4OWCA

Pti6 binding to hewl
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
publication title The binding of platinum hexahalides (Cl, Br and I) to hen egg-white lysozyme and the chemical transformation of the PtI6 octahedral complex to a PtI3 moiety bound to His15.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-01-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4owcA00
1JTTL 1C7PA 1SQ2L 1F10A 5KXPA 3T36A 5HMVA 4HPIA 1LCNA 5B06A 4EOFA 3TXJA 5LYTA 1GFKA 1BB5A 1LMTA 3LHMA 1J1OY 1IWUA 3W6BA 1LMPA 1QUSA 2HTXA 1GBYA 3TXGA 4PHIA 3CSQA 4GCFA 4HV2A 3TMXA 2DKVA 5A3ZA 1LZTA 1GFHA 1LZGA 5LAGA 5KY1A 1UA6Y 1HEQA 1IX0A 3CSZA 1GE2A 1C45A 1YILA 3G3BB 4YM8A 1T6VL 3AZ5A 2YDGA 3WYHA 1AT5A 1DI4A 3A94A 2F2NA 1LMCA 1LZAA 2D91A 2G4PA 3P64A 2D4KA 3P68A 4I8SA 1B7MA 1GPQC 3ULRA 1XEIA 1JJ3A 1HNLA 4FJRA 2HU3A 2BQAA 1IOSA 1ZMYL 5F16A 1CKDA 2ZIJA 2G4QA 2X0AA 4IATA 1LHMA 2C8OA 3CT5A 2GV0A 4WG1A 1NBYC 3A92A 3IWRA 5FSTA 132LA 3F6ZA 5LXWA 2MEFA 4NHTA 3LZTA 4OW1A 1DXJA 4OWEA 5I4WA 1IP5A 2HEDA 2BQLA 4XJHA 1UUZC 1LJJA 4UWUA 2CDSA 4DD2A 5I4XA 4H90A 4KL7A 3P66A 1LSNA 1BVKC 1NBZC 5KXRA 3CB7A 1LYSA 1IP4A 4PPOA 4J1AA 1HFXA 4UWVA 4BADA 3VWOA 3AZ4A 1LHKA 2MEHA 4N1CC 4LZTA 3D3DA 4TSCA 5HNLA 4DDAA 4ZEEA 1GFAA 2YBNA 3AW7A 2NWDX 1LZ6A 3GXKA 4OOTA 4P2EA 1LZ8A 1LJEA 3AB6A 4H9AA 4ET8A 2CGIA 1GF8A 1ZVYB 2LYOA 4WM4A 1YL0X 1LSPA 2YBIA 5APCA 3WVYA 6LYTA 2XBSA 1VDPA 5C6LA 1OUFA 1B7SA 1H87A 1QTEA 3J4GA 1WQPA 1LZYA 4GCBA 1DKKA 1QQYA 5DLAA 1HSWA 1KXWA 1LMQA 4LYBA 4HTNA 1DKJA 2B5ZA 4H92A 1GFVA 1O23A 1LZ9A 3WUMA 1G7JC 1I1ZA 4WL7A 193LA 1B5UA 4HV1A 4NGLA 3OK0A 1B5XA 3AZ7A 5C6JA 1LZEA 5IDDA 4DC4A 5KKJA 4OWCA 1NDGC 1KIPC 4W96A 4HTKA 5IELA 1LMNA 1XGTC 4DDBA 1WVVA 2AUBA 3TXBA 5HLLA 1BWIA 2I25L 4H1PA 4NSHA 1OUGA 1GD6A 1LSYA 1LZCA 2YBLA 1GBWA 1LYOA 3K3TA 5FHWA 4H94A 4FDYA 4H8XA 4QGZA 5LA8A 1REYA 1LSFA 1XEKA 1Z55A 1B9OA 1GBZA 1GB2A 1HENA 1JISA 5KXKA 4A7DA 5M1YA 1OUJA 2IHLA 1JKAA 5APDA 5J7CA 1UIHA 4NGYA 3TXHA 1CJ7A 1GB8A 4GN5C 3W6DA 1JEFA 1B7LA 2BQGA 3ZEKA 9LYZA 2I6ZA 5KXZA 1IP1A 1WQRA 1IY3A 3FI7A 4MCKA 6LYZA 1JKBA 2BQCA 2CJLA 4YEMA 1DPXA 1GXV2 1LSCA 4Z41A 4YOPA 1IWXA 2ZNXY 1UBZA 4TX7A 1E8LA 2BQDA 1EQEA 3WMKA 2Z2EA 2MEBA 1IP6A 1TCYA 1W6ZA 4OWHA 4B4EA 1CKCA 4Z46A 5KXMA 1IEEA 3WPLA 2BPUA 154LA 1OUBA 3M18B 3LYTA 1GF5A 3AYQA 1CKFA 2W1XA 4G4CA 3W6FA 4DWXA 3RU5A 3P4ZA 5KKIA 1LAAA 1LMAA 4WM1A 4AXTA 3EBAB 153LA 4B1AA 2HEFA 4WL6A 1HFZA 1IR7A 1GB9A 1HMKA 2BQKA 2ZWBA 4QY9A 1YANA 1NKHA 1IC4Y 1NF5A 4TWSA 2BQMA 3W6EA 4XYYA 2YVBA 1NHEA 4RW1A 1LJHA 1GFTA 5F9XA 1ZV5L 1DQJC 1IWTA 1LZ1A 1V7TA 2YSSC 3B0OA 2Q0MX 3M3UA 4KPMA 5B05A 2DQGY 1HSXA 2ZYPA 1OUAA 1JTOL 3TXEA 2H9KA 3RW8A 1B5WA 4NIJA 3SP3A 5FELA 5D5FA 4H91A 1UIDA 3OJPA 3P65A 3A3RX 4RLNA 4C5FA 1DZBX 1JKDA 1LYZA 1YAOA 4NY5A 4NWHA 2Z19A 3HFMY 4WLXA 1IWZA 4G4HA 1XGPC 4PRQA 1GXXA 1CJ8A 2F4GA 2G4NA 4OWAA 2H5ZA 5B1FA 1GFUA 4LT0A 5LYZA 4ZIXA 133LA 5KXNA 1YKXX 1BGIA 1LSMA 3W6AA 4B0DA 4NHSA 4XJFA 3WU9A 5ILFA 1GF9A 1VDSA 1TDYA 1GAYA 2DQAA 2VB1A 1DI5A 2HEAA 1QSWA 2N5ZA 3B6LA 5I54A 1HEOA 1BB6A 1GFRA 5A3EA 3WULA 3CSRA 1LJKA 2Z12A 3WUNA 2F30A 3GXRA 5LVGA 2DQEY 2YBMA 3B0IA 4PRUA 2DBTA 207LA 2XJWA 2DQIY 3A90A 1MELL 5I5QA 4LT2A 1GE1A 4LYTA 1JKCA 3QNGA 1NMMA 1I20A 4HTQA 3KAMA 3G3AB 1JPOA 4G49A 4ETBA 1NWGA 2BQOA 4ETAA 4RDSA 1WQNA 2W1MA 4RLMA 1ZVHL 1JJ0A 4M6DA 3TXIA 5L9JA 4NGVA 2LYMA 1GB0A 1BB4A 1FLUA 4D9ZA 4AGAA 4GCCA 1C46A 4NHPA 5FCPA 4I0CA 3WL2A 1D0MA 3WH1A 1LJ4A 1YKYX 2EIZC 3LYMA 4H9CA 5LAFA 4WLDA 1AKIA 1CKHA 4XJDA 3A8ZA 1LSGA 1FLWA 1CNSA 1LZ4A 4NG1A 4YEOA 1JUGA 4L41A 1ALCA 1TBYA 1CJ9A 1BHZA 4H93A 3D9AC 4EMNA 2Z37A 2DQDY 4H9BA 134LA 1FDLY 4HPEA 5LVJA 1BQLY 2MEDA 2I26L 3J6KA 1YIKA 1DPWA 2IFFY 2Y8PA 1IIZA 4XENA 4TTDA 3A6BY 1C43A 1KXXA 2MEGA 4IJ4A 4BAFA 1GBSA 2D4JA 1GBXA 1UACY 1XGQC 2ZQ4A 4DYGA 1VDQA 3N9EA 1XFPL 2BLYA 4WG7A 4MR1A 3RZ4A 2A7DA 1LHHA 1KIQC 4CFPA 1QIOA 4OWBA 1GB6A 4NGJA 2YBHA 1B0DA 1RE2A 1IR9A 1UCOA 2HUBA 1FLYA 1JITA 1XGUC 1SLYA 1GFGA 4TUNA 1IP3A 2BLXA 5IHGA 1IOQA 3LYOA 4MSTA 4NGOA 1WQQA 1OP9B 1IVMA 1IP2A 4ZFPA 4TSBA 4X3BA 3EO5A 4H9HA 1LZDA 1GF3A 3IJUA 1XGRC 3AZ6A 4PGJB 1LPIA 1UIGA 1LZRA 1IO5A 1CKGA 1HEMA 1OUCA 1IWWA 5B1GA 1XSFA 4KT3A 2W1LA 2LHMA 1KIRC 1JSFA 4NG8A 1GB7A 1H6MA 3A34A 4GLAA 1C10A 1T3PA 1LJIA 4LYZA 3EMSA 1G7IC 1TAYA 1YKZX 1LOZA 4LYCA 5KXTA 2Z39A 1LJFA 4WLTA 2HEEA 4E3UA 1INUA 1EQ5A 1RCMA 4NSJA 3A96A 1G7HC 4J0LA 1GF6A 4Z3MA 4DD1A 1LTMA 1WQOA 5F14A 1F6RA 4HJYA 2MECA 4ET9A 5L3HA 2XBRA 5KXSA 3QY4A 2C8PA 3AGHA 4HSFA 1A2YC 5LVHA 1JIYA 1IORA 1LKSA 1HEWA 5EBHA 1HMLA 4BS7A 2F4AA 1GF7A 1D6QA 5KXLA 3A3QA 3CQLA 2FYDA 3WXTA 4UWNA 1PS5A 3CT0A 4KXIA 1LMOA 4YENA 1VATA 2ZYCA 1VDTA 3ATOA 1HC0A 1IP7A 2PC2A 4HJVA 1PZYA 4N5RA 1A4VA 3TXDA 2FYCA 5LVKA 4CHXA 1B7NA 4GCDA 1D0KA 2ZQ3A 5APFA 3WPKA 5HMJA 1GDWA 1JWRA 1LZBA 2EKSC 2YBJA 1DI3A 1AM7A 1B7OA 2BQIA 4LYMA 1G7MC 4LGKA 1YL1X 3N9AA 2BQNA 1GHLA 5FDJA 5LINA 3A95A 5LIOA 2BQFA 1IOCA 1NDMC 4B4JA 5LYMA 4NFVA 1RJCB 2EPEA 4G4BA 1GE3A 2BQHA 1FLQA 1REZA 1OUDA 4GN3A 4LFPA 4WOAA 1YAPA 4GCEA 3FE0A 3LYZA 1LHJA 4ML7A 4DD7A 4XJGA 3ZVQA 1B7RA 5T3FA 3RNXA 1GEZA 3IJVA 4H9FA 3WPJA 4C3WA 2Z18A 1B5YA 1D9UA 1WQMA 1YAMA 3W6CA 1JHLA 2D4IA 4HP0A 4DDCA 1LSEA 1P2CC 4LT3A 2BQBA 4WMGA 5B07A 3AW6A 1BB7A 1WTNA 1REMA 1FN5A 1J1XY 1QSAA 3B72A 4NGZA 3BKVA 5B59A 1YROA 3TMWA 2WARA 1XEJA 1GAZA 4OOOA 1B2KA 1LJ3A 1C08C 1UIAA 1LHIA 3WU8A 3HBEX 4BAPA 3AJNA 5DL9A 1HEPA 1LYYA 4N0JA 4B49A 4WM6A 4WM5A 1GE0A 1IC7Y 1GF0A 2MEEA 5KXWA 2A7FA 1GFJA 5ILCA 1FKVA 2ZIKA 1LJGA 1UIEA 2BAAA 1JJ1A 4NEBA 4G9SA 1VEDA 1UIBA 1IY4A 4GLVA 2MEIA 5KXYA 3CT1A 4NWEA 2DQCY 1JSEA 4NHQA 1LSDA 4RW2A 1HHLA 5DN5A 1B5VA 5APEA 3W3EA 4QDNA 4CFOA 4NGKA 5KJ9A 1OUIA 5I53A 1JTPL 1LJNA 1MLCE 5C6IA 4NGIA 1QDRA 1UICA 1YAQA 1CJ6A 1IWVA 1OUHA 3A93A 1W08A 4NGWA 4NSIA 1LSBA 2DQJY 3A91A 3WU7A 3WUAA 1WTMA 4H8ZA 4W94A 135LA 1BVXA 3RT5X 3T6UA 3WVXA 1EQ4A 4XN6A 4DD9A 5LVIA 3ZVQB 1BB3A 1REXA 3N9CA 4M4OA 5II3A 1FBIX 5JENB 3AGIA 4N9RA 2RSCA 3TMVA 4H9EA 1GWDA 4WM3A 1LHLA 4CGEA 1QTKA 5KXOA 4XJBA 4NSGA 3WXUA 1LZNA 3HBDA 1GF4A 1B7QA 1GEVA 7LYZA 1QUTA 4ETDA 1WVUA 208LA 1G7LC 4J1BA 1NQIA 4LYOA 4ETCA 8LYZA 5HQ1A 4H9IA 2HECA 1RFPA 1IR8A 1GE4A 1UIFA 3E3DA 3WW6A 3ATNA 2XTHA 3LZ2A 1QDTA 4PJ2C 4WLYA 3AGGG 1V7SA 1TEWA 2FBDA 4HJZA 4B4IA 2BQEA 1IWYA 2MEAA 5DN4A 1HFYA 4II8A 1RI8B 4N1EI 1BWJA 3QE8A 1AZFA 5DM9A 1GB3A 1D0LA 5L3IA 1LZ5A 194LA 2LZTA 4N8ZA 2D6BA 3A67Y 2H9JA 4WM2A 4XJIA 2HU1A 5D5CA 1F0WA 2Z38A 5LA5A 5KXXA 2EQLA 1GFEA 2HEBA 1EL1A 1GDXA 4CJ2A 4ANRA 2FBBA 2BQJA 3BKHA 1I56A 1GBOA 2W1YA 4H8YA 4ETEA 1FKQA 5HNCA 3WW5A 4LT1A 4Z98A 5E9RA 1UC0A 1BWHA 5F81A 4DD0A 2LYZA 3A6CY 4NHIA 4IASA 1VFBC 5E4PA 1B5ZA 4DD3A 3TXKA 2CWIA 1D6PA 5I4YA 2ZNWY 1OQMA 1HELA 3LN2A 4O34A 5F9UA 4DT3A 1KXYA 4U3XB 3TMUA 4WO6A 1HF4A 3EXDA 4LFXA 2DQFC 2ZILA 1YQVY 3TXFA 5K7OA 4R0FA 5AMYA 2DQHY 4WO9A 1F6SA 1B7PA 1VAUA 1LZSA 2LZ2A 1IOTA 1GB5A 1LKRA 4YF2A 3HBHA 1J1PY 1LSZA 2Z2FA 1AT6A 4QEQA 4GN4A 4XADA 3B0KA 3MGWA 1IC5Y 1LSAA 4J7VA 4R6CA 1N4FA 1OUEA 5FEKA 1HERA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5LYTA 1L65A 1GFKA 3LHMA 1LMTA 1J1OY 1IWUA 3F9LA 1LMPA 2HTXA 4PHIA 4HV2A 3TMXA 5A3ZA 1LZTA 1LZGA 5LAGA 186LA 3CSZA 1GE2A 125LA 1OV7A 1YILA 1L27A 2RAZX 148LE 1AT5A 1LZAA 2G4PA 1CU6A 1JTNA 1XEIA 1LLHA 2HU3A 5F16A 240LA 1L82A 4IATA 1LHMA 3A92A 3IWRA 132LA 2O4WA 104LA 2MEFA 4OW1A 2BQLA 4H90A 3P66A 1BVKC 3CB7A 4PPOA 1L21A 1L94A 3D3DA 5I14A 4OOTA 1LJEA 3AB6A 4ET8A 2CGIA 1GF8A 6LYTA 1LWGA 3C8RA 1L40A 1B7SA 1H87A 4GCBA 1WQPA 1LZYA 1LMQA 1O23A 1LZ9A 193LA 4NGLA 3OK0A 5KKJA 4DC4A 4EKQA 2RB1X 164LA 4HTKA 1LMNA 4DDBA 3TXBA 5HLLA 1OUGA 5FHWA 1LYOA 4W55A 4H8XA 1XEKA 1B9OA 1CV5A 3TXHA 227LA 9LYZA 1IY3A 1JKBA 1DPXA 1GXV2 1LSCA 2ZNXY 1L35A 4DQ5A 3WMKA 2Z2EA 1W6ZA 1TCYA 4Z46A 1L20A 1IEEA 154LA 1C65A 4AXTA 4QY9A 1YANA 1IC4Y 1NF5A 4S0WA 3DMVA 142LA 170LA 1L81A 1LZ1A 2YSSC 1L73A 2Q0MX 3B0OA 3M3UA 2DQGY 1OUAA 1L91A 2H9KA 3RW8A 3NYAA 3FADA 3A3RX 4C5FA 1DZBX 1JKDA 2Z19A 3HFMY 4WLXA 1XGPC 1GXXA 4OWAA 2H5ZA 5B1FA 4LT0A 5LYZA 190LA 4B0DA 102LA 3L2XA 1GF9A 2DQAA 1QSWA 2N5ZA 1HEOA 1L95A 3LZMA 4I7TA 3CSRA 1DYCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1JTT L;  1C7P A;  1SQ2 L;  1F10 A;  5KXP A;  3T36 A;  5HMV A;  4HPI A;  1LCN A;  5B06 A;  4EOF A;  3TXJ A;  5LYT A;  1GFK A;  1BB5 A;  1LMT A;  3LHM A;  1J1O Y;  1IWU A;  3W6B A;  1LMP A;  1QUS A;  2HTX A;  1GBY A;  3TXG A;  4PHI A;  3CSQ A;  4GCF A;  4HV2 A;  3TMX A;  2DKV A;  5A3Z A;  1LZT A;  1GFH A;  1LZG A;  5LAG A;  5KY1 A;  1UA6 Y;  1HEQ A;  1IX0 A;  3CSZ A;  1GE2 A;  1C45 A;  1YIL A;  3G3B B;  4YM8 A;  1T6V L;  3AZ5 A;  2YDG A;  3WYH A;  1AT5 A;  1DI4 A;  3A94 A;  2F2N A;  1LMC A;  1LZA A;  2D91 A;  2G4P A;  3P64 A;  2D4K A;  3P68 A;  4I8S A;  1B7M A;  1GPQ C;  3ULR A;  1XEI A;  1JJ3 A;  1HNL A;  4FJR A;  2HU3 A;  2BQA A;  1IOS A;  1ZMY L;  5F16 A;  1CKD A;  2ZIJ A;  2G4Q A;  2X0A A;  4IAT A;  1LHM A;  2C8O A;  3CT5 A;  2GV0 A;  4WG1 A;  1NBY C;  3A92 A;  3IWR A;  5FST A;  132L A;  3F6Z A;  5LXW A;  2MEF A;  4NHT A;  3LZT A;  4OW1 A;  1DXJ A;  4OWE A;  5I4W A;  1IP5 A;  2HED A;  2BQL A;  4XJH A;  1UUZ C;  1LJJ A;  4UWU A;  2CDS A;  4DD2 A;  5I4X A;  4H90 A;  4KL7 A;  3P66 A;  1LSN A; 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 1QUT A;  4ETD A;  1WVU A;  208L A;  1G7L C;  4J1B A;  1NQI A;  4LYO A;  4ETC A;  8LYZ A;  5HQ1 A;  4H9I A;  2HEC A;  1RFP A;  1IR8 A;  1GE4 A;  1UIF A;  3E3D A;  3WW6 A;  3ATN A;  2XTH A;  3LZ2 A;  1QDT A;  4PJ2 C;  4WLY A;  3AGG G;  1V7S A;  1TEW A;  2FBD A;  4HJZ A;  4B4I A;  2BQE A;  1IWY A;  2MEA A;  5DN4 A;  1HFY A;  4II8 A;  1RI8 B;  4N1E I;  1BWJ A;  3QE8 A;  1AZF A;  5DM9 A;  1GB3 A;  1D0L A;  5L3I A;  1LZ5 A;  194L A;  2LZT A;  4N8Z A;  2D6B A;  3A67 Y;  2H9J A;  4WM2 A;  4XJI A;  2HU1 A;  5D5C A;  1F0W A;  2Z38 A;  5LA5 A;  5KXX A;  2EQL A;  1GFE A;  2HEB A;  1EL1 A;  1GDX A;  4CJ2 A;  4ANR A;  2FBB A;  2BQJ A;  3BKH A;  1I56 A;  1GBO A;  2W1Y A;  4H8Y A;  4ETE A;  1FKQ A;  5HNC A;  3WW5 A;  4LT1 A;  4Z98 A;  5E9R A;  1UC0 A;  1BWH A;  5F81 A;  4DD0 A;  2LYZ A;  3A6C Y;  4NHI A;  4IAS A;  1VFB C;  5E4P A;  1B5Z A;  4DD3 A;  3TXK A;  2CWI A;  1D6P A;  5I4Y A;  2ZNW Y;  1OQM A;  1HEL A;  3LN2 A;  4O34 A;  5F9U A;  4DT3 A;  1KXY A;  4U3X B;  3TMU A;  4WO6 A;  1HF4 A;  3EXD A;  4LFX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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