4WLTA

High pressure protein crystallography of hen egg white lysozyme at 190 mpa
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High-pressure protein crystallography of hen egg-white lysozyme
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 52
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4wltA00
2YBMA 2BQMA 1GFVA 2HECA 5L3HA 1IIZA 1HC0A 3AJNA 1J1PY 1GFEA 5D5CA 4RW1A 3HBDA 1YKZX 1RI8B 4LYTA 1FKVA 4WM5A 2DQJY 2BLXA 2LYMA 3N9CA 2LHMA 1TDYA 4WM6A 1HF4A 4LYZA 4HV1A 1DI4A 3J4GA 3TMUA 153LA 1GF5A 5DN5A 4NEBA 1OUJA 3AZ4A 3W6FA 3ATNA 3TXFA 1DQJC 1G7IC 1HEOA 5FSTA 3A91A 5IHGA 4WM3A 1OUBA 1HENA 2IHLA 1YAQA 1HELA 2DQEY 3WUAA 3N9AA 2CGIA 1JTTL 4GN4A 1LZCA 1KIQC 1LJ3A 1IY4A 5M1YA 1OUAA 5HQ1A 1GF9A 4XJHA 1TBYA 1IWXA 1OUEA 3ATOA 1DKJA 1B7PA 1UUZC 3TXJA 2BQNA 1JKAA 3ZVQB 2HTXA 4HJZA 4LT0A 1GBOA 3WVYA 3RW8A 5FEKA 1D0MA 3TXBA 1CKHA 4R6CA 1DXJA 1BWJA 2PC2A 4NSHA 4CFOA 4DD3A 1EL1A 4HJYA 1UIEA 1DKKA 3ZVQA 4NHSA 1YKXX 2Z19A 4YM8A 3VWOA 5L9JA 4TX7A 2H9JA 5E4PA 1F6SA 1JPOA 4J1BA 2HEEA 1VFBC 1LOZA 4M6DA 5C6JA 4KPMA 4WG7A 4N9RA 1IC7Y 5B07A 2G4QA 2BAAA 1GFHA 1IP6A 1JUGA 4OWAA 1LHJA 2BQFA 1AT5A 1B7QA 1MELL 4NGVA 3T36A 5KY1A 1C46A 1GB6A 1VDQA 4HTKA 4H94A 1LJHA 4WO9A 1G7MC 1IP5A 3CSQA 4G4CA 2BQCA 4LT1A 4Z46A 4I8SA 1GFTA 4WOAA 1D0LA 2DKVA 1J1XY 4LT2A 4H93A 2A7DA 3HBHA 4TTDA 5B1GA 2EPEA 1BB4A 3GXRA 4NG8A 1UIHA 5LVIA 4WL7A 2BQAA 1XFPL 3IWRA 4J1AA 1LZGA 4LGKA 1GE3A 2BQHA 4N1CC 4NSJA 1CJ8A 3G3BB 4YENA 1REMA 1WQPA 3A6BY 1NKHA 1IWZA 4GLAA 3SP3A 2BQOA 2D4IA 1YL0X 3B6LA 4I0CA 3HFMY 2MEBA 3A67Y 4RW2A 4XADA 5KXYA 4N0JA 1WQRA 1UIDA 4H8ZA 2FBBA 3G3AB 1C10A 1VDTA 1DPWA 1IR8A 1REXA 4C5FA 4XJIA 1LHKA 1J1OY 4ETCA 1LYZA 4PRQA 4WLYA 1W08A 1AKIA 1LJFA 3FI7A 1OUFA 1WTMA 2W1YA 1GBYA 1UCOA 2LZ2A 1VAUA 3AB6A 4NGLA 4OOTA 4H8XA 4RLMA 4DD2A 4DWXA 4UWNA 2HEBA 3MGWA 4UWUA 5DLAA 1JKCA 1QTKA 5EBHA 4EMNA 4NGZA 2Y8PA 3A3RX 2MEGA 3W6CA 2GV0A 1GB9A 4N5RA 1GB7A 2DBTA 4Z41A 1LSNA 1QTEA 4XN6A 4DD1A 2BQLA 1IP7A 1JSFA 193LA 1GB0A 1LZBA 3J6KA 3QE8A 3AZ5A 5LA8A 4ANRA 4ET9A 1VDPA 1BB7A 1QQYA 1DZBX 1YROA 2HUBA 1IOTA 2BQBA 5HNLA 3WPJA 1B9OA 3WPLA 4AXTA 1H87A 1IC5Y 2ZQ3A 1JTOL 2D4JA 3LZ2A 4XJFA 3RU5A 2D6BA 1HEQA 2BQIA 1QDTA 2Z2EA 4OWHA 1FLUA 4QGZA 5A3EA 1B5ZA 4DT3A 4Z98A 1T6VL 3ULRA 1OUCA 1IOQA 2B5ZA 1TEWA 3BKHA 1B7SA 1LKRA 1V7SA 4ET8A 4OWEA 1NQIA 1H6MA 4IASA 1LJEA 3TMVA 1IEEA 3WH1A 4DDCA 1LJIA 1WVVA 2BLYA 5I54A 4ZEEA 3WW5A 4G4HA 3WYHA 3TMXA 2Z37A 4LYOA 5B05A 1GDXA 4L41A 1UIGA 5F14A 1XGPC 1HFZA 1LYOA 4CGEA 4DYGA 5KXWA 1F6RA 1LMCA 9LYZA 1G7JC 2XBSA 4XJDA 1ALCA 3AGHA 3AGGG 5B59A 2Z39A 5K7OA 1IOCA 1LMQA 4H9CA 1BWIA 1GFJA 1F10A 1NBZC 1BQLY 3B0IA 3B72A 4WM4A 2YSSC 3ZEKA 1DPXA 1C43A 1LZEA 5B06A 2LYOA 1BB3A 6LYTA 3P66A 5B1FA 3LZTA 1GFGA 4CJ2A 1IR7A 1C7PA 1LCNA 1LZYA 3EMSA 5APDA 4BAPA 5LVJA 1CJ6A 1QUTA 1JTPL 2MEHA 1TCYA 1GE4A 2DQDY 5D5FA 5APFA 5KXRA 4MSTA 2YDGA 1ZMYL 3D9AC 3W6BA 1GBZA 1JISA 2CJLA 2FYCA 1INUA 2HEAA 2DQCY 3AZ7A 1HEMA 1LSPA 2ZQ4A 2A7FA 3B0OA 5ILCA 1QSAA 1I1ZA 4HTNA 3WUMA 1NMMA 1A4VA 1B5VA 1LZ8A 1QDRA 2ZNWY 4H9BA 5KXTA 4RDSA 1FBIX 2ZWBA 5KXLA 1LMPA 1RCMA 1OQMA 3LHMA 3OK0A 1GF4A 4QDNA 2ZYCA 4LFXA 1G7HC 3AYQA 1WQNA 4ZIXA 1W6ZA 5KXMA 1LZSA 5APCA 3HBEX 1D6QA 3WU8A 1DI3A 1HFXA 1LHMA 2DQAA 3P4ZA 1LSZA 1D0KA 1LZ1A 4W94A 1GB2A 3A34A 4RLNA 1N4FA 4WLTA 3W6DA 1Z55A 1AM7A 5KXZA 4H90A 208LA 5F9XA 1A2YC 1RE2A 1P2CC 1EQ4A 1C08C 1BWHA 3P64A 2W1XA 2W1MA 4G49A 1GEVA 1JEFA 4HV2A 4XJGA 4XYYA 3TXDA 5F81A 3LYOA 2MECA 1CKFA 3B0KA 1GAZA 1OUIA 2VB1A 4LFPA 2ZIJA 5HLLA 4NGWA 4GCDA 2G4PA 1CKDA 5LINA 1B7NA 1NDMC 1NWGA 1PS5A 2FBDA 1XGUC 4GCEA 1HHLA 2FYDA 1GFUA 1JWRA 2ZNXY 1B5WA 3EXDA 4PPOA 1GXXA 2DQHY 4WMGA 1GF7A 5KXKA 3EO5A 2YBNA 5LA5A 4WM2A 4LYCA 1ZV5L 2DQIY 4XJBA 1B5YA 1UIBA 5APEA 5AMYA 5C6LA 3TXEA 1EQ5A 3WU7A 4M4OA 1LJKA 2BQDA 5C6IA 3A90A 3P65A 135LA 1LZ6A 4NFVA 1HMKA 4NHPA 1JKDA 1LMOA 4H1PA 4HP0A 5DM9A 1OP9B 5LYMA 1IO5A 1LJGA 1YAMA 1ZVHL 4BADA 1LSAA 4WLDA 3A95A 1B5UA 1HERA 8LYZA 4YF2A 4NGIA 5KXNA 3TXKA 1LMAA 4NSGA 1NHEA 4NHTA 2HEFA 4H9AA 4KXIA 4PRUA 4DDBA 2C8PA 5KJ9A 4H9EA 4O34A 3P68A 3WPKA 3A93A 3AZ6A 3QNGA 4KT3A 3WU9A 4B4EA 3WUNA 5KXSA 1GE1A 3K3TA 1LPIA 5ILFA 4AGAA 1LHHA 4C3WA 4NHQA 1LJ4A 4WL6A 3WMKA 1JJ3A 1F0WA 1VATA 1JKBA 7LYZA 2CWIA 1LSDA 5T3FA 2YVBA 1D9UA 5KXXA 3TXGA 5LVKA 1BHZA 4GCBA 4CHXA 3CB7A 4P2EA 2YBJA 1JJ0A 3A92A 3CT1A 5DL9A 3TXIA 2IFFY 1GF3A 1XEIA 1GEZA 1T3PA 1HSWA 4X3BA 1LZDA 5DN4A 1YILA 1REYA 5F9UA 2AUBA 132LA 4G9SA 2Z18A 2CDSA 4EOFA 1UC0A 1YAPA 2X0AA 1XGQC 4NGKA 1YAOA 1YQVY 4W96A 4ETDA 2D4KA 5LAGA 2BQKA 1B0DA 2MEEA 2MEFA 1E8LA 1GPQC 4WG1A 1QIOA 1I20A 3W6EA 1VDSA 1XGRC 5IDDA 4FJRA 4DD9A 1QUSA 4ETAA 1LMNA 4QY9A 2G4NA 4CFPA 1B7OA 3RNXA 1UICA 4H9HA 2DQGY 1JHLA 1YL1X 2LZTA 1GHLA 4DD7A 1BGIA 1LHIA 2EQLA 1OUGA 1KIRC 2ZILA 1V7TA 4NWEA 4NHIA 5LYZA 4HJVA 207LA 5LVHA 1IP4A 2ZYPA 5HNCA 5I5QA 1SLYA 1FLQA 2EKSC 4NGYA 4OWBA 1LAAA 3AGIA 4B49A 4MCKA 2BPUA 4B4IA 1IVMA 1DI5A 1GFRA 2C8OA 4J0LA 3CQLA 3IJVA 2F2NA 4G4BA 1LMTA 1UACY 4B4JA 1IP1A 3RZ4A 2NWDX 2ZIKA 1LZNA 1IORA 1LZ9A 3A6CY 2BQGA 1LKSA 1RJCB 1UIFA 2H9KA 2YBIA 1XEKA 3A3QA 3E3DA 3IJUA 4GN5C 1OUDA 1IWUA 4OW1A 3T6UA 4DDAA 5JENB 1GB3A 1GBXA 4N1EI 1REZA 5KKJA 1KIPC 4LYBA 1LSCA 1LJNA 1FLYA 2DQFC 3QY4A 4PJ2C 4XENA 1IOSA 1B7LA 1B7RA 1GF0A 2BQJA 2HU1A 2I25L 1WVUA 1KXWA 4NGJA 4UWVA 4YEOA 5FDJA 5J7CA 5F16A 5KKIA 5KXOA 4B0DA 5II3A 1HFYA 2W1LA 1CJ9A 1JITA 1D6PA 1GF6A 1UIAA 1FN5A 2MEAA 3FE0A 2WARA 154LA 1FLWA 1LZ5A 1O23A 3LYMA 4GCFA 4H9IA 1BVXA 1LHLA 2HU3A 4LZTA 2Z38A 4H92A 4NY5A 3W6AA 4ETBA 5FCPA 1FKQA 1SQ2L 4NIJA 1KXYA 1LJJA 2MEDA 3M3UA 2YBHA 4QEQA 3CSZA 1AZFA 1GAYA 1C45A 4N8ZA 2F30A 4H9FA 133LA 1FDLY 1IWWA 2XBRA 4HPEA 1MLCE 1WQOA 1NDGC 2F4GA 1IX0A 1LSBA 2XJWA 4HPIA 4FDYA 194LA 1EQEA 2EIZC 1PZYA 4BAFA 5LAFA 1HSXA 4WO6A 4A7DA 3A94A 3BKVA 3F6ZA 1IP2A 1IWYA 1LYSA 1YIKA 2D91A 2I6ZA 4KL7A 2BQEA 5LIOA 4II8A 4GCCA 1LSFA 1HMLA 1LSEA 1GF8A 4GN3A 1GD6A 1GDWA 2N5ZA 2RSCA 3GXKA 1BVKC 1HNLA 4H91A 1GE0A 3CT0A 4OOOA 4WLXA 5LVGA 4WM1A 1NF5A 1UBZA 5I4YA 1CKGA 3A8ZA 3WULA 5LXWA 3W3EA 5FHWA 1GE2A 4ETEA 1XEJA 2XTHA 1LSMA 4Z3MA 1UA6Y 4NG1A 4NSIA 4ML7A 4TWSA 4NWHA 2H5ZA 1GBSA 1YKYX 2Z12A 1I56A 1LSYA 4LT3A 4LYMA 4TUNA 3TMWA 2Z2FA 1LZRA 1GB5A 5KXPA 4YEMA 1OUHA 1ZVYB 1YANA 4BS7A 4IATA 5HMVA 2F4AA 5L3IA 1IY3A 1LSGA 3OJPA 1XSFA 5FELA 4DD0A 5A3ZA 6LYZA 1KXXA 1GBWA 134LA 1LTMA 3A96A 3D3DA 1WQMA 4MR1A 5HMJA 3WW6A 5I4WA 1G7LC 4HSFA 2I26L 2Q0MX 1JJ1A 4GLVA 1IWTA 5E9RA 1B5XA 1NBYC 1CKCA 1IWVA 1LZ4A 4H8YA 4OWCA 3TXHA 3WXUA 3N9EA 2YBLA 1B7MA 1JSEA 4U3XB 4J7VA 1HEWA 2HEDA 3RT5X 1IR9A 4HTQA 1WQQA 1RFPA 1GWDA 3CT5A 4TSBA 3AW6A 5LYTA 4E3UA 4ZFPA 1JIYA 3KAMA 3LN2A 5I53A 4DC4A 3WXTA 3WVXA 1IP3A 3LYZA 4PGJB 4YOPA 1TAYA 3EBAB 1BB6A 4PHIA 1BB5A 4R0FA 1LZTA 1GXV2 1AT6A 1QSWA 5IELA 3LYTA 1HEPA 3AW7A 3CSRA 2MEIA 4B1AA 4D9ZA 3WL2A 1GB8A 1GFAA 2LYZA 4TSCA 1IC4Y 1CNSA 1B2KA 4IJ4A 1CJ7A 1GFKA 1XGTC 3M18B 1VEDA 5I4XA 4NGOA 1LYYA 1LZAA 1WTNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4EJ4A 3AJNA 3HBDA 2LHMA 4WM6A 4LYZA 1DI4A 153LA 1GF5A 199LA 3DKEX 1L45A 2IHLA 1LLHA 1YAQA 1HELA 171LA 1ZURA 5M1YA 2Z6BA 2B72A 3GUNA 150LA 1DKJA 252LA 1UUZC 3C82A 2BQNA 2HTXA 4LT0A 3GUPA 3TXBA 1CKHA 3V2WA 1BWJA 4NSHA 4DD3A 4HJYA 1UIEA 2LZMA 1YKXX 4YM8A 2RH1A 152LA 180LA 5E4PA 1F6SA 4J1BA 2HEEA 1LOZA 2L78A 4WG7A 2G4QA 2BAAA 3HTDA 4DQJA 2BQFA 1AT5A 165LA 4NGVA 4HTKA 4G4CA 2BQCA 5B1GA 238LA 2EPEA 3GXRA 2BQAA 4J1AA 4N1CC 1LZGA 4NSJA 3SP3A 2BQOA 2D4IA 1YL0X 3B6LA 5LVIA 3HUQA 1WQRA 4H8ZA 2FBBA 1J1OY 1OUFA 1WTMA 4DD2A 4UWUA 2F32A 3A3RX 3W6CA 4N5RA 118LA 2DBTA 2BQLA 1IP7A 1GB0A 3ODUA 3AZ5A 2OTZX 2QB0B 1XJTA 1DZBX 4W51A 2BQBA 1L58A 2IGCA 1L26A 1L87A 168LA 3LZ2A 1I6SA 104LA 1QDTA 1B5ZA 1L95A 1TEWA 3BKHA 1B7SA 1LKRA 1L24A 4OWEA 1H6MA 4IASA 1OVHA 1IEEA 163LA 3TMXA 1GDXA 226LA 2OE7X 1C6AA 1HFZA 231LA 1IOCA 1LMQA 3B0IA 3B72A 3ZEKA 1DPXA 4W58A 5APDA 1CJ6A 137LA 1L10A 5KXRA 1TCYA 1GE4A 3G3XA 2CJLA 1JISA 5LA5A 3AZ7A 3WUMA 1NMMA 1QDRA 129LA 4H9BA 5KXTA 1FBIX 3LHMA 1GF4A 2ZYCA 1G7HC 5KXMA 1D6QA 1HFXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2YBM A;  2BQM A;  1GFV A;  2HEC A;  5L3H A;  1IIZ A;  1HC0 A;  3AJN A;  1J1P Y;  1GFE A;  5D5C A;  4RW1 A;  3HBD A;  1YKZ X;  1RI8 B;  4LYT A;  1FKV A;  4WM5 A;  2DQJ Y;  2BLX A;  2LYM A;  3N9C A;  2LHM A;  1TDY A;  4WM6 A;  1HF4 A;  4LYZ A;  4HV1 A;  1DI4 A;  3J4G A;  3TMU A;  153L A;  1GF5 A;  5DN5 A;  4NEB A;  1OUJ A;  3AZ4 A;  3W6F A;  3ATN A;  3TXF A;  1DQJ C;  1G7I C;  1HEO A;  5FST A;  3A91 A;  5IHG A;  4WM3 A;  1OUB A;  1HEN A;  2IHL A;  1YAQ A;  1HEL A;  2DQE Y;  3WUA A;  3N9A A;  2CGI A;  1JTT L;  4GN4 A;  1LZC A;  1KIQ C;  1LJ3 A;  1IY4 A;  5M1Y A;  1OUA A;  5HQ1 A;  1GF9 A;  4XJH A;  1TBY A;  1IWX A;  1OUE A;  3ATO A;  1DKJ A;  1B7P A;  1UUZ C;  3TXJ A;  2BQN A;  1JKA A;  3ZVQ B;  2HTX A;  4HJZ A;  4LT0 A;  1GBO A;  3WVY A;  3RW8 A;  5FEK A;  1D0M A;  3TXB A;  1CKH A;  4R6C A;  1DXJ A;  1BWJ A;  2PC2 A;  4NSH A;  4CFO A;  4DD3 A;  1EL1 A;  4HJY A;  1UIE A;  1DKK A;  3ZVQ A;  4NHS A;  1YKX X;  2Z19 A;  4YM8 A;  3VWO A;  5L9J A;  4TX7 A;  2H9J A;  5E4P A;  1F6S A;  1JPO A;  4J1B A; 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 1NF5 A;  1UBZ A;  5I4Y A;  1CKG A;  3A8Z A;  3WUL A;  5LXW A;  3W3E A;  5FHW A;  1GE2 A;  4ETE A;  1XEJ A;  2XTH A;  1LSM A;  4Z3M A;  1UA6 Y;  4NG1 A;  4NSI A;  4ML7 A;  4TWS A;  4NWH A;  2H5Z A;  1GBS A;  1YKY X;  2Z12 A;  1I56 A;  1LSY A;  4LT3 A;  4LYM A;  4TUN A;  3TMW A;  2Z2F A;  1LZR A;  1GB5 A;  5KXP A;  4YEM A;  1OUH A;  1ZVY B;  1YAN A;  4BS7 A;  4IAT A;  5HMV A;  2F4A A;  5L3I A;  1IY3 A;  1LSG A;  3OJP A;  1XSF A;  5FEL A;  4DD0 A;  5A3Z A;  6LYZ A;  1KXX A;  1GBW A;  134L A;  1LTM A;  3A96 A;  3D3D A;  1WQM A;  4MR1 A;  5HMJ A;  3WW6 A;  5I4W A;  1G7L C;  4HSF A;  2I26 L;  2Q0M X;  1JJ1 A;  4GLV A;  1IWT A;  5E9R A;  1B5X A;  1NBY C;  1CKC A;  1IWV A;  1LZ4 A;  4H8Y A;  4OWC A;  3TXH A;  3WXU A;  3N9E A;  2YBL A;  1B7M A;  1JSE A;  4U3X B;  4J7V A;  1HEW A;  2HED A;  3RT5 X;  1IR9 A;  4HTQ A;  1WQQ A;  1RFP A;  1GWD A;  3CT5 A;  4TSB A;  3AW6 A;  5LYT A;  4E3U A;  4ZFP A;  1JIY A;  3KAM A;  3LN2 A;  5I53 A;  4DC4 A;  3WXT A;  3WVX A;  1IP3 A;  3LYZ A;  4PGJ B;  4YOP A;  1TAY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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