4DDAA

Eval processed hewl, nag
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural studies of the effect that dimethyl sulfoxide (DMSO) has on cisplatin and carboplatin binding to histidine in a protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 44
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4ddaA00
4H8XA 4N1CC 5KJ9A 1ZMYL 4QDNA 2Z19A 4II8A 3RU5A 4H9AA 4H8ZA 5LIOA 1LHIA 1GBWA 9LYZA 5LXWA 1VFBC 4LGKA 3WPJA 3AYQA 4H9IA 3FI7A 5LVKA 1GFRA 4AGAA 1WQNA 1CJ7A 1LJHA 3EXDA 4XJBA 4FDYA 4PHIA 1JPOA 1LZCA 3RNXA 1GB8A 5LINA 4GLAA 4Z98A 1GE1A 1LZAA 207LA 3A93A 4YENA 5KXMA 4XJIA 1TDYA 1UC0A 4NGZA 4GCFA 4M4OA 1G7JC 1HFYA 5I4XA 4BS7A 1YROA 1GFVA 2CDSA 1LHMA 3B0IA 1QSWA 2Y8PA 1O23A 1D0LA 1LOZA 3AZ5A 1GXXA 1GB5A 1IP7A 4LFPA 4NSIA 4WOAA 4Z46A 4IJ4A 1CKGA 1FLQA 1W6ZA 1I56A 4DD3A 1GE2A 1OUHA 1Z55A 1B7LA 3W6FA 1HEMA 3HBEX 2FBDA 4NSGA 4GCBA 3P68A 4NSJA 1B2KA 4WM6A 1NHEA 1C43A 2EIZC 153LA 1LSPA 4UWNA 4NHQA 5FEKA 1G7MC 4WL7A 5APDA 4DDCA 5T3FA 1AM7A 3ULRA 4N8ZA 4LYOA 2MEEA 3D3DA 4LT3A 1GFTA 1F0WA 1LJEA 4CFPA 1IC7Y 1B5UA 1GF6A 1LMPA 4DWXA 3B6LA 1LSMA 2FYDA 2HUBA 1IP3A 1VEDA 1LCNA 4ETDA 1UACY 4XJGA 1DPXA 2DQIY 5ILCA 2N5ZA 1F6SA 2Z39A 1LYYA 4J1BA 3QY4A 3TMVA 5HLLA 1IWYA 1FLYA 4WG1A 1B0DA 1CJ9A 1QTEA 3OJPA 3WXTA 3OK0A 3WH1A 5I54A 1IP4A 3BKHA 1LSYA 1LSDA 1N4FA 3P66A 1WQRA 1LZ4A 4W94A 1LMOA 2YBIA 4NSHA 4WM2A 4NHIA 2C8PA 4BAPA 1D6PA 4Z3MA 4GCEA 3WU9A 4NHSA 1F6RA 1HELA 3ATOA 1OUBA 4TX7A 1GD6A 1LPIA 1WVVA 4OWCA 4QEQA 4N9RA 2YBMA 3W6BA 1C08C 1KXWA 1JITA 2D4IA 1GFGA 4G49A 1C7PA 4TUNA 3A6BY 4CHXA 1YKXX 2BLYA 4XADA 5DL9A 3TXDA 3AZ6A 1DI3A 1REMA 2Z12A 4WLTA 3WVYA 2Z18A 6LYTA 1XSFA 1B9OA 2DBTA 5HMVA 2BQCA 3T36A 4HTKA 3A91A 3WW6A 1IY3A 4NFVA 3CT5A 4PGJB 3W6AA 6LYZA 4WG7A 1IR9A 4KL7A 4DD2A 2XTHA 4QGZA 4DDBA 5B05A 1NDMC 2ZIKA 4HTNA 4P2EA 1YILA 1LSAA 2A7FA 3AGGG 1LJKA 3CT1A 4WM3A 5AMYA 1JKDA 1WQOA 4LT2A 4WLXA 1LTMA 2BQHA 5DN5A 3TMXA 3W3EA 1B5WA 1B7MA 1DI5A 1GF3A 2DQEY 4HV1A 2ZQ4A 1BVXA 4GN5C 2BQBA 3LZ2A 1GWDA 4N0JA 2HEAA 5KXYA 2DQAA 1QIOA 1XGUC 1LJFA 4GN3A 1LJ3A 1LJ4A 2D4KA 1JJ0A 1GAYA 1KIRC 2BQEA 1QDTA 4NWHA 3AGIA 2BQLA 4M6DA 5J7CA 1JJ3A 1IP5A 3TXJA 2HEEA 1NKHA 1XEKA 2MEAA 1F10A 4BADA 5KXWA 1BWJA 5HQ1A 1JHLA 1JISA 2DQHY 4DD1A 1YAQA 1OUDA 2CGIA 1REXA 4U3XB 1B5XA 5L9JA 3LYZA 1LSNA 4H9CA 5D5FA 1JKAA 2LZTA 5KXOA 3M3UA 1OUAA 4XJHA 1VDPA 5IHGA 5K7OA 5LYZA 1CJ6A 1YL0X 4AXTA 1BWHA 3W6EA 2EKSC 5B1GA 1HEOA 3AW7A 5LVIA 1G7IC 4H94A 2YBJA 5E9RA 4HJZA 2W1MA 1BGIA 2BQOA 1GF9A 1GXV2 3EBAB 1FBIX 2YVBA 2ZNXY 2DQDY 4KT3A 134LA 5F81A 2MEGA 1IWWA 2B5ZA 2RSCA 1DKJA 1C10A 3QNGA 1RE2A 5A3EA 1FKQA 1GE3A 1C46A 5LYTA 1IEEA 1TBYA 1D0KA 1AT5A 1JSFA 2I25L 1GFJA 1LZ1A 1AKIA 1FKVA 1WTNA 2A7DA 1VAUA 1YANA 4LYTA 1DZBX 1A2YC 1SLYA 154LA 3A67Y 4HV2A 5LA5A 5IDDA 3TMUA 2HEFA 1GBOA 4Z41A 4LT0A 1BWIA 1HF4A 4NY5A 4XJDA 1LHJA 1G7LC 4YOPA 2BQGA 2H9JA 3A6CY 4NGLA 4ETAA 1GB9A 1BB4A 2BAAA 8LYZA 4NGJA 2HTXA 1CKDA 2D91A 3BKVA 5KXZA 2BQKA 4G4CA 2DQCY 1OUJA 1LZRA 4WO6A 5KXRA 1NQIA 1IORA 1J1XY 3W6CA 1YAMA 1HERA 2BQNA 4J1AA 1RCMA 1VATA 3TXGA 4B49A 4YF2A 5I4YA 1DPWA 1IR7A 1EL1A 2BQDA 2LHMA 3B0OA 4R0FA 1LJNA 2BQIA 2MEHA 4WLDA 5KXTA 3F6ZA 2ZYPA 4RLMA 1BB3A 1GFHA 2BPUA 1B5YA 1QUSA 1NMMA 4GCCA 4LFXA 3A34A 2MEFA 1HEQA 1LYOA 2ZWBA 1PS5A 1WQPA 2CJLA 1LSGA 1IOTA 5LAGA 3ZVQA 4J0LA 3CSQA 1HSXA 1LSEA 4ETEA 2W1YA 4ET8A 208LA 1JUGA 3TXBA 3AW6A 4DC4A 3B0KA 1QQYA 4XYYA 5F16A 2G4PA 1REZA 3WXUA 1JIYA 4B4EA 1UCOA 4ZFPA 3AB6A 5II3A 1IWVA 3CQLA 1B7OA 3WW5A 1DQJC 1LZNA 3G3AB 3WPKA 2MEDA 3A96A 5LA8A 1CJ8A 2HEBA 1LZ8A 1GE0A 1XFPL 4J7VA 3SP3A 1WTMA 4PPOA 4WM5A 4DD0A 4CGEA 5L3IA 1GBZA 4HJYA 3ZVQB 3A8ZA 2DQJY 4ET9A 5APFA 1QSAA 2IHLA 1B7QA 1YIKA 1BB5A 1EQ4A 1AT6A 3D9AC 1KIPC 3IJUA 4MCKA 1JTTL 1LJGA 2DQFC 3K3TA 1AZFA 4O34A 4CFOA 2MECA 1OQMA 3AGHA 4WM1A 4UWUA 3WL2A 1LSCA 4LT1A 4D9ZA 1IWUA 135LA 3WMKA 1I1ZA 1MLCE 3LZTA 1GBSA 2HU1A 1CNSA 2BLXA 4C3WA 4I0CA 1IWXA 1YL1X 4EMNA 4DDAA 1G7HC 2GV0A 4IATA 1B7SA 2BQMA 3E3DA 4LZTA 1C45A 1LYZA 1UIFA 4H92A 3LYOA 1SQ2L 4WMGA 5B59A 4YEOA 1LSZA 1LMQA 4NHPA 5I5QA 2LYMA 4G9SA 4LYZA 1OP9B 5IELA 1NBZC 1LZSA 3A94A 4H9FA 3WVXA 5LYMA 1LJJA 2YSSC 1OUEA 1UUZC 1UIBA 1JTPL 193LA 1FLUA 1P2CC 3A90A 5KKJA 1RI8B 1XGRC 4MR1A 4NG1A 1E8LA 3WU7A 1UBZA 2ZQ3A 1JKBA 4H9EA 4XENA 4H1PA 1LMAA 1GF0A 1HNLA 4G4BA 1OUIA 1B5ZA 3W6DA 4B1AA 1LKRA 3P4ZA 4QY9A 1OUGA 4NG8A 3J6KA 1DKKA 1YQVY 4MSTA 4E3UA 4ZEEA 1XEIA 4UWVA 1LZ6A 1CKFA 1QUTA 2G4NA 1BB7A 1B5VA 1D6QA 1NBYC 5B06A 2Z37A 3RW8A 4B4JA 1D9UA 5JENB 2Z38A 1JJ1A 1TAYA 1NDGC 1IY4A 1IC5Y 1LSBA 2F30A 3RT5X 1GB3A 3N9AA 2AUBA 3N9CA 4KXIA 5APEA 3B72A 194LA 1GFEA 4OW1A 4N5RA 3TXHA 1QDRA 1ZV5L 2F4GA 3FE0A 4KPMA 3WYHA 1GB7A 1LHLA 3TXIA 1IP2A 1NF5A 4H90A 1GFAA 1XGQC 2H5ZA 5KXKA 2D6BA 4NEBA 4N1EI 1LKSA 1BVKC 2F4AA 5HNLA 1WVUA 1H6MA 2MEBA 1GB2A 1H87A 4ZIXA 1B7NA 1OUCA 2YDGA 1JSEA 1IWZA 2ZNWY 3CSRA 4H8YA 4FJRA 1V7SA 3AZ7A 1B7PA 1HEWA 4C5FA 1RJCB 2I26L 4I8SA 4NGOA 4PJ2C 4WM4A 2YBNA 3CSZA 1ZVYB 5M1YA 1UIHA 2LZ2A 4TWSA 5EBHA 1XGPC 4DD9A 1GDWA 4L41A 3T6UA 5DM9A 4YEMA 3N9EA 1VDTA 2YBHA 2NWDX 1HENA 5I53A 3IJVA 3IWRA 1GEZA 4ML7A 2XBSA 2LYOA 3G3BB 4TSBA 4EOFA 3EO5A 1IOCA 2ZILA 1UICA 1JEFA 4HPEA 4H91A 3HBDA 5LVGA 2FYCA 4DD7A 1TEWA 1UIAA 1QTKA 1GDXA 5LVJA 2H9KA 4BAFA 1B7RA 1FDLY 1IIZA 1IP6A 3QE8A 4G4HA 5FCPA 4NIJA 4W96A 1I20A 4WL6A 1CKHA 2Z2FA 5FELA 3TXEA 1INUA 3TMWA 3EMSA 4GCDA 4RW2A 2WARA 2BQFA 4PRQA 4NWEA 3A3QA 1GF4A 1UA6Y 4X3BA 1RFPA 5B1FA 1JWRA 5KXNA 1IR8A 2BQAA 5F9UA 1ALCA 4XN6A 4HPIA 7LYZA 3HBHA 1HSWA 4OWBA 4A7DA 1DXJA 5I4WA 4NGVA 1GBXA 1T6VL 2G4QA 1BQLY 4TTDA 3WUNA 3WULA 4ANRA 2ZYCA 1GFKA 1VDQA 4H93A 1J1OY 5KKIA 3ZEKA 4TSCA 1LJIA 2YBLA 1JTOL 4HP0A 3WUAA 133LA 1YKYX 4DYGA 3TXFA 4RLNA 2FBBA 1HMLA 3AJNA 4WO9A 3P64A 4B0DA 4OWHA 5C6IA 5C6LA 5D5CA 1YAOA 4LYMA 4NHTA 5F9XA 1LZTA 2I6ZA 2W1LA 1IOQA 1HFXA 1GAZA 2Z2EA 1LZ9A 1GB6A 1LZ5A 4NGWA 3ATNA 3A3RX 4ETBA 5LVHA 2X0AA 5FSTA 3HFMY 1LZGA 4HTQA 4R6CA 1GBYA 3WUMA 1FN5A 5KXSA 1OUFA 1W08A 1WQMA 3AZ4A 1IOSA 1DI4A 1UIGA 1IWTA 5DLAA 2XJWA 4HSFA 3LYMA 1KIQC 4GN4A 5LAFA 2W1XA 5HNCA 1IVMA 5KXPA 3RZ4A 3P65A 2PC2A 5L3HA 1HEPA 1A4VA 1YAPA 1HMKA 4ETCA 132LA 1BB6A 2HECA 4LYCA 1EQ5A 1IC4Y 4H9HA 1GF5A 1KXYA 5E4PA 1VDSA 1LZEA 3GXRA 4NGIA 1V7TA 1MELL 1TCYA 2EQLA 1CKCA 2DQGY 1FLWA 4NGYA 1GPQC 1D0MA 1LHHA 3LYTA 3TXKA 1UIDA 2VB1A 1LMNA 4B4IA 4OOTA 1GF8A 4OWAA 2HU3A 1YKZX 4WLYA 1LYSA 5KXXA 1LHKA 1LAAA 3M18B 1GFUA 5DN4A 2D4JA 4OOOA 4RDSA 4H9BA 1WQQA 4CJ2A 1IO5A 3J4GA 3WU8A 5B07A 1IX0A 1LZBA 3A95A 3A92A 3KAMA 2DKVA 3LN2A 1LSFA 1HHLA 1XGTC 5HMJA 1GE4A 2MEIA 4HJVA 4XJFA 5C6JA 5F14A 1HFZA 1BHZA 1LZDA 1ZVHL 3MGWA 4OWEA 4GLVA 4LYBA 2IFFY 5KY1A 1PZYA 5FHWA 1HC0A 5KXLA 1J1PY 1UIEA 2EPEA 1REYA 4PRUA 1EQEA 1GEVA 3LHMA 2C8OA 2BQJA 1JKCA 1LZYA 1LMTA 3WPLA 1T3PA 1LMCA 2CWIA 5A3ZA 3GXKA 5ILFA 4DT3A 5FDJA 3VWOA 1GHLA 2F2NA 2XBRA 2ZIJA 3CT0A 1NWGA 4RW1A 5APCA 1GB0A 1KXXA 1XEJA 1IP1A 2Q0MX 4NGKA 4YM8A 4IASA 1GF7A 3CB7A 2HEDA 2LYZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H8XA 3CDTA 1L83A 4YXAC 3RU5A 3HT7A 9LYZA 5LXWA 1VFBC 3WPJA 1L04A 3FI7A 4AGAA 1QTVA 3EXDA 3SB9A 137LA 114LA 1NHBA 2F2QA 3A93A 1UC0A 4GCFA 4M4OA 1HFYA 4BS7A 1YROA 3C8SA 2CDSA 3VW7A 1LHMA 1QSWA 2Y8PA 1D0LA 1LOZA 4LFPA 1IP7A 1C6IA 2RBSA 1GE2A 4DQ7A 4ARPA 1HEMA 2B6XA 2FBDA 214LA 4NSJA 253LA 153LA 3DMVA 4NHQA 5FEKA 1QUGA 5APDA 1L65A 2MEEA 3D3DA 4LT3A 4I7LA 1IC7Y 3F9LA 1L92A 3B6LA 1VEDA 2NTHA 2Z39A 1F6SA 1LYYA 5HLLA 1IWYA 1FLYA 1B0DA 3OJPA 4EXMA 3OK0A 4IAPA 3WH1A 5I54A 1L24A 1LSDA 1N4FA 1L21A 4NSHA 4BAPA 1F6RA 3ATOA 4OWCA 4I7TA 4I7JA 2YBMA 4ARQB 1C7PA 168LA 1C6EA 1YKXX 2BLYA 4XADA 5DL9A 1DI3A 6LYTA 2F47A 2Z18A 198LA 5HMVA 2BQCA 1QUHA 3CT5A 4WG7A 4KL7A 2XTHA 1NDMC 4P2EA 3AGGG 5AMYA 3NY9A 4LT2A 4WLXA 1LTMA 5DN5A 3TMXA 4W54A 3W3EA 2DQEY 1CV1A 1QT7A 4GN5C 5KXYA 1QIOA 1LJ4A 2RBRA 111LA 3PDSA 2BQLA 3DN4A 260LA 1IP5A 140LA 4I7MA 3SBBC 229LA 1JHLA 1OUDA 1REXA 2OU0X 5K7OA 1L27A 5LYZA 1HEOA 5LVIA 4H94A 1L61A 4LDLA 1L05A 1GF9A 3EBAB 177LA 1LYIA 262LA 3G3WA 1L74A 2RBOA 2B5ZA 2RSCA 1L13A 2A4TA 1RE2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4H8X A;  4N1C C;  5KJ9 A;  1ZMY L;  4QDN A;  2Z19 A;  4II8 A;  3RU5 A;  4H9A A;  4H8Z A;  5LIO A;  1LHI A;  1GBW A;  9LYZ A;  5LXW A;  1VFB C;  4LGK A;  3WPJ A;  3AYQ A;  4H9I A;  3FI7 A;  5LVK A;  1GFR A;  4AGA A;  1WQN A;  1CJ7 A;  1LJH A;  3EXD A;  4XJB A;  4FDY A;  4PHI A;  1JPO A;  1LZC A;  3RNX A;  1GB8 A;  5LIN A;  4GLA A;  4Z98 A;  1GE1 A;  1LZA A;  207L A;  3A93 A;  4YEN A;  5KXM A;  4XJI A;  1TDY A;  1UC0 A;  4NGZ A;  4GCF A;  4M4O A;  1G7J C;  1HFY A;  5I4X A;  4BS7 A;  1YRO A;  1GFV A;  2CDS A;  1LHM A;  3B0I A;  1QSW A;  2Y8P A;  1O23 A;  1D0L A;  1LOZ A;  3AZ5 A;  1GXX A;  1GB5 A;  1IP7 A;  4LFP A;  4NSI A;  4WOA A;  4Z46 A;  4IJ4 A;  1CKG A;  1FLQ A;  1W6Z A;  1I56 A;  4DD3 A;  1GE2 A;  1OUH A;  1Z55 A;  1B7L A;  3W6F A;  1HEM A;  3HBE X;  2FBD A;  4NSG A;  4GCB A;  3P68 A;  4NSJ A;  1B2K A;  4WM6 A;  1NHE A;  1C43 A;  2EIZ C;  153L A;  1LSP A;  4UWN A;  4NHQ A;  5FEK A;  1G7M C;  4WL7 A;  5APD A;  4DDC A;  5T3F A;  1AM7 A;  3ULR A;  4N8Z A;  4LYO A;  2MEE A;  3D3D A;  4LT3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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