4TUNA

Crystal structure of chicken egg white lysozyme adduct with organophosphorus pesticide monochrotophos
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Biophysical aspects of lysozyme adduct with monocrotophos.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4tunA00
4OWEA 5KXOA 4LFXA 5KXMA 4UWNA 1VAUA 3WU9A 1DXJA 5KXXA 1G7JC 4MSTA 5I4XA 1IWXA 1LHIA 3SP3A 5LINA 4XN6A 1JJ0A 1GBSA 1NDGC 1LSFA 1UIBA 2HEFA 1OUIA 2BQCA 5FSTA 1GF8A 1DI4A 2YBLA 5C6IA 3WW5A 5LYZA 1VDQA 3LYZA 1UIFA 2MECA 1LYYA 1NBYC 4ZEEA 4FDYA 3A6BY 1IOTA 2F30A 1QSAA 4DD2A 1IOSA 1GE2A 5F81A 1IR8A 1JKDA 3A6CY 3OJPA 1XEIA 3AW7A 4R6CA 4YEMA 1LSGA 3B72A 3E3DA 1WQQA 1XGUC 5KXKA 1JTTL 1VDSA 1LSPA 4B4EA 3J4GA 3OK0A 3RNXA 2Z37A 3LZ2A 3TMWA 1GB8A 1J1PY 1O23A 1GF3A 1GBWA 1CJ6A 1QSWA 2ZILA 1LZ1A 1N4FA 3TMXA 2ZNXY 4XYYA 1JTOL 4A7DA 4NY5A 4PGJB 5HQ1A 4D9ZA 1UC0A 3M3UA 4WLYA 194LA 5DN5A 4G9SA 2DQHY 3WPLA 3P66A 3AZ6A 1AT5A 2XBRA 4H9EA 4NGIA 5J7CA 4ET9A 2IHLA 2GV0A 1B5YA 1IVMA 5B1FA 2D4KA 5A3EA 2BAAA 4O34A 4OOOA 1HMLA 1GE3A 3WPJA 3W3EA 1TBYA 3LHMA 4N5RA 3LYOA 2LYZA 1CKFA 3A67Y 1LMCA 2IFFY 4H8ZA 4RLNA 1CJ8A 1JTPL 1IP6A 4HSFA 2XBSA 3WYHA 3TXFA 1B9OA 1KXWA 1GBYA 1LYOA 2YBMA 2EIZC 4HJZA 1H87A 1LJNA 2MEAA 1JJ3A 4XJHA 1DI5A 1GB5A 1CNSA 1DQJC 2DBTA 2FYCA 4YENA 4XJIA 1NHEA 2C8PA 2BPUA 5E9RA 1IO5A 5A3ZA 3ZVQB 4RLMA 4KT3A 2N5ZA 4H1PA 3WXUA 2ZYPA 1LSBA 1A2YC 4WMGA 4WO9A 4ET8A 2DQCY 4NG1A 5IHGA 4OW1A 1IP2A 3KAMA 4NHIA 1ZVHL 1GFKA 5AMYA 4DWXA 1UBZA 1FDLY 1FLWA 1GFRA 2Z12A 4B4IA 4NSIA 1YANA 1LYSA 1IORA 2NWDX 4GN5C 4C3WA 1IWVA 5T3FA 1RCMA 2BQMA 2H5ZA 1HMKA 1J1OY 4TUNA 5LYMA 4GLAA 1ALCA 1UIEA 1NQIA 2DQFC 4E3UA 1IIZA 2ZYCA 3AB6A 4HP0A 1NKHA 1ZV5L 2I6ZA 1B7MA 1UIAA 2YDGA 4NGWA 1GF0A 4ZIXA 5I4YA 5KXSA 4I8SA 1LJIA 3W6EA 1D6QA 4ETEA 1WVVA 5HMVA 2MEEA 1LZ4A 2Q0MX 4NSHA 5F9UA 3G3AB 1JPOA 3A94A 1GF9A 4OWAA 1BWJA 5E4PA 3AGHA 1YL1X 1V7TA 1KIQC 3A3QA 1LSEA 1HFYA 3TXJA 1GBOA 3WL2A 4WM5A 1RJCB 2AUBA 5KXRA 1NF5A 2BQNA 1I1ZA 1SLYA 3M18B 5LVIA 5I54A 5KJ9A 1YAPA 3AJNA 1C7PA 1JEFA 4H9FA 4BADA 1LCNA 4G4CA 4HPIA 1GPQC 5KXWA 2D4JA 1B7LA 1HHLA 4GLVA 4WG7A 1IC5Y 5F14A 2BQFA 1HFXA 2LYOA 4GCEA 1GXV2 3CT0A 1IWTA 1D0MA 1NMMA 1LZRA 2Z2EA 1HEQA 2VB1A 4B0DA 207LA 1B7RA 5JENB 1LJFA 2YBJA 2BQOA 1CKDA 1QDRA 4ETCA 4LYOA 3WUAA 2H9JA 4H92A 3TXHA 4LYTA 3QY4A 7LYZA 5LIOA 1QUSA 4G4HA 5II3A 4BAPA 1UCOA 1GDWA 1GFEA 4J0LA 1HELA 1WQMA 2HTXA 5LA5A 1IOQA 1D0KA 4PRQA 1VDTA 1IX0A 4QEQA 1IWYA 1LZDA 1WQOA 5EBHA 1HERA 1ZVYB 3CSQA 4LT1A 4OWBA 1BVXA 1LSMA 3D3DA 4NIJA 1GB7A 2RSCA 4PJ2C 1BB6A 1PS5A 1JKCA 1YL0X 4WM2A 5LAFA 1UUZC 4C5FA 1JKBA 1LHMA 5HNLA 1HSWA 5KXYA 4H9CA 134LA 3A92A 3CQLA 1V7SA 4WG1A 1GFGA 2BQHA 1B7PA 1GAYA 3A96A 3LYMA 4N9RA 133LA 5IDDA 3AYQA 3WULA 1KXXA 1PZYA 4PPOA 4IATA 2G4QA 3HFMY 4GCFA 5DLAA 1UIDA 1QDTA 1JISA 1RI8B 1BWHA 4WM1A 1LKRA 1DI3A 4DT3A 3WU8A 5KKJA 4EMNA 2YSSC 2FYDA 4NFVA 5LYTA 4B49A 1BQLY 5FELA 1YAMA 1HENA 5F16A 1LOZA 2EKSC 4NHQA 4XJFA 3J6KA 1I56A 5C6LA 1MELL 3N9EA 3WW6A 1AM7A 1CKCA 5B05A 4UWVA 5B1GA 2BLYA 3AZ5A 3BKVA 4HTNA 1BHZA 4RW1A 4DDAA 1I20A 5DL9A 5B06A 5KXPA 1W6ZA 4RW2A 3LZTA 4QY9A 1G7HC 1IY4A 1IP7A 1OUDA 1EQEA 4HPEA 1LZAA 4YF2A 1TDYA 3HBEX 1YKZX 1JHLA 1LZSA 1D9UA 4LT3A 5I4WA 154LA 3BKHA 1GE0A 2Z2FA 1AKIA 1HEMA 2MEHA 4X3BA 4XJBA 1GB6A 1YAOA 1UIGA 1XSFA 1IP4A 2BQDA 4OWCA 1DPXA 2MEFA 3EXDA 4ANRA 4H9AA 4HJYA 1IR9A 1GAZA 4LYBA 1LZ9A 4TSCA 4H9HA 2LYMA 2WARA 4GCBA 5I5QA 1LKSA 1LHJA 5B07A 5I53A 1IC7Y 1AZFA 4CJ2A 1XFPL 4H91A 1IEEA 2CJLA 1D0LA 1NWGA 4IJ4A 4B1AA 2MEBA 1BB4A 3K3TA 3W6BA 4PHIA 1FLYA 135LA 3WXTA 1GB9A 1NDMC 3W6FA 1GFHA 1LJHA 2F4AA 1GEZA 2YBNA 1LZ6A 1XEKA 2X0AA 5D5FA 4AXTA 5LXWA 4BAFA 1IWWA 2W1MA 1OUGA 1JIYA 4NWHA 4FJRA 3TXDA 1NBZC 1C43A 1GFVA 1E8LA 4TTDA 5HMJA 1G7MC 3B6LA 4CFPA 2FBBA 3A93A 2YBIA 1FKVA 4EOFA 1IY3A 1QTKA 1LZNA 1B5VA 4N1EI 4AGAA 1JSFA 1MLCE 4G4BA 1C46A 1OUFA 4J7VA 5HNCA 4BS7A 3MGWA 4WM6A 3AW6A 4XJGA 3TXEA 2B5ZA 1BB7A 4NGVA 1XGTC 2DQEY 3B0IA 3EMSA 1Z55A 1EL1A 2G4PA 1RE2A 1FBIX 1LJ3A 3A90A 5C6JA 1GB2A 4WL6A 4NHPA 2HEBA 193LA 3F6ZA 4DDBA 5K7OA 4N1CC 1QTEA 1JJ1A 3ZEKA 8LYZA 1LJKA 2I25L 3QNGA 1GFTA 1P2CC 1IOCA 1C45A 1WQRA 3RT5X 3TXGA 3EBAB 1LSZA 4XADA 4NSJA 5HLLA 2DQDY 3HBHA 2CWIA 3RW8A 3N9AA 5DM9A 1LMNA 4DD7A 1LTMA 2HEDA 4XENA 1GFAA 4TSBA 4WOAA 3A34A 3FE0A 3P68A 1REYA 1B7QA 1HEOA 4NHTA 1YQVY 2ZNWY 1HFZA 4LYCA 3TXKA 3B0KA 4L41A 2BQAA 1DKKA 3P64A 4W96A 1IC4Y 4RDSA 5L3IA 5IELA 1HF4A 1QUTA 2HUBA 3CSRA 4MR1A 4LZTA 2ZIJA 2BQEA 3RU5A 1FN5A 3TXIA 1YKYX 4DC4A 2Z19A 1LMAA 2DQIY 4N8ZA 153LA 1B0DA 3FI7A 4NGOA 1TEWA 5FDJA 132LA 1VDPA 2DQAA 5B59A 1WVUA 5APDA 4NG8A 4HTKA 5D5CA 2D4IA 2MEIA 1XGPC 1OUAA 4GCCA 4ETBA 3CT5A 4GN3A 4DD0A 4ML7A 1OUBA 1IWUA 1REMA 1UICA 2DKVA 2LHMA 4LGKA 2ZWBA 2HU3A 2HEAA 3ATOA 1J1XY 1A4VA 1GB3A 1LJEA 2HU1A 1YKXX 2EPEA 2ZQ4A 1GWDA 1BVKC 5DN4A 4Z3MA 1LZGA 3B0OA 1VEDA 3IWRA 4J1AA 2BQGA 1ZMYL 5LVKA 1LHHA 4NGZA 4U3XB 4XJDA 3EO5A 3IJVA 1GXXA 2BQLA 4WLDA 4GCDA 1REZA 1T3PA 1OUJA 4H93A 5FHWA 4NGKA 1LSCA 3ZVQA 4WO6A 5FEKA 1B7OA 2ZQ3A 1LZBA 4ETDA 5ILFA 1GDXA 1XGQC 3QE8A 4II8A 1RFPA 3GXRA 1IR7A 3IJUA 2F4GA 1LZCA 2YVBA 4KPMA 4M4OA 1GHLA 1GBXA 1LZTA 1JWRA 5LA8A 4OOTA 3G3BB 4WM4A 1GF4A 2D91A 5KXTA 2HECA 4PRUA 1LMPA 2DQJY 3HBDA 3ATNA 3AGIA 1OUEA 1REXA 2XTHA 3LN2A 1WQNA 3LYTA 2DQGY 1WTNA 3TMVA 1LZEA 1LZYA 1D6PA 1WQPA 4YM8A 2LZ2A 3A3RX 3WH1A 2CGIA 1LMOA 1W08A 2I26L 3P65A 1LHKA 1LZ5A 2H9KA 4TX7A 1IP5A 5M1YA 4P2EA 3WMKA 1FLQA 4NGYA 1DZBX 1QIOA 4W94A 5APCA 4WL7A 3WVYA 3A8ZA 3WVXA 208LA 5APFA 4Z41A 5KY1A 1LMQA 1F6RA 1LMTA 2XJWA 4Z46A 4NGJA 4NHSA 2ZIKA 3CT1A 1LJGA 4QDNA 1LHLA 3WU7A 3N9CA 1HNLA 1KXYA 4H8XA 1YILA 1GB0A 1CJ7A 1OUCA 4LFPA 3ULRA 3WPKA 2BQKA 4ZFPA 2YBHA 1F0WA 9LYZA 1WTMA 1HC0A 1EQ4A 2D6BA 2W1XA 1GE4A 4KXIA 4TWSA 5FCPA 3AGGG 1CJ9A 1GD6A 1LSYA 1JUGA 1B5WA 4J1BA 1B5UA 4DD3A 5L9JA 1JSEA 1KIPC 1UACY 5KXLA 4OWHA 5L3HA 4GN4A 1LSDA 4IASA 5KXNA 1VATA 4CHXA 1OQMA 1IP1A 1SQ2L 2HEEA 1LSAA 4B4JA 4NEBA 4WLXA 4G49A 2Z18A 4H90A 1YAQA 5F9XA 1DKJA 4N0JA 2Z38A 1JKAA 3TMUA 1EQ5A 1C10A 2LZTA 3CSZA 4LYMA 3VWOA 1QQYA 5KXZA 2W1LA 2MEGA 4LT2A 4HV1A 4DD1A 1IP3A 1B7SA 2BLXA 3W6DA 1BGIA 1F10A 1LZ8A 3A95A 1G7LC 2EQLA 3AZ7A 1INUA 3WUNA 5LVHA 3TXBA 4ETAA 6LYZA 1UIHA 2MEDA 1HSXA 4WM3A 4WLTA 6LYTA 1G7IC 1B7NA 4M6DA 4CFOA 4NWEA 2G4NA 1LJJA 1C08C 4DDCA 1HEPA 4CGEA 1JITA 3T36A 3A91A 2PC2A 5KKIA 4DYGA 4YOPA 1B5ZA 2Y8PA 2BQIA 5APEA 2C8OA 4HV2A 4HTQA 1IWZA 3W6AA 1CKHA 2Z39A 3AZ4A 4YEOA 1XEJA 3RZ4A 1GF7A 4QGZA 1F6SA 1OP9B 1GF5A 1H6MA 1KIRC 1XGRC 4H9BA 4KL7A 5LVGA 4DD9A 1DPWA 1BB5A 1TAYA 2A7FA 5LAGA 3GXKA 4MCKA 1LSNA 2W1YA 2BQBA 1B2KA 1GFJA 5LVJA 3P4ZA 4LT0A 1LJ4A 4HJVA 1OUHA 1BWIA 4LYZA 4R0FA 4Z98A 3WUMA 1UA6Y 2F2NA 4UWUA 1LYZA 1YROA 1LAAA 5ILCA 1FKQA 1HEWA 1T6VL 1BB3A 1GF6A 2CDSA 1GEVA 3D9AC 1LPIA 1B5XA 1GBZA 1FLUA 1GFUA 1YIKA 2A7DA 3CB7A 4I0CA 4NGLA 3T6UA 1CKGA 1AT6A 4NSGA 4H8YA 1VFBC 3W6CA 1TCYA 1GE1A 2FBDA 4H9IA 2BQJA 4H94A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4XN6A 173LA 1NDGC 4I7OA 1LWKA 3F9LA 3LYZA 1LYYA 4DD2A 1GE2A 2B73A 1JKDA 1XEIA 3AW7A 1LSGA 3B72A 5KXKA 1LYDA 2Z37A 3LZ2A 1O23A 1GF3A 4W55A 1GBWA 258LA 1N4FA 3TMXA 2F2QA 5HQ1A 1LYJA 4H9EA 2GV0A 3WPJA 3OE0A 1QT3A 3RZEA 1L27A 1L34A 1JTPL 3DN1A 1QT7A 1PQKA 3TXFA 1GBYA 1G1VA 1C60A 2EIZC 1LJNA 1JJ3A 1DQJC 2FYCA 1L05A 4XJIA 1L13A 5E9RA 1IO5A 1KW5A 3HTFA 4RLMA 4KT3A 1QUOA 4H1PA 3WXUA 1QSBA 1A2YC 4OW1A 163LA 1ZVHL 1GFKA 4DWXA 1SSYA 1UBZA 4B4IA 1LYSA 4GN5C 5T3FA 3LZMA 1RCMA 1D2WA 4TUNA 1NQIA 3HUAA 241LA 1L10A 1L96A 1GF0A 143LA 5KXSA 1LJIA 1LGWA 3W6EA 4ETEA 1WVVA 1LZ4A 2Q0MX 1C64A 3G3AB 3A94A 232LA 4YXAC 4OWAA 164LA 3A3QA 1C6TA 1GBOA 195LA 4WM5A 2AUBA 2BQNA 1I1ZA 3SB7A 3AJNA 1C7PA 4BADA 2ANVA 4G4CA 4HPIA 1LGUA 1B7LA 1I6SA 2BQFA 4GCEA 3CT0A 110LA 1D0MA 1NMMA 1CU2A 1L31A 5JENB 3C82A 2RH1A 1ZYTA 4ETCA 2H9JA 3TXHA 4LYTA 2RBOA 1HELA 1IOQA 1IX0A 2Q9EA 5EBHA 1L76A 1HERA 4LT1A 4OWBA 1LSMA 1GB7A 4PJ2C 1C61A 5LAFA 1UUZC 1XJTA 3DNAA 1HSWA 3A92A 251LA 2BQHA 3LYMA 2LZMA 4N9RA 3WULA 1QTHA 2RBNA 1DI3A 2A4TA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4OWE A;  5KXO A;  4LFX A;  5KXM A;  4UWN A;  1VAU A;  3WU9 A;  1DXJ A;  5KXX A;  1G7J C;  4MST A;  5I4X A;  1IWX A;  1LHI A;  3SP3 A;  5LIN A;  4XN6 A;  1JJ0 A;  1GBS A;  1NDG C;  1LSF A;  1UIB A;  2HEF A;  1OUI A;  2BQC A;  5FST A;  1GF8 A;  1DI4 A;  2YBL A;  5C6I A;  3WW5 A;  5LYZ A;  1VDQ A;  3LYZ A;  1UIF A;  2MEC A;  1LYY A;  1NBY C;  4ZEE A;  4FDY A;  3A6B Y;  1IOT A;  2F30 A;  1QSA A;  4DD2 A;  1IOS A;  1GE2 A;  5F81 A;  1IR8 A;  1JKD A;  3A6C Y;  3OJP A;  1XEI A;  3AW7 A;  4R6C A;  4YEM A;  1LSG A;  3B72 A;  3E3D A;  1WQQ A;  1XGU C;  5KXK A;  1JTT L;  1VDS A;  1LSP A;  4B4E A;  3J4G A;  3OK0 A;  3RNX A;  2Z37 A;  3LZ2 A;  3TMW A;  1GB8 A;  1J1P Y;  1O23 A;  1GF3 A;  1GBW A;  1CJ6 A;  1QSW A;  2ZIL A;  1LZ1 A;  1N4F A;  3TMX A;  2ZNX Y;  4XYY A;  1JTO L;  4A7D A;  4NY5 A;  4PGJ B;  5HQ1 A;  4D9Z A;  1UC0 A;  3M3U A;  4WLY A;  194L A;  5DN5 A;  4G9S A;  2DQH Y;  3WPL A;  3P66 A;  3AZ6 A;  1AT5 A;  2XBR A;  4H9E A;  4NGI A;  5J7C A;  4ET9 A;  2IHL A;  2GV0 A;  1B5Y A;  1IVM A;  5B1F A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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