3WXTA

Crystal structure of hen egg-white lysozyme
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Grease matrix as a versatile carrier of proteins for serial crystallography
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3wxtA00
1B5ZA 4H9IA 1D0MA 1NKHA 2HUBA 2CDSA 1WQRA 1IC5Y 4IATA 4QGZA 4DDBA 1NBZC 1XGPC 7LYZA 5J7CA 1GBZA 1LMAA 4TUNA 5APCA 1HHLA 2XBRA 4LYOA 5HMVA 1VEDA 1IORA 1OUHA 4YEMA 1HSXA 3B72A 4DD1A 5KXSA 1GB7A 5KXYA 5L3IA 4GCEA 9LYZA 2Z38A 3AW7A 4R0FA 1ZVYB 1VAUA 1C7PA 3HBEX 4H8YA 5KXPA 3A93A 4LYCA 4CJ2A 2YBJA 2CGIA 4J1BA 1LMPA 194LA 1LZ4A 1B7PA 1GB6A 1WQOA 2G4QA 1GDWA 1GFKA 3RT5X 1D0LA 1XEJA 3FI7A 1LSNA 1OUJA 5B1FA 1JKBA 3WULA 1GB5A 1NMMA 4C3WA 5I5QA 3J4GA 5LVHA 5KXRA 4NHSA 2ZIJA 3N9CA 3RZ4A 2AUBA 3WXUA 2HU1A 5HNCA 1RJCB 4WO6A 2HEEA 5LXWA 2F4AA 1RFPA 2BQJA 5KXWA 1HEQA 1CKHA 4G49A 1YIKA 3A3RX 1GB2A 1B5UA 2I26L 3A90A 2IHLA 1FLUA 4LYBA 1GFEA 5KXNA 3TXJA 3BKVA 1JHLA 1XGTC 3WUAA 1OUFA 3BKHA 4NGLA 1CJ8A 3E3DA 1GF5A 1BQLY 5HNLA 2DBTA 1INUA 1NWGA 1UIFA 1IP3A 1LHJA 3K3TA 1DI3A 3VWOA 4BAPA 3W6AA 1HELA 5ILFA 4WM2A 1UIBA 6LYZA 1IY4A 4GCCA 1IC7Y 3W6EA 4H92A 2LYMA 2YBLA 5B05A 4ANRA 4HPEA 1HEWA 1EQ5A 3EMSA 4IJ4A 3WUNA 1JEFA 5L3HA 4BADA 5KXMA 1IP4A 4ETDA 2BQLA 1QTEA 1IIZA 4TSBA 1GB8A 1JPOA 1KIPC 1BVKC 5DN4A 1LHLA 2YSSC 4GN3A 1RI8B 4H9AA 1D6QA 3AZ5A 2DQGY 3F6ZA 1KXXA 4IASA 4NY5A 1GE0A 4TWSA 3ZVQA 1B5WA 2CJLA 1UCOA 4ETAA 4GN4A 1YKZX 2DQCY 1TAYA 2BQAA 1LAAA 4Z3MA 1GPQC 3AZ4A 1CKGA 1LJEA 4XJFA 5F16A 3FE0A 1YKYX 208LA 3W6BA 3A95A 1B7NA 2BQDA 1OUBA 4E3UA 1IOTA 2EIZC 3P4ZA 2ZNWY 3N9AA 4GLVA 2Z37A 4N1EI 2MECA 1OQMA 4LGKA 1JIYA 1GXXA 1LKSA 4NSGA 1UIHA 1OUAA 2MEHA 2MEFA 4NG8A 5FELA 4B0DA 4DT3A 1GBOA 1W6ZA 1WTMA 2RSCA 5I53A 1B7MA 1GE2A 2BQEA 4OW1A 5LVJA 5E4PA 1LMTA 3A6BY 3TMWA 207LA 1HMKA 1LSBA 1QIOA 1C08C 1SLYA 4J0LA 4WM5A 2BPUA 2DQHY 4B49A 5APDA 4PGJB 1GE4A 2HU3A 1UICA 1YILA 4R6CA 4LZTA 4RW2A 3TXDA 3WH1A 2LZTA 2CWIA 1JKDA 4FJRA 1B5VA 1UIDA 3EBAB 5B59A 4TSCA 5B1GA 4M4OA 2LYZA 1IR7A 1LYZA 4AXTA 2LZ2A 4ZEEA 3B0IA 1REYA 4WOAA 1UIEA 1PS5A 5F9UA 1LYOA 1WQQA 193LA 4OWBA 1IOCA 1HMLA 1REXA 1LOZA 2FBDA 4NFVA 1GEZA 5LAFA 4YOPA 1SQ2L 1CJ6A 1LZ9A 3M18B 6LYTA 1GBWA 5LYTA 5I54A 1FBIX 5I4YA 5LINA 3T36A 4LT1A 4XADA 3WW6A 5LVGA 4NGKA 4HP0A 5T3FA 1OUIA 1LJIA 1IP1A 1YAPA 3ATNA 4QDNA 1GBXA 4MSTA 3TXGA 2XTHA 4NGYA 3CT0A 3QY4A 4TX7A 4H9BA 3RNXA 1UC0A 3A3QA 4X3BA 4PRUA 5KXOA 1LJKA 1UIGA 1GHLA 1JJ3A 1LSPA 2D91A 2H9KA 4XJGA 4ETEA 5KJ9A 1LZYA 5APFA 1F6RA 1LHKA 4XENA 4G9SA 4XJIA 1RE2A 4OWEA 1UACY 2YBHA 4HPIA 4WL7A 1JSEA 4LFXA 1HSWA 1LSDA 1JISA 1DPWA 1YAMA 1LSYA 4N9RA 4OWAA 1IWWA 1GFGA 1LZCA 4NSHA 1GWDA 3A96A 1MLCE 1LSFA 4WG1A 4B4EA 4HV2A 5ILCA 1O23A 4LFPA 1YL1X 3N9EA 1HEMA 1NQIA 2N5ZA 4RDSA 3TMXA 1J1PY 2ZQ3A 4HSFA 2MEBA 4XYYA 3TXIA 5KY1A 1CKDA 3AGHA 2YVBA 3B0KA 1JKCA 4LT2A 3ZVQB 5C6JA 4MCKA 4N1CC 1OP9B 1BWIA 1TCYA 5HLLA 3AW6A 1V7SA 4WLTA 4M6DA 4MR1A 1QSWA 1WQMA 4WO9A 4RW1A 4XN6A 1IVMA 1LSZA 5II3A 4WM6A 1A4VA 1GD6A 1YL0X 3TXEA 1Z55A 4KT3A 4NGIA 5A3ZA 1REMA 1KXWA 2MEDA 4NIJA 1IY3A 2X0AA 1DKKA 4H9CA 4WLXA 1QDTA 1VDSA 1IP2A 1LZ5A 3A94A 1LJFA 3EO5A 1XGQC 1N4FA 1TEWA 5KKJA 4B4JA 1C45A 1FN5A 3TXBA 4WLDA 3RW8A 1GDXA 3QNGA 2DQEY 2DQJY 3GXKA 4H8ZA 3WUMA 1BVXA 3AZ7A 1IP5A 1LJNA 2FBBA 1AKIA 1GF4A 3AYQA 1WQPA 1GFJA 3CT1A 5LA5A 4QEQA 1YQVY 3W6FA 1BB6A 1DI5A 3GXRA 1F0WA 1G7HC 1B9OA 1JSFA 2W1MA 2Z12A 3P65A 4UWNA 5A3EA 2B5ZA 3P64A 3P66A 4H93A 1HFZA 4NHTA 4KL7A 3AGIA 4II8A 3WVYA 4ET8A 3M3UA 4LYZA 1LYSA 3TXHA 4NGWA 2YDGA 4H9HA 1JTTL 5LIOA 4CFPA 5IDDA 3RU5A 3CSZA 4G4HA 3AZ6A 4BAFA 1ALCA 3CQLA 1IP7A 1EQEA 1NDMC 2D6BA 1ZMYL 2GV0A 4YENA 4DWXA 2BQBA 4ZFPA 1LMOA 1JUGA 4N0JA 1NHEA 3EXDA 1B7QA 3W3EA 2MEIA 3WPLA 1AT5A 1HNLA 1YANA 2ZILA 8LYZA 1LHHA 133LA 4J1AA 5LYZA 4G4CA 1LJGA 4GLAA 1TDYA 2BQNA 1T3PA 1D0KA 1I56A 1VDQA 2F30A 1DI4A 2LHMA 2W1LA 2DQFC 1FKVA 1KIRC 1UBZA 1AZFA 1UUZC 1OUGA 3TXFA 3D9AC 3LYTA 4LT0A 1IWZA 4DD7A 2D4IA 4NHIA 4CHXA 3WW5A 4WM3A 4NGZA 4YM8A 5L9JA 1QSAA 1XSFA 5FDJA 1XFPL 5LVKA 4Z46A 2ZYPA 2Y8PA 4J7VA 1NDGC 4YEOA 1GE3A 2BLXA 1P2CC 1LJHA 1D6PA 1LZEA 1D9UA 2BQIA 132LA 1WTNA 5C6LA 5C6IA 2G4PA 1EQ4A 1LZDA 1OUEA 2MEGA 3TMUA 1LZ8A 135LA 1LPIA 5KXXA 4A7DA 5HQ1A 1IEEA 1YKXX 2Z39A 1QTKA 1GFAA 2G4NA 1UA6Y 1IR8A 4ZIXA 1GAZA 1JTOL 1LJJA 3HFMY 3CSRA 1OUDA 1CJ9A 1GE1A 4BS7A 4FDYA 4I8SA 1J1OY 1XGRC 1LJ4A 2I25L 4XJHA 2LYOA 1E8LA 1WVUA 4NHQA 3WU8A 1B7SA 1HENA 1GF3A 2VB1A 4I0CA 3A67Y 3A92A 5I4WA 4OWCA 4H1PA 2Z19A 1XEKA 4H91A 1LHIA 1BWJA 2EKSC 4RLNA 1CKCA 3HBHA 1QDRA 3LYZA 4G4BA 1DZBX 3KAMA 4GCBA 4WM1A 1BHZA 5HMJA 4WMGA 1QUTA 4U3XB 4H9EA 2YBIA 3IWRA 4N5RA 5IHGA 4W96A 2WARA 1FLYA 4D9ZA 1LSAA 1LHMA 1F6SA 1C10A 1IWXA 3AGGG 4NSJA 1GFUA 4XJDA 1VDTA 5FHWA 3AJNA 1AM7A 1QQYA 2D4KA 2ZYCA 2BLYA 3LN2A 4EOFA 1IO5A 1IWYA 4GCFA 4HTNA 1EL1A 2EPEA 1LMQA 2XJWA 1AT6A 5LA8A 4NHPA 1BWHA 1CJ7A 2ZQ4A 3ZEKA 2C8PA 2YBMA 3A34A 1HF4A 1QUSA 3W6CA 1GB3A 5LYMA 1CNSA 2F2NA 2HEAA 4WL6A 4H8XA 1DQJC 1FDLY 4AGAA 5F81A 2W1YA 1XEIA 1IWVA 2FYDA 4DD9A 1VATA 2YBNA 5F9XA 1IOSA 3OK0A 154LA 4DC4A 4NGVA 2HECA 1LKRA 4WLYA 3J6KA 1B5XA 2EQLA 4W94A 4NGOA 1H6MA 4O34A 2I6ZA 2C8OA 1C46A 1RCMA 2DQAA 4HJZA 4LT3A 4CFOA 3TXKA 1IP6A 1LZ1A 2BQGA 2ZIKA 4ETCA 4QY9A 1VDPA 5DN5A 5B06A 1WQNA 3WVXA 134LA 2IFFY 3G3AB 3WPJA 4EMNA 4ETBA 1OUCA 2Z2EA 4N8ZA 1DKJA 1NBYC 1T6VL 1G7IC 1LSEA 1UIAA 3B6LA 2F4GA 4NG1A 2PC2A 3CB7A 1LCNA 3A91A 5KXLA 2FYCA 2A7DA 3LZTA 2DQDY 3AB6A 2XBSA 3HBDA 1BB3A 1JJ0A 2H9JA 4ML7A 1REZA 1PZYA 1LMCA 1GFHA 1IC4Y 1GXV2 2HEBA 3LZ2A 4DD3A 3LYOA 1LZTA 1GFRA 2HEFA 3ULRA 1BGIA 3A8ZA 5KXZA 4Z41A 1YAOA 1BB7A 1VFBC 1IWUA 5APEA 2D4JA 4WG7A 153LA 1LZAA 4OOOA 4HV1A 5IELA 1HC0A 1G7MC 3MGWA 3QE8A 3IJUA 5DM9A 4B4IA 2MEAA 4WM4A 4DDAA 4PPOA 4H94A 1JWRA 5EBHA 2DKVA 1LMNA 1B2KA 1LZSA 4ET9A 4HTKA 4NWEA 1IX0A 3WU9A 4L41A 1FLWA 1FLQA 1GF6A 1FKQA 1LSCA 1DPXA 2BAAA 1IWTA 1LSGA 4PHIA 1JJ1A 1ZVHL 2BQCA 4PRQA 5FSTA 4NGJA 2W1XA 1GF8A 1IOQA 2BQKA 1H87A 5D5FA 4DD0A 1KXYA 1LZGA 3T6UA 1I1ZA 4NEBA 4B1AA 1B7OA 2ZNXY 3LYMA 1LYYA 1JKAA 3IJVA 3W6DA 3WL2A 4H9FA 2HTXA 4KXIA 1XGUC 5F14A 1GB9A 2H5ZA 5JENB 3SP3A 4C5FA 1LTMA 5KXKA 5E9RA 1J1XY 1DXJA 2BQOA 1GF0A 1HFXA 1BB5A 4GN5C 4LYMA 1GBSA 1LZRA 5FEKA 1F10A 4RLMA 4TTDA 3WPKA 4NSIA 3OJPA 1LSMA 3D3DA 1I20A 4P2EA 4KPMA 4UWUA 2BQMA 1HEPA 1B7RA 1B5YA 1GB0A 3WU7A 4HJVA 3CT5A 5KXTA 5LVIA 4LYTA 5B07A 3G3BB 4GCDA 4HTQA 1GFVA 1GEVA 1GAYA 1LJ3A 1YAQA 5LAGA 4DDCA 2Z18A 1NF5A 1MELL 2Z2FA 1A2YC 1C43A 1CKFA 1G7LC 1LZ6A 5K7OA 1B7LA 1JTPL 4CGEA 4NWHA 4DD2A 2A7FA 5FCPA 3WYHA 3A6CY 5KKIA 1LZNA 4H90A 1KIQC 3LHMA 2ZWBA 1HERA 1YROA 5M1YA 1GBYA 5I4XA 4XJBA 3CSQA 3TMVA 1B0DA 1GFTA 2MEEA 4DYGA 1JITA 1WVVA 3ATOA 5DL9A 4HJYA 3WMKA 3P68A 1G7JC 1LZBA 1W08A 4OWHA 2DQIY 4PJ2C 1TBYA 3B0OA 4OOTA 2NWDX 4UWVA 2Q0MX 5D5CA 1BB4A 1HEOA 3WXTA 4YF2A 2BQFA 1GF7A 1GF9A 1HFYA 1ZV5L 1IR9A 5DLAA 1V7TA 2BQHA 5AMYA 2HEDA 4Z98A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B5ZA 1D0MA 4W57A 4DDBA 1NBZC 1LMAA 2F32A 4LYOA 4W59A 4I7RA 1EPYA 3B72A 4DD1A 1GB7A 5L3IA 1CU2A 4R0FA 1ZVYB 181LA 4LYCA 1ZWNA 1LMPA 1DYDA 3RT5X 1D0LA 1XEJA 5B1FA 1JKBA 3WULA 5I5QA 3N9CA 1L65A 3GUKA 5LXWA 1RFPA 3EMLA 1CKHA 1C6AA 1KS3A 1C60A 4LYBA 1GFEA 1L25A 5KXNA 1JHLA 1XGTC 3WUAA 1OUFA 3E3DA 1L64A 3VWOA 1NWGA 3W6AA 4GCCA 1QT6A 180LA 2LYMA 2YBLA 4ANRA 3G3WA 3EMSA 3WUNA 1L20A 1IIZA 1KIPC 1L42A 1RI8B 3AZ5A 4TWSA 4I7MA 2CJLA 205LA 1YKZX 1LAAA 231LA 5F16A 3W6BA 3A95A 2BQDA 4E3UA 2Z37A 131LA 3C81A 3HU8A 4LDEA 2B72A 1JIYA 2NTHA 3CDVA 5FELA 2MEFA 1W6ZA 1WTMA 2RSCA 5I53A 2BQEA 1GE2A 3DN0A 5E4PA 3A6BY 4WM5A 4B49A 4DD0A 1PQOA 2BPUA 1GE4A 2HU3A 1YILA 3TXDA 4LZTA 2LZTA 4FJRA 222LA 1B5VA 1UIDA 3EBAB 1ZURA 4ZEEA 1REYA 1PS5A 1L45A 2F2QA 1REXA 2FBDA 4YOPA 1L17A 1CJ6A 1L26A 3CDQA 247LA 1LPYA 3T36A 195LA 3WW6A 1LJIA 1IP1A 1GBXA 2XTHA 3C8QA 4I7LA 1QUHA 3RNXA 1UC0A 172LA 4XJGA 1C6LA 4ETEA 5KJ9A 1LZYA 128LA 250LA 1JISA 1L67A 1LSYA 1IWWA 1GFGA 1LZCA 4HV2A 4LFPA 1HEMA 1NQIA 3TMXA 1LYDA 2OU9A 2ZQ3A 4XYYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1B5Z A;  4H9I A;  1D0M A;  1NKH A;  2HUB A;  2CDS A;  1WQR A;  1IC5 Y;  4IAT A;  4QGZ A;  4DDB A;  1NBZ C;  1XGP C;  7LYZ A;  5J7C A;  1GBZ A;  1LMA A;  4TUN A;  5APC A;  1HHL A;  2XBR A;  4LYO A;  5HMV A;  1VED A;  1IOR A;  1OUH A;  4YEM A;  1HSX A;  3B72 A;  4DD1 A;  5KXS A;  1GB7 A;  5KXY A;  5L3I A;  4GCE A;  9LYZ A;  2Z38 A;  3AW7 A;  4R0F A;  1ZVY B;  1VAU A;  1C7P A;  3HBE X;  4H8Y A;  5KXP A;  3A93 A;  4LYC A;  4CJ2 A;  2YBJ A;  2CGI A;  4J1B A;  1LMP A;  194L A;  1LZ4 A;  1B7P A;  1GB6 A;  1WQO A;  2G4Q A;  1GDW A;  1GFK A;  3RT5 X;  1D0L A;  1XEJ A;  3FI7 A;  1LSN A;  1OUJ A;  5B1F A;  1JKB A;  3WUL A;  1GB5 A;  1NMM A;  4C3W A;  5I5Q A;  3J4G A;  5LVH A;  5KXR A;  4NHS A;  2ZIJ A;  3N9C A;  3RZ4 A;  2AUB A;  3WXU A;  2HU1 A;  5HNC A;  1RJC B;  4WO6 A;  2HEE A;  5LXW A;  2F4A A;  1RFP A;  2BQJ A;  5KXW A;  1HEQ A;  1CKH A;  4G49 A;  1YIK A;  3A3R X;  1GB2 A;  1B5U A;  2I26 L;  3A90 A;  2IHL A;  1FLU A;  4LYB A;  1GFE A;  5KXN A;  3TXJ A;  3BKV A;  1JHL A;  1XGT C;  3WUA A;  1OUF A; 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 1H87 A;  5D5F A;  4DD0 A;  1KXY A;  1LZG A;  3T6U A;  1I1Z A;  4NEB A;  4B1A A;  1B7O A;  2ZNX Y;  3LYM A;  1LYY A;  1JKA A;  3IJV A;  3W6D A;  3WL2 A;  4H9F A;  2HTX A;  4KXI A;  1XGU C;  5F14 A;  1GB9 A;  2H5Z A;  5JEN B;  3SP3 A;  4C5F A;  1LTM A;  5KXK A;  5E9R A;  1J1X Y;  1DXJ A;  2BQO A;  1GF0 A;  1HFX A;  1BB5 A;  4GN5 C;  4LYM A;  1GBS A;  1LZR A;  5FEK A;  1F10 A;  4RLM A;  4TTD A;  3WPK A;  4NSI A;  3OJP A;  1LSM A;  3D3D A;  1I20 A;  4P2E A;  4KPM A;  4UWU A;  2BQM A;  1HEP A;  1B7R A;  1B5Y A;  1GB0 A;  3WU7 A;  4HJV A;  3CT5 A;  5KXT A;  5LVI A;  4LYT A;  5B07 A;  3G3B B;  4GCD A;  4HTQ A;  1GFV A;  1GEV A;  1GAY A;  1LJ3 A;  1YAQ A;  5LAG A;  4DDC A;  2Z18 A;  1NF5 A;  1MEL L;  2Z2F A;  1A2Y C;  1C43 A;  1CKF A;  1G7L C;  1LZ6 A;  5K7O A;  1B7L A;  1JTP L;  4CGE A;  4NWH A;  4DD2 A;  2A7F A;  5FCP A;  3WYH A;  3A6C Y;  5KKI A;  1LZN A;  4H90 A;  1KIQ C;  3LHM A;  2ZWB A;  1HER A;  1YRO A;  5M1Y A;  1GBY A;  5I4X A;  4XJB A;  3CSQ A;  3TMV A;  1B0D A;  1GFT A;  2MEE A;  4DYG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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