4J1AA

X-ray structure of the adduct between hen egg white lysozyme and aziru (green crystal)
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Interaction of Anticancer Ruthenium Compounds with Proteins: High-Resolution X-ray Structures and Raman Microscopy Studies of the Adduct between Hen Egg White Lysozyme and AziRu.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-02-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4j1aA00
1GF5A 2D4KA 3P68A 5KXYA 4XADA 3AZ5A 5KXZA 1XEIA 4WM6A 5LA8A 1CKFA 1GB2A 3D3DA 1IR9A 1LAAA 3TXIA 1IP2A 1GFEA 2BQCA 5L9JA 3N9CA 1YAMA 4H1PA 4HV1A 4ET8A 1UIAA 2Z19A 5DM9A 4DWXA 3AZ4A 1IWTA 3AGIA 2H9JA 3A34A 1BVKC 4XJDA 4DD1A 4H8XA 1T3PA 3CB7A 3TMUA 3FI7A 1HEPA 4IJ4A 4YEOA 5J7CA 1LJGA 4HSFA 2F4AA 2BLYA 4WO9A 4NY5A 4D9ZA 2D6BA 1GF7A 4H9EA 2C8OA 2BQOA 4DYGA 1B2KA 2VB1A 2DBTA 4H8YA 4NHSA 5F9UA 3WYHA 3J4GA 1ZVYB 154LA 5LIOA 4H93A 1WQNA 3LHMA 4NGYA 4NG1A 5FCPA 4H9FA 1CKCA 2BPUA 2EKSC 4H9HA 5LVJA 2HU1A 4GN5C 6LYTA 5KXXA 4H9BA 2YVBA 1FLWA 1NMMA 1LJHA 3LYOA 2LYMA 1I20A 1I1ZA 2BQMA 1OP9B 1UACY 4NHQA 3LN2A 2ZWBA 4OW1A 1OUDA 1HFXA 1BB3A 2Z38A 4LT2A 1J1OY 2Z39A 1LJ4A 2MEAA 4PRQA 1LHJA 4WM3A 1B7NA 4AXTA 2DQFC 4LGKA 4YEMA 1BB5A 1YANA 4J0LA 1GFJA 1LSYA 2Z18A 4ETDA 1IEEA 1XGTC 2HECA 2W1LA 3A90A 3A8ZA 1NWGA 1GAYA 1UIEA 4TSBA 2MEFA 4KPMA 1LZ8A 1LZCA 1LSBA 5LAFA 4DDAA 3IJVA 4GLAA 2Z2FA 1GHLA 4HJYA 1HNLA 1B5WA 1LHKA 3WULA 1B5UA 1H87A 2LZ2A 1F6RA 4E3UA 1LMOA 2CWIA 4H9CA 4DD3A 1KIQC 6LYZA 1OQMA 4PGJB 4GCFA 1OUGA 5E9RA 4LYBA 1NKHA 2MECA 193LA 1GB3A 2DQDY 4N1CC 3HBEX 5F14A 5KXLA 1LYOA 1IC5Y 1LJJA 1VATA 2MEGA 4TTDA 3CSZA 4WLXA 5IHGA 4KT3A 1UCOA 4AGAA 5FSTA 4J7VA 5I4WA 4CJ2A 4NSHA 5B1GA 5KXTA 1RCMA 2Z12A 3LZTA 4FDYA 1HSWA 2F2NA 4NWHA 3B6LA 2W1MA 1GE3A 4XJHA 4EOFA 2DQAA 3QY4A 1GEVA 4BAPA 3LYZA 4RLNA 4ETAA 1LMTA 1LMPA 2D4IA 3RNXA 5FDJA 1JJ1A 2F30A 4XENA 8LYZA 1QSAA 1RJCB 1JITA 3RW8A 2W1YA 5A3ZA 1AT5A 1LSDA 1LZ6A 1JUGA 4QY9A 3TXHA 4PRUA 4H92A 3VWOA 3TXDA 4UWUA 1GF9A 5LA5A 3WUNA 1JKBA 1GE0A 4PJ2C 4M4OA 1IWZA 2FBBA 4NHTA 2BQNA 5II3A 1BGIA 2HEBA 4LT1A 1HC0A 1LSMA 3QNGA 1LZYA 4TWSA 4C5FA 3M18B 1GWDA 1HENA 1OUHA 1REZA 3A92A 4WLYA 4LFPA 2YSSC 4WM1A 3N9EA 4NGWA 4TX7A 5LYMA 2ZNXY 1KXWA 1YKZX 1PZYA 4I0CA 4B49A 5I4YA 1D6QA 1GXV2 1BB4A 5KJ9A 5APCA 3QE8A 2XTHA 1KXXA 1SLYA 1QDTA 4CGEA 1GBSA 1GB9A 4ZFPA 1INUA 1ZV5L 1CJ8A 3B0IA 1GEZA 1LZTA 4LT3A 1WTMA 3W6CA 4P2EA 5C6LA 1IP4A 4Z98A 1LHHA 2F4GA 4MSTA 5APDA 5HQ1A 1DKKA 1H6MA 4OWHA 4HJVA 4DC4A 2YBJA 1FBIX 1FLYA 1XFPL 1YAPA 5E4PA 4LYOA 4NGOA 1IVMA 3K3TA 1GD6A 1AT6A 1QUTA 4H91A 1UUZC 2HEDA 1JTTL 1FLUA 1B9OA 1HEMA 4UWVA 4OWAA 2IHLA 3TXBA 2HEEA 1ZVHL 2BLXA 4KXIA 5KXWA 1GFAA 1EQ5A 4B0DA 1GE1A 3EBAB 4HTNA 4NGLA 4BS7A 4DD7A 5B59A 4HJZA 5KXNA 3WU7A 1HEQA 1HEOA 3A6CY 4X3BA 1EQ4A 1DI3A 1GF0A 1Z55A 4W94A 2HEAA 4B1AA 2GV0A 2YBLA 1GB5A 3W6FA 2DKVA 2IFFY 5KXRA 1GF6A 1G7JC 1SQ2L 1QTEA 4GN4A 4WL6A 2HU3A 3W3EA 4UWNA 1XSFA 1VEDA 2DQIY 4XJBA 2BQLA 1GE4A 4LYCA 1YL0X 4HP0A 1YILA 4NGIA 3BKVA 1B7PA 1WVVA 1FLQA 4XJIA 3AGHA 4MCKA 4YM8A 3EMSA 3TXGA 4YOPA 4OOTA 1GBXA 5LVKA 2B5ZA 1GFRA 3WH1A 2PC2A 1AKIA 1IOSA 3HFMY 1BWIA 2BQIA 3D9AC 1IX0A 4RDSA 1JKDA 1GFVA 4XN6A 5LAGA 1GAZA 1UA6Y 5I5QA 4H94A 2ZILA 4WLTA 1IWYA 1YQVY 4DD2A 1W08A 5B07A 4GN3A 1JHLA 1W6ZA 3LYTA 1LSFA 2XBRA 2C8PA 3T36A 2XJWA 1B7LA 4NFVA 4NWEA 1NBZC 2N5ZA 5KXPA 1BB7A 1XGPC 5KKIA 3W6DA 1OUBA 1B7MA 5HLLA 4U3XB 3TXEA 1DXJA 4HPEA 2CDSA 4PHIA 1C10A 1HERA 1RI8B 3A94A 1YKXX 4WMGA 1WQMA 1G7HC 5DN5A 2MEEA 1TCYA 4WOAA 1TAYA 5DLAA 5KXMA 2MEBA 1LZBA 1D0LA 1LJFA 1B5VA 1GFHA 4NGJA 1LZ1A 5JENB 1B5ZA 1IOQA 1LHMA 1LSNA 3TMVA 3T6UA 1NDGC 1HELA 1ALCA 1LZGA 1KIRC 3ATOA 1DI4A 1VDSA 3WPLA 2BQGA 1LZNA 3IJUA 4LT0A 4OWEA 1QSWA 5B05A 3A3QA 1PS5A 1CKGA 1C08C 2W1XA 3AB6A 5KXOA 1IWWA 3WMKA 5KXKA 1OUFA 1VDPA 1FKVA 3HBDA 4HTQA 4DDCA 5K7OA 3KAMA 4OWBA 5D5FA 1WQPA 3TXKA 4HTKA 5I53A 1UIHA 1GF4A 1HFZA 3FE0A 1JISA 1BQLY 2ZIJA 1WTNA 1F6SA 3A95A 4LZTA 132LA 1BVXA 1DPWA 3WPJA 3AW7A 5F9XA 1QUSA 133LA 1UBZA 1BHZA 1HF4A 1WQQA 3ZEKA 1GBWA 5EBHA 1JSEA 3CQLA 7LYZA 3OK0A 1HEWA 1D0KA 1LZ4A 134LA 4N8ZA 1LJNA 4NGVA 1LKRA 1IC7Y 2A7FA 4XYYA 2BAAA 3WU9A 4FJRA 5FHWA 1GFGA 1IP1A 1WQOA 1LYZA 4WM2A 1HMLA 4GCCA 1N4FA 4NHIA 2BQKA 2BQHA 1NHEA 1BWJA 1OUJA 3B72A 5C6IA 1UICA 1B7SA 1FDLY 2DQHY 3W6EA 2G4NA 1JJ3A 5F16A 1IOCA 1IOTA 1KIPC 2YDGA 4BADA 4ET9A 1OUCA 1UIGA 1GF3A 4HV2A 1V7SA 1T6VL 1DKJA 1LJ3A 4N1EI 4J1AA 3MGWA 3ULRA 3WPKA 1JEFA 1B7QA 3HBHA 3A6BY 1IP3A 1LTMA 1GE2A 1JTOL 3CT5A 5KKJA 1IY3A 2FYCA 5M1YA 1GB7A 5LINA 1IWXA 5F81A 2G4QA 1LZRA 1O23A 4NSIA 5HNLA 5D5CA 3P4ZA 1IORA 1IR8A 1GF8A 4NEBA 2YBMA 4Z3MA 3BKHA 3AYQA 4G9SA 1A2YC 2DQEY 3WW5A 1CJ6A 2DQGY 3F6ZA 3SP3A 1XGUC 5B06A 2HEFA 4NGZA 2BQDA 4GCEA 3TMWA 1REYA 2I25L 3AW6A 4A7DA 4ETEA 4WL7A 4C3WA 5HMJA 1QTKA 135LA 2LZTA 1CKDA 4G49A 4CHXA 1NF5A 1LZDA 4LYMA 3CSRA 1LMQA 5L3IA 4GLVA 1B7OA 3AZ7A 1DI5A 3EO5A 1LSEA 4LYTA 4CFPA 4XJFA 2Z2EA 3EXDA 1HHLA 1MLCE 1WQRA 5LVIA 3LZ2A 3AGGG 4WM4A 3GXKA 2A7DA 5IDDA 4QDNA 2MEIA 1F0WA 2G4PA 4WO6A 1CNSA 1IC4Y 1AZFA 2ZYPA 4M6DA 3WVXA 1V7TA 1JTPL 1GB6A 5DN4A 1QIOA 5L3HA 2WARA 1WVUA 2BQFA 4HPIA 2Z37A 4G4HA 1GBZA 2CGIA 2LYOA 1LHIA 1D9UA 1BWHA 3N9AA 3RZ4A 1IP5A 1BB6A 2H9KA 1MELL 4WG7A 2DQJY 1LOZA 4QGZA 1LYSA 4LFXA 4MR1A 2ZIKA 1XGQC 2X0AA 1B5XA 2I26L 1GFKA 5FEKA 207LA 1B0DA 1RFPA 4R0FA 153LA 1LMCA 1LMAA 1IO5A 1B5YA 4RLMA 1VAUA 3CT1A 1AM7A 3CT0A 1GB8A 3AZ6A 1EQEA 1UIFA 1TDYA 3ZVQA 4RW1A 1TBYA 4ZIXA 4R6CA 4B4IA 5APFA 1HFYA 1C43A 4O34A 4W96A 1JKCA 2EPEA 4I8SA 1GB0A 1LHLA 4J1BA 1LKSA 5I4XA 1G7LC 2CJLA 4N9RA 1F10A 4YF2A 2ZYCA 4BAFA 4DD0A 1YROA 5LYZA 4OOOA 4PPOA 3WU8A 3M3UA 1IP7A 2AUBA 1VDQA 3LYMA 3WVYA 1QQYA 2RSCA 5ILCA 3WW6A 2Y8PA 1JIYA 4KL7A 1REXA 3RT5X 1LJKA 4H9AA 1CJ7A 1LZSA 3W6AA 4IATA 2Q0MX 1GFUA 2ZNWY 1OUEA 3WL2A 1UIBA 5KXSA 4II8A 4OWCA 1YAQA 2FBDA 2BQJA 1JKAA 3TMXA 2MEDA 1LCNA 2LHMA 3TXFA 1IWUA 1LZ5A 5LVGA 1C46A 1LJEA 1LPIA 5LVHA 1DQJC 1NBYC 1VDTA 2EQLA 4EMNA 4Z41A 3A93A 1RE2A 1LYYA 2BQEA 2H5ZA 1JJ0A 1GXXA 1LZ9A 1QDRA 1XEJA 3A67Y 3IWRA 5APEA 1G7IC 1IR7A 4ML7A 5ILFA 3G3AB 1GFTA 2LYZA 3E3DA 5C6JA 3P64A 3TXJA 3G3BB 3B0KA 1FN5A 2XBSA 4G4CA 194LA 4RW2A 4DT3A 1REMA 1YL1X 4H8ZA 1TEWA 3ATNA 1UC0A 2BQBA 4H9IA 5LYTA 1LMNA 3AJNA 4N5RA 3RU5A 4G4BA 5B1FA 1CKHA 3A3RX 1A4VA 3P66A 1XEKA 5HMVA 3W6BA 3WUAA 1UIDA 1LSAA 1ZMYL 2FYDA 4TUNA 1NQIA 5A3EA 4YENA 3A96A 5KY1A 1NDMC 1C45A 2D4JA 3GXRA 2D91A 4DDBA 1EL1A 1LSCA 5FELA 1LSZA 1KXYA 4NG8A 4ZEEA 1CJ9A 5I54A 1P2CC 4L41A 1G7MC 3J6KA 4DD9A 1B7RA 2EIZC 4WG1A 4LYZA 4NHPA 2DQCY 5AMYA 2MEHA 2ZQ4A 1E8LA 1IP6A 1LJIA 3CSQA 3P65A 2HUBA 3A91A 1J1XY 1FKQA 4NIJA 1OUIA 4NSGA 1GPQC 1IIZA 1DPXA 5DL9A 4B4JA 4N0JA 9LYZA 4ETCA 3ZVQB 1LZEA 2BQAA 1HMKA 2NWDX 4B4EA 4WM5A 1YKYX 5T3FA 4GCBA 1LZAA 1JPOA 2ZQ3A 3B0OA 1VFBC 3WXUA 1DZBX 4WLDA 5IELA 1YIKA 1I56A 4IASA 4NSJA 4ANRA 1OUAA 3WXTA 208LA 1HSXA 1D0MA 1LSPA 1IY4A 1YAOA 4Z46A 2YBNA 4CFOA 1C7PA 1JWRA 1IWVA 1XGRC 2HTXA 3OJPA 4ETBA 1D6PA 4NGKA 4TSCA 1JSFA 1GDWA 1GBYA 5LXWA 4QEQA 1LSGA 4GCDA 5HNCA 1GDXA 4XJGA 1J1PY 3WUMA 2YBIA 2I6ZA 1GBOA 4H90A 2YBHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2D4KA 2RH1A 5KXYA 3CDTA 5L9JA 1YAMA 5DM9A 3AZ4A 1IWTA 1OV7A 1KY1A 1LI6A 3A34A 1BVKC 1T3PA 4IJ4A 1HEPA 2F4AA 2BLYA 169LA 4NY5A 4WO9A 4D9ZA 2D6BA 1B2KA 4NHSA 4H8YA 154LA 5LIOA 3OE8A 4W53A 1CKCA 2EKSC 1CV5A 4H9HA 5KXXA 182LA 4H9BA 2YVBA 1NMMA 1LJHA 2LYMA 180LA 1I1ZA 4OW1A 1OUDA 1BB3A 1J1OY 2MEAA 4PRQA 1LYFA 140LA 3GULA 4ETDA 3A8ZA 4TSBA 1UIEA 1PQDA 3DN6A 3IJVA 1LW9A 2Z2FA 6LZMA 1GHLA 1HNLA 1LHKA 3HDFA 2LZ2A 1F6RA 1C6FA 2CWIA 261LA 1KIQC 4GCFA 2MECA 5KXLA 2IGCA 1LJJA 4WLXA 2MEGA 3JR6A 4AGAA 1LYHA 1L80A 5B1GA 176LA 1HSWA 2F2NA 2W1MA 3GUNA 1QUHA 1OVJA 4BAPA 1LMPA 3RNXA 3HTFA 148LE 5FDJA 1JJ1A 2F30A 214LA 3RW8A 5A3ZA 4QY9A 1JUGA 222LA 1GF9A 5LA5A 160LA 4NHTA 1G0JA 3GUOA 4ARQB 3M18B 1HENA 1C6QA 3HT9A 2YSSC 4I7SA 4WM1A 151LA 1CU3A 5I4YA 1L35A 1D3NA 1GB9A 3HH3A 4ZFPA 209LA 1LZTA 2F4GA 1DKKA 4HJVA 5E4PA 4LYOA 3K3TA 2HEDA 1B9OA 1C6GA 251LA 4OWAA 1EQ5A 1GE1A 183LA 4HTNA 3CDOA 216LA 1DYCA 1EPYA 1HEOA 3A6CY 1EQ4A 1L47A 1L81A 3W6FA 2IFFY 1GF6A 3W3EA 3CDVA 4UWNA 2OE4X 2DQIY 1VEDA 3SN6R 2BQLA 1GE4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GF5 A;  2D4K A;  3P68 A;  5KXY A;  4XAD A;  3AZ5 A;  5KXZ A;  1XEI A;  4WM6 A;  5LA8 A;  1CKF A;  1GB2 A;  3D3D A;  1IR9 A;  1LAA A;  3TXI A;  1IP2 A;  1GFE A;  2BQC A;  5L9J A;  3N9C A;  1YAM A;  4H1P A;  4HV1 A;  4ET8 A;  1UIA A;  2Z19 A;  5DM9 A;  4DWX A;  3AZ4 A;  1IWT A;  3AGI A;  2H9J A;  3A34 A;  1BVK C;  4XJD A;  4DD1 A;  4H8X A;  1T3P A;  3CB7 A;  3TMU A;  3FI7 A;  1HEP A;  4IJ4 A;  4YEO A;  5J7C A;  1LJG A;  4HSF A;  2F4A A;  2BLY A;  4WO9 A;  4NY5 A;  4D9Z A;  2D6B A;  1GF7 A;  4H9E A;  2C8O A;  2BQO A;  4DYG A;  1B2K A;  2VB1 A;  2DBT A;  4H8Y A;  4NHS A;  5F9U A;  3WYH A;  3J4G A;  1ZVY B;  154L A;  5LIO A;  4H93 A;  1WQN A;  3LHM A;  4NGY A;  4NG1 A;  5FCP A;  4H9F A;  1CKC A;  2BPU A;  2EKS C;  4H9H A;  5LVJ A;  2HU1 A;  4GN5 C;  6LYT A;  5KXX A;  4H9B A;  2YVB A;  1FLW A;  1NMM A;  1LJH A;  3LYO A;  2LYM A;  1I20 A;  1I1Z A;  2BQM A;  1OP9 B;  1UAC Y;  4NHQ A;  3LN2 A;  2ZWB A;  4OW1 A;  1OUD A;  1HFX A;  1BB3 A;  2Z38 A;  4LT2 A;  1J1O Y;  2Z39 A;  1LJ4 A;  2MEA A;  4PRQ A; 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 4G4C A;  194L A;  4RW2 A;  4DT3 A;  1REM A;  1YL1 X;  4H8Z A;  1TEW A;  3ATN A;  1UC0 A;  2BQB A;  4H9I A;  5LYT A;  1LMN A;  3AJN A;  4N5R A;  3RU5 A;  4G4B A;  5B1F A;  1CKH A;  3A3R X;  1A4V A;  3P66 A;  1XEK A;  5HMV A;  3W6B A;  3WUA A;  1UID A;  1LSA A;  1ZMY L;  2FYD A;  4TUN A;  1NQI A;  5A3E A;  4YEN A;  3A96 A;  5KY1 A;  1NDM C;  1C45 A;  2D4J A;  3GXR A;  2D91 A;  4DDB A;  1EL1 A;  1LSC A;  5FEL A;  1LSZ A;  1KXY A;  4NG8 A;  4ZEE A;  1CJ9 A;  5I54 A;  1P2C C;  4L41 A;  1G7M C;  3J6K A;  4DD9 A;  1B7R A;  2EIZ C;  4WG1 A;  4LYZ A;  4NHP A;  2DQC Y;  5AMY A;  2MEH A;  2ZQ4 A;  1E8L A;  1IP6 A;  1LJI A;  3CSQ A;  3P65 A;  2HUB A;  3A91 A;  1J1X Y;  1FKQ A;  4NIJ A;  1OUI A;  4NSG A;  1GPQ C;  1IIZ A;  1DPX A;  5DL9 A;  4B4J A;  4N0J A;  9LYZ A;  4ETC A;  3ZVQ B;  1LZE A;  2BQA A;  1HMK A;  2NWD X;  4B4E A;  4WM5 A;  1YKY X;  5T3F A;  4GCB A;  1LZA A;  1JPO A;  2ZQ3 A;  3B0O A;  1VFB C;  3WXU A;  1DZB X;  4WLD A;  5IEL A;  1YIK A;  1I56 A;  4IAS A;  4NSJ A;  4ANR A;  1OUA A;  3WXT A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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