4LFPA

X-ray structure of the adduct between hen egg white lysozyme and a homoleptic gold(i) complex with the saccharynate ligand
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The mode of action of anticancer gold-based drugs: a structural perspective.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4lfpA00
3WU9A 1FLQA 1D0MA 1T3PA 1GWDA 3B0KA 1LHIA 3ZEKA 1VDSA 3AZ4A 2RSCA 4NHTA 3WL2A 2BQMA 2YVBA 1Z55A 1RFPA 3HBHA 2BQDA 2BQJA 2G4PA 3QE8A 1ZVHL 4NHQA 2YBIA 4HPEA 1OUEA 3LZTA 3VWOA 1KXXA 4BS7A 4LFXA 1WQPA 1GF3A 1NKHA 2C8PA 4I0CA 2Y8PA 1LSMA 1UIFA 3FE0A 1JTOL 1HEWA 1UA6Y 2DQHY 1HHLA 4NGWA 1HC0A 2D4JA 1GB2A 1NBZC 5KXSA 1KIQC 1G7LC 1KIRC 1LSBA 1NDMC 1D0KA 1YKZX 2Z19A 3D3DA 5KXMA 5KY1A 1IR9A 1UCOA 4DD2A 3WPKA 2BLYA 2Z2FA 5I4XA 2PC2A 1GF9A 1GD6A 1AKIA 2A7FA 2I25L 3CSZA 5IHGA 2DQFC 2LYOA 3W6DA 1LZTA 3LHMA 3CSRA 1CJ6A 4DD1A 2DQAA 2G4QA 2I26L 3N9AA 4WM1A 4YF2A 3CT0A 1AT5A 1JKCA 1C46A 4OW1A 1LCNA 2F30A 3AYQA 1JJ0A 3HBEX 1JIYA 1FLWA 1PZYA 1JUGA 1LHKA 2BQHA 5LYTA 2HEFA 3EBAB 4DDCA 1BB3A 1F6RA 1UIBA 4WM6A 5JENB 4XJIA 2H9KA 2BQOA 4XJHA 2HU3A 4X3BA 4YENA 1IWUA 3SP3A 3TXKA 1GE3A 2BPUA 4UWNA 2MEDA 1V7TA 132LA 1GBOA 4DD0A 5KXNA 1GFRA 1B5ZA 1IWWA 1GE2A 1GEZA 1VEDA 4B1AA 1CJ9A 3KAMA 4C5FA 1YAMA 1QSWA 1JWRA 4DD9A 3B0IA 5ILCA 2BQBA 2FBDA 4MR1A 2YBNA 2HEBA 5I53A 1H6MA 4NEBA 1DQJC 4WLTA 3W6CA 4QY9A 3TXDA 4NHPA 4WLDA 1HMKA 1GF5A 4W96A 4OWHA 1LZYA 4YEOA 4B49A 4G49A 4CFPA 2Z38A 4P2EA 1OUBA 5APDA 1LMQA 1MLCE 4HSFA 4NWHA 3WUAA 4WOAA 2DQIY 4PJ2C 1NDGC 2HU1A 1WTMA 4H9AA 3IWRA 4G4CA 1LYZA 1GAZA 1BGIA 1LJKA 5B06A 1YQVY 3AW7A 4HPIA 2BQIA 1XEKA 1GFJA 1WTNA 1HFXA 3QY4A 2DQGY 2Q0MX 1XGRC 2XJWA 1OUHA 5LINA 1LAAA 4MCKA 4C3WA 1UUZC 3TMXA 4HV2A 1WQRA 5HLLA 1IORA 1UIDA 3HBDA 1JKDA 4GLAA 3A3RX 4D9ZA 3WXUA 1HELA 1LZ4A 1DXJA 4N8ZA 1CJ8A 4OOTA 4Z3MA 3D9AC 1LHLA 2YBMA 2CJLA 4H8XA 1W08A 1OP9B 4NGYA 1C08C 4B4EA 3LYZA 1G7HC 3A91A 3G3BB 5KXPA 1B0DA 3WH1A 1IP3A 1OUAA 1XGUC 1YKXX 2DQCY 1IY3A 3TXHA 1F6SA 3LYOA 4N0JA 5IDDA 2BQGA 1B2KA 4Z41A 5ILFA 4I8SA 4WLYA 208LA 4YM8A 2ZQ3A 1NMMA 5L9JA 135LA 4OWCA 5F9UA 133LA 2ZWBA 2DQDY 1B7LA 2Z37A 1GB9A 1REZA 4WLXA 3A93A 5LYMA 1OUGA 1UIAA 1GF4A 4H92A 4NGJA 5FHWA 5KXOA 4LYCA 3AZ5A 3W3EA 1GBWA 4PRUA 1JTTL 1B5YA 4LT3A 4EMNA 1O23A 4TX7A 5A3ZA 4PRQA 1UACY 3A3QA 4IJ4A 1LHJA 1YL1X 2EPEA 1LZGA 1GF7A 1C7PA 1WQQA 2ZIJA 4GCBA 1BB5A 1TEWA 1LMPA 3M3UA 4UWUA 4GCEA 4TSCA 5DM9A 3TXFA 6LYZA 5I54A 2MECA 1DI5A 5LVKA 4E3UA 1I56A 2XTHA 3A90A 3B72A 1GB0A 1QDRA 4LYOA 1E8LA 3E3DA 2DQJY 3W6BA 2Z2EA 4ETEA 154LA 2F4GA 4XYYA 4LT1A 5E4PA 1VDTA 3OK0A 5HMVA 2YBLA 1EQ4A 1GEVA 4GLVA 4PPOA 4GN4A 4LYTA 4WM5A 5LAFA 4DDBA 134LA 4A7DA 1QDTA 2BQFA 1WQMA 1LSAA 1ZV5L 5KXTA 3ZVQA 2N5ZA 2LYMA 1WVVA 1B7OA 5I4YA 3WUMA 1WQNA 4NSHA 2CDSA 4Z98A 2ZNWY 4J7VA 3J4GA 1BB4A 1I1ZA 4WO6A 2MEFA 1YILA 2F4AA 3A67Y 1DI4A 4NIJA 1GBSA 1UC0A 5LVHA 3W6FA 2D6BA 1GE1A 4XN6A 4XJBA 5FSTA 2D91A 5HMJA 1HEMA 5D5FA 1LJHA 1DPWA 1VFBC 3TMWA 1B7NA 4H9BA 3WW5A 5LVIA 3P66A 1JJ3A 3B0OA 1B7SA 1YANA 2ZYPA 1YKYX 1NBYC 3P4ZA 4FJRA 2D4IA 4ET8A 3N9EA 4ANRA 2IFFY 4NGVA 1N4FA 4WM3A 5APEA 2B5ZA 5LIOA 4NGIA 3WPJA 5KXWA 4WMGA 2BAAA 3CT5A 1GF6A 2LYZA 1DI3A 4GN5C 5B05A 1LJIA 5I4WA 5K7OA 1YAPA 1BHZA 4NGKA 1A2YC 1LOZA 5F81A 1GFTA 1GHLA 1C43A 1AZFA 1XGPC 2C8OA 2W1YA 2ZNXY 4N9RA 1F0WA 4GCFA 3IJVA 1IOSA 2W1LA 1IX0A 1LSYA 1OUFA 5LXWA 1GFUA 1LZDA 3AW6A 2YDGA 3RT5X 2DQEY 4ETCA 1LMCA 3W6AA 4RDSA 1IIZA 1LHHA 5J7CA 1IWVA 5II3A 2FYDA 1CKGA 4NGZA 2AUBA 5APCA 1UIEA 3AJNA 4DDAA 5KXLA 2MEHA 4WG1A 1GFKA 5DL9A 1FDLY 1LYSA 3A94A 1INUA 3AZ6A 2LHMA 2LZTA 1G7IC 1LSZA 4NWEA 1BB7A 1TCYA 3P64A 3WVYA 1J1OY 1GE0A 5KXRA 1LZSA 3WYHA 1D9UA 5APFA 2YSSC 3EMSA 1GB8A 1HSWA 2ZQ4A 4OOOA 5HQ1A 5LYZA 4ZFPA 3MGWA 1JSFA 1IC4Y 1LYYA 1IOQA 2BQCA 4GCCA 3BKVA 4M6DA 1CKHA 1KXWA 1DKJA 2BQNA 4J1AA 4N1CC 4EOFA 1EQEA 1YROA 5L3IA 1REMA 3AGGG 1GDWA 5F9XA 2HECA 2X0AA 194LA 1FLYA 1JTPL 1MELL 2YBHA 1QIOA 4R0FA 1IP2A 5KKIA 3RZ4A 1LMAA 1GXV2 4NSIA 1NQIA 9LYZA 1JEFA 4H9IA 2MEEA 1LSGA 1LMNA 3ZVQB 4H8YA 1G7JC 4DT3A 1LJGA 4AGAA 1UIHA 3QNGA 4H8ZA 1HENA 1B5VA 1IWXA 4H94A 4DC4A 1XGQC 3CSQA 5B1FA 4TWSA 1IC7Y 1RE2A 5DN4A 4O34A 3AB6A 2GV0A 1QQYA 3A96A 1LZEA 1FKQA 1NHEA 1W6ZA 1BWIA 1BVKC 1CKCA 5IELA 4BAPA 4CHXA 1SLYA 1J1XY 4ET9A 2W1XA 3BKHA 1XFPL 3LYMA 2D4KA 4NG8A 4ETAA 1LZAA 1JSEA 1HERA 3T6UA 5KXKA 4BAFA 5KKJA 1GF8A 3CQLA 1JKAA 4J0LA 2BQEA 2HUBA 5HNLA 1JISA 4GCDA 1GFGA 4PHIA 4YOPA 4LYBA 4NSJA 5B1GA 1LZNA 4DWXA 1UICA 5LVGA 1P2CC 4M4OA 4IASA 1VATA 2YBJA 3EXDA 2Z18A 3LYTA 3CT1A 5F16A 2F2NA 1GBZA 1B5UA 1IP5A 2DBTA 4PGJB 5E9RA 1HEQA 3WUNA 4XJFA 1YAOA 1AT6A 1GAYA 3TXEA 1A4VA 1B7PA 1LHMA 1LKRA 3WULA 4LT2A 2MEGA 1HF4A 1KIPC 1GE4A 4TTDA 4QGZA 193LA 5L3HA 1OUJA 3P68A 4TSBA 5AMYA 4HJZA 2G4NA 4NFVA 1LJEA 1IO5A 4WM4A 3A6CY 1IWZA 1I20A 2FBBA 3WPLA 1T6VL 5M1YA 1HFYA 4OWAA 1GFAA 4WG7A 4N5RA 4L41A 1LZRA 1EQ5A 3ULRA 1G7MC 4NSGA 1LZCA 1KXYA 1C45A 1DZBX 4HP0A 5LVJA 1FKVA 1JHLA 1OUIA 3AGIA 4HV1A 4II8A 4MSTA 1GDXA 2FYCA 4LGKA 1LZ5A 3GXKA 4G9SA 4NY5A 6LYTA 1SQ2L 1LZ8A 1YIKA 1VAUA 4WL7A 1IWYA 3A34A 3M18B 3AGHA 2EQLA 4TUNA 1FLUA 1GF0A 1LSFA 5D5CA 1WQOA 3TXBA 3AZ7A 4GN3A 2Z39A 5KXYA 4DYGA 4XENA 1VDPA 3LZ2A 5B59A 1QTEA 5KJ9A 1H87A 2HEEA 3A95A 1B7QA 1HMLA 4N1EI 3TXIA 4RW2A 1GBXA 2A7DA 1ZMYL 1QTKA 4ZIXA 1LJ4A 153LA 1OQMA 4G4HA 2BQLA 1BB6A 4AXTA 1LZBA 3J6KA 3K3TA 1CNSA 3CB7A 1UIGA 3ATNA 1BWHA 2BQAA 4H9FA 1LSNA 4J1BA 2MEBA 1IY4A 4LYZA 1AM7A 8LYZA 1OUCA 2MEIA 4H9CA 4QEQA 2WARA 1NF5A 3WU8A 2EIZC 4LZTA 2EKSC 1EL1A 1BWJA 1RJCB 1B5XA 1LZ9A 4XJDA 3IJUA 3T36A 1GB5A 5DLAA 5HNCA 5FCPA 5T3FA 1DKKA 5EBHA 1JKBA 1QUTA 1WVUA 3OJPA 2HEDA 1LJNA 4KXIA 4DD7A 1F10A 1C10A 2Z12A 4NGLA 4BADA 1LSDA 2ZILA 5B07A 5DN5A 2CGIA 4HTQA 4ETDA 1LJ3A 1GXXA 1B9OA 2XBSA 4U3XB 5A3EA 5LA8A 1HEOA 3WW6A 2W1MA 4W94A 2LZ2A 1IP4A 4OWBA 1BQLY 4B0DA 1GPQC 1HEPA 1QSAA 1CKDA 2BQKA 3A6BY 1IWTA 2DKVA 3HFMY 3N9CA 1LKSA 1TDYA 1JJ1A 5C6IA 4H1PA 1GB6A 1NWGA 3TXGA 1GB3A 4G4BA 3WXTA 4H90A 1HFZA 4H93A 4OWEA 5I5QA 1OUDA 3RNXA 5C6JA 4WO9A 4NHIA 1XEIA 1GFHA 1J1PY 4HJYA 4WM2A 1REYA 1B7MA 4HTKA 1IP1A 3ATOA 1LPIA 1PS5A 1XGTC 4XADA 4B4JA 4CGEA 1LZ1A 3TMUA 3W6EA 5FEKA 2ZYCA 1HSXA 3B6LA 4QDNA 5FDJA 2BLXA 1GBYA 1REXA 3RW8A 4XJGA 1ALCA 1LMOA 4ETBA 3EO5A 3TMVA 1XSFA 1BVXA 1LTMA 3WU7A 1CKFA 1YL0X 3F6ZA 1LYOA 5LA5A 1B7RA 1IC5Y 4KT3A 4IATA 7LYZA 1D6PA 1IR8A 1TAYA 4ZEEA 1IOTA 1DPXA 1RI8B 3TXJA 1JPOA 1IOCA 1LJFA 1TBYA 1GB7A 5FELA 1LZ6A 207LA 2HTXA 1FBIX 4NHSA 4CFOA 4LYMA 1UBZA 1XEJA 1FN5A 5LAGA 2I6ZA 4LT0A 3WVXA 1IR7A 4RW1A 4H9HA 2CWIA 3G3AB 1IP6A 2NWDX 1D0LA 1LMTA 1LSPA 4H9EA 4NG1A 1IVMA 3P65A 5F14A 2MEAA 4WL6A 1IP7A 1LSCA 1V7SA 3GXRA 4HTNA 4RLMA 1HNLA 4H91A 2VB1A 2XBRA 3A92A 4KPMA 3LN2A 1QUSA 4CJ2A 5KXXA 4RLNA 5C6LA 4Z46A 1ZVYB 2H5ZA 2IHLA 1B5WA 1JITA 1LSEA 1RCMA 4FDYA 3A8ZA 1YAQA 4DD3A 3FI7A 1GFEA 4ML7A 1CJ7A 1GFVA 5KXZA 2ZIKA 4R6CA 1VDQA 1LJJA 3RU5A 1D6QA 3WMKA 4UWVA 4LFPA 1IEEA 2H9JA 4HJVA 4NGOA 2HEAA 4YEMA 4KL7A 4B4IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GWDA 3AZ4A 2RSCA 3DN0A 1I6SA 1RFPA 3HBHA 4HPEA 3LZTA 4BS7A 1WQPA 1GF3A 1NKHA 2OU0X 4K5YA 1UIFA 1L28A 3DN8A 3HH5A 165LA 1GB2A 1NBZC 5KXMA 1LSBA 3D3DA 1L87A 5KY1A 4ARPA 1OWZA 3WPKA 2Z2FA 1GD6A 1AKIA 1LGWA 5IHGA 2DQFC 1CU6A 236LA 3CSRA 4EXMA 2DQAA 3DN6A 4YF2A 1LYDA 1JKCA 1QSQA 1SSYA 1LCNA 1JJ0A 2BQHA 1C6CA 1PZYA 219LA 2B6XA 4WM6A 1L17A 4X3BA 2BPUA 2MEDA 2B7XA 1GBOA 1C66A 5KXNA 1GFRA 1B5ZA 1GE2A 1GEZA 1VEDA 1XEPA 3KAMA 4C5FA 1JWRA 3B0IA 5ILCA 242LA 2HEBA 3NY9A 1HMKA 229LA 1LZYA 4B49A 4ARQA 5APDA 4P2EA 1OUBA 1LMQA 1L65A 2HU1A 1L91A 1GAZA 1BGIA 1C6AA 3AW7A 187LA 1XEKA 2DQGY 2Q0MX 1XGRC 4ARMA 1OUHA 1LAAA 4MCKA 1CV4A 1L08A 3V2YA 3GUMA 1IORA 3C8QA 1UIDA 4D9ZA 4W59A 1DXJA 1CJ8A 1L46A 4Z3MA 2CJLA 1C08C 1D2WA 1IP3A 209LA 3TXHA 3LYOA 4N0JA 231LA 5ILFA 107LA 2ZQ3A 4OWCA 1REZA 4LDOA 3A93A 5LYMA 1OUGA 1GF4A 5KXOA 4LYCA 109LA 1LI3A 3W3EA 253LA 261LA 4EMNA 4TX7A 5A3ZA 4PRQA 2B6TA 3HT6A 1D2YA 3CDRA 4W51A 1BB5A 1TEWA 3NY8A 2HUMA 4TSCA 168LA 1DI5A 3FI5A 1I56A 1L63A 244LA 1L26A 2YBLA 5LAFA 227LA 2BQFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3WU9 A;  1FLQ A;  1D0M A;  1T3P A;  1GWD A;  3B0K A;  1LHI A;  3ZEK A;  1VDS A;  3AZ4 A;  2RSC A;  4NHT A;  3WL2 A;  2BQM A;  2YVB A;  1Z55 A;  1RFP A;  3HBH A;  2BQD A;  2BQJ A;  2G4P A;  3QE8 A;  1ZVH L;  4NHQ A;  2YBI A;  4HPE A;  1OUE A;  3LZT A;  3VWO A;  1KXX A;  4BS7 A;  4LFX A;  1WQP A;  1GF3 A;  1NKH A;  2C8P A;  4I0C A;  2Y8P A;  1LSM A;  1UIF A;  3FE0 A;  1JTO L;  1HEW A;  1UA6 Y;  2DQH Y;  1HHL A;  4NGW A;  1HC0 A;  2D4J A;  1GB2 A;  1NBZ C;  5KXS A;  1KIQ C;  1G7L C;  1KIR C;  1LSB A;  1NDM C;  1D0K A;  1YKZ X;  2Z19 A;  3D3D A;  5KXM A;  5KY1 A;  1IR9 A;  1UCO A;  4DD2 A;  3WPK A;  2BLY A;  2Z2F A;  5I4X A;  2PC2 A;  1GF9 A;  1GD6 A;  1AKI A;  2A7F A;  2I25 L;  3CSZ A;  5IHG A;  2DQF C;  2LYO A;  3W6D A;  1LZT A;  3LHM A;  3CSR A;  1CJ6 A;  4DD1 A;  2DQA A;  2G4Q A;  2I26 L;  3N9A A;  4WM1 A;  4YF2 A;  3CT0 A;  1AT5 A;  1JKC A;  1C46 A;  4OW1 A;  1LCN A;  2F30 A;  3AYQ A;  1JJ0 A;  3HBE X;  1JIY A;  1FLW A;  1PZY A;  1JUG A;  1LHK A;  2BQH A;  5LYT A;  2HEF A;  3EBA B;  4DDC A; 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 4NHI A;  1XEI A;  1GFH A;  1J1P Y;  4HJY A;  4WM2 A;  1REY A;  1B7M A;  4HTK A;  1IP1 A;  3ATO A;  1LPI A;  1PS5 A;  1XGT C;  4XAD A;  4B4J A;  4CGE A;  1LZ1 A;  3TMU A;  3W6E A;  5FEK A;  2ZYC A;  1HSX A;  3B6L A;  4QDN A;  5FDJ A;  2BLX A;  1GBY A;  1REX A;  3RW8 A;  4XJG A;  1ALC A;  1LMO A;  4ETB A;  3EO5 A;  3TMV A;  1XSF A;  1BVX A;  1LTM A;  3WU7 A;  1CKF A;  1YL0 X;  3F6Z A;  1LYO A;  5LA5 A;  1B7R A;  1IC5 Y;  4KT3 A;  4IAT A;  7LYZ A;  1D6P A;  1IR8 A;  1TAY A;  4ZEE A;  1IOT A;  1DPX A;  1RI8 B;  3TXJ A;  1JPO A;  1IOC A;  1LJF A;  1TBY A;  1GB7 A;  5FEL A;  1LZ6 A;  207L A;  2HTX A;  1FBI X;  4NHS A;  4CFO A;  4LYM A;  1UBZ A;  1XEJ A;  1FN5 A;  5LAG A;  2I6Z A;  4LT0 A;  3WVX A;  1IR7 A;  4RW1 A;  4H9H A;  2CWI A;  3G3A B;  1IP6 A;  2NWD X;  1D0L A;  1LMT A;  1LSP A;  4H9E A;  4NG1 A;  1IVM A;  3P65 A;  5F14 A;  2MEA A;  4WL6 A;  1IP7 A;  1LSC A;  1V7S A;  3GXR A;  4HTN A;  4RLM A;  1HNL A;  4H91 A;  2VB1 A;  2XBR A;  3A92 A;  4KPM A;  3LN2 A;  1QUS A;  4CJ2 A;  5KXX A;  4RLN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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