4ML7A

Crystal structure of brucella abortus plic in complex with human lysozyme
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Basis for the Inhibition of Human Lysozyme by PliC from Brucella abortus
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-09-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4ml7A00
1F0WA 1BB7A 2MEGA 2BQDA 1JJ1A 2HTXA 1WQMA 5D5CA 4ETEA 1WTMA 1JKCA 3QNGA 1IR8A 5B07A 5I53A 1DPXA 1LMCA 3M3UA 1LAAA 1LZTA 1IC4Y 1LJNA 5DL9A 4QGZA 3WH1A 1C45A 1SQ2L 2DQJY 4BS7A 1GFAA 2ZNXY 2ZIKA 4H8XA 1UIFA 4ETAA 5IELA 5APCA 1HFXA 4NHSA 3RNXA 1BQLY 2ZQ4A 3G3AB 4OWAA 1BB3A 1ZMYL 1LMNA 3AYQA 3N9CA 4LYBA 1GFKA 4LT3A 5DLAA 1IOCA 1REZA 1LOZA 1LSPA 3F6ZA 4NGWA 4PGJB 4C5FA 4NFVA 5A3ZA 4DD1A 1QUSA 6LYTA 1C7PA 1LSZA 2ZILA 3B0IA 3WXTA 2DQIY 1W6ZA 1GEVA 3CSRA 1JKBA 2EKSC 3D3DA 5B05A 4PJ2C 2BQMA 3AGIA 5KXMA 1CKDA 1GF4A 3A92A 3TMVA 1GF0A 3IJVA 1GFVA 2IFFY 3WPJA 3WXUA 153LA 4DD0A 4H9FA 4OOOA 3K3TA 2Z18A 1IP3A 1FLQA 1GFHA 5KXOA 4GLVA 1LSGA 1B5VA 1NWGA 208LA 1XGTC 4U3XB 3TXJA 1HEOA 1BB6A 1GXV2 4RDSA 4GCCA 5EBHA 5KXYA 1LJ3A 3HFMY 3EO5A 4KL7A 4LYMA 1JTPL 3ATNA 2I6ZA 1GE1A 4M4OA 5LYMA 1J1OY 1IY3A 5B1GA 4TX7A 1LKSA 5C6IA 5B59A 1CNSA 2DQEY 1HELA 4NSHA 5KXPA 4L41A 4HPIA 1LYOA 1HENA 1LZSA 1V7TA 2FBDA 2YVBA 4QEQA 1IWYA 1FLWA 1ZV5L 2BQEA 4NG1A 1BWJA 1LHLA 1GE2A 1NF5A 4HTKA 3CSQA 1YAQA 4CHXA 1B7MA 3E3DA 2BQIA 5KKJA 1RI8B 1B5ZA 2C8PA 3LZTA 5KKIA 4II8A 1JPOA 3IJUA 4N8ZA 1JJ0A 4WL6A 4MCKA 4TTDA 4EMNA 3TXEA 2BLXA 4ETBA 5FELA 1KIRC 1T3PA 1QDRA 1XFPL 1B7OA 1GBOA 1LZCA 3WUNA 1LSCA 2Z39A 4XJBA 1YROA 2BAAA 3CT0A 4HSFA 4GLAA 1TCYA 5A3EA 1XEKA 2MEDA 3WU9A 1WQRA 3M18B 2YBMA 1BVXA 2CJLA 3WMKA 1RCMA 2C8OA 4H9IA 4YM8A 1DQJC 1LHHA 5HMJA 4DD9A 1VAUA 1GB6A 5APDA 1FLYA 2D4JA 4LZTA 3LHMA 4WM1A 4Z98A 4XJHA 2Z19A 4HJVA 4LT2A 1LSNA 4D9ZA 5D5FA 3EMSA 4IJ4A 5LVIA 1C10A 3WU7A 4TWSA 5I5QA 1GB8A 4DD2A 4CJ2A 1OP9B 1QDTA 3CT1A 4X3BA 2DQCY 1LJEA 1PZYA 3LYOA 2G4QA 3CB7A 1GB3A 3J6KA 3LZ2A 4H92A 4LYZA 4WG1A 3AGHA 1QTKA 1BWIA 1JJ3A 3A34A 1HEWA 2FYDA 1KIQC 1UACY 2BQBA 2HUBA 1ALCA 5LA5A 3N9EA 1JEFA 4NEBA 1YKZX 3CSZA 2HEBA 2MEAA 4NGOA 1IY4A 3CQLA 1GFTA 2Q0MX 1OUCA 4N1CC 5AMYA 1IEEA 1JSEA 4W96A 4GCBA 1P2CC 4H8ZA 1XSFA 1B7LA 4DDCA 1B0DA 1F6SA 134LA 1DI3A 3P65A 4HJYA 3QY4A 3TXIA 1UA6Y 2I25L 2LYOA 5LA8A 1MLCE 1GEZA 3A96A 4TUNA 1GBWA 1A2YC 3LN2A 154LA 3W6CA 4GCFA 1CKGA 3SP3A 1REMA 4HJZA 5F9UA 4YEMA 4G4BA 1UBZA 1IR7A 3N9AA 1LJIA 1B7SA 4P2EA 3B6LA 5J7CA 3GXRA 1B2KA 4XJIA 4GN4A 5APEA 2BQLA 2BQAA 1A4VA 1LTMA 3WUAA 3A90A 4B1AA 4DDBA 2Z2EA 4NY5A 5L3IA 1UIEA 5DN5A 1VDQA 2W1XA 1D0LA 2HEAA 4HTNA 2ZNWY 5KY1A 2F30A 4R6CA 4NGZA 4ZEEA 3WVXA 1B5XA 1IOQA 1LMQA 3LYZA 5HQ1A 1V7SA 1QSAA 1D9UA 1IP5A 1LZ8A 1NDGC 1OUIA 1LJFA 1NKHA 1YKYX 4H90A 1FBIX 4N5RA 3ZVQB 3TXFA 1FLUA 3WULA 1JUGA 5APFA 3TXGA 2D6BA 1OUHA 2Z38A 1BHZA 1LSAA 4HTQA 4OWHA 4HV2A 3WPLA 1MELL 3A93A 4NIJA 2BQHA 1HEQA 2WARA 4WM5A 1WQNA 4WG7A 2MEHA 1AKIA 2Z12A 3CT5A 2H9KA 1LZEA 4B4JA 1AZFA 1JIYA 1DI4A 1YAPA 3FE0A 1W08A 1EQEA 1O23A 1F10A 1OUJA 1GBSA 1LJGA 3EXDA 2MEFA 1JKAA 4PRQA 2XBRA 3WUMA 4B4IA 5KXZA 1GB5A 4N0JA 1LZYA 4J1BA 3WW6A 1C43A 3AW6A 1IORA 2LHMA 3A8ZA 1BWHA 2H9JA 5LAFA 3J4GA 3A67Y 4H9HA 4ET8A 4UWVA 5F16A 5KJ9A 1YKXX 1GFJA 5E9RA 1QUTA 2XTHA 4TSCA 5IDDA 1IWXA 1XGQC 3WU8A 5T3FA 3AW7A 4LFXA 4UWNA 3LYTA 1CJ7A 4WM4A 1CJ8A 5LAGA 4WO6A 1IX0A 2MEIA 2HEDA 5KXXA 5E4PA 3T36A 4ZIXA 1DPWA 3BKHA 1NDMC 1FKQA 1RJCB 1D0MA 3W6DA 1GFGA 1NMMA 4BADA 2HEFA 1HEPA 1HFYA 4R0FA 3T6UA 1LZ5A 2CWIA 1D0KA 4NHIA 5ILFA 1GF3A 1G7MC 4GCDA 4ET9A 5IHGA 1GF7A 3A3RX 1RE2A 2AUBA 4O34A 1C46A 2X0AA 2DKVA 3IWRA 1DKJA 1GAZA 1RFPA 3GXKA 3WPKA 4LYTA 1TEWA 1HC0A 1TBYA 2A7FA 1LSBA 1B5WA 4G9SA 1GDXA 3MGWA 1DZBX 1GE4A 2LZTA 1GB2A 4ETCA 3KAMA 1VFBC 4BAFA 4GCEA 1GHLA 3AZ5A 4WLXA 1LKRA 1B5YA 4DD7A 1Z55A 1I56A 1WTNA 1T6VL 1LZAA 2HECA 3WVYA 5F81A 4LYCA 4OWCA 3AZ4A 1JSFA 1NBYC 1UIGA 1GWDA 2XJWA 2YSSC 2Z37A 193LA 3RW8A 3W6FA 4ML7A 5F9XA 1YAMA 5C6LA 5DN4A 1OQMA 2EIZC 1IOTA 3B0OA 5KXTA 2DQAA 4WMGA 5I4XA 1E8LA 1LZDA 1VATA 1GE0A 1OUFA 2YDGA 1EQ5A 4UWUA 4OWBA 2FBBA 4Z41A 4OW1A 1HMLA 1LHJA 135LA 1XEJA 2B5ZA 1IR9A 4Z3MA 1NBZC 2BPUA 5M1YA 1IIZA 1B7PA 1IVMA 2CGIA 1LMAA 1OUAA 4AGAA 5KXLA 1LMPA 1LYYA 4IASA 5KXWA 1BB4A 3AZ6A 1LSDA 4WL7A 5LVJA 2N5ZA 1LJ4A 1OUBA 4NSIA 5ILCA 4GN3A 2I26L 4XJGA 4HPEA 1QTEA 4KPMA 4NGLA 1REYA 2F4GA 4CFPA 1LPIA 6LYZA 1VDTA 1ZVHL 4TSBA 5B1FA 3TXHA 1IO5A 4LT0A 2DBTA 3TXDA 1IP7A 132LA 1CKCA 1FN5A 1UICA 1XGUC 4W94A 1NQIA 4XADA 4H94A 3TXBA 1YILA 2G4NA 5LVHA 3A91A 1D6QA 1TAYA 1YL0X 1JTOL 4NHTA 4XYYA 4DWXA 1HNLA 3WL2A 3BKVA 4H9BA 1GFEA 1KXYA 1LMOA 2LYZA 4B4EA 1LJKA 1QSWA 2VB1A 3WYHA 207LA 5HNCA 4J7VA 1LSYA 1JITA 5KXRA 4G49A 7LYZA 1REXA 5L3HA 3AB6A 4DT3A 3TMWA 3AZ7A 1OUDA 2ZYCA 3B72A 1GFRA 4DC4A 1HHLA 4EOFA 2DQFC 1CJ6A 1GDWA 1GF5A 4B0DA 1FKVA 1LSMA 5B06A 4N1EI 4B49A 3AGGG 4GN5C 4PRUA 1WQQA 1I20A 1LSFA 4PPOA 4I8SA 4J1AA 1AT5A 4NG8A 1HF4A 1KIPC 1LCNA 1OUGA 2ZYPA 4G4HA 3VWOA 4H9AA 4NSGA 5FCPA 1YIKA 1FDLY 4NGYA 5I4YA 1LYSA 2BQOA 1XGRC 1G7JC 4H91A 4NSJA 1AM7A 133LA 1CJ9A 4H1PA 2D91A 1LZBA 1GE3A 1TDYA 2EPEA 1IWUA 2BQCA 4XN6A 3EBAB 3ZVQA 4A7DA 3P4ZA 2CDSA 5K7OA 1H87A 2ZWBA 1IWWA 4KT3A 5HLLA 3QE8A 1GB7A 5I54A 1IWTA 1IP1A 4AXTA 1NHEA 2HEEA 4WLTA 4WM3A 3TMUA 1LHKA 1JTTL 1QQYA 2YBIA 1B7NA 2DQDY 2YBJA 4M6DA 3W6AA 1LHMA 1LZ9A 1G7IC 1LJHA 1XGPC 2BQNA 2IHLA 4XJFA 2BQJA 4NGKA 1IWVA 2GV0A 1LZNA 4QDNA 1QIOA 4OWEA 5KXKA 2NWDX 4NHQA 1DI5A 1YAOA 1B9OA 1VEDA 4YOPA 5I4WA 1CKFA 4ANRA 4KXIA 5LYZA 4RLMA 5FHWA 1DXJA 2BQGA 3G3BB 3FI7A 2W1LA 3AJNA 1GPQC 3D9AC 1BVKC 1GBXA 1HSXA 4ETDA 4WOAA 4CGEA 1IC7Y 5LINA 5FDJA 2YBLA 4MR1A 3RT5X 2ZIJA 4G4CA 2Y8PA 1G7LC 4YEOA 3WW5A 4RW2A 1WQOA 1WVUA 4Z46A 2XBSA 1B5UA 5LVKA 4YF2A 1KXXA 1HSWA 2D4IA 1CKHA 1YANA 2MEEA 3A3QA 4BAPA 5LIOA 3OJPA 4WM6A 4LYOA 1VDPA 4NHPA 3ATOA 1GB9A 2YBHA 1B7RA 2LZ2A 3ULRA 5F14A 3ZEKA 1JKDA 4H9EA 4NWEA 1YQVY 1LZ6A 1N4FA 2BQFA 5HNLA 2W1MA 1LJJA 1IWZA 1LHIA 1GF8A 2HU1A 1GF6A 2PC2A 3B0KA 4HP0A 1HEMA 2MEBA 5KXSA 5C6JA 5LYTA 2W1YA 1G7HC 2F4AA 1UIDA 2MECA 1GB0A 4PHIA 1PS5A 4DDAA 1GFUA 2A7DA 5LXWA 1ZVYB 1F6RA 1JHLA 3HBHA 4RW1A 3P68A 1J1XY 4ZFPA 1EQ4A 4CFOA 4XENA 5L9JA 3TMXA 4I0CA 4J0LA 1UIBA 1IP4A 1GXXA 1DKKA 1GF9A 4E3UA 1J1PY 1IC5Y 4DYGA 4H9CA 3A95A 4LGKA 2FYCA 4H8YA 1UC0A 1UIHA 1H6MA 1LZRA 2RSCA 4C3WA 1HERA 1LYZA 1I1ZA 1OUEA 4N9RA 1AT6A 1JISA 8LYZA 1YL1X 4QY9A 2YBNA 1GAYA 1LZGA 1BB5A 4YENA 1HMKA 1JWRA 1SLYA 1VDSA 4IATA 2LYMA 5DM9A 1INUA 4OOTA 5JENB 2H5ZA 2EQLA 9LYZA 4NGIA 1D6PA 1IP6A 2G4PA 3P66A 4H93A 5HMVA 4DD3A 3HBDA 5II3A 1BGIA 1UIAA 1UUZC 4WM2A 1IP2A 4XJDA 2BLYA 2Z2FA 4FJRA 5FEKA 1EL1A 1UCOA 3W6BA 1GD6A 2BQKA 2DQGY 4WO9A 1B7QA 3OK0A 1HFZA 2D4KA 2ZQ3A 3P64A 5FSTA 3RU5A 1LZ4A 3HBEX 4HV1A 4WLYA 3A94A 4LFPA 4NGJA 3A6BY 4NWHA 4NGVA 194LA 4WLDA 3TXKA 4RLNA 2F2NA 1LMTA 3W6EA 3A6CY 4LT1A 1WVVA 3LYMA 4FDYA 1IOSA 1LZ1A 1XEIA 2HU3A 5KXNA 3RZ4A 5LVGA 1GBYA 1C08C 1WQPA 4MSTA 1LSEA 3W3EA 1GBZA 2DQHY 1KXWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1F0WA 1L24A 1QT7A 4I7LA 200LA 259LA 1IR8A 5B07A 1LZTA 1IC4Y 5IELA 2ZNXY 2ZIKA 4OO9A 4W53A 125LA 3RNXA 2ZQ4A 1L59A 4W51A 3HTDA 1QTHA 231LA 1IOCA 260LA 4NFVA 4DD1A 1QUSA 6LYTA 3B0IA 2DQIY 2EKSC 3DMXA 3D3DA 252LA 102LA 3A92A 3IJVA 3HTFA 1GFVA 3WPJA 153LA 114LA 5KXOA 4GLVA 1B5VA 2RAZX 1BB6A 4EPIA 4GCCA 1LJ3A 3SBAA 1GE1A 1IY3A 3HUKA 5KXPA 1LZSA 1HENA 1V7TA 1IWYA 1FLWA 1LHLA 3HH5A 3E3DA 1RI8B 3SB8A 1L29A 1JJ0A 4MCKA 144LA 1T3PA 4I7KA 4XJBA 1YROA 3CT0A 1C60A 4GLAA 3SB6A 2MEDA 1BVXA 2CJLA 2RBQA 2C8OA 3HT7A 1PQDA 1DQJC 1P36A 1VAUA 1L35A 3LHMA 2NTHA 4XJHA 2NTGA 137LA 5D5FA 1C10A 5I5QA 3CT1A 1LI2A 1LYFA 1G0MA 1LJEA 140LA 3J6KA 3LZ2A 4LYZA 1QTKA 1BWIA 2OU9A 1KIQC 2BQBA 2HUBA 1ALCA 1YKZX 3CSZA 1L15A 4NGOA 3CQLA 1GFTA 1DYGA 2Q0MX 1QSQA 1DYCA 5AMYA 1IEEA 4GCBA 4DDCA 3SB5A 3HH6A 3QY4A 1UA6Y 2LYOA 1A2YC 3OE8A 3W6CA 1CU5A 5F9UA 1B7SA 1L50A 1A4VA 3HDEA 3A90A 4NY5A 1UIEA 4EPFA 2HEAA 2ZNWY 5KY1A 2F30A 4NGZA 4W57A 4I7OA 1B5XA 1LMQA 1CX7A 1NDGC 1D3MA 3ZVQB 213LA 3OE0A 2D6BA 3GUKA 2Z38A 1BHZA 3F8VA 1CU3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1F0W A;  1BB7 A;  2MEG A;  2BQD A;  1JJ1 A;  2HTX A;  1WQM A;  5D5C A;  4ETE A;  1WTM A;  1JKC A;  3QNG A;  1IR8 A;  5B07 A;  5I53 A;  1DPX A;  1LMC A;  3M3U A;  1LAA A;  1LZT A;  1IC4 Y;  1LJN A;  5DL9 A;  4QGZ A;  3WH1 A;  1C45 A;  1SQ2 L;  2DQJ Y;  4BS7 A;  1GFA A;  2ZNX Y;  2ZIK A;  4H8X A;  1UIF A;  4ETA A;  5IEL A;  5APC A;  1HFX A;  4NHS A;  3RNX A;  1BQL Y;  2ZQ4 A;  3G3A B;  4OWA A;  1BB3 A;  1ZMY L;  1LMN A;  3AYQ A;  3N9C A;  4LYB A;  1GFK A;  4LT3 A;  5DLA A;  1IOC A;  1REZ A;  1LOZ A;  1LSP A;  3F6Z A;  4NGW A;  4PGJ B;  4C5F A;  4NFV A;  5A3Z A;  4DD1 A;  1QUS A;  6LYT A;  1C7P A;  1LSZ A;  2ZIL A;  3B0I A;  3WXT A;  2DQI Y;  1W6Z A;  1GEV A;  3CSR A;  1JKB A;  2EKS C;  3D3D A;  5B05 A;  4PJ2 C;  2BQM A;  3AGI A;  5KXM A;  1CKD A;  1GF4 A;  3A92 A;  3TMV A;  1GF0 A;  3IJV A;  1GFV A;  2IFF Y;  3WPJ A;  3WXU A;  153L A;  4DD0 A;  4H9F A;  4OOO A;  3K3T A;  2Z18 A;  1IP3 A;  1FLQ A;  1GFH A;  5KXO A;  4GLV A;  1LSG A;  1B5V A;  1NWG A;  208L A;  1XGT C;  4U3X B;  3TXJ A;  1HEO A; 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 2W1Y A;  1G7H C;  2F4A A;  1UID A;  2MEC A;  1GB0 A;  4PHI A;  1PS5 A;  4DDA A;  1GFU A;  2A7D A;  5LXW A;  1ZVY B;  1F6R A;  1JHL A;  3HBH A;  4RW1 A;  3P68 A;  1J1X Y;  4ZFP A;  1EQ4 A;  4CFO A;  4XEN A;  5L9J A;  3TMX A;  4I0C A;  4J0L A;  1UIB A;  1IP4 A;  1GXX A;  1DKK A;  1GF9 A;  4E3U A;  1J1P Y;  1IC5 Y;  4DYG A;  4H9C A;  3A95 A;  4LGK A;  2FYC A;  4H8Y A;  1UC0 A;  1UIH A;  1H6M A;  1LZR A;  2RSC A;  4C3W A;  1HER A;  1LYZ A;  1I1Z A;  1OUE A;  4N9R A;  1AT6 A;  1JIS A;  8LYZ A;  1YL1 X;  4QY9 A;  2YBN A;  1GAY A;  1LZG A;  1BB5 A;  4YEN A;  1HMK A;  1JWR A;  1SLY A;  1VDS A;  4IAT A;  2LYM A;  5DM9 A;  1INU A;  4OOT A;  5JEN B;  2H5Z A;  2EQL A;  9LYZ A;  4NGI A;  1D6P A;  1IP6 A;  2G4P A;  3P66 A;  4H93 A;  5HMV A;  4DD3 A;  3HBD A;  5II3 A;  1BGI A;  1UIA A;  1UUZ C;  4WM2 A;  1IP2 A;  4XJD A;  2BLY A;  2Z2F A;  4FJR A;  5FEK A;  1EL1 A;  1UCO A;  3W6B A;  1GD6 A;  2BQK A;  2DQG Y;  4WO9 A;  1B7Q A;  3OK0 A;  1HFZ A;  2D4K A;  2ZQ3 A;  3P64 A;  5FST A;  3RU5 A;  1LZ4 A;  3HBE X; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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