4WLXA

High pressure protein crystallography of hen egg white lysozyme at 280 mpa
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
publication title High-pressure protein crystallography of hen egg-white lysozyme
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 51
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4wlxA00
1E8LA 4DC4A 2G4QA 2VB1A 1HERA 1OQMA 4TTDA 1REZA 2F2NA 4HJYA 5T3FA 5B1FA 1KXXA 2MEDA 1F6RA 1LMOA 2D4JA 2BLXA 3P4ZA 4NGOA 5LVKA 4NHSA 5KXYA 132LA 1B7NA 1C7PA 1OP9B 4H92A 1TEWA 4HP0A 5APDA 3A90A 1LMQA 5B59A 2BLYA 2BQAA 3TXIA 4NGKA 4NIJA 2F30A 3B0IA 1LMTA 3WU9A 4HTQA 208LA 3W6BA 3T6UA 1GBXA 1GWDA 2YBJA 1CJ6A 4NGJA 1RFPA 4G4HA 3W6EA 1YL1X 2MEFA 4YENA 4DD3A 1KXYA 1LZ8A 1UIEA 3CB7A 4LT1A 3G3BB 2BAAA 2Z37A 3WXUA 4DD9A 4H9IA 4H9HA 1FDLY 1LZ5A 1VDPA 4WM2A 4H90A 3D3DA 1VFBC 1LZ1A 4BADA 1IWXA 5I54A 1CKHA 1LJEA 1F6SA 4WMGA 1A2YC 1YILA 1LSGA 5LA5A 4TSCA 2DBTA 4I0CA 1IP7A 4NFVA 1JIYA 1LZSA 2A7DA 1GB9A 1GB0A 4YM8A 4IASA 4B1AA 4W94A 1GDWA 2CJLA 2D6BA 4OWEA 1B5YA 1BQLY 1JHLA 1YAOA 1I1ZA 5HQ1A 1IC4Y 1GF9A 4NWHA 1LZBA 1LYSA 3WUNA 1LTMA 3CT5A 4GLAA 2LYMA 1LKSA 1HMKA 1HENA 4WG7A 1TAYA 1YROA 5KXPA 3A8ZA 3W3EA 4BAPA 3TMWA 4ANRA 2ZYPA 4OWBA 2DQIY 1RJCB 2YBHA 153LA 4LYCA 4AGAA 4IATA 1C08C 3WH1A 4B4EA 1IOTA 1IWWA 3AB6A 4D9ZA 1QDTA 1V7TA 4GN3A 1BVKC 5JENB 4QDNA 4WLDA 5FEKA 5LYMA 3D9AC 1CJ8A 1UIHA 3N9CA 4NSJA 2Z18A 1JTPL 1LSDA 1LHJA 2GV0A 4DDBA 1DI4A 1GXV2 5C6LA 3A67Y 5II3A 4GCDA 1LJIA 4RW1A 1WQMA 2BQEA 5KXXA 4PPOA 1GFGA 1BB5A 3A96A 1PS5A 1QUSA 4PHIA 1JITA 1GD6A 1JKBA 5I4WA 193LA 3EBAB 1XEKA 1OUIA 1QSAA 1C43A 1EL1A 3WU7A 2HEDA 4KT3A 4NGIA 4DYGA 2XBRA 1VDTA 3WYHA 2XJWA 3B6LA 1OUFA 3A91A 1LYZA 1NDMC 4LYMA 1G7IC 2WARA 2Z19A 1OUBA 4FJRA 1OUDA 4H9CA 5E9RA 3TXKA 5LVHA 2A7FA 3TXJA 4IJ4A 1NKHA 1LJFA 1B7RA 1IY4A 1DI3A 4DDCA 2EKSC 1LYYA 2MECA 1IORA 4NSHA 5FHWA 2XTHA 1LMPA 1QUTA 4NWEA 1GF7A 4LT2A 3BKHA 1IOSA 4LGKA 4H94A 1DZBX 1J1OY 3A94A 3J4GA 4DWXA 1DI5A 154LA 1LZDA 4NGZA 4OWHA 3CSQA 2BQJA 3HBDA 5LIOA 4G4BA 1YAMA 2G4NA 2N5ZA 3WUAA 4XJDA 2ZIJA 3QE8A 4WM3A 7LYZA 2YBMA 3LYOA 2YSSC 1F0WA 1IP5A 1C45A 2DQHY 4LT0A 2H9KA 1LYOA 4HV2A 3KAMA 1ALCA 1HEQA 3FE0A 1IR9A 3LHMA 5HMJA 3WPJA 3AGIA 2DQAA 4PRUA 5KJ9A 4GN5C 4NG1A 2D4KA 2F4GA 4DD0A 4I8SA 2HEEA 5C6JA 2NWDX 3EO5A 3A6BY 1JISA 2YDGA 2DQDY 1HSWA 1XSFA 3F6ZA 1CKCA 6LYTA 5D5FA 1MELL 1BB4A 1LAAA 3E3DA 1LSAA 4N1CC 1G7JC 4X3BA 4XENA 2MEEA 1JSFA 1VAUA 2LYOA 5APFA 4TUNA 2BQNA 1IOQA 1REMA 3IJUA 1LZRA 1VDQA 5E4PA 1BB6A 5LAGA 3CSZA 1GAZA 4MSTA 2HU3A 4J0LA 2G4PA 1UIAA 1HEMA 1LOZA 4N5RA 2W1MA 1UA6Y 2LZ2A 5HNLA 1GE2A 3B0KA 4NHTA 4WLYA 1HEPA 4Z46A 1GF6A 1UACY 4DDAA 3WVXA 5APCA 4HPIA 5DM9A 4NGWA 1GFEA 1JTTL 1YAQA 3WUMA 1ZV5L 1VDSA 1GEVA 3ULRA 1B7LA 1IWVA 4OW1A 1T6VL 4G4CA 1HMLA 1LHKA 2DKVA 2LZTA 2MEBA 2ZQ3A 3A3RX 5A3ZA 1OUAA 4H9BA 1YAPA 2Z38A 4NSIA 1DXJA 1HHLA 1D9UA 2Z2FA 5J7CA 1EQEA 1ZVYB 3B0OA 4GCCA 4YEMA 2Z2EA 5IHGA 5LVJA 2Y8PA 1XGQC 1GBWA 4QGZA 5APEA 1LZGA 2MEIA 1G7HC 1RCMA 1LZ4A 2YBIA 4G49A 2HEAA 2D4IA 2DQJY 4WL6A 3M3UA 4B4IA 1D6PA 1G7MC 5HNCA 3AW6A 1QDRA 3T36A 1LSMA 1GDXA 1GFAA 1KIPC 3W6CA 3WULA 1GB3A 3LN2A 2FYCA 1FLUA 1HC0A 1IO5A 1YL0X 3RW8A 1AT5A 1BWJA 1LJJA 5DN4A 4DD2A 4NGYA 3N9EA 5ILFA 1XGPC 3LYTA 6LYZA 1QIOA 1NBYC 1P2CC 5KY1A 1GE1A 1GFTA 1GPQC 1GE3A 1LJGA 5LA8A 3TMXA 5B05A 5HMVA 2BPUA 1D0MA 1FLYA 1FBIX 3EXDA 3VWOA 1IP1A 1CKFA 2Z12A 1B0DA 4CHXA 4Z3MA 1T3PA 2YBLA 1GFVA 1YKYX 4NGVA 2C8OA 4XADA 4EMNA 1GHLA 2BQMA 1GB6A 1IP6A 4KL7A 4H9EA 1GB5A 4ETDA 3TMVA 1HNLA 3LZ2A 5FELA 4TWSA 5LXWA 4GCEA 1C10A 1O23A 1LPIA 1XEIA 5KKIA 1KXWA 1NBZC 4NEBA 3WU8A 2F4AA 3TXBA 5B1GA 2HTXA 4ET8A 2ZYCA 5IELA 1KIQC 2ZQ4A 5DL9A 5LVGA 3WPKA 4MR1A 3WMKA 1B7SA 4H9AA 1XFPL 1OUEA 2DQFC 4ZEEA 1XGRC 4G9SA 1GBYA 2ZIKA 4KPMA 1CJ9A 4LFPA 3CSRA 2I25L 3WXTA 1BHZA 1ZVHL 4TSBA 1WVUA 3N9AA 1IWTA 1QTKA 4ML7A 1HELA 1OUHA 2DQEY 1H6MA 3P66A 2ZILA 4LFXA 4YEOA 3P65A 3AW7A 4YOPA 3TXDA 1GF3A 4C3WA 2C8PA 4O34A 1LZYA 1WQOA 1UBZA 4NY5A 1RE2A 2CWIA 2ZWBA 3HBEX 1IR7A 1SLYA 1W6ZA 2BQBA 1DQJC 1I56A 2HUBA 1W08A 3AZ4A 5EBHA 3CT0A 3MGWA 3QY4A 1OUCA 4H1PA 3B72A 1NDGC 1IY3A 1B7OA 5KXRA 4DD1A 1JJ0A 1UCOA 4OOTA 3TXGA 1GFHA 1GB2A 4LYOA 5L3IA 3A93A 5I4YA 4N9RA 1IEEA 4YF2A 4RLMA 3SP3A 4HTNA 1LSYA 1GF5A 1LZ9A 5IDDA 2BQGA 1B5ZA 1UIGA 4WLTA 2FBDA 4KXIA 1IOCA 1YKZX 1LJNA 4BAFA 3QNGA 1UICA 4NG8A 1UIDA 5I5QA 4DD7A 1LMAA 3AZ7A 1LSZA 1GF4A 1IP2A 4MCKA 2Z39A 1IIZA 3ATNA 1CKDA 4LZTA 4L41A 4OWAA 4PRQA 4WO9A 4WL7A 1OUGA 4NSGA 2BQIA 1LJ3A 4RLNA 5FSTA 3G3AB 4H93A 5LVIA 1IX0A 4A7DA 1QSWA 1WTNA 5KXTA 1IC5Y 135LA 2DQCY 5L9JA 1B9OA 1LJHA 2HEBA 2X0AA 1WTMA 5LAFA 1LHLA 1GBSA 4XJBA 3RU5A 4C5FA 1LZTA 4NGLA 4CFOA 2MEGA 8LYZA 1JJ1A 1LZAA 4Z98A 4ETBA 1NMMA 1VEDA 4N1EI 4W96A 1AM7A 2BQLA 1WQQA 1JKDA 1FKQA 1PZYA 2HECA 3AYQA 134LA 1GXXA 1SQ2L 1TBYA 4OOOA 1B5WA 3A3QA 3RT5X 4XJFA 3AGGG 3LYZA 2H5ZA 3RZ4A 3TXEA 1IWZA 1NQIA 1GE4A 2FBBA 1BB3A 4PGJB 2YVBA 2Q0MX 1GAYA 1XGUC 5FDJA 1DPXA 4U3XB 4RW2A 1AKIA 1HEWA 4CFPA 5F14A 1WQNA 4B49A 3WW6A 3W6FA 1LZ6A 3AGHA 4HV1A 5D5CA 1EQ4A 4E3UA 2I26L 4H8XA 4TX7A 1GFKA 1HFYA 1J1PY 2ZNWY 5B06A 5HLLA 1GFRA 3WVYA 3WL2A 2BQHA 1QTEA 2BQOA 3K3TA 3OJPA 1WQRA 5DN5A 1CNSA 1RI8B 2CDSA 4UWVA 3OK0A 1CKGA 1ZMYL 4H8ZA 1MLCE 1NWGA 1KIRC 1LZEA 3IWRA 4ZFPA 1B5UA 2YBNA 1YQVY 4CJ2A 2ZNXY 4GCBA 4Z41A 3LZTA 5LYTA 1GF8A 4WO6A 1JKAA 1J1XY 4NHPA 4WM6A 1GEZA 1CJ7A 1IC7Y 1UC0A 2EQLA 1DKKA 2HU1A 4UWNA 1IP4A 3AZ6A 1DKJA 4XJHA 5B07A 5FCPA 2BQDA 1Z55A 4H91A 1JPOA 1YKXX 3WPLA 1LJKA 1IP3A 4H8YA 4DT3A 1N4FA 1QQYA 4N0JA 2BQFA 3WW5A 1LJ4A 1UIFA 1FLWA 3FI7A 1LHIA 1HEOA 5M1YA 3LYMA 194LA 2IHLA 4WM5A 1TCYA 5F16A 4ET9A 5DLAA 1LSFA 4HSFA 1IR8A 3TXFA 3A92A 4LYTA 3IJVA 4HJVA 1JKCA 5KKJA 1GBZA 3ZVQA 1WQPA 1LSEA 5KXNA 1HF4A 5LYZA 5I4XA 5KXZA 3AJNA 1XEJA 2D91A 1UUZC 1VATA 4WG1A 1B5XA 3GXKA 4LYZA 4HTKA 9LYZA 3W6AA 4R6CA 2AUBA 1DPWA 4AXTA 3CT1A 5KXSA 3ZEKA 1FKVA 4HPEA 5L3HA 1HSXA 4R0FA 2W1XA 1GF0A 4GCFA 1OUJA 1NF5A 1JTOL 1WVVA 1LCNA 5AMYA 4GN4A 5C6IA 2LYZA 3TXHA 1V7SA 5LINA 1GFUA 5ILCA 3HFMY 4ZIXA 1GE0A 4EOFA 1BWIA 2LHMA 3ZVQB 1LSPA 2H9JA 1BWHA 207LA 4J7VA 1UIBA 1GFJA 1FLQA 4II8A 3TMUA 1JUGA 2PC2A 1LHMA 3M18B 2EIZC 5KXOA 5K7OA 4B4JA 2W1YA 1BB7A 1B2KA 4QEQA 1D0KA 4NHQA 133LA 5F9UA 1H87A 1FN5A 1REXA 2IFFY 4WLXA 1REYA 1A4VA 4FDYA 5I53A 2B5ZA 1D6QA 4XN6A 5KXWA 4GLVA 4LT3A 1BGIA 5KXKA 1LHHA 2EPEA 1IVMA 1B5VA 2BQCA 1GB7A 4BS7A 4J1AA 3HBHA 1B7MA 1LMCA 4WM1A 4HJZA 1IWYA 4N8ZA 3AZ5A 2FYDA 4UWUA 4M4OA 4NHIA 1BVXA 3EMSA 3ATOA 4RDSA 5KXLA 1IWUA 1JSEA 3W6DA 1AZFA 4ETAA 1AT6A 2W1LA 1INUA 3J6KA 4CGEA 5F9XA 2CGIA 4OWCA 3CQLA 1LSBA 1LSCA 1NHEA 3A34A 1JEFA 2I6ZA 1LSNA 2BQKA 2MEHA 1LZNA 3A95A 4XYYA 5A3EA 1C46A 1EQ5A 1I20A 5KXMA 1JWRA 1HFXA 1YANA 4XJIA 4M6DA 3A6CY 2HEFA 1HFZA 1F10A 1XGTC 2DQGY 4H9FA 4XJGA 3BKVA 1D0LA 3P64A 4WM4A 3RNXA 1GB8A 2XBSA 4ETEA 1LZCA 1B7PA 1YIKA 1LMNA 3P68A 3GXRA 2MEAA 1TDYA 4P2EA 1LKRA 1G7LC 1B7QA 1GBOA 2RSCA 4J1BA 5F81A 4B0DA 4QY9A 4ETCA 4LYBA 4PJ2C 1JJ3A 4WOAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DC4A 2D4JA 1LMOA 2BLXA 4NHSA 5KXYA 1B7NA 4H92A 1DYGA 5APDA 3EMLA 1D3JA 4NIJA 3WU9A 3W6BA 4G4HA 4YENA 1KXYA 4DAJA 2Z37A 2RB0X 4BADA 4WM2A 4H90A 3D3DA 1LZ1A 1IWXA 1CKHA 4YX7C 1IP7A 1JIYA 1GB9A 1L48A 1XEPA 4W94A 4ARLA 2D6BA 4OWEA 1B5YA 1L88A 4NWHA 3WUNA 1LZBA 1LYSA 3FA0A 3CT5A 4ARQA 4GLAA 2LYMA 1CV4A 1HENA 5KXPA 3W3EA 1KY0A 1DYDA 3GULA 4OWBA 4LYCA 4AGAA 4IATA 3WH1A 162LA 4D9ZA 1QDTA 1BVKC 4QDNA 201LA 219LA 3SB8A 213LA 3D9AC 1UIHA 2Z18A 1L97A 1LSDA 1JTMA 1GXV2 3A67Y 218LA 2RB2X 1L26A 1GFGA 1BB5A 1PS5A 1GD6A 1QSAA 4KT3A 4NGIA 1QS9A 3HH3A 1VDTA 3WYHA 3A91A 1NDMC 3L64A 1G7IC 2Z19A 5E9RA 1C6KA 191LA 1L59A 196LA 1LYYA 3HU8A 3BKHA 1L79A 3A94A 3J4GA 4DWXA 1DI5A 3CSQA 3DNAA 5LIOA 2NTGA 4XJDA 2ZIJA 7LYZA 2YBMA 1QUDA 2H9KA 1L91A 7LZMA 3FE0A 1IR9A 5HMJA 1DYBA 4GN5C 2D4KA 2F4GA 206LA 2YDGA 2DQDY 1CKCA 1MELL 3E3DA 1LSAA 1G7JC 2MEEA 2LYOA 4YXCA 1L0KA 2B6YA 1LZRA 1VDQA 104LA 5E4PA 5LAGA 4EXMA 1HEMA 5HNLA 4WLYA 1L0JA 3DN6A 1PQOA 4Z46A 4DDAA 1CU6A 1D3NA 1L15A 1B7LA 4OW1A 1LHKA 2LZTA 5A3ZA 1OUAA 2Z38A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1E8L A;  4DC4 A;  2G4Q A;  2VB1 A;  1HER A;  1OQM A;  4TTD A;  1REZ A;  2F2N A;  4HJY A;  5T3F A;  5B1F A;  1KXX A;  2MED A;  1F6R A;  1LMO A;  2D4J A;  2BLX A;  3P4Z A;  4NGO A;  5LVK A;  4NHS A;  5KXY A;  132L A;  1B7N A;  1C7P A;  1OP9 B;  4H92 A;  1TEW A;  4HP0 A;  5APD A;  3A90 A;  1LMQ A;  5B59 A;  2BLY A;  2BQA A;  3TXI A;  4NGK A;  4NIJ A;  2F30 A;  3B0I A;  1LMT A;  3WU9 A;  4HTQ A;  208L A;  3W6B A;  3T6U A;  1GBX A;  1GWD A;  2YBJ A;  1CJ6 A;  4NGJ A;  1RFP A;  4G4H A;  3W6E A;  1YL1 X;  2MEF A;  4YEN A;  4DD3 A;  1KXY A;  1LZ8 A;  1UIE A;  3CB7 A;  4LT1 A;  3G3B B;  2BAA A;  2Z37 A;  3WXU A;  4DD9 A;  4H9I A;  4H9H A;  1FDL Y;  1LZ5 A;  1VDP A;  4WM2 A;  4H90 A;  3D3D A;  1VFB C;  1LZ1 A;  4BAD A;  1IWX A;  5I54 A;  1CKH A;  1LJE A;  1F6S A;  4WMG A;  1A2Y C;  1YIL A;  1LSG A;  5LA5 A;  4TSC A;  2DBT A;  4I0C A;  1IP7 A;  4NFV A;  1JIY A;  1LZS A;  2A7D A;  1GB9 A;  1GB0 A;  4YM8 A;  4IAS A;  4B1A A;  4W94 A;  1GDW A;  2CJL A;  2D6B A;  4OWE A;  1B5Y A;  1BQL Y;  1JHL A;  1YAO A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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