4XYYA

Hen egg-white lysozyme (hewl) complexed with zr(iv)-substituted keggin-type polyoxometalate
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Characterization of the Complex between Hen Egg-White Lysozyme and Zr(IV) -Substituted Keggin Polyoxometalate as Artificial Protease.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2015-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4xyyA00
1DKKA 5HLLA 3T6UA 1D0MA 1FLUA 4H9CA 1WQMA 3QNGA 1LSGA 3W6FA 1IP7A 2XBRA 2CGIA 1GE4A 1HELA 1RE2A 4H91A 4H9IA 1W08A 4G9SA 4RW2A 5LVGA 1LZDA 1YAQA 4DWXA 1QTKA 2D4KA 4NGOA 5I4WA 1YL0X 2F4GA 3WVXA 4B4EA 4GLVA 4DD2A 4TSBA 1V7TA 3AYQA 1LZ1A 2FYCA 1VFBC 1IWVA 2Y8PA 3CT0A 4OWHA 4WM6A 4B4IA 1B7LA 2D91A 3TMVA 1IP4A 1G7IC 4H9BA 1BWJA 2G4QA 4LYBA 1AKIA 3QY4A 4EMNA 1TBYA 3EXDA 3A90A 4YF2A 2F2NA 1GAZA 1B5YA 3GXRA 1AZFA 3B72A 1LZ8A 1YAPA 5I4YA 2Z37A 4WLXA 3LYZA 1BWHA 1ALCA 3EMSA 1LJJA 4GN4A 4UWVA 1IX0A 2HEEA 1LJHA 5FHWA 1XEJA 2MEAA 1LSYA 1MLCE 1XEIA 5LYZA 5LYMA 2Z39A 1G7LC 2D6BA 2DQDY 4WG7A 1A2YC 4WL7A 4N0JA 5D5FA 5T3FA 2HU1A 3ZVQB 3CSZA 5KJ9A 3RW8A 1HMKA 1LZTA 4WM2A 1JSEA 5KXYA 5HNLA 3A6BY 4Z46A 4WO6A 3J4GA 1BHZA 1HNLA 1LMQA 1G7HC 1I56A 3LZTA 1LZSA 2CWIA 3A92A 4TX7A 1YKXX 4WL6A 2YVBA 1D0LA 3N9CA 4NSJA 5I5QA 1LSZA 1REYA 1F6RA 1GFVA 4MR1A 1VATA 1IP1A 4NGKA 4ETBA 1HSWA 1LPIA 1B7RA 5AMYA 1LHJA 1GBWA 4NHPA 1IVMA 1HERA 4ET9A 1ZMYL 4J7VA 132LA 2ZILA 1QIOA 1BB6A 1HMLA 4H8ZA 5KXMA 5L9JA 4YEOA 4AGAA 5FDJA 3D3DA 5IELA 2LZTA 2IHLA 1LSAA 1LZYA 1FN5A 1JKDA 4G4BA 1QUSA 1BB3A 2DQFC 2F30A 4P2EA 4FJRA 3ATNA 1REXA 4OW1A 1JISA 1GFUA 1GFJA 1FLYA 5KXLA 1DPXA 4HTKA 2BLYA 1HEMA 2BAAA 4G49A 2D4JA 4HJZA 5FSTA 3TMXA 1IP5A 3LZ2A 4I8SA 4EOFA 1DXJA 2YBIA 1ZVHL 4NSIA 4ETDA 1OUGA 1YAOA 3WYHA 2VB1A 4DDAA 1LYSA 1GFTA 1IIZA 1YL1X 3AW7A 5KKJA 4UWNA 3W6AA 2D4IA 3A6CY 4PJ2C 1GB8A 5B1FA 4H9EA 1LHHA 1GF0A 2EQLA 5KKIA 3T36A 1B5XA 3M18B 1SLYA 4H9AA 2BQNA 2BLXA 4G4CA 1F0WA 2EPEA 4GLAA 4NGYA 1IEEA 1GEVA 2W1XA 1AT6A 2ZQ3A 5I4XA 3J6KA 1OUCA 1WTMA 1LSCA 2BQOA 4ETAA 4D9ZA 4NHTA 1GFKA 3W6CA 5IHGA 4XENA 2BQMA 1JHLA 5M1YA 1OUBA 5FEKA 3RT5X 4A7DA 1B7NA 1IWXA 1XSFA 2H5ZA 2I25L 3TMUA 2XBSA 4NGWA 3WW5A 4N1EI 5HNCA 1FLQA 3HBDA 4J0LA 5LIOA 2YBNA 4H90A 5C6JA 1DPWA 1CKHA 1GE0A 4RDSA 4BAPA 2A7FA 2DKVA 4NIJA 3A3RX 1CJ8A 1GB2A 4XJFA 5IDDA 4GCBA 8LYZA 1RJCB 4NY5A 1QSAA 2MEBA 4WG1A 5D5CA 3A94A 2CDSA 1LMOA 2RSCA 4ETEA 3A96A 4CFOA 1KXYA 5ILCA 1B7PA 4ZFPA 1UIBA 4ML7A 5HMVA 2W1MA 4XADA 3WW6A 1OUAA 1LYZA 1LJFA 1J1PY 1HENA 3AGIA 1LZ9A 3WL2A 4DD9A 1QDRA 1BQLY 3LYOA 4LYMA 3BKHA 1LMTA 4IJ4A 7LYZA 1LSBA 2LHMA 1YIKA 1NF5A 5II3A 1C46A 4O34A 1B7MA 1GDXA 207LA 2C8PA 1GPQC 3B0OA 4R0FA 5DN5A 5L3IA 4XJGA 1V7SA 1VDQA 3P65A 4LFXA 2LZ2A 4GN5C 3TXKA 1LTMA 1SQ2L 4HV2A 4GCCA 5KY1A 1HSXA 4CJ2A 1B7OA 4RW1A 3WXUA 6LYTA 2IFFY 1LHKA 3P4ZA 4H1PA 4YM8A 1JSFA 4B1AA 153LA 3EO5A 3GXKA 4WM3A 2Z2EA 1HFZA 1ZVYB 3A34A 4TSCA 1JTPL 1LZBA 1YILA 193LA 133LA 1EQ4A 1GB3A 4R6CA 1IR8A 4NHQA 1IC4Y 1T3PA 1T6VL 1LJ4A 1WVVA 1LOZA 1LZ4A 1REZA 2MEEA 6LYZA 4NSHA 1OUJA 3TXDA 1HEOA 3HBEX 5ILFA 5B06A 5LXWA 1GFAA 1FKQA 4DC4A 5B1GA 2BQIA 4HV1A 1JPOA 1JUGA 1IWUA 1C08C 1OUEA 3RZ4A 1UIEA 2Z2FA 1UUZC 5APFA 1IOSA 1LHMA 1GF6A 1LSEA 1LMCA 1QDTA 4GCEA 3TXJA 5JENB 1JIYA 2HEFA 4C5FA 1WQQA 3CT5A 4BAFA 4Z41A 1NQIA 1C43A 1HEWA 1JTTL 1OUFA 1GB0A 4B0DA 5KXXA 4LT0A 4Z3MA 2ZNWY 4II8A 1DI3A 4B4JA 1KIQC 4NGIA 1VDTA 2MEDA 2DQAA 5DL9A 4DYGA 3A3QA 1GXXA 1UCOA 3A67Y 2EKSC 1GBZA 1YROA 4XN6A 1UIHA 1B7SA 1LMAA 5F9UA 2YSSC 1IP3A 154LA 4ETCA 1VDSA 2H9KA 4DD0A 1LZ5A 3TXEA 4OWAA 1HF4A 1Z55A 1JKAA 4LT1A 3OK0A 3TMWA 4DDBA 4LYTA 3P66A 2Z38A 1LMNA 2BPUA 1LSNA 2FBDA 3ATOA 1UIFA 5APEA 1B2KA 5E9RA 4ZIXA 5FCPA 1JJ0A 1DKJA 2BQDA 4QDNA 3WUAA 1KIPC 1IWTA 1IP2A 5EBHA 1JWRA 1BGIA 2HU3A 1XGTC 2BQFA 4X3BA 4H8YA 4HSFA 4I0CA 4BS7A 3W6DA 3IJVA 3LHMA 2FYDA 1LKRA 4H9FA 1OUIA 1CKCA 2X0AA 1C10A 1YKZX 4WM1A 2N5ZA 2DQEY 3VWOA 5HQ1A 1D6QA 1LSPA 1MELL 1LZRA 4OWEA 4CHXA 1CKFA 4NHSA 4L41A 2C8OA 4WLYA 5F81A 4HJVA 1GFGA 1NMMA 4MCKA 1LKSA 1WTNA 4ET8A 1YAMA 4GN3A 1B7QA 3A91A 4GCFA 4XJBA 3AB6A 5F14A 2ZNXY 4LYZA 1IOCA 1UACY 1XGUC 1GD6A 1LZNA 3EBAB 1IO5A 1LSMA 1NBZC 1UIAA 1W6ZA 3K3TA 1EL1A 3HBHA 4FDYA 4NSGA 5LAGA 5LVKA 3RNXA 3WULA 3D9AC 1IP6A 1VEDA 2HUBA 4HTQA 1XFPL 4XJDA 5APDA 4LGKA 1JJ1A 3W6EA 1TDYA 3A8ZA 3N9EA 3E3DA 4H9HA 5DLAA 5LVHA 1GWDA 1IC5Y 2XJWA 5HMJA 5KXTA 1GF9A 2W1LA 1GFEA 3M3UA 1NBYC 1WQRA 3ZVQA 4YEMA 1GAYA 1RCMA 1CJ6A 5C6LA 4NWEA 1GB9A 1BWIA 1KXWA 5A3EA 1GF8A 1LHIA 1HHLA 3RU5A 1O23A 1GXV2 4NG8A 4H93A 3CQLA 1QQYA 5B05A 1DQJC 2BQGA 4DD7A 4LZTA 4NGJA 2BQCA 4NEBA 1GF5A 4W94A 5FELA 1UICA 1JKCA 1GE1A 4QEQA 1LJNA 1GF4A 3HFMY 4J1AA 1DI5A 2BQKA 1B5UA 2DQGY 4LYOA 4PRQA 4WMGA 4NGZA 1IOTA 3N9AA 1PS5A 4LT2A 4QGZA 1NDMC 5LA8A 2LYZA 4ZEEA 2ZQ4A 4G4HA 4NGVA 1LHLA 2W1YA 2MEIA 5C6IA 4GCDA 5LVIA 1KXXA 1NDGC 2HEDA 1GBXA 135LA 1REMA 2Q0MX 2BQJA 4WLDA 3CB7A 5KXNA 4XYYA 1UA6Y 1LZCA 3WU8A 1LJEA 3ULRA 3AZ6A 3TXHA 1EQ5A 4XJHA 5KXPA 4PHIA 2YBHA 4YOPA 1GBOA 2A7DA 2HTXA 1IR7A 4WLTA 4ANRA 3WPJA 1GHLA 1FDLY 2I26L 4PGJB 2FBBA 3AJNA 3LYMA 1QTEA 9LYZA 1FKVA 2BQBA 5F16A 4WM5A 1WQNA 1GBSA 1GFHA 4AXTA 1A4VA 3MGWA 1IORA 1TEWA 1CKGA 1JEFA 4MSTA 2EIZC 5L3HA 2I6ZA 4HPIA 3WMKA 4DT3A 4M4OA 2H9JA 1F10A 2F4AA 2DQIY 4NFVA 5LINA 2GV0A 1UIDA 1VDPA 4LYCA 4QY9A 2NWDX 1I20A 194LA 4N1CC 3KAMA 3P68A 4H8XA 4M6DA 2Z12A 3SP3A 2BQAA 2G4NA 1XEKA 5KXWA 2WARA 4TUNA 4HTNA 2MEFA 1HC0A 2MECA 1G7JC 4LFPA 3LN2A 1YQVY 1N4FA 1HFXA 2ZWBA 3AZ7A 3CT1A 1XGRC 4YENA 134LA 4NWHA 3B0KA 3P64A 2ZIJA 5LVJA 4WM4A 1FBIX 3IJUA 1LJKA 1HFYA 1JJ3A 5KXSA 1CKDA 5DM9A 1C7PA 4DDCA 1AM7A 1EQEA 2DBTA 1B0DA 2ZIKA 2BQHA 1GDWA 4OWBA 2YBLA 3QE8A 1GB7A 1WQOA 5E4PA 1NKHA 5KXZA 1GB5A 1OP9B 1FLWA 5APCA 1LJGA 4DD3A 3TXBA 1J1OY 5B07A 2HEBA 5LYTA 1XGPC 1LYYA 1IY4A 1LSDA 1GE3A 3G3AB 5I53A 1IWWA 1GB6A 1WVUA 4HP0A 4C3WA 5B59A 1F6SA 1GE2A 1IWZA 1INUA 1NHEA 4KL7A 3B6LA 1TCYA 4OWCA 4WOAA 2MEGA 1BB5A 1RI8B 1VAUA 5I54A 1I1ZA 2B5ZA 5A3ZA 4B49A 4W96A 2BQEA 4N5RA 1IR9A 1LZ6A 5J7CA 4J1BA 1DI4A 208LA 1B5VA 1D6PA 1GFRA 2Z18A 4OOTA 1IC7Y 4UWUA 1HEPA 2BQLA 2DQHY 4RLMA 3W6BA 3WVYA 4N8ZA 2CJLA 1WQPA 1JITA 3TXGA 5LA5A 3CSQA 1TAYA 1B9OA 2YBMA 4KT3A 1E8LA 4U3XB 1GF3A 3A93A 1GBYA 1LAAA 3WUNA 1NWGA 1OUDA 2LYMA 3ZEKA 2XTHA 1ZV5L 1J1XY 1B5ZA 2MEHA 1UC0A 4HJYA 3WH1A 1B5WA 4TWSA 1IOQA 4BADA 3BKVA 1YANA 1H87A 1LZAA 2LYOA 1DZBX 1OQMA 3B0IA 1IY3A 3LYTA 2ZYCA 3A95A 3TXFA 1RFPA 4OOOA 3WPLA 3AZ5A 4NG1A 2YBJA 5DN4A 3TXIA 3G3BB 4TTDA 1AT5A 2HEAA 3WPKA 4E3UA 4NGLA 1LZGA 1OUHA 1BVXA 1D0KA 1BVKC 1JKBA 2ZYPA 3FI7A 4HPEA 1UIGA 1PZYA 2DQCY 3WUMA 4RLNA 2AUBA 1YKYX 1CNSA 2Z19A 3OJPA 4Z98A 5KXKA 1C45A 3AGHA 3AGGG 1P2CC 2DQJY 1IWYA 1LJIA 4NHIA 1UBZA 1LYOA 4PPOA 3WU9A 1BB4A 4PRUA 1KIRC 2HECA 2YDGA 4IASA 5LAFA 3WU7A 1CJ9A 1LZEA 1LJ3A 1GF7A 5KXRA 1JTOL 4KXIA 4H92A 4CGEA 1QSWA 1BB7A 4WO9A 4XJIA 5F9XA 2G4PA 4N9RA 1D9UA 3AW6A 1HEQA 4LT3A 4CFPA 3WXTA 1LSFA 5K7OA 2PC2A 1H6MA 5KXOA 3F6ZA 1LCNA 1QUTA 3FE0A 1GEZA 4KPMA 3IWRA 3CSRA 4H94A 3W3EA 1G7MC 1LMPA 4DD1A 4IATA 1XGQC 3AZ4A 1CJ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HLLA 2CGIA 127LA 1CU0A 1YAQA 169LA 1CU6A 1PQJA 1QTKA 5I4WA 1OYUA 3AYQA 3CT0A 1VFBC 1L08A 2Y8PA 4OWHA 2D91A 1BWJA 2G4QA 4EMNA 3A90A 233LA 4YF2A 2F2NA 1GAZA 170LA 3B72A 5I4YA 2Z37A 3LYZA 4EJ4A 1L50A 1L70A 2OTZX 1LJHA 5FHWA 1LSYA 213LA 1C63A 4WG7A 5KXKA 1A2YC 5T3FA 5KJ9A 4S0WA 5KXYA 4Z46A 3J4GA 1C67A 3LZTA 2B6XA 3A92A 4WL6A 3DKEX 4ZPUA 5I5QA 4MR1A 1IP1A 4NGKA 4ETBA 1B7RA 5AMYA 155LA 1GBWA 4NHPA 1HERA 2ZILA 1QIOA 5KXMA 5FDJA 2LZTA 4P2EA 1C6DA 3ATNA 1REXA 114LA 1K28A 1C6NA 2BLYA 4HJZA 4G49A 4EOFA 1DXJA 1ZVHL 1PQKA 1LYSA 177LA 1T8AA 3W6AA 3A6CY 2F2QA 3HU8A 4H9EA 4H9AA 4GLAA 1CU2A 3K2RA 1KNIA 4NGYA 1AT6A 4DJHA 2BQOA 4ETAA 3V2YA 1GFKA 1L89A 5IHGA 1L91A 5FEKA 4A7DA 2I25L 5HNCA 3HTGA 4H90A 1L96A 1DPWA 2A7FA 1CJ8A 1GB2A 1C60A 2RSCA 4ETEA 1P36A 1B7PA 1L97A 247LA 3LYOA 4LYMA 2IGCA 7LYZA 200LA 172LA 1YIKA 1NF5A 4O34A 1QT3A 3B0OA 1L30A 1KW5A 3P65A 3RUNA 1CV3A 4GCCA 1HSXA 4CJ2A 1B7OA 6LYTA 1P37A 1JSFA 3EO5A 3GXKA 4WM3A 1ZVYB 193LA 4YXAC 1WVVA 1LOZA 6LYZA 3TXDA 1HEOA 3HBEX 5LXWA 146LA 4HV1A 7LZMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1DKK A;  5HLL A;  3T6U A;  1D0M A;  1FLU A;  4H9C A;  1WQM A;  3QNG A;  1LSG A;  3W6F A;  1IP7 A;  2XBR A;  2CGI A;  1GE4 A;  1HEL A;  1RE2 A;  4H91 A;  4H9I A;  1W08 A;  4G9S A;  4RW2 A;  5LVG A;  1LZD A;  1YAQ A;  4DWX A;  1QTK A;  2D4K A;  4NGO A;  5I4W A;  1YL0 X;  2F4G A;  3WVX A;  4B4E A;  4GLV A;  4DD2 A;  4TSB A;  1V7T A;  3AYQ A;  1LZ1 A;  2FYC A;  1VFB C;  1IWV A;  2Y8P A;  3CT0 A;  4OWH A;  4WM6 A;  4B4I A;  1B7L A;  2D91 A;  3TMV A;  1IP4 A;  1G7I C;  4H9B A;  1BWJ A;  2G4Q A;  4LYB A;  1AKI A;  3QY4 A;  4EMN A;  1TBY A;  3EXD A;  3A90 A;  4YF2 A;  2F2N A;  1GAZ A;  1B5Y A;  3GXR A;  1AZF A;  3B72 A;  1LZ8 A;  1YAP A;  5I4Y A;  2Z37 A;  4WLX A;  3LYZ A;  1BWH A;  1ALC A;  3EMS A;  1LJJ A;  4GN4 A;  4UWV A;  1IX0 A;  2HEE A;  1LJH A;  5FHW A;  1XEJ A;  2MEA A;  1LSY A;  1MLC E;  1XEI A;  5LYZ A;  5LYM A;  2Z39 A;  1G7L C;  2D6B A;  2DQD Y;  4WG7 A;  1A2Y C;  4WL7 A;  4N0J A;  5D5F A;  5T3F A;  2HU1 A;  3ZVQ B;  3CSZ A;  5KJ9 A;  3RW8 A;  1HMK A;  1LZT A;  4WM2 A;  1JSE A;  5KXY A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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