA 1VDSA 1TBYA 1GFJA 4CJ2A 1JTTL 2MEHA 4EOFA 3A94A 4G9SA 3A92A 4NG1A 4ANRA 2LYOA 2G4NA 4OWCA 2EQLA 1WQMA 1JWRA 4H9IA 1LCNA 3WU8A 1LZRA 1JSFA 1UICA 1B7SA 5KXZA 1OUFA 5DLAA 1GB6A 3ZVQA 4B4IA 1YAQA 1QDTA 4TSBA 4WM6A 2EIZC 2DQGY 1JJ3A 1JKCA 1B5WA 1LMPA 3TXHA 3AZ4A 153LA 4ZIXA 1HNLA 1BGIA 1B5VA 1HEWA 5FEKA 4DD0A 5B05A 3WH1A 4GCCA 2BAAA 1XGRC 4XJIA 3W6BA 4WL7A 2FBDA 4WM1A 1LMCA 5LA5A 4NGVA 1DZBX 3M18B 4HTQA 4CHXA 5HQ1A 3AGGG 3HBDA 1CJ8A 3A95A 4NHSA 4WLDA 3TXDA 1A2YC 1YANA 2BLYA 1GE1A 2DQJY 1IC4Y 1LSCA 2GV0A 1REMA 4II8A 1LZEA 1LZSA 2YSSC 3OJPA 4J0LA 1NQIA 2D4KA 4OW1A 4WG7A 1LJHA 3TXKA 4DDCA 3A90A 5KXMA 1IR7A 4H8XA 2LZ2A 1GFRA 4QDNA 1IOTA 4UWVA 4G49A 1OUIA 2HEBA 4HV2A 1LSFA 4Z41A 5ILFA 5I4YA 1QQYA 3BKVA 3CT0A 1IX0A 4IJ4A 4WM5A 2Z18A 1LSBA 3LYTA 5LAFA 1VAUA 4O34A 1IP6A 3AB6A 3P68A 1YAMA 1UACY 1BVKC 3SP3A 1LZDA 2BQJA 3A96A 5F14A 3TMXA 5KXYA 1IOSA 4LYTA 2CGIA 1LSDA 1GE3A 1GFVA 4LGKA 2B5ZA 3B72A 3TXFA 5KXWA 133LA 5B59A 2D4IA 1FDLY 4XN6A 5F9UA 1I20A 1IC7Y 1LSMA 3AJNA 4CGEA 3CT1A 4H90A 1LJNA 2XBRA 2Q0MX 4G4BA 4LYOA 1GF0A 1GD6A 4WLTA 5L9JA 2DQFC 3M3UA 1WQNA 1UIHA 2DQCY 4LFPA 5F16A 1UIGA 4DD3A 2BQIA 3EBAB 5A3ZA 1YILA 1YAPA 5I54A 134LA 1GB7A 3A3QA 4GLVA 4DD2A 1GF8A 5LINA 4UWUA 5KXTA 1VDQA 4DDAA 3T6UA 4DD7A 1JISA 2BPUA 2W1MA 3P66A 1LJFA 3N9CA 1BWIA 2H9JA 4GCDA 4HTNA 5EBHA 3WUNA 1FN5A 5I4XA 3A3RX 2BQFA 1JKDA 5HMJA 4N0JA 3TMWA 1F6RA 1JITA 1DQJC 1IOQA 1B9OA 1NBZC 1EQ5A 4Z98A 4Z46A 1HSWA 4FDYA 4N8ZA 3WYHA 4YENA 1OUHA 4EMNA 1NHEA 4NWEA 4PRUA 1DXJA 5ILCA 1RCMA 1BB5A 1XGUC 3WPKA 4LYBA 5C6JA 1C45A 1OP9B 4M6DA 2DQAA 4WO9A 1OUAA 4NGZA 5DM9A 3E3DA 1GFHA 1NBYC 2XBSA 5L3HA 1LYYA 1LPIA 4BAFA 1LYZA 2F2NA 1I1ZA 4HTKA 1E8LA 4IATA 4WLXA 1JKBA 4ETEA 5C6LA 1GFTA 1GF5A 4HJZA 2DQIY 1QUSA 5I53A 1GAZA 3B0OA 4W94A 1KXYA 5J7CA 1GB0A 2IFFY 1FLUA 3F6ZA 3GXKA 4XENA 4NSJA 1GEVA 1FKQA 2LYMA 1HELA 1DPXA 1LHHA 1TDYA 1XFPL 4WL6A 4WOAA 4C5FA 3IJVA 1CNSA 4QY9A 4ETDA 1HENA 1O23A 1F6SA 2FBBA 1G7JC 5DL9A 1NKHA 4NHTA 1HMKA 1VFBC 4N9RA 1SQ2L 2BLXA 2HU1A 2EPEA 2BQCA 1RFPA 1GE0A 2D91A 2YBNA 4H92A 1HEPA 3CB7A 3AW6A 1FLWA 4ZFPA 4LT2A 3P4ZA 1BB3A 1GB3A 1RI8B 4AXTA 4RLNA 1LSYA 4GCBA 4ETAA 5LVHA 1XEKA 2HEAA 132LA 1LJEA 1UIDA 1BB7A 4TTDA 1UUZC 5B1FA 4GN5C 5C6IA 1MLCE 2A7DA 1YKXX 2CDSA 1B7PA 1GHLA 1GXXA 1GB5A 1CKHA 1LJKA 1YAOA 4P2EA 1HEMA 1JSEA 1LJIA 2Z2FA 3AZ6A 1QIOA 4ET8A 1IORA 4KT3A 3WL2A 4LT1A 4CFOA 1GFEA 1LJ3A 1V7SA 4R0FA 1LHMA 4H9BA 1LSZA 3AGIA 3IWRA 3W6EA 3LYMA 4H1PA 4ETCA 2BQLA 4AGAA 1OQMA 4DYGA 1GFKA 3RU5A 1B7OA 1YKYX 2BQBA 2H9KA 2Z37A 4I0CA 135LA 1KIRC 2Z39A 4H94A 4L41A 4IASA 1VDTA 3TXBA 1AZFA 2YBHA 2YBMA 1IWYA 4B4JA 1XGPC 3CQLA 2ZIJA 1T6VL 1B5XA 4NHPA 2FYCA 4BAPA 4QGZA 5KXXA 3N9EA 1YQVY 5APFA 1JJ1A 5LYZA 2YBJA 2C8PA 2PC2A 1AKIA 2BQEA 3B0IA 4NFVA 1B5YA 2FYDA 5LXWA 1NWGA 4NHQA 4YM8A 3AYQA 3FE0A 3WVYA 2BQNA 1KIQC 2DBTA 1LHLA 1ZVHL 1GXV2 1REZA 1IR8A 3RT5X 1G7LC 2N5ZA 1OUDA 4GCEA 3TMUA 1GFGA 2G4PA 1VATA 3W6DA 7LYZA 1IOCA 2WARA 2BQGA 5F9XA 1UC0A 4LFXA 1JHLA 1VEDA 4BADA 1LZAA 1IWVA 1N4FA 1LZYA 1A4VA 1LMQA 1RJCB 4H9AA 4G4CA 4X3BA 3ZVQB 2DQDY 4XJGA 1ALCA 1UBZA 5E9RA 1LKSA 1C10A 1YROA 1JJ0A 4OWAA 9LYZA 3WPLA 4MCKA 1T3PA 3CSZA 1OUEA 1UCOA 4H9HA 4NIJA 4NGKA 193LA 4B4EA 1INUA 2BQMA 1LZ4A 3QY4A 1H6MA 4OWBA 5KXRA 1GEZA 3LN2A 1B5UA 4TWSA 4YEMA 2LYZA 3WXTA 5LYTA 1CJ9A 1PS5A 1AT6A 4HPEA 4NWHA 4NG8A 4RDSA 1BB6A 1FBIX 3ULRA 2BQDA 3LYOA 4HP0A 4YOPA 2DQEY 4PGJB 1GAYA 2AUBA 5KXPA 3FI7A 1LAAA 4XYYA 1DKJA 5I5QA 3T36A 5AMYA 1BVXA 1GPQC 1JUGA 2ZNWY 3RW8A 1UIFA 4LYMA 4NSIA 1IWZA 3WULA 3P65A 5JENB 1C08C 3D3DA 4HJYA 5KJ9A 4W96A 1CKCA 1NDMC 1TEWA 4CFPA 1LHKA 4WM2A 2RSCA 3EMSA 1LMOA 1LSNA 2ZQ3A 5FDJA 1QDRA 2MEFA 1LHJA 4GN3A 5FHWA 2MEDA 1GF6A 1KXWA 1OUBA 1GF4A 4WG1A 1TAYA 1IY4A 1VDPA 4N5RA 3HBHA 4XJFA 5LVKA 4H9FA 1MELL 3LZ2A 3AZ7A 3MGWA 5IHGA 3EXDA 1Z55A 1WQRA 5APDA 1REYA 3TXIA 1LJGA 207LA 2ZNXY 4DDBA 5HMVA 4R6CA 3A8ZA 4H93A 5KY1A 1KIPC 1B7QA 3W6FA 1GF7A 1HF4A 1YKZX 4B1AA 2HEFA 3WUMA 1XEJA 1GBXA 1ZMYL 4TUNA 1LZ8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Y8PA 5IELA 3TMVA 1K28A 192LA 1LJ4A 1QT4A 1D0LA 1CKGA 5B06A 5II3A 4PPOA 4J7VA 4NSGA 4W55A 1TCYA 1JTNA 4ARJA 3ATOA 1LGWA 1L15A 4WM4A 4NGOA 1YL1X 1L56A 1GWDA 4OOTA 4H9CA 215LA 1LZTA 1L0KA 175LA 4DWXA 1B0DA 4NGWA 1L21A 4ETBA 3KAMA 2RBRA 4OWHA 146LA 3HT9A 2B73A 3A6BY 2MEGA 5B07A 3G3BB 1L06A 2I26L 2NTGA 4LYZA 4E3UA 1SWZA 158LA 1IP7A 1QUGA 209LA 4GCFA 4NGIA 1HFYA 1HC0A 3SB6A 194LA 3W3EA 2LHMA 1GDWA 154LA 5FCPA 1FKVA 4N1CC 1HMLA 2HECA 2LZTA 5HNLA 3G3VA 2QARC 4XJDA 4LYCA 4N1EI 4RLMA 3VW7A 1AT5A 1WTMA 2W1XA 4I7JA 225LA 2HTXA 186LA 1GFUA 249LA 1GBOA 1UA6Y 1D2YA 1LOZA 1LZ9A 4S0WA 3WPJA 1H87A 4EKQA 4GBRB 4W58A 1HSXA 3N9AA 5KKJA 4TX7A 2BQAA 4RW2A 5LVGA 2ANXA 1G1VA 1OVHA 5L3IA 1CJ7A 1L17A 2MEBA 3AW7A 1OVKA 4H91A 1LMTA 4TSCA 1FLYA 3J6KA 3A93A 5FELA 4DC4A 1LPYA 6LYTA 2OTZX 2W1LA 4DKLA 3BKHA 3W6AA 4DD9A 1L62A 180LA 5APCA 3HT8A 1DYAA 4KL7A 1I56A 2MECA 2RB0X 1QS9A 1L42A 4MSTA 4WO6A 5DN5A 4DJHA 3FI5A 4NGYA 1L83A 1C67A 1EQ4A 4LT0A 1CV4A 1L43A 3HTGA 1C46A 1XJUA 1L40A 4EOFA 243LA 4ANRA 2LYOA 1TLAA 4OWCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1YL0 X;  1IP2 A;  2Y8P A;  4H8Z A;  4NY5 A;  5DN4 A;  2YBI A;  1LSA A;  1B7R A;  4WMG A;  3TMV A;  5IEL A;  3IJU A;  1CJ6 A;  1J1P Y;  4RW1 A;  1LJ4 A;  3QNG A;  4M4O A;  1AM7 A;  1D0L A;  1PZY A;  1CKG A;  3TXJ A;  5B06 A;  5II3 A;  1QSA A;  1REX A;  4PPO A;  4H8Y A;  5D5C A;  4J7V A;  2A7F A;  4LT3 A;  4I8S A;  4NSG A;  1HER A;  1D6Q A;  1DPW A;  1TCY A;  2HUB A;  2W1Y A;  1LZ1 A;  2DKV A;  1IVM A;  3A6C Y;  4A7D A;  3B6L A;  3ATO A;  5B1G A;  2Z38 A;  1ZVY B;  1GBZ A;  3CSR A;  1IP1 A;  1D0M A;  4PHI A;  5KXS A;  1LZB A;  4WM4 A;  2BQO A;  1D6P A;  4NGO A;  2ZIK A;  1WVV A;  1YL1 X;  3LZT A;  2MEI A;  1GWD A;  4OOT A;  1IWX A;  3WVX A;  1LSG A;  1J1O Y;  1NF5 A;  3CT5 A;  4H9C A;  2XTH A;  1LZT A;  3B0K A;  2G4Q A;  1WTN A;  4DWX A;  1B0D A;  1B7L A;  2XJW A;  4NGW A;  1D9U A;  1DKK A;  2HEE A;  4ETB A;  3KAM A;  2X0A A;  4OWH A;  5HLL A;  1LMN A;  1BHZ A;  4KXI A;  1LYS A;  3D9A C;  2CWI A;  2MEG A;  1WQP A;  3A6B Y;  4Z3M A;  4ZEE A;  5M1Y A;  5B07 A;  3ZEK A;  1JTP L;  5E4P A;  3A34 A; 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 1QIO A;  4ET8 A;  1IOR A;  4KT3 A;  3WL2 A;  4LT1 A;  4CFO A;  1GFE A;  1LJ3 A;  1V7S A;  4R0F A;  1LHM A;  4H9B A;  1LSZ A;  3AGI A;  3IWR A;  3W6E A;  3LYM A;  4H1P A;  4ETC A;  2BQL A;  4AGA A;  1OQM A;  4DYG A;  1GFK A;  3RU5 A;  1B7O A;  1YKY X;  2BQB A;  2H9K A;  2Z37 A;  4I0C A;  135L A;  1KIR C;  2Z39 A;  4H94 A;  4L41 A;  4IAS A;  1VDT A;  3TXB A;  1AZF A;  2YBH A;  2YBM A;  1IWY A;  4B4J A;  1XGP C;  3CQL A;  2ZIJ A;  1T6V L;  1B5X A;  4NHP A;  2FYC A;  4BAP A;  4QGZ A;  5KXX A;  3N9E A;  1YQV Y;  5APF A;  1JJ1 A;  5LYZ A;  2YBJ A;  2C8P A;  2PC2 A;  1AKI A;  2BQE A;  3B0I A;  4NFV A;  1B5Y A;  2FYD A;  5LXW A;  1NWG A;  4NHQ A;  4YM8 A;  3AYQ A;  3FE0 A;  3WVY A;  2BQN A;  1KIQ C;  2DBT A;  1LHL A;  1ZVH L;  1GXV 2;  1REZ A;  1IR8 A;  3RT5 X;  1G7L C;  2N5Z A;  1OUD A;  4GCE A;  3TMU A;  1GFG A;  2G4P A;  1VAT A;  3W6D A;  7LYZ A;  1IOC A;  2WAR A;  2BQG A;  5F9X A;  1UC0 A;  4LFX A;  1JHL A;  1VED A;  4BAD A;  1LZA A;  1IWV A;  1N4F A;  1LZY A;  1A4V A;  1LMQ A;  1RJC B;  4H9A A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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