4C5FA

Structure of lytic transglycosylase mltc from escherichia coli at 2.3 a resolution.
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
WVKDTNGFDILMGQFAHNIENIWGFKEVVIAGPKDYVKYTDQYQTRSHINFDDGTITIETIAGTEPAAHLRRAIIKTLLMGDDPSSVDLYSDVDDITISKEPFLYGQVVDNTGQPIRWEGRASNFADYLLKNRLKSRSNGLRIIYSVTINMVPNHLDKRAHKYLGMVRQASRKYGVDESLILAIMQTESSFNPYAVSRSDALGLMQVVQHTAGKDVFRSQGKSGTPSRSFLFDPASNIDTGTAYLAMLNNVYLGGIDNPTSRRYAVITAYNGGAGSVLRVFSNDKIQAANIINTMTPGDVYQTLTTRHPSAESRRYLYKVNTAQKSYRRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and Cell Wall Cleavage by Modular Lytic Transglycosylase Mltc of Escherichia Coli.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE C
molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
total genus 114
structure length 330
sequence length 330
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
A PF11873 Mltc_N Membrane-bound lytic murein transglycosylase C, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4c5fA02
3IJUA 1IOTA 1ALCA 1UIFA 4CFOA 3AW6A 4KPMA 3CT1A 5ILFA 1GB9A 4G9SA 4LYTA 1IWUA 1LZDA 1LJEA 5HQ1A 3G3BB 1VFBC 1GEZA 1V7TA 4LT0A 4LYMA 3AW7A 1IC7Y 4G4HA 1HERA 2Z12A 1JKBA 1BB3A 2W1LA 1BVKC 1JSFA 3QY4A 1I20A 5DLAA 2D4JA 1BB5A 1B5WA 1LJFA 3A3QA 3LYMA 2MEFA 2BQMA 2LYZA 4HTKA 1YAOA 1J1OY 1GF4A 4J1AA 2LZ2A 4NSGA 3A91A 1NBYC 4ETDA 1GE2A 4WLTA 1LJNA 2CGIA 4G4CA 2Y8PA 4NGLA 1N4FA 1CKGA 1IORA 1LJHA 1QSWA 1UA6Y 1GXV2 4H8XA 1BVXA 5T3FA 1LSMA 1NF5A 2WARA 3FI7A 4N0JA 3WU9A 4ETBA 1JIYA 4MR1A 1QTEA 1B5UA 1LOZA 1GFGA 3LN2A 1YKYX 4P2EA 1RJCB 2BQCA 5KXMA 4G4BA 1OQMA 3P66A 1QTKA 1JJ0A 1W08A 1F0WA 4ET9A 4NGZA 1UIAA 4HV1A 3W6BA 4M6DA 2AUBA 2DQIY 2DQAA 2D6BA 134LA 1IWVA 1YKZX 1LSCA 1FBIX 2H5ZA 3WW5A 1IWTA 1GE1A 1GXXA 1LKSA 3WVXA 5I4XA 1UUZC 5FHWA 5M1YA 2MEEA 3LZ2A 4DC4A 3WUNA 4U3XB 3ATNA 1OUCA 4NHQA 3BKVA 1AZFA 2MEDA 4XENA 4R0FA 3HBDA 2YSSC 2Z2FA 2F4GA 5DM9A 3ZVQA 4PRUA 3LYOA 1G7JC 5E4PA 1YANA 1LZ6A 4AXTA 4N1EI 1I1ZA 3ZVQB 4OWCA 1YAQA 1TDYA 2YDGA 5F9UA 5JENB 1TAYA 4IASA 4NGWA 3CT0A 3WU8A 1D0MA 3HBEX 2DQJY 2BQEA 4I0CA 3EBAB 2ZIJA 1VDQA 3B6LA 1GF5A 1IEEA 1HFYA 1LSFA 1LZSA 2XBRA 4NWHA 4WG1A 1JJ3A 3J4GA 5IHGA 2F4AA 1LSDA 3AGGG 4EOFA 3P4ZA 1HENA 3TXIA 4TTDA 1IWWA 3EMSA 1GFUA 1HELA 2CJLA 3WULA 4LFPA 4DDCA 4AGAA 1GBWA 3LYTA 2FYDA 4OOTA 4NGYA 1DI3A 5KXNA 5J7CA 4NFVA 1LHHA 4W96A 1NWGA 4UWUA 3TMVA 3WPJA 4B4IA 1QDTA 5KKJA 2VB1A 1BHZA 1YKXX 5KY1A 4QGZA 3A93A 1GD6A 3TXEA 4NEBA 2HU3A 1YQVY 1GPQC 4TUNA 1VDPA 5KXSA 3A6CY 4H9AA 1GBOA 1GFAA 5II3A 1LMQA 1LZEA 1CJ9A 2D4KA 2MEAA 5KXWA 3MGWA 1GF7A 1LKRA 4HTQA 4A7DA 2LYMA 5A3EA 2MEHA 2XJWA 3WXTA 1UIHA 1LCNA 1XFPL 1NMMA 4LT2A 5KXPA 1OUDA 1LJKA 2MEGA 4NGJA 2HEAA 3A90A 5HMJA 1HFXA 3CQLA 4H93A 4IATA 4YEOA 2BQNA 4PHIA 3E3DA 1NHEA 1GF0A 5B1GA 1LMAA 5LVHA 4ETCA 1HEQA 1TEWA 3BKHA 3VWOA 3AGHA 1B7RA 1D6PA 4WOAA 5KXZA 1UC0A 3CB7A 5LYZA 4NGKA 1XGUC 1LJJA 3W6AA 5LYTA 5C6IA 1LZ4A 1JKAA 2N5ZA 1HC0A 2F2NA 1DZBX 2MEBA 4H9BA 4NHTA 1BB6A 4YOPA 1LHMA 1VDSA 1DPWA 5I53A 4GLAA 1JISA 4I8SA 4ZFPA 1FKVA 1VAUA 3TXHA 3WMKA 4H9FA 2H9KA 1LHKA 3EXDA 1YILA 1QUSA 1LAAA 4GN5C 4WLYA 1GB5A 1IP3A 1I56A 1BB4A 4NSJA 4CHXA 1XGQC 8LYZA 4N1CC 1LYSA 5KKIA 3A3RX 1NQIA 1LZ1A 4WO9A 4TWSA 2X0AA 1WQNA 3D3DA 4DD3A 1AT5A 2YVBA 4DWXA 5K7OA 3AZ4A 2DQGY 4XJHA 1XGPC 3F6ZA 4XJDA 4LZTA 3QE8A 3G3AB 4QDNA 1E8LA 1XEKA 4OWAA 1LSGA 2HEBA 2I25L 2W1YA 4YENA 1LZAA 1QDRA 1Z55A 1LZTA 2BQGA 4WL7A 2ZYPA 1RE2A 1VATA 1OUFA 3SP3A 4ZIXA 4YM8A 2ZWBA 1DI5A 1B7OA 1YAMA 5IELA 2C8OA 1LMPA 4XJIA 1MLCE 4YF2A 3RT5X 1LYZA 1GAZA 1EQEA 1H6MA 1WQQA 1ZV5L 3W6EA 1CKDA 2BLYA 3A94A 3WH1A 5F9XA 3B0OA 2I6ZA 1JITA 4WM5A 3W6DA 2BQOA 1C08C 4LT1A 1JPOA 1ZVYB 3M3UA 4R6CA 2W1MA 5I4WA 4H9EA 3LZTA 4WM1A 1IR9A 1RFPA 1YIKA 5IDDA 1LSPA 3WL2A 5I4YA 2A7DA 1JWRA 1WQRA 5HNCA 1LSNA 3TXKA 1DPXA 4H90A 4B49A 1AT6A 4HTNA 4RLMA 1MELL 1IP7A 1WVVA 1B7NA 2HEDA 1XEIA 5F16A 3W6FA 2XBSA 5I5QA 3TMUA 2HU1A 3TMXA 1QSAA 4DD2A 1OP9B 1B2KA 1JKDA 4WLXA 1LMNA 1RCMA 2IHLA 2H9JA 3M18B 4DD7A 1LTMA 2G4NA 4LYOA 4WM4A 5KJ9A 5LAGA 1J1XY 1LMCA 4XADA 4XYYA 5EBHA 1B5ZA 1B5VA 2YBLA 1LZYA 3OK0A 2MECA 5A3ZA 4PJ2C 4XJGA 4ET8A 2BPUA 1UICA 3CSZA 1KXXA 2ZYCA 4BAFA 5B05A 4XJFA 2YBHA 1GFHA 1HHLA 3WVYA 2HUBA 3HBHA 4MCKA 4Z41A 1FN5A 1OUHA 3GXKA 4H1PA 1IX0A 4J0LA 4TSCA 4H8ZA 2Z39A 1UIGA 4KXIA 1QUTA 1GFVA 1O23A 2BQBA 2DQEY 5B1FA 4IJ4A 4O34A 5LAFA 4NWEA 4NGVA 1LSYA 1GF3A 2BAAA 2DQCY 3N9CA 4GN4A 1IP6A 1FLWA 1GB3A 1CJ7A 1LHJA 4KL7A 1LSBA 2BQAA 4NHSA 5LVKA 1CJ6A 1HSWA 4QEQA 4KT3A 3T36A 1F6SA 4N8ZA 3WUMA 5B59A 2ZQ3A 4NSIA 1CKHA 1GF8A 2Z18A 1HEMA 4ZEEA 1B7QA 1LZCA 1QQYA 1LPIA 2Z19A 1XGTC 193LA 1REYA 3FE0A 1P2CC 4TSBA 4C3WA 2LHMA 4DDAA 4QY9A 1CKFA 1EL1A 1VEDA 1REXA 2DQDY 3P65A 4LYZA 3WUAA 4DDBA 1CNSA 3CSRA 2DQHY 207LA 1HMLA 4DD0A 4PRQA 1FLUA 5LXWA 4OWBA 4GCDA 3AJNA 1BWJA 1LZRA 1IWZA 1B5YA 1BWHA 2LYOA 2HEEA 2EPEA 1GB8A 3P68A 1IO5A 2BQDA 1LJIA 4GN3A 4L41A 3RNXA 1RI8B 5LINA 1NDMC 3A34A 2I26L 1B7SA 5DN4A 1JEFA 1G7MC 3A95A 3AYQA 5KXYA 4UWNA 1JTTL 2DQFC 4B1AA 2BQJA 1SLYA 1WQMA 4II8A 2ZNWY 3HFMY 4J1BA 3WPKA 4X3BA 1KXWA 4OWEA 1GF9A 1HFZA 1OUAA 1GFKA 3AGIA 4WM6A 1BGIA 4BS7A 3A6BY 1HNLA 3A8ZA 1REZA 1YROA 4H94A 3RW8A 1GBXA 2D4IA 1H87A 1INUA 4H8YA 1IVMA 1AKIA 1HEWA 2CDSA 1YL0X 1JTPL 3TMWA 4LYBA 2YBJA 2YBNA 1WVUA 3IJVA 5KXRA 1LZGA 5B07A 1GB6A 1IY4A 1EQ4A 1OUJA 1SQ2L 1UBZA 1J1PY 1D6QA 4FDYA 4UWVA 5DN5A 1G7LC 1BWIA 4LYCA 1HEOA 2Q0MX 4OWHA 1LHLA 4W94A 9LYZA 4WO6A 4WL6A 1IY3A 2XTHA 1GFJA 3WU7A 1C43A 2D91A 4N5RA 4Z98A 4B4EA 5L3IA 1UIBA 4ETEA 4RLNA 1GEVA 1D0KA 4WMGA 4ANRA 5ILCA 1LJ3A 1KXYA 1UIDA 1GB0A 4CFPA 2HECA 154LA 3AZ5A 2Z37A 4NGOA 1IWXA 5KXKA 4M4OA 5APCA 1JSEA 2IFFY 4HJZA 1LYYA 1LSAA 1IIZA 5FELA 1LZ8A 1D9UA 1LHIA 4G49A 4ML7A 1VDTA 1DQJC 1OUIA 1UACY 3AB6A 135LA 194LA 3AZ6A 5KXTA 1C45A 1XEJA 4B4JA 1WTMA 1IR7A 208LA 4N9RA 2BQLA 2EIZC 1LZNA 7LYZA 2MEIA 4GCEA 5FCPA 1IP2A 3ZEKA 1WQPA 4NG8A 1AM7A 4OOOA 5HMVA 4XJBA 1IWYA 4WLDA 1LZBA 5I54A 1HSXA 1DI4A 1UCOA 1YAPA 1F10A 4DYGA 3TXDA 1OUEA 4H9CA 3WXUA 4D9ZA 4NIJA 5LA5A 5FDJA 1B7PA 1LSZA 1IC4Y 3TXJA 4HSFA 4DD9A 1LJGA 5KXXA 3N9AA 4GCCA 2ZNXY 3A96A 3D9AC 2DKVA 1KIQC 4RW2A 1G7IC 1IOQA 1GWDA 2HTXA 2ZQ4A 2FBBA 1PZYA 1DKJA 2BQKA 3GXRA 3CT5A 4H92A 5L3HA 2C8PA 3TXFA 6LYTA 153LA 3IWRA 3W6CA 4GCFA 2DBTA 1XGRC 4NHPA 3OJPA 4RW1A 4MSTA 5AMYA 4EMNA 5F14A 1C46A 2CWIA 1CJ8A 4HPEA 2EKSC 4E3UA 1HF4A 1BQLY 2LZTA 4H9IA 3AZ7A 1GFTA 4J7VA 1GE0A 4WM2A 1REMA 1YL1X 5LIOA 1A2YC 3A67Y 4H91A 5FEKA 3ULRA 1A4VA 1TCYA 3KAMA 3TXBA 6LYZA 1OUGA 1ZVHL 1GBZA 133LA 1LSEA 4BADA 2Z2EA 3T6UA 4NHIA 3P64A 2G4PA 1GE4A 1GE3A 1IP4A 1IC5Y 1B5XA 2BQFA 1GFRA 1B0DA 1C10A 1GB7A 5KXOA 2EQLA 4NG1A 132LA 4XN6A 4Z46A 1WTNA 1DXJA 1B7LA 2G4QA 3QNGA 1GB2A 1G7HC 1F6RA 2NWDX 2YBIA 4NGIA 1FLYA 4LGKA 5LVJA 5FSTA 3A92A 2B5ZA 3K3TA 4RDSA 1IR8A 1GFEA 4WM3A 1WQOA 1HMKA 1GBSA 4HJVA 1GDXA 5C6JA 5DL9A 3B0IA 2FYCA 3B72A 1JTOL 5F81A 5KXLA 5LVGA 1T3PA 2YBMA 1JJ1A 1ZMYL 4GCBA 3WPLA 4HJYA 1LZ5A 1UIEA 1GHLA 1LMTA 3B0KA 3LYZA 4DT3A 1FKQA 4NY5A 4HPIA 1TBYA 4HP0A 5D5FA 4CGEA 1NKHA 3EO5A 1LJ4A 4YEMA 3J6KA 1KIPC 1W6ZA 3W3EA 1JKCA 4FJRA 3ATOA 1EQ5A 1OUBA 1KIRC 5C6LA 1GBYA 3WYHA 2ZILA 4OW1A 4Z3MA 1FLQA 4TX7A 1IP1A 2BQHA 5APFA 1D0LA 2F30A 2BLXA 4NSHA 4ETAA 1BB7A 1GDWA 1IOSA 4LFXA 2RSCA 4C5FA 5LA8A 5D5CA 5HNLA 4PPOA 1NDGC 1XSFA 1GF6A 1LMOA 1LYOA 3CSQA 1LZ9A 4DD1A 3TXGA 1IP5A 1C7PA 4WG7A 1PS5A 2HEFA 4B0DA 4H9HA 4CJ2A 3RZ4A 1FDLY 1T6VL 2BQIA 1CKCA 4HV2A 3WW6A 1NBZC 1JHLA 2PC2A 2Z38A 1B7MA 1IOCA 1DKKA 2A7FA 1HEPA 1QIOA 4LT3A 4PGJB 2FBDA 1V7SA 1B9OA 2ZIKA 2W1XA 5LVIA 4BAPA 5HLLA 5L9JA 4GLVA 5APDA 5APEA 3N9EA 1GAYA 5E9RA 3RU5A 5LYMA 3LHMA 2GV0A 1JUGA 5B06A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IJUA 1UIFA 2F2QA 1GB9A 1GEZA 1V7TA 4LDLA 4PK0A 178LA 1HERA 1G0LA 1JKBA 113LA 5DLAA 1QUOA 1LYJA 1LJFA 1C6TA 3NY8A 1JQUA 1J1OY 2LZ2A 1LJNA 4W54A 2Q9DA 1L94A 3L2XA 1QSWA 3C83A 5T3FA 2WARA 1JIYA 1L40A 3LN2A 118LA 1RJCB 1C6KA 5KXMA 4DQJA 1QTKA 210LA 2F32A 1KW5A 2RBPA 3W6BA 2DQIY 2DQAA 1YKZX 1IWVA 2H5ZA 1L77A 1UUZC 2MEEA 3DN0A 4XENA 1L56A 3ZVQA 161LA 4AXTA 1CU3A 5E4PA 4N1EI 3ZVQB 4OWCA 1YAQA 1L30A 157LA 3CT0A 1D0MA 3HBEX 2BQEA 1L37A 3HH5A 122LA 2RB2X 4WG1A 2XBRA 4NWHA 201LA 3SB7A 4EOFA 1L62A 4LFPA 199LA 4AGAA 1SSWA 1SWYA 3LYTA 3SBBC 3HWLA 1NWGA 3TMVA 1QDTA 143LA 2VB1A 3A93A 1GD6A 155LA 1YQVY 1L23A 4TUNA 4EKPA 3A6CY 4H9AA 1L06A 1LZEA 2MEAA 3MGWA 1L54A 4HTQA 5A3EA 3HT6A 1CU5A 5KXPA 4LT2A 1OUDA 2MEGA 4NGJA 221LA 3A90A 1HFXA 1P5CA 1TEWA 3VWOA 5LYZA 3C8SA 3W6AA 3EMLA 5C6IA 1LZ4A 2N5ZA 1HC0A 1DPWA 1L72A 171LA 1L07A 1LHKA 1LAAA 4GN5C 1OV5A 205LA 209LA 6LZMA 1ZWNA 1BB4A 4CHXA 120LA 3A3RX 1C65A 1CV4A 2B72A 1L01A 1D3JA 4I7TA 185LA 1K28A 111LA 4LZTA 3QE8A 1LLHA 2I25L 1QDRA 2BQGA 2ZYPA 1RE2A 1VATA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3IJU A;  1IOT A;  1ALC A;  1UIF A;  4CFO A;  3AW6 A;  4KPM A;  3CT1 A;  5ILF A;  1GB9 A;  4G9S A;  4LYT A;  1IWU A;  1LZD A;  1LJE A;  5HQ1 A;  3G3B B;  1VFB C;  1GEZ A;  1V7T A;  4LT0 A;  4LYM A;  3AW7 A;  1IC7 Y;  4G4H A;  1HER A;  2Z12 A;  1JKB A;  1BB3 A;  2W1L A;  1BVK C;  1JSF A;  3QY4 A;  1I20 A;  5DLA A;  2D4J A;  1BB5 A;  1B5W A;  1LJF A;  3A3Q A;  3LYM A;  2MEF A;  2BQM A;  2LYZ A;  4HTK A;  1YAO A;  1J1O Y;  1GF4 A;  4J1A A;  2LZ2 A;  4NSG A;  3A91 A;  1NBY C;  4ETD A;  1GE2 A;  4WLT A;  1LJN A;  2CGI A;  4G4C A;  2Y8P A;  4NGL A;  1N4F A;  1CKG A;  1IOR A;  1LJH A;  1QSW A;  1UA6 Y;  1GXV 2;  4H8X A;  1BVX A;  5T3F A;  1LSM A;  1NF5 A;  2WAR A;  3FI7 A;  4N0J A;  3WU9 A;  4ETB A;  1JIY A;  4MR1 A;  1QTE A;  1B5U A;  1LOZ A;  1GFG A;  3LN2 A;  1YKY X;  4P2E A;  1RJC B;  2BQC A;  5KXM A;  4G4B A;  1OQM A;  3P66 A;  1QTK A;  1JJ0 A;  1W08 A;  1F0W A;  4ET9 A;  4NGZ A;  1UIA A;  4HV1 A;  3W6B A;  4M6D A;  2AUB A;  2DQI Y;  2DQA A;  2D6B A;  134L A;  1IWV A;  1YKZ X;  1LSC A;  1FBI X; 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 1G7H C;  1F6R A;  2NWD X;  2YBI A;  4NGI A;  1FLY A;  4LGK A;  5LVJ A;  5FST A;  3A92 A;  2B5Z A;  3K3T A;  4RDS A;  1IR8 A;  1GFE A;  4WM3 A;  1WQO A;  1HMK A;  1GBS A;  4HJV A;  1GDX A;  5C6J A;  5DL9 A;  3B0I A;  2FYC A;  3B72 A;  1JTO L;  5F81 A;  5KXL A;  5LVG A;  1T3P A;  2YBM A;  1JJ1 A;  1ZMY L;  4GCB A;  3WPL A;  4HJY A;  1LZ5 A;  1UIE A;  1GHL A;  1LMT A;  3B0K A;  3LYZ A;  4DT3 A;  1FKQ A;  4NY5 A;  4HPI A;  1TBY A;  4HP0 A;  5D5F A;  4CGE A;  1NKH A;  3EO5 A;  1LJ4 A;  4YEM A;  3J6K A;  1KIP C;  1W6Z A;  3W3E A;  1JKC A;  4FJR A;  3ATO A;  1EQ5 A;  1OUB A;  1KIR C;  5C6L A;  1GBY A;  3WYH A;  2ZIL A;  4OW1 A;  4Z3M A;  1FLQ A;  4TX7 A;  1IP1 A;  2BQH A;  5APF A;  1D0L A;  2F30 A;  2BLX A;  4NSH A;  4ETA A;  1BB7 A;  1GDW A;  1IOS A;  4LFX A;  2RSC A;  4C5F A;  5LA8 A;  5D5C A;  5HNL A;  4PPO A;  1NDG C;  1XSF A;  1GF6 A;  1LMO A;  1LYO A;  3CSQ A;  1LZ9 A;  4DD1 A;  3TXG A;  1IP5 A;  1C7P A;  4WG7 A;  1PS5 A;  2HEF A;  4B0D A;  4H9H A;  4CJ2 A;  3RZ4 A;  1FDL Y;  1T6V L;  2BQI A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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