4GBRB

N-terminal t4 lysozyme fusion facilitates crystallization of a g protein coupled receptor
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
NIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title N-terminal t4 lysozyme fusion facilitates crystallization of a g protein coupled receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-2 adrenergic receptor
molecule tags Membrane protein/hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 50
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4gbrB00
144LA 1L04A 114LA 1L28A 3G3VA 262LA 119LA 1DYEA 1L69A 2RAZX 1SWYA 4ARQA 1KW5A 1L59A 3LZMA 1L51A 180LA 1L43A 3CDVA 4OO9A 1L86A 1G1WA 1L15A 2F47A 140LA 1LGUA 1L68A 1G07A 3HDEA 1C6PA 4I7OA 1L82A 3FADA 1L00A 1L19A 3V2YA 1C6IA 2B74A 3NY9A 3PBLA 2LC9A 4W53A 222LA 4E97A 4EKPA 3C81A 1CV5A 231LA 113LA 2A4TA 219LA 2HUKA 1QUGA 256LA 151LA 2B7XA 1CU3A 1T97A 1DYGA 1L81A 1C60A 1L66A 4W58A 120LA 1L74A 1L77A 1OVJA 3DMZA 167LA 2F32A 3CDOA 2HULA 2B6XA 1LI3A 2ANXA 3HTBA 3FA0A 1L47A 1XEPA 1L08A 1DYBA 3HTFA 2RB1X 2Q9DA 3RUNA 1P46A 244LA 2OTZX 103LA 1L18A 1JQUA 3DN2A 1L93A 147LA 104LA 1D9WA 1QS9A 254LA 3C82A 2RBRA 4I7LA 4EKRA 4EPFA 1XJUA 1L53A 3G3WA 1L0JA 3HUKA 115LA 3C8SA 1L03A 1LYHA 4PJZA 3GUNA 165LA 1C65A 260LA 3SB8A 3RZEA 3OE9A 1OYUA 2B6TA 191LA 1KY0A 4AQNA 2QB0B 243LA 4LDOA 1CV4A 1QT4A 1LYFA 1QTHA 122LA 1L10A 1C6MA 1L88A 4IAPA 1L33A 1L12A 3L64A 4I7RA 185LA 145LA 1P5CA 4ARJA 4DAJA 1L50A 3VW7A 248LA 3HU8A 195LA 1L57A 199LA 1CU6A 1L87A 3UONA 183LA 1L38A 4W54A 1SSWA 5I14A 1KY1A 1L72A 1C6QA 2OU8A 1L94A 3DN3A 1G0MA 232LA 1D3FA 1L89A 1CU5A 1C6LA 2B73A 2NTHA 174LA 1QSQA 2QARC 3PDSA 3DMXA 200LA 1CX6A 1L14A 158LA 157LA 162LA 212LA 4I7SA 1D3MA 1OWYA 226LA 2B70A 3SBAA 3GUJA 1P36A 166LA 4W57A 1L79A 4DJHA 1SSYA 1L45A 3DN6A 192LA 1C6BA 1L07A 3HWLA 4LDEA 149LA 1QTCA 1G0LA 1QT8A 4YXCA 1T8FA 1L40A 221LA 143LA 1L92A 1L95A 3JR6A 182LA 1L01A 2RB0X 1SX7A 4I7TA 255LA 1L42A 2Q9EA 1L83A 1L98A 3DN8A 210LA 1QT3A 1I6SA 1L67A 189LA 1C6DA 118LA 2LZMA 1C6KA 3DMVA 1LYIA 3SB5A 1QUDA 205LA 137LA 1T6HA 1SX2A 2RBNA 1QTVA 213LA 1NHBA 2OE9X 3HU9A 1L22A 1L52A 3C80A 4I7NA 1C6AA 1L61A 4EPIA 1LPYA 3HH4A 3HH3A 3CDRA 4ZPUA 3HDFA 245LA 3C83A 1LYJA 1L75A 1OWZA 3HT9A 4EKQA 1L36A 2RBOA 1L58A 4W52A 1LYEA 4S0WA 1T8GA 3NY8A 2B75A 4I7JA 3SBBC 236LA 1D2YA 2HUMA 1XJTA 1QTZA 1ZYTA 175LA 1KW7A 1CV0A 2LCBA 1G06A 1CV3A 4W55A 1P64A 109LA 216LA 218LA 4W51A 187LA 1LYDA 1C6GA 2O7AA 108LA 1L48A 241LA 3C8QA 1C62A 1K28A 3GUOA 3D4SA 1CU0A 110LA 1JTNA 4I7KA 251LA 3SB6A 239LA 1L31A 3GULA 3SN6R 3F8VA 1L21A 1DYAA 259LA 160LA 1L56A 3G3XA 148LE 1P3NA 2Z6BA 1LW9A 126LA 177LA 1QT5A 253LA 139LA 3HTGA 3L2XA 146LA 161LA 1L91A 1C6NA 3K2RA 1QT7A 2F2QA 209LA 1L37A 2CUUA 2OE4X 224LA 3SB7A 1C66A 1L97A 1LYGA 257LA 1LI6A 1D3JA 1QTBA 164LA 1G0PA 1QS5A 7LZMA 171LA 1LGXA 1L96A 3C8RA 1P2LA 4YX7C 2OU0X 181LA 4LZMA 1P56A 1CV1A 3HTDA 3GUKA 2RH1A 1DYCA 170LA 3DN4A 178LA 3V2WA 1L24A 247LA 242LA 1PQOA 186LA 4EXMA 2IGCA 1CUQA 3HT7A 3CDQA 3NYAA 198LA 1ZWNA 1C68A 206LA 3HT6A 1LLHA 1L16A 1C69A 201LA 3GUPA 258LA 1LWKA 190LA 197LA 3DN1A 2B6ZA 1LWGA 3C7ZA 1L05A 1C61A 1QT6A 4I7QA 240LA 230LA 2RAYX 1OVKA 3HUQA 1QSBA 131LA 1C6FA 1OV5A 1DYDA 1L64A 3QAKA 1T8AA 1L44A 169LA 141LA 223LA 4K5YA 225LA 1P2RA 3GUMA 107LA 1SWZA 246LA 1L62A 3HH5A 211LA 176LA 1L26A 159LA 220LA 1P37A 4W59A 1P6YA 4EJ4A 1C6HA 1L02A 188LA 3OE6A 1C6TA 3HUAA 4ARMB 1L65A 1C64A 1OV7A 3ODUA 184LA 3EMLA 1G0QA 1PQDA 1L23A 2OEAX 128LA 1WTHA 1G0GA 2B6YA 3F9LA 1L13A 1L70A 1L29A 2OE7X 1L25A 125LA 1L27A 252LA 1L73A 155LA 1OVHA 1L90A 3OE0A 196LA 2O79A 1PQKA 217LA 5LZMA 102LA 1C6EA 1C6JA 1G0JA 142LA 215LA 2NTGA 156LA 1L76A 1QUHA 1LI2A 1L11A 235LA 1QTDA 1L39A 1B6IA 2RBPA 229LA 123LA 1L46A 234LA 2O4WA 3DKEX 2B72A 3DNAA 4ARMA 1C6CA 1D2WA 2OU9A 1L71A 6LZMA 2OTYX 3CDTA 4EKSA 1PQIA 261LA 1EPYA 214LA 1JTMA 4W56A 1KNIA 129LA 163LA 2RBSA 4I7PA 1CV6A 1L99A 1CX7A 1LGWA 1QUOA 4LDLA 1L32A 1CU2A 1ZURA 1L17A 1L80A 1L0KA 1PQMA 3DN0A 3SB9A 168LA 1C63A 152LA 1D3NA 2RBQA 1L30A 127LA 1L20A 1CVKA 3C7WA 4PK0A 150LA 1L60A 1L63A 1TLAA 1L84A 4GRVA 249LA 4ARQB 1L85A 130LA 4DKLA 2ANVA 1KS3A 1P7SA 237LA 250LA 3C7YA 233LA 1DYFA 2RB2X 3HH6A 1G1VA 4ARPA 4ARLA 227LA 1CTWA 3GUIA 238LA 173LA 1PQJA 1L49A 228LA 172LA 1G0KA 112LA 1L55A 1L35A 2L78A 4YXAC 1L41A 1L34A 4GBRB 3HT8A 1L54A 111LA 1L06A 1CUPA 2B6WA 138LA 3FI5A 1C67A 3OE8A 4I7MA 1L09A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3GXRA 3G3VA 119LA 1DYEA 3LYTA 1SWYA 4NGOA 1LSAA 1L59A 4B0DA 1CKGA 1BQLY 1YAMA 4DD9A 1TDYA 1UA6Y 4NSGA 2F47A 3P4ZA 1B7PA 1L68A 1G07A 1L00A 3V2YA 1C6IA 3NY9A 3ZVQA 3C81A 231LA 113LA 1QUGA 4H9CA 2ZYCA 1INUA 2W1YA 151LA 3WU7A 1L74A 167LA 3CDOA 2B6XA 2W1LA 2G4QA 1JUGA 1T6VL 1VDSA 1XEPA 1L08A 2ZIJA 4TUNA 3HTFA 2BLXA 103LA 1YANA 1L18A 1GFGA 1JQUA 1KIQC 3W3EA 1QS9A 4RW1A 4WM5A 1IP6A 2ZWBA 1GAZA 3HUKA 115LA 1LOZA 1L03A 135LA 1LYHA 4WM2A 1LMQA 4DD7A 1DI5A 5HMJA 3HBHA 3OE9A 2B6TA 4AQNA 2QB0B 4QY9A 2I6ZA 1QTHA 122LA 1L10A 4ETBA 1L88A 4NWHA 4IAPA 1LSDA 1WQRA 1JKDA 4WO6A 2MEAA 4TX7A 1BWIA 1YIKA 248LA 3HU8A 1FKQA 5KXTA 1GF4A 3LZTA 1L57A 1CU6A 3ATOA 3TXHA 1JJ1A 1GF3A 1L38A 1GF9A 1AT6A 2OU8A 1QUTA 3WPLA 232LA 1C6LA 2B73A 3PDSA 1IR9A 1QSQA 5LVJA 200LA 1B0DA 157LA 162LA 1OUIA 4I7SA 1OWYA 4WMGA 166LA 2X0AA 3LHMA 4W57A 4W96A 1ZVHL 3DN6A 1C6BA 1IP7A 1JTPL 3IJUA 1VDTA 1L40A 221LA 1L95A 1PZYA 2NWDX 255LA 1L42A 3LZ2A 1LZBA 3DN8A 4YM8A 3DMVA 4PRUA 3SB5A 1QUDA 1SX2A 1L22A 2BQFA 2DQDY 1L61A 4NG8A 1GE2A 4EPIA 1LPYA 1HMLA 3A90A 3CDRA 245LA 1QSWA 2BQCA 4BAFA 4LYOA 1GFRA 5I4WA 3HT9A 1L36A 4NHIA 2RBOA 1FLWA 3AZ7A 1ALCA 2B75A 3SBBC 236LA 4NWEA 5DM9A 1QTZA 5LYTA 1CV0A 2FYCA 1F6RA 4W51A 1LYDA 3HBDA 1GPQC 3C8QA 1B7QA 1C62A 1YL0X 2HTXA 5J7CA 1MLCE 1L31A 1IR8A 2MEFA 1L21A 4LT1A 4ZFPA 160LA 1GE3A 3F6ZA 1LMPA 4YF2A 1EQ4A 2DQCY 253LA 4GN3A 1LHKA 2YSSC 2YBNA 1C6NA 3AW6A 1D9UA 2Z12A 1C66A 3FI7A 1Z55A 3W6DA 1OUJA 1XGUC 1HFXA 1REMA 3C8RA 4YX7C 1JKAA 2RH1A 3RNXA 3QE8A 1B5ZA 5APCA 186LA 5KXPA 3NYAA 198LA 1WVVA 5I54A 1ZWNA 1C68A 1L16A 4NGIA 2IHLA 2F4AA 5II3A 2PC2A 2A7FA 3DN1A 230LA 1D0LA 1C6FA 3QAKA 4XJDA 3N9AA 1L44A 169LA 223LA 4K5YA 1KXXA 2MEGA 5M1YA 220LA 1P37A 4W59A 4NSJA 1L02A 1GD6A 2YBIA 3ATNA 1L65A 1BWJA 2YBJA 1EQEA 1B5UA 2CJLA 3LYMA 5LAGA 1JEFA 1OUCA 1GE4A 2HUBA 1G0GA 1CKDA 1L25A 1L27A 1C46A 1IOCA 5IHGA 4RLNA 4PHIA 1L90A 217LA 1FKVA 1HEWA 3A34A 1KIRC 1DQJC 1DI4A 5LZMA 4H93A 4B1AA 2DQFC 2LZTA 215LA 2NTGA 1L76A 1QUHA 1LI2A 5LVKA 1HEQA 208LA 2CDSA 2RBPA 229LA 1L46A 4H9HA 1GF0A 234LA 2O4WA 2B72A 1D2WA 4NFVA 6LZMA 1PQIA 261LA 1G7HC 4W56A 4WL7A 3ZEKA 129LA 163LA 4H8ZA 1WQMA 1ZURA 1UC0A 2HEFA 1L17A 1L80A 3ULRA 4XJGA 3AYQA 2ZIKA 2DQHY 1CKFA 4N5RA 1D3NA 1OUDA 2XBRA 127LA 1WTMA 3WPKA 1L20A 1CJ9A 4PK0A 3TXEA 1LYOA 1FBIX 1L63A 1TLAA 2D4KA 4IATA 5I53A 1IVMA 1L85A 1YKXX 3CSRA 1P7SA 2FBDA 250LA 3WMKA 1DYFA 2RB2X 1CKHA 4ARLA 3WW6A 227LA 1GAYA 4LYZA 3A8ZA 173LA 1GB2A 4H9AA 1BWHA 1L55A 1L54A 1D0MA 2B6WA 5D5CA 2Z2FA 2LHMA 4AGAA 144LA 1A4VA 2ZILA 1L28A 3CB7A 4C5FA 262LA 1L69A 1REZA 2H9KA 4OWAA 5A3ZA 1XGRC 4WLTA 3CDVA 4Z3MA 5B06A 1LJKA 3HDEA 2XTHA 1HEMA 3PBLA 1LJ4A 3G3BB 2HECA 1BHZA 2A4TA 2HUKA 4Z46A 5E4PA 3OJPA 1FLUA 2B7XA 4BS7A 1C60A 5F9XA 120LA 5IELA 1NHEA 2HEBA 2BQIA 2ANXA 3HTBA 1WQOA 1JKCA 1QTEA 1GDXA 2ZYPA 4E3UA 1GEVA 1I56A 4WLYA 2Q9DA 3RUNA 2OTZX 4TTDA 4QEQA 3DN2A 1B5XA 5HNLA 1D9WA 104LA 254LA 4NEBA 1QSAA 1OUBA 3A67Y 3P66A 4I7LA 4EKRA 5I4XA 1XJUA 4DDBA 4NSHA 1BVKC 1VDPA 5KXMA 1CJ7A 3GUNA 1C65A 1AM7A 1P2CC 4G4BA 1C08C 3RZEA 2LZ2A 2I25L 1GF8A 191LA 1KY0A 4LDOA 4M4OA 1LYFA 2VB1A 4I0CA 1LSBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3GXR A;  3G3V A;  119L A;  1DYE A;  3LYT A;  1SWY A;  4NGO A;  1LSA A;  1L59 A;  4B0D A;  1CKG A;  1BQL Y;  1YAM A;  4DD9 A;  1TDY A;  1UA6 Y;  4NSG A;  2F47 A;  3P4Z A;  1B7P A;  1L68 A;  1G07 A;  1L00 A;  3V2Y A;  1C6I A;  3NY9 A;  3ZVQ A;  3C81 A;  231L A;  113L A;  1QUG A;  4H9C A;  2ZYC A;  1INU A;  2W1Y A;  151L A;  3WU7 A;  1L74 A;  167L A;  3CDO A;  2B6X A;  2W1L A;  2G4Q A;  1JUG A;  1T6V L;  1VDS A;  1XEP A;  1L08 A;  2ZIJ A;  4TUN A;  3HTF A;  2BLX A;  103L A;  1YAN A;  1L18 A;  1GFG A;  1JQU A;  1KIQ C;  3W3E A;  1QS9 A;  4RW1 A;  4WM5 A;  1IP6 A;  2ZWB A;  1GAZ A;  3HUK A;  115L A;  1LOZ A;  1L03 A;  135L A;  1LYH A;  4WM2 A;  1LMQ A;  4DD7 A;  1DI5 A;  5HMJ A;  3HBH A;  3OE9 A;  2B6T A;  4AQN A;  2QB0 B;  4QY9 A;  2I6Z A;  1QTH A;  122L A;  1L10 A;  4ETB A;  1L88 A;  4NWH A;  4IAP A;  1LSD A;  1WQR A;  1JKD A;  4WO6 A;  2MEA A;  4TX7 A;  1BWI A;  1YIK A;  248L A;  3HU8 A;  1FKQ A;  5KXT A;  1GF4 A;  3LZT A;  1L57 A;  1CU6 A;  3ATO A;  3TXH A;  1JJ1 A;  1GF3 A;  1L38 A;  1GF9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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