4LFXA

X-ray structure of the adduct between hen egg white lysozyme and auoxo6, a dinuclear gold(iii) complex with -dioxo bridges linking the two metal centers
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The mode of action of anticancer gold-based drugs: a structural perspective.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 44
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4lfxA00
2F4GA 1G7MC 1XEJA 1LHKA 1LHMA 2BQDA 1G7LC 2C8OA 4DD2A 5A3EA 2C8PA 2MEBA 3CT1A 3CB7A 5I4XA 4HV2A 3TXIA 3W6DA 1GF4A 1ALCA 1UIGA 3A6CY 4KXIA 2YVBA 1B5XA 2IHLA 1IWVA 2N5ZA 3LZTA 4NFVA 4ANRA 4DD0A 5HLLA 2LHMA 4H90A 3B0KA 4ETDA 1IP2A 1LYZA 1NMMA 2BQGA 4OOTA 4N8ZA 2BQIA 4ZEEA 5M1YA 1HELA 5B1GA 1LKSA 1XGUC 1HSWA 2D4KA 3B0OA 2Z39A 5L3HA 1LSDA 3TXJA 1CJ9A 4LT1A 154LA 1LKRA 5LYTA 1GFAA 1HMLA 4DD7A 4C3WA 2DQDY 4NSJA 4DC4A 1GDXA 1IC4Y 4LZTA 4G9SA 2DQJY 4KT3A 4P2EA 3J6KA 4N1CC 1IVMA 1C43A 1BB7A 5I4WA 1LAAA 3B0IA 2HEDA 4NSHA 1BHZA 4RW1A 5FCPA 1FDLY 2AUBA 2RSCA 4NSGA 4YEMA 3HBEX 3WULA 5KXKA 5DN4A 1LZ8A 2BAAA 3W6FA 1HFZA 1IR9A 1LZ9A 1WQPA 2MEAA 1IP4A 2W1YA 3LN2A 5FHWA 1LZ6A 4M4OA 1JPOA 5LA5A 3A94A 1LSMA 3G3BB 1B7NA 1LYSA 5LAFA 4ETEA 4NSIA 5E9RA 3TXDA 3W3EA 1D6QA 1OUIA 2Z2FA 1GFKA 1LMCA 1FLYA 3A34A 4O34A 1QDRA 3ZVQA 1LSAA 4NHPA 5IHGA 1GEVA 1GB5A 4HJZA 1QQYA 1GFGA 2XBSA 3WL2A 4N0JA 4DD1A 2I25L 2ZQ3A 4H1PA 4N1EI 1CJ7A 1BB4A 2YBHA 1B7LA 1NBZC 1W6ZA 5LINA 1DXJA 1GB7A 5D5FA 3EO5A 5KKJA 1MLCE 4XN6A 4IJ4A 1LZSA 1T6VL 5F14A 2LYOA 1B5ZA 1I20A 3N9CA 2Z19A 5E4PA 1TAYA 4QY9A 4MR1A 1GDWA 1IWUA 1QDTA 5B06A 1AT6A 4B4IA 1C7PA 1JKCA 3E3DA 1XEIA 4WG1A 4WO9A 1LZ5A 1QTEA 1MELL 1IP3A 1J1OY 5A3ZA 1J1PY 1HSXA 4H9FA 4H9HA 5LYZA 1LMNA 4QDNA 4R6CA 5LIOA 2CJLA 3WPLA 5APCA 1HC0A 3AW6A 4AXTA 1ZVHL 4GN3A 1IOQA 4N9RA 4I8SA 4YEOA 1GHLA 1TEWA 1EQEA 1NKHA 1NDMC 2Y8PA 4UWNA 5F81A 5KXRA 1JITA 1RFPA 1LZCA 1UIDA 4TUNA 1LZRA 1CNSA 3A91A 3MGWA 4QEQA 1VAUA 4CJ2A 2H5ZA 5KXZA 1LZDA 1NDGC 1RJCB 1G7IC 1B5VA 1LSPA 2ZYPA 1YKYX 4XJDA 4B1AA 3WYHA 1YAOA 1WQOA 1LJ4A 1QSAA 1KIPC 3WXTA 2DBTA 2BQHA 2CWIA 3LYTA 1GE3A 5J7CA 1GBYA 1VEDA 1WQRA 1B7OA 1D9UA 1F6RA 1OUGA 2XTHA 4TSBA 4OWHA 1GBXA 1PZYA 3T6UA 1GFEA 4II8A 1DPXA 1LHHA 5HNCA 3KAMA 3QNGA 1BWHA 4GLVA 3CT5A 3D9AC 4WLYA 4OWCA 5I53A 4OWAA 5KJ9A 4NG1A 1PS5A 2F4AA 1RI8B 5FEKA 3TXHA 2ZIKA 3AW7A 5IDDA 1LZTA 2HUBA 1GAYA 1IX0A 1UA6Y 5KXMA 1TCYA 5DLAA 4UWVA 4AGAA 2D91A 1AT5A 4HTQA 2Q0MX 1GB3A 4HV1A 4R0FA 3ZEKA 4H9CA 132LA 2BQOA 4H9IA 4OOOA 4WOAA 4LFPA 4J0LA 3EMSA 4Z98A 2BPUA 1GBWA 194LA 1LZYA 2F2NA 4GN5C 1A2YC 1IP1A 1KIQC 1VFBC 3A96A 1XGPC 1QUSA 1G7HC 2H9JA 1LMTA 2HU1A 3OK0A 3TXEA 3WUNA 1GBSA 1IWTA 2D6BA 1IO5A 2W1LA 4XYYA 2FYDA 4GCFA 2HEBA 1JIYA 3ATNA 2ZWBA 2NWDX 1IORA 5KKIA 4H8YA 2BQLA 1O23A 1LPIA 1NF5A 5KXYA 1HHLA 1YAQA 3GXRA 4CGEA 3CSRA 1IWWA 1LJEA 1V7TA 1GE4A 1UIAA 1WQNA 4H9AA 4XJFA 5HNLA 4WLXA 4NWHA 4W94A 5DN5A 4H9BA 4NGIA 207LA 4GN4A 4C5FA 1FLQA 1REXA 1QTKA 4NGJA 3AJNA 3TMUA 1OUDA 2EQLA 1BWJA 1N4FA 3N9EA 1OP9B 3P66A 3VWOA 5II3A 1GB9A 1LHIA 3BKHA 4ETAA 4WLDA 1B7RA 4WO6A 1GF8A 5K7OA 1EL1A 6LYTA 1LSCA 4GCCA 3CSQA 1JJ0A 1GB6A 4HTKA 1I56A 4TTDA 1LSYA 2CGIA 5FDJA 2DQHY 4WM1A 4CHXA 2ZNWY 134LA 2MEGA 4WG7A 4PRQA 1JTTL 1QUTA 2IFFY 3A3QA 5B1FA 4BAFA 3WVYA 4Z41A 1GD6A 2DQGY 4PHIA 1IOSA 4HJYA 1DKJA 1GF9A 4ETBA 5KXXA 4PPOA 5B05A 5LVGA 3K3TA 1HFYA 5D5CA 5KXSA 1YROA 5APEA 1DKKA 1UICA 4NGVA 1H6MA 1LMAA 4ZFPA 1NWGA 4H9EA 1CKHA 5F16A 1UC0A 5LA8A 5APDA 1B5YA 1W08A 2LYZA 2Z18A 1VATA 1GBZA 4X3BA 4I0CA 2G4PA 1LTMA 3ATOA 1HNLA 2HTXA 3WPKA 1YIKA 4FJRA 4L41A 1REZA 3N9AA 1LJFA 4ML7A 5FSTA 4NGOA 1LHLA 1LZ4A 1HFXA 3F6ZA 4DDBA 1NQIA 135LA 5ILCA 1LZGA 2I6ZA 3IWRA 4NHTA 1UIHA 2ZILA 3A93A 4BAPA 2YBJA 1GF0A 1CKDA 3M18B 3SP3A 1HEPA 1LOZA 4WM4A 5LVJA 1IY3A 1CKGA 3A90A 1D0LA 1IWXA 4G4BA 4NGZA 1UBZA 4MSTA 2D4JA 1LJIA 2YBNA 1WTMA 1LMPA 4YF2A 4DD3A 1WVUA 1VDSA 1D0MA 4UWUA 2A7DA 3G3AB 3WU8A 5F9UA 5LAGA 2ZNXY 4GLAA 6LYZA 3LHMA 1YL1X 5AMYA 1GFTA 4DT3A 3GXKA 1JJ3A 1LZNA 3TXGA 5KXTA 1NBYC 1OUJA 1GF3A 2WARA 3AZ5A 1GF7A 3RNXA 1B5UA 2B5ZA 2DQFC 1D0KA 4PRUA 1GBOA 1XGTC 4KL7A 1GB2A 4WM2A 4LYZA 2YSSC 3CSZA 5L9JA 1JEFA 4RW2A 4TSCA 1LSNA 3WVXA 1C10A 1LZBA 2MEFA 3HFMY 1HEMA 3P64A 4B4EA 1ZVYB 1LSFA 4LYTA 1GFJA 4RDSA 2I26L 2HECA 5ILFA 4J7VA 1JWRA 3HBDA 3B72A 4TWSA 5EBHA 1REMA 1OUAA 2DKVA 3TMXA 1FLUA 1E8LA 2DQCY 3WH1A 3W6EA 7LYZA 1VDTA 1BGIA 1DI4A 1C45A 1UUZC 1HEOA 2LYMA 3LYZA 3QY4A 4LFXA 3T36A 1F10A 2YBLA 1XGRC 4NEBA 2X0AA 1IEEA 2BQFA 2BLXA 2G4NA 1OUFA 4HPIA 1D6PA 3FE0A 1REYA 2G4QA 1YQVY 4LT0A 5F9XA 5LVKA 4ZIXA 1EQ5A 3A8ZA 4IASA 4XJBA 3TXKA 1BQLY 4LYBA 4CFPA 3LYMA 5KY1A 208LA 3LZ2A 1YANA 3EXDA 4NGWA 3LYOA 2Z12A 1BB5A 4NIJA 4WM3A 3RZ4A 3AGIA 5JENB 1BWIA 1F6SA 4XENA 1VDQA 4RLMA 1GFVA 1Z55A 4FDYA 1AZFA 1LJ3A 1IIZA 1DZBX 1GF6A 5B59A 1JSEA 3FI7A 1GFHA 1RCMA 2DQIY 4WM6A 3WW5A 1ZV5L 1IP6A 2MEHA 3CQLA 4H92A 2Z37A 4M6DA 3RT5X 4B4JA 1LSGA 3AZ4A 4XJGA 1YAMA 4GCDA 4H94A 3WU9A 1XGQC 2YBMA 2FBBA 1KXYA 4KPMA 4LYMA 3TXFA 1B7PA 4H8ZA 5I4YA 1FLWA 1KIRC 2ZQ4A 1LJKA 3QE8A 1LHJA 1ZMYL 4PGJB 1AM7A 5LXWA 1LSZA 1GF5A 1HERA 1XSFA 5L3IA 1CJ8A 1H87A 5KXOA 4DDCA 2GV0A 3ULRA 1UACY 3WXUA 1T3PA 2DQAA 1UIEA 1GWDA 1UIBA 2PC2A 4XADA 2BQNA 1CJ6A 5LVIA 4GCBA 1GPQC 3P4ZA 2LZ2A 4G4HA 4QGZA 1GAZA 5KXPA 1OUHA 4NGLA 1YILA 2HEEA 1IC5Y 4WMGA 1C46A 1RE2A 1DPWA 1LSEA 4H93A 1B5WA 4BADA 1WVVA 4EMNA 2HEAA 4XJIA 1LYOA 2A7FA 1GB0A 1YL0X 4NY5A 3WUMA 1F0WA 5LYMA 5LVHA 1JJ1A 1HENA 1LSBA 4ETCA 1A4VA 1B0DA 3A3RX 5APFA 4OWBA 4ET8A 1FKVA 1JUGA 1JKDA 2HEFA 5B07A 1DQJC 2H9KA 1IR7A 1WQQA 4OW1A 4DDAA 5I5QA 1OUEA 4G49A 4NG8A 1GXV2 1GE2A 4HP0A 1DI5A 4MCKA 4PJ2C 4YOPA 153LA 1DI3A 3WPJA 1LMQA 2Z2EA 2VB1A 1OUCA 1LJGA 4J1AA 4NHQA 4WLTA 1GE0A 5T3FA 1IR8A 4W96A 1BVXA 2DQEY 3AYQA 1FBIX 1B7SA 2BQMA 1QIOA 3WMKA 3RU5A 1LJHA 4H91A 4YM8A 5DL9A 2EPEA 2XJWA 4IATA 4EOFA 5C6JA 5HMVA 2BQBA 4DYGA 8LYZA 4YENA 3A6BY 3OJPA 3WUAA 1BB6A 9LYZA 4TX7A 1GE1A 4ET9A 1GXXA 1OUBA 5KXNA 3AZ6A 1CKFA 1B7MA 4CFOA 4LGKA 4BS7A 1JTPL 4WL6A 4E3UA 1J1XY 5DM9A 4J1BA 4A7DA 4XJHA 3ZVQB 4B0DA 1YAPA 4RLNA 2BQEA 1INUA 1XFPL 1YKXX 3WW6A 1LMOA 1GEZA 4NHIA 3HBHA 3IJVA 2YDGA 1TBYA 1IWZA 1WTNA 2EKSC 3P68A 1UIFA 1VDPA 1IP7A 1LCNA 3W6AA 1LJNA 1P2CC 1LJJA 2FBDA 4DD9A 3D3DA 3CT0A 1JHLA 1LZ1A 2BQKA 133LA 4HJVA 5HMJA 3TMWA 4OWEA 2MECA 1V7SA 4NHSA 1JTOL 2Z38A 3TXBA 2BQJA 1IY4A 1HEQA 1LZEA 1QSWA 5KXLA 3IJUA 3W6CA 3B6LA 4NGYA 1BVKC 1UCOA 3AZ7A 1IWYA 1GFUA 3W6BA 1IC7Y 1I1ZA 2MEEA 4Z46A 4N5RA 1B2KA 2BLYA 1HEWA 4Z3MA 3AB6A 1G7JC 193LA 4GCEA 3WU7A 3RW8A 1JKBA 1HF4A 4B49A 1SQ2L 1LZAA 1GFRA 2LZTA 2F30A 4NGKA 3AGHA 4HPEA 1OQMA 1KXXA 3AGGG 1KXWA 1CKCA 2MEIA 5FELA 5KXWA 5I54A 2YBIA 4LYOA 1LYYA 4HSFA 1WQMA 1GB8A 4DWXA 1IOCA 4NWEA 1EQ4A 1JSFA 1SLYA 4LYCA 3TMVA 4WL7A 1FKQA 1HMKA 5C6IA 2CDSA 1TDYA 2XBRA 1AKIA 4U3XB 1IOTA 4WM5A 1FN5A 3P65A 2ZYCA 5C6LA 2HU3A 1BB3A 4LT3A 3A67Y 1B7QA 4HTNA 1B9OA 1JKAA 1NHEA 2W1MA 3BKVA 3EBAB 2W1XA 3M3UA 1C08C 1JISA 5IELA 2EIZC 4LT2A 4D9ZA 5HQ1A 2D4IA 2BQAA 1XEKA 4H8XA 1IP5A 4G4CA 3A95A 1YKZX 3A92A 3J4GA 2MEDA 2FYCA 2BQCA 2ZIJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1G7MC 1LI6A 1L42A 144LA 4DD2A 1C6NA 248LA 1G0LA 3W6DA 3C7YA 4ANRA 113LA 4H90A 1L10A 4I7NA 2BQGA 1LKSA 2B6YA 154LA 3TXJA 2RB1X 4DD7A 1HMLA 2DQDY 1GDXA 1IC4Y 4LZTA 2B6WA 4G9SA 4KT3A 4N1CC 240LA 102LA 5FCPA 1FDLY 1L24A 1LZ8A 1IP4A 2W1YA 1L60A 4M4OA 1JPOA 5LA5A 3G3BB 1C6AA 3HUQA 5E9RA 3TXDA 234LA 1L11A 3LZMA 4HJZA 1QQYA 4DD1A 4N0JA 223LA 2YBHA 2QB0B 3C82A 3HH4A 1L81A 1B5ZA 1I20A 4QY9A 1IWUA 3DN1A 1JKCA 3E3DA 1LZ5A 2Q9DA 2NTGA 5A3ZA 172LA 4H9HA 1LMNA 2CUUA 2RBNA 1HC0A 3AW6A 226LA 162LA 1IOQA 4YEOA 1NDMC 1JITA 1PQOA 4TUNA 1CVKA 1CNSA 4QEQA 1NDGC 1RJCB 1L95A 3SN6R 4B1AA 1QUGA 3WYHA 1KIPC 3WXTA 2BQHA 1C6HA 2CWIA 3F8VA 1GE3A 1F6RA 1GBXA 1DPXA 3L2XA 1CU3A 1BWHA 4GLVA 3CT5A 5I53A 4OWCA 5KJ9A 4OWAA 1DYEA 3C80A 2F4AA 4GBRB 1RI8B 4NG1A 3TXHA 5IDDA 255LA 1IX0A 5KXMA 211LA 1AT5A 4W59A 4R0FA 3ZEKA 132LA 194LA 4DKLA 1LMTA 1GBSA 1L53A 2HEBA 1JIYA 2NWDX 125LA 4H8YA 5KXYA 1YAQA 3GXRA 1PQDA 3JR6A 1D2YA 1LJEA 1V7TA 229LA 5HNLA 236LA 4WLXA 4H9BA 4GN4A 1REXA 3TMUA 3AJNA 3G3XA 3P66A 3CDQA 1WTHA 1KW7A 4ETAA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2F4G A;  1G7M C;  1XEJ A;  1LHK A;  1LHM A;  2BQD A;  1G7L C;  2C8O A;  4DD2 A;  5A3E A;  2C8P A;  2MEB A;  3CT1 A;  3CB7 A;  5I4X A;  4HV2 A;  3TXI A;  3W6D A;  1GF4 A;  1ALC A;  1UIG A;  3A6C Y;  4KXI A;  2YVB A;  1B5X A;  2IHL A;  1IWV A;  2N5Z A;  3LZT A;  4NFV A;  4ANR A;  4DD0 A;  5HLL A;  2LHM A;  4H90 A;  3B0K A;  4ETD A;  1IP2 A;  1LYZ A;  1NMM A;  2BQG A;  4OOT A;  4N8Z A;  2BQI A;  4ZEE A;  5M1Y A;  1HEL A;  5B1G A;  1LKS A;  1XGU C;  1HSW A;  2D4K A;  3B0O A;  2Z39 A;  5L3H A;  1LSD A;  3TXJ A;  1CJ9 A;  4LT1 A;  154L A;  1LKR A;  5LYT A;  1GFA A;  1HML A;  4DD7 A;  4C3W A;  2DQD Y;  4NSJ A;  4DC4 A;  1GDX A;  1IC4 Y;  4LZT A;  4G9S A;  2DQJ Y;  4KT3 A;  4P2E A;  3J6K A;  4N1C C;  1IVM A;  1C43 A;  1BB7 A;  5I4W A;  1LAA A;  3B0I A;  2HED A;  4NSH A;  1BHZ A;  4RW1 A;  5FCP A;  1FDL Y;  2AUB A;  2RSC A;  4NSG A;  4YEM A;  3HBE X;  3WUL A;  5KXK A;  5DN4 A;  1LZ8 A;  2BAA A;  3W6F A;  1HFZ A;  1IR9 A;  1LZ9 A;  1WQP A;  2MEA A;  1IP4 A;  2W1Y A;  3LN2 A;  5FHW A;  1LZ6 A;  4M4O A; 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 3IJV A;  2YDG A;  1TBY A;  1IWZ A;  1WTN A;  2EKS C;  3P68 A;  1UIF A;  1VDP A;  1IP7 A;  1LCN A;  3W6A A;  1LJN A;  1P2C C;  1LJJ A;  2FBD A;  4DD9 A;  3D3D A;  3CT0 A;  1JHL A;  1LZ1 A;  2BQK A;  133L A;  4HJV A;  5HMJ A;  3TMW A;  4OWE A;  2MEC A;  1V7S A;  4NHS A;  1JTO L;  2Z38 A;  3TXB A;  2BQJ A;  1IY4 A;  1HEQ A;  1LZE A;  1QSW A;  5KXL A;  3IJU A;  3W6C A;  3B6L A;  4NGY A;  1BVK C;  1UCO A;  3AZ7 A;  1IWY A;  1GFU A;  3W6B A;  1IC7 Y;  1I1Z A;  2MEE A;  4Z46 A;  4N5R A;  1B2K A;  2BLY A;  1HEW A;  4Z3M A;  3AB6 A;  1G7J C;  193L A;  4GCE A;  3WU7 A;  3RW8 A;  1JKB A;  1HF4 A;  4B49 A;  1SQ2 L;  1LZA A;  1GFR A;  2LZT A;  2F30 A;  4NGK A;  3AGH A;  4HPE A;  1OQM A;  1KXX A;  3AGG G;  1KXW A;  1CKC A;  2MEI A;  5FEL A;  5KXW A;  5I54 A;  2YBI A;  4LYO A;  1LYY A;  4HSF A;  1WQM A;  1GB8 A;  4DWX A;  1IOC A;  4NWE A;  1EQ4 A;  1JSF A;  1SLY A;  4LYC A;  3TMV A;  4WL7 A;  1FKQ A;  1HMK A;  5C6I A;  2CDS A;  1TDY A;  2XBR A;  1AKI A;  4U3X B;  1IOT A;  4WM5 A;  1FN5 A;  3P65 A;  2ZYC A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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