3ZVQB

Crystal structure of proteolyzed lysozyme
Total Genus 13
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
13
sequence length
58
structure length
58
Chain Sequence
SRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME C
publication title Salt-Assisted Religation of Proteolyzed Glutathione-S-Transferase Follows Hofmeister Series.
pubmed rcsb
total genus 13
structure length 58
sequence length 58
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-07-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3zvqB00
1LJJA 1YAMA 2Q0MX 5DL9A 1LKSA 1JJ1A 1LZ8A 4C5FA 5HQ1A 1JTTL 2DQHY 2Y8PA 4OWHA 1GXV2 1LJEA 193LA 3FI7A 3A94A 1H6MA 5B06A 1VFBC 2MEDA 1T3PA 1WQMA 3CT5A 2YBJA 4DD1A 4GN3A 1IEEA 2EKSC 4XJBA 1JTOL 1EQ5A 1UIDA 4OOOA 3B0KA 1IWYA 1VDSA 1DPXA 1WTNA 1JKCA 5DLAA 4CHXA 1EQEA 2YDGA 3FE0A 5KKIA 1DI4A 2MEIA 1BB3A 5HNLA 4NGLA 3D9AC 5T3FA 1B7QA 1GXXA 4B4EA 3WVXA 4Z41A 1JEFA 1GE1A 2G4NA 1IWXA 1LZTA 1CKFA 4UWVA 3M18B 1QSAA 2Z12A 4TX7A 3AB6A 4G9SA 1GFRA 5LA5A 1T6VL 1JJ3A 134LA 1HSWA 1LTMA 1UACY 4OOTA 1GWDA 1GE2A 2D4JA 2YSSC 3F6ZA 5KXSA 1OUJA 1WQQA 2YBNA 1LYOA 3IWRA 3P66A 1XGUC 5HNCA 1AM7A 2HU3A 3HFMY 1G7IC 4DDBA 3WULA 5KY1A 1YAOA 5KXLA 1GF5A 1HERA 4LFXA 1IWTA 1IP2A 2HU1A 5F16A 1GFVA 3BKVA 4H8XA 4NGIA 2ZIJA 2BQHA 5FEKA 1UCOA 1GF9A 1J1PY 2Z2FA 2BQMA 3WUMA 2DQGY 4NGZA 2WARA 4H9EA 2I26L 5KXTA 1NBZC 4LT3A 5FSTA 3TXJA 2DQEY 3AGGG 4OW1A 2BLXA 5D5FA 2BQNA 4OWBA 5DN5A 4H9BA 4RW2A 1VATA 1TEWA 4XYYA 2Z19A 4LT0A 1JKAA 1WQRA 1IP7A 2DQDY 4Z3MA 2CDSA 3G3BB 4XN6A 1NBYC 1GBYA 3QNGA 3ZVQA 3VWOA 5IELA 1KIQC 1ZMYL 1FKQA 1SLYA 1LMNA 1ZVYB 2MEBA 1LHMA 1W08A 1GF0A 3WXTA 5LIOA 4RLMA 1JJ0A 3LZ2A 2H9KA 4LYOA 5LVJA 1XEKA 1HENA 1LYSA 1LZ4A 1BB7A 2ZILA 2H5ZA 5FDJA 1F0WA 1LSCA 1GF7A 3KAMA 4KT3A 1GAZA 1O23A 5LYMA 1GD6A 5E9RA 1J1OY 1LZYA 4G4CA 2ZNXY 4H9FA 1XFPL 1FDLY 1HF4A 4BAFA 4WLDA 4ET8A 4TSBA 2CGIA 3A93A 2Z37A 1HFXA 3IJVA 4H8ZA 3AZ7A 1OUEA 3AYQA 3W3EA 1BQLY 1LYZA 1GB5A 5I4YA 153LA 1QQYA 5KXXA 1GE4A 2C8PA 1HNLA 4GCFA 3RZ4A 1IP3A 1B0DA 1JHLA 3N9EA 3RU5A 3A90A 2D4KA 1LZEA 5LVIA 4QGZA 1C43A 1LSBA 2BQAA 3CSZA 3LZTA 4NG1A 1AZFA 1LAAA 1TAYA 4OWCA 4XADA 1NQIA 2YBLA 3LN2A 1LSYA 2YBHA 2XBRA 4RLNA 2GV0A 1LSDA 1LMOA 1V7TA 5HLLA 1IWWA 1GAYA 1I56A 3D3DA 1ZV5L 2YVBA 4HV2A 1LJIA 1LSEA 3RW8A 2VB1A 1F6SA 4WG7A 1GF8A 1LHHA 2Z2EA 1HEMA 4I8SA 1LCNA 1LSZA 3HBHA 1I1ZA 4H9IA 4NGJA 4ETEA 4DDAA 4QY9A 4WM5A 2ZYCA 1BWJA 1B5YA 1JITA 4H1PA 1XGTC 3IJUA 2DQCY 5APDA 1ZVHL 4DD9A 3TXKA 4ETAA 2PC2A 1GFAA 1H87A 4N5RA 4D9ZA 4GLAA 1LMQA 2HEEA 4NGOA 2FBBA 4GN4A 1YAQA 1LSFA 5KXRA 1XGRC 3CT0A 4WO9A 1C46A 1HELA 4AXTA 9LYZA 4H94A 4B1AA 1PS5A 1OUHA 2AUBA 1BHZA 3AW7A 2G4PA 3LYZA 4LZTA 1B7NA 3P65A 4DD7A 4G4HA 1HEQA 4LT1A 1LJ3A 4ML7A 1UIFA 2CWIA 1DXJA 1IP5A 1IP1A 1WQPA 2FYCA 2BQGA 4WO6A 5L3IA 3TXIA 4N9RA 2ZYPA 5B05A 2BQEA 1FBIX 1GB6A 1NKHA 1B5WA 2DQAA 1UC0A 3A6BY 1WVUA 1BGIA 4NGKA 4PPOA 4WM4A 5KXYA 5LVHA 4YENA 1GF3A 2BQIA 2W1LA 5DN4A 3LYOA 1UIAA 1REXA 2BQCA 4M6DA 1WTMA 3P64A 3B0IA 207LA 1UIGA 1GPQC 4LYCA 4G49A 4CGEA 1DZBX 1QUSA 4GLVA 4YF2A 1SQ2L 1GB3A 2IFFY 5LVKA 1KXXA 1IOQA 1RJCB 2IHLA 4HTQA 1CJ7A 1PZYA 1KXYA 2LYMA 3ATNA 5B1FA 5B59A 1IOSA 4XENA 3ATOA 2BQFA 1TCYA 1VDPA 1LOZA 4DWXA 3G3AB 1FKVA 4O34A 4DDCA 4H9CA 1HHLA 1CKGA 1LZ6A 4WMGA 5I54A 1GDWA 1UIHA 1B7MA 3WUAA 1CNSA 4DD3A 4XJIA 1C45A 1YKYX 2HEBA 1LZRA 1AT5A 3B6LA 3OJPA 4ET9A 4ZIXA 4IJ4A 1QSWA 4ZEEA 2W1MA 4KXIA 4YEOA 4P2EA 2ZIKA 4OWEA 2A7FA 1OP9B 2DQFC 1NWGA 3RNXA 1LHJA 1LZCA 1LJ4A 2EIZC 3EMSA 2B5ZA 4RW1A 5F9XA 2DKVA 1LZSA 2FBDA 1LPIA 1UIBA 4HJYA 4PGJB 3SP3A 3TMWA 2D4IA 3RT5X 3W6BA 5M1YA 3A3RX 4WOAA 1IC7Y 4H91A 2BPUA 3A91A 208LA 1GFTA 2D6BA 4B4JA 1C08C 4A7DA 4PRUA 5FCPA 3AGIA 3N9CA 4GCBA 3TMVA 3ULRA 1AKIA 1FN5A 2DQIY 4II8A 1IWUA 3WPKA 5JENB 2EPEA 4NGYA 2DQJY 1CJ9A 1FLQA 3TMXA 1GFGA 3WU9A 4DT3A 5KJ9A 3ZVQB 4W96A 1LZAA 3W6DA 4YOPA 1BB6A 1GF6A 1IIZA 1QDTA 1RFPA 4NGVA 1UICA 5F9UA 135LA 5KXZA 1FLYA 4Z98A 1KIPC 1JWRA 1HEWA 1YANA 2HEDA 3AJNA 3EXDA 2FYDA 4NG8A 4NHSA 5LAFA 1GB0A 1REYA 1A2YC 1FLWA 1DPWA 1IP6A 5I4WA 2ZQ3A 1GB9A 1GHLA 1DI5A 3TMUA 1D0KA 1NHEA 2C8OA 2I25L 4ETCA 1DKJA 2HTXA 2YBMA 3N9AA 4R6CA 4ETDA 2MEEA 3T36A 5EBHA 1IORA 1GF4A 1LSGA 4GN5C 4E3UA 1XGQC 5LYTA 3P68A 1DI3A 3TXBA 7LYZA 1MELL 4NEBA 1B5XA 1RI8B 4NWHA 4I0CA 1RCMA 4LYMA 1B2KA 2I6ZA 1EQ4A 4HSFA 1EL1A 1G7JC 2Z38A 4NHQA 3WU7A 5KXOA 6LYZA 1IOCA 3WUNA 1INUA 2XJWA 5KXMA 3AGHA 1LZNA 5ILFA 1HSXA 1BWIA 1YAPA 1B7OA 1BB4A 3BKHA 2XBSA 4MR1A 1GFJA 4NSHA 5AMYA 3EBAB 1NMMA 1BVKC 5ILCA 1JPOA 4N8ZA 1LJNA 1GFUA 1GE0A 1ALCA 5LVGA 1OUFA 3WVYA 1LJKA 3CB7A 4TSCA 1LJFA 3AW6A 1GB2A 1D0LA 4FJRA 3W6AA 4HP0A 1E8LA 4NHIA 1GEVA 3B72A 1JIYA 1HMKA 1LZDA 2A7DA 1LHKA 4OWAA 3WW5A 4B49A 1B5VA 4WLXA 2ZNWY 1BWHA 1IR7A 3MGWA 4B0DA 1UUZC 2F4GA 2Z39A 4GCEA 3AZ4A 4J0LA 4C3WA 5K7OA 1IY4A 2BQDA 2MEGA 3J6KA 4GCDA 1LSMA 1LHIA 4H93A 1OUGA 4L41A 1JKDA 1P2CC 1IP4A 2BQLA 1OUIA 3EO5A 3WPJA 4H92A 4QEQA 1GBSA 3J4GA 1LHLA 3ZEKA 4IATA 3W6FA 2X0AA 1YKXX 1HEPA 2HEAA 3A3QA 1FLUA 4HPEA 4J7VA 4UWNA 4CJ2A 1HEOA 1F10A 5LA8A 1OUBA 1J1XY 1QTEA 1GFHA 1IC4Y 1B7RA 5A3ZA 2F30A 5APEA 1B5UA 2BQKA 4NSJA 4BAPA 3LYMA 1GEZA 3AZ6A 2HEFA 3WH1A 4WG1A 3AZ5A 4RDSA 1IR8A 1IX0A 2MEFA 1IR9A 1CJ8A 4XJDA 1N4FA 1D6PA 2RSCA 1LSAA 4LYTA 4N0JA 1LSPA 4WLYA 6LYTA 4LYZA 3OK0A 3WW6A 3W6EA 1LJGA 3TXFA 5C6IA 4DD2A 1XSFA 1IY3A 2Z18A 1JSEA 4MCKA 2BLYA 3GXKA 4XJGA 2BQBA 1IWZA 1JUGA 4PHIA 5C6LA 5KXKA 5KXWA 3A96A 2EQLA 2LHMA 1HFYA 1OUDA 4H90A 1YL0X 1IO5A 4UWUA 4WL6A 5DM9A 2W1XA 1GDXA 4PJ2C 5B1GA 4GCCA 3TXDA 4QDNA 3WXUA 1VAUA 1JSFA 1Z55A 3CQLA 4WM3A 5APFA 5D5CA 1GB7A 2BQJA 3W6CA 4ZFPA 5LXWA 1IVMA 5HMVA 3M3UA 1CKDA 1LMTA 2MEAA 3P4ZA 4B4IA 1B9OA 5APCA 3CSQA 5B07A 3WPLA 3WU8A 1NDGC 4KL7A 4XJHA 1D9UA 1YKZX 5F14A 1UA6Y 1G7LC 4HTNA 1IC5Y 1OUAA 1CKCA 1QTKA 1GBXA 2LZTA 1GBWA 4Z46A 1DQJC 2ZWBA 1DKKA 2W1YA 4KPMA 4ETBA 154LA 1YIKA 1LKRA 1LZ5A 2D91A 4H8YA 4NIJA 3WL2A 4M4OA 1GBOA 3LHMA 1QDRA 4NY5A 2HUBA 4N1EI 3A67Y 1IWVA 1GFKA 4CFPA 1G7HC 2NWDX 5A3EA 4XJFA 4DD0A 1YQVY 3A34A 1CJ6A 4HTKA 1REZA 2ZQ4A 1LMPA 1F6RA 1LZ9A 3E3DA 4G4BA 4TWSA 1TDYA 4NFVA 4WM1A 5KXNA 2BQOA 1GFEA 2XTHA 2MECA 4HJVA 1YILA 4IASA 1OUCA 2MEHA 3WYHA 132LA 5E4PA 3WMKA 1GE3A 1XEJA 1UIEA 2LYOA 3HBEX 4H9HA 5L3HA 3GXRA 1JISA 5F81A 4BS7A 5FELA 3A95A 1LSNA 1YL1X 194LA 1BVXA 1LZGA 4NHPA 8LYZA 4LGKA 4R0FA 5IDDA 4DYGA 4MSTA 1LZ1A 4X3BA 1MLCE 1RE2A 4U3XB 4YM8A 1HC0A 1NF5A 4LFPA 1D0MA 1D6QA 3TXHA 3A6CY 5C6JA 1WQNA 2DBTA 2F4AA 3CT1A 1B7SA 1LJHA 4FDYA 4HV1A 4J1AA 4N1CC 4NGWA 4ANRA 4WLTA 4DC4A 1QIOA 1JKBA 4WM2A 1REMA 3HBDA 1VDTA 4TTDA 3LYTA 1B7PA 2HECA 4AGAA 1B7LA 3TXEA 5IHGA 3QY4A 5LINA 2LYZA 4NHTA 1TBYA 2F2NA 2H9JA 4NSIA 5LAGA 3TXGA 5I53A 4TUNA 1A4VA 1NDMC 1WVVA 1YROA 3A92A 4J1BA 1G7MC 1XGPC 3K3TA 2G4QA 1LMAA 4EMNA 4HJZA 1JTPL 1BB5A 1C7PA 4CFOA 2YBIA 3A8ZA 2N5ZA 2LZ2A 5HMJA 1LMCA 4LT2A 5FHWA 1OQMA 1HMLA 1B5ZA 1IOTA 1GB8A 3B0OA 1XEIA 5KXPA 5L9JA 1WQOA 4W94A 1LYYA 4WM6A 5KKJA 4BADA 5II3A 1AT6A 1KIRC 5I5QA 1I20A 1CKHA 4NSGA 4NWEA 1LZBA 1C10A 1HFZA 1VDQA 4HPIA 1VEDA 4LYBA 5J7CA 5I4XA 1W6ZA 133LA 3CSRA 1KXWA 4H9AA 4EOFA 1GBZA 3T6UA 3QE8A 2CJLA 5LYZA 4YEMA 4WL7A 1UBZA 4PRQA 2BAAA 1QUTA 1V7SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LZ8A 2Y8PA 1GXV2 193LA 1G0QA 1L05A 5LZMA 2B6ZA 3A94A 2MEDA 1L74A 4YXAC 1L79A 1L30A 4DD1A 4GN3A 2EKSC 1L29A 1EQ5A 1L49A 1UIDA 1DPXA 1WTNA 1EQEA 1DI4A 1BB3A 148LE 5HNLA 1L14A 3CDOA 4NGLA 173LA 4B4EA 1GXXA 1IWXA 3M18B 2HUMA 1JJ3A 1GWDA 2D4JA 3IWRA 3P66A 1XGUC 3SBAA 5HNCA 2HU3A 1QTCA 4LFXA 1IWTA 1GFVA 4NGIA 2BQHA 190LA 1UCOA 1CTWA 242LA 1NBZC 3TXJA 2DQEY 1NHBA 2BLXA 1C69A 4OWBA 4I7PA 1JKAA 2O79A 1FKQA 1D2YA 218LA 3WXTA 3HTBA 4LYOA 1HENA 113LA 1L0KA 3KAMA 2ZNXY 4I7OA 1FDLY 1HF4A 4WLDA 2CGIA 3W3EA 1LYZA 1GB5A 5KXXA 1IP3A 3RU5A 3C7YA 240LA 1L65A 3A90A 5LVIA 1C6FA 2BQAA 1LSYA 138LA 1G0JA 2XBRA 4RLNA 2GV0A 1LSDA 3GUIA 3D3DA 1LSEA 1L81A 1GF8A 2Z2EA 176LA 4I8SA 1LSZA 4H9IA 2QARC 4NGJA 4DDAA 1L71A 1L99A 3IJUA 1SX2A 1G06A 2DQCY 2RAZX 4DD9A 4N5RA 4D9ZA 4NGOA 1L92A 1LSFA 1L36A 5KXRA 2B6YA 137LA 4B1AA 1OUHA 1BHZA 180LA 1KNIA 3LYZA 4DD7A 4G4HA 167LA 1LI2A 4DQJA 4LDLA 1UIFA 1G0LA 1IP5A 4WO6A 2BQGA 1L17A 3TXIA 141LA 1XJTA 5B05A 2BQEA 1FBIX 1GB6A 1NKHA 1OV5A 2B7XA 1LYEA 1L96A 195LA 1L43A 1L86A 4I7KA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1LJJ A;  1YAM A;  2Q0M X;  5DL9 A;  1LKS A;  1JJ1 A;  1LZ8 A;  4C5F A;  5HQ1 A;  1JTT L;  2DQH Y;  2Y8P A;  4OWH A;  1GXV 2;  1LJE A;  193L A;  3FI7 A;  3A94 A;  1H6M A;  5B06 A;  1VFB C;  2MED A;  1T3P A;  1WQM A;  3CT5 A;  2YBJ A;  4DD1 A;  4GN3 A;  1IEE A;  2EKS C;  4XJB A;  1JTO L;  1EQ5 A;  1UID A;  4OOO A;  3B0K A;  1IWY A;  1VDS A;  1DPX A;  1WTN A;  1JKC A;  5DLA A;  4CHX A;  1EQE A;  2YDG A;  3FE0 A;  5KKI A;  1DI4 A;  2MEI A;  1BB3 A;  5HNL A;  4NGL A;  3D9A C;  5T3F A;  1B7Q A;  1GXX A;  4B4E A;  3WVX A;  4Z41 A;  1JEF A;  1GE1 A;  2G4N A;  1IWX A;  1LZT A;  1CKF A;  4UWV A;  3M18 B;  1QSA A;  2Z12 A;  4TX7 A;  3AB6 A;  4G9S A;  1GFR A;  5LA5 A;  1T6V L;  1JJ3 A;  134L A;  1HSW A;  1LTM A;  1UAC Y;  4OOT A;  1GWD A;  1GE2 A;  2D4J A;  2YSS C;  3F6Z A;  5KXS A;  1OUJ A;  1WQQ A;  2YBN A;  1LYO A;  3IWR A;  3P66 A;  1XGU C;  5HNC A;  1AM7 A;  2HU3 A;  3HFM Y;  1G7I C;  4DDB A;  3WUL A;  5KY1 A;  1YAO A;  5KXL A;  1GF5 A;  1HER A;  4LFX A;  1IWT A;  1IP2 A;  2HU1 A;  5F16 A;  1GFV A; 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 5L3H A;  3GXR A;  1JIS A;  5F81 A;  4BS7 A;  5FEL A;  3A95 A;  1LSN A;  1YL1 X;  194L A;  1BVX A;  1LZG A;  4NHP A;  8LYZ A;  4LGK A;  4R0F A;  5IDD A;  4DYG A;  4MST A;  1LZ1 A;  4X3B A;  1MLC E;  1RE2 A;  4U3X B;  4YM8 A;  1HC0 A;  1NF5 A;  4LFP A;  1D0M A;  1D6Q A;  3TXH A;  3A6C Y;  5C6J A;  1WQN A;  2DBT A;  2F4A A;  3CT1 A;  1B7S A;  1LJH A;  4FDY A;  4HV1 A;  4J1A A;  4N1C C;  4NGW A;  4ANR A;  4WLT A;  4DC4 A;  1QIO A;  1JKB A;  4WM2 A;  1REM A;  3HBD A;  1VDT A;  4TTD A;  3LYT A;  1B7P A;  2HEC A;  4AGA A;  1B7L A;  3TXE A;  5IHG A;  3QY4 A;  5LIN A;  2LYZ A;  4NHT A;  1TBY A;  2F2N A;  2H9J A;  4NSI A;  5LAG A;  3TXG A;  5I53 A;  4TUN A;  1A4V A;  1NDM C;  1WVV A;  1YRO A;  3A92 A;  4J1B A;  1G7M C;  1XGP C;  3K3T A;  2G4Q A;  1LMA A;  4EMN A;  4HJZ A;  1JTP L;  1BB5 A;  1C7P A;  4CFO A;  2YBI A;  3A8Z A;  2N5Z A;  2LZ2 A;  5HMJ A;  1LMC A;  4LT2 A;  5FHW A;  1OQM A;  1HML A;  1B5Z A;  1IOT A;  1GB8 A;  3B0O A;  1XEI A;  5KXP A;  5L9J A;  1WQO A;  4W94 A;  1LYY A;  4WM6 A;  5KKJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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