4L41A

Human lactose synthase: a 2:1 complex between human alpha-lactalbumin and human beta1,4-galactosyltransferase
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
123
structure length
123
Chain Sequence
AKQFTKCELSQLLKDIDGYGGIALPELICTMFHTSGYDTQAIVENNESTEYGLFQISNKLWCKSSQVPQSRNICDISCDKFLDDDITDDIMCAKKILDIKGIDYWLAHKALCTEKLEQWLCEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal Structure of Human Lactose Synthase forms a Novel 1:2 Complex between beta1,4Galactosyltransferase 1 and alpha-Lactalbumin Proteins
rcsb
molecule keywords Alpha-lactalbumin
molecule tags Calcium binding protein/transferase
source organism Homo sapiens
total genus 38
structure length 123
sequence length 123
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-06-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4l41A00
4GLAA 1C7PA 1UC0A 1OUDA 4ETCA 3AZ4A 2A7FA 4YEMA 4NIJA 5KY1A 3WULA 1C45A 1XGUC 1UIAA 2FBDA 3LZ2A 1GBSA 1LZBA 1ZV5L 3J6KA 1HNLA 4C3WA 1LZAA 5F14A 5LVGA 1NDGC 1UIBA 1YL0X 1G7HC 3WH1A 1WTNA 3EXDA 4HTQA 4XADA 4Z98A 1REZA 1IOCA 1GBOA 1LMOA 3LYZA 5LYMA 4UWNA 4BAFA 4Z3MA 1LMCA 3VWOA 1YAOA 4WM2A 1QQYA 4DD7A 3TMWA 1GF5A 1AZFA 2YBNA 1GFKA 1LZTA 1DKKA 4WG7A 5DN5A 4WLTA 1YL1X 1Z55A 2ZILA 1LSGA 2DQHY 2F4GA 2Z18A 1LYSA 2YBLA 1YAMA 1KXYA 1OUHA 2Z2EA 4LYZA 1LKSA 1VDPA 4NHQA 5LIOA 1B0DA 1CKFA 1B7SA 1GBWA 4ML7A 4RLNA 2MEGA 3LYTA 1INUA 1GB9A 1BB5A 1LSBA 4WLXA 1GXXA 1HFZA 3TMVA 1A2YC 3WMKA 1XFPL 2BLYA 1GWDA 2DQCY 2ZWBA 3A34A 4NSIA 4PHIA 3TXDA 1BB7A 1LMNA 1LZNA 4G4HA 2WARA 1LJKA 3ZVQB 1UCOA 3CSRA 1GF0A 1VDSA 1OUGA 3LZTA 1IORA 5HMJA 1C08C 3HBEX 1OUIA 2H9JA 4TWSA 1AKIA 1GE3A 4XJHA 1HEWA 1LYOA 3TXJA 3WU9A 1XEJA 1AT5A 4IATA 1D0KA 2D6BA 1LTMA 5APFA 2Z39A 5LVKA 2CGIA 2W1YA 3P64A 3G3BB 4NHTA 4NY5A 1LZ6A 2C8OA 5I5QA 1EQEA 4GLVA 4UWVA 1OUCA 3EO5A 4B49A 3N9EA 3WW5A 2BPUA 1GB7A 1LZ9A 1GDXA 2MEBA 2ZQ3A 4H8ZA 5F9UA 3CQLA 1AT6A 4H90A 2BQFA 4B4JA 1LCNA 1LSPA 2DQDY 4LFXA 2MEAA 4NGIA 1GXV2 4LYTA 1IP4A 1GB0A 1ZVHL 4NG8A 3A6BY 4GCEA 1FLQA 3TXFA 2XBSA 1VFBC 2HEEA 1B5YA 1HMLA 4G4BA 1GFAA 1RFPA 4YEOA 1ALCA 3AJNA 1BWJA 4J1AA 1EQ4A 2XBRA 1G7LC 3TXBA 3W6FA 1H6MA 4NG1A 2I26L 3A91A 4O34A 1QUTA 2HECA 4WG1A 1G7IC 1GFGA 2Z12A 4R0FA 5KXSA 1CKGA 3AB6A 1BB6A 1YAPA 4H9BA 4N1CC 3WU7A 4NGZA 1QTKA 1FKQA 1IC4Y 1C46A 3WPKA 1CJ8A 1LJ3A 4ANRA 3TXKA 1KIPC 2X0AA 1GFRA 4Z46A 5FDJA 3A90A 2BQMA 2BLXA 4IJ4A 4DT3A 1W08A 3D3DA 2ZQ4A 1GPQC 3GXRA 3ATNA 4YENA 1LYYA 5B1GA 5I4WA 2BQDA 3AW7A 5LVIA 1HEMA 1GF9A 4H9IA 2MEEA 1JEFA 1KIRC 4DDBA 3BKHA 2G4QA 1GAZA 4J1BA 1WQOA 4UWUA 1LJ4A 2G4NA 4HTKA 5LVHA 2H5ZA 1LZGA 1LSDA 4ZFPA 1BQLY 3CB7A 3FI7A 2MEHA 3W6AA 1QIOA 4IASA 1YILA 4H92A 5APCA 4TUNA 3B72A 4ETEA 2Z19A 4TSCA 1NQIA 1UUZC 4KXIA 4XN6A 1HHLA 1B5WA 2VB1A 1D6PA 5LAGA 3E3DA 5K7OA 4KT3A 1BB4A 1G7JC 3AGIA 3P66A 2ZIJA 3W6EA 1FKVA 4W96A 4YOPA 2HEAA 1HEOA 4WO6A 1LZ1A 2CWIA 1BB3A 3WYHA 1B7RA 1LSYA 1F10A 2I25L 1OUFA 3MGWA 1LJEA 2A7DA 1GE4A 1HELA 1N4FA 3QY4A 1LHIA 1LMPA 4D9ZA 1XEIA 1B9OA 4WM3A 3B0IA 3ZVQA 1A4VA 1B5VA 4NHIA 3M3UA 4GN4A 4LGKA 1B7LA 3RT5X 1IP1A 1IO5A 1QDTA 4TSBA 5C6LA 3QNGA 1BWHA 3LYOA 4H8YA 4MR1A 3WXUA 1T6VL 2ZIKA 1NKHA 3HBDA 1OUBA 3LHMA 1QDRA 4PRUA 4LT3A 1LYZA 3J4GA 1HFXA 1IOSA 3WW6A 5HQ1A 1LZ5A 1GFUA 5F16A 4OWHA 1IWUA 2HUBA 5ILCA 3CT0A 3A3RX 3W6CA 2LHMA 2LYMA 5KXTA 2YBMA 1UIGA 5KXPA 1MELL 4XENA 1BGIA 1WQMA 4GN3A 4HPIA 1GD6A 3AW6A 4KL7A 4C5FA 1WTMA 4HJZA 4OWBA 1VDQA 1B5XA 3WVYA 2D4JA 4N5RA 2W1XA 3GXKA 2MEDA 4NGWA 3T6UA 1BWIA 208LA 2G4PA 1JKCA 3B0KA 1HC0A 2DQIY 1JTOL 1XGTC 1JKDA 4NSHA 1GF8A 4NWEA 1TDYA 1LHHA 1RI8B 4NFVA 2CJLA 2MEFA 4QDNA 5E9RA 4Z41A 1KXXA 1LZCA 1UICA 4HJVA 3FE0A 4ET9A 1IR8A 1GB2A 4PRQA 2BQJA 2DQFC 3P65A 4XYYA 4B4IA 1LJHA 4NGKA 2FYCA 1B7OA 1LHKA 2RSCA 4H93A 1CJ7A 4B1AA 4CGEA 1GE1A 2BAAA 4HPEA 1GDWA 1LSEA 1WVUA 2IHLA 1XGQC 4CFPA 9LYZA 1YKYX 1CKDA 2FBBA 4YF2A 2ZYCA 1GF3A 1NF5A 4WO9A 1IWZA 4N8ZA 4M4OA 3SP3A 3A3QA 3WUAA 5LYZA 4B4EA 1GBZA 4DDCA 1YANA 2BQAA 4MSTA 3TXHA 2F4AA 1LJGA 5HNCA 4J7VA 4NSGA 4ZIXA 1KIQC 1LZ4A 3K3TA 4OOTA 4BAPA 5JENB 2HEBA 5LAFA 4WM6A 5A3ZA 5LINA 4LYOA 3WPLA 4I0CA 5L9JA 1SQ2L 3KAMA 3OK0A 5C6JA 4AGAA 3ATOA 4XJBA 194LA 3N9CA 1NWGA 1YIKA 3CT5A 1GEVA 4OW1A 5LYTA 1B7MA 1IWXA 1F6SA 3HFMY 5KXXA 1BHZA 4DD2A 5APEA 1W6ZA 1IWYA 1DI5A 5B07A 5KXLA 1LJIA 2DQGY 1IOTA 2LYZA 135LA 4NHPA 2DQJY 3TXIA 2D4IA 4PPOA 1LKRA 2BQIA 5FSTA 1TAYA 3IJUA 3HBHA 1JIYA 1QUSA 4GCCA 1XEKA 1IC5Y 4LYMA 8LYZA 1HSWA 2AUBA 4XJDA 4TX7A 5A3EA 5IHGA 1V7TA 2XTHA 5APDA 4GN5C 4N0JA 1JITA 1HSXA 1EL1A 1IC7Y 1P2CC 4NGVA 4X3BA 2DQEY 1LPIA 5B05A 1LSMA 1OUAA 3WL2A 2N5ZA 2YBJA 1LMQA 4CJ2A 1JSEA 1GBXA 2HTXA 2DQAA 5KJ9A 1LSNA 4GCDA 4WOAA 5LA8A 3WVXA 4CFOA 3P68A 1IY4A 4WLYA 4NWHA 4P2EA 4PGJB 3TXEA 7LYZA 1WQRA 5I54A 1GB6A 1HERA 1IEEA 5J7CA 1GAYA 1OUEA 3A93A 2LYOA 1B5ZA 3TMXA 1GFTA 1LSZA 2ZYPA 3WUNA 1GB5A 1NMMA 4CHXA 5KKJA 4H91A 1UIDA 5LA5A 4RW1A 1C10A 1JJ0A 4WL6A 4WMGA 2DBTA 1GFEA 1QSAA 3B0OA 4NGLA 4NEBA 1FLYA 4DD0A 1FLWA 4H9HA 2F2NA 4L41A 1HMKA 3IJVA 3T36A 4LFPA 1WQQA 4DWXA 1LMTA 4G4CA 4QGZA 1CNSA 2HEFA 2LZTA 4U3XB 193LA 1UACY 2YDGA 1DPXA 3N9AA 5D5CA 4BS7A 2Q0MX 3RU5A 1I56A 4H94A 4R6CA 1IWVA 1LJFA 1JKBA 5KXWA 4II8A 3F6ZA 1H87A 4LZTA 2EKSC 3OJPA 1JPOA 1LZ8A 3A92A 1LJNA 1IWWA 2EPEA 1DQJC 3A95A 1CKCA 1UA6Y 4GCBA 1BVKC 1LZDA 1GHLA 1V7SA 4ETDA 5FELA 3D9AC 5LXWA 4HTNA 4NSJA 1TCYA 3RW8A 1REYA 4I8SA 5HMVA 1I1ZA 5C6IA 3QE8A 4NGJA 4WLDA 4NHSA 4H9FA 5M1YA 1FN5A 2MECA 4LT2A 1IOQA 1G7MC 1QSWA 4LT0A 3A96A 1HF4A 1FDLY 4G9SA 1GFVA 2HU3A 1LJJA 2YVBA 2C8PA 2D4KA 4HP0A 1DI3A 3EBAB 4HV2A 4RLMA 3CSZA 4W94A 5D5FA 3WUMA 1JJ3A 2Z2FA 1IP5A 5L3IA 5LVJA 4YM8A 133LA 2HEDA 1GE2A 4M6DA 1RCMA 1HEPA 207LA 1VATA 1BVXA 1EQ5A 4HV1A 5L3HA 3TXGA 2BQGA 1DI4A 1WVVA 5DLAA 1GFHA 1LZEA 1JISA 1WQNA 1YAQA 4XJFA 1TBYA 4FDYA 1NHEA 1NBYC 1LZRA 1J1OY 3W3EA 5KXKA 1DZBX 4OWEA 3M18B 4WL7A 4H8XA 2DKVA 4ETBA 3CSQA 3AZ5A 1UIFA 132LA 1KXWA 1MLCE 1PZYA 5II3A 5FEKA 5I4XA 5B59A 134LA 3WU8A 3ULRA 4MCKA 1ZVYB 2W1MA 1D0LA 1J1PY 1DKJA 4DD1A 1DPWA 3IWRA 4WM5A 3AZ6A 4HJYA 1GBYA 3RZ4A 3B6LA 3AGHA 4N1EI 4E3UA 4KPMA 4QY9A 2BQKA 2YSSC 5HNLA 1YROA 4OWAA 1LSAA 1YKZX 1REMA 4QEQA 6LYTA 2GV0A 3A8ZA 2IFFY 4DD3A 2HU1A 1IP3A 1B7NA 1TEWA 1LOZA 1B7PA 1IX0A 2BQHA 1RE2A 4G49A 1CJ6A 1DXJA 4RW2A 1HEQA 2PC2A 1B5UA 4FJRA 2BQCA 3W6BA 3AYQA 1LZYA 1GF7A 1UIEA 4EOFA 4ZEEA 5B1FA 2I6ZA 3ZEKA 5KXOA 1IIZA 3A67Y 1IP6A 153LA 5HLLA 1C43A 2BQNA 3BKVA 1IR9A 1JJ1A 1GE0A 5FHWA 3A6CY 1PS5A 1GF6A 1OP9B 5KXZA 1VEDA 4WM1A 1NDMC 2Y8PA 1CKHA 1F6RA 2F30A 3RNXA 1IP7A 2ZNWY 2EQLA 5KKIA 5IDDA 2EIZC 4NGOA 1JHLA 1O23A 1T3PA 5KXYA 4A7DA 1ZMYL 4DD9A 5T3FA 4LYCA 1LSCA 1LHMA 4EMNA 1LHLA 4OWCA 5DL9A 1B7QA 5I4YA 3CT1A 4H9AA 1VAUA 4J0LA 4OOOA 4AXTA 2FYDA 6LYZA 4RDSA 4PJ2C 1GB8A 1FLUA 2CDSA 5DM9A 2B5ZA 4H9EA 1UIHA 1D6QA 4DYGA 1F0WA 2Z37A 2XJWA 3AGGG 1XGRC 1IP2A 4LT1A 1B2KA 1I20A 1LAAA 5FCPA 5KXRA 1JUGA 5I53A 1LSFA 2BQBA 2NWDX 1YKXX 4TTDA 5F9XA 5IELA 5F81A 5AMYA 4NGYA 2YBHA 5DN4A 1JTTL 1IVMA 1J1XY 1LMAA 1LZSA 2BQOA 2W1LA 1AM7A 3EMSA 1HFYA 2ZNXY 3LYMA 4WM4A 1GF4A 5E4PA 4DC4A 4B0DA 1GFJA 2LZ2A 4N9RA 3W6DA 1OUJA 3AZ7A 2BQLA 1FBIX 1JTPL 5B06A 1JSFA 5KXMA 1GEZA 1LHJA 3LN2A 1IWTA 2YBIA 5EBHA 1UBZA 4BADA 5KXNA 1XSFA 2Z38A 1YQVY 1D0MA 4HSFA 2MEIA 1REXA 3TMUA 2H9KA 4GCFA 3A94A 2D91A 1SLYA 1D9UA 1HENA 154LA 4H1PA 1WQPA 1VDTA 2BQEA 1JWRA 4ET8A 1E8LA 4ETAA 3WPJA 1GB3A 1XGPC 4DDAA 1QTEA 4XJIA 3G3AB 1OQMA 3WXTA 4XJGA 1CJ9A 3P4ZA 1NBZC 1IY3A 1RJCB 4LYBA 1IR7A 4H9CA 5ILFA 1JKAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1C7PA 1UC0A 1QTCA 1P2LA 238LA 2OU8A 1LZBA 3J6KA 1YL0X 2OE4X 1G7HC 2RBNA 1REZA 5LYMA 1QT8A 1QSBA 3HTBA 3TMWA 3SB8A 1LZTA 5DN5A 4WLTA 1Z55A 1YAMA 1CU6A 4LYZA 4RLNA 4ML7A 4I7OA 1KW5A 3D4SA 1GXXA 1HFZA 3TMVA 2BLYA 166LA 144LA 2O7AA 1L24A 1C6BA 1GF0A 3LZTA 1IORA 141LA 4DAJA 1OUIA 4TWSA 1GE3A 3TXJA 1HEWA 2RBRA 1D0KA 1NHBA 1LTMA 1P56A 3RZEA 5I5QA 1EQEA 4GLVA 1T8GA 1L26A 1LZ9A 2MEBA 1L19A 2DQDY 4LFXA 1L60A 156LA 4NGIA 4LYTA 4ARQA 249LA 2OTZX 1VFBC 4G4BA 112LA 3OE8A 2XBRA 3TXBA 2B72A 213LA 2I26L 1QUTA 2HECA 4WG1A 2RBSA 2Z12A 138LA 1CKGA 3WU7A 3HTGA 1FKQA 1LJ3A 2X0AA 5FDJA 167LA 1D3NA 3A90A 3G3VA 4IJ4A 3UONA 3D3DA 2ZQ4A 1LYYA 2BQDA 1HEMA 1LYIA 4H9IA 2B6TA 3BKHA 2G4QA 1WQOA 2G4NA 1QT7A 3FI7A 1QS9A 4ETEA 3HWLA 1HHLA 2VB1A 1L28A 5LAGA 1BB4A 3AGIA 2ZIJA 4WO6A 1B7RA 227LA 1OUFA 3MGWA 1GE4A 1LMPA 1XEIA 2OEAX 1B9OA 1G0PA 1QUOA 1B5VA 4I7JA 1L66A 3CDRA 1IP1A 163LA 3LYOA 3WXUA 3RUNA 1CTWA 2NTHA 1LYZA 1XEPA 2QB0B 4W59A 1IWUA 2HUBA 5ILCA 3CT0A 1L58A 1LWKA 2LHMA 5KXPA 4XENA 4HPIA 4C5FA 4HJZA 3WVYA 4N5RA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4GLA A;  1C7P A;  1UC0 A;  1OUD A;  4ETC A;  3AZ4 A;  2A7F A;  4YEM A;  4NIJ A;  5KY1 A;  3WUL A;  1C45 A;  1XGU C;  1UIA A;  2FBD A;  3LZ2 A;  1GBS A;  1LZB A;  1ZV5 L;  3J6K A;  1HNL A;  4C3W A;  1LZA A;  5F14 A;  5LVG A;  1NDG C;  1UIB A;  1YL0 X;  1G7H C;  3WH1 A;  1WTN A;  3EXD A;  4HTQ A;  4XAD A;  4Z98 A;  1REZ A;  1IOC A;  1GBO A;  1LMO A;  3LYZ A;  5LYM A;  4UWN A;  4BAF A;  4Z3M A;  1LMC A;  3VWO A;  1YAO A;  4WM2 A;  1QQY A;  4DD7 A;  3TMW A;  1GF5 A;  1AZF A;  2YBN A;  1GFK A;  1LZT A;  1DKK A;  4WG7 A;  5DN5 A;  4WLT A;  1YL1 X;  1Z55 A;  2ZIL A;  1LSG A;  2DQH Y;  2F4G A;  2Z18 A;  1LYS A;  2YBL A;  1YAM A;  1KXY A;  1OUH A;  2Z2E A;  4LYZ A;  1LKS A;  1VDP A;  4NHQ A;  5LIO A;  1B0D A;  1CKF A;  1B7S A;  1GBW A;  4ML7 A;  4RLN A;  2MEG A;  3LYT A;  1INU A;  1GB9 A;  1BB5 A;  1LSB A;  4WLX A;  1GXX A;  1HFZ A;  3TMV A;  1A2Y C;  3WMK A;  1XFP L;  2BLY A;  1GWD A;  2DQC Y;  2ZWB A;  3A34 A;  4NSI A;  4PHI A;  3TXD A;  1BB7 A;  1LMN A;  1LZN A;  4G4H A;  2WAR A;  1LJK A;  3ZVQ B; 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 5KKI A;  5IDD A;  2EIZ C;  4NGO A;  1JHL A;  1O23 A;  1T3P A;  5KXY A;  4A7D A;  1ZMY L;  4DD9 A;  5T3F A;  4LYC A;  1LSC A;  1LHM A;  4EMN A;  1LHL A;  4OWC A;  5DL9 A;  1B7Q A;  5I4Y A;  3CT1 A;  4H9A A;  1VAU A;  4J0L A;  4OOO A;  4AXT A;  2FYD A;  6LYZ A;  4RDS A;  4PJ2 C;  1GB8 A;  1FLU A;  2CDS A;  5DM9 A;  2B5Z A;  4H9E A;  1UIH A;  1D6Q A;  4DYG A;  1F0W A;  2Z37 A;  2XJW A;  3AGG G;  1XGR C;  1IP2 A;  4LT1 A;  1B2K A;  1I20 A;  1LAA A;  5FCP A;  5KXR A;  1JUG A;  5I53 A;  1LSF A;  2BQB A;  2NWD X;  1YKX X;  4TTD A;  5F9X A;  5IEL A;  5F81 A;  5AMY A;  4NGY A;  2YBH A;  5DN4 A;  1JTT L;  1IVM A;  1J1X Y;  1LMA A;  1LZS A;  2BQO A;  2W1L A;  1AM7 A;  3EMS A;  1HFY A;  2ZNX Y;  3LYM A;  4WM4 A;  1GF4 A;  5E4P A;  4DC4 A;  4B0D A;  1GFJ A;  2LZ2 A;  4N9R A;  3W6D A;  1OUJ A;  3AZ7 A;  2BQL A;  1FBI X;  1JTP L;  5B06 A;  1JSF A;  5KXM A;  1GEZ A;  1LHJ A;  3LN2 A;  1IWT A;  2YBI A;  5EBH A;  1UBZ A;  4BAD A;  5KXN A;  1XSF A;  2Z38 A;  1YQV Y;  1D0M A;  4HSF A;  2MEI A;  1REX A;  3TMU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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