4ML7A

Crystal structure of brucella abortus plic in complex with human lysozyme
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural Basis for the Inhibition of Human Lysozyme by PliC from Brucella abortus
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-09-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4ml7A00
3W6BA 4RLNA 1LSPA 1YL0X 4UWVA 3W6CA 2ZIKA 3ATNA 3ZVQB 1DPWA 1LHHA 4LZTA 4BAPA 4G4CA 4HTQA 4LYZA 3IWRA 1FN5A 2FBBA 4LYTA 153LA 3WUMA 1WQMA 4NY5A 2YVBA 4DC4A 2MEAA 5D5CA 4WM5A 1GFJA 3D3DA 2DBTA 1JISA 1CJ6A 1B9OA 193LA 134LA 3WUNA 1IVMA 1B5UA 1RE2A 1GF5A 1TDYA 4H9AA 1B7MA 1YILA 1LJNA 3G3AB 1GFAA 1IIZA 2YSSC 4WL7A 1OUAA 1OUCA 3BKVA 4G9SA 1B7LA 1IP6A 1GB0A 4HP0A 4GCEA 1DPXA 1WQRA 4FJRA 2CDSA 3TXEA 4H90A 1LZRA 5B1FA 1GF3A 3TMUA 3QNGA 1BWJA 1XGTC 1HC0A 2C8OA 3AB6A 1Z55A 132LA 2HU3A 3SP3A 3WW5A 4X3BA 4DD2A 1W08A 3AGHA 1BVKC 4U3XB 1REXA 2BQMA 2HEEA 1NF5A 5L3IA 1GDXA 1XFPL 2WARA 4OWEA 3WW6A 1EL1A 1QUTA 1JTPL 4DD3A 1VAUA 1KIRC 1WQNA 5KXNA 3N9CA 2CWIA 4OOTA 3W6DA 5II3A 1LSEA 1JKBA 5LVHA 2MEEA 4NHIA 1IWUA 1YKZX 3ZEKA 2YBIA 3FE0A 1LJEA 5KXRA 4DWXA 1G7IC 2G4QA 4QEQA 2Y8PA 1DXJA 1IEEA 4YEMA 3WU8A 3D9AC 4NWHA 5LVKA 1F6RA 2HECA 4NGOA 4TSCA 3AZ6A 3ATOA 4WM2A 3B0OA 8LYZA 1XSFA 4YM8A 4NIJA 4PHIA 3B72A 5D5FA 1YL1X 1HEPA 2ZYPA 1CKDA 1GAZA 1B7QA 4WLTA 1GFHA 1JSEA 2YBMA 4XADA 1OUBA 3RT5X 1T3PA 1I56A 2GV0A 5KXTA 1REZA 4GN4A 5KKJA 1T6VL 1LZEA 4OW1A 4KL7A 2HUBA 5L3HA 4UWUA 4MSTA 1UIAA 2X0AA 4XJFA 4HJVA 3A95A 3LYZA 1GBOA 1LJJA 2BQFA 2EIZC 3A3RX 3TXHA 1YKYX 1LJKA 1IR9A 3LYMA 4N9RA 4XN6A 3QE8A 4H9IA 3MGWA 4OWBA 4WMGA 1GEZA 3A67Y 1GF9A 3EXDA 3HBDA 5LYZA 4ETAA 4ET9A 4O34A 194LA 3A91A 3WH1A 1JSFA 1GBSA 5KKIA 5LAFA 1DI3A 2FYCA 4H92A 4DYGA 5IHGA 1OP9B 5DN4A 3CSRA 4AGAA 4WG7A 1GAYA 1ZVHL 4WOAA 5F16A 1LMNA 4XJHA 4XJGA 4QDNA 3CB7A 4HPEA 3CSQA 4NG1A 4PGJB 2XJWA 3CT1A 1LMCA 2YBHA 1JKAA 3CT5A 1GB3A 2A7DA 1LZDA 2EKSC 4NFVA 1GXXA 1LHLA 1YAMA 4R0FA 4C3WA 4H94A 1IR8A 1LZBA 1REMA 4C5FA 1VDTA 3N9AA 4YENA 4N0JA 2BQEA 5KXMA 1LSFA 3TXFA 3ULRA 1MLCE 1RI8B 3RW8A 1HFYA 1JTTL 1LSBA 1RFPA 3TMXA 3A93A 1C7PA 5LINA 1NDGC 2DQFC 3TXBA 1GF6A 4HPIA 4G4HA 2XBRA 2FBDA 3WUAA 4NSJA 1UC0A 5FELA 5I4YA 4LYOA 2BQJA 1JJ3A 4II8A 1GE1A 1A4VA 5L9JA 4DDCA 4NSIA 2D6BA 4OWAA 3B0KA 4ETEA 1OUEA 1BWIA 5F9UA 5KXZA 1LZ1A 1J1OY 4H91A 3HBEX 1IWVA 1GB6A 1FLUA 2HEFA 1AT5A 1B7SA 4Z98A 4HV2A 2F4AA 1VDSA 4LFPA 4N8ZA 4CFOA 1D6PA 2IFFY 2LZTA 5HMJA 4HSFA 1DI4A 1HERA 4ETCA 5LXWA 1LZSA 1ZV5L 2BLYA 1HFZA 4LFXA 4ZEEA 1LJHA 2LZ2A 1IWYA 1NDMC 1MELL 3OJPA 1QTKA 4NGIA 1B0DA 1LTMA 4NHPA 4WL6A 4PRQA 3A92A 3EBAB 1BQLY 5C6LA 4KT3A 1JIYA 1VDPA 3LYOA 4B4IA 1C08C 1LKSA 3CSZA 4TWSA 1IP1A 1UIDA 5B1GA 6LYTA 1CJ7A 1LYZA 3A90A 5EBHA 4NHTA 4HTNA 4RDSA 5KXSA 5LA8A 3T36A 4NEBA 3TXDA 1ZVYB 1D6QA 3VWOA 1GF0A 4B49A 4OWHA 2Z39A 3W6EA 1CNSA 1VEDA 2ZILA 3AZ4A 1RCMA 7LYZA 1YAQA 2DQIY 1UIGA 4J0LA 5LYTA 208LA 1BVXA 1ALCA 3GXRA 1IWXA 3AW7A 5KXLA 2BQLA 1LHIA 3IJUA 154LA 4MR1A 1B7PA 1YAOA 1LHJA 133LA 4NWEA 1HSXA 1KIPC 3A3QA 4KXIA 2DQHY 1QQYA 1DI5A 5B06A 3RNXA 2EQLA 4HV1A 1HELA 3P4ZA 5C6JA 1XEKA 4LT2A 2VB1A 1LMOA 1IY4A 1BB4A 1HEMA 4EOFA 1OUIA 3OK0A 1LYOA 2ZIJA 1OUDA 1IO5A 4N1CC 1RJCB 3WU9A 1AZFA 4KPMA 4R6CA 1WTNA 1H87A 1GFGA 1LZ4A 1HHLA 2DQJY 1OUGA 1LZAA 1W6ZA 3P66A 5FHWA 4DDBA 4PRUA 1IWTA 1QSWA 4N5RA 1HMLA 4H8YA 4A7DA 2LYOA 5ILCA 1WQOA 1UA6Y 4GN3A 5HQ1A 1XGQC 3N9EA 4Z46A 5J7CA 1BGIA 4WM4A 1GHLA 4WG1A 1J1PY 4TSBA 1C46A 1REYA 5APCA 1F10A 1I20A 1LAAA 3A6BY 3EO5A 1LZYA 5LAGA 2BQAA 1IP2A 2YDGA 4IJ4A 5JENB 1GB8A 4WM1A 1LOZA 4XYYA 1LZCA 5A3ZA 4ANRA 1B5VA 4WM6A 4GCCA 5APFA 5FCPA 2BQOA 1JKDA 1UACY 2CJLA 2BLXA 2DQAA 1LSNA 2LYMA 1IR7A 5DL9A 3WU7A 2I6ZA 5B59A 1CKCA 5I4WA 1NBYC 1NQIA 3CQLA 1XEJA 1KIQC 2MEFA 4XJDA 1CJ8A 1GFKA 2HEBA 2HEDA 4DDAA 1BHZA 1LPIA 1GDWA 4NGLA 5B07A 1LJIA 1YROA 2DQDY 4J7VA 4PPOA 1D0KA 1GF8A 4H9HA 2MEDA 1GFVA 5T3FA 4CHXA 3WXTA 3W6FA 1TEWA 4H9EA 4LT3A 1FBIX 1IORA 1GFRA 1YAPA 2LYZA 5I53A 5KXPA 1GBYA 4ETBA 1HNLA 1UIEA 4IATA 5DLAA 5F9XA 3KAMA 1DQJC 5LIOA 2D91A 1OUFA 5IELA 1UICA 4I8SA 1HSWA 1IWZA 9LYZA 1V7TA 3TXKA 4GLVA 1BB3A 4DD7A 1B2KA 1ZMYL 3QY4A 1DKJA 1LHKA 2MEIA 2Z38A 4D9ZA 2H9JA 4NSGA 4TUNA 3HBHA 5APEA 1LZ5A 1UCOA 1KXXA 4WLYA 1OUJA 1TAYA 1HMKA 1LZ6A 2BQKA 2F2NA 4TTDA 1QUSA 6LYZA 1BB7A 4H93A 4AXTA 3P68A 5F81A 1JJ1A 4NGZA 1F0WA 2H5ZA 5KXWA 2H9KA 2FYDA 4RLMA 3RZ4A 1TBYA 1GB5A 3HFMY 1FLYA 1NWGA 2MEHA 1QTEA 5F14A 4WO9A 3A34A 1LSYA 4OWCA 4GCDA 5I4XA 1G7HC 1F6SA 1UIHA 1B5WA 1JTOL 1IOTA 2YBNA 1LJ3A 4WLDA 3TXJA 1EQ5A 1SQ2L 1IP5A 2W1LA 3AW6A 4LYCA 3M18B 3TXGA 3WXUA 2IHLA 2ZNWY 3P65A 1CKFA 2RSCA 3WL2A 1JHLA 1VDQA 3FI7A 4WLXA 1AM7A 5LVIA 135LA 2F4GA 2BQNA 4ETDA 1LZTA 2BQBA 1IC7Y 1IP4A 1HEWA 1C10A 1HEOA 2MEBA 1GB7A 1IC5Y 4EMNA 4MCKA 4QY9A 5E4PA 1YKXX 3AGGG 5KY1A 1LZ9A 1IP7A 1LHMA 1NKHA 3BKHA 1G7MC 5IDDA 3RU5A 5HMVA 2DQCY 4LT1A 1GFEA 1GFTA 4CJ2A 1GF4A 1AT6A 2MECA 2Z2FA 4TX7A 4B4JA 1BB5A 1V7SA 1GE2A 1QDTA 4H8ZA 5LA5A 3LHMA 4G4BA 1D0LA 3LZTA 2BQCA 2ZNXY 1JUGA 1I1ZA 1GF7A 1O23A 4GCBA 1GEVA 2YBJA 5HNLA 2YBLA 3CT0A 4E3UA 4YF2A 1WQPA 1IY3A 5KXKA 4B0DA 2LHMA 1QSAA 1LJGA 2HTXA 4HTKA 4Z41A 3LYTA 1GB9A 1XGUC 1XGRC 4YEOA 4LGKA 1LSAA 5A3EA 1VATA 1NBZC 2DQGY 1C43A 1QDRA 5LVGA 4WM3A 3WPLA 1JWRA 1VFBC 1GD6A 4UWNA 4PJ2C 1LSMA 1DKKA 2I25L 2G4NA 4NHQA 1GE3A 2ZQ3A 1B7OA 1KXYA 3EMSA 3TXIA 1WTMA 5M1YA 1YANA 1LZ8A 1LSCA 1B5XA 2W1XA 1LYSA 2BQDA 1GXV2 4LYBA 1HFXA 1UIFA 5I5QA 4B4EA 3WULA 5B05A 5KXOA 1IOCA 4DT3A 5I54A 3E3DA 4HJYA 1WVVA 3TMVA 1LZGA 3WMKA 4RW1A 1INUA 1OUHA 4NGVA 1NHEA 2Z2EA 1G7LC 4LT0A 1UIBA 4NSHA 1EQ4A 5LYMA 1YIKA 4YOPA 1IX0A 1JJ0A 1CKGA 2C8PA 1GPQC 1JEFA 1UBZA 2D4JA 3GXKA 1YQVY 5HNCA 3B0IA 1LMAA 1CKHA 1LSGA 3K3TA 5KXXA 1LJ4A 4DD9A 4L41A 1LMQA 1LSZA 1UUZC 1GE4A 2D4KA 2N5ZA 2BPUA 4B1AA 1H6MA 1BB6A 4H9CA 3WYHA 1QIOA 4NGKA 1D9UA 4BADA 3WPJA 1LCNA 1BWHA 3WVYA 1IOSA 2Q0MX 4NGWA 3LZ2A 207LA 2AUBA 4P2EA 4W94A 4M6DA 1PZYA 4ZFPA 4NGYA 1LMTA 3W6AA 1JKCA 4GCFA 4ML7A 2HU1A 1DZBX 3J6KA 2D4IA 1LJFA 4CGEA 4H9FA 4H8XA 1LZNA 1FDLY 2HEAA 2Z12A 4GN5C 1IWWA 1IOQA 1FLWA 1FKQA 1LMPA 4NGJA 3WVXA 2BQHA 1N4FA 2PC2A 4FDYA 1IP3A 1B7NA 1LKRA 5FEKA 2W1MA 2A7FA 5DM9A 1TCYA 5HLLA 4I0CA 1WVUA 2F30A 1CJ9A 1P2CC 4WO6A 2Z37A 3AJNA 3M3UA 1KXWA 1NMMA 5ILFA 5DN5A 1B5ZA 4NG8A 4CFPA 3AZ5A 4G49A 1IC4Y 1D0MA 1WQQA 4OOOA 4XJIA 2Z19A 5E9RA 5FDJA 5FSTA 3ZVQA 2ZQ4A 4GLAA 1SLYA 2XTHA 3B6LA 1GE0A 5K7OA 1PS5A 2I26L 1HENA 5C6IA 4BS7A 1GB2A 2BAAA 3A96A 1FKVA 2G4PA 3TMWA 1G7JC 2NWDX 2ZYCA 2BQGA 3AYQA 3F6ZA 4IASA 4W96A 2CGIA 1B5YA 2EPEA 1LSDA 3G3BB 1GBXA 1GBZA 1GBWA 3T6UA 1LYYA 3LN2A 4RW2A 4XJBA 1XEIA 2MEGA 2DKVA 1GFUA 4DD0A 1A2YC 1FLQA 3A6CY 2ZWBA 4H1PA 4BAFA 1EQEA 4N1EI 3AGIA 4XENA 4QGZA 2XBSA 4DD1A 4H9BA 3AZ7A 3A8ZA 1J1XY 4J1AA 5APDA 1GWDA 4ZIXA 1AKIA 1JITA 1HEQA 2B5ZA 5KXYA 4J1BA 1E8LA 3A94A 4M4OA 4NHSA 1XGPC 2W1YA 3P64A 3W3EA 2DQEY 1B7RA 4LYMA 2Z18A 5AMYA 4Z3MA 4HJZA 5LVJA 4ET8A 1OQMA 3WPKA 2BQIA 5KJ9A 3IJVA 1JPOA 3J4GA 1HF4A 1C45A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YL0X 3W6CA 2ZIKA 4LZTA 4LYZA 3IWRA 1QT8A 3HWLA 3HTDA 1L45A 4WM5A 1GFJA 1LJNA 1L63A 4I7TA 3G3AB 1IIZA 1PQMA 3BKVA 4GCEA 1QS9A 1GF3A 1BWJA 1HC0A 256LA 2C8OA 1Z55A 132LA 4X3BA 1W08A 3HTGA 181LA 1NF5A 1QUTA 4DD3A 1KIRC 212LA 3N9CA 5II3A 1C61A 4OOTA 1LSEA 2L78A 5LVHA 4NHIA 5KXRA 2G4QA 1DXJA 131LA 1T8FA 2RBPA 3B72A 2F47A 1CKDA 1JSEA 2YBMA 1OUBA 1T3PA 249LA 4W53A 5L3HA 2B72A 4MSTA 1CUQA 1WTHA 3A95A 1LJJA 3F9LA 147LA 4I7SA 1P2LA 1C69A 3QE8A 4WMGA 3MGWA 3HBDA 5LYZA 194LA 1JSFA 5LAFA 1DI3A 2FYCA 4DYGA 107LA 1D3NA 2HUKA 1ZVHL 2RBSA 5F16A 4XJHA 1LI2A 1L31A 4PGJB 2XJWA 3CT1A 1CVKA 1LZDA 2EKSC 1GXXA 1YAMA 4C3WA 1L32A 227LA 4C5FA 4YENA 1XJTA 1MLCE 1QT3A 3RW8A 1HFYA 1LSBA 1C7PA 1GF6A 5I4YA 2XBRA 4NSJA 5FELA 4II8A 5L9JA 2Q9DA 4DDCA 3B0KA 4ETEA 1OUEA 5F9UA 251LA 5KXZA 1LZ1A 1FLUA 1L85A 2F4AA 164LA 4CFOA 213LA 2IFFY 2LZTA 4YXCA 4ARJA 2OE4X 196LA 1L69A 3GUPA 1L91A 173LA 3OJPA 4WL6A 4S0WA 2OTZX 4PRQA 1JIYA 1C08C 1C6LA 1LKSA 1UIDA 5EBHA 4RDSA 1L21A 5KXSA 158LA 1ZVYB 1D6QA 1C62A 2ZILA 3AZ4A 7LYZA 4J0LA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3W6B A;  4RLN A;  1LSP A;  1YL0 X;  4UWV A;  3W6C A;  2ZIK A;  3ATN A;  3ZVQ B;  1DPW A;  1LHH A;  4LZT A;  4BAP A;  4G4C A;  4HTQ A;  4LYZ A;  3IWR A;  1FN5 A;  2FBB A;  4LYT A;  153L A;  3WUM A;  1WQM A;  4NY5 A;  2YVB A;  4DC4 A;  2MEA A;  5D5C A;  4WM5 A;  1GFJ A;  3D3D A;  2DBT A;  1JIS A;  1CJ6 A;  1B9O A;  193L A;  134L A;  3WUN A;  1IVM A;  1B5U A;  1RE2 A;  1GF5 A;  1TDY A;  4H9A A;  1B7M A;  1YIL A;  1LJN A;  3G3A B;  1GFA A;  1IIZ A;  2YSS C;  4WL7 A;  1OUA A;  1OUC A;  3BKV A;  4G9S A;  1B7L A;  1IP6 A;  1GB0 A;  4HP0 A;  4GCE A;  1DPX A;  1WQR A;  4FJR A;  2CDS A;  3TXE A;  4H90 A;  1LZR A;  5B1F A;  1GF3 A;  3TMU A;  3QNG A;  1BWJ A;  1XGT C;  1HC0 A;  2C8O A;  3AB6 A;  1Z55 A;  132L A;  2HU3 A;  3SP3 A;  3WW5 A;  4X3B A;  4DD2 A;  1W08 A;  3AGH A;  1BVK C;  4U3X B;  1REX A;  2BQM A;  2HEE A;  1NF5 A;  5L3I A;  1GDX A;  1XFP L;  2WAR A;  4OWE A;  3WW6 A;  1EL1 A;  1QUT A;  1JTP L;  4DD3 A;  1VAU A;  1KIR C;  1WQN A;  5KXN A;  3N9C A;  2CWI A;  4OOT A;  3W6D A;  5II3 A;  1LSE A; 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 2HEA A;  2Z12 A;  4GN5 C;  1IWW A;  1IOQ A;  1FLW A;  1FKQ A;  1LMP A;  4NGJ A;  3WVX A;  2BQH A;  1N4F A;  2PC2 A;  4FDY A;  1IP3 A;  1B7N A;  1LKR A;  5FEK A;  2W1M A;  2A7F A;  5DM9 A;  1TCY A;  5HLL A;  4I0C A;  1WVU A;  2F30 A;  1CJ9 A;  1P2C C;  4WO6 A;  2Z37 A;  3AJN A;  3M3U A;  1KXW A;  1NMM A;  5ILF A;  5DN5 A;  1B5Z A;  4NG8 A;  4CFP A;  3AZ5 A;  4G49 A;  1IC4 Y;  1D0M A;  1WQQ A;  4OOO A;  4XJI A;  2Z19 A;  5E9R A;  5FDJ A;  5FST A;  3ZVQ A;  2ZQ4 A;  4GLA A;  1SLY A;  2XTH A;  3B6L A;  1GE0 A;  5K7O A;  1PS5 A;  2I26 L;  1HEN A;  5C6I A;  4BS7 A;  1GB2 A;  2BAA A;  3A96 A;  1FKV A;  2G4P A;  3TMW A;  1G7J C;  2NWD X;  2ZYC A;  2BQG A;  3AYQ A;  3F6Z A;  4IAS A;  4W96 A;  2CGI A;  1B5Y A;  2EPE A;  1LSD A;  3G3B B;  1GBX A;  1GBZ A;  1GBW A;  3T6U A;  1LYY A;  3LN2 A;  4RW2 A;  4XJB A;  1XEI A;  2MEG A;  2DKV A;  1GFU A;  4DD0 A;  1A2Y C;  1FLQ A;  3A6C Y;  2ZWB A;  4H1P A;  4BAF A;  1EQE A;  4N1E I;  3AGI A;  4XEN A;  4QGZ A;  2XBS A;  4DD1 A;  4H9B A;  3AZ7 A;  3A8Z A;  1J1X Y; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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