4WLYA

High pressure protein crystallography of hen egg white lysozyme at 380 mpa
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High-pressure protein crystallography of hen egg-white lysozyme
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
total genus 54
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2014-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4wlyA00
4WM4A 3WVXA 5KXOA 1IWZA 1LKSA 1GFKA 1F10A 2YDGA 1DI5A 4HTKA 3AW7A 3P68A 4NWHA 2XBRA 1CJ8A 1IIZA 2D4KA 5FDJA 4XJIA 1DI4A 5F9XA 4NGVA 1LSNA 1VATA 3TXDA 1C45A 3W3EA 1HNLA 3RT5X 4H9AA 1HFXA 4J0LA 1LHHA 208LA 4KPMA 1GFTA 1IO5A 3A94A 3AZ4A 5FHWA 1F6RA 5LA5A 1HFZA 3A90A 4Z46A 1CKDA 3WXTA 2YBMA 5B1FA 2ZQ4A 3B0OA 3LN2A 3N9CA 4HV2A 3RU5A 3G3BB 1IP6A 4UWNA 4E3UA 3WUAA 1I1ZA 4TX7A 3TXKA 2BQAA 1HEPA 1GFRA 1GF4A 2BQCA 1YKZX 1RJCB 2IFFY 1QUSA 4KL7A 4BADA 2Z38A 4OWCA 1GFUA 3CT5A 1LZSA 5KXSA 1PS5A 1D6PA 1JITA 1LSYA 4P2EA 1B5UA 3IJUA 1YL0X 1AM7A 1IOSA 4B4JA 1B7NA 2C8PA 3LYZA 1GE0A 1UC0A 1GBOA 4WG7A 1B5WA 3TMWA 1TDYA 2LYZA 1YILA 4GN4A 1GXXA 3LYOA 4PRUA 4WLTA 1IVMA 4YEOA 4LFXA 3WUMA 2ZYPA 132LA 1IOCA 1FLUA 4G4BA 5LVIA 1DXJA 1AT5A 4NHIA 1BB4A 2HU1A 5LXWA 1BWJA 5B06A 1LHLA 1GB8A 4X3BA 4LYCA 5LVHA 1TBYA 4WLDA 1G7JC 2BQNA 3TXJA 1LAAA 4WLXA 8LYZA 1IWYA 1GB7A 1ZV5L 4ETDA 2X0AA 5HMVA 4B4IA 5FELA 3B0IA 5KXMA 1D0LA 5KXNA 3ZEKA 1LZ5A 3N9EA 2CWIA 4XJFA 4PJ2C 3LZ2A 1GFHA 1LSBA 4ET8A 2Z2EA 5A3ZA 2W1LA 1QTEA 5APEA 2F2NA 1NBYC 1ALCA 1GAZA 1KIRC 3T6UA 3HBDA 2ZIJA 1CKFA 1CJ6A 4IATA 4H93A 1LZBA 3W6FA 2YBLA 2DQAA 3EO5A 4DDCA 4XENA 4WM6A 5C6LA 2MEIA 2ZQ3A 2DBTA 1Z55A 4NG1A 2LHMA 3A67Y 5FSTA 1BWIA 4RLNA 2EKSC 1NDMC 1GF8A 1HHLA 1IY3A 1LSZA 5KY1A 3VWOA 3M3UA 1D0KA 5M1YA 1B7LA 3CSZA 3AGHA 1J1PY 2W1YA 1OUEA 4DC4A 2F4GA 2H5ZA 2I6ZA 2A7FA 1HEMA 1LJNA 4UWVA 1AZFA 5B07A 1WQMA 3EMSA 5ILCA 3A3QA 1QDRA 1OP9B 4DWXA 1ZVYB 1LZ9A 4DD0A 1LMTA 2H9KA 4LZTA 5HMJA 2XBSA 1I56A 1RCMA 1IP4A 3M18B 1LJEA 2BQEA 1LHMA 5LAGA 3GXRA 1XEJA 4LT1A 1UIAA 4B0DA 1TAYA 1C10A 5C6IA 1JKDA 1LJ3A 3ZVQA 3WVYA 4WM5A 1IORA 4DD1A 1EQ5A 4R6CA 1YKYX 4PRQA 1GF5A 3MGWA 4CGEA 1LJ4A 2AUBA 3A6BY 5LA8A 1BB7A 4D9ZA 5JENB 2Z19A 3WXUA 1KXWA 4G4CA 3WW5A 1CJ9A 3WU9A 4L41A 1IC7Y 1JISA 1HMKA 1YQVY 1LJJA 2BQKA 4H9EA 4OWAA 4II8A 5LVJA 7LYZA 1QDTA 2MEBA 2XTHA 1IWUA 1JSEA 4ML7A 4NSGA 4NHQA 2BLYA 4OW1A 2Z39A 4EMNA 1XGPC 3A92A 5KXRA 1EQEA 1RFPA 3EBAB 1LMPA 4WM3A 4XADA 3AYQA 1B9OA 4MCKA 2HEEA 4PPOA 5I54A 1G7HC 1QTKA 4LYMA 5I4YA 4NIJA 5DM9A 4OWBA 4Z98A 1GD6A 3WYHA 4KT3A 1WQOA 1OUDA 3AJNA 1GF6A 2HU3A 4NGLA 5K7OA 1W08A 1YAOA 2NWDX 4B4EA 1GB0A 1LMAA 1UIBA 1HF4A 1XFPL 1BGIA 1GWDA 1GE3A 2BQFA 1GBYA 1P2CC 2DQGY 1OQMA 3A95A 3B0KA 1CJ7A 5AMYA 3IJVA 1REXA 4UWUA 1WTNA 5KKJA 1GEZA 2BQGA 1LZ1A 1NHEA 4NGZA 5KXPA 1OUGA 1BVKC 1B7OA 2MECA 4NGWA 1HC0A 1C7PA 4DD3A 2D6BA 1HSXA 1GB3A 5KXTA 1B5VA 3W6CA 1IP2A 4NGKA 2YBHA 3CT0A 4TTDA 1B7SA 1NBZC 1FN5A 2DQHY 4WMGA 5KXKA 1GF9A 1LJGA 1HFYA 1GBZA 1OUJA 4BS7A 4WOAA 1HERA 1JTTL 1UIHA 4DDBA 4I0CA 4DD2A 1WQRA 4TSBA 1LMCA 1LSEA 1WQQA 2Z18A 3WPKA 1XEIA 4NGOA 1LYYA 1LSAA 1E8LA 1H6MA 4WO9A 1FLWA 1LTMA 3LYMA 1VDQA 4HPEA 5KKIA 1UUZC 1TCYA 1LPIA 193LA 1YL1X 4H94A 2CGIA 3BKHA 3TXFA 3WW6A 4ZFPA 1F6SA 1IEEA 1LSCA 1F0WA 5B1GA 3QY4A 1LZNA 3KAMA 3A34A 1LHKA 5A3EA 1G7IC 3AZ5A 5I4WA 1JKCA 1HMLA 1AKIA 3WU7A 1JKAA 1IC4Y 3W6AA 2DQFC 1FLYA 1LYZA 3W6DA 5E9RA 1GB2A 4IJ4A 4NGJA 1HELA 3TMVA 1B2KA 1LSDA 4DD9A 1GE4A 2YBJA 2FYDA 3ULRA 1REYA 3CB7A 3TXGA 2HEAA 2HEDA 4LT0A 1HEWA 1A4VA 4W94A 4H1PA 4TUNA 4GCBA 4XYYA 5DN4A 2B5ZA 1EQ4A 1IOQA 1DI3A 4J7VA 4N0JA 1VDSA 4PGJB 1JJ0A 1JPOA 2BQIA 3TXEA 1YKXX 1IR8A 2YBIA 1XGQC 4GLVA 5LAFA 1YAPA 4YENA 2Z2FA 2BQLA 4GCEA 1HEOA 1LJFA 4OWEA 4CFPA 4BAPA 1DKKA 3CSQA 4XN6A 4NGYA 4ETEA 1BWHA 6LYZA 1UIDA 4IASA 3W6EA 3D3DA 4LT3A 4B1AA 1JEFA 2XJWA 2MEDA 2MEFA 4HSFA 5E4PA 3A96A 3BKVA 1G7LC 3WULA 2D4JA 1RI8B 1JJ3A 3W6BA 1VAUA 1BB5A 4H9IA 1LSGA 1LZTA 2Z12A 4H9FA 5APFA 4GCCA 5KXLA 4YF2A 1WTMA 1KIQC 3WPJA 3LZTA 1GFJA 2FBDA 1BHZA 1B5XA 2HTXA 4LYBA 2ZIKA 4FJRA 4M6DA 1GBWA 2ZYCA 1MLCE 9LYZA 4GLAA 4OOOA 1UA6Y 1T3PA 5EBHA 153LA 1GDWA 1UBZA 1EL1A 3P4ZA 1GB9A 4H8XA 1GF0A 3RW8A 4CHXA 1D9UA 4XJGA 3QNGA 1I20A 207LA 1LZ8A 3B72A 1ZVHL 1HSWA 2N5ZA 3A6CY 1LZ4A 4Z41A 1INUA 1LSFA 4TSCA 1DQJC 2ZILA 3QE8A 5D5FA 1MELL 4GN5C 1GEVA 1LMNA 1IWWA 1NKHA 1AT6A 3CSRA 4NY5A 4DDAA 4M4OA 5FEKA 1DPXA 1GAYA 1IY4A 1FKQA 1WVVA 1OUHA 3TXIA 4DYGA 1IWXA 2ZNXY 4MSTA 5I5QA 5IDDA 1NDGC 2DQIY 1JJ1A 1GDXA 1LMQA 2DKVA 3A91A 4HV1A 4O34A 1GE2A 3J6KA 1IC5Y 1GFAA 4N1CC 5B59A 2YVBA 135LA 4CFOA 3AGGG 3T36A 1LSMA 4J1AA 1WVUA 1O23A 2MEHA 4H9BA 4NSJA 2CJLA 1ZMYL 4NEBA 3TXHA 4AXTA 6LYTA 5B05A 3F6ZA 1FBIX 1T6VL 4GCDA 4HJZA 5DN5A 1LZAA 4WO6A 133LA 4GCFA 1NQIA 3P65A 4YEMA 3TMXA 4ZEEA 1GBSA 1HENA 3AZ7A 4XJDA 4YM8A 1B7RA 1LYOA 1UICA 1GXV2 1D6QA 1XGRC 4H9HA 2F4AA 4NG8A 1GF3A 4DD7A 3G3AB 2LYOA 4XJHA 1JKBA 5L3HA 1IP7A 3TXBA 1BVXA 1C08C 3P66A 4ANRA 1IP1A 2EQLA 4AGAA 1OUBA 4WL6A 4G4HA 5HQ1A 4WG1A 4H9CA 4C5FA 3LYTA 2MEGA 1LZCA 4OWHA 4J1BA 3HBEX 1OUAA 4N5RA 2Y8PA 5F14A 5T3FA 4H90A 1LOZA 1GFVA 3GXKA 1LCNA 2EPEA 2W1MA 3HBHA 4LFPA 1GHLA 1J1XY 2DQCY 2LZTA 3WPLA 2A7DA 4ET9A 3CQLA 1IR9A 4QY9A 2C8OA 1JUGA 2I25L 4H91A 3A3RX 4H8ZA 1GBXA 2FYCA 2DQJY 4OOTA 4N1EI 2RSCA 5LINA 1CKHA 4A7DA 1KIPC 1JIYA 1VDPA 3AGIA 5KXWA 2BQHA 2LZ2A 2PC2A 5APCA 154LA 4TWSA 2HEFA 5I53A 3EXDA 2BPUA 1QUTA 2BAAA 1CNSA 1YAQA 1NF5A 3WL2A 3ATNA 1UCOA 5D5CA 1N4FA 1IP5A 4C3WA 4NHSA 2D4IA 1B0DA 5KJ9A 1IWTA 1OUCA 1LHJA 2DQDY 4RLMA 1QQYA 4HTQA 2CDSA 3TMUA 1XEKA 1GFGA 5LIOA 2I26L 3AB6A 3HFMY 1GPQC 1VFBC 2Z37A 134LA 1CKGA 3WMKA 2YBNA 5LYMA 3A8ZA 3WH1A 2H9JA 1LJKA 3IWRA 3OJPA 3D9AC 5DLAA 5I4XA 4WM1A 4W96A 4ETCA 1W6ZA 5F16A 1G7MC 1BB6A 1QSWA 194LA 1B5YA 2HEBA 4R0FA 4RW2A 4NWEA 4G9SA 4G49A 3SP3A 2DQEY 1PZYA 1D0MA 3E3DA 4H92A 1B7MA 1GE1A 2LYMA 5IHGA 2W1XA 1QSAA 1LZYA 2ZNWY 2G4QA 1DZBX 1DKJA 1KXYA 5LYZA 3RZ4A 1LJHA 4LYTA 4N9RA 3LHMA 4WL7A 1FLQA 1LZEA 1J1OY 2FBBA 1LSPA 5F81A 4NSIA 4MR1A 4PHIA 1IWVA 1V7SA 1XSFA 1B5ZA 4RW1A 2Q0MX 3FI7A 5FCPA 1LJIA 1YANA 1NMMA 1XGTC 1LZDA 3A93A 4QGZA 4LGKA 4EOFA 4NHTA 2BQBA 1H87A 5KXZA 4N8ZA 4WM2A 5F9UA 5II3A 2D91A 1JSFA 5ILFA 3CT1A 1GF7A 1YIKA 1UACY 2HUBA 3OK0A 5LVKA 5C6JA 4ZIXA 5KXXA 2VB1A 1QIOA 1FKVA 4CJ2A 5J7CA 1WQPA 2BQOA 1TEWA 1BB3A 4FDYA 1LMOA 3N9AA 1SLYA 2BLXA 4LYOA 3RNXA 1BQLY 3WU8A 3ATOA 5L9JA 1DPWA 5KXYA 3ZVQB 1WQNA 3WUNA 1GB6A 1C46A 5HLLA 4QDNA 2WARA 4I8SA 1GFEA 4NFVA 5DL9A 1LZRA 1XGUC 3AZ6A 2G4NA 5L3IA 2F30A 1LZ6A 1UIEA 2HECA 1C43A 4ETAA 5HNLA 1IOTA 3K3TA 4WLYA 4Z3MA 4LT2A 1HEQA 4BAFA 1REMA 2YSSC 4LYZA 1UIFA 2MEEA 4B49A 4RDSA 1FDLY 1LKRA 1YROA 3AW6A 2MEAA 3P64A 1YAMA 4HJYA 1OUIA 5HNCA 5APDA 4ETBA 1JHLA 1GB5A 1SQ2L 1VEDA 1IR7A 1UIGA 1IP3A 2EIZC 4NGIA 4NSHA 4XJBA 2G4PA 5IELA 1LZGA 1OUFA 1RE2A 2ZWBA 1LHIA 1B7PA 4QEQA 2IHLA 4YOPA 3J4GA 4H8YA 3B6LA 1VDTA 4HTNA 4HPIA 1JTOL 1JWRA 1LYSA 1V7TA 2BQDA 1B7QA 1A2YC 2GV0A 1KXXA 4KXIA 4NHPA 3FE0A 1JTPL 1NWGA 2BQJA 4U3XB 4DT3A 1CKCA 4HP0A 4GN3A 2BQMA 1IX0A 5LVGA 5LYTA 4HJVA 1REZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WVXA 1GFKA 1F10A 1SX7A 3AW7A 4XJIA 1L61A 1LSNA 3LZMA 1C45A 1L51A 225LA 4H9AA 4J0LA 1P56A 208LA 3C7ZA 5LA5A 3AZ4A 1F6RA 3A90A 4Z46A 3LN2A 3RZEA 261LA 231LA 3SB8A 1GF4A 2BQCA 4I7SA 1YKZX 4I7MA 1RJCB 2IFFY 4KL7A 4BADA 3HH3A 4OWCA 1PS5A 1D3MA 1L75A 1B7NA 3LYZA 1GE0A 3HTBA 1UC0A 2Q9DA 3TMWA 1C62A 1XEPA 4LFXA 5LVIA 5LXWA 4NHIA 1AT5A 3CDOA 2HU1A 1KS3A 1L69A 5B06A 1LHLA 3HTGA 1L34A 2BQNA 1IWYA 4ETDA 3HH6A 5HMVA 4B4IA 3N9EA 2CWIA 1L01A 3LZ2A 2A4TA 4ET8A 5A3ZA 2W1LA 2ANXA 201LA 3HBDA 1PQIA 2HUKA 2YBLA 4DDCA 2MEIA 2ZQ3A 4NG1A 107LA 1CUPA 4RLNA 1QUGA 2EKSC 1KY1A 1L84A 3AGHA 2W1YA 1HEMA 3A3QA 1LZ9A 1LMTA 1P37A 1RCMA 1L11A 1LJEA 1ZURA 4B0DA 1C10A 1L58A 235LA 3ZVQA 164LA 1G0JA 4EKPA 4CGEA 2AUBA 3A6BY 5LA8A 1BB7A 113LA 1KXWA 4G4CA 1C67A 161LA 1CJ9A 4L41A 1QT6A 1LJJA 2BQKA 7LYZA 1LYDA 2MEBA 1IWUA 1JSEA 4NSGA 4NHQA 1L98A 3A92A 1RFPA 187LA 4KT3A 1OUDA 1L57A 1W08A 1GB0A 176LA 216LA 1CU5A 3OE0A 1GWDA 2DQGY 1OQMA 3FI5A 3DMVA 1QS5A 1L83A 3SBBC 1CV1A 5KKJA 2BQGA 1LZ1A 1BVKC 1CV0A 1B7OA 1CV3A 1DYGA 1GB3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4WM4 A;  3WVX A;  5KXO A;  1IWZ A;  1LKS A;  1GFK A;  1F10 A;  2YDG A;  1DI5 A;  4HTK A;  3AW7 A;  3P68 A;  4NWH A;  2XBR A;  1CJ8 A;  1IIZ A;  2D4K A;  5FDJ A;  4XJI A;  1DI4 A;  5F9X A;  4NGV A;  1LSN A;  1VAT A;  3TXD A;  1C45 A;  3W3E A;  1HNL A;  3RT5 X;  4H9A A;  1HFX A;  4J0L A;  1LHH A;  208L A;  4KPM A;  1GFT A;  1IO5 A;  3A94 A;  3AZ4 A;  5FHW A;  1F6R A;  5LA5 A;  1HFZ A;  3A90 A;  4Z46 A;  1CKD A;  3WXT A;  2YBM A;  5B1F A;  2ZQ4 A;  3B0O A;  3LN2 A;  3N9C A;  4HV2 A;  3RU5 A;  3G3B B;  1IP6 A;  4UWN A;  4E3U A;  3WUA A;  1I1Z A;  4TX7 A;  3TXK A;  2BQA A;  1HEP A;  1GFR A;  1GF4 A;  2BQC A;  1YKZ X;  1RJC B;  2IFF Y;  1QUS A;  4KL7 A;  4BAD A;  2Z38 A;  4OWC A;  1GFU A;  3CT5 A;  1LZS A;  5KXS A;  1PS5 A;  1D6P A;  1JIT A;  1LSY A;  4P2E A;  1B5U A;  3IJU A;  1YL0 X;  1AM7 A;  1IOS A;  4B4J A;  1B7N A;  2C8P A;  3LYZ A;  1GE0 A;  1UC0 A;  1GBO A;  4WG7 A;  1B5W A;  3TMW A;  1TDY A;  2LYZ A;  1YIL A;  4GN4 A;  1GXX A;  3LYO A;  4PRU A;  4WLT A;  1IVM A;  4YEO A;  4LFX A;  3WUM A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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