4G49A

Room temperature x-ray diffraction of cisplatin binding to hewl in aqueous media after 15 months of crystal storage
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Room-temperature X-ray diffraction studies of cisplatin and carboplatin binding to His15 of HEWL after prolonged chemical exposure.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4g49A00
1QIOA 5HNLA 4LT1A 3A95A 1LMPA 2X0AA 4LT3A 4NY5A 4DD2A 2Z12A 1FKVA 4LYZA 1GB0A 1A2YC 1OUHA 2ZYPA 3IJUA 2D91A 4NGWA 1DXJA 1XEJA 4OWBA 1JTOL 4XADA 1LYOA 2BQAA 4C3WA 4N1EI 4I0CA 3ZVQB 3B72A 1JIYA 4HSFA 1LMCA 5M1YA 1KXXA 1J1OY 3AZ5A 3WH1A 1XGUC 4H1PA 4Z3MA 4ET9A 1GF9A 3A3QA 1IEEA 135LA 4Z41A 1XGQC 1LMQA 1GBZA 1GBOA 1IY3A 1UIEA 1UICA 1I56A 4HJVA 1IP5A 4NGJA 5IHGA 5B07A 2YBLA 4XJGA 3WVYA 4H94A 1BB5A 5FELA 1LHMA 1WQQA 4NG8A 3W6CA 3WU9A 134LA 2BQOA 1GE2A 3TMXA 1YROA 5KXSA 4BADA 3EBAB 1HEMA 1GE1A 1LHJA 4NFVA 5KXZA 4HJZA 4BAFA 1NHEA 4NSIA 1JJ0A 1GFTA 1LSAA 4WLTA 4ANRA 1VDSA 1NBYC 3AZ7A 3WXUA 4MR1A 5K7OA 1LZAA 4NWEA 1JKCA 1LSDA 2LYMA 4NHPA 1RFPA 2EKSC 2H5ZA 1BGIA 1JITA 1WQOA 1TEWA 4W94A 1LMOA 1LZ5A 4R6CA 1JUGA 4HJYA 1IC5Y 1JSFA 1C46A 1XGRC 4A7DA 4YEMA 1INUA 3A34A 1HERA 2BLXA 1J1PY 1A4VA 1LSEA 4ETAA 1GF5A 4XN6A 4DDCA 5B1GA 2HEFA 1IP3A 1V7TA 4TTDA 3BKHA 3TMUA 5D5FA 4CJ2A 1GFHA 3AGGG 4OOTA 1GEVA 1HELA 1JEFA 1FLWA 1UIFA 1YQVY 4NHQA 1UIHA 5KXNA 1LJNA 4B1AA 1LHIA 1BB7A 3CQLA 1VFBC 2DQEY 4J7VA 1WQMA 1KXYA 1LJFA 2F4GA 2CWIA 2XJWA 5LYMA 1UIDA 1LYSA 1AZFA 1B7SA 1LJEA 3WVXA 1G7JC 1LZBA 3M3UA 4H92A 4J1AA 1NKHA 2C8OA 2H9JA 1CKCA 5FEKA 1LKRA 5APEA 1DKJA 4PPOA 5LINA 1IVMA 1BWHA 5T3FA 1CKFA 4PRUA 2ZNXY 3HBEX 4M6DA 5KKIA 1UA6Y 5FSTA 1GXXA 3B0IA 4WM6A 1IWYA 1BB4A 2YBHA 5APDA 5C6LA 4H90A 1B5ZA 3LN2A 5KXKA 4GN5C 1JPOA 2NWDX 3CSRA 1GFVA 3EXDA 4Z98A 1B7RA 5KXWA 1B7NA 1JHLA 2MEDA 2MEHA 1LSFA 4WO9A 1FBIX 3VWOA 1CKHA 1LCNA 1NF5A 2ZQ4A 1ZMYL 3HFMY 2XBSA 4NGKA 4NGIA 4NGYA 4UWVA 1QDTA 3AW6A 1JTPL 1VDQA 1GB3A 4IATA 1YAPA 3WU8A 4ET8A 2XTHA 3A6CY 4G49A 1GD6A 5KXYA 1OUBA 1LJ4A 3AJNA 4N0JA 4XJFA 5LIOA 2LZTA 3ATOA 1LMAA 3BKVA 3TXGA 3FI7A 1LZSA 3ZVQA 1WQPA 1G7HC 2HEEA 3TMWA 4B0DA 3EO5A 1GWDA 2YBNA 1QSAA 5F9XA 1XEKA 1IP7A 1OUJA 4WO6A 4TUNA 1LSZA 3P66A 1YAMA 5C6IA 1FKQA 4ZFPA 1B7MA 3KAMA 4MCKA 4NWHA 4PHIA 1IR7A 5HQ1A 1LSCA 1LSGA 1W08A 4PRQA 4RW2A 1EQEA 1GB9A 1GFGA 1CJ6A 1I1ZA 4NIJA 4PGJB 4WG7A 5DLAA 5DN4A 5LA8A 5HMVA 3WPKA 4ZEEA 2MEAA 5L3HA 3D3DA 1C43A 1HMLA 1TCYA 1HFYA 5KJ9A 4NEBA 4EMNA 5KXLA 5F9UA 4LYTA 5KXTA 1LZ8A 1I20A 4OWEA 1N4FA 4C5FA 2W1YA 4CFPA 1JKDA 3W6BA 1IO5A 1CNSA 3OK0A 4J1BA 3A96A 5E9RA 3WMKA 1OP9B 193LA 1SLYA 1QSWA 2BQGA 3P65A 4DWXA 4ETEA 1LZRA 1BHZA 4GCFA 2BQHA 4TX7A 4MSTA 5IDDA 1QQYA 2YVBA 3CB7A 1DI3A 1LAAA 2RSCA 4GLAA 3LZTA 1WVVA 1NWGA 1GB8A 2BAAA 3ZEKA 1LJJA 4EOFA 3WW5A 2BQFA 4DD1A 1IWTA 1VDTA 3J4GA 1JWRA 5F81A 2DQFC 3W6AA 1REMA 5I4YA 3TXDA 1XGTC 2EIZC 1BWIA 1EL1A 1NBZC 132LA 1NMMA 1OQMA 3GXKA 4RW1A 3RNXA 3WU7A 2YBMA 1BB3A 1DI5A 4L41A 1FLQA 1RE2A 5JENB 4G4CA 1B2KA 3AB6A 4XYYA 1BVXA 2Z19A 1GBYA 1KIQC 1GDWA 5APCA 3WXTA 1GXV2 2YDGA 3FE0A 2BQLA 3WPLA 1UIBA 4NHSA 1GAYA 1ZV5L 2BQBA 1GBWA 1BB6A 2CDSA 1LZ4A 1IX0A 1DPWA 1T3PA 1UC0A 2HTXA 1JTTL 1H6MA 1HSXA 5F16A 4BAPA 2PC2A 3N9EA 4OW1A 3WUMA 1IP1A 1HFXA 2ZYCA 1LMNA 1C45A 1E8LA 2LHMA 3ULRA 1DKKA 1GEZA 1OUCA 1WTMA 1UBZA 4N8ZA 4IJ4A 4YM8A 2FYCA 207LA 3AZ4A 4HP0A 154LA 1IOCA 2Z38A 4H9EA 1IP4A 2HU1A 133LA 1LHLA 1YKYX 2BPUA 2D6BA 1TBYA 4KXIA 4UWNA 1IY4A 1YL0X 4HTKA 3TXJA 1HC0A 1B5VA 1GF8A 4LZTA 3TXEA 8LYZA 4ETDA 4CGEA 5A3EA 1GF7A 2W1MA 2DQGY 3AGIA 3HBDA 5LVIA 3P4ZA 2Z2EA 1HEOA 2ZQ3A 1G7LC 2ZILA 3LHMA 4NGOA 4DD0A 1LTMA 5LXWA 1GDXA 1NDGC 3MGWA 4UWUA 4WM5A 1REXA 3W6EA 1QTEA 4DD3A 2LYZA 4HPIA 2DBTA 1GB6A 2D4KA 2F30A 4GCCA 1F10A 4NSGA 4PJ2C 1HHLA 1YILA 1YKZX 1NQIA 1LSPA 2C8PA 1OUAA 4LT2A 2DQHY 4WLYA 1GF0A 5LYZA 3QE8A 1QTKA 1UCOA 1HMKA 4KT3A 4LYMA 4H8YA 4TSBA 1LZ1A 1LJGA 1H87A 1KIRC 4LGKA 1B9OA 2G4NA 1UIAA 1LOZA 1FDLY 2DQAA 2FYDA 2HEAA 1D0LA 4DYGA 4B49A 5HLLA 1D0MA 1BWJA 2BQDA 4H91A 5KXXA 1G7MC 5I4XA 208LA 5II3A 1LHHA 3B0KA 3P68A 4ETCA 1WVUA 2D4JA 4WOAA 4OWCA 3HBHA 3TMVA 5KXMA 2GV0A 2YBJA 3F6ZA 1IWZA 5ILFA 4RLMA 4M4OA 1JKAA 3B0OA 1JJ3A 2DQDY 5EBHA 4NGVA 4I8SA 1FLUA 1LSYA 1TDYA 1WQRA 1MELL 1AT5A 4H8XA 5E4PA 4XJHA 3T6UA 1REZA 2G4PA 1HEPA 4DC4A 4CHXA 5HNCA 4XJDA 4LFXA 1F0WA 4KPMA 3A93A 3EMSA 5KXPA 4D9ZA 3A94A 4DT3A 1IIZA 4DDAA 5L9JA 2MEBA 4G4HA 4H93A 4HV1A 4LFPA 1GB7A 3B6LA 4LT0A 2B5ZA 3AGHA 3AYQA 4QEQA 5KXRA 4KL7A 1LZYA 4H9HA 2MEEA 2ZWBA 5AMYA 2LYOA 4OOOA 1IC4Y 1IR8A 3CSQA 2Z2FA 4NGLA 4E3UA 1IOTA 4NSHA 1YAOA 5I4WA 2Q0MX 1GFUA 4WLDA 2YSSC 1LKSA 1LZ9A 1GFEA 2G4QA 4G9SA 3CSZA 5B1FA 3RW8A 1HNLA 1QUSA 1IWWA 2CJLA 5FCPA 2CGIA 4YENA 4H9IA 4B4JA 2F4AA 3SP3A 2F2NA 4II8A 4OWAA 4XJIA 4N1CC 1DPXA 3N9CA 3AZ6A 1HEWA 5J7CA 1GF4A 1RJCB 5HMJA 9LYZA 1GB5A 2DKVA 2FBBA 1IP6A 1HFZA 4ML7A 1W6ZA 5FHWA 2DQIY 4H8ZA 4HV2A 1YKXX 1NDMC 2IFFY 4HTNA 4OWHA 3RT5X 3G3BB 4RDSA 3TXHA 4R0FA 3TXIA 1UIGA 1IORA 2A7DA 3CT5A 2IHLA 1IWXA 5D5CA 5DN5A 2AUBA 4GCDA 1ZVHL 2BLYA 3E3DA 1QDRA 3WUNA 2FBDA 4WL7A 3A92A 1LPIA 1AKIA 1GF6A 3AW7A 1B5WA 4LYOA 4FJRA 1OUFA 4ZIXA 1FN5A 5B06A 1MLCE 4WM3A 6LYZA 2N5ZA 4W96A 3WYHA 3LYMA 1BVKC 1YIKA 2BQEA 2W1LA 2YBIA 1V7SA 1HF4A 2DQCY 4Z46A 4GN4A 5I53A 2HECA 4GCEA 3A6BY 1B7OA 2BQMA 1OUGA 1LZNA 1SQ2L 1C08C 1GF3A 1QUTA 1CJ8A 4QY9A 4H9CA 3LYZA 1IWUA 1LSMA 4DDBA 1G7IC 4H9FA 4NG1A 1P2CC 1REYA 3W6DA 5KXOA 2BQIA 4CFOA 3IWRA 1LZEA 1TAYA 3N9AA 2MEIA 2I25L 1F6RA 1O23A 2LZ2A 1DZBX 1CJ9A 1J1XY 5APFA 1GB2A 2BQNA 1OUIA 1GAZA 4N5RA 4LYBA 3M18B 3WL2A 3RZ4A 5LVKA 4DD9A 4IASA 3WULA 1EQ4A 3A3RX 4H9BA 1AT6A 4HPEA 4NSJA 4QDNA 5F14A 1JISA 1VATA 5B05A 4YEOA 2I6ZA 4WM1A 1C7PA 1AM7A 1HEQA 4NGZA 5I54A 1VAUA 6LYTA 4U3XB 1VEDA 2WARA 5I5QA 1F6SA 1HSWA 1IP2A 3D9AC 4AGAA 1UACY 5DL9A 4WM4A 1XFPL 1XEIA 1B7LA 3GXRA 4FDYA 2BQCA 1IC7Y 3CT0A 1LZCA 2H9KA 1D6QA 4J0LA 1LMTA 4TWSA 2Z18A 1DI4A 4WLXA 1D9UA 1GE3A 3CT1A 4WMGA 3TXBA 4GCBA 3T36A 1RCMA 2I26L 5LVJA 194LA 2ZNWY 1IOQA 3OJPA 1JKBA 1GBXA 1Z55A 3A8ZA 3TXFA 4BS7A 5LVHA 5LAFA 1IWVA 1D6PA 1GFKA 1GFRA 1GHLA 4G4BA 3K3TA 1B7PA 2EQLA 3WPJA 2Z39A 3P64A 1T6VL 3QNGA 2HU3A 1XSFA 1PS5A 3IJVA 4B4IA 4GLVA 1CJ7A 4WL6A 3A91A 2MEFA 2BQKA 2BQJA 3ATNA 1YL1X 1C10A 3W3EA 4XENA 4NHTA 1BQLY 4AXTA 5KY1A 4GN3A 1LSNA 1FLYA 1WTNA 3WW6A 1LZTA 3LYTA 4XJBA 1LJHA 1B7QA 3J6KA 5LAGA 1LZGA 4YOPA 1B5UA 1YANA 5ILCA 1GPQC 2VB1A 1LYZA 3WUAA 1LJKA 1HENA 2Z37A 2EPEA 4WG1A 5KKJA 2D4IA 1GE4A 1IR9A 1D0KA 5C6JA 2MEGA 1VDPA 4O34A 3TXKA 1LHKA 1GE0A 1LYYA 2MECA 3A67Y 1LJIA 4TSCA 5B59A 2A7FA 3W6FA 3A90A 4B4EA 1PZYA 4ETBA 5DM9A 1ALCA 1CKGA 1B5XA 1KIPC 1DQJC 1B5YA 2HEBA 7LYZA 1WQNA 3G3AB 3QY4A 1LSBA 2XBRA 4LYCA 2DQJY 4N9RA 5IELA 153LA 1YAQA 5A3ZA 1GFJA 2ZIJA 1OUDA 1EQ5A 1UUZC 4HTQA 5FDJA 5LA5A 1LJ3A 1KXWA 1JJ1A 4NHIA 2W1XA 4RLNA 4DD7A 1RI8B 4QGZA 1XGPC 2HUBA 1CKDA 2HEDA 4X3BA 2Y8PA 1GFAA 3LZ2A 5LYTA 5L3IA 4P2EA 1ZVYB 3LYOA 5LVGA 1IOSA 1GBSA 1OUEA 4H9AA 3RU5A 1JSEA 4WM2A 4YF2A 1LZ6A 1LZDA 2ZIKA 1B0DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HNLA 1L82A 4LT1A 1LMPA 2X0AA 4NY5A 3CDOA 4PJZA 2Z12A 1A2YC 4XADA 180LA 4N1EI 3ZVQB 1JIYA 1LMCA 5M1YA 1KXXA 3AZ5A 1L75A 145LA 1GBZA 1CUQA 1L87A 186LA 1KW7A 4H94A 104LA 1BB5A 3WU9A 199LA 262LA 3GUOA 1GE2A 1LYGA 1HEMA 206LA 3C7YA 5KXZA 4BAFA 1NHEA 4W54A 4ANRA 1GFTA 1VDSA 3WXUA 1LSDA 209LA 2B74A 1L56A 4R6CA 1JUGA 4HJYA 1INUA 4I7LA 1HERA 1L43A 2BLXA 1PQIA 4I7OA 1A4VA 1P3NA 1PQOA 3HWLA 3DN3A 1GFHA 143LA 167LA 4ARQA 2QARC 1UIHA 1LJNA 4B1AA 1L12A 165LA 1AZFA 1LJEA 1LZBA 1NKHA 2H9JA 1CKFA 1I6SA 2ZNXY 1CV3A 4WM6A 3B0IA 5FSTA 5APDA 5C6LA 4H90A 1B5ZA 1DYAA 1SX2A 1L93A 3LN2A 5KXKA 1JPOA 2NWDX 4Z98A 3VWOA 1FBIX 1NF5A 4ETBA 1ZMYL 1SWZA 4UWVA 1GB3A 4IATA 158LA 2XTHA 3A6CY 3D4SA 1C6CA 1LJ4A 5LIOA 6LZMA 2LZTA 3BKVA 3C81A 148LE 1WQPA 2HEEA 3G3WA 1L36A 1L47A 1L13A 1B7MA 3KAMA 1LSCA 1W08A 4PRQA 1GFGA 1P2RA 1CJ6A 5DN4A 2OU9A 2MEAA 4ARMB 2B73A 4NEBA 1PQMA 2OEAX 4LYTA 4C5FA 2W1YA 1JKDA 3W6BA 4DJHA 3A96A 1C6LA 3F8VA 1SLYA 159LA 3P65A 1BHZA 3VW7A 2YVBA 3LZTA 2BAAA 1LJJA 1LWKA 1VDTA 1JWRA 2DQFC 1REMA 5I4YA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1QIO A;  5HNL A;  4LT1 A;  3A95 A;  1LMP A;  2X0A A;  4LT3 A;  4NY5 A;  4DD2 A;  2Z12 A;  1FKV A;  4LYZ A;  1GB0 A;  1A2Y C;  1OUH A;  2ZYP A;  3IJU A;  2D91 A;  4NGW A;  1DXJ A;  1XEJ A;  4OWB A;  1JTO L;  4XAD A;  1LYO A;  2BQA A;  4C3W A;  4N1E I;  4I0C A;  3ZVQ B;  3B72 A;  1JIY A;  4HSF A;  1LMC A;  5M1Y A;  1KXX A;  1J1O Y;  3AZ5 A;  3WH1 A;  1XGU C;  4H1P A;  4Z3M A;  4ET9 A;  1GF9 A;  3A3Q A;  1IEE A;  135L A;  4Z41 A;  1XGQ C;  1LMQ A;  1GBZ A;  1GBO A;  1IY3 A;  1UIE A;  1UIC A;  1I56 A;  4HJV A;  1IP5 A;  4NGJ A;  5IHG A;  5B07 A;  2YBL A;  4XJG A;  3WVY A;  4H94 A;  1BB5 A;  5FEL A;  1LHM A;  1WQQ A;  4NG8 A;  3W6C A;  3WU9 A;  134L A;  2BQO A;  1GE2 A;  3TMX A;  1YRO A;  5KXS A;  4BAD A;  3EBA B;  1HEM A;  1GE1 A;  1LHJ A;  4NFV A;  5KXZ A;  4HJZ A;  4BAF A;  1NHE A;  4NSI A;  1JJ0 A;  1GFT A;  1LSA A;  4WLT A;  4ANR A;  1VDS A;  1NBY C;  3AZ7 A;  3WXU A;  4MR1 A;  5K7O A;  1LZA A;  4NWE A;  1JKC A;  1LSD A;  2LYM A;  4NHP A;  1RFP A;  2EKS C;  2H5Z A;  1BGI A;  1JIT A;  1WQO A; 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 1D6P A;  1GFK A;  1GFR A;  1GHL A;  4G4B A;  3K3T A;  1B7P A;  2EQL A;  3WPJ A;  2Z39 A;  3P64 A;  1T6V L;  3QNG A;  2HU3 A;  1XSF A;  1PS5 A;  3IJV A;  4B4I A;  4GLV A;  1CJ7 A;  4WL6 A;  3A91 A;  2MEF A;  2BQK A;  2BQJ A;  3ATN A;  1YL1 X;  1C10 A;  3W3E A;  4XEN A;  4NHT A;  1BQL Y;  4AXT A;  5KY1 A;  4GN3 A;  1LSN A;  1FLY A;  1WTN A;  3WW6 A;  1LZT A;  3LYT A;  4XJB A;  1LJH A;  1B7Q A;  3J6K A;  5LAG A;  1LZG A;  4YOP A;  1B5U A;  1YAN A;  5ILC A;  1GPQ C;  2VB1 A;  1LYZ A;  3WUA A;  1LJK A;  1HEN A;  2Z37 A;  2EPE A;  4WG1 A;  5KKJ A;  2D4I A;  1GE4 A;  1IR9 A;  1D0K A;  5C6J A;  2MEG A;  1VDP A;  4O34 A;  3TXK A;  1LHK A;  1GE0 A;  1LYY A;  2MEC A;  3A67 Y;  1LJI A;  4TSC A;  5B59 A;  2A7F A;  3W6F A;  3A90 A;  4B4E A;  1PZY A;  4ETB A;  5DM9 A;  1ALC A;  1CKG A;  1B5X A;  1KIP C;  1DQJ C;  1B5Y A;  2HEB A;  7LYZ A;  1WQN A;  3G3A B;  3QY4 A;  1LSB A;  2XBR A;  4LYC A;  2DQJ Y;  4N9R A;  5IEL A;  153L A;  1YAQ A;  5A3Z A;  1GFJ A;  2ZIJ A;  1OUD A;  1EQ5 A;  1UUZ C;  4HTQ A;  5FDJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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