4HP0A

Crystal structure of hen egg white lysozyme in complex with gn3-m
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
128
structure length
128
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A novel transition-state analogue for lysozyme, 4-O-beta-tri-N-acetylchitotriosyl moranoline, provided evidence supporting the covalent glycosyl-enzyme intermediate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
total genus 48
structure length 128
sequence length 128
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4hp0A00
5LA8A 2MEIA 5B1FA 1HHLA 2C8OA 4CFOA 3P64A 2DQIY 4AGAA 5LVKA 1AT5A 4GCCA 2EIZC 1REZA 3WU8A 4Z46A 1CKDA 5DLAA 3LYMA 3ULRA 1IEEA 1YKZX 1XEIA 2GV0A 1IP1A 2XBSA 1IOTA 1GF6A 1LMNA 2DQDY 4HSFA 4XADA 5FELA 1REXA 3RU5A 3A6CY 4DYGA 2Q0MX 1FLUA 4LT1A 4DWXA 2Z2EA 1GE4A 4HJYA 4B4JA 2AUBA 3K3TA 1GFUA 3AGHA 1UIBA 2Z12A 1HMKA 5IHGA 1XGTC 4GN3A 1B5UA 1LTMA 4PHIA 1GE1A 1UIHA 1HEPA 2BQJA 1AT6A 2BAAA 1LSEA 1GF0A 1WQMA 2EQLA 1IP2A 2W1LA 3AZ7A 4RW2A 5B1GA 1B7SA 1JISA 1WTNA 1LYZA 1LMPA 4H8YA 6LYZA 1UIFA 2XJWA 4QEQA 5A3EA 3TXKA 1ZVHL 1QDTA 5KXLA 3A67Y 2HEDA 4LYOA 1OQMA 2Z38A 1VDSA 1DPXA 5F81A 1RI8B 4U3XB 4DD2A 2BLYA 2G4NA 1VDTA 3WL2A 5C6JA 1UACY 4NY5A 2BQCA 4LYCA 1XEJA 4NSHA 1IR7A 4XN6A 3AGGG 1IC4Y 2Z19A 4PRQA 2HECA 3SP3A 5JENB 1I20A 3AB6A 1IX0A 3LZ2A 5KXWA 5EBHA 1AKIA 1FLYA 1CKCA 3WUNA 1YKXX 1LMCA 1WQOA 4WLDA 5HLLA 1GF4A 4ET8A 4YEOA 1D6PA 3TXEA 3A34A 1FKVA 4RDSA 4GCBA 1LYYA 4Z3MA 4W96A 4ZIXA 7LYZA 1W6ZA 1B0DA 1GF8A 1LZSA 1YAMA 3GXRA 5LIOA 1HFYA 3M3UA 1OUHA 3EXDA 1G7HC 5LVHA 4C3WA 3WVXA 1E8LA 1JEFA 1BB6A 4UWUA 5KXOA 1BB7A 1GF5A 4EOFA 4PRUA 4NHTA 3RNXA 1VFBC 4H8XA 1B5YA 5L3IA 1B5VA 1HC0A 1REYA 4YOPA 1LZ4A 4OWCA 5M1YA 1OUJA 5KXTA 4NGWA 3W3EA 1ZMYL 1N4FA 3WH1A 5DN4A 1B7PA 1KIQC 1KIRC 1I56A 4YM8A 4I8SA 2WARA 2MEHA 1EQEA 1TAYA 1LJKA 1INUA 1C45A 1OUAA 3M18B 4H90A 1IOQA 4B49A 2BQGA 3BKVA 1GFJA 1B2KA 2YBMA 5I4XA 1GBSA 1YIKA 2DQAA 1GPQC 1LSMA 2MEEA 4LYZA 4RW1A 4NGYA 5KXYA 1HSWA 5APEA 1GB8A 1RJCB 2DQEY 1GBOA 2H9KA 4OWEA 2Z2FA 4EMNA 1LJHA 1ZVYB 4G4HA 4NGKA 5HQ1A 4ETBA 1JTPL 4CGEA 2LYZA 1FKQA 1BWHA 5LAGA 3EO5A 5KXPA 1C08C 1DKJA 3TXBA 3EBAB 1LJIA 4DDBA 4NGVA 1OUBA 1JITA 2F4AA 2ZIJA 4DD9A 3AZ6A 4NHSA 1YAOA 2YDGA 3P4ZA 4MSTA 2BQHA 5D5CA 1IY4A 2I26L 1LZNA 4HV2A 1UC0A 3CT0A 1LOZA 3A94A 4NWEA 5APFA 4TTDA 4ANRA 1DKKA 4N8ZA 5KKJA 1JWRA 3P68A 3WUAA 3BKHA 1IWWA 1IP7A 1GAZA 1BWIA 1WQPA 1BWJA 4OWAA 3TXGA 3LYZA 5D5FA 4MCKA 1LSNA 4E3UA 1D0MA 2HEBA 2CGIA 2MEDA 2YBIA 5B06A 1A2YC 5FDJA 4YF2A 1SQ2L 1B5WA 1NBYC 2ZNWY 4H8ZA 1HEQA 1DI3A 1VAUA 1LAAA 4N1CC 3A90A 3B0IA 1UUZC 1WVVA 3CSQA 3RZ4A 1HERA 4H9FA 1LJNA 153LA 5APCA 4OWBA 2Z18A 1J1XY 4XJBA 4X3BA 1FLQA 1LZ6A 1H6MA 1GDWA 4PPOA 5LVIA 1NBZC 1GD6A 4MR1A 1JKAA 4OOOA 3WUMA 3W6BA 2FBDA 4NGLA 4CHXA 2DQFC 3RT5X 3N9EA 4LT0A 1J1PY 2A7FA 4II8A 4OOTA 2D4KA 1LSGA 4HPIA 3QY4A 1VDQA 3J6KA 3LYOA 1XSFA 1VDPA 1YL0X 3W6DA 3W6AA 1YQVY 1IVMA 1WQQA 4R6CA 5F16A 3TXJA 3A6BY 1GFAA 5C6IA 4GCFA 1EQ5A 4IATA 3HFMY 3TXHA 1SLYA 2ZQ4A 1CJ7A 3N9CA 4H9BA 1JKCA 2BQNA 1LYSA 4HP0A 3CQLA 3W6EA 4WMGA 1LMTA 3GXKA 9LYZA 1LHMA 1PZYA 3B0KA 4RLNA 4KXIA 1CNSA 4LZTA 4LFXA 1IO5A 4HPEA 4ZFPA 2D91A 3WW5A 1GE2A 1B9OA 2F30A 2Z39A 1QDRA 1WQRA 3E3DA 5HMJA 1IORA 2BQAA 1DI5A 1LSAA 4DD3A 1TBYA 3TXDA 3B0OA 4J1AA 4Z41A 2XTHA 4YEMA 1W08A 1UCOA 1FBIX 2YSSC 4J0LA 4QY9A 3CT5A 1IC5Y 1NHEA 5I4YA 4CJ2A 1LSPA 1QSWA 1WQNA 1YANA 1JJ1A 4CFPA 1LJ3A 1IY3A 1ZV5L 4LYMA 5IELA 3MGWA 1IWVA 1FLWA 4H94A 1IWYA 4WM6A 1OP9B 1WVUA 4P2EA 4BS7A 4H93A 1LSBA 3A95A 5KXSA 5LAFA 2ZWBA 2Z37A 3W6CA 1XGPC 4TUNA 1BQLY 1GFKA 4NHQA 1A4VA 207LA 1LSCA 2HEEA 1AZFA 1Z55A 2HUBA 2YBHA 3CSRA 1DQJC 4WG7A 4GN5C 2BLXA 2X0AA 1HENA 3WMKA 2DBTA 3ATOA 135LA 2ZQ3A 1REMA 1G7IC 2HEAA 4GN4A 4WO6A 1HMLA 2G4QA 1IR8A 4LYTA 4NGJA 5LVJA 1OUEA 4I0CA 1LPIA 4H9CA 1GB3A 4D9ZA 4LT2A 5DM9A 1B5ZA 1XFPL 1LMOA 2MEBA 1BVXA 1LKSA 3TMWA 5DL9A 1LSYA 1VEDA 4ETCA 1GXV2 1JTTL 1QTEA 3IWRA 4GCEA 4N1EI 2HEFA 4BADA 1CKFA 1QTKA 4HTKA 4KL7A 1HELA 4TX7A 4A7DA 1JJ0A 2DKVA 2I25L 3HBHA 1OUFA 5B59A 5B05A 5LXWA 1UIAA 1YL1X 1LSDA 2BQFA 2C8PA 3IJVA 5E9RA 1BVKC 5HNLA 5KXZA 5FEKA 3TXIA 4HTNA 2LHMA 1LHLA 1BHZA 4DDCA 1QUTA 1LCNA 1H87A 1NDGC 4IJ4A 4B4EA 3LYTA 2W1YA 2MEGA 2BQKA 5K7OA 1GB0A 1NKHA 1NWGA 1GHLA 1JUGA 4DD7A 3A3QA 2RSCA 5KXRA 2ZILA 1GBXA 1IWZA 4NFVA 1RCMA 1F10A 3WXUA 4N9RA 4KT3A 1HF4A 1NF5A 1IC7Y 4H91A 1LZ1A 2YBJA 3D9AC 1B7RA 1UBZA 1GB2A 193LA 1GB6A 5KKIA 2B5ZA 4Z98A 3AJNA 5L3HA 1XGQC 2NWDX 5A3ZA 1GE3A 1KXWA 2MEFA 1D0LA 3CB7A 2VB1A 3AGIA 3F6ZA 1KIPC 5F14A 2LYMA 1DZBX 3IJUA 3WULA 1JSFA 1RE2A 1D6QA 1GB7A 1IP6A 1JTOL 5HMVA 5KY1A 1F6SA 5C6LA 1IWUA 1MELL 2D4IA 2FYCA 1LHIA 4L41A 1LKRA 3T36A 4AXTA 4ETEA 5FSTA 4H9AA 4H9IA 4G4BA 5I5QA 1HEWA 2YVBA 5E4PA 1LMAA 3FE0A 2MEAA 1VATA 4TSBA 1GXXA 4G4CA 4NSJA 4WL7A 3ZVQA 1GFGA 4BAPA 1ALCA 3KAMA 3D3DA 1OUIA 5FHWA 1TEWA 3FI7A 3HBDA 4R0FA 4WOAA 5KXNA 5LVGA 1BB5A 3TXFA 1LZTA 5KJ9A 1FN5A 1YAPA 133LA 1LZAA 4IASA 4NHIA 3TMXA 4WLTA 3G3BB 1T3PA 1V7SA 2BQBA 3B72A 1GF7A 3LHMA 1B5XA 1CJ9A 5FCPA 4NGZA 4DD1A 1AM7A 2IFFY 3W6FA 4DC4A 1UIEA 4W94A 4WM1A 2F4GA 2DQHY 3N9AA 3TMVA 5F9XA 5I4WA 1BB3A 3AZ5A 4GLVA 1UIGA 5LYZA 1B7NA 1JPOA 4ML7A 4NEBA 3AW7A 3VWOA 3ZVQB 1HNLA 1C10A 1LZYA 4NG8A 4WM3A 1IR9A 2ZYCA 4WG1A 1WTMA 1UICA 4KPMA 3A8ZA 2HU1A 3WU9A 5I53A 1UA6Y 4XJDA 5LYTA 4XJGA 1JHLA 3ATNA 4G9SA 1G7MC 1GB5A 2HU3A 4NSIA 5APDA 1IIZA 1G7LC 2BPUA 1IP5A 2PC2A 4DDAA 3LN2A 208LA 1C43A 1DI4A 1GFRA 3LZTA 5LYMA 4NWHA 1GB9A 4H9EA 1LJFA 4WM5A 2XBRA 4N0JA 1F6RA 1QIOA 1YKYX 2BQOA 2LZTA 1LZDA 2H9JA 2ZIKA 3A93A 194LA 1D9UA 1MLCE 1KXXA 2IHLA 3CSZA 4NIJA 4B4IA 3WU7A 5HNCA 1GFHA 1OUCA 3B6LA 1LZGA 1CKHA 1LHHA 1IP3A 4XJIA 4DT3A 2W1XA 3A91A 4TWSA 6LYTA 1TCYA 1LZCA 3AZ4A 5KXKA 3CT1A 4TSCA 1V7TA 2HTXA 1GEZA 1QUSA 2YBNA 4NSGA 1LSZA 1IWXA 4HTQA 4QGZA 3A3RX 2D4JA 1JJ3A 1JKDA 1D0KA 1LSFA 1PS5A 1IP4A 2CDSA 3EMSA 2LYOA 5AMYA 1GDXA 8LYZA 5KXXA 1LZBA 5KXMA 4ZEEA 1KXYA 1NDMC 1GAYA 1HEMA 2I6ZA 1TDYA 4N5RA 2FYDA 4ETAA 1BGIA 2ZYPA 4XYYA 1C46A 5ILFA 1GBZA 1GFTA 1GFEA 5B07A 4XJFA 1XEKA 1XGRC 1LJEA 1LJ4A 2BQLA 4OW1A 3OK0A 4WL6A 1T6VL 1FDLY 1NMMA 5T3FA 5L9JA 154LA 3WW6A 1B7OA 3QNGA 4B1AA 4RLMA 4YENA 4WM2A 1XGUC 4FJRA 2A7DA 4GLAA 2MECA 5II3A 3OJPA 4UWVA 4OWHA 4H92A 1GWDA 2CJLA 1LMQA 2DQCY 4NGIA 4WLXA 3WPJA 4B0DA 2N5ZA 1YROA 1QSAA 4H9HA 2ZNXY 1HFXA 4O34A 1IOCA 3WVYA 3HBEX 5LA5A 1GEVA 134LA 1LHJA 2Y8PA 3TMUA 1YILA 4HJZA 3T6UA 1JSEA 1GF9A 4UWNA 1CJ6A 132LA 1QQYA 2EKSC 1GBWA 4PJ2C 4QDNA 1LJGA 1GE0A 4NG1A 2DQGY 1LJJA 1C7PA 2BQEA 1CKGA 5DN5A 1O23A 4G49A 1EQ4A 1GF3A 1LYOA 1LHKA 1LZ9A 4XENA 4LFPA 4DD0A 4J1BA 3WXTA 4LGKA 4WM4A 3P65A 1DPWA 1HFZA 2DQJY 4HJVA 1RFPA 1IOSA 1JKBA 2YBLA 1BB4A 1YAQA 3AW6A 4GCDA 1F0WA 4ET9A 2BQDA 1B7LA 4BAFA 3A96A 4WO9A 1GFVA 2FBBA 2G4PA 4PGJB 1B7MA 1JIYA 5F9UA 3QE8A 4HV1A 4NHPA 3AYQA 3J4GA 5ILCA 1CJ8A 1HSXA 3P66A 5IDDA 3WPKA 5LINA 2CWIA 4J7VA 1G7JC 1LZ8A 1DXJA 1OUGA 4H1PA 1I1ZA 2H5ZA 1LZRA 1GBYA 4NGOA 2D6BA 2BQIA 2BQMA 4LYBA 1P2CC 4M6DA 1IWTA 2F2NA 3A92A 2W1MA 3WYHA 4LT3A 1LZEA 3WPLA 1J1OY 1UIDA 2EPEA 1OUDA 4C5FA 4XJHA 3RW8A 5I54A 1B7QA 2LZ2A 1LZ5A 3ZEKA 4M4OA 1EL1A 4FDYA 5J7CA 1NQIA 3G3AB 1HEOA 4WLYA 4ETDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NY8A 4CFOA 3P64A 2DQIY 5LVKA 4GCCA 3WU8A 3LYMA 1QT8A 217LA 2GV0A 3HUAA 2XBSA 4HSFA 1IOTA 1GF6A 4XADA 2DQDY 4LT1A 253LA 1GE4A 2AUBA 167LA 1QT4A 2Z12A 1HMKA 4GN3A 2BQJA 1HEPA 5B1GA 3AZ7A 1CV5A 1JISA 3OE9A 1LYZA 6LYZA 219LA 1UIFA 3C81A 5A3EA 2A4TA 141LA 3A67Y 187LA 1C6EA 2LC9A 1SSWA 3HT6A 1CUPA 4LYCA 1XEJA 4XN6A 3GUNA 2Z19A 1C68A 176LA 1I20A 3AB6A 5KXWA 1AKIA 1LYDA 205LA 1WQOA 4YEOA 3A34A 4RDSA 1LYYA 4ZIXA 5LIOA 190LA 1L79A 3EXDA 3DN2A 1G7HC 2RB0X 220LA 7LZMA 3ODUA 1HC0A 1REYA 5KXTA 4NGWA 3DN3A 1D3FA 3WH1A 1B7PA 1OV5A 1KIRC 1LYIA 3DN6A 261LA 1EQEA 1TAYA 3CDTA 3D4SA 4H90A 1IOQA 4W59A 4B49A 2DQAA 1GPQC 2MEEA 5KXYA 4EMNA 2Z2FA 4NGKA 1JTPL 1L27A 1L07A 1FKQA 1LJIA 3F9LA 1JITA 2ZIJA 1SWZA 246LA 1IY4A 231LA 1JWRA 1IWWA 1IP7A 4OWAA 3TXGA 1LSNA 2MEDA 5FDJA 1VAUA 1LAAA 1LGXA 1WVVA 3CSQA 3RZ4A 1LJNA 5APCA 2Z18A 1J1XY 3SB6A 1GD6A 3WUMA 3W6BA 3N9EA 4OOTA 1DYAA 1LSGA 3QY4A 1YL0X 3W6DA 1L17A 3W6AA 1IVMA 3HTFA 5C6IA 4IATA 3HFMY 2ZQ4A 1JKCA 4HP0A 4WMGA 9LYZA 1LHMA 181LA 3B0KA 4LZTA 4DAJA 1LW9A 4HPEA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5LA8 A;  2MEI A;  5B1F A;  1HHL A;  2C8O A;  4CFO A;  3P64 A;  2DQI Y;  4AGA A;  5LVK A;  1AT5 A;  4GCC A;  2EIZ C;  1REZ A;  3WU8 A;  4Z46 A;  1CKD A;  5DLA A;  3LYM A;  3ULR A;  1IEE A;  1YKZ X;  1XEI A;  2GV0 A;  1IP1 A;  2XBS A;  1IOT A;  1GF6 A;  1LMN A;  2DQD Y;  4HSF A;  4XAD A;  5FEL A;  1REX A;  3RU5 A;  3A6C Y;  4DYG A;  2Q0M X;  1FLU A;  4LT1 A;  4DWX A;  2Z2E A;  1GE4 A;  4HJY A;  4B4J A;  2AUB A;  3K3T A;  1GFU A;  3AGH A;  1UIB A;  2Z12 A;  1HMK A;  5IHG A;  1XGT C;  4GN3 A;  1B5U A;  1LTM A;  4PHI A;  1GE1 A;  1UIH A;  1HEP A;  2BQJ A;  1AT6 A;  2BAA A;  1LSE A;  1GF0 A;  1WQM A;  2EQL A;  1IP2 A;  2W1L A;  3AZ7 A;  4RW2 A;  5B1G A;  1B7S A;  1JIS A;  1WTN A;  1LYZ A;  1LMP A;  4H8Y A;  6LYZ A;  1UIF A;  2XJW A;  4QEQ A;  5A3E A;  3TXK A;  1ZVH L;  1QDT A;  5KXL A;  3A67 Y;  2HED A;  4LYO A;  1OQM A;  2Z38 A;  1VDS A;  1DPX A;  5F81 A;  1RI8 B;  4U3X B;  4DD2 A;  2BLY A;  2G4N A;  1VDT A;  3WL2 A;  5C6J A;  1UAC Y;  4NY5 A;  2BQC A;  4LYC A;  1XEJ A;  4NSH A;  1IR7 A;  4XN6 A; 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 4OWH A;  4H92 A;  1GWD A;  2CJL A;  1LMQ A;  2DQC Y;  4NGI A;  4WLX A;  3WPJ A;  4B0D A;  2N5Z A;  1YRO A;  1QSA A;  4H9H A;  2ZNX Y;  1HFX A;  4O34 A;  1IOC A;  3WVY A;  3HBE X;  5LA5 A;  1GEV A;  134L A;  1LHJ A;  2Y8P A;  3TMU A;  1YIL A;  4HJZ A;  3T6U A;  1JSE A;  1GF9 A;  4UWN A;  1CJ6 A;  132L A;  1QQY A;  2EKS C;  1GBW A;  4PJ2 C;  4QDN A;  1LJG A;  1GE0 A;  4NG1 A;  2DQG Y;  1LJJ A;  1C7P A;  2BQE A;  1CKG A;  5DN5 A;  1O23 A;  4G49 A;  1EQ4 A;  1GF3 A;  1LYO A;  1LHK A;  1LZ9 A;  4XEN A;  4LFP A;  4DD0 A;  4J1B A;  3WXT A;  4LGK A;  4WM4 A;  3P65 A;  1DPW A;  1HFZ A;  2DQJ Y;  4HJV A;  1RFP A;  1IOS A;  1JKB A;  2YBL A;  1BB4 A;  1YAQ A;  3AW6 A;  4GCD A;  1F0W A;  4ET9 A;  2BQD A;  1B7L A;  4BAF A;  3A96 A;  4WO9 A;  1GFV A;  2FBB A;  2G4P A;  4PGJ B;  1B7M A;  1JIY A;  5F9U A;  3QE8 A;  4HV1 A;  4NHP A;  3AYQ A;  3J4G A;  5ILC A;  1CJ8 A;  1HSX A;  3P66 A;  5IDD A;  3WPK A;  5LIN A;  2CWI A;  4J7V A;  1G7J C;  1LZ8 A;  1DXJ A;  1OUG A;  4H1P A;  1I1Z A;  2H5Z A;  1LZR A;  1GBY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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