4DQ7A

Structural investigation of bacteriophage phi6 lysin (v207f mutant)
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
173
structure length
168
Chain Sequence
LQALLPKNSRVRFTTAEVDSAVARISQKIGVPASYYQFLIPIENFVVAGGFETTVSGSFRGLGQFNRQTWDGLRRLGRNLPAFEEGSAQLNASLYAIGFLYLENKRAYEASFKGRVFTHEIAYLYHNQGAPAAEQYLTSGRLVYPKQSEAAVAAFAAARNQHVKESWA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Selective pressure causes an RNA virus to trade reproductive fitness for increased structural and thermal stability of a viral enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Membrane protein Phi6 P5
molecule tags Hydrolase
source organism Pseudomonas phage phi6
total genus 56
structure length 168
sequence length 173
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-02-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dq7A00
4DQJA 4DQ7A 4DQ5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L33A 2Q0MX 1CV4A 1C08C 1T6VL 1D0MA 1LSDA 2LCBA 4H8YA 240LA 5HMJA 5LVGA 4NEBA 1L68A 2NWDX 1JSFA 1LZ4A 3TXKA 1XEJA 3TXDA 4I7NA 4LYMA 2OEAX 4NSHA 1ALCA 1C6TA 3W6DA 1L79A 1LAAA 3WVYA 1C6AA 2FYDA 4I7SA 3LZMA 4LT0A 150LA 1LYEA 102LA 1PS5A 4HV1A 1ZWNA 3J4GA 3TXFA 2XQOA 4H91A 4YEOA 4KXIA 1XGRC 5IDDA 1JJ0A 1L54A 166LA 4DD7A 3C82A 3CT1A 4EMNA 1LCNA 3KAMA 104LA 1UIFA 1C6EA 1GFHA 1EL1A 2RSCA 1L32A 3QY4A 2YBHA 4G49A 4WLXA 1YKXX 1LMCA 256LA 207LA 1B7QA 1HERA 1C60A 1HFYA 4I7JA 185LA 1LZAA 1L97A 3C7YA 1UIGA 3C80A 4N5RA 1AT5A 4HJYA 1IVMA 237LA 1LWKA 1L15A 1BWIA 3M18B 1OUDA 1P37A 2Z19A 2F47A 1XGTC 4H1PA 1LHIA 1LZGA 4DQ7A 5B05A 2OE7X 3CDTA 1JIYA 3HTFA 1XEPA 1LYIA 3HH4A 3WW6A 177LA 2BQIA 4DD3A 2LZMA 5LZMA 3LYTA 1LHMA 4I7LA 1L67A 119LA 3BKVA 4LDLA 2AUBA 1L24A 1QS5A 2HEBA 5E9RA 1VDSA 1C6KA 1IWXA 1L98A 2YBJA 221LA 1CU6A 4ARPA 135LA 1LOZA 2NTHA 1G7MC 2OE4X 3M3UA 1KY1A 1IWZA 1I20A 1G0QA 2ANXA 4B4JA 1HHLA 1L23A 3AZ7A 1NWGA 2MEGA 3C81A 4WL7A 3SN6R 4HJZA 1UIDA 4DD9A 4YX7C 158LA 1L08A 4LYTA 1P2LA 4MSTA 4LT2A 3OE6A 114LA 1WQOA 113LA 1D9WA 1AZFA 1DKKA 2D6BA 3J6KA 3WPJA 5KXLA 1JHLA 229LA 4WM3A 2G4QA 210LA 1QDRA 1VDTA 2B7XA 4W55A 191LA 224LA 4AXTA 1ZYTA 1T97A 4NGKA 1GE0A 1B9OA 2YBNA 4NY5A 1Z55A 1D0LA 4GCEA 4GLAA 4XJIA 1SLYA 5LVJA 4ZPUA 133LA 1LYFA 2LYZA 1FKVA 2XJWA 1CKFA 1GE4A 3B72A 1QT3A 2HU1A 5HLLA 4CFPA 1C6GA 4I7QA 3QAKA 238LA 2OU9A 215LA 4L41A 162LA 4WG7A 3DMXA 241LA 3AYQA 3DN3A 1QQYA 1LSEA 1L10A 1OYUA 1LMQA 1UICA 1HEWA 3RT5X 2EQLA 1L35A 1UC0A 2B73A 1DPWA 3CSZA 155LA 1TLAA 5II3A 5FHWA 4EKPA 3TMUA 1P2RA 261LA 5I4YA 4DYGA 5ILFA 2RH1A 4NSIA 3WULA 1ZV5L 3CB7A 4YEMA 4LFPA 2B75A 3A96A 4I7OA 4ANRA 1CV5A 4TSBA 1L56A 1LMTA 1QTHA 1QT6A 1TEWA 1P2CC 3EMSA 3PBLA 1LGXA 4NG8A 3RZ4A 1QTBA 209LA 1L51A 1L58A 4H92A 3SB9A 1IOQA 1OVJA 3A90A 4XJDA 1IC7Y 1JPOA 3G3AB 3DNAA 1HELA 141LA 3AGIA 4NGJA 5KXWA 3AB6A 2OTZX 2HEDA 1UIHA 5F9XA 4D9ZA 2Z37A 1IOTA 1LTMA 1FLYA 3E3DA 125LA 2HUBA 2L78A 1L60A 2BQJA 1G7IC 4NIJA 1OUAA 2QARC 1DI4A 1WTMA 3WPLA 1YAMA 3WU8A 5E4PA 225LA 4PHIA 2YDGA 1D3JA 5LAGA 1JKDA 1BB5A 1IP4A 3HUQA 4E97A 4NWHA 3GUPA 1NHBA 2YBLA 1L00A 3QNGA 1KIQC 4NGYA 1LJGA 5L9JA 1GE3A 1JKBA 1INUA 1BB6A 1C6NA 1L96A 4LYCA 1C46A 1LZ8A 1W6ZA 1LI3A 1QDTA 1QUDA 2BQKA 4ET8A 5LYMA 1HEMA 4HV2A 1L53A 1JSEA 3TXIA 4EXMA 1I1ZA 243LA 1E8LA 2IGCA 1L01A 1RFPA 2RBRA 1FLQA 2RAZX 137LA 1BHZA 244LA 4KT3A 1DKJA 1KIPC 4I7KA 4OWCA 2BPUA 1B7OA 4H9IA 3IJVA 1G0MA 1OUIA 2RB0X 3RU5A 1BB4A 2A7DA 4NFVA 173LA 1GFGA 1L34A 3WXUA 1C6HA 1B7LA 1G0KA 1CKDA 1QUHA 2IFFY 4LT1A 2CUUA 1G06A 4G4CA 1LZ5A 1HEOA 1UBZA 1L59A 1L45A 5KXZA 4GCCA 3G3XA 5C6IA 2F4AA 3JR6A 1HMLA 5LVIA 1GFTA 260LA 1FLWA 1L91A 197LA 3B0KA 1PQKA 1LZYA 4OOTA 144LA 2O79A 4IJ4A 1JTOL 4ET9A 1A2YC 5KXSA 3A93A 1HFZA 2HTXA 3TXEA 2FYCA 4LYBA 152LA 5F16A 1CV1A 1AKIA 1P6YA 252LA 2RBSA 3WPKA 2LYMA 2HUKA 3T36A 1B5UA 5KKIA 4FJRA 4DD0A 134LA 1P64A 3DMVA 1LMAA 2H9KA 1IP7A 2CGIA 3HH5A 1BVXA 128LA 4LFXA 3A34A 4DD1A 4H9CA 1OUBA 1YROA 1TDYA 1HNLA 3A67Y 127LA 2Y8PA 1QSAA 4BAFA 1QUTA 5KXTA 5I5QA 183LA 1LHKA 213LA 1J1PY 1XGPC 1LKSA 2ZYPA 1L26A 3WU7A 1WVUA 1DYGA 4B1AA 4PK0A 1L48A 4WL6A 2DQDY 4OO9A 2N5ZA 1G0PA 4H8XA 1ZVYB 4LT3A 1IR7A 1G1WA 1PQJA 4H9BA 2BQGA 3LN2A 2RB1X 4HTNA 206LA 4DDBA 1OVKA 1LYJA 1CU3A 1REXA 2D4IA 1SWYA 3A8ZA 1BQLY 4QY9A 3HDEA 1C66A 1NMMA 3GUMA 3ULRA 1LJJA 5K7OA 3WUMA 1LZRA 5FELA 1GHLA 5B1FA 3CT5A 2LZ2A 228LA 1B0DA 3DKEX 2ZQ4A 1OUEA 1IP2A 5ILCA 4WG1A 1L0JA 1B5WA 3B0OA 4EOFA 234LA 4EKSA 1G0LA 3TXJA 2B6WA 149LA 3F6ZA 1LJ4A 1L20A 151LA 157LA 4Z98A 1GFEA 3L2XA 1AT6A 1IC5Y 1GXXA 5LA8A 2NTGA 1IP5A 1L06A 4N9RA 5KXYA 5KXNA 1OUHA 1L12A 165LA 3P68A 4TTDA 1B7PA 2MEEA 1B5XA 5F9UA 1SSWA 1L61A 4BS7A 1T8FA 2IHLA 1QSWA 2VB1A 1XJTA 3HUAA 5APCA 4CFOA 2D4KA 4H8ZA 1VDQA 4OW1A 1WQQA 1CU5A 1CUPA 4W59A 248LA 4C3WA 4AQNA 1GB5A 3AZ5A 3FE0A 1T8AA 4YOPA 1KY0A 1GDWA 1NKHA 3SB7A 4H93A 1MELL 2MEHA 1A4VA 5C6JA 4B49A 2B72A 1SWZA 172LA 1DXJA 1LI2A 6LZMA 4WM4A 4DKLA 5B06A 1L62A 4RW1A 1CJ7A 4ARMA 3DN6A 1QUSA 1BWHA 5I4WA 3FA0A 3W6CA 1GXV2 4Z3MA 3D3DA 4W56A 1IP1A 1B7MA 189LA 2ZIKA 3WL2A 3CDQA 5I54A 4H9HA 2F2QA 4GN4A 1DI3A 5APFA 115LA 1LJFA 167LA 4WLDA 2DQAA 2B6YA 5B1GA 5KJ9A 2F2NA 4IATA 1DQJC 3HH6A 3GUIA 4OWEA 3T6UA 2D4JA 1GBOA 3HBEX 1JTPL 3WVXA 4HTKA 1L07A 3A95A 1XEKA 1HENA 1OV5A 1D3FA 2W1LA 4PRQA 1L28A 1L43A 4S0WA 1C69A 3ZVQA 2HUMA 5M1YA 1LSNA 1HEPA 1D9UA 233LA 2QB0B 1B7RA 5B59A 3W6BA 1LZ1A 1B6IA 3EXDA 3HTGA 1REMA 2RB2X 1QSBA 4ML7A 1LYDA 4GBRB 1L75A 1L92A 1QTDA 3HT8A 1IWTA 5LAFA 142LA 4G4HA 1GF8A 3AZ4A 1KXXA 8LYZA 187LA 5DM9A 3LHMA 1LZ6A 1I56A 1C64A 1TBYA 4KL7A 5LYTA 3C8QA 4W51A 245LA 4H9FA 3A6CY 3F9LA 2B6TA 2YVBA 3CSRA 2RBQA 3NY8A 1QTVA 123LA 2HEFA 1TCYA 1OUJA 3CDRA 1LZCA 4RW2A 1B2KA 227LA 4UWUA 1JUGA 3N9AA 4WMGA 5L3HA 4GN5C 5FCPA 3WXTA 1J1XY 4PJZA 3NYAA 3WUNA 1C10A 1CNSA 3HT7A 1LHLA 1W08A 3QE8A 4GN3A 1GD6A 1C63A 132LA 1C6JA 3A92A 4TUNA 4W57A 4CJ2A 2BLXA 2MECA 3HU9A 1GFJA 1L04A 1D6QA 3LYMA 3A91A 5C6LA 3SBAA 3CDOA 1QTKA 1V7TA 164LA 1L64A 1CX7A 2RBPA 129LA 1C67A 2MEIA 1UIAA 5HMVA 1C6MA 1JWRA 4LZTA 1QTCA 4NHPA 4IAPA 1EQEA 2G4PA 2HECA 199LA 2B74A 4B4EA 174LA 2XBSA 1GE2A 2CJLA 4ARMB 4YENA 2YBMA 1CKHA 2MEAA 2BQCA 2O7AA 2DQCY 1L05A 251LA 4I8SA 1L65A 1GBXA 1C6CA 5FSTA 112LA 1L30A 1G7JC 147LA 1UA6Y 1EPYA 1LYSA 1G7LC 4NGLA 3SB6A 2A4TA 5F81A 120LA 1LJHA 1LHJA 1LSZA 3GUNA 1NBYC 1LZBA 1L27A 5DN4A 4WO9A 1V7SA 4N0JA 1F10A 3DN2A 1L36A 1NHEA 3DN0A 1T8GA 3OK0A 2OTYX 5LIOA 1BB7A 3EBAB 3P64A 4B4IA 3P65A 3D9AC 4OWAA 1LMOA 3ZVQB 1LSPA 2FBDA 1HFXA 4H90A 148LE 1GFVA 3B6LA 4X3BA 1DYDA 1L99A 1L16A 4ETAA 212LA 4Z41A 4DT3A 5HNCA 1LSFA 4H9AA 4NSJA 1L74A 230LA 3HWLA 5APDA 3C8RA 1HSXA 1JITA 4GCDA 1CUQA 2Z2FA 1N4FA 4J1AA 3HDFA 1P36A 1L71A 1YIKA 4OWBA 2H5ZA 1CU0A 3EMLA 118LA 2LYOA 1LZTA 1LYYA 5KKJA 4HSFA 3GUKA 5APEA 1LZEA 4PJ2C 2G4NA 1FN5A 1GF4A 156LA 1IR8A 1C62A 2I26L 182LA 110LA 1L0KA 5EBHA 4H94A 145LA 208LA 1L14A 1IY3A 2F4GA 1C61A 139LA 1JTTL 2DQHY 9LYZA 1L57A 1VEDA 3VWOA 2HULA 1GF6A 5LXWA 161LA 4I7MA 1L88A 1IWYA 1IOCA 4U3XB 2W1XA 218LA 1QSQA 1BWJA 1NQIA 1HMKA 1QT5A 3AGGG 2OU0X 5KY1A 4NGOA 1PQIA 4ZFPA 1GWDA 2ANVA 4NHIA 4ARQA 1CJ8A 3LYZA 1GAZA 1UCOA 1XJUA 4I7RA 2Z18A 1LI6A 1CV6A 198LA 1LGWA 2OE9X 4W94A 195LA 1KNIA 1LW9A 1CX6A 3OJPA 4QGZA 1LWGA 1WQPA 2BQDA 1C65A 5IHGA 1OP9B 1GEVA 1CTWA 1QIOA 1QT4A 1WTNA 1B5YA 3V2YA 4K5YA 159LA 2LC9A 1SX2A 2DQFC 2C8OA 3FI7A 3SP3A 3SBBC 3HTBA 2ZWBA 1L84A 5I4XA 3GULA 2I6ZA 1JKAA 2Q9EA 1LZNA 4DDAA 3GXRA 4Z46A 3LZ2A 3N9EA 1GF3A 4YXCA 1CJ6A 1FBIX 4AGAA 1OWYA 1L17A 5J7CA 1UIEA 1C6BA 1DYCA 3HTDA 2C8PA 216LA 1MLCE 4E3UA 1L95A 2CDSA 4LYZA 4R0FA 4NGVA 1IR9A 1OUFA 1L55A 1L22A 3A6BY 3A3QA 1XSFA 3W6EA 1OV7A 1L89A 1GF0A 1GB6A 2F32A 5KXOA 3NY9A 1HSWA 3RW8A 2BQBA 3FADA 1TAYA 1YL0X 131LA 1PQOA 2B70A 1GFKA 1GDXA 2DQGY 2MEBA 4FDYA 4G4BA 170LA 4WM5A 1DYFA 4WLYA 5D5CA 1GF9A 3CT0A 257LA 5LYZA 1L13A 1JISA 4I7TA 1UACY 1L66A 3ZEKA 1CKCA 239LA 2D91A 4CGEA 1RJCB 1C6FA 2Z39A 3DMZA 1KXWA 4ETBA 4NWEA 1T6HA 1JJ1A 1O23A 5DL9A 246LA 3DN4A 1L76A 1GBZA 1OWZA 211LA 4XJFA 2EKSC 5AMYA 5I14A 4LDOA 1JJ3A 2MEFA 5DN5A 4NG1A 1L93A 4M6DA 1L80A 1YAPA 4HP0A 186LA 249LA 154LA 205LA 3BKHA 2A7FA 5B07A 2DKVA 1P3NA 3AGHA 1WVVA 1L11A 3A94A 4UWNA 4EPFA 1EQ5A 5A3EA 4ARQB 4J1BA 1D0KA 4BAPA 4KPMA 4RLMA 1CU2A 1J1OY 1P46A 1VATA 2ZNXY 4GLVA 2ZNWY 3OE9A 1UIBA 1L50A 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 4DQJ A;  4DQ7 A;  4DQ5 A; 
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1L33 A;  2Q0M X;  1CV4 A;  1C08 C;  1T6V L;  1D0M A;  1LSD A;  2LCB A;  4H8Y A;  240L A;  5HMJ A;  5LVG A;  4NEB A;  1L68 A;  2NWD X;  1JSF A;  1LZ4 A;  3TXK A;  1XEJ A;  3TXD A;  4I7N A;  4LYM A;  2OEA X;  4NSH A;  1ALC A;  1C6T A;  3W6D A;  1L79 A;  1LAA A;  3WVY A;  1C6A A;  2FYD A;  4I7S A;  3LZM A;  4LT0 A;  150L A;  1LYE A;  102L A;  1PS5 A;  4HV1 A;  1ZWN A;  3J4G A;  3TXF A;  2XQO A;  4H91 A;  4YEO A;  4KXI A;  1XGR C;  5IDD A;  1JJ0 A;  1L54 A;  166L A;  4DD7 A;  3C82 A;  3CT1 A;  4EMN A;  1LCN A;  3KAM A;  104L A;  1UIF A;  1C6E A;  1GFH A;  1EL1 A;  2RSC A;  1L32 A;  3QY4 A;  2YBH A;  4G49 A;  4WLX A;  1YKX X;  1LMC A;  256L A;  207L A;  1B7Q A;  1HER A;  1C60 A;  1HFY A;  4I7J A;  185L A;  1LZA A;  1L97 A;  3C7Y A;  1UIG A;  3C80 A;  4N5R A;  1AT5 A;  4HJY A;  1IVM A;  237L A;  1LWK A;  1L15 A;  1BWI A;  3M18 B;  1OUD A;  1P37 A;  2Z19 A;  2F47 A;  1XGT C;  4H1P A;  1LHI A;  1LZG A;  4DQ7 A;  5B05 A;  2OE7 X;  3CDT A;  1JIY A;  3HTF A;  1XEP A;  1LYI A;  3HH4 A;  3WW6 A;  177L A; 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