4HJVA

Crystal structure of e. coli mlte with bound bulgecin and murodipeptide
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
184
structure length
184
Chain Sequence
HDYTNPPWNAKVPVQRAMQWMPISQKAGAAWGVDPQLITAIIAIESGGNPNAVSKSNAIGLMQLKASTSGRDVYRRMGWSGEPTTSELKNPERNISMGAAYLNILETGPLAGIEDPKVLQYALVVSYANGAGALLRTFSSDRKKAISKINDLDADEFLEHVARNHPAPQAPRYIYKLEQALDAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title On the Mechanism of Peptidoglycan Binding and Cleavage by the endo-Specific Lytic Transglycosylase MltE from Escherichia coli.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Endo-type membrane-bound lytic murein transglycosylase A
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Escherichia coli
total genus 67
structure length 184
sequence length 184
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 4.2.2.n2: Peptidoglycan lytic endotransglycosylase.
pdb deposition date 2012-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4hjvA00
1D0KA 1B5UA 5KKIA 2EPEA 1JTPL 1YKYX 1DPWA 2YSSC 1TCYA 1NBZC 1UIDA 1LMNA 4OW1A 1TEWA 2XBRA 2ZILA 208LA 1LZCA 1B9OA 2HEBA 1IORA 1GB8A 1XGTC 1WQPA 1F0WA 2G4QA 4WOAA 1GFJA 2BQIA 1JHLA 4O34A 1RE2A 4LT1A 1GE2A 2BQBA 1UCOA 4HTKA 1JKBA 5KXZA 1B7SA 1D9UA 1GF0A 3WYHA 4TWSA 3ZVQB 1GFVA 1LPIA 3AYQA 2DQHY 2YBNA 4A7DA 3N9AA 2NWDX 1VDSA 1LJNA 3BKHA 4H8XA 3SP3A 5LYTA 3EO5A 2LYOA 1JKDA 1GE4A 1IWWA 2EKSC 4NGJA 1RCMA 4NGLA 5FEKA 1HEOA 1LSGA 4NSIA 2BQGA 4XENA 5B07A 3RT5X 1GDXA 1YL1X 2LZ2A 2ZQ4A 4G4HA 133LA 4XJIA 3W6EA 1SQ2L 2CWIA 1UA6Y 1LHKA 2ZIJA 3BKVA 4GCCA 4OOTA 3ZEKA 2YVBA 3WULA 1JIYA 1CKFA 1FLWA 3GXRA 2I6ZA 1YL0X 2DQGY 3IJVA 5HMJA 5J7CA 1GXV2 1GE1A 3W6CA 4WLTA 2BQEA 1NF5A 4WM2A 1G7HC 2DQIY 4U3XB 5LAFA 5FCPA 4PGJB 1V7SA 2RSCA 5I53A 3A8ZA 1LSBA 1D6PA 4CFPA 2F30A 1RFPA 4L41A 2C8PA 3ATOA 3P68A 4WG1A 3ULRA 1MLCE 4H93A 1IWUA 4YF2A 4EOFA 1LSCA 1UIAA 1GF9A 1GBXA 5KXWA 1WVUA 2HEDA 3T36A 4PHIA 2FBBA 1C45A 2MEGA 5K7OA 3G3AB 5IELA 4GCEA 2YBLA 4OWBA 1GB2A 1LMPA 3D9AC 1F6SA 3LZ2A 1GBZA 1J1XY 1IP2A 5M1YA 4ET9A 1BB5A 1F6RA 1IP1A 1KXYA 3AZ4A 1VFBC 1AT5A 4H8YA 1GB5A 1GFUA 3AGGG 4BAFA 1HSXA 1C43A 2BQDA 1GE0A 1XSFA 2EIZC 2HUBA 2ZWBA 4KPMA 3AZ5A 4II8A 1JPOA 3ZVQA 3TXEA 1LHLA 1LKSA 3HBHA 4HJZA 2Z38A 1OUAA 2BQHA 2ZNXY 3TMWA 1IWVA 1XGRC 1LZEA 4NY5A 5DN5A 5B1FA 1DKJA 1LSMA 3CB7A 1OUJA 1C7PA 2MECA 1LYOA 1OUDA 1UIHA 1NQIA 1CJ6A 3AJNA 1DPXA 1BVXA 2H5ZA 1LZ9A 2CDSA 4ML7A 1AT6A 2BQAA 2YBMA 4RW2A 1IOTA 3WW5A 1LZ8A 4H9FA 1ZV5L 4ANRA 1KIRC 1IWYA 1HMLA 4ETAA 1I20A 1IWTA 2Z12A 1IC5Y 1ZVHL 4N0JA 1CJ8A 1UIGA 1LMOA 1IOSA 1LAAA 2I26L 5KXMA 1I56A 1JTOL 3HFMY 1QSAA 3QE8A 4NHSA 4BS7A 1BGIA 3N9EA 4H91A 1XEJA 5HMVA 2MEEA 1EQ4A 3TXHA 2D4JA 5KXPA 2D4IA 3A90A 1B7QA 1N4FA 1HFXA 4XJGA 1HMKA 4NHTA 3AGHA 4XYYA 1LJEA 3WUAA 4DYGA 2YBIA 1LHJA 4UWVA 1B7MA 4NWEA 1B2KA 1GFRA 4R0FA 3B72A 1C10A 4Z98A 2C8OA 3G3BB 1LZRA 4E3UA 4IJ4A 4NG8A 1A4VA 5IHGA 1LYSA 4W94A 5DLAA 2H9JA 1C08C 1DXJA 4GCFA 4FDYA 5IDDA 5F81A 1IX0A 3TXBA 3ATNA 1JJ0A 1OUHA 3WU8A 1YKZX 1LHMA 4PJ2C 4NGYA 4KL7A 1YROA 4YOPA 4DD0A 1LJIA 4HTNA 4OOOA 4N5RA 2XJWA 1QDTA 1LZYA 1LZNA 5A3EA 1JTTL 1GB7A 1OUGA 2PC2A 4H1PA 1GWDA 1HNLA 1JUGA 3LYMA 5F16A 4N8ZA 4GN5C 1GHLA 4ZIXA 5KXRA 1GF5A 1W08A 1IOCA 1QSWA 1YKXX 4H9IA 1EQEA 1GDWA 3J6KA 1BB6A 2F2NA 2FYDA 2W1YA 3AZ6A 3P4ZA 4PPOA 1FLQA 1B5WA 1XEIA 3KAMA 1XGUC 1BWHA 1KIQC 4H92A 1NKHA 4H9HA 4WM4A 1HEPA 2Y8PA 3LYZA 1LMQA 5APCA 4ETBA 3CT5A 1LMTA 1LZTA 1FBIX 4Z41A 3E3DA 4LT2A 4RLNA 5LVGA 1QUSA 193LA 1HEWA 2BQKA 1HERA 1O23A 2G4PA 1WQNA 3RW8A 4YEMA 1VDQA 3A93A 1CKCA 5I4WA 4NGOA 4YEOA 2LYZA 6LYZA 1NDMC 8LYZA 4W96A 5I4XA 4RW1A 1D6QA 4C5FA 1CKDA 3LYTA 3A67Y 1CNSA 2N5ZA 3CT0A 5DM9A 5KXSA 2DQCY 3LZTA 3M18B 3QNGA 5APEA 5F14A 4Z46A 5JENB 1NWGA 1T6VL 2MEHA 4WLDA 4QGZA 2MEAA 3EMSA 1BHZA 4GLAA 4J0LA 1GAZA 1VEDA 1JKAA 4H9BA 4B0DA 4PRUA 5LYZA 1LZAA 1RJCB 5C6JA 3TXJA 1LKRA 1LMAA 3WUMA 2BQJA 1LJHA 4XADA 4ZEEA 6LYTA 1LSPA 3RU5A 1LCNA 3A3RX 1NMMA 3AW7A 1D0MA 3N9CA 1WQMA 2ZYCA 3A34A 1IO5A 1G7MC 2FYCA 3OJPA 5I54A 2DQAA 1W6ZA 1B7LA 4LYCA 1ZVYB 4OWCA 5LIOA 1GFHA 4I8SA 1WQRA 2F4GA 4G9SA 1FLUA 1PS5A 1YAMA 1MELL 4LFXA 4TSCA 5LVKA 153LA 1HFZA 1B7RA 4OWEA 4NGKA 5KY1A 3TXDA 4G49A 2CGIA 5LVJA 4HTQA 5I5QA 1IOQA 4IATA 4B4EA 1CKHA 1H6MA 4B1AA 2IFFY 1INUA 3RNXA 4ETDA 3WPLA 1GB6A 5E9RA 4CJ2A 1VDTA 1WTNA 4DWXA 1B5VA 1LJGA 1IP6A 1BWJA 2Z2FA 2BAAA 4C3WA 5I4YA 2Z39A 4LYOA 1LJ4A 2XTHA 1REMA 4J7VA 1C46A 1LJFA 3B0OA 1G7IC 1LJJA 1OQMA 4OWAA 4N1EI 1BWIA 1HEQA 4HJVA 2A7FA 5AMYA 5APDA 5T3FA 1KXXA 2BQFA 1GBSA 4M4OA 4TUNA 4NEBA 4H94A 4NHIA 1IP5A 5KXNA 4HP0A 3CSRA 1CJ9A 1LJKA 2HU3A 3WPKA 3AW6A 1GFGA 1BB4A 3A96A 4UWUA 2BPUA 4YENA 4MSTA 1LZ1A 4BAPA 1HELA 1YANA 4X3BA 2Q0MX 5KXTA 3WL2A 2DKVA 5DL9A 4QDNA 1IWZA 3FE0A 1V7TA 3LYOA 3WU9A 1NDGC 4GN3A 3CSQA 1GB3A 4HPEA 1F10A 1UICA 4HJYA 3TXKA 5FDJA 4GN4A 4MCKA 3EXDA 1P2CC 1GXXA 1LZ5A 5B1GA 1IP4A 1XGQC 2MEIA 1B5YA 1DQJC 1REYA 3A3QA 1TAYA 5LVHA 1JJ3A 1B7NA 1EQ5A 1OUCA 4TX7A 1WVVA 1QQYA 1LYYA 3A6BY 3LN2A 1DKKA 3P66A 5A3ZA 2LZTA 1Z55A 4RLMA 1HHLA 1IY3A 4ETCA 4YM8A 2HEFA 4NG1A 1IR9A 4NGWA 3CT1A 4WM1A 1GB0A 1WQOA 207LA 4NGVA 4LT0A 2Z19A 1GAYA 4DDAA 4IASA 1B0DA 4LGKA 4WG7A 1LJ3A 1UUZC 1WTMA 4LYTA 2DBTA 3A92A 5HNLA 3B6LA 4KXIA 1GD6A 1DI4A 1LSNA 2BLYA 2Z37A 5LVIA 1JSEA 3P65A 4CHXA 1JSFA 1TBYA 3D3DA 1LZSA 1IEEA 2DQJY 3CQLA 2FBDA 1CKGA 7LYZA 1GFKA 1NBYC 1IP3A 5LA8A 1HC0A 1LTMA 2WARA 4WLYA 5B06A 2MEFA 4B4IA 1IWXA 5ILCA 5D5FA 2DQDY 3RZ4A 1DZBX 4GCBA 4RDSA 1B7OA 1BVKC 1ALCA 4GCDA 4NSHA 4DDBA 1LZGA 3J4GA 2AUBA 3HBDA 4N1CC 3TXFA 3W6AA 3W6FA 4I0CA 2HU1A 2D6BA 5KXXA 1KXWA 2DQFC 3LHMA 2G4NA 1HF4A 2BQNA 1CJ7A 1GBOA 1GE3A 1JISA 4WM6A 1YILA 1UBZA 1JITA 3EBAB 1GB9A 4WMGA 2W1LA 4J1AA 1KIPC 3AB6A 3WH1A 2YBHA 1DI5A 2BQLA 4OWHA 4LYMA 4XJDA 2CJLA 1YAQA 2XBSA 4CFOA 1PZYA 1IVMA 5L9JA 1XGPC 4UWNA 5D5CA 1IIZA 1IP7A 3AGIA 1DI3A 1GF6A 2MEBA 1AKIA 2D91A 2I25L 1TDYA 2MEDA 5KKJA 1WQQA 4TTDA 4B4JA 1B5XA 2LYMA 4ETEA 5HLLA 4DD2A 4PRQA 2A7DA 1IC7Y 5FELA 4M6DA 3TXIA 2BQMA 1ZMYL 1OUBA 3IWRA 3K3TA 3AZ7A 1A2YC 4J1BA 4NHPA 5APFA 3WW6A 1LZDA 2YDGA 1XEKA 1YQVY 1LZ6A 4ET8A 1XFPL 4WO9A 1UC0A 4BADA 5KXYA 5DN4A 132LA 1GEVA 1HSWA 1QTKA 3TMVA 5KJ9A 4WO6A 4DT3A 1HFYA 2LHMA 4H9CA 4DC4A 1GF3A 1LYZA 5LINA 4DD1A 1AM7A 1LSFA 1GBWA 1IC4Y 1B7PA 1LSEA 3FI7A 4H9AA 2BLXA 1FLYA 4G4CA 4LYBA 1JEFA 4R6CA 1OP9B 1YAPA 3WVYA 5KXLA 1GFTA 1B5ZA 4LFPA 4NFVA 5F9XA 1G7JC 4NGIA 1LOZA 2BQOA 4LT3A 1JKCA 4LZTA 135LA 1GFAA 1J1OY 4HPIA 1GFEA 5C6IA 3WVXA 4EMNA 4HV2A 2HECA 3P64A 4WL6A 5EBHA 2YBJA 3A91A 4D9ZA 5HNCA 1BB3A 5LA5A 3T6UA 3W3EA 1E8LA 1T3PA 3A95A 4NSJA 4DD3A 5B05A 154LA 3WMKA 1BQLY 2Z2EA 4WM3A 1RI8B 3VWOA 1J1PY 1YAOA 3CSZA 1G7LC 1GF7A 5B59A 1UIBA 1HENA 1UIEA 1LZBA 4AGAA 5L3IA 2D4KA 2ZYPA 3MGWA 4LYZA 4GLVA 2F4AA 1QIOA 3WXTA 1VATA 4WLXA 4XJFA 1BB7A 2HEEA 1REZA 194LA 4TSBA 4H9EA 4QY9A 3WXUA 4B49A 4N9RA 4AXTA 1GPQC 1D0LA 1LSZA 2IHLA 4DD7A 5LXWA 1LSDA 2HEAA 2ZIKA 1FKQA 1GF8A 3HBEX 1HEMA 4FJRA 4NWHA 4WM5A 1VDPA 1H87A 4HSFA 2HTXA 5ILFA 1JWRA 3OK0A 3M3UA 4KT3A 1FKVA 4Z3MA 1QUTA 4DD9A 4NSGA 3IJUA 4XJBA 1VAUA 1OUEA 2W1MA 3A6CY 3B0IA 5HQ1A 1GF4A 2W1XA 4NHQA 134LA 4P2EA 2BQCA 3TMUA 3TXGA 1FDLY 5FHWA 1FN5A 1I1ZA 4G4BA 1LSAA 4HV1A 3WPJA 1AZFA 3A94A 5F9UA 4WL7A 2EQLA 3TMXA 3W6BA 5KXOA 1LHIA 1EL1A 5FSTA 1LSYA 3WUNA 5II3A 1LHHA 5LAGA 3WU7A 1JJ1A 4DDCA 1OUFA 2ZNWY 1IR8A 3B0KA 1QTEA 1LMCA 1NHEA 4H90A 4MR1A 5L3HA 3QY4A 2ZQ3A 5C6LA 1IR7A 4H8ZA 1UACY 2X0AA 1GEZA 4ZFPA 1SLYA 3GXKA 2VB1A 2H9KA 4NGZA 4XN6A 1REXA 1UIFA 4CGEA 5KXKA 1OUIA 5E4PA 1IY4A 4XJHA 1QDRA 2GV0A 2Z18A 4QEQA 1GBYA 3F6ZA 3W6DA 5LYMA 1LZ4A 2DQEY 2B5ZA 4NIJA 9LYZA 1YIKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2EPEA 259LA 1NBZC 1UIDA 1LMNA 1NHBA 2HEBA 2BQIA 4O34A 211LA 1JKBA 5KXZA 1B7SA 4A7DA 4I7QA 3N9AA 3SP3A 1KS3A 1L77A 1C68A 3BKHA 4H8XA 3EO5A 1IWWA 2EKSC 4NGJA 4NGLA 1L37A 4NSIA 2BQGA 4XENA 161LA 214LA 1YL1X 1LHKA 4LZMA 1CKFA 2I6ZA 3NY8A 3DKEX 1GXV2 1G7HC 4U3XB 4PGJB 2RSCA 1T8AA 255LA 3ATOA 3ULRA 1MLCE 4H93A 1G0MA 2HEDA 1QTVA 3T36A 2FBBA 5IELA 2B70A 3GULA 1F6SA 1GBZA 1J1XY 1IP2A 2O4WA 3C8QA 1CUQA 1C6NA 141LA 1C43A 1GE0A 4KPMA 3ZVQA 3TXEA 1P6YA 1LKSA 2Z38A 2OU0X 1IWVA 2F47A 4NY5A 1SWYA 1DKJA 1QUHA 1UIHA 3AJNA 1NQIA 1CJ6A 1L86A 1D2WA 1DPXA 1G0LA 3DN8A 2BQAA 4RW2A 1IOTA 4H9FA 3C80A 4ANRA 1HMLA 1IWTA 1ZVHL 1IOSA 1PQJA 1L61A 5KXMA 1QSAA 1L31A 4BS7A 197LA 1D3NA 1EQ4A 3TXHA 1I6SA 3A90A 3C83A 4XJGA 3HTGA 1LJEA 1B7MA 217LA 1XJTA 3G3BB 1LZRA 4NG8A 1A4VA 4W94A 4GCFA 2RAZX 1G0PA 1IX0A 234LA 1G1WA 1OUHA 1YKZX 4PJ2C 2LC9A 4YOPA 196LA 1LJIA 1LZNA 1GB7A 4H1PA 231LA 2Q9DA 1HNLA 3LYMA 1W08A 1IOCA 4H9IA 1QSWA 1L54A 2FYDA 2W1YA 3AZ6A 4PPOA 3P4ZA 1L65A 1XEIA 1XGUC 1BWHA 5APCA 3LYZA 4EKRA 216LA 3CT5A 1FBIX 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1D0K A;  1B5U A;  5KKI A;  2EPE A;  1JTP L;  1YKY X;  1DPW A;  2YSS C;  1TCY A;  1NBZ C;  1UID A;  1LMN A;  4OW1 A;  1TEW A;  2XBR A;  2ZIL A;  208L A;  1LZC A;  1B9O A;  2HEB A;  1IOR A;  1GB8 A;  1XGT C;  1WQP A;  1F0W A;  2G4Q A;  4WOA A;  1GFJ A;  2BQI A;  1JHL A;  4O34 A;  1RE2 A;  4LT1 A;  1GE2 A;  2BQB A;  1UCO A;  4HTK A;  1JKB A;  5KXZ A;  1B7S A;  1D9U A;  1GF0 A;  3WYH A;  4TWS A;  3ZVQ B;  1GFV A;  1LPI A;  3AYQ A;  2DQH Y;  2YBN A;  4A7D A;  3N9A A;  2NWD X;  1VDS A;  1LJN A;  3BKH A;  4H8X A;  3SP3 A;  5LYT A;  3EO5 A;  2LYO A;  1JKD A;  1GE4 A;  1IWW A;  2EKS C;  4NGJ A;  1RCM A;  4NGL A;  5FEK A;  1HEO A;  1LSG A;  4NSI A;  2BQG A;  4XEN A;  5B07 A;  3RT5 X;  1GDX A;  1YL1 X;  2LZ2 A;  2ZQ4 A;  4G4H A;  133L A;  4XJI A;  3W6E A;  1SQ2 L;  2CWI A;  1UA6 Y;  1LHK A;  2ZIJ A;  3BKV A;  4GCC A;  4OOT A;  3ZEK A;  2YVB A;  3WUL A;  1JIY A;  1CKF A;  1FLW A;  3GXR A;  2I6Z A;  1YL0 X;  2DQG Y;  3IJV A;  5HMJ A;  5J7C A;  1GXV 2;  1GE1 A;  3W6C A;  4WLT A;  2BQE A;  1NF5 A;  4WM2 A; 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 1UIB A;  1HEN A;  1UIE A;  1LZB A;  4AGA A;  5L3I A;  2D4K A;  2ZYP A;  3MGW A;  4LYZ A;  4GLV A;  2F4A A;  1QIO A;  3WXT A;  1VAT A;  4WLX A;  4XJF A;  1BB7 A;  2HEE A;  1REZ A;  194L A;  4TSB A;  4H9E A;  4QY9 A;  3WXU A;  4B49 A;  4N9R A;  4AXT A;  1GPQ C;  1D0L A;  1LSZ A;  2IHL A;  4DD7 A;  5LXW A;  1LSD A;  2HEA A;  2ZIK A;  1FKQ A;  1GF8 A;  3HBE X;  1HEM A;  4FJR A;  4NWH A;  4WM5 A;  1VDP A;  1H87 A;  4HSF A;  2HTX A;  5ILF A;  1JWR A;  3OK0 A;  3M3U A;  4KT3 A;  1FKV A;  4Z3M A;  1QUT A;  4DD9 A;  4NSG A;  3IJU A;  4XJB A;  1VAU A;  1OUE A;  2W1M A;  3A6C Y;  3B0I A;  5HQ1 A;  1GF4 A;  2W1X A;  4NHQ A;  134L A;  4P2E A;  2BQC A;  3TMU A;  3TXG A;  1FDL Y;  5FHW A;  1FN5 A;  1I1Z A;  4G4B A;  1LSA A;  4HV1 A;  3WPJ A;  1AZF A;  3A94 A;  5F9U A;  4WL7 A;  2EQL A;  3TMX A;  3W6B A;  5KXO A;  1LHI A;  1EL1 A;  5FST A;  1LSY A;  3WUN A;  5II3 A;  1LHH A;  5LAG A;  3WU7 A;  1JJ1 A;  4DDC A;  1OUF A;  2ZNW Y;  1IR8 A;  3B0K A;  1QTE A;  1LMC A;  1NHE A;  4H90 A;  4MR1 A;  5L3H A;  3QY4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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