4PGJ | Genus

Total Genus 47

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	47
sequence length	128
structure length	127
Chain Sequence	KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCR

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__633783040314579__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__633783040314579__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/4PGJ/B/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__633783040314579__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"633783040314579","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/4PGJ/B/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__633783040314579__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

Viewer cachePut cache://localLOAD_/file/5d0092352af9fbe3f097570c/pdb.gz

Viewer cachePut https://genus.fuw.edu.pl/file/5d0092352af9fbe3f097570c/pdb.gz

FileManager.getAtomSetCollectionFromFile(/file/5d0092352af9fbe3f097570c/pdb.gz)

loadScript /static/js/j2s/core/corezip.z.js

The Resolver thinks Pdb

loadScript /static/js/j2s/core/corebio.z.js

Time for openFile(/file/5d0092352af9fbe3f097570c/pdb.gz): 161 ms

reading 127 atoms

ModelSet: haveSymmetry:false haveUnitcells:false haveFractionalCoord:false

1 model in this collection. Use getProperty "modelInfo" or getProperty "auxiliaryInfo" to inspect them.

Default Van der Waals type for model set to Jmol

127 atoms created

ModelSet: autobonding; use autobond=false to not generate bonds automatically

Time for creating model: 18 ms

Adding embedded #jmolscript: select ({0:126});backbone only;select *;

platformSpeed = 8

cartoonsFancy = true

sheetSmoothing = 1.0

traceAlpha = true

loadScript /static/js/j2s/core/corescriptcmd.z.js

specularPower = 9

ambientPercent = 20

antialiasDisplay = true

Script completed

Jmol script terminated

loadScript /static/js/j2s/J/g3d/HermiteRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/renderbio/BioMeshRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/render/MeshRenderer.js

loadScript /static/js/j2s/J/shape/Mesh.js

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Immune system/hydrolase
source organism	Homo sapiens
publication title	Fully Human VH Single Domains That Rival the Stability and Cleft Recognition of Camelid Antibodies. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Human heavy chain domain antibody
total genus	47
structure length	127
sequence length	128
chains with identical sequence	D
ec nomenclature	ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date	2014-05-02

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
B	PF00062	Lys	C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.530.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Lysozyme	Lysozyme	4pgjB00

1P2CC 1CKFA 4RW1A 1DI3A 1INUA 2EKSC 1HFXA 1JUGA 1LSZA 3P68A 5DLAA 4ZEEA 3AZ6A 1YKXX 2LYMA 1FKVA 4Z41A 9LYZA 1GFHA 1IR8A 4OWAA 5FELA 3G3BB 4B1AA 1LHMA 4NSGA 1YANA 3QE8A 4ETDA 1GEZA 1GF3A 2A7FA 4B4IA 3A90A 4DD1A 8LYZA 1G7LC 3WUAA 3AGGG 3WXUA 4HJZA 5DM9A 1XEKA 3CSZA 1D0LA 3LZ2A 3B0KA 3G3AB 2H9JA 3HBEX 2CDSA 1FBIX 1LZAA 1CNSA 1ZVHL 4RLNA 2W1YA 1UA6Y 1QTKA 1WQNA 1XGTC 2DQJY 1OUJA 4N0JA 4GN3A 5KXNA 4M6DA 5HQ1A 1REYA 4NG8A 4GCCA 4XJDA 4B4JA 5C6LA 1JJ0A 3TXBA 5JENB 4H94A 1OP9B 1NBYC 4N9RA 4TTDA 1YIKA 5DL9A 1AT5A 4J7VA 5KXWA 3CB7A 3K3TA 4LGKA 1LZRA 1EL1A 1UBZA 3LYTA 3WPJA 1JITA 4AXTA 1KXWA 5LA8A 1H6MA 1B5WA 1XGQC 2EIZC 2LZTA 4NHQA 1LHIA 1GF8A 1LSDA 1CKDA 2PC2A 4MSTA 1DZBX 3TXHA 4Z46A 3ZEKA 1LZBA 1GBWA 2W1XA 2ZNWY 2F4GA 4HV1A 3FI7A 5I4WA 1WQRA 3AYQA 4TWSA 1RE2A 4WG7A 1XEJA 3QNGA 1UUZC 1PZYA 1UACY 1LKRA 1OUFA 4WLYA 1YAOA 4HJVA 2D4IA 4G9SA 4NGZA 5L3HA 1ZMYL 1LSPA 2HEAA 3T6UA 5LINA 1J1XY 5LVHA 4NHPA 1C45A 4YOPA 3N9EA 1IX0A 2LZ2A 1HMLA 4H9IA 3A94A 1EQEA 1IP4A 1DI4A 1GB2A 2BQBA 1LMQA 5I53A 2ZNXY 4DD7A 1HSWA 4H9CA 5D5FA 3TXGA 1B5VA 4YM8A 2DQHY 4DDBA 5KXSA 3ULRA 1JKAA 2LYZA 5APDA 1QDTA 1GF0A 5HMVA 4D9ZA 1VDPA 208LA 3GXKA 4EMNA 4NHSA 3RU5A 4ANRA 1B5UA 4C5FA 1UC0A 1SQ2L 3GXRA 4UWUA 1HEPA 4W96A 4H91A 5B59A 1HEOA 1LSMA 2Y8PA 1NF5A 2N5ZA 3A67Y 1VFBC 4RLMA 4HTQA 3QY4A 1IR9A 1D0MA 3CSQA 154LA 3WPKA 4NIJA 3P64A 1YQVY 1LSNA 4H8ZA 3KAMA 4IATA 4NGIA 1BB3A 5A3ZA 3B6LA 1B2KA 1JISA 134LA 1GF7A 3TMWA 1LHKA 4DC4A 3P65A 2DKVA 4BADA 1B7NA 2FBDA 1B5ZA 4EOFA 3F6ZA 1IWZA 2BQEA 2NWDX 4H93A 1B7RA 1HEQA 3AW6A 3CT0A 5KY1A 1XGPC 1LHHA 1BVXA 1OUBA 1UICA 1UIBA 3IWRA 2FBBA 2BQNA 2BQMA 1XGRC 4ET9A 1BB4A 3FE0A 4NY5A 3AZ4A 2YBNA 4QGZA 2BQLA 4ETCA 1GF9A 1IWYA 2YBHA 2W1MA 3D9AC 3W6CA 1CKGA 1GPQC 1LJKA 3J4GA 1IORA 4XJBA 1NDGC 4H8YA 5I4XA 1GB0A 1LZ1A 3AJNA 1BVKC 133LA 2MEHA 4RDSA 5LYZA 5KJ9A 1GFUA 1HSXA 1V7TA 3RNXA 5KXPA 5C6JA 1KXXA 1DPWA 1YL1X 1C10A 2HTXA 2YBLA 2ZQ4A 3EO5A 4KPMA 2DQCY 1JWRA 4IASA 3SP3A 5M1YA 2BQFA 1IVMA 1AZFA 1NHEA 1D6PA 1VDQA 2IHLA 1OUAA 2MEFA 4XJHA 1OUGA 5LA5A 2CGIA 1QSAA 4TSBA 1BQLY 1VDSA 5FSTA 4UWNA 2VB1A 2Z38A 4GN5C 3A95A 1LMTA 3LYMA 1QUSA 1KIQC 5D5CA 4PRUA 4DYGA 4NG1A 5F9XA 1LOZA 4WO9A 1IWVA 1GE0A 1C46A 1YILA 2HEFA 1LJEA 2BQHA 3TMXA 3WVXA 4WMGA 4WM6A 1H87A 1IP2A 1HEMA 4GN4A 4QEQA 5B05A 4NGYA 5LVGA 3T36A 4W94A 1UIEA 3HFMY 4GCBA 4GLAA 2G4NA 5HNCA 5IHGA 2BQDA 6LYZA 1YKYX 1GWDA 2Z12A 5A3EA 2Z2EA 3M18B 5C6IA 4I8SA 1T3PA 2MEGA 1FLQA 3W6FA 3AB6A 1GB5A 1V7SA 2CJLA 1GE3A 4ML7A 2EQLA 2FYCA 1I20A 3N9CA 1GBSA 1IP3A 2AUBA 1OUIA 4XENA 5ILFA 1LJIA 4HSFA 1ZVYB 4PPOA 5T3FA 4DDCA 1UIHA 1JSFA 4XJGA 1UCOA 2C8OA 2Z19A 5KXXA 2XBSA 3LYOA 5LYMA 1DKJA 1UIAA 3IJVA 1LZDA 2YDGA 1HF4A 3AZ7A 1NKHA 1GFTA 4XYYA 4TSCA 4QY9A 2BQOA 4J1BA 1LYZA 1FLUA 1REXA 1LYSA 4TX7A 1GF5A 3RT5X 1IY3A 1DI5A 1LJ3A 1IR7A 2LHMA 5B06A 2DBTA 1UIDA 2D4JA 1LZCA 3OK0A 4ETAA 1GD6A 3A6BY 5B07A 1XSFA 1UIFA 5LVKA 1G7MC 3ZVQB 2ZIJA 1QSWA 3WH1A 1JEFA 1O23A 4U3XB 3WW6A 3D3DA 4NWEA 4WM1A 3A93A 1LSYA 4LYTA 4DD0A 4HP0A 4LT1A 2ZIKA 3M3UA 3CT1A 4XJIA 3W6BA 4L41A 4G4CA 1LZYA 1GB9A 1LHJA 5HLLA 4B0DA 5APEA 2D6BA 1IC5Y 4WLTA 1GXV2 1NDMC 5HMJA 4J1AA 5LIOA 4LYBA 1LSAA 1LSCA 2X0AA 2HEEA 5ILCA 5APCA 1HENA 1IEEA 3A96A 4XN6A 4LFXA 2XTHA 1D6QA 1YAQA 5LAFA 2W1LA 4AGAA 1G7JC 1LZNA 5I4YA 2HU3A 1C08C 1GB3A 2WARA 1A2YC 1GBXA 3B72A 5KXZA 1FLWA 1LCNA 4BAFA 1RCMA 4LT3A 1BHZA 4H90A 2DQEY 4WG1A 4NSIA 1GFKA 2BQJA 2YVBA 1CKHA 1LZEA 2MEEA 3WUMA 4Z3MA 2MEDA 1HMKA 2BQGA 132LA 194LA 1JJ3A 1CJ8A 1W08A 1FLYA 1CKCA 2HUBA 4PHIA 4DT3A 1BB6A 1C7PA 3WPLA 1GHLA 1SLYA 4LYZA 1JTOL 1GAYA 4FDYA 1LZ9A 4PJ2C 3ATNA 4XJFA 5DN5A 1BGIA 1WQOA 2BPUA 4FJRA 4LZTA 3WW5A 1OUEA 3P66A 2H5ZA 2Z18A 4WOAA 5FCPA 4H9BA 3W6DA 1LZ5A 1GDXA 1HELA 4B49A 4OOOA 2ZYCA 5KXTA 1HFZA 1HC0A 1F6SA 4KXIA 2RSCA 4Z98A 3N9AA 1LHLA 1DPXA 2MEAA 1YAPA 1VAUA 3WMKA 1REMA 1CJ9A 1IWTA 1JKDA 3E3DA 1JTPL 1NQIA 2Z2FA 1REZA 4J0LA 4DD9A 1IOQA 1LMOA 2I26L 3HBDA 1JKCA 3TXJA 5FDJA 1BWJA 3TXIA 1IIZA 2HU1A 1IOCA 1JTTL 1LMAA 1T6VL 1GFEA 1DXJA 2DQFC 4NGKA 5IDDA 1ALCA 1GBOA 2ZYPA 4OW1A 7LYZA 5KXOA 2FYDA 1LMNA 5IELA 4HV2A 4M4OA 3OJPA 1GFVA 3J6KA 3EBAB 5LYTA 4CHXA 4MCKA 4GLVA 2HEDA 2YSSC 4LYCA 4HTKA 5I54A 1HERA 4OWCA 5KXKA 3TMUA 3RW8A 1C43A 1WVVA 4O34A 3WULA 3EMSA 1GFGA 3AW7A 1WQQA 1IY4A 1W6ZA 3B0OA 1LAAA 4TUNA 1UIGA 1FKQA 4DDAA 4YF2A 1VEDA 3WL2A 4N8ZA 5KXLA 1RFPA 193LA 3AGIA 1AKIA 4OWEA 3TMVA 4BS7A 4C3WA 1OUCA 1IP1A 1LMCA 1JIYA 1AM7A 1B7SA 4NGLA 4ETEA 4NGVA 1B0DA 2GV0A 2G4QA 4HPIA 1B5YA 4WM5A 1QUTA 1IP7A 1WTMA 1IO5A 4PGJB 4XADA 2C8PA 3WU8A 4YEMA 5HNLA 3TXDA 1JPOA 1BWIA 1QIOA 1NWGA 1D0KA 1KIPC 4MR1A 4CFOA 5KKIA 4R0FA 3CQLA 4II8A 2EPEA 2ZWBA 3WYHA 2ZILA 1F10A 5KXRA 2D91A 1B7MA 1A4VA 3B0IA 1HFYA 5J7CA 4LFPA 1GF6A 1GBZA 5LAGA 4WL7A 1NMMA 1LSGA 4WLDA 1YAMA 1B9OA 4YENA 1GFAA 2YBJA 1IOSA 5E9RA 1F6RA 5L9JA 1QDRA 2HEBA 4H8XA 4NSJA 3BKVA 5II3A 1IC7Y 1IP6A 4LYMA 4NEBA 1FN5A 4IJ4A 4N1EI 2BLXA 5B1FA 3W6EA 2XJWA 2ZQ3A 2MEIA 1XFPL 1YKZX 1WQMA 5E4PA 1CJ6A 2F2NA 4B4EA 4NWHA 4I0CA 4A7DA 2I6ZA 1B7PA 3EXDA 1GDWA 1EQ4A 1B7QA 2A7DA 3CSRA 1WQPA 1GFRA 5APFA 4H9AA 3A3QA 5LVIA 3MGWA 1LJJA 3LHMA 4WLXA 1WTNA 4PRQA 1HEWA 3TXEA 3HBHA 2B5ZA 2XBRA 1ZV5L 1GXXA 135LA 1VATA 3LN2A 4OWHA 1KIRC 1LJ4A 1LZSA 3TXFA 4DD3A 4H9FA 5DN4A 4G49A 1LPIA 1VDTA 2F4AA 4HPEA 4X3BA 1GE4A 3ZVQA 1RI8B 2BAAA 1OUDA 4NGOA 5KKJA 1EQ5A 4H92A 1LMPA 3W6AA 1IWUA 4G4BA 4WM4A 1E8LA 1G7HC 1I56A 3RZ4A 1LZ6A 2LYOA 3A6CY 1IOTA 5FHWA 2BLYA 3WXTA 4H1PA 3W3EA 5I5QA 4ETBA 4H9HA 3A34A 2G4PA 4NGWA 1GEVA 3A92A 4E3UA 1LKSA 2CWIA 4CGEA 4ZFPA 3A8ZA 1J1OY 3IJUA 1GB7A 5K7OA 2HECA 1B7LA 1LSFA 1LJFA 1TAYA 4LT0A 1JHLA 4N1CC 1I1ZA 2YBMA 5AMYA 1IWWA 4WL6A 2F30A 4CFPA 4NGJA 5LXWA 2DQIY 2MECA 4WM2A 5FEKA 1J1PY 1GFJA 153LA 1FDLY 1IP5A 4KT3A 3TXKA 2Z37A 2Q0MX 1F0WA 3CT5A 2I25L 3P4ZA 4P2EA 1GB8A 4WM3A 4DD2A 1LZ4A 1LJNA 5EBHA 2H9KA 3BKHA 4WO6A 4CJ2A 3AGHA 1LTMA 1DKKA 4YEOA 1JJ1A 4G4HA 5F81A 2BQAA 1TDYA 2D4KA 4OOTA 1LZ8A 4GCEA 4NHIA 1GAZA 1OQMA 1MLCE 1YROA 1PS5A 1Z55A 4LYOA 4DWXA 2DQGY 1XEIA 3WUNA 1RJCB 3VWOA 4H9EA 3AZ5A 1G7IC 1NBZC 1CJ7A 6LYTA 1BWHA 1D9UA 1N4FA 2Z39A 5KXYA 3ATOA 4GCFA 2BQCA 2BQIA 1B7OA 1GE1A 4QDNA 4R6CA 4OWBA 5F16A 5LVJA 4LT2A 4HJYA 1LJHA 2BQKA 4NFVA 1KXYA 1QTEA 1LZGA 5KXMA 4HTNA 3WU7A 1QQYA 4BAPA 1TBYA 5L3IA 4NSHA 1GB6A 3WVYA 4NHTA 3A91A 2DQDY 4ET8A 5F9UA 1TEWA 1BB5A 1AT6A 1LYOA 1LYYA 4RW2A 4ZIXA 4N5RA 1B5XA 1LSEA 4UWVA 1IC4Y 2YBIA 3LZTA 2IFFY 1OUHA 1HHLA 207LA 1DQJC 1XGUC 1LSBA 1HNLA 5F14A 1GE2A 3LYZA 1JSEA 5B1GA 3WU9A 1IWXA 1JKBA 1GF4A 2MEBA 1BB7A 4KL7A 1LJGA 1LZTA 1WVUA 1YL0X 1GBYA 1MELL 3A3RX 1TCYA 4GCDA 2DQAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1DYDA 197LA 1P2CC 1C6AA 1LSZA 3P68A 4ZEEA 3HTDA 189LA 4Z41A 110LA 1GFHA 1LGXA 1L14A 1LWKA 4ETDA 167LA 1GF3A 3HT8A 259LA 3AGGG 4HJZA 1L13A 1LGWA 4GBRB 3HBEX 2CDSA 1FBIX 1LZAA 1ZVHL 2W1YA 1UA6Y 241LA 2DQJY 2B70A 4M6DA 5HQ1A 5JENB 4H94A 1OP9B 4TTDA 5DL9A 6LZMA 4LGKA 1LZRA 3LYTA 1ZURA 1XGQC 2LZTA 2PC2A 1DZBX 1L31A 3OE6A 2W1XA 2F4GA 4HV1A 3FI7A 3AYQA 3QNGA 1PZYA 1UACY 159LA 1C6GA 4WLYA 1YAOA 1B6IA 104LA 4YXCA 1L37A 1G07A 1KW7A 118LA 1L48A 1IP4A 1DI4A 2ZNXY 4DD7A 5D5FA 4I7QA 3ULRA 1JKAA 3SB6A 1P7SA 1GF0A 1QDTA 1CUQA 208LA 3HDFA 1L79A 3RU5A 4ANRA 3GXRA 1HEPA 4H91A 5B59A 3GUPA 1VFBC 1P6YA 154LA 1OWZA 4NGIA 1BB3A 1B2KA 134LA 1CV5A 2BQEA 5KY1A 1BVXA 3IWRA 1UIBA 120LA 1BB4A 1ZYTA 4QGZA 2BQLA 4ETCA 1GF9A 3W6CA 1L28A 1GPQC 3J4GA 1BVKC 1C69A 5LYZA 1L22A 1CU3A 243LA 5C6JA 5KXPA 1KXXA 2YBLA 1C10A 5M1YA 3DN6A 212LA 2MEFA 1D6PA 1VDQA 5LA5A 4TSBA 1QSAA 2VB1A 2Z38A 1L38A 3A95A 168LA 5D5CA 1LOZA 3WVXA 2A4TA 149LA 3SB7A 1HEMA 3T36A 4W94A 138LA 4GLAA 3G3XA 4YX7C 1P46A 2Q9EA 1C6TA 5A3EA 1L61A 3AB6A 1GB5A 1V7SA 2EQLA 2FYCA 1I20A 4XENA 3FADA 122LA 1UIHA 1LYGA 1JSFA 3HDEA 3L64A 4XJGA 1UCOA 2Z19A 3G3WA 1L33A 4EPIA 1HF4A 3C80A 1NKHA 239LA 4TSCA 2BQOA 1ZWNA 1LYZA 1FLUA 1L52A 1REXA 1LYSA 170LA 2LHMA 187LA 1L53A 3ODUA 1L57A 3OK0A 4ETAA 1D3JA 5B07A 1XSFA 1L74A 1L16A 235LA 2ZIJA 1JEFA 3C83A 1QT5A 3D3DA 3SN6R 4NWEA 4WM1A 3CT1A 1L83A 4L41A 1CV1A 1LHJA 5HLLA 4B0DA 1GXV2 5LIOA 3C8RA 5APCA 1HENA 3HT7A 1IEEA 4LFXA 1LZNA 5I4YA 2HU3A 2WARA 1GBXA 3B72A 3RUNA 4BAFA 2QB0B 4H90A 2DQEY 2BQJA 4Z3MA 1T97A 2BQGA 132LA 194LA 1W08A 1CJ8A 4DT3A 1BB6A 1C7PA 1GHLA 1L01A 1SLYA 1JTOL 4FDYA 3HH6A 5DN5A 3ATNA 1BGIA 2BPUA 4OOOA 2ZYCA 1P64A 1HC0A 3UONA 3N9AA 2MEAA 1C65A 140LA 1REMA 1JKDA 4DD9A 4J0LA 131LA 3TXJA 1C6JA 2RAYX 3TXIA 1L82A 7LYZA 5KXOA 1GBOA 3PDSA 5IELA 4M4OA 4GLVA 3TMUA 1D2WA 1C43A 3EMSA 1L50A 1LAAA 1UIGA 1FKQA 1VEDA 1C62A 4OWEA 3TMVA 4BS7A 4C3WA 1LMCA 1AM7A 1KW5A 4NGVA 2GV0A 162LA 228LA 1B5YA 1L09A 4ARJA 3TXDA 1JPOA 5KKIA 1D0KA 4CFOA 2ZWBA 3WYHA 1JTMA 5KXRA 4EJ4A 1DYGA 3GUOA 1A4VA 219LA 2OE9X 4YENA 1YAMA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1P2C C;  1CKF A;  4RW1 A;  1DI3 A;  1INU A;  2EKS C;  1HFX A;  1JUG A;  1LSZ A;  3P68 A;  5DLA A;  4ZEE A;  3AZ6 A;  1YKX X;  2LYM A;  1FKV A;  4Z41 A;  9LYZ A;  1GFH A;  1IR8 A;  4OWA A;  5FEL A;  3G3B B;  4B1A A;  1LHM A;  4NSG A;  1YAN A;  3QE8 A;  4ETD A;  1GEZ A;  1GF3 A;  2A7F A;  4B4I A;  3A90 A;  4DD1 A;  8LYZ A;  1G7L C;  3WUA A;  3AGG G;  3WXU A;  4HJZ A;  5DM9 A;  1XEK A;  3CSZ A;  1D0L A;  3LZ2 A;  3B0K A;  3G3A B;  2H9J A;  3HBE X;  2CDS A;  1FBI X;  1LZA A;  1CNS A;  1ZVH L;  4RLN A;  2W1Y A;  1UA6 Y;  1QTK A;  1WQN A;  1XGT C;  2DQJ Y;  1OUJ A;  4N0J A;  4GN3 A;  5KXN A;  4M6D A;  5HQ1 A;  1REY A;  4NG8 A;  4GCC A;  4XJD A;  4B4J A;  5C6L A;  1JJ0 A;  3TXB A;  5JEN B;  4H94 A;  1OP9 B;  1NBY C;  4N9R A;  4TTD A;  1YIK A;  5DL9 A;  1AT5 A;  4J7V A;  5KXW A;  3CB7 A;  3K3T A;  4LGK A;  1LZR A;  1EL1 A;  1UBZ A;  3LYT A;  3WPJ A;  1JIT A;  4AXT A;  1KXW A;  5LA8 A;  1H6M A;  1B5W A;  1XGQ C;  2EIZ C;  2LZT A;  4NHQ A;  1LHI A;  1GF8 A;  1LSD A;  1CKD A;  2PC2 A;  4MST A;  1DZB X; 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 4PPO A;  5T3F A;  2C8O A;  5KXX A;  2XBS A;  185L A;  3AZ7 A;  234L A;  2QAR C;  174L A;  1OV5 A;  5B06 A;  2DBT A;  1UID A;  2D4J A;  218L A;  130L A;  1GD6 A;  1UIF A;  1G7M C;  1L44 A;  3A93 A;  1LSY A;  2O7A A;  4DD0 A;  4LT1 A;  1L73 A;  3M3U A;  3W6B A;  4G4C A;  1LZY A;  1L21 A;  5APE A;  1C6I A;  1LSA A;  2X0A A;  126L A;  3CDV A;  1CU6 A;  2HEE A;  221L A;  181L A;  3A96 A;  4XN6 A;  1G7J C;  141L A;  4W53 A;  109L A;  1LCN A;  182L A;  1CTW A;  216L A;  4NSI A;  1GFK A;  1HMK A;  1JJ3 A;  148L E;  1FLY A;  157L A;  103L A;  4LYZ A;  4XJF A;  1L92 A;  1LZ9 A;  4LZT A;  3WW5 A;  1L70 A;  2H5Z A;  2Z18 A;  5FCP A;  4H9B A;  1HEL A;  1HFZ A;  1VAU A;  3WMK A;  2Z2F A;  1NQI A;  1G0G A;  4DKL A;  175L A;  3HBD A;  5FDJ A;  191L A;  1JTT L;  1GFE A;  2DQF C;  5IDD A;  4NGK A;  1ALC A;  2OTY X;  4EPF A;  1LMN A;  1GFV A;  1L51 A;  2F2Q A;  5I54 A;  1HER A;  3RW8 A;  1DYF A;  1WQQ A;  3K2R A;  4YF2 A;  188L A;  3WL2 A;  4N8Z A;  5KXL A;  193L A;  1IP1 A;  1B7S A;  245L A;  1IO5 A;  2C8P A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4PGJB

Total Genus

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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