4NHTA

X-ray structure of the complex between hen egg white lysozyme and pentachlorocarbonyliridate(iii) (6 days)
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Interaction between proteins and Ir based CO releasing molecules: mechanism of adduct formation and CO release.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4nhtA00
3A6BY 1B5XA 2CGIA 4QDNA 1F10A 1JTPL 4HJVA 1AM7A 1TAYA 4YEOA 4NHTA 2BAAA 1HEQA 1LOZA 4DD1A 2EKSC 4H9AA 1IC5Y 5DN5A 3B0OA 5APDA 1HELA 4W96A 4NGWA 5D5CA 2DQFC 1XFPL 1GD6A 4HTKA 1LSPA 1LMOA 1WVUA 3N9AA 1GFKA 4L41A 3AB6A 1B7OA 1VDTA 2PC2A 3W6AA 3P68A 2YBLA 4DWXA 3WW5A 1JKAA 1UACY 1YKYX 1RJCB 1XGPC 4C5FA 4LYOA 3G3AB 1IR7A 3M3UA 2BQJA 1LZ1A 1WVVA 3OK0A 4OOTA 4NG8A 3CT1A 1GEVA 4TSBA 4WLYA 5F16A 1B7LA 1YAMA 4P2EA 4GCDA 3WU7A 3IJVA 2G4PA 4ETAA 1LMPA 4PRUA 4H8ZA 1J1XY 1QQYA 1XEIA 5EBHA 4NGIA 1G7HC 1P2CC 3WW6A 4NSGA 3ZVQB 1LJFA 1LSMA 1FN5A 3TXBA 5F81A 3BKVA 1FKQA 1HEOA 1GBZA 1OUBA 3T36A 3TXFA 2BQLA 1B2KA 4NGYA 2YSSC 1D0MA 1GAZA 4N1EI 1RI8B 1GB9A 1QSAA 2YVBA 2MEIA 1C7PA 4II8A 2IFFY 5IHGA 4XJHA 1D6PA 1TDYA 1CNSA 3A92A 3CT0A 4GCBA 1IWYA 4D9ZA 1GB3A 4N9RA 1HEWA 1O23A 3A67Y 3WUMA 4H9BA 4YENA 1CKFA 1GDWA 1LZ5A 4FDYA 4WG1A 2AUBA 3CT5A 1GF9A 1EQEA 1GFEA 5LVGA 4B1AA 2G4NA 1FBIX 1YAOA 4WG7A 1IX0A 4ZIXA 5LVJA 5FSTA 2HECA 1CKDA 3ATOA 1IORA 3N9EA 4OWCA 5KXZA 3WUNA 5HMVA 5M1YA 1DPWA 4NY5A 4PGJB 1B5YA 1OQMA 1BVXA 1EQ4A 2LYMA 1LZAA 4TSCA 4TUNA 5KXNA 5LIOA 4I8SA 4LFPA 1LHLA 3QE8A 5KXTA 5LXWA 3ZVQA 5B1GA 1YANA 2ZYPA 4KPMA 2EIZC 3TXDA 5E4PA 4NGKA 2DQJY 1WQQA 2C8PA 1FLWA 3LYMA 1B7QA 1GB0A 2D4JA 1HFYA 1GF4A 1W6ZA 2H9JA 5B59A 5LVHA 4PRQA 4CHXA 1BWIA 1GE2A 2Z37A 3TMUA 1VDPA 1LTMA 4ZFPA 1REMA 3WU9A 1BHZA 3TXHA 1UIDA 4OW1A 1LKRA 3RU5A 4BADA 4Z46A 1IP5A 3AZ7A 4GLAA 4GCFA 3CSRA 1F6RA 4Z3MA 1E8LA 4XYYA 1LYSA 2X0AA 2BQKA 4LYBA 4NHQA 3LYOA 1HERA 2ZIJA 3IJUA 1DZBX 3D3DA 3LZTA 4HJYA 2Z12A 4WLDA 1IC4Y 4GN3A 5KXMA 1VAUA 7LYZA 1NDMC 207LA 2N5ZA 3HBEX 3TXEA 1GF8A 5F9XA 1QSWA 5K7OA 1ZMYL 5APEA 1OUFA 1LZGA 3B6LA 1LJEA 5I4XA 3LZ2A 5LYTA 2ZILA 5KY1A 1IP2A 4HPEA 1GE4A 4WO9A 3FE0A 1KXYA 208LA 3D9AC 3MGWA 1N4FA 2D4IA 3EO5A 1C08C 1VDQA 3CSQA 4NWHA 1CJ6A 2YBNA 4BAFA 5FEKA 1JKBA 4H92A 5L9JA 4KXIA 4G9SA 1D6QA 4H91A 5IDDA 3EMSA 1F6SA 3TMWA 6LYZA 5I4WA 2Z39A 1DPXA 4G49A 1XGUC 1FKVA 3WL2A 1LSEA 2W1MA 1ZV5L 1NBYC 3A8ZA 2XBRA 4LYZA 1B7PA 4ETBA 4ET9A 4PPOA 1NWGA 1KXXA 4NGJA 5LINA 1LYZA 1OUGA 4I0CA 2LZTA 1D9UA 1W08A 2MEFA 1G7LC 4LT2A 4HTQA 1JPOA 2BQOA 3BKHA 3WYHA 2LZ2A 3CB7A 4H93A 3P4ZA 1FLUA 1LZYA 1XEKA 3B0IA 4ZEEA 4N0JA 1DKKA 3WU8A 1LMNA 1T6VL 1JSEA 1IWVA 4IATA 1BVKC 3T6UA 1QDRA 1YL1X 4J0LA 2RSCA 4ANRA 1GE0A 1G7MC 5LVIA 1UICA 1JJ0A 3LN2A 4BS7A 3WVYA 1KIQC 1UC0A 2H5ZA 1DI3A 1IIZA 1A2YC 1KIRC 3TXJA 1UA6Y 4M4OA 5FDJA 1NF5A 1IP3A 2Z38A 3ATNA 5AMYA 1LZBA 1LZ4A 1GF3A 2W1XA 4UWUA 4ETEA 1TEWA 2YBHA 1WTNA 1LSCA 3W3EA 1LSBA 2YBMA 2BQDA 2DQHY 4WLTA 1GBYA 1GE1A 4H9FA 2DQIY 2A7DA 4XN6A 1TCYA 2HEAA 1WQPA 1GF6A 1LJHA 2HEFA 1JHLA 2A7FA 3A94A 3AGHA 4OWBA 1OUEA 1JTOL 3A95A 1GXXA 1AKIA 2CDSA 4NGZA 3A93A 1JIYA 4NSJA 4AGAA 6LYTA 3AJNA 1YKZX 2BQHA 1AT6A 1B7SA 1LJ3A 1LJKA 1VATA 3LYTA 1QDTA 1V7SA 4J1AA 4LT3A 4NSHA 1BB6A 4R0FA 4RLNA 1WQRA 2EPEA 5KKIA 2W1YA 5HNLA 1UIFA 1SQ2L 1D0LA 4IASA 1D0KA 2BQNA 2Q0MX 1IP1A 1DI5A 2BLYA 1DI4A 1I56A 1B9OA 1REZA 1SLYA 4RLMA 1CJ7A 2F4GA 2ZNWY 1IC7Y 5KXKA 3GXKA 4MR1A 1LZNA 1LSGA 1I20A 1WQMA 3WXTA 2BQGA 2F30A 3W6EA 1OUIA 5FCPA 3CSZA 5ILCA 1YL0X 2LYZA 2Y8PA 2Z18A 1LSYA 4GLVA 5APFA 2Z2EA 3A90A 1GFGA 4G4CA 4QEQA 4CJ2A 2XBSA 1GB6A 2HUBA 1GF0A 2B5ZA 3AGIA 1GFRA 4LFXA 5LYZA 4B4IA 1H87A 2ZIKA 5JENB 1LZRA 3A6CY 3TMXA 3WUAA 133LA 1WTMA 1MELL 4DD7A 1NMMA 3AW7A 1YILA 3P65A 1LAAA 4UWVA 5A3ZA 3AZ6A 3TXIA 4RW2A 5I5QA 3N9CA 2F2NA 8LYZA 1LCNA 1MLCE 4HPIA 5E9RA 4WM2A 1FLYA 2BQEA 5LYMA 4WM5A 5HQ1A 1UIHA 4HTNA 4LYCA 4TWSA 1GFHA 4EMNA 2Z2FA 3WXUA 3WH1A 3E3DA 5DN4A 4O34A 1UIGA 1J1OY 4YEMA 3AZ5A 3W6BA 4BAPA 1LZ8A 2YDGA 4GCCA 3RZ4A 1BB3A 1KXWA 4OWEA 4Z98A 4DD3A 1YAQA 4LT1A 1GFAA 1TBYA 1XGRC 4DD0A 1IO5A 4LT0A 1DKJA 1YQVY 4DDAA 3HBDA 1INUA 4PHIA 1LYOA 1LZCA 1LSNA 1ZVHL 1HFZA 2WARA 5B06A 2BQFA 1REXA 2ZQ3A 1LJGA 4OOOA 5KXWA 5C6LA 1GAYA 1I1ZA 1JITA 2EQLA 1REYA 5KJ9A 1B5VA 1IY4A 1LJIA 4G4HA 1LJNA 2BPUA 4ETDA 1VFBC 5F14A 4M6DA 1J1PY 4HP0A 5I54A 1LZEA 2Z19A 1UIEA 1BB4A 4DDBA 1JJ3A 2BQBA 3SP3A 1RE2A 1NHEA 1BB7A 1GFJA 1LMCA 4GN5C 1B5ZA 3WMKA 1G7JC 1GBSA 4PJ2C 5T3FA 1LMAA 4B4EA 2D91A 5I53A 5B05A 1GHLA 4B4JA 5KXXA 5KXOA 5D5FA 3EXDA 1CJ9A 1CKGA 2D4KA 1PS5A 1LMQA 1UCOA 3A3QA 1IWUA 4A7DA 4C3WA 1IR8A 132LA 2DKVA 1KIPC 1LHKA 1YAPA 5C6JA 2DQEY 1HENA 1IR9A 1GBXA 1RFPA 2ZYCA 1BWHA 1UBZA 1LZTA 1IVMA 1UIAA 4B0DA 5FELA 1OUJA 1GXV2 2LYOA 1GDXA 4XJIA 1GPQC 1BB5A 1QTEA 4W94A 4NHSA 4NGVA 1CKHA 1F0WA 1Z55A 4X3BA 1GBWA 4HV2A 1C45A 2MEDA 2DBTA 1B5UA 1GB8A 1NBZC 1VDSA 4N8ZA 4H8XA 4LYTA 3ZEKA 5IELA 1C46A 3TMVA 3CQLA 5KXSA 5DM9A 4OWHA 3WPJA 1QUTA 4EOFA 5KXPA 1YIKA 3LHMA 4WLXA 4WMGA 3A91A 3VWOA 154LA 3W6CA 4IJ4A 4R6CA 2ZNXY 1PZYA 193LA 2MECA 4QGZA 1HF4A 4NEBA 4NG1A 1LHIA 3AW6A 4MSTA 4NIJA 1B7MA 1LHMA 2BQMA 4WOAA 4NGLA 1LJ4A 4OWAA 1JUGA 2DQCY 1LZDA 2GV0A 1NQIA 4N5RA 4HV1A 135LA 4XJDA 3WPKA 4H9IA 4DD2A 4ET8A 3A96A 3OJPA 2I6ZA 1AT5A 1HFXA 1ALCA 1FDLY 1JTTL 194LA 1WQNA 1JJ1A 1B7NA 2HEEA 4XJGA 1IEEA 4DD9A 1HMKA 1LJJA 1OUHA 1GFTA 2BQAA 4NFVA 4NSIA 1IOTA 2HU3A 1JKDA 153LA 3QY4A 2BLXA 1CJ8A 1LSDA 3RNXA 4RW1A 1JKCA 4WM3A 1BQLY 3A3RX 1UUZC 4B49A 2FBDA 1OUAA 3WVXA 1B5WA 1IOQA 4MCKA 1HSXA 2VB1A 5HLLA 1GF7A 4WL6A 3J4GA 5FHWA 1LYYA 4NHIA 1T3PA 4FJRA 1XSFA 4G4BA 3LYZA 2DQDY 4AXTA 3TXGA 1JEFA 3B0KA 1BGIA 4ML7A 1GBOA 1IOCA 2I26L 4XADA 2MEEA 4XENA 1LMTA 2C8OA 3A34A 1IY3A 2HTXA 3K3TA 5ILFA 4KL7A 5F9UA 4CGEA 2BQIA 5L3IA 3M18B 4QY9A 1QTKA 4UWNA 1HNLA 3J6KA 5DLAA 1HMLA 1AZFA 4GN4A 5LVKA 4J7VA 3W6FA 2D6BA 5KXLA 1HC0A 1JWRA 2H9KA 2CWIA 1OUDA 3QNGA 4YF2A 1LZ9A 5LAFA 2HEDA 4H90A 3AZ4A 4LZTA 4NWEA 2FBBA 5B07A 4CFOA 1OP9B 4HJZA 1IWXA 1RCMA 4N1CC 1LZSA 4WM4A 5C6IA 3W6DA 2DQAA 1DQJC 4NGOA 1B7RA 134LA 1A4VA 1GB7A 1XGTC 5B1FA 1IP4A 3F6ZA 4J1BA 1HSWA 1VEDA 4WL7A 3FI7A 3HBHA 2YBJA 4DDCA 2BQCA 1GEZA 4TTDA 2MEHA 1WQOA 3RW8A 5KXRA 5I4YA 2XJWA 3TXKA 3AYQA 3ULRA 1B0DA 1LZ6A 3WPLA 1XGQC 2FYDA 1OUCA 2HEBA 2MEBA 2XTHA 2ZQ4A 4U3XB 5HMJA 5L3HA 4DYGA 1C10A 1GF5A 4YOPA 2MEAA 4Z41A 5KXYA 1GB2A 1GE3A 1C43A 1HHLA 2G4QA 1H6MA 4WM6A 5DL9A 5II3A 5A3EA 1LHHA 1LSZA 1UIBA 2IHLA 2F4AA 2MEGA 4GCEA 4H9HA 4KT3A 4TX7A 5APCA 3WULA 1NKHA 3P66A 3GXRA 1NDGC 2ZWBA 1IWWA 3HFMY 1YKXX 4NHPA 1QUSA 4HSFA 1GWDA 2NWDX 2DQGY 2I25L 1IWTA 1QIOA 4LYMA 4XJFA 1YROA 5HNCA 1XEJA 5J7CA 4H1PA 1CKCA 4XJBA 9LYZA 3KAMA 5LA8A 1JSFA 1DXJA 3G3BB 1GB5A 4H9CA 3AGGG 4YM8A 4H8YA 4RDSA 4H94A 5LA5A 1ZVYB 1V7TA 1FLQA 2CJLA 1LSAA 2FYCA 2W1LA 3P64A 4E3UA 1LPIA 1BWJA 3IWRA 5LAGA 1IWZA 3B72A 3EBAB 4LGKA 4DC4A 4ETCA 1IP6A 4H9EA 4CFPA 4WM1A 5KKJA 1LKSA 1IP7A 1JISA 1IOSA 4DT3A 1GFUA 1HEMA 1LSFA 2YBIA 1EL1A 1EQ5A 1G7IC 1GFVA 3RT5X 4WO6A 1LHJA 2HU1A 2LHMA 1HEPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3A6BY 252LA 4QDNA 1HEQA 4DD1A 1L56A 1G06A 1CV0A 1GD6A 249LA 1WVUA 1GFKA 3AB6A 3W6AA 3P68A 1I6SA 1G0LA 1L44A 1C6NA 1C64A 1L77A 1XGPC 4C5FA 3CDTA 1L16A 3OK0A 1WVVA 3D4SA 1GEVA 2B6TA 5F16A 1B7LA 1YAMA 2RAYX 150LA 4P2EA 4H8ZA 231LA 167LA 1FN5A 3BKVA 1FKQA 1OUBA 4NGYA 2YSSC 1GAZA 1GB9A 1L29A 1QSAA 242LA 1C7PA 4ZPUA 2IFFY 2O7AA 4XJHA 1D6PA 4GCBA 4N9RA 1HEWA 1DYEA 1L25A 1LZ5A 180LA 4FDYA 2AUBA 3CT5A 1GFEA 1IX0A 1SWYA 5KXZA 3WUNA 5HMVA 5M1YA 4NY5A 1B5YA 1EQ4A 5KXNA 5LIOA 1L61A 5B1GA 1YANA 4KPMA 4NGKA 2D4JA 3C8QA 174LA 1HFYA 3HT8A 5B59A 5LVHA 1GE2A 2Z37A 1KW7A 3TXHA 2F2QA 1L42A 2NTGA 1IP5A 3OE6A 3CSRA 201LA 1P36A 182LA 3D3DA 3LZTA 4HJYA 4WLDA 2N5ZA 207LA 3TXEA 5K7OA 5APEA 199LA 107LA 1LJEA 5LYTA 5KY1A 1IP2A 1KXYA 208LA 3CDOA 1N4FA 3CSQA 4BAFA 1LI3A 102LA 4H92A 5IDDA 3TMWA 6LYZA 1FKVA 3CDQA 3WL2A 4ETBA 4LYZA 1P64A 2RBRA 1L28A 1G7LC 4LT2A 4H93A 1LMNA 4IATA 1L66A 1QDRA 1L65A 1YL1X 4J0LA 144LA 1UICA 1JJ0A 1LGXA 1KIQC 1C6MA 1LPYA 1DI3A 4M4OA 1L46A 1LZBA 3HTGA 1TEWA 2YBHA 3W3EA 1C66A 1LSBA 2YBMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3A6B Y;  1B5X A;  2CGI A;  4QDN A;  1F10 A;  1JTP L;  4HJV A;  1AM7 A;  1TAY A;  4YEO A;  4NHT A;  2BAA A;  1HEQ A;  1LOZ A;  4DD1 A;  2EKS C;  4H9A A;  1IC5 Y;  5DN5 A;  3B0O A;  5APD A;  1HEL A;  4W96 A;  4NGW A;  5D5C A;  2DQF C;  1XFP L;  1GD6 A;  4HTK A;  1LSP A;  1LMO A;  1WVU A;  3N9A A;  1GFK A;  4L41 A;  3AB6 A;  1B7O A;  1VDT A;  2PC2 A;  3W6A A;  3P68 A;  2YBL A;  4DWX A;  3WW5 A;  1JKA A;  1UAC Y;  1YKY X;  1RJC B;  1XGP C;  4C5F A;  4LYO A;  3G3A B;  1IR7 A;  3M3U A;  2BQJ A;  1LZ1 A;  1WVV A;  3OK0 A;  4OOT A;  4NG8 A;  3CT1 A;  1GEV A;  4TSB A;  4WLY A;  5F16 A;  1B7L A;  1YAM A;  4P2E A;  4GCD A;  3WU7 A;  3IJV A;  2G4P A;  4ETA A;  1LMP A;  4PRU A;  4H8Z A;  1J1X Y;  1QQY A;  1XEI A;  5EBH A;  4NGI A;  1G7H C;  1P2C C;  3WW6 A;  4NSG A;  3ZVQ B;  1LJF A;  1LSM A;  1FN5 A;  3TXB A;  5F81 A;  3BKV A;  1FKQ A;  1HEO A;  1GBZ A;  1OUB A;  3T36 A;  3TXF A;  2BQL A;  1B2K A;  4NGY A;  2YSS C;  1D0M A;  1GAZ A;  4N1E I;  1RI8 B;  1GB9 A;  1QSA A;  2YVB A;  2MEI A;  1C7P A;  4II8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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