4Z3MA

X-ray structure of the adduct formed in the reaction between lysozyme and a platinum(ii) complex with s,o bidentate ligands (9b)
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Platinum(II) Complexes with O,S Bidentate Ligands: Biophysical Characterization, Antiproliferative Activity, and Crystallographic Evidence of Protein Binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 51
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2015-03-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4z3mA00
3P66A 5APCA 2G4NA 3RT5X 1O23A 2WARA 1DQJC 4D9ZA 1LYOA 1NF5A 4WM2A 5KY1A 5FSTA 3TXEA 4LYZA 6LYZA 1GPQC 1G7HC 3AZ4A 4AGAA 1LZTA 4IASA 1BB7A 3A6CY 1G7IC 1GDXA 2DQEY 3WPKA 1LSYA 1KXWA 1GF0A 3K3TA 1LZAA 3OK0A 1NDMC 1LZSA 1REYA 1B5ZA 2CDSA 2ZIJA 1NWGA 2A7DA 1B9OA 3AZ7A 1JTOL 1ALCA 3TXGA 1GB6A 1D0MA 2BQGA 3IJUA 5LA8A 2ZNXY 3AZ5A 5LAGA 1LZ4A 1GFAA 1JJ3A 1JWRA 1QUSA 3P68A 1SLYA 1B5WA 2ZNWY 1G7LC 1OUEA 1LZDA 4LYOA 1QUTA 3T6UA 1TAYA 1JHLA 3HBDA 4H9FA 1IY4A 1B2KA 1UICA 1WQOA 1ZV5L 3QE8A 2BAAA 2BQFA 4HTNA 5HMJA 1CJ6A 1GBYA 4J0LA 4MCKA 3TMUA 4GCBA 1IOSA 4GLVA 4NSHA 5KXSA 3ULRA 154LA 1A2YC 4LYBA 5B07A 1B7NA 5LVHA 2H5ZA 3A67Y 4RDSA 4NSGA 134LA 4G4HA 1BB5A 4WLYA 3CT0A 1LZ1A 3AJNA 1H87A 1QSWA 4LYMA 5E9RA 1DPXA 2VB1A 3FI7A 1LZ5A 1GB0A 1V7TA 1D0LA 1CJ7A 4W96A 1HC0A 5FEKA 4GCDA 9LYZA 2AUBA 3P4ZA 4WM3A 1IVMA 4YEOA 1OUGA 2YBHA 1YROA 4Z98A 2BQOA 1LSCA 2F2NA 1FN5A 2BLXA 1YKYX 5HLLA 1HMLA 1LZRA 4R0FA 3P64A 2W1MA 4ZFPA 1XGPC 2MEAA 4I0CA 1IOTA 5APFA 1LHMA 2DQFC 1GAZA 3E3DA 3WPLA 4H9BA 2ZYPA 1UIHA 3WMKA 4BAPA 4OW1A 2DQHY 1NBYC 3AGHA 4TSCA 1JKCA 4BAFA 1LHJA 1IWYA 1LYSA 1QTKA 3N9CA 2DQGY 4TSBA 5B59A 4EMNA 3N9AA 2I26L 4H90A 4NGWA 3W6BA 2D4JA 2EQLA 2XBSA 4J1AA 5KKIA 1J1PY 1IC5Y 1LZYA 1OUBA 1YQVY 2MEEA 1JKDA 1IR8A 1GD6A 2Z38A 4WM1A 1GB2A 2BQBA 1WTMA 4M4OA 1LMOA 5HNCA 1ZVHL 4ANRA 3TXJA 1LJ3A 5LIOA 1REMA 5T3FA 1NMMA 1F0WA 1LKSA 5KXMA 1AM7A 1GBOA 1LJHA 4QY9A 2MEBA 1VEDA 1IR7A 1FLQA 1JTTL 4HJVA 4R6CA 4PHIA 3WH1A 1T6VL 5KXWA 4PRUA 1B7PA 3CQLA 1IP6A 4WMGA 3TXBA 1BVXA 4N9RA 5KXLA 1YAOA 3LHMA 4NWHA 1GFKA 2N5ZA 1OP9B 4GN5C 3LYZA 1IWTA 2YBLA 5KXTA 1GB8A 5JENB 1LJGA 2DQDY 3KAMA 1GF4A 1XGUC 4H94A 4NG1A 3WVXA 3W6AA 1B5XA 2BQKA 2BQHA 2ZILA 5KXYA 2EIZC 5LVKA 4NGJA 5IHGA 3T36A 3WU9A 1FKVA 4YM8A 1BGIA 4BS7A 2XBRA 5FHWA 5LVIA 1UCOA 1JEFA 2BQCA 2H9KA 4TX7A 1UIEA 3EXDA 1LKRA 1BVKC 5F9UA 1JJ0A 4CJ2A 1GB7A 1WVUA 1Z55A 3B0KA 1YILA 3BKVA 3ZEKA 1RI8B 4RLMA 2G4QA 5B1FA 1LHLA 1EQ4A 1GE3A 4ETDA 2DQCY 2CWIA 4LT2A 1B0DA 3CT1A 5FELA 2BQDA 3A3RX 3EO5A 2XJWA 5B06A 1YAQA 1OUAA 1XSFA 1YKZX 4WM4A 4NY5A 2DQJY 3LYMA 4ETBA 4NGKA 2BQJA 1JJ1A 1CNSA 1GHLA 1LJIA 1RE2A 1DZBX 3MGWA 3WVYA 5LYMA 1DKKA 3WYHA 1FBIX 2DQAA 1KIQC 1HF4A 2CGIA 3D3DA 132LA 4WOAA 1JKBA 4C5FA 4OWBA 4GN3A 2I25L 4UWVA 2A7FA 2Q0MX 1OUDA 5KXOA 1JUGA 1AT5A 1GEVA 1VFBC 4WM6A 4UWUA 4XJFA 4XJHA 3IWRA 4WLXA 3A3QA 1NHEA 4HP0A 2HECA 4OWEA 3B72A 4NSIA 3HFMY 1GF3A 1I1ZA 4HPIA 4YOPA 1LYZA 1GFGA 1F6SA 1LZ9A 3G3BB 4I8SA 4B49A 5IELA 4C3WA 1XGTC 1LTMA 1YAMA 1UBZA 2YVBA 2Z18A 5I4XA 2FYCA 4XJGA 1KIRC 5KXRA 2C8OA 4KXIA 5DM9A 1LJJA 3TMXA 4H91A 3QY4A 5M1YA 2B5ZA 2YBJA 1B7QA 5KXPA 5HQ1A 1DXJA 2HUBA 1IWXA 5A3ZA 1HNLA 3AYQA 1REXA 2F4GA 3AW6A 3B6LA 3CSZA 3VWOA 1NQIA 1TBYA 1MELL 4QDNA 1CKDA 1FLUA 2Y8PA 3WW6A 2C8PA 1IP1A 2DKVA 1B5VA 3GXKA 1GFRA 1IWWA 1IOCA 2HEAA 2LHMA 194LA 4G4CA 1BB4A 3W6CA 1HHLA 1F10A 1GB9A 3TMWA 4A7DA 3LN2A 1IOQA 1LMQA 4NGZA 3QNGA 3WW5A 5DL9A 5KXXA 3LZTA 5C6JA 3TMVA 4YF2A 1QIOA 3ZVQA 1FKQA 2Z12A 1IORA 1H6MA 1VDQA 1T3PA 4YEMA 3ATOA 1HENA 1IY3A 1GF8A 5AMYA 4NFVA 4BADA 4ML7A 1I20A 5FCPA 3AZ6A 3AB6A 4U3XB 1HEOA 1SQ2L 4DD0A 3WULA 4Z46A 3HBHA 3IJVA 1LSEA 3EBAB 1C45A 4DD1A 4GCEA 3RU5A 3W3EA 5IDDA 1LZGA 1IWVA 1B7SA 1UACY 4B4IA 2MEHA 3HBEX 4LYCA 5D5FA 1JITA 1FLYA 2Z37A 1C43A 1GBSA 1RFPA 3AW7A 4HJYA 3A91A 3WL2A 5LYTA 3SP3A 4OOTA 4FJRA 4NGYA 5KXZA 4OOOA 1DKJA 4II8A 4NIJA 4KL7A 1NBZC 4AXTA 4H1PA 1GBWA 5I5QA 1UIFA 1QDRA 1VDTA 1UIBA 1DI3A 4HTQA 1GE1A 4DDAA 1LAAA 1HERA 4H9AA 3TXIA 1GBXA 2Z2FA 1YL1X 1IO5A 1CKHA 2F30A 1GFTA 1CKGA 2NWDX 4NWEA 1F6RA 3TXKA 1G7MC 3N9EA 1WQPA 3A94A 4NHTA 4WLDA 1INUA 1B7MA 1JKAA 4H8YA 4LGKA 4NHSA 4B4EA 1LSNA 1P2CC 3WPJA 2MEGA 4OWAA 1CJ9A 5LVJA 4Z3MA 2DQIY 1LSZA 2BQEA 4GCFA 3A90A 4H92A 1XEJA 3WUAA 4H8XA 4XN6A 1HSXA 3J6KA 4CHXA 2PC2A 5F81A 4NGOA 4HJZA 7LYZA 1IC7Y 1LJFA 2MEFA 3WXTA 1DI4A 1LZ6A 5APDA 1JIYA 3M18B 4DT3A 3TXDA 2W1XA 1UIGA 4N1CC 4RW2A 3A95A 1UC0A 1OUHA 1UIDA 1IC4Y 1LSDA 1VDSA 3OJPA 4N0JA 2YDGA 1IP7A 1ZMYL 4G49A 1LZCA 4H9EA 4DD3A 1CKFA 3A8ZA 3W6DA 2LYOA 1GB5A 4H93A 2EKSC 4XYYA 2Z39A 1AZFA 1HEQA 4H9IA 2HU1A 1B7OA 3A93A 3B0IA 1B5UA 4NGIA 1LSBA 4LFXA 1GFHA 3WU8A 4NHIA 4DD2A 1UUZC 1QTEA 1GDWA 2BQMA 4CFOA 2YBIA 5I53A 1GFUA 2FBBA 3BKHA 2IHLA 5ILFA 2Z19A 5A3EA 4XENA 4XJBA 1GF9A 4GLAA 1HFZA 1LMAA 2HTXA 1GE2A 1BWIA 4KT3A 4NHPA 4B4JA 1FDLY 1GFJA 1IWUA 1OQMA 2CJLA 2HEEA 2YBNA 3FE0A 4WM5A 5I4YA 4H9HA 1GAYA 4ET9A 1LZBA 1AT6A 3CSQA 3LYTA 193LA 3EMSA 1LPIA 4Z41A 1G7JC 1IEEA 1GEZA 2MECA 4H8ZA 3F6ZA 2ZIKA 4H9CA 2YSSC 1GBZA 4DC4A 4LT0A 207LA 4N8ZA 2H9JA 4DD7A 133LA 1C10A 1OUCA 3WUMA 4HSFA 1GXV2 1CJ8A 3ZVQB 1WQNA 4N1EI 4OWCA 4WL6A 5ILCA 4GN4A 5HMVA 5LINA 1WTNA 4FDYA 3RW8A 5KKJA 3CB7A 1WQQA 2Z2EA 1EQ5A 1GE4A 1YKXX 2W1YA 5DN4A 4DYGA 1REZA 1W08A 1W6ZA 1QQYA 1VATA 4MR1A 5I54A 6LYTA 1VAUA 1IWZA 1LMCA 1J1XY 4IJ4A 1VDPA 4J7VA 4WL7A 5HNLA 2G4PA 1EQEA 4CGEA 1IIZA 5B05A 3A92A 4ETEA 1XEKA 5B1GA 2HEFA 4WG7A 4L41A 4RW1A 3A34A 2D4KA 2ZQ3A 3WUNA 2HEBA 1OUJA 1TCYA 1BB6A 1HFXA 2GV0A 2XTHA 1NDGC 2X0AA 1AKIA 3G3AB 4LYTA 5J7CA 1HEMA 1GFEA 2ZYCA 4QGZA 3W6EA 3GXRA 5APEA 1HEWA 4ZEEA 1N4FA 1BWHA 1YL0X 2IFFY 4HV1A 2MEIA 1LSMA 1UIAA 3J4GA 5E4PA 5D5CA 1IP5A 1E8LA 4WO9A 2LZ2A 3A96A 4O34A 4XJDA 1GF5A 4LFPA 1D6PA 2LZTA 3RNXA 4RLNA 4HTKA 4N5RA 4B0DA 1KIPC 4DDBA 4NEBA 4X3BA 3M3UA 4ETCA 5L3IA 5LAFA 1IP4A 3B0OA 3LYOA 208LA 1LMTA 1JISA 1LZEA 1LJ4A 1LMPA 3CSRA 1XGQC 4XADA 5F9XA 2BQAA 1BWJA 5K7OA 5F16A 3TXHA 1HELA 1GFVA 5LYZA 5L3HA 4TWSA 3RZ4A 2D4IA 1UA6Y 1C46A 2F4AA 1EL1A 1KXXA 4M6DA 1BQLY 4PPOA 1C08C 2ZQ4A 3ATNA 5LXWA 1OUFA 1HFYA 5DLAA 2BQIA 1QSAA 2FBDA 2FYDA 5KXKA 1QDTA 1JPOA 1J1OY 1LMNA 5I4WA 4WO6A 3CT5A 4MSTA 153LA 4NHQA 1DI5A 1MLCE 1LHHA 1XFPL 1HEPA 4NGLA 4OWHA 1GB3A 3LZ2A 1RJCB 1GE0A 2MEDA 2DBTA 4G4BA 1IX0A 1NKHA 135LA 2HU3A 2I6ZA 1JSEA 5DN5A 1V7SA 1GF6A 1LSPA 1IP2A 3TXFA 4HPEA 3WU7A 1LYYA 8LYZA 5F14A 1LSGA 4E3UA 4GCCA 1HSWA 1LZ8A 4DDCA 1LJEA 4KPMA 1LCNA 2D91A 2D6BA 4NGVA 1B7RA 1HMKA 1WQMA 4HV2A 4PJ2C 1C7PA 1RCMA 4PRQA 3W6FA 1A4VA 2HEDA 1FLWA 1GXXA 4XJIA 4DWXA 4ETAA 4TUNA 4P2EA 5L9JA 4YENA 4WG1A 1LSAA 1GWDA 2BLYA 1LHIA 1WVVA 4WLTA 5KXNA 3P65A 5C6IA 4EOFA 4ET8A 1WQRA 1CKCA 5LA5A 1B5YA 2BPUA 3AGIA 1JTPL 1I56A 1TEWA 1YIKA 4LT3A 4LZTA 4QEQA 2ZWBA 1LSFA 4IATA 2W1LA 3WXUA 1D0KA 3A6BY 2RSCA 4B1AA 4NSJA 1BHZA 4TTDA 1PS5A 1IP3A 4ZIXA 5FDJA 1GF7A 1JSFA 5II3A 5KJ9A 2EPEA 1BB3A 4J1BA 4PGJB 1LOZA 1XEIA 3D9AC 1KXYA 1LJNA 4CFPA 1D6QA 1TDYA 5LVGA 1ZVYB 1D9UA 4LT1A 1IR9A 1DPWA 5EBHA 2LYZA 3AGGG 4G9SA 2YBMA 1YAPA 4DD9A 1LZNA 1YANA 1LJKA 4W94A 1PZYA 4UWNA 2BQNA 2BQLA 2LYMA 4NG8A 1LHKA 1XGRC 1OUIA 5C6LA 1B7LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SSYA 2B6YA 1L79A 2WARA 228LA 1LYOA 5KY1A 4WM2A 5FSTA 6LYZA 4W56A 3AZ4A 1LSYA 3K3TA 1C66A 1L20A 1P37A 1JJ3A 1QUSA 2ZNWY 176LA 236LA 1IY4A 1L08A 1L34A 4J0LA 4GLVA 1OWYA 5B07A 3A67Y 1BB5A 205LA 1H87A 1DPXA 3DN8A 1C69A 1CUPA 3EMLA 1D0LA 1CJ7A 4GCDA 1IVMA 4YEOA 1OUGA 4Z98A 1YKYX 1LZRA 4R0FA 1L35A 3LZMA 3P64A 1C60A 1GAZA 4EPFA 3WMKA 178LA 3AGHA 1L51A 1OWZA 4BAFA 118LA 2DQGY 5B59A 4EMNA 3N9AA 2I26L 4H90A 2XBSA 1J1PY 1OUBA 1C63A 1JKDA 1GD6A 4WM1A 1GB2A 229LA 1WTMA 2BQBA 5HNCA 1LJ3A 1NMMA 217LA 3RZEA 1VEDA 188LA 1FLQA 4HJVA 3CDOA 3CDRA 196LA 259LA 1IP6A 103LA 4NWHA 4LDEA 1GFKA 1P46A 1OP9B 2N5ZA 1TLAA 1G0PA 1QS5A 142LA 1IWTA 1L80A 1LJGA 1GF4A 3W6AA 2NTHA 4IAPA 4NGJA 1BGIA 1UCOA 1JEFA 1LYDA 2H9KA 1L41A 3ZEKA 2G4QA 5B1FA 1LHLA 1L70A 1GE3A 2XJWA 5B06A 1YAQA 183LA 3MGWA 1L23A 1CNSA 1GHLA 1D2YA 1KIQC 165LA 4WOAA 4GN3A 2RBQA 1OUDA 1VFBC 4UWUA 1WTHA 1CV4A 3IWRA 3A3QA 4HP0A 3HFMY 1I1ZA 187LA 1D3FA 1KIRC 3TMXA 1B7QA 262LA 1DXJA 260LA 3VWOA 1NQIA 232LA 2DKVA 248LA 3DN1A 3HH6A 2HEAA 140LA 3HU9A 3LN2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3P66 A;  5APC A;  2G4N A;  3RT5 X;  1O23 A;  2WAR A;  1DQJ C;  4D9Z A;  1LYO A;  1NF5 A;  4WM2 A;  5KY1 A;  5FST A;  3TXE A;  4LYZ A;  6LYZ A;  1GPQ C;  1G7H C;  3AZ4 A;  4AGA A;  1LZT A;  4IAS A;  1BB7 A;  3A6C Y;  1G7I C;  1GDX A;  2DQE Y;  3WPK A;  1LSY A;  1KXW A;  1GF0 A;  3K3T A;  1LZA A;  3OK0 A;  1NDM C;  1LZS A;  1REY A;  1B5Z A;  2CDS A;  2ZIJ A;  1NWG A;  2A7D A;  1B9O A;  3AZ7 A;  1JTO L;  1ALC A;  3TXG A;  1GB6 A;  1D0M A;  2BQG A;  3IJU A;  5LA8 A;  2ZNX Y;  3AZ5 A;  5LAG A;  1LZ4 A;  1GFA A;  1JJ3 A;  1JWR A;  1QUS A;  3P68 A;  1SLY A;  1B5W A;  2ZNW Y;  1G7L C;  1OUE A;  1LZD A;  4LYO A;  1QUT A;  3T6U A;  1TAY A;  1JHL A;  3HBD A;  4H9F A;  1IY4 A;  1B2K A;  1UIC A;  1WQO A;  1ZV5 L;  3QE8 A;  2BAA A;  2BQF A;  4HTN A;  5HMJ A;  1CJ6 A;  1GBY A;  4J0L A;  4MCK A;  3TMU A;  4GCB A;  1IOS A;  4GLV A;  4NSH A;  5KXS A;  3ULR A;  154L A;  1A2Y C;  4LYB A;  5B07 A;  1B7N A;  5LVH A;  2H5Z A;  3A67 Y;  4RDS A;  4NSG A;  134L A;  4G4H A;  1BB5 A;  4WLY A;  3CT0 A;  1LZ1 A;  3AJN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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