4XYYA

Hen egg-white lysozyme (hewl) complexed with zr(iv)-substituted keggin-type polyoxometalate
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Characterization of the Complex between Hen Egg-White Lysozyme and Zr(IV) -Substituted Keggin Polyoxometalate as Artificial Protease.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2015-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4xyyA00
4ETDA 3RW8A 3AW7A 5LA8A 5B1FA 4BS7A 1TCYA 1B7NA 1YAPA 2DKVA 3TXIA 1EQ4A 3WYHA 2Z38A 3D3DA 1BHZA 4LFPA 4NSHA 5KXWA 1G7LC 5I53A 1WQPA 1IVMA 5FHWA 4NGWA 1B2KA 4IATA 2LYZA 3WU7A 2BQGA 1JEFA 1QIOA 4NWEA 2C8OA 3LYMA 1GB8A 4CFPA 4MCKA 2HEFA 4XJGA 5B1GA 1CKFA 3SP3A 2I26L 2LYMA 2RSCA 1GFEA 1NWGA 5LYZA 1GFTA 2MEFA 1YKZX 2MEHA 4CHXA 1KIPC 5LVIA 2N5ZA 3N9AA 1VEDA 4DDBA 2Z2EA 4YEMA 4WO9A 2X0AA 2BQBA 3EO5A 5I5QA 2GV0A 1NHEA 1D9UA 3FI7A 5C6JA 1AM7A 1LZSA 2B5ZA 2DQGY 2HU1A 2MECA 3N9EA 5HMJA 2D6BA 4OOOA 4OWAA 4U3XB 3LZTA 3ATOA 193LA 1G7IC 5FELA 5KXKA 1G7HC 1LKSA 3T36A 5EBHA 5I4XA 154LA 4ETAA 2NWDX 1VAUA 2MEIA 3AGHA 1AKIA 4N1EI 4PRUA 4XADA 5HQ1A 1OUEA 5AMYA 3TXGA 4BAFA 1LSDA 4MSTA 4ETCA 3CQLA 4I0CA 3RT5X 1JKCA 3TMUA 4MR1A 1B5VA 4M4OA 2HEAA 1LCNA 1BWIA 2CGIA 3E3DA 2Q0MX 5KKJA 1GFGA 1YANA 1LSBA 1TEWA 3QY4A 5KXMA 1HFYA 4ET9A 1GFVA 3HBEX 3BKVA 3P64A 4B1AA 1OQMA 3WULA 1IORA 3GXRA 4HJVA 3WU8A 1LHLA 1VATA 2LZ2A 2Z19A 5I4YA 2YBJA 5LAGA 1T6VL 4HTQA 5JENB 1YROA 4QEQA 1LSMA 1AT6A 5E4PA 3P4ZA 1IWWA 1IEEA 4HTKA 3ATNA 5D5FA 4WL6A 2BAAA 1OUGA 1KXXA 4AGAA 4LYTA 8LYZA 3W6EA 3OJPA 3WVYA 5LYMA 1LMPA 9LYZA 2G4NA 1LZAA 132LA 1GB7A 4WLTA 5KXNA 1GHLA 2LHMA 3A95A 5M1YA 1LMNA 2XTHA 1TDYA 5APDA 5F14A 4XJIA 4A7DA 2YBIA 1CJ8A 1G7JC 1OUDA 1LSEA 4PHIA 4XJHA 4WO6A 5DN4A 4N9RA 4XENA 5HMVA 5I4WA 1OUAA 3WUMA 4N1CC 4GCBA 2BLYA 2BQNA 1OUHA 3T6UA 3CT0A 1F6RA 1CKHA 4H93A 4NY5A 4EOFA 2BQKA 1HEOA 1EQEA 1TBYA 1QDTA 1GF5A 1GWDA 1UIEA 2BQHA 1LJIA 194LA 1PS5A 5HLLA 5KXPA 5LINA 1LZ4A 1C45A 5FCPA 1RFPA 4HP0A 1DPXA 2BQJA 3RZ4A 2HUBA 1IY4A 4HJZA 3P66A 4H91A 4WOAA 2BQAA 2AUBA 1JHLA 1F10A 2DBTA 5F81A 1YAMA 3WH1A 4XN6A 4ETEA 1QTKA 5F9XA 4GCFA 5KXXA 1UIAA 1DI4A 2LYOA 2ZQ3A 3AJNA 3GXKA 4PGJB 1LZCA 1HSWA 1GBYA 1RCMA 4N8ZA 1D0KA 1CKDA 4O34A 1UUZC 1V7SA 5B06A 3HBDA 3TXDA 2ZQ4A 1A2YC 1GFJA 2HECA 3CT1A 1D6PA 2H9JA 4FJRA 2EKSC 2F4AA 3RNXA 3TXBA 2BQMA 2VB1A 2W1XA 1B5ZA 1BVXA 3M3UA 4NGJA 3TXJA 4E3UA 3LZ2A 4B4EA 1IOSA 1BVKC 1KIQC 1B5XA 4D9ZA 1B7MA 4C5FA 4WG1A 4NHPA 4DD1A 4OW1A 2Z2FA 1B9OA 3TXKA 1XEKA 4XJDA 4B0DA 1LYZA 1XGPC 4H9FA 1MLCE 1JKBA 4XJBA 3MGWA 4G4CA 1A4VA 1IOCA 4LT0A 2CWIA 1LZGA 1C43A 4LZTA 5APCA 1CJ9A 1NKHA 4Z41A 2HEEA 4WM2A 1PZYA 4LT1A 6LYTA 2DQIY 1IWTA 3F6ZA 4NGIA 1GF3A 1HFXA 1NDGC 5KXYA 4B49A 5L3IA 1GB9A 2F2NA 3B0OA 3CSQA 1CNSA 4GCCA 4P2EA 1B5WA 1GFAA 4HPIA 4B4IA 1SLYA 1LZYA 1HENA 1LMAA 3HFMY 1IP2A 4LYZA 4YEOA 4H8XA 1GBZA 1FKVA 4WM5A 3WW5A 5C6LA 4C3WA 1HHLA 1B7OA 1LJ3A 1G7MC 1BB3A 1LZ1A 3HBHA 3OK0A 4LYBA 4NGYA 2W1YA 4NGLA 4PRQA 1REXA 1YL0X 3ZVQB 1UA6Y 1WVUA 4NSGA 4PPOA 4H9IA 5KXTA 1H6MA 4RW1A 4BAPA 3LHMA 4HV2A 1GDWA 1OUFA 2ZIKA 3AGIA 5L9JA 1LZNA 3W6AA 4H8YA 4CJ2A 1LSYA 1DZBX 1LJGA 1B7RA 1YAQA 2F30A 2MEEA 3FE0A 1FLYA 2ZILA 1LMQA 1YQVY 1IOQA 1GBOA 3ZEKA 3A67Y 3VWOA 1IWZA 1DQJC 1LJHA 1QUTA 5DN5A 1OUCA 4LT2A 1F6SA 1HNLA 5HNLA 1FLWA 1UICA 134LA 4NGKA 4NEBA 4KXIA 1WTMA 2Z12A 3N9CA 1HC0A 1IX0A 4WM6A 1XFPL 1JITA 3AW6A 1JSEA 1JKAA 4LT3A 4LGKA 1FDLY 1IP6A 1OUJA 1IWYA 4YM8A 1JPOA 4H9CA 4DD3A 2YBMA 4H92A 3WUAA 4GN4A 4J1AA 5E9RA 2I6ZA 1NF5A 1LJ4A 4II8A 3W6FA 2MEDA 4WL7A 1LHIA 1NBYC 1QUSA 1GBWA 2IHLA 4OOTA 4DD0A 1KXWA 1BWHA 3B6LA 1LSZA 2HEBA 3TMXA 1RE2A 3P68A 1JTPL 1IR7A 3G3BB 4NGOA 1HEQA 1D0MA 5IELA 2BLXA 1LZDA 4ML7A 2DQEY 1LZEA 4NFVA 1J1XY 2DQJY 4NIJA 1I20A 1OUIA 2D4IA 5LIOA 3TMWA 4DD7A 2FBDA 2G4PA 1XEIA 1DKJA 1JIYA 4H9BA 3ULRA 5KY1A 1LSNA 1GB6A 1P2CC 4ZIXA 3IJUA 3CB7A 1B5YA 1XGTC 1LHHA 4I8SA 1GB0A 135LA 3A34A 4NHTA 4NG1A 1REYA 4DT3A 1JJ0A 5LVGA 1IC7Y 4J7VA 3D9AC 1REZA 1AT5A 1WQQA 2BQCA 1UC0A 1UIHA 2DQFC 5D5CA 1GBSA 1ZVHL 1LSGA 2DQDY 1GD6A 1IY3A 1YILA 3AB6A 4UWVA 1LYSA 2I25L 4H1PA 4WM1A 3EBAB 4DD9A 1GE0A 1C7PA 2HEDA 5B07A 1MELL 1BB6A 2YBNA 1LYYA 1YL1X 1GB2A 1QSWA 5L3HA 4DYGA 1GE3A 4WMGA 4Z98A 4GLVA 1VFBC 3G3AB 5KJ9A 1IWUA 1KIRC 1GDXA 4OWEA 5DLAA 3AYQA 1XGRC 2CDSA 4RW2A 4YENA 5DL9A 1OUBA 1D0LA 2H9KA 1GF9A 5F16A 2Z37A 4ZEEA 1GE2A 1B0DA 4H94A 4LYCA 1N4FA 1DI3A 3J6KA 5T3FA 1E8LA 1BB5A 5F9UA 1LSAA 1LZ6A 1DPWA 1W08A 1HEMA 1GEZA 5KXRA 4RLMA 5II3A 1VDSA 1HERA 2A7FA 4G9SA 1HFZA 4W94A 1BQLY 2ZYPA 2YDGA 4LFXA 1LTMA 4TWSA 2HU3A 1YKXX 1DI5A 1LAAA 1Z55A 1GPQC 1BB7A 2EPEA 1VDTA 2IFFY 2XJWA 3AGGG 4ETBA 2BQDA 4B4JA 1YIKA 1JWRA 1FBIX 1GEVA 3AZ4A 4HTNA 1IP7A 1DKKA 4HV1A 5FEKA 1I56A 1C46A 4N5RA 1BWJA 1LZ8A 1GXV2 1GFHA 3B0KA 3WW6A 5LYTA 1QTEA 2FYDA 1D6QA 4IASA 3ZVQA 1B7SA 4HPEA 4H9HA 2FYCA 1HEWA 1KXYA 5ILCA 1JJ3A 2CJLA 1LZRA 1GF7A 2XBSA 4WLDA 1GB3A 1LHKA 4WM4A 1HEPA 3B72A 4YOPA 4AXTA 5B59A 2W1LA 4GN5C 1UIDA 2C8PA 1UIBA 4WLXA 4HSFA 1TAYA 1YKYX 5FDJA 1GF0A 1LMOA 1WQRA 5KXOA 3LYOA 3KAMA 4DWXA 1JTOL 1QQYA 2PC2A 2W1MA 4KL7A 5APFA 2EQLA 208LA 4GLAA 4CFOA 1GF8A 3W6CA 4NHIA 1F0WA 5I54A 1GE1A 1IP3A 1FKQA 4WM3A 1GE4A 1OP9B 1HMKA 2DQAA 3EMSA 1GAYA 1C08C 2XBRA 3AZ6A 5DM9A 3W3EA 5LVHA 3LN2A 4NWHA 1B7LA 4NSJA 5LVJA 3IWRA 1LMTA 4ANRA 1GB5A 4GCEA 3A8ZA 1WVVA 1ZVYB 3QE8A 1ZV5L 1HMLA 3J4GA 1QSAA 3A96A 3RU5A 4TSBA 4NSIA 4G4BA 1JISA 4YF2A 3TXFA 5KXLA 4TX7A 3WMKA 3WU9A 1LZBA 4ZFPA 4H90A 1QDRA 2YBLA 1J1PY 2YBHA 4L41A 3WPJA 1LHJA 4RDSA 1LHMA 3W6DA 1GF6A 4N0JA 2FBBA 5IHGA 3CSRA 1LOZA 2YVBA 1LZTA 1ALCA 1NMMA 4BADA 1JSFA 3W6BA 4G4HA 2A7DA 4HJYA 4RLNA 153LA 1FLUA 5KXZA 2MEBA 1I1ZA 1V7TA 4NGVA 3M18B 3WUNA 3A94A 4M6DA 1O23A 4QGZA 6LYZA 4G49A 1NDMC 3A3RX 5LAFA 2YSSC 4EMNA 3WXTA 1GXXA 1IWXA 1REMA 4WG7A 5HNCA 2G4QA 1JTTL 1BB4A 1JJ1A 1FLQA 4QY9A 5K7OA 3BKHA 5LA5A 5C6IA 4X3BA 4Z3MA 4DC4A 3WVXA 1CKCA 1IIZA 3A6CY 1JKDA 1HF4A 3A90A 1INUA 4H8ZA 4J1BA 3WL2A 1B7QA 4FDYA 2DQCY 1XSFA 4OWBA 1GAZA 1LJEA 3P65A 4ET8A 1IWVA 2Z39A 3EXDA 1B5UA 1JUGA 1LZ9A 1SQ2L 3B0IA 3K3TA 4GN3A 4OWHA 2BQOA 1HSXA 4NG8A 4W96A 3AZ5A 1UCOA 5LVKA 1HELA 2BQIA 1CKGA 2BQLA 1YAOA 2WARA 2Z18A 2LZTA 4UWUA 1LJJA 2D4KA 2H5ZA 1LZ5A 4WLYA 1UBZA 3A92A 1EQ5A 4NHQA 4XJFA 4H9EA 1GBXA 2Y8PA 1IP4A 3A93A 1C10A 207LA 5B05A 4LYMA 4Z46A 1LSPA 3CT5A 1IOTA 1CJ6A 1GFUA 4TUNA 1CJ7A 1RJCB 3A3QA 4OWCA 1LJFA 4GCDA 3TXEA 1IP1A 2MEAA 3AZ7A 1GFKA 3TMVA 1LYOA 4LYOA 1WTNA 2BQFA 4J0LA 1LSCA 2ZNWY 4NHSA 1H87A 1IC4Y 1DXJA 3WPLA 1AZFA 1WQMA 1FN5A 4TSCA 1IR9A 1NBZC 1ZMYL 3LYZA 3A91A 2ZNXY 1J1OY 1LSFA 133LA 2ZYCA 3LYTA 1GF4A 1UIFA 4NGZA 1W6ZA 1WQOA 1IR8A 1VDQA 1WQNA 1IC5Y 1UIGA 2DQHY 2F4GA 4R0FA 1VDPA 4IJ4A 4PJ2C 4TTDA 4KT3A 1LMCA 2BQEA 3WPKA 1UACY 3A6BY 4DD2A 1XGUC 2D4JA 5IDDA 5J7CA 1BGIA 2ZWBA 1B7PA 1XGQC 1LJNA 1NQIA 1RI8B 3QNGA 3IJVA 4DDCA 1GFRA 1T3PA 2EIZC 3TXHA 4CGEA 3CSZA 4KPMA 4UWNA 5KXSA 5A3EA 7LYZA 5LXWA 2HTXA 1LJKA 4QDNA 1LPIA 2MEGA 4H9AA 5FSTA 1LKRA 2ZIJA 5ILFA 2D91A 1XEJA 2BPUA 1IO5A 1IP5A 4XYYA 4DDAA 5A3ZA 3WXUA 5KKIA 4R6CA 5APEA 1EL1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3RW8A 3AW7A 5B1FA 1B7NA 1EQ4A 3D3DA 3CDTA 2B6XA 4LFPA 1G7LC 3SN6R 1GB8A 1CKFA 2QB0B 2LYMA 1C6KA 1KIPC 2HUKA 5LVIA 1LYDA 4WO9A 1K28A 1NHEA 1G0PA 2B5ZA 1SSWA 2HU1A 2D6BA 4OOOA 2A4TA 1QT5A 1G7HC 1LKSA 1C6TA 1L40A 4ETAA 4PRUA 5HQ1A 4MSTA 3RT5X 1JKCA 1L57A 2HEAA 1C67A 2CGIA 1GFGA 2B7XA 5KXMA 4ET9A 3BKVA 3HDEA 3HH6A 4HJVA 3WU8A 2RAYX 1T6VL 4ARPA 5JENB 1YROA 4QEQA 1AT6A 1CV3A 2BAAA 1QTVA 4AGAA 8LYZA 127LA 5LYMA 4I7RA 2G4NA 1LZAA 1CU0A 3LZMA 4WLTA 2LC9A 1GHLA 1LMNA 1G1WA 5F14A 4A7DA 2YBIA 1CJ8A 1G7JC 1OUDA 5HMVA 4N9RA 1C6MA 5I4WA 1OUAA 1CV0A 2BLYA 2BQNA 3PDSA 237LA 3CDQA 1EQEA 1GF5A 1GWDA 3GUJA 1L89A 1UIEA 194LA 5HLLA 5KXPA 5LINA 2L78A 126LA 2HUBA 3RZ4A 1F10A 2LYOA 2ZQ3A 3AJNA 3GXKA 4PGJB 4N8ZA 257LA 1UUZC 4FJRA 221LA 4E3UA 2VB1A 1IVMA 1BVXA 1L43A 222LA 3LZ2A 1B7MA 4W56A 1C60A 4NHPA 109LA 2B6ZA 123LA 1XEKA 4XJDA 1XGPC 4H9FA 1C43A 4IAPA 4Z41A 2HEEA 4EKSA 1LYEA 1GF3A 4B49A 2RH1A 238LA 4I7QA 3DN8A 4GBRB 3OE0A 4LYZA 4C3WA 1B7OA 1G7MC 1LZ1A 2RB0X 1REXA 1G07A 1WVUA 4H9IA 150LA 1H6MA 3AGIA 2B70A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4ETD A;  3RW8 A;  3AW7 A;  5LA8 A;  5B1F A;  4BS7 A;  1TCY A;  1B7N A;  1YAP A;  2DKV A;  3TXI A;  1EQ4 A;  3WYH A;  2Z38 A;  3D3D A;  1BHZ A;  4LFP A;  4NSH A;  5KXW A;  1G7L C;  5I53 A;  1WQP A;  1IVM A;  5FHW A;  4NGW A;  1B2K A;  4IAT A;  2LYZ A;  3WU7 A;  2BQG A;  1JEF A;  1QIO A;  4NWE A;  2C8O A;  3LYM A;  1GB8 A;  4CFP A;  4MCK A;  2HEF A;  4XJG A;  5B1G A;  1CKF A;  3SP3 A;  2I26 L;  2LYM A;  2RSC A;  1GFE A;  1NWG A;  5LYZ A;  1GFT A;  2MEF A;  1YKZ X;  2MEH A;  4CHX A;  1KIP C;  5LVI A;  2N5Z A;  3N9A A;  1VED A;  4DDB A;  2Z2E A;  4YEM A;  4WO9 A;  2X0A A;  2BQB A;  3EO5 A;  5I5Q A;  2GV0 A;  1NHE A;  1D9U A;  3FI7 A;  5C6J A;  1AM7 A;  1LZS A;  2B5Z A;  2DQG Y;  2HU1 A;  2MEC A;  3N9E A;  5HMJ A;  2D6B A;  4OOO A;  4OWA A;  4U3X B;  3LZT A;  3ATO A;  193L A;  1G7I C;  5FEL A;  5KXK A;  1G7H C;  1LKS A;  3T36 A;  5EBH A;  5I4X A;  154L A;  4ETA A;  2NWD X;  1VAU A;  2MEI A;  3AGH A;  1AKI A;  4N1E I;  4PRU A;  4XAD A;  5HQ1 A;  1OUE A;  5AMY A;  3TXG A;  4BAF A;  1LSD A;  4MST A; 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 5LVK A;  1HEL A;  2BQI A;  1CKG A;  2BQL A;  1YAO A;  2WAR A;  2Z18 A;  2LZT A;  4UWU A;  1LJJ A;  2D4K A;  2H5Z A;  1LZ5 A;  4WLY A;  1UBZ A;  3A92 A;  1EQ5 A;  4NHQ A;  4XJF A;  4H9E A;  1GBX A;  2Y8P A;  1IP4 A;  3A93 A;  1C10 A;  207L A;  5B05 A;  4LYM A;  4Z46 A;  1LSP A;  3CT5 A;  1IOT A;  1CJ6 A;  1GFU A;  4TUN A;  1CJ7 A;  1RJC B;  3A3Q A;  4OWC A;  1LJF A;  4GCD A;  3TXE A;  1IP1 A;  2MEA A;  3AZ7 A;  1GFK A;  3TMV A;  1LYO A;  4LYO A;  1WTN A;  2BQF A;  4J0L A;  1LSC A;  2ZNW Y;  4NHS A;  1H87 A;  1IC4 Y;  1DXJ A;  3WPL A;  1AZF A;  1WQM A;  1FN5 A;  4TSC A;  1IR9 A;  1NBZ C;  1ZMY L;  3LYZ A;  3A91 A;  2ZNX Y;  1J1O Y;  1LSF A;  133L A;  2ZYC A;  3LYT A;  1GF4 A;  1UIF A;  4NGZ A;  1W6Z A;  1WQO A;  1IR8 A;  1VDQ A;  1WQN A;  1IC5 Y;  1UIG A;  2DQH Y;  2F4G A;  4R0F A;  1VDP A;  4IJ4 A;  4PJ2 C;  4TTD A;  4KT3 A;  1LMC A;  2BQE A;  3WPK A;  1UAC Y;  3A6B Y;  4DD2 A;  1XGU C;  2D4J A;  5IDD A;  5J7C A;  1BGI A;  2ZWB A;  1B7P A;  1XGQ C;  1LJN A;  1NQI A;  1RI8 B;  3QNG A;  3IJV A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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