4HPIA

Crystal structure of hen egg white lysozyme complex with gn2-m
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
128
structure length
128
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A novel transition-state analogue for lysozyme, 4-O-beta-tri-N-acetylchitotriosyl moranoline, provided evidence supporting the covalent glycosyl-enzyme intermediate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
total genus 46
structure length 128
sequence length 128
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4hpiA00
1IP7A 1GFJA 4MCKA 5LINA 1RE2A 5KKJA 1DKJA 4QGZA 1TAYA 1UIBA 1WQRA 1QTKA 1D0MA 4PRQA 1IVMA 4NSGA 1XGQC 1LZEA 1QUTA 2DQDY 4GN3A 1RCMA 5DM9A 5F14A 4GCBA 5HQ1A 4LFXA 1REXA 194LA 1QDRA 1F0WA 3IJVA 1WQQA 5KXXA 1XFPL 3AW6A 1LSDA 5KXRA 4H90A 1JUGA 1B5YA 1IP2A 2MEFA 5LA5A 1SLYA 1GF6A 2CWIA 4GLVA 3HBHA 1OUFA 4X3BA 4TUNA 4LFPA 5E4PA 1OUEA 3RT5X 3J4GA 5EBHA 1JEFA 3P4ZA 1BB5A 4PPOA 4DT3A 5I54A 2CDSA 207LA 2Z19A 4ETDA 2Z12A 1BVKC 1H6MA 5FSTA 1DKKA 1TBYA 4ETAA 1LZ1A 1IP5A 135LA 1KIRC 1VDQA 2N5ZA 3G3AB 2DQAA 3WUMA 4DD2A 2Z2FA 5B07A 5DL9A 1FLUA 4NWEA 1LYYA 1LMQA 1HELA 2YBIA 2HEDA 1QQYA 4I8SA 1LSAA 4OWEA 1IWWA 3A67Y 2C8PA 4B4EA 1IY3A 1GB2A 1WTNA 5T3FA 1YILA 1GEVA 5HNCA 1CKFA 1REZA 1YKZX 2DKVA 2HECA 5B1GA 2ZQ4A 1LSEA 1AM7A 1GE3A 1DPWA 1ZVYB 5IDDA 3TMXA 4D9ZA 5HMVA 3RZ4A 3A91A 4RLMA 4EMNA 1HF4A 2PC2A 4DYGA 3WVXA 4QDNA 4IASA 4Z3MA 1IR9A 4RLNA 4H9BA 4ML7A 3WU8A 1GFVA 1GPQC 2DQJY 2D4KA 1KIPC 5ILFA 4L41A 2Z2EA 3W6DA 2YSSC 1HMLA 1XGRC 1JISA 1I1ZA 1A2YC 1B5WA 4DDCA 4A7DA 1GE0A 4OWHA 1LSMA 1LHJA 3A93A 1REYA 3ZVQA 2MEGA 4J1BA 3W6AA 1NBZC 4HTNA 5F9XA 4BAPA 3CT1A 1IWXA 3AB6A 4HV2A 1HSXA 1QDTA 2YDGA 1AT6A 1IWZA 3A8ZA 1BWHA 3FE0A 4HJYA 1WQNA 4H92A 2DQGY 1BWJA 4DDBA 2BQCA 1IR8A 2BQKA 3BKVA 3A34A 1UC0A 2LYMA 5DLAA 3GXKA 3T6UA 4GLAA 4NG1A 3MGWA 1KXXA 1GFTA 1TCYA 3A90A 4XJBA 3N9CA 4OWBA 1LCNA 1JTPL 1LHIA 4LYCA 4NGIA 1IWUA 1FKVA 2LZ2A 1IY4A 3LZ2A 3B0OA 4H8XA 3QY4A 1YKYX 1ALCA 2ZWBA 1B5VA 1LZCA 4RDSA 1LZ9A 3AZ6A 4XJIA 3RU5A 4NGJA 1NQIA 2HU3A 1HERA 3IWRA 2I26L 4ANRA 5LYZA 1LSGA 1LMCA 2BQFA 5KKIA 1JJ3A 4WO9A 1LSFA 4J7VA 4B0DA 1ZMYL 2W1YA 1B0DA 4N1EI 1DPXA 5I4YA 4U3XB 1LJFA 3FI7A 4NG8A 4HSFA 2D6BA 5KXZA 1B7PA 3TXDA 1Z55A 3KAMA 4N5RA 5C6JA 5HMJA 1C46A 1QUSA 1DI3A 1VDTA 1VFBC 2Z18A 4H9CA 5I53A 5K7OA 2BQDA 1FDLY 1LZRA 4W94A 1J1PY 4RW1A 5II3A 3BKHA 2HUBA 132LA 1IWVA 2XBRA 3LYOA 3WPJA 3WXTA 5KXWA 4YM8A 2BQBA 1LOZA 1YAOA 2Y8PA 2AUBA 2DQCY 2BQEA 1NDMC 4NGOA 4W96A 1I56A 1LKSA 3A96A 4G4BA 5FCPA 1PS5A 5J7CA 1JHLA 1IEEA 4WO6A 4TX7A 2WARA 1B7QA 1LZBA 4YOPA 1JPOA 3WPKA 1HEOA 4LT3A 1NKHA 3CT0A 5D5FA 1TEWA 1LZDA 4ETBA 1GHLA 1NBYC 5IELA 1RFPA 3AJNA 3VWOA 1JITA 2MEEA 4UWUA 6LYZA 5B05A 3WU7A 1BQLY 1NF5A 4LYZA 1UUZC 3A6BY 4NGWA 1CJ6A 2YVBA 4XN6A 4GN5C 1IOTA 5APEA 4BS7A 4ET8A 1XGPC 2A7DA 1JKBA 1BVXA 2W1XA 2HEBA 2BQAA 1GWDA 2B5ZA 3A6CY 4IJ4A 1AZFA 4NWHA 2ZQ3A 1LZTA 4HPEA 1HMKA 1IP1A 2W1MA 4GCFA 4UWNA 5B1FA 3WUNA 4B4JA 1BB6A 4E3UA 2YBHA 1IC4Y 1UICA 1GBXA 1YIKA 4N0JA 1CJ8A 4DC4A 2HEAA 1IP4A 2MEBA 1MELL 5LYTA 1UBZA 1B7SA 4WMGA 1LSBA 4I0CA 3TXKA 1GF4A 2BQMA 3QNGA 1CJ7A 4DD0A 1GF5A 4B49A 1LSCA 2GV0A 2H9KA 1GXXA 5FEKA 4H9AA 1UIHA 4OWCA 153LA 3B6LA 1IOCA 4GN4A 3D9AC 1LYOA 4H8YA 3K3TA 5A3EA 1I20A 1D9UA 1JWRA 1IP6A 3AYQA 1GD6A 1CKCA 1EQ4A 1OUAA 1UIGA 1ZVHL 2XBSA 4TWSA 1HC0A 4GCCA 1KXYA 1UCOA 2YBJA 1GFGA 1GAZA 4H1PA 4YENA 1LSNA 1T6VL 1WTMA 2ZILA 1BB4A 3OK0A 1CNSA 4GCEA 4H91A 3TXHA 1EQ5A 2DQHY 1GEZA 2BLYA 134LA 1IO5A 3P64A 3N9EA 1C43A 133LA 1REMA 4J0LA 1HSWA 5HNLA 5KXTA 1GXV2 1LJ4A 1OUIA 3OJPA 3ZVQB 3HBEX 8LYZA 2XTHA 4LT1A 3ZEKA 4HTKA 1F10A 3P65A 1CKDA 2VB1A 4HJVA 1LZSA 2DQEY 3B0KA 2FBDA 1LMAA 3M3UA 1BWIA 1LHHA 1FKQA 1GB0A 1EQEA 4ZIXA 1XEKA 208LA 4YEMA 1LMOA 3M18B 4II8A 3N9AA 2LYOA 4FJRA 2X0AA 3W6EA 1GE4A 4HV1A 4KT3A 5IHGA 1W6ZA 4LYMA 1V7SA 2G4NA 4WM5A 1DI4A 4WM4A 4Z41A 1DQJC 1LZ8A 5LVHA 1LTMA 2Z38A 4XYYA 4WG1A 2D91A 4HTQA 4NGZA 4Z98A 1JKDA 2F30A 4R0FA 1KIQC 1XGTC 3TXEA 2W1LA 1EL1A 1IWTA 1G7JC 1V7TA 2IFFY 4XJHA 3AZ5A 5L3IA 3A3RX 1B2KA 1LZYA 1JJ0A 3T36A 4CHXA 5JENB 5KXMA 1B7RA 2ZYPA 1LHMA 5KXSA 1B7MA 1QIOA 3GXRA 1LJGA 3EXDA 1GB9A 1GFUA 1CKGA 3CSRA 3LN2A 2DQFC 2CJLA 2XJWA 4TSBA 3WH1A 1IWYA 1OQMA 5L3HA 1IC5Y 4HP0A 1WQPA 1LYSA 1DI5A 4H93A 1JSEA 154LA 4NEBA 5D5CA 1HFYA 4XJDA 5DN4A 4DWXA 3ULRA 4DDAA 4ZEEA 4OOOA 1C10A 3EBAB 3J6KA 5LYMA 3WPLA 1GB8A 1HFXA 3WXUA 1GFKA 1IOQA 3WW6A 4DD7A 5LIOA 5I4WA 5E9RA 4LT0A 5APFA 1UIDA 1IC7Y 2I6ZA 2BQNA 4LT2A 2MEAA 4WL6A 5F16A 4G4CA 4PGJB 3W6CA 5LXWA 4DD1A 1LJEA 1NHEA 4CFOA 1B7LA 3HFMY 4ZFPA 4CGEA 2HTXA 4WOAA 2LHMA 4UWVA 5LVGA 1AKIA 1HEQA 4YEOA 2BQJA 1BB3A 1QSAA 1B9OA 1JTTL 1YL1X 3CQLA 1HEMA 4H94A 1HEWA 2ZIJA 4CFPA 1O23A 1A4VA 3HBDA 1HFZA 3F6ZA 5KXOA 2LYZA 3D3DA 4LYTA 1LYZA 2BQHA 3W3EA 1NDGC 3WU9A 4WL7A 5HLLA 5FHWA 1JKAA 3SP3A 1C7PA 1N4FA 3TMUA 5KY1A 4NHSA 1B5UA 3EMSA 4NHPA 5APCA 1GBYA 1J1OY 1YL0X 4ET9A 3W6BA 1XSFA 1LHLA 4TSCA 2MEDA 2BPUA 4DD9A 5KXYA 1XEJA 1B7NA 3AGGG 2H5ZA 5F9UA 3WVYA 4C3WA 1T3PA 4H9EA 4OW1A 1GFAA 1LJKA 2Z39A 3A92A 4NSJA 1GF0A 3WYHA 1OUGA 4NSIA 2IHLA 1AT5A 2YBNA 5C6IA 3AZ4A 3LYMA 4FDYA 1F6RA 1GF9A 1BHZA 1B7OA 1GBWA 5APDA 6LYTA 4Z46A 5KJ9A 5L9JA 1GFRA 4NGKA 1OUBA 4BADA 1GB6A 3E3DA 1UIAA 4H9HA 1LZAA 4WLTA 5FDJA 5LAFA 3RNXA 4AGAA 1JJ1A 4XADA 1YAPA 2A7FA 1YAMA 1B5XA 1KXWA 1LJHA 1UA6Y 4PJ2C 1IX0A 3WL2A 1LJ3A 5AMYA 4NSHA 1JSFA 1JTOL 1UACY 3P68A 1BB7A 1GB5A 3AGHA 1D6QA 5LVIA 2F2NA 3A94A 5M1YA 4KL7A 2FBBA 3WUAA 4WG7A 2BAAA 4M6DA 4G4HA 4MR1A 1WQOA 3LHMA 1W08A 1GB3A 1F6SA 4G49A 3TXBA 1MLCE 2DQIY 1VATA 1YAQA 2G4PA 4RW2A 4LGKA 4GCDA 1IIZA 1IR7A 1LZ5A 4LZTA 1GE1A 4TTDA 3WULA 1NMMA 5C6LA 1OUDA 4NFVA 1GF8A 4NGLA 1LJNA 2HEEA 3IJUA 5I5QA 1NWGA 5LA8A 3TMWA 2G4QA 1QTEA 4NY5A 1LMNA 1LZGA 5KXLA 1WVVA 2EIZC 1WQMA 3G3BB 5KXPA 4EOFA 193LA 1FLYA 1GBZA 2F4GA 1HHLA 2MEHA 1GFHA 3RW8A 1G7IC 2EKSC 5LVKA 2LZTA 1LSZA 2BQOA 4WM3A 4OOTA 3TXGA 1GE2A 3W6FA 1IP3A 4M4OA 3CB7A 5KXNA 3TXJA 5B59A 3QE8A 4H9FA 2FYCA 2EQLA 1HNLA 1YROA 1LHKA 4C5FA 2H9JA 3AZ7A 4PRUA 1FN5A 4YF2A 1C08C 1FLQA 4BAFA 4WLXA 1INUA 5ILCA 1GDWA 4XJGA 4NGVA 1PZYA 1WVUA 1GBOA 1SQ2L 3B72A 3WMKA 4LYOA 1TDYA 1FLWA 1ZV5L 1XGUC 5B06A 5DN5A 3B0IA 1DXJA 1OUCA 4J1AA 1LZ4A 1LKRA 4XJFA 1D0LA 2CGIA 1BGIA 1D6PA 1LJJA 3ATNA 1DZBX 3TXIA 1JKCA 1XEIA 4WM6A 2YBLA 4CJ2A 1E8LA 1JIYA 1YANA 4IATA 3A95A 4AXTA 1UIEA 4NHTA 1CJ9A 1GF3A 1HEPA 2ZNXY 4OWAA 2C8OA 2Z37A 3LZTA 4DD3A 4NIJA 9LYZA 1GDXA 3LYZA 1LMTA 2F4AA 4MSTA 5LVJA 2ZNWY 3CT5A 1UIFA 5F81A 1GBSA 1QSWA 4ETEA 1B5ZA 1YQVY 1IOSA 1C45A 1P2CC 1VDPA 1G7HC 1LJIA 2NWDX 2D4JA 2HEFA 1J1XY 2ZYCA 3ATOA 4N1CC 2D4IA 3CSQA 3EO5A 4NGYA 1YKXX 1GAYA 3CSZA 3TMVA 3WW5A 5A3ZA 4R6CA 3A3QA 1OUJA 2BQLA 2Q0MX 5I4XA 4NHQA 4P2EA 1FBIX 4XENA 5FELA 3P66A 4WM1A 3LYTA 1VAUA 4LYBA 2DBTA 2EPEA 4WM2A 1OP9B 4HJZA 3AGIA 4PHIA 1LPIA 3TXFA 1GB7A 4ETCA 1G7LC 4HPIA 1LZ6A 1LZNA 1RJCB 4H8ZA 4KXIA 4NHIA 4B4IA 1VDSA 4QEQA 2YBMA 2FYDA 1OUHA 3AW7A 1LSYA 7LYZA 2HU1A 1RI8B 1LAAA 1G7MC 2ZIKA 2BQGA 2MECA 4WLDA 4G9SA 1LMPA 5LAGA 2BLXA 1HENA 4H9IA 1VEDA 4KPMA 1GF7A 2I25L 2MEIA 4B1AA 1GFEA 1LSPA 1H87A 1IORA 2BQIA 5KXKA 4WLYA 2RSCA 1D0KA 4N9RA 4O34A 4QY9A 4N8ZA 1CKHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5LINA 1RE2A 1LYHA 1DKJA 1JQUA 4QGZA 1L67A 1UIBA 2LC9A 1D0MA 1B6IA 4LFXA 2RB2X 194LA 3IJVA 1PQDA 4H90A 1JUGA 1B5YA 2MEFA 1GF6A 4TUNA 1LYFA 2Z12A 201LA 196LA 2N5ZA 1LI3A 2Z2FA 5DL9A 3C80A 1HELA 4I8SA 2HEDA 131LA 2C8PA 4B4EA 1IY3A 1GEVA 1LSEA 1AM7A 160LA 5IDDA 163LA 3NY9A 3A91A 1L90A 1L01A 4W57A 1L80A 1L44A 3WU8A 126LA 2DQJY 1KIPC 1OWYA 149LA 1B5WA 1LSMA 211LA 248LA 3W6AA 1G0MA 4HTNA 4BAPA 3AB6A 1BWHA 4W51A 1WQNA 4H92A 4DDBA 2BQKA 3MGWA 4XJBA 4ARQB 1L28A 1JTPL 1LHIA 1L85A 3LZ2A 4E97A 1YKYX 1ALCA 1B5VA 2A4TA 1NQIA 166LA 3HH5A 1C6EA 1L63A 138LA 195LA 125LA 3HUAA 5LYZA 1JJ3A 4B0DA 1ZMYL 2W1YA 1G0KA 1C62A 5I4YA 1LJFA 3FI7A 4NG8A 1SWZA 1LZRA 4W94A 2HUBA 132LA 3LYOA 226LA 2BQBA 1YAOA 1C6JA 3SB5A 1G0GA 2BQEA 2RBOA 1QS9A 5FCPA 1I56A 1LKSA 3A96A 4G4BA 4W53A 1JHLA 4WO6A 3HH4A 2WARA 228LA 1HEOA 1NKHA 250LA 145LA 3CT0A 3HU8A 142LA 3AJNA 2MEEA 4LYZA 1OVJA 4BS7A 1XGPC 1JKBA 1BVXA 2HEBA 2BQAA 255LA 4B4JA 1IP1A 2W1MA 4GCFA 5B1FA 1L58A 1CJ8A 4DC4A 2HEAA 1L06A 218LA 1D2WA 156LA 1L99A 1LSBA 1GF4A 4B49A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1IP7 A;  1GFJ A;  4MCK A;  5LIN A;  1RE2 A;  5KKJ A;  1DKJ A;  4QGZ A;  1TAY A;  1UIB A;  1WQR A;  1QTK A;  1D0M A;  4PRQ A;  1IVM A;  4NSG A;  1XGQ C;  1LZE A;  1QUT A;  2DQD Y;  4GN3 A;  1RCM A;  5DM9 A;  5F14 A;  4GCB A;  5HQ1 A;  4LFX A;  1REX A;  194L A;  1QDR A;  1F0W A;  3IJV A;  1WQQ A;  5KXX A;  1XFP L;  3AW6 A;  1LSD A;  5KXR A;  4H90 A;  1JUG A;  1B5Y A;  1IP2 A;  2MEF A;  5LA5 A;  1SLY A;  1GF6 A;  2CWI A;  4GLV A;  3HBH A;  1OUF A;  4X3B A;  4TUN A;  4LFP A;  5E4P A;  1OUE A;  3RT5 X;  3J4G A;  5EBH A;  1JEF A;  3P4Z A;  1BB5 A;  4PPO A;  4DT3 A;  5I54 A;  2CDS A;  207L A;  2Z19 A;  4ETD A;  2Z12 A;  1BVK C;  1H6M A;  5FST A;  1DKK A;  1TBY A;  4ETA A;  1LZ1 A;  1IP5 A;  135L A;  1KIR C;  1VDQ A;  2N5Z A;  3G3A B;  2DQA A;  3WUM A;  4DD2 A;  2Z2F A;  5B07 A;  5DL9 A;  1FLU A;  4NWE A;  1LYY A;  1LMQ A;  1HEL A;  2YBI A;  2HED A;  1QQY A;  4I8S A;  1LSA A;  4OWE A;  1IWW A;  3A67 Y;  2C8P A;  4B4E A;  1IY3 A;  1GB2 A;  1WTN A;  5T3F A;  1YIL A;  1GEV A;  5HNC A;  1CKF A;  1REZ A; 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 1D0L A;  2CGI A;  1BGI A;  1D6P A;  1LJJ A;  3ATN A;  1DZB X;  3TXI A;  1JKC A;  1XEI A;  4WM6 A;  2YBL A;  4CJ2 A;  1E8L A;  1JIY A;  1YAN A;  4IAT A;  3A95 A;  4AXT A;  1UIE A;  4NHT A;  1CJ9 A;  1GF3 A;  1HEP A;  2ZNX Y;  4OWA A;  2C8O A;  2Z37 A;  3LZT A;  4DD3 A;  4NIJ A;  9LYZ A;  1GDX A;  3LYZ A;  1LMT A;  2F4A A;  4MST A;  5LVJ A;  2ZNW Y;  3CT5 A;  1UIF A;  5F81 A;  1GBS A;  1QSW A;  4ETE A;  1B5Z A;  1YQV Y;  1IOS A;  1C45 A;  1P2C C;  1VDP A;  1G7H C;  1LJI A;  2NWD X;  2D4J A;  2HEF A;  1J1X Y;  2ZYC A;  3ATO A;  4N1C C;  2D4I A;  3CSQ A;  3EO5 A;  4NGY A;  1YKX X;  1GAY A;  3CSZ A;  3TMV A;  3WW5 A;  5A3Z A;  4R6C A;  3A3Q A;  1OUJ A;  2BQL A;  2Q0M X;  5I4X A;  4NHQ A;  4P2E A;  1FBI X;  4XEN A;  5FEL A;  3P66 A;  4WM1 A;  3LYT A;  1VAU A;  4LYB A;  2DBT A;  2EPE A;  4WM2 A;  1OP9 B;  4HJZ A;  3AGI A;  4PHI A;  1LPI A;  3TXF A;  1GB7 A;  4ETC A;  1G7L C;  4HPI A;  1LZ6 A;  1LZN A;  1RJC B;  4H8Z A;  4KXI A;  4NHI A;  4B4I A;  1VDS A;  4QEQ A;  2YBM A;  2FYD A;  1OUH A;  3AW7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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