4NWHA

Lysozyme under 30 bar pressure of xenon
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystallographic Studies with Xenon and Nitrous Oxide Provide Evidence for Protein-dependent Processes in the Mechanisms of General Anesthesia
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4nwhA00
1FDLY 1KIPC 1KXXA 4ZEEA 4G9SA 2IHLA 4WO6A 1LOZA 1HHLA 4LFPA 1LZ8A 2I25L 2AUBA 1LSEA 1AKIA 1LZ1A 3GXRA 4WM4A 3AGIA 5IDDA 2DQCY 1LHMA 4FDYA 4LYTA 3W6CA 1QQYA 4H9EA 5I4WA 4HJVA 4NG1A 1WQMA 4NSJA 1G7LC 1XGPC 1QTKA 4B0DA 3AW6A 5EBHA 1P2CC 194LA 2YBNA 4LT2A 2LYMA 1VDSA 4ZFPA 2GV0A 4Z3MA 1LYSA 4TSBA 1JTOL 4DDBA 1H87A 3EBAB 1JKDA 2YDGA 4NGKA 5KXSA 1LZGA 4ET8A 4HTQA 2Y8PA 1CKHA 2EQLA 1EQ4A 5LAFA 1WQRA 1IR7A 1KXYA 1WQOA 4NG8A 1GF5A 3W3EA 5I4XA 4PJ2C 5KXWA 153LA 1LSNA 1XGUC 1CKDA 1LZAA 1HEMA 4HP0A 4B4JA 1KIRC 1KXWA 4NGLA 1CKCA 5LA5A 4OWAA 2ZIJA 1QDTA 2I6ZA 1IP4A 4YOPA 1F6RA 1B7NA 4MCKA 1IY3A 1BB7A 4OOTA 1LMQA 4QEQA 1GF7A 2Z37A 2XBSA 1LSDA 5JENB 5LYTA 1OUJA 2YSSC 135LA 4H9HA 1JJ0A 1IOSA 5F9UA 1RFPA 3WU7A 1LSCA 1HSXA 2H9JA 3A94A 3ZVQB 1WTMA 1BQLY 1UIFA 1UA6Y 3AB6A 1GB0A 3P4ZA 3G3AB 4WM6A 2BQGA 1LZDA 1IC4Y 3AZ7A 208LA 3CB7A 1LSZA 1VDTA 3LN2A 1JITA 1GFJA 1LSPA 1LYOA 1UIAA 2ZQ4A 3A90A 4J0LA 4LT1A 1GFEA 1HFXA 3QE8A 2EIZC 1W08A 4DWXA 3LYOA 1TEWA 2DKVA 1NMMA 1XGRC 4HV2A 5D5FA 1REZA 1C45A 5F81A 4Z46A 1JEFA 2HU1A 3A91A 3WPJA 3TXIA 4RLMA 5A3ZA 1IOQA 4GN4A 1YL0X 4BADA 1FKVA 3T36A 4WG1A 1ZMYL 1B7MA 5LVHA 1LJHA 1HFZA 1YIKA 1TDYA 2MEEA 3GXKA 3P68A 4HPEA 1RCMA 1B9OA 1UACY 1YL1X 3RNXA 4E3UA 4CJ2A 4WLDA 1GE0A 1IP7A 1GE1A 4DD3A 1GEZA 2Z19A 1UIHA 1T6VL 2DQGY 3P65A 5DN4A 4ETCA 4BAPA 1GBOA 1B5VA 1QUSA 4NGJA 5I53A 4OWHA 4BS7A 3TMVA 3WYHA 4DDAA 1JKAA 2BQHA 4G4CA 1NQIA 2MEAA 1LHIA 1UCOA 3TXFA 1CJ6A 1UICA 1B7OA 1MLCE 1NKHA 1UIDA 1LKRA 3HBEX 3A67Y 4HV1A 5KXTA 4NGYA 4WLXA 1CKGA 1LMTA 2IFFY 3N9CA 4H90A 4LZTA 3D3DA 5LVJA 4OWBA 2HEBA 2DQJY 1GXV2 2YBLA 1C43A 5I5QA 3QNGA 1GXXA 2G4PA 1HC0A 1LAAA 4EMNA 4GN5C 1LZ6A 5LAGA 3TMWA 4B4EA 4QY9A 5ILFA 2BPUA 3W6EA 3A8ZA 4DD2A 1LZTA 1WVUA 4X3BA 2CGIA 2LYZA 1LZBA 1BGIA 4H92A 2W1MA 4H8YA 4LYCA 3TXEA 1RE2A 2HTXA 1UIGA 5FDJA 2BQDA 3ZEKA 1GWDA 1GEVA 4DT3A 3A3QA 4WL6A 2W1LA 2DQFC 4LYOA 4YF2A 2HECA 1JJ1A 3AZ5A 1LKSA 3W6AA 207LA 5II3A 4H9FA 3SP3A 4L41A 2BQOA 4DD1A 5KXKA 4XN6A 1LHLA 1B7SA 3J4GA 3TXBA 3E3DA 4GLAA 4ETBA 1GE4A 2YBJA 1PZYA 5APCA 1LSBA 1XEIA 1JTPL 1IOTA 1GF8A 1GF3A 5LYMA 1GBZA 4WO9A 3QY4A 4WL7A 1E8LA 1LZRA 3CSZA 5B05A 4H9BA 1LSFA 2G4NA 3MGWA 4GCCA 1BB5A 1IP6A 4NGIA 4ANRA 2LZTA 2DQHY 1IWUA 4NEBA 5F9XA 1V7TA 2RSCA 3WW6A 4CHXA 2MEGA 4H93A 1UIEA 4IJ4A 1GE3A 1G7MC 2FYCA 2XJWA 3W6BA 1IORA 1SQ2L 1IC7Y 1OUGA 1QDRA 2ZQ3A 3AZ4A 3EMSA 2BQMA 1N4FA 1GFRA 1GBYA 1LSYA 4N9RA 1A2YC 4NWEA 4WM1A 1FKQA 2Z18A 5M1YA 4NGWA 3TMXA 2DQDY 5KXXA 1DI5A 4C3WA 5B07A 5B1FA 5F16A 4LFXA 2BQFA 4ETAA 4H9IA 1GB3A 1HEPA 1JKCA 1T3PA 4M6DA 1GB7A 1O23A 1VFBC 4NWHA 3N9EA 2LHMA 4N5RA 2ZNWY 4DD7A 1YKZX 4TX7A 3FE0A 5E4PA 1B5ZA 3M3UA 3WMKA 4B49A 4A7DA 1ALCA 1JIYA 1GBWA 1HEQA 2CJLA 5I54A 1YKYX 5LA8A 3N9AA 1REXA 3J6KA 1IWXA 2MEBA 4RLNA 2BQBA 2HUBA 5AMYA 5IELA 3W6FA 1IO5A 1WVVA 5B59A 2MEDA 2YBHA 1G7JC 4DC4A 1LJFA 5APEA 1LCNA 1IY4A 4DYGA 1D0MA 2XTHA 3ATOA 5APFA 1IWWA 5LINA 2Z12A 2CDSA 1NDMC 4NHPA 1KIQC 4XJGA 1C10A 1FLQA 1LJNA 1UUZC 4WM3A 4DD0A 4ET9A 3AGHA 4W96A 4N1CC 1EQ5A 1IR9A 1OUDA 2EKSC 1TAYA 4XJDA 1DKKA 1VATA 1YAPA 1GFAA 1HEWA 4NY5A 5T3FA 5KKJA 1GBSA 3HBDA 1IVMA 1LJ3A 132LA 1HNLA 1GB9A 3A34A 4R6CA 1BWIA 1LZNA 1ZVYB 4YENA 2HEDA 1C7PA 1GHLA 1UC0A 3D9AC 4NGVA 2H5ZA 5LYZA 5C6IA 1LJGA 2HEFA 4J7VA 1OUHA 2HU3A 3FI7A 3IJUA 2BLXA 4YM8A 2BQJA 3G3BB 1IOCA 1AZFA 5LXWA 3KAMA 1DXJA 1CKFA 4WLYA 3WL2A 4O34A 5KXOA 3B6LA 4B1AA 4H9AA 1HENA 4QGZA 1G7IC 2H9KA 1HSWA 4PGJB 5HLLA 4PRUA 1QUTA 2YBIA 4I8SA 1B7PA 2F4GA 4GCEA 1BVXA 1BWHA 1CJ7A 1ZV5L 5I4YA 1HF4A 3A6CY 1IX0A 3RW8A 3P66A 1B5XA 3TXHA 3VWOA 3HBHA 1FLUA 1XEJA 4UWNA 1WQPA 5HNLA 5DM9A 4HSFA 2BQIA 4NHSA 1JUGA 1GB5A 1Z55A 3IJVA 1QTEA 1OUCA 3IWRA 1LYYA 4TTDA 3TXGA 4RDSA 4WM2A 3T6UA 3CT5A 1LZYA 4CGEA 1YQVY 2D6BA 4OWEA 1INUA 3LYMA 1D6QA 4MR1A 1B5UA 5B06A 4G4HA 1WQNA 4NSGA 3LHMA 4LYBA 1GFVA 2XBRA 4WM5A 4EOFA 1XEKA 1LHHA 1GFHA 2FBBA 5KXZA 1JSFA 2LYOA 4UWUA 4ML7A 2F2NA 1DI3A 4FJRA 4NSIA 1RI8B 1IWZA 4RW2A 1B0DA 1LYZA 3WU9A 1C46A 1YKXX 4AXTA 5IHGA 3BKHA 3CQLA 4HTNA 4HJZA 5A3EA 4PHIA 1D9UA 3WXTA 1LZEA 3F6ZA 1VDQA 5KXPA 1DQJC 1LZCA 2MEHA 4J1AA 3A92A 1LHJA 4BAFA 2LZ2A 1GB6A 1F10A 2X0AA 1I56A 1I20A 4H94A 1IWTA 1NWGA 4Z98A 1EQEA 1XGTC 1GPQC 1QSAA 3WUAA 4MSTA 5ILCA 4D9ZA 3M18B 2F30A 2Z2EA 1GF6A 4P2EA 1GE2A 1NBZC 4ETDA 1GDXA 1FLWA 1IR8A 1B7RA 1LMOA 1OUFA 2DQIY 1JJ3A 2N5ZA 4NSHA 1ZVHL 5HMJA 2G4QA 1LMCA 2BQLA 4XENA 2PC2A 1HMKA 3EO5A 1B5YA 1BWJA 1GFGA 2BQNA 1BVKC 1LJIA 3OK0A 1F0WA 3CSRA 4NHIA 5FELA 2C8PA 5KXLA 5L9JA 2D4JA 4GN3A 3ATNA 1YROA 1CJ8A 2BAAA 4YEOA 3RU5A 1DKJA 1LMNA 1NBYC 3TXJA 5C6LA 1B5WA 2FYDA 3EXDA 4WMGA 2MEIA 1JKBA 4CFOA 2Z38A 2Z39A 1OUAA 1VAUA 4HPIA 4I0CA 8LYZA 2YVBA 4NGOA 4C5FA 1GBXA 3CT0A 5J7CA 2DQAA 2D91A 4HJYA 1HFYA 4Z41A 2ZYPA 1LZ5A 1D6PA 4IATA 1LJKA 4LYZA 3BKVA 3WUNA 3A93A 4KPMA 4G49A 7LYZA 4NGZA 1FBIX 2F4AA 4II8A 1CJ9A 3CT1A 4PPOA 1YAOA 2EPEA 1YILA 4G4BA 1IEEA 1UBZA 1BHZA 1HERA 4XADA 2CWIA 3RZ4A 3LZTA 5KXRA 4DD9A 1BB3A 2ZWBA 4TSCA 3RT5X 1G7HC 1NF5A 1GAZA 3A95A 4NHQA 1J1XY 1DPWA 4KL7A 3TMUA 2VB1A 5KXNA 2YBMA 134LA 3B0OA 4PRQA 4GLVA 193LA 3AYQA 4QDNA 1JSEA 1LHKA 2HEAA 4KT3A 1LZSA 1BB6A 1LMPA 1LPIA 4WLTA 1IP5A 4TWSA 5DL9A 4B4IA 2BLYA 2DQEY 1EL1A 4LT0A 5KJ9A 2ZNXY 1B7QA 1OQMA 4R0FA 154LA 1IC5Y 1IP3A 1GB8A 4WOAA 5LVKA 1DZBX 4XYYA 4LT3A 2I26L 3B72A 3LYZA 4OOOA 5L3HA 1C08C 1TBYA 1LSGA 1GB2A 4H1PA 1D0KA 4H8XA 4U3XB 1H6MA 4XJHA 4J1BA 4ETEA 1AT5A 2A7DA 3AJNA 5LVGA 1VDPA 1J1OY 1XSFA 9LYZA 3AGGG 3P64A 5APDA 5B1GA 3WPLA 2DBTA 2ZYCA 1GD6A 1JHLA 1GAYA 1JISA 1IP1A 5KXYA 5C6JA 4HTKA 5DN5A 1J1PY 1A4VA 4W94A 133LA 3WVYA 1LTMA 2BQKA 2ZIKA 5KKIA 1UIBA 2BQCA 4RW1A 1MELL 4UWVA 4H8ZA 5LIOA 2MECA 2B5ZA 5LVIA 2C8OA 1TCYA 1LMAA 1B2KA 1LSMA 3B0KA 1WTNA 1D0LA 2W1YA 4GCFA 4H9CA 5FSTA 3TXDA 5FHWA 1GFUA 5K7OA 5HMVA 4ZIXA 1PS5A 1IP2A 3WPKA 4DDCA 1OUBA 2MEFA 3LZ2A 4YEMA 1F6SA 3A3RX 3WH1A 4OW1A 1REMA 2D4KA 3WW5A 5FEKA 1LZ9A 5KXMA 3K3TA 4GCBA 3AW7A 1YAMA 4LGKA 1REYA 1NHEA 1CNSA 1QSWA 4N8ZA 4TUNA 2Z2FA 6LYZA 1YANA 2Q0MX 2BQAA 1JTTL 4OWCA 5L3IA 3TXKA 3ULRA 3WVXA 1RJCB 2HEEA 1JWRA 3W6DA 3ZVQA 1IWVA 1HEOA 1HELA 4N0JA 1IIZA 4AGAA 5KY1A 4IASA 1OP9B 4M4OA 1VEDA 4H91A 6LYTA 3LYTA 1AM7A 1LSAA 1OUEA 1I1ZA 3WU8A 1BB4A 4KXIA 4CFPA 1XGQC 3CSQA 4NFVA 3AZ6A 4NHTA 2FBDA 1LJ4A 1WQQA 4LYMA 1JPOA 2BQEA 5HQ1A 1HMLA 2D4IA 1FN5A 1GF4A 4XJFA 1GDWA 4XJBA 3OJPA 1OUIA 5DLAA 1QIOA 1LJEA 4NIJA 3A96A 1NDGC 2WARA 5E9RA 1GFTA 1B7LA 1SLYA 5D5CA 4WG7A 1IWYA 2W1XA 1GFKA 2A7FA 1DI4A 2ZILA 5FCPA 1GF9A 1LJJA 4GCDA 5HNCA 1GF0A 1V7SA 3B0IA 1DPXA 1XFPL 5F14A 1YAQA 3HFMY 4XJIA 1AT6A 3WXUA 4N1EI 3A6BY 3WULA 2NWDX 1FLYA 3WUMA 1LZ4A 1W6ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OE0A 254LA 4ZEEA 1NHBA 1LOZA 1D3FA 1HHLA 4LFPA 2I25L 1LZ1A 1LHMA 1QQYA 5I4WA 4NG1A 1WQMA 1G7LC 1QTVA 4EJ4A 4ZFPA 183LA 4DDBA 4LZMA 3EBAB 5KXSA 2EQLA 1WQRA 1IR7A 1WQOA 5KXWA 1L97A 1LSNA 112LA 4HP0A 4NGLA 1L27A 1OWYA 1IP4A 1B7NA 1C6KA 1IY3A 4QEQA 2Z37A 1OUJA 1RFPA 3WU7A 1SSYA 107LA 4WM6A 1LI3A 2BQGA 1JITA 1LYOA 2ZQ4A 4LT1A 141LA 1L74A 4DWXA 3LYOA 1TEWA 1XGRC 227LA 3WPJA 1YL0X 4BADA 3P68A 1P36A 1B9OA 1T8FA 4EKPA 1QT5A 1GE0A 5DN4A 1QUSA 201LA 3TXFA 168LA 1CJ6A 3HBEX 1NKHA 1JQUA 1LKRA 1CKGA 1OV7A 223LA 2DQJY 3OE9A 165LA 1C43A 4GN5C 1L57A 4B4EA 5ILFA 3A8ZA 2RBSA 2CGIA 1LZBA 137LA 4LYCA 5FDJA 3A3QA 1L92A 3AZ5A 5II3A 1L77A 4L41A 4YXAC 3GULA 1L51A 221LA 1B7SA 4EPFA 2LCBA 1LSBA 1WTHA 4ARPA 1GBZA 1LZRA 213LA 1LSFA 2LZTA 4NEBA 3WW6A 123LA 4H93A 4IJ4A 1G7MC 2XJWA 1SQ2L 1QDRA 2ZQ3A 3RZEA 2BQMA 1N4FA 1SSWA 3FI5A 1LSYA 126LA 4N9RA 5M1YA 1FKQA 2Z18A 4NGWA 2DQDY 4C3WA 1OV5A 5B07A 4LFXA 3C7WA 1D3JA 1O23A 3N9EA 2LHMA 188LA 244LA 4I7OA 3M3UA 4A7DA 1JIYA 1HEQA 1YKYX 236LA 1QUDA 2BQBA 5IELA 1L37A 3UONA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1FDL Y;  1KIP C;  1KXX A;  4ZEE A;  4G9S A;  2IHL A;  4WO6 A;  1LOZ A;  1HHL A;  4LFP A;  1LZ8 A;  2I25 L;  2AUB A;  1LSE A;  1AKI A;  1LZ1 A;  3GXR A;  4WM4 A;  3AGI A;  5IDD A;  2DQC Y;  1LHM A;  4FDY A;  4LYT A;  3W6C A;  1QQY A;  4H9E A;  5I4W A;  4HJV A;  4NG1 A;  1WQM A;  4NSJ A;  1G7L C;  1XGP C;  1QTK A;  4B0D A;  3AW6 A;  5EBH A;  1P2C C;  194L A;  2YBN A;  4LT2 A;  2LYM A;  1VDS A;  4ZFP A;  2GV0 A;  4Z3M A;  1LYS A;  4TSB A;  1JTO L;  4DDB A;  1H87 A;  3EBA B;  1JKD A;  2YDG A;  4NGK A;  5KXS A;  1LZG A;  4ET8 A;  4HTQ A;  2Y8P A;  1CKH A;  2EQL A;  1EQ4 A;  5LAF A;  1WQR A;  1IR7 A;  1KXY A;  1WQO A;  4NG8 A;  1GF5 A;  3W3E A;  5I4X A;  4PJ2 C;  5KXW A;  153L A;  1LSN A;  1XGU C;  1CKD A;  1LZA A;  1HEM A;  4HP0 A;  4B4J A;  1KIR C;  1KXW A;  4NGL A;  1CKC A;  5LA5 A;  4OWA A;  2ZIJ A;  1QDT A;  2I6Z A;  1IP4 A;  4YOP A;  1F6R A;  1B7N A;  4MCK A;  1IY3 A;  1BB7 A;  4OOT A;  1LMQ A;  4QEQ A;  1GF7 A;  2Z37 A;  2XBS A;  1LSD A;  5JEN B;  5LYT A;  1OUJ A;  2YSS C;  135L A;  4H9H A; 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 1TCY A;  1LMA A;  1B2K A;  1LSM A;  3B0K A;  1WTN A;  1D0L A;  2W1Y A;  4GCF A;  4H9C A;  5FST A;  3TXD A;  5FHW A;  1GFU A;  5K7O A;  5HMV A;  4ZIX A;  1PS5 A;  1IP2 A;  3WPK A;  4DDC A;  1OUB A;  2MEF A;  3LZ2 A;  4YEM A;  1F6S A;  3A3R X;  3WH1 A;  4OW1 A;  1REM A;  2D4K A;  3WW5 A;  5FEK A;  1LZ9 A;  5KXM A;  3K3T A;  4GCB A;  3AW7 A;  1YAM A;  4LGK A;  1REY A;  1NHE A;  1CNS A;  1QSW A;  4N8Z A;  4TUN A;  2Z2F A;  6LYZ A;  1YAN A;  2Q0M X;  2BQA A;  1JTT L;  4OWC A;  5L3I A;  3TXK A;  3ULR A;  3WVX A;  1RJC B;  2HEE A;  1JWR A;  3W6D A;  3ZVQ A;  1IWV A;  1HEO A;  1HEL A;  4N0J A;  1IIZ A;  4AGA A;  5KY1 A;  4IAS A;  1OP9 B;  4M4O A;  1VED A;  4H91 A;  6LYT A;  3LYT A;  1AM7 A;  1LSA A;  1OUE A;  1I1Z A;  3WU8 A;  1BB4 A;  4KXI A;  4CFP A;  1XGQ C;  3CSQ A;  4NFV A;  3AZ6 A;  4NHT A;  2FBD A;  1LJ4 A;  1WQQ A;  4LYM A;  1JPO A;  2BQE A;  5HQ1 A;  1HML A;  2D4I A;  1FN5 A;  1GF4 A;  4XJF A;  1GDW A;  4XJB A;  3OJP A;  1OUI A;  5DLA A;  1QIO A;  1LJE A;  4NIJ A;  3A96 A;  1NDG C;  2WAR A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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