4DD9A

Eval processed hewl, carboplatin dmso paratone
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural studies of the effect that dimethyl sulfoxide (DMSO) has on cisplatin and carboplatin binding to histidine in a protein.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
total genus 44
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dd9A00
1QDRA 3WPLA 1XEKA 5I4WA 2ZYCA 5FEKA 5B07A 1F10A 1LZTA 4KL7A 1IWXA 1YAMA 4U3XB 4H90A 2Z38A 5F14A 3CSRA 1LZYA 1OUFA 4DD7A 1BWHA 1DI4A 2DKVA 3WL2A 5KXRA 1LSPA 1SLYA 1JISA 1IP7A 3AGGG 4DD9A 1LZ6A 1HFXA 2BQIA 2HU3A 1GE1A 1LSFA 1HHLA 1OUJA 3KAMA 1KIQC 2DQFC 1G7HC 3RNXA 1GF9A 1GF5A 1JHLA 5F9UA 3WVXA 4TWSA 1HEOA 3TXDA 1LJFA 1YROA 5LYTA 1YAQA 2MEFA 1F6SA 1XSFA 1DPXA 4NGLA 5AMYA 1WQRA 1LOZA 5B1FA 1XGUC 4NFVA 1GF8A 1DZBX 1GAYA 1GD6A 3AB6A 1LHKA 5J7CA 2BQJA 1YKXX 4WO6A 4G49A 2HEDA 1GHLA 4H94A 3TXBA 4ZEEA 4ETEA 2G4PA 1LJ3A 3HFMY 1B5WA 2AUBA 4LT1A 1LMAA 4OWAA 1IP6A 4XJGA 2ZWBA 5LYZA 4EOFA 1BVXA 2DQAA 4J1AA 1LHHA 2A7FA 4N9RA 3TXHA 1FN5A 1RCMA 2F4AA 1LZ5A 4LYCA 4NG1A 4H92A 4MCKA 5FHWA 4RW2A 1GXV2 1IOSA 4G4BA 3CQLA 2D91A 1I20A 4NGZA 1H87A 4C5FA 1QTEA 1BVKC 3D3DA 2W1LA 4ETCA 1LYYA 5L9JA 5HNCA 2C8OA 3P65A 2I26L 1C10A 4HSFA 4PHIA 4LYZA 1QUSA 2BQBA 1HMLA 4XADA 4HPIA 2DQCY 2MEBA 4PJ2C 1UUZC 4PRUA 2Y8PA 3QNGA 1HEWA 3D9AC 1C08C 4KT3A 2DQIY 2DQDY 3P4ZA 1GB9A 1RI8B 1XEJA 3TMVA 1IP1A 1JTOL 2DQEY 4H91A 4WM5A 4DD1A 3QE8A 3TXGA 2EQLA 2EPEA 1NBZC 3TXKA 1IOTA 1GE3A 5FDJA 2DQJY 2LYZA 3AZ5A 5DLAA 1JITA 1REZA 4FJRA 9LYZA 1OUIA 3WVYA 1J1PY 1GE4A 4N1CC 1WTMA 4PRQA 3W6AA 2X0AA 4LT3A 5I53A 2F2NA 3K3TA 1JJ3A 1EQEA 4EMNA 2F4GA 1P2CC 5KXTA 1FLUA 4NSGA 1LCNA 3CT0A 1B5VA 1LHIA 1DXJA 5DL9A 3W6BA 1IC7Y 1GB7A 1IR7A 1WVUA 1INUA 1FKVA 1XEIA 2ZILA 4G4HA 4WL7A 4WLYA 2YBIA 1GB0A 1LJHA 4PPOA 1OUHA 4LFPA 1LYSA 4XN6A 2Z19A 4WG1A 5B1GA 4DDAA 2HEAA 1JWRA 3WUNA 4H9FA 1IO5A 3RZ4A 1IOCA 2CDSA 4DD2A 3A93A 4IASA 2IFFY 3ATNA 2BQNA 4H1PA 2Z2EA 3TXIA 2BLXA 4M6DA 1E8LA 3EBAB 4GCEA 2WARA 4ETAA 3B72A 1B5ZA 3CSZA 4WM4A 1JUGA 1LSAA 4B49A 4I8SA 1IWUA 1LSZA 4WM6A 3AZ6A 4HJVA 2LYMA 1LSMA 1IP5A 1JTPL 1B2KA 1NQIA 1OUAA 1WQOA 4TSBA 5APFA 4QY9A 3WW5A 3A94A 4LYBA 2LZ2A 1B7SA 1IWTA 2DQHY 1GF6A 4RLMA 4WMGA 2BPUA 5ILCA 1A2YC 4RDSA 5L3IA 4XJBA 4KPMA 2GV0A 4H9CA 1OUBA 3FE0A 1WVVA 1ZV5L 5KXOA 3J4GA 1CJ9A 1GDWA 4HPEA 1IY4A 3HBDA 3MGWA 2W1XA 4HJZA 1GBWA 4AXTA 1B7QA 1EQ5A 5HMVA 1LZBA 3WUMA 4J7VA 3OK0A 1QTKA 4TX7A 2YSSC 4XJIA 1B7NA 1VATA 1FLQA 4WLTA 1CJ8A 3CSQA 4YEOA 3AYQA 1YKYX 3WU7A 8LYZA 3W6EA 4J1BA 1CJ7A 2HEBA 1LSDA 3W3EA 2YBJA 4HV2A 4ETBA 5IELA 4MSTA 1WTNA 1JEFA 5I4XA 2HEEA 1QSAA 2DQGY 1G7LC 5E9RA 1LSCA 1IVMA 1VEDA 4BAPA 4YENA 4QDNA 1T3PA 4YEMA 4XENA 1B7LA 208LA 5LAGA 5E4PA 1LMQA 3M3UA 4H9HA 4UWUA 1LZEA 2YBLA 4II8A 4CFPA 3N9CA 2YBNA 2Q0MX 1BGIA 2D4IA 2YBMA 4H8XA 4LYMA 1YL0X 1BB3A 5LXWA 194LA 1YQVY 1WQMA 4AGAA 5KXXA 1NMMA 3A8ZA 2FYCA 3LYZA 4GCCA 4OW1A 3N9EA 3LZTA 4H8ZA 1KXWA 1GAZA 1HELA 2Z37A 1B5XA 1OP9B 132LA 1JJ1A 133LA 4XYYA 2MEGA 2C8PA 1CJ6A 3AZ7A 4NWEA 4OOTA 4TSCA 4QGZA 1GFTA 5HNLA 4DYGA 2XBRA 1C45A 1V7SA 4NSHA 4WO9A 5APDA 2B5ZA 1GF0A 4D9ZA 4NHQA 1RJCB 4NIJA 2HU1A 5C6JA 1YKZX 5KXKA 1IWZA 2FBDA 1J1OY 1KXXA 1REMA 3IJUA 1LSBA 1NBYC 4H9IA 4TTDA 5C6LA 3W6FA 5KKJA 1AM7A 2NWDX 3WPKA 4NSIA 1LJEA 3ATOA 3M18B 1IX0A 1LJKA 1GPQC 4WLDA 1BB6A 1AKIA 1NWGA 2BQDA 3W6DA 2BQOA 4WOAA 1NDGC 1LZCA 3LN2A 3TXEA 2BLYA 1CKCA 1GFEA 1LAAA 3CB7A 1H6MA 5I5QA 4ET9A 4TUNA 1LZ4A 1MELL 1DI3A 1O23A 2D4KA 1LJIA 3P66A 2CGIA 1AT5A 5KXPA 1G7IC 1HFZA 1REYA 5KXSA 5FSTA 1SQ2L 1XGRC 2XTHA 3B0IA 1I56A 1LZRA 4HJYA 2ZIJA 4PGJB 4XJHA 1LJNA 1GB3A 1CKFA 1EQ4A 1B7PA 3BKVA 5LIOA 4LZTA 1LSNA 1LYOA 2BQKA 4NSJA 4W96A 4DDCA 3LYMA 1GF4A 4MR1A 4N0JA 1IORA 1D9UA 1NDMC 2H5ZA 2I25L 3ZEKA 4DT3A 3T6UA 2MEIA 1LSEA 1D6PA 3WMKA 2PC2A 1BWJA 3AW7A 1GFKA 1TAYA 1GE2A 2MEDA 4HV1A 5LVKA 4A7DA 1HEMA 1W08A 1B9OA 3A90A 4Z41A 4ET8A 2Z18A 3RW8A 5KJ9A 1IWYA 4B4EA 1FLWA 1N4FA 5FCPA 5LVGA 1IY3A 4CFOA 2G4QA 1UIDA 1HF4A 1PZYA 5JENB 3A67Y 1LKRA 1YIKA 4UWVA 4G4CA 3G3AB 4LGKA 1GEVA 1C7PA 3LYOA 3WU8A 4DD3A 3TMUA 2ZYPA 1OUEA 1GEZA 1LZ9A 5II3A 4CGEA 1JTTL 1IP2A 1B5UA 1HEPA 1T6VL 1GXXA 1BB7A 2W1MA 4HTQA 1FBIX 1QDTA 1XFPL 4LFXA 4E3UA 4WM3A 1LZDA 5A3EA 3WU9A 1D0LA 2LHMA 5FELA 1QIOA 4ETDA 4H9BA 3B6LA 4H93A 3WXTA 4CJ2A 3ZVQA 6LYTA 1BWIA 2A7DA 4NY5A 1IC5Y 4GCBA 5KXYA 1GDXA 3EMSA 1BB4A 3WUAA 4DC4A 1VDSA 4OWBA 4C3WA 1QSWA 3P68A 5K7OA 5F9XA 1YAOA 4LYOA 3QY4A 2HUBA 1CKHA 1HERA 3IWRA 4NGJA 5T3FA 4OWEA 1CNSA 1F6RA 4W94A 2CWIA 1JKDA 2HECA 2BQCA 2BQMA 2Z12A 3B0KA 6LYZA 5B06A 3A3RX 4H9EA 4NEBA 4NGIA 4B0DA 1XGTC 4OWCA 5B05A 1JKBA 1GWDA 3T36A 4BADA 1UC0A 4WM1A 5HQ1A 1KIPC 3A92A 1FDLY 4XJDA 3AZ4A 5LVIA 2FBBA 4R0FA 1LYZA 2DBTA 3A91A 4CHXA 1UIBA 4M4OA 4LYTA 1IEEA 5KXWA 4KXIA 1HNLA 1REXA 2YBHA 4LT2A 3A6BY 5KXMA 4RLNA 4WLXA 2CJLA 2D6BA 5B59A 4H8YA 1BB5A 3IJVA 1OQMA 2G4NA 3TXFA 1UIEA 3AGHA 3WW6A 1HC0A 1EL1A 1IC4Y 4NGVA 4NWHA 5LA5A 1LJJA 1UBZA 1VFBC 4NGKA 1IP4A 1JKAA 1GB2A 1GBOA 1LPIA 3WYHA 1GBXA 4ZIXA 1DKJA 5F81A 1GBYA 1G7MC 2EIZC 4NGOA 4XJFA 1LZ1A 1B5YA 1GFAA 1I1ZA 2ZNWY 3EXDA 1F0WA 4GN4A 1FLYA 1RE2A 4J0LA 3W6CA 1YILA 2LZTA 4WM2A 1LMPA 5IDDA 5A3ZA 1C43A 4GCFA 1CKDA 1GB8A 2YDGA 2H9JA 5DM9A 3HBHA 1GFUA 1D0KA 3F6ZA 1G7JC 2ZQ4A 4Z3MA 3FI7A 1LMTA 1HFYA 2BQHA 3HBEX 4NHIA 4P2EA 1VDPA 3J6KA 5LA8A 1DKKA 1UIAA 1UIGA 1OUDA 4DD0A 3LHMA 1OUCA 3SP3A 5DN4A 1GFRA 1XGQC 4BS7A 1DI5A 1NKHA 3AGIA 1LKSA 1GBZA 1UIHA 3LZ2A 4HTKA 5LINA 1UACY 7LYZA 1GF7A 1NHEA 1C46A 2ZNXY 1HEQA 1TDYA 4N5RA 3WH1A 1LZ8A 2HEFA 2BQEA 5F16A 2XJWA 4UWNA 2BQAA 4GN5C 3A6CY 1ALCA 1LZSA 1WQPA 1YL1X 2LYOA 3CT5A 3WPJA 4DDBA 2EKSC 1UICA 1GB5A 5C6IA 4ZFPA 4HP0A 3OJPA 1GBSA 1WQQA 2MEHA 4IJ4A 3TXJA 4LT0A 1LMCA 1B0DA 1HSXA 5EBHA 3A3QA 3A96A 154LA 4B4JA 5M1YA 4NHSA 4GLAA 1RFPA 3TMWA 3CT1A 1LTMA 2I6ZA 2MEEA 2MECA 4YF2A 2Z39A 1LZAA 4WL6A 1GFHA 5DN5A 1Z55A 1LHJA 3AJNA 4ML7A 3TMXA 1LZNA 4Z46A 5HLLA 5KXZA 1B7OA 1JKCA 1TCYA 1LSGA 5L3HA 1GF3A 2HTXA 3A34A 4OWHA 1XGPC 4RW1A 5IHGA 3EO5A 1NF5A 4N8ZA 5KXNA 2N5ZA 1JSFA 5I4YA 1JPOA 4X3BA 1IP3A 1B7MA 4HTNA 1LJGA 5APEA 1AT6A 4L41A 1ZVYB 4ANRA 1IOQA 1D0MA 1J1XY 4WG7A 2F30A 1LSYA 1HSWA 2FYDA 1FKQA 4Z98A 3ZVQB 2BAAA 2IHLA 1JIYA 1JJ0A 3GXRA 2BQLA 2BQFA 1IWWA 1WQNA 4I0CA 2Z2FA 207LA 5HMJA 5I54A 1CKGA 1DQJC 5LAFA 4GN3A 1LHMA 4R6CA 1YANA 3AW6A 134LA 5APCA 1BQLY 1QUTA 2MEAA 5KY1A 1AZFA 1V7TA 4NHPA 1TBYA 3RU5A 1IIZA 1B7RA 1TEWA 2D4JA 4FDYA 1KIRC 4GLVA 1UIFA 1UCOA 4B1AA 1OUGA 2XBSA 2VB1A 3G3BB 2YVBA 1IWVA 1HMKA 1D6QA 1LMNA 3GXKA 4NGYA 3RT5X 3VWOA 193LA 2ZIKA 135LA 1A4VA 1JSEA 3ULRA 2BQGA 1GE0A 4NGWA 2ZQ3A 1LJ4A 5KXLA 1GFJA 1BHZA 1UA6Y 5D5FA 4DWXA 4NG8A 1GFGA 3BKHA 1GFVA 4OOOA 2H9KA 153LA 3WULA 1MLCE 3P64A 1IR8A 3E3DA 5D5CA 1QQYA 1W6ZA 1DPWA 1GB6A 1VDQA 4H9AA 4N1EI 2W1YA 4YOPA 4B4IA 4BAFA 4NHTA 4IATA 1ZMYL 3A95A 5ILFA 4G9SA 4GCDA 5LYMA 1LHLA 5LVJA 4O34A 1LZGA 3B0OA 4QEQA 5LVHA 3N9AA 4YM8A 1VDTA 1KXYA 1PS5A 1LMOA 1YAPA 3WXUA 1VAUA 1HENA 1IR9A 3LYTA 1ZVHL 5KKIA 2RSCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L68A 1QDRA 5I4WA 1F10A 4PJZA 1YAMA 2Z38A 1KW7A 1DI4A 3NY9A 1SLYA 1IP7A 1SWZA 1HFXA 3DN3A 2HU3A 1L92A 140LA 1OUJA 4ARLA 185LA 4K5YA 1L62A 5LYTA 1DPXA 1WQRA 4I7SA 2B6ZA 1YKXX 4G49A 1GHLA 4H94A 4YXAC 2G4PA 1LJ3A 253LA 2AUBA 4OWAA 2A7FA 2B6WA 4N9RA 1FN5A 1CV6A 4ARJA 1OV7A 1IOSA 1EPYA 2D91A 1QTEA 1BVKC 3D3DA 1QT6A 2C8OA 1C10A 1PQOA 4HPIA 2DQCY 2MEBA 2Y8PA 1HEWA 4KT3A 2DQDY 183LA 2DQEY 128LA 2RBQA 1LYIA 1L11A 187LA 2OE9X 5FDJA 1JITA 1REZA 1OUIA 3WVYA 1J1PY 4N1CC 4LT3A 2Z6BA 3K3TA 5I53A 212LA 4EMNA 120LA 1P2CC 5KXTA 1FLUA 1LCNA 1LHIA 2RB1X 127LA 5DL9A 1IC7Y 4WLYA 1L42A 4PPOA 199LA 1K28A 4I7KA 4ARQA 4DDAA 1L12A 1L02A 4H9FA 1IO5A 1IOCA 2F47A 4DD2A 1OVJA 2IFFY 1L69A 3TXIA 1L64A 4WM4A 1B5ZA 1LSAA 4I8SA 4WM6A 4HJVA 2LYMA 1LSMA 5APFA 4TSBA 4LYBA 2HUMA 2LZ2A 1G0JA 2DQHY 4WMGA 1GF6A 2BPUA 155LA 223LA 4KPMA 2GV0A 1QT4A 3C8QA 1GDWA 4HPEA 1IY4A 2RBNA 162LA 4AXTA 1B7QA 3OK0A 1QTKA 4TX7A 1B7NA 3CSQA 2XQOA 2RAYX 4J1BA 1CJ7A 2YBJA 2F2QA 4DQ7A 5I4XA 2DQGY 5E9RA 255LA 1T3PA 1C6JA 1B7LA 5E4PA 256LA 1L53A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1QDR A;  3WPL A;  1XEK A;  5I4W A;  2ZYC A;  5FEK A;  5B07 A;  1F10 A;  1LZT A;  4KL7 A;  1IWX A;  1YAM A;  4U3X B;  4H90 A;  2Z38 A;  5F14 A;  3CSR A;  1LZY A;  1OUF A;  4DD7 A;  1BWH A;  1DI4 A;  2DKV A;  3WL2 A;  5KXR A;  1LSP A;  1SLY A;  1JIS A;  1IP7 A;  3AGG G;  4DD9 A;  1LZ6 A;  1HFX A;  2BQI A;  2HU3 A;  1GE1 A;  1LSF A;  1HHL A;  1OUJ A;  3KAM A;  1KIQ C;  2DQF C;  1G7H C;  3RNX A;  1GF9 A;  1GF5 A;  1JHL A;  5F9U A;  3WVX A;  4TWS A;  1HEO A;  3TXD A;  1LJF A;  1YRO A;  5LYT A;  1YAQ A;  2MEF A;  1F6S A;  1XSF A;  1DPX A;  4NGL A;  5AMY A;  1WQR A;  1LOZ A;  5B1F A;  1XGU C;  4NFV A;  1GF8 A;  1DZB X;  1GAY A;  1GD6 A;  3AB6 A;  1LHK A;  5J7C A;  2BQJ A;  1YKX X;  4WO6 A;  4G49 A;  2HED A;  1GHL A;  4H94 A;  3TXB A;  4ZEE A;  4ETE A;  2G4P A;  1LJ3 A;  3HFM Y;  1B5W A;  2AUB A;  4LT1 A;  1LMA A;  4OWA A;  1IP6 A;  4XJG A;  2ZWB A;  5LYZ A;  4EOF A;  1BVX A;  2DQA A;  4J1A A;  1LHH A;  2A7F A;  4N9R A;  3TXH A;  1FN5 A;  1RCM A;  2F4A A;  1LZ5 A;  4LYC A;  4NG1 A;  4H92 A;  4MCK A; 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 4X3B A;  1IP3 A;  1B7M A;  4HTN A;  1LJG A;  5APE A;  1AT6 A;  4L41 A;  1ZVY B;  4ANR A;  1IOQ A;  1D0M A;  1J1X Y;  4WG7 A;  2F30 A;  1LSY A;  1HSW A;  2FYD A;  1FKQ A;  4Z98 A;  3ZVQ B;  2BAA A;  2IHL A;  1JIY A;  1JJ0 A;  3GXR A;  2BQL A;  2BQF A;  1IWW A;  1WQN A;  4I0C A;  2Z2F A;  207L A;  5HMJ A;  5I54 A;  1CKG A;  1DQJ C;  5LAF A;  4GN3 A;  1LHM A;  4R6C A;  1YAN A;  3AW6 A;  134L A;  5APC A;  1BQL Y;  1QUT A;  2MEA A;  5KY1 A;  1AZF A;  1V7T A;  4NHP A;  1TBY A;  3RU5 A;  1IIZ A;  1B7R A;  1TEW A;  2D4J A;  4FDY A;  1KIR C;  4GLV A;  1UIF A;  1UCO A;  4B1A A;  1OUG A;  2XBS A;  2VB1 A;  3G3B B;  2YVB A;  1IWV A;  1HMK A;  1D6Q A;  1LMN A;  3GXK A;  4NGY A;  3RT5 X;  3VWO A;  193L A;  2ZIK A;  135L A;  1A4V A;  1JSE A;  3ULR A;  2BQG A;  1GE0 A;  4NGW A;  2ZQ3 A;  1LJ4 A;  5KXL A;  1GFJ A;  1BHZ A;  1UA6 Y;  5D5F A;  4DWX A;  4NG8 A;  1GFG A;  3BKH A;  1GFV A;  4OOO A;  2H9K A;  153L A;  3WUL A;  1MLC E;  3P64 A;  1IR8 A;  3E3D A;  5D5C A;  1QQY A;  1W6Z A;  1DPW A;  1GB6 A;  1VDQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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