4IJ4A

Crystal structure of a family gh19 chitinase from bryum coronatum in complex with (glcnac)4
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
204
structure length
203
Chain Sequence
SWTSFVTPAVFEGWFPNRNPFYTYDGLVSASNGYPEFGTTGSLDDQKRELAAFLGNINQASGGLQFIQEQNPSDYCDTSSTQYPCAAGKQYYGRGPIQLSWNYNYGEAGADLGLDLLNNPDLVAQDSTVAWRTALWFWMKRDCHGAITASPPSFSGTIRIINGGLECNQPAGSIGNMQMENRVTYYTQFCQTLGVDPGTDLRC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a "loopless" GH19 chitinase in complex with chitin tetrasaccharide spanning the catalytic center
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Bryum coronatum
molecule keywords Chitinase A
total genus 72
structure length 203
sequence length 204
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4ij4A01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 4ij4A02
5E9RA 4AXTA 1E8LA 2ZILA 2EKSC 1EL1A 1F6RA 1NMMA 1UIBA 1LHMA 4P2EA 4KL7A 4YOPA 2XTHA 1IO5A 1LMNA 4TUNA 1JKAA 3A90A 1HFXA 2BLYA 5KXYA 1UBZA 1JHLA 1HC0A 3EBAB 2HEEA 1IOQA 4OW1A 1OUGA 2ZIJA 2BLXA 1GB5A 4OWBA 4DD3A 1LJHA 2CJLA 1DKJA 3TXBA 1HEOA 2BQKA 1XGPC 1C10A 4HJYA 4LT1A 4NWHA 3QY4A 4QY9A 2BQMA 4IATA 5KKIA 1GF4A 1BB5A 2MEHA 4H8YA 1YKXX 3B6LA 1LMOA 3B0KA 4WM1A 3WW5A 2BPUA 5IHGA 5KXRA 2YDGA 4G9SA 4HSFA 3W6FA 2NWDX 4CJ2A 1GF5A 4WL6A 2H9KA 4NHPA 4DYGA 5LINA 1DI5A 3W6DA 2BQIA 4GN4A 1QSWA 4IASA 4YENA 5DL9A 5LYZA 4DDAA 2Z2EA 4ET8A 4GCEA 2IFFY 5I54A 4GLAA 3RU5A 3AGHA 5L3HA 1JISA 1JUGA 3A94A 1IWZA 4G4CA 4WO9A 5B1FA 4OWAA 1LZ6A 4NHIA 4H91A 3GXRA 1LMQA 1UACY 3TMXA 1GDXA 1T3PA 5LVGA 1LJEA 1FN5A 1KXYA 3K3TA 3SP3A 1C46A 4Z3MA 3LYZA 3N9AA 1LZSA 1GBZA 1GE1A 1WQNA 3EXDA 1GF6A 3A67Y 2B5ZA 2DQDY 1EQEA 3AGGG 1LSGA 4LGKA 1AT6A 4TTDA 3CT0A 1IOTA 1NHEA 5KXZA 3WXTA 1LOZA 3W6CA 132LA 1HFZA 1B2KA 4OWEA 1OUHA 1GHLA 4B4EA 1J1XY 1MELL 1KXWA 5FCPA 1GEZA 1LYZA 1JTOL 2HEDA 4WM6A 2MECA 5LXWA 5L3IA 4WOAA 3AZ5A 3P66A 3AZ4A 5I4XA 3RZ4A 1LJJA 3B0IA 1JSFA 1LJKA 1IR8A 1JKBA 1TAYA 4NIJA 5B06A 1CJ6A 2XJWA 1LZYA 1UUZC 4XADA 5KXSA 1FLUA 1GAZA 2ZYPA 3A93A 1BVXA 1C43A 2Q0MX 1GFEA 4G4BA 1PZYA 3AYQA 4CFPA 134LA 4WM2A 4PGJB 1GB7A 1LKRA 1IC4Y 4TSCA 1LHHA 2MEFA 1BGIA 3LYTA 3AZ7A 1FBIX 4NGLA 1CNSA 1GFKA 1HMLA 2BQNA 2LZTA 1REMA 4HV1A 4NSJA 1NQIA 4H9EA 1BQLY 2HU1A 1HNLA 1C7PA 1UIHA 1GFHA 2LYZA 4GN5C 5KJ9A 5KXKA 208LA 1GB6A 4TWSA 3RW8A 3CT1A 4FJRA 1VEDA 2ZNXY 1LSMA 1OUIA 4J1BA 1JKDA 1N4FA 5F9XA 1LSNA 1UIFA 3WW6A 3CQLA 3RNXA 2I26L 5FSTA 1Z55A 1JSEA 5II3A 4Z46A 1DI3A 2YBJA 3WU9A 3WULA 1NBZC 1DI4A 2BQLA 2HUBA 1XGRC 2MEBA 2F30A 5FELA 1B9OA 2MEAA 1YAMA 1XEJA 1GAYA 4NGKA 4M6DA 5B59A 1JJ3A 4ETAA 1XGTC 3ZVQA 1XGUC 4MSTA 2DQEY 3W6EA 1IP5A 1B7NA 4NG1A 1JITA 2D4JA 1IOCA 4DT3A 2I6ZA 2WARA 4NSGA 1TEWA 4HTQA 4PPOA 1UIDA 1GB2A 1LHIA 4H8ZA 1DQJC 1BVKC 1OUJA 3W6AA 4RDSA 1CJ7A 3A6CY 3A92A 5JENB 1REXA 1RI8B 4H9HA 2DQHY 4LYOA 4B4JA 5C6LA 5APEA 5LAFA 3OK0A 4QGZA 4TSBA 1VDTA 1RJCB 1RCMA 3ZEKA 2Z2FA 1REYA 1YKYX 1MLCE 3AZ6A 1KXXA 3J4GA 1A2YC 1D0KA 3IJUA 3M3UA 4H90A 4H8XA 4NHTA 5F16A 1B7SA 1LZ1A 4W96A 4H93A 2A7DA 1OUFA 1EQ5A 1GFUA 4ETEA 3TXKA 4XYYA 3P64A 4A7DA 2YBHA 4DDCA 4H94A 2DBTA 4WLXA 1LHJA 2EQLA 2BQOA 4N0JA 4CHXA 1LCNA 1B5YA 4BAPA 5KXMA 5KXXA 1CKDA 4II8A 2F4AA 1LHKA 1FKQA 3CSRA 1REZA 5LVHA 1IWVA 135LA 5DN4A 1F0WA 3HBDA 1LMAA 4RW1A 1IP4A 5F9UA 1G7LC 2W1XA 3TMUA 3P4ZA 1LSZA 194LA 2MEDA 1NWGA 2BQHA 4GCDA 2D4KA 2GV0A 4KXIA 4LYMA 5F81A 4DD9A 1LZ4A 1LZBA 1LSEA 1LKSA 2ZNWY 1LPIA 9LYZA 4WLYA 3A34A 1BWIA 3EO5A 1IVMA 4WM5A 1IWYA 4NHSA 1LZDA 1A4VA 1LZTA 1LZAA 5T3FA 3A91A 1B5WA 3HBEX 1GB3A 1DPWA 4HPIA 3WL2A 1WVVA 5DM9A 1XSFA 4WM3A 1INUA 3WUNA 1FKVA 5ILFA 1IWXA 2BQAA 1B7RA 4NG8A 4H9FA 1DPXA 3AW7A 2XBRA 5KXPA 5LAGA 1V7TA 1LZ5A 1QUSA 1G7JC 1ZV5L 1GF9A 4RLNA 1LHLA 4WG1A 5AMYA 3AGIA 3A6BY 5LVJA 1HEWA 5ILCA 4WLDA 1XFPL 1UA6Y 1JPOA 4BADA 1OUAA 2Z19A 3T6UA 5I4YA 4B1AA 1GB8A 1B5VA 2DQCY 4YF2A 4OWHA 1WTMA 1D6PA 3WU7A 1LMTA 1LZNA 1FLYA 2YVBA 1NBYC 2Y8PA 4YEOA 1IP3A 4ANRA 2Z12A 3WXUA 4C3WA 1LSPA 1ALCA 1IP6A 1DXJA 4DC4A 5KKJA 4N5RA 3WU8A 1B7PA 3M18B 5D5CA 1HFYA 1HSWA 2FBBA 3FE0A 1GBWA 1GPQC 1EQ4A 7LYZA 3G3AB 4RW2A 3W3EA 4BS7A 1LJ4A 3LZTA 2DQFC 3LHMA 4CGEA 3A96A 3HFMY 5KXOA 1BB7A 1KIRC 4YM8A 4J1AA 4WO6A 2D6BA 1UCOA 1GBYA 5LA8A 3WVYA 3A3RX 2Z38A 5KXTA 5HMJA 4MR1A 4NGJA 1VFBC 5B07A 4DD1A 1LJFA 2EIZC 3E3DA 5LVIA 3VWOA 1GF8A 1LZ8A 1P2CC 1QTKA 2XBSA 3TXGA 1GFGA 1RFPA 4KT3A 4ZEEA 1GB9A 1LMPA 1LYSA 1HF4A 2Z39A 4NY5A 3TXIA 3LZ2A 193LA 4NSHA 1VAUA 1JEFA 3WPLA 4DDBA 3W6BA 3AB6A 2LHMA 2BQBA 3D9AC 1ZVYB 1IP1A 4D9ZA 3QE8A 4NGIA 1AT5A 1QDRA 5EBHA 2RSCA 1BWHA 1LAAA 2F2NA 3CB7A 1YAQA 4O34A 1NF5A 3MGWA 4LYTA 3WMKA 4NEBA 1F10A 3TXHA 2C8PA 5KXLA 1WTNA 3A8ZA 3WYHA 4H9AA 3T36A 3N9CA 2W1MA 4M4OA 2Z18A 2F4GA 1IY3A 1SLYA 3LYOA 5A3ZA 1I56A 1YAOA 4N9RA 5HNCA 1IEEA 1LSCA 1IWTA 1HEMA 4LYCA 4CFOA 1IIZA 2ZQ3A 1QUTA 5LA5A 4H9BA 5IELA 1IORA 5FDJA 5HLLA 1CKCA 4H1PA 5HQ1A 1YANA 1GBOA 1OUBA 1BB6A 1SQ2L 1QTEA 1RE2A 2HU3A 2YBMA 4KPMA 2YBNA 1AM7A 3GXKA 2FYDA 2N5ZA 1CKHA 4LYBA 1LTMA 1LJ3A 1GWDA 1GFRA 1B7MA 1D0LA 2Z37A 4E3UA 4DWXA 1NDGC 4DD0A 1DKKA 4NSIA 1FDLY 1CKFA 1LYOA 2G4PA 2G4QA 2ZQ4A 4PHIA 1NDMC 2LYOA 3AW6A 3N9EA 5DN5A 5HMVA 2MEEA 2MEGA 4ETDA 1GXV2 1UIAA 2I25L 3QNGA 1XGQC 4ETCA 1I1ZA 1GB0A 1DZBX 1JKCA 1OUDA 1D9UA 1LJNA 1UIEA 4W94A 4EOFA 2LZ2A 2HEBA 5C6JA 1C45A 1B0DA 4HJVA 1LSYA 1QDTA 1VDSA 2CDSA 1BWJA 2PC2A 3BKHA 4NGWA 4XJGA 1TBYA 4NGOA 3BKVA 4XENA 3TMVA 4MCKA 1XEIA 4QEQA 3AJNA 2DQIY 4HPEA 4WMGA 1HEQA 4DD2A 3OJPA 6LYZA 1H6MA 1VATA 2DQJY 1BB3A 2YBLA 4OWCA 4WG7A 4FDYA 1O23A 5APDA 8LYZA 2BQEA 4YEMA 4B49A 1WQPA 1WQQA 1F6SA 5KXWA 1KIQC 1GEVA 1JWRA 4R0FA 2H9JA 1IC5Y 1CJ9A 5J7CA 3ATNA 1GXXA 1B5UA 4ML7A 5C6IA 1GBSA 2H5ZA 2LYMA 2ZYCA 4I8SA 5LYMA 3WH1A 5I4WA 2BQCA 3IJVA 4B4IA 1LZEA 1ZMYL 4PJ2C 2BQDA 3CT5A 5F14A 5B1GA 1YROA 1GD6A 1BB4A 4RLMA 3B72A 1VDPA 2CGIA 2ZWBA 1TCYA 1LZRA 1GE3A 1HELA 4GN3A 1LSFA 3LYMA 4LYZA 2HECA 4UWUA 2FBDA 2FYCA 4TX7A 4UWNA 5LIOA 3WUMA 4ZIXA 1UICA 2C8OA 2DQGY 4HTKA 4ZFPA 4NFVA 4B0DA 5A3EA 3TXDA 4XJHA 2IHLA 1NKHA 4I0CA 4N1CC 4H9CA 4LT2A 1LJGA 4XN6A 1I20A 1W08A 3A3QA 4ETBA 1LYYA 4H92A 1HHLA 4C5FA 2CWIA 1LZGA 1AZFA 3EMSA 3WVXA 2YBIA 1OP9B 1OUEA 4AGAA 5IDDA 4LZTA 1H87A 1WQMA 1QQYA 4R6CA 1C08C 4OOOA 4J0LA 4ET9A 1XEKA 1B7LA 2DKVA 4XJDA 5FEKA 4LFXA 5KXNA 1VDQA 1ZVHL 4BAFA 1IC7Y 1GFAA 1B5XA 2EPEA 1PS5A 4HTNA 1GE2A 1YILA 1IR7A 2BQJA 2HTXA 4H9IA 1IWWA 1LSAA 1LSDA 1GE4A 4X3BA 1UIGA 3IWRA 4XJBA 4NGVA 2X0AA 4Z98A 1LZCA 5B05A 4N8ZA 1FLWA 4WM4A 1GF3A 1YQVY 1IR9A 2DQAA 3ATOA 1B7QA 4N1EI 4WL7A 1GFTA 4NGYA 4HJZA 2D91A 3TXJA 3P68A 1D6QA 6LYTA 5I5QA 4PRUA 1QSAA 4G4HA 5DLAA 1UC0A 3ZVQB 5HNLA 2HEFA 2W1YA 1OUCA 1GFVA 1JTTL 4NHQA 3TXFA 1LZ9A 1HENA 2MEIA 1JIYA 5I53A 1IY4A 4HV2A 4XJFA 4XJIA 1CKGA 1AKIA 4Z41A 1D0MA 1IOSA 5APCA 5L9JA 1G7HC 5D5FA 3A95A 3KAMA 1T6VL 1J1OY 4G49A 5K7OA 1JTPL 1IP2A 3RT5X 1GE0A 2A7FA 1HEPA 3G3BB 3TXEA 3J6KA 1HERA 1KIPC 1B5ZA 3P65A 1IWUA 4EMNA 4LFPA 1CJ8A 1IP7A 2HEAA 3D3DA 2ZIKA 2AUBA 4NWEA 1YIKA 133LA 2BQFA 2W1LA 1FLQA 2BAAA 1LJIA 3LN2A 5E4PA 1GDWA 2YSSC 3ULRA 1YKZX 1WQRA 1LMCA 1YL0X 4U3XB 1GF7A 3B0OA 4WLTA 2G4NA 2VB1A 4GCFA 1IX0A 1JJ0A 3TMWA 3CSQA 3HBHA 1OQMA 5M1YA 1GFJA 1HSXA 1LSBA 2BQGA 3FI7A 1JJ1A 3F6ZA 4LT0A 3WPJA 4PRQA 4IJ4A 3WPKA 1YAPA 4QDNA 4J7VA 5LVKA 1W6ZA 1WQOA 207LA 1J1PY 3CSZA 3WUAA 154LA 1B7OA 1QIOA 5LYTA 1HMKA 1G7MC 1V7SA 1WVUA 4GLVA 4OOTA 5APFA 1GBXA 4LT3A 4L41A 4GCBA 1BHZA 4NGZA 4HP0A 4GCCA 4UWVA 5KY1A 1YL1X 5FHWA 2D4IA 1TDYA 153LA 4DD7A 1G7IC 1GF0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1E8LA 1EL1A 4YOPA 1LMNA 5KXYA 1CUQA 1DYFA 2BLXA 1GB5A 1L61A 3NYAA 1SX2A 1HEOA 1QTHA 4HJYA 1GF4A 1LWKA 4H8YA 1L06A 4EKPA 3B6LA 4WM1A 3G3VA 2YDGA 130LA 3W6FA 2NWDX 2H9KA 5LINA 1L04A 1DI5A 1QSWA 4DDAA 123LA 2IFFY 1L23A 1JISA 1JUGA 2OE9X 4NHIA 1L77A 1T97A 229LA 1UACY 3TMXA 1CX7A 5LVGA 3C81A 1KXYA 3LYZA 3N9AA 1C6CA 3EXDA 1WQNA 3CT0A 1IOTA 5KXZA 3WXTA 1HFZA 1B2KA 1J1XY 5L3IA 3AZ5A 1LGXA 5I4XA 2OE7X 1JSFA 233LA 1JKBA 1XJTA 4NIJA 1CJ6A 1LYGA 1LZYA 1D3MA 1FLUA 4G4BA 2Q0MX 1L82A 139LA 4PGJB 1LKRA 1IC4Y 1L75A 138LA 1FBIX 1CNSA 1BQLY 5KJ9A 2LZMA 3PDSA 1QUOA 4FJRA 4TWSA 4J1BA 1LSNA 1UIFA 235LA 1JSEA 4I7MA 1DI3A 1DI4A 186LA 2BQLA 4PJZA 1XGRC 1B9OA 2MEAA 1XEJA 1GAYA 4NGKA 5B59A 1JJ3A 1XGTC 4MSTA 1IP5A 1UIDA 3NY8A 1P6YA 192LA 1REXA 4H9HA 4QGZA 4TSBA 1YKYX 3AZ6A 1KXXA 3IJUA 1L65A 4W96A 4H93A 2CUUA 3HDEA 2YBHA 2DBTA 1LHJA 1L44A 2EQLA 5KXMA 4W58A 1CTWA 1LHKA 1FKQA 1L36A 1REZA 3HBDA 1QS9A 1LMAA 4RW1A 5F9UA 2W1XA 2MEDA 142LA 1CV0A 2BQHA 5F81A 4LYMA 2ZNWY 1LZBA 1LPIA 4W59A 1OVJA 3A34A 3EO5A 1IWYA 4NHSA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5E9R A;  4AXT A;  1E8L A;  2ZIL A;  2EKS C;  1EL1 A;  1F6R A;  1NMM A;  1UIB A;  1LHM A;  4P2E A;  4KL7 A;  4YOP A;  2XTH A;  1IO5 A;  1LMN A;  4TUN A;  1JKA A;  3A90 A;  1HFX A;  2BLY A;  5KXY A;  1UBZ A;  1JHL A;  1HC0 A;  3EBA B;  2HEE A;  1IOQ A;  4OW1 A;  1OUG A;  2ZIJ A;  2BLX A;  1GB5 A;  4OWB A;  4DD3 A;  1LJH A;  2CJL A;  1DKJ A;  3TXB A;  1HEO A;  2BQK A;  1XGP C;  1C10 A;  4HJY A;  4LT1 A;  4NWH A;  3QY4 A;  4QY9 A;  2BQM A;  4IAT A;  5KKI A;  1GF4 A;  1BB5 A;  2MEH A;  4H8Y A;  1YKX X;  3B6L A;  1LMO A;  3B0K A;  4WM1 A;  3WW5 A;  2BPU A;  5IHG A;  5KXR A;  2YDG A;  4G9S A;  4HSF A;  3W6F A;  2NWD X;  4CJ2 A;  1GF5 A;  4WL6 A;  2H9K A;  4NHP A;  4DYG A;  5LIN A;  1DI5 A;  3W6D A;  2BQI A;  4GN4 A;  1QSW A;  4IAS A;  4YEN A;  5DL9 A;  5LYZ A;  4DDA A;  2Z2E A;  4ET8 A;  4GCE A;  2IFF Y;  5I54 A;  4GLA A;  3RU5 A;  3AGH A;  5L3H A;  1JIS A;  1JUG A;  3A94 A;  1IWZ A;  4G4C A;  4WO9 A;  5B1F A;  4OWA A;  1LZ6 A;  4NHI A;  4H91 A;  3GXR A;  1LMQ A;  1UAC Y;  3TMX A;  1GDX A;  1T3P A; 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 2D91 A;  3TXJ A;  3P68 A;  1D6Q A;  6LYT A;  5I5Q A;  4PRU A;  1QSA A;  4G4H A;  5DLA A;  1UC0 A;  3ZVQ B;  5HNL A;  2HEF A;  2W1Y A;  1OUC A;  1GFV A;  1JTT L;  4NHQ A;  3TXF A;  1LZ9 A;  1HEN A;  2MEI A;  1JIY A;  5I53 A;  1IY4 A;  4HV2 A;  4XJF A;  4XJI A;  1CKG A;  1AKI A;  4Z41 A;  1D0M A;  1IOS A;  5APC A;  5L9J A;  1G7H C;  5D5F A;  3A95 A;  3KAM A;  1T6V L;  1J1O Y;  4G49 A;  5K7O A;  1JTP L;  1IP2 A;  3RT5 X;  1GE0 A;  2A7F A;  1HEP A;  3G3B B;  3TXE A;  3J6K A;  1HER A;  1KIP C;  1B5Z A;  3P65 A;  1IWU A;  4EMN A;  4LFP A;  1CJ8 A;  1IP7 A;  2HEA A;  3D3D A;  2ZIK A;  2AUB A;  4NWE A;  1YIK A;  133L A;  2BQF A;  2W1L A;  1FLQ A;  2BAA A;  1LJI A;  3LN2 A;  5E4P A;  1GDW A;  2YSS C;  3ULR A;  1YKZ X;  1WQR A;  1LMC A;  1YL0 X;  4U3X B;  1GF7 A;  3B0O A;  4WLT A;  2G4N A;  2VB1 A;  4GCF A;  1IX0 A;  1JJ0 A;  3TMW A;  3CSQ A;  3HBH A;  1OQM A;  5M1Y A;  1GFJ A;  1HSX A;  1LSB A;  2BQG A;  3FI7 A;  1JJ1 A;  3F6Z A;  4LT0 A;  3WPJ A;  4PRQ A;  4IJ4 A;  3WPK A;  1YAP A;  4QDN A;  4J7V A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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