4ZEEA

X-ray structure of the bis-platinum lysozyme adduct formed in the reaction between the protein and the two drugs cisplatin and oxaliplatin (preparation 2)
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Oxaliplatin vs. cisplatin: competition experiments on their binding to lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2015-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4zeeA00
1BQLY 4NG8A 1JHLA 4HTNA 4WLTA 3W6DA 2DQGY 2DQAA 4Z98A 3VWOA 9LYZA 1GE0A 3N9AA 2D4IA 2Z39A 1IR9A 2FBDA 1AT5A 3LYTA 3TXHA 1VFBC 2BPUA 2C8OA 1QUSA 5LIOA 1DQJC 1J1XY 2WARA 1IWYA 2LZ2A 1G7IC 5HMJA 4HJYA 4XJFA 4DDAA 1NKHA 1OUGA 1IWVA 1KXYA 2MEAA 1BB4A 3F6ZA 1FN5A 4GLAA 3A6CY 1LZGA 1XGRC 1GPQC 5KJ9A 4H91A 4J7VA 4CJ2A 1AZFA 1UIFA 1GF8A 1HEOA 1IOCA 1LSGA 2BQLA 2ZQ4A 4ML7A 4DYGA 194LA 1QIOA 1RCMA 1OQMA 3ZEKA 1GBXA 1YAMA 1HSXA 5KXOA 1GWDA 2FBBA 5FSTA 3TXBA 5B59A 1GBOA 2BAAA 1AKIA 3WU7A 1NBZC 5D5CA 5KKJA 2DQIY 3A92A 1XFPL 1GFHA 1IOTA 1CJ6A 1GE2A 3WXUA 2DQEY 2Y8PA 4YEMA 2HEAA 1EQ4A 5KXPA 5M1YA 1IWUA 1UCOA 1WQQA 4C3WA 5J7CA 3TXEA 4ETCA 1IP2A 4H8ZA 3TXJA 4NGVA 1LJHA 1YQVY 4GCBA 1B7PA 5B1GA 1CJ8A 1LSCA 1LYYA 2BQAA 1YANA 4GCDA 4IJ4A 3A90A 4NG1A 3E3DA 1GB9A 1JJ0A 2G4QA 3W6AA 5I4YA 1LSEA 2D4JA 1AM7A 5I5QA 4HP0A 4TTDA 1GFEA 1HMLA 3EMSA 1OUFA 2BQMA 1NMMA 4N9RA 2BLXA 1LHHA 1LSZA 1UA6Y 1BVXA 2BQDA 2X0AA 2BQIA 4NIJA 133LA 1LZ9A 208LA 1H87A 1YAQA 2G4PA 3AGIA 4OOOA 2A7FA 1SQ2L 3B0KA 5FEKA 3CT0A 2GV0A 3HBEX 1C45A 2Q0MX 1TDYA 3WXTA 1GB0A 3A6BY 4Z46A 3LHMA 1FLYA 4WM6A 4H9EA 4C5FA 2YDGA 1LHKA 3B0OA 1GE4A 1LJJA 5FCPA 1BGIA 1LYZA 3ATOA 1CKFA 3A95A 1IOQA 4LYBA 5I53A 4O34A 4A7DA 5KXYA 1LMQA 1N4FA 1FLWA 3J6KA 3T6UA 1GEZA 3A96A 4NSIA 4CHXA 4NEBA 1EQ5A 2EIZC 3A67Y 3A94A 3AZ5A 3CSQA 5KXRA 5EBHA 1BB3A 4WM3A 1YKXX 1HERA 4KT3A 3CSZA 4FJRA 1LMTA 5F9XA 4DT3A 154LA 1LZYA 6LYTA 3QE8A 1LZ1A 1LZNA 1B5YA 4NHQA 3N9CA 5ILFA 2D6BA 4HTKA 2MEGA 1D0LA 5I4WA 193LA 1PS5A 4GCEA 4B49A 1UICA 3CT1A 1LCNA 5DM9A 1I56A 1Z55A 3WW5A 4H92A 2ZNWY 4B4IA 1REXA 1GF6A 4W96A 4W94A 5ILCA 1GHLA 4LGKA 4QGZA 4DD0A 132LA 1HEWA 1VDSA 3CT5A 4MCKA 135LA 1IWZA 5FHWA 4RDSA 4DDBA 4NFVA 4OWBA 1G7LC 4UWVA 1QDTA 1YAPA 4H94A 4RLNA 2XBSA 1FKQA 1ALCA 3LYOA 4L41A 2DKVA 1GB3A 2I25L 1NHEA 4LT1A 4LYOA 4BADA 1WVUA 5KXMA 1LZ5A 5LINA 3AW7A 4NWEA 1LYOA 5C6IA 1BVKC 5KXWA 1LHMA 4BAPA 4WM1A 4PRUA 2MEHA 3TXGA 1LJIA 1C7PA 1GB2A 3A8ZA 2BQCA 2YBNA 2YBJA 2HEEA 4DD1A 1UUZC 1VATA 2HEDA 6LYZA 5DN5A 1LJEA 2Z2FA 3WW6A 3SP3A 4NHPA 4IATA 1LSNA 4R6CA 2BQNA 4NHIA 1IR7A 1BWJA 5L9JA 1HFZA 1VDQA 1HEPA 1LZEA 1KXXA 2D91A 5LXWA 1YAOA 5L3HA 1QDRA 1XGPC 1IWWA 1VDPA 3G3BB 5LYZA 1GBWA 4WLDA 1OP9B 5E9RA 1J1OY 2XJWA 4WMGA 1REYA 1IO5A 1YROA 2H9JA 4RW1A 5B1FA 3WYHA 1J1PY 1T3PA 2NWDX 1GFUA 1LZSA 1EQEA 1VAUA 5HNLA 4CGEA 4NSGA 1LZRA 5IELA 2HUBA 3WVYA 4LT2A 1GXV2 1C43A 2VB1A 2YSSC 5LAGA 1A4VA 207LA 2MEFA 3CSRA 3OK0A 1RI8B 1V7SA 1B5ZA 1GFVA 3W3EA 4NWHA 1ZMYL 4DWXA 2MEDA 5F14A 3GXKA 2N5ZA 1GFAA 3AYQA 1LOZA 3M18B 1JJ3A 4H9CA 5I54A 3AGGG 1BWIA 1F10A 3B72A 4ET9A 2HEFA 2LYMA 5LVIA 4WLYA 1OUEA 2MEEA 1GBSA 4ETDA 1JISA 5FDJA 2H5ZA 4MSTA 3LZTA 4YF2A 3IJUA 1DPWA 4LYZA 1B7LA 5LVGA 1LJFA 4AXTA 1GB8A 2BQJA 2MEIA 1JUGA 5DN4A 4H8XA 4DD7A 4GN3A 1WVVA 3B0IA 4WLXA 1LMAA 4TWSA 1HFYA 4WM2A 4ETBA 2LHMA 1IC7Y 1LJKA 1P2CC 3KAMA 1GFGA 1UIBA 1WTNA 1YL0X 1B7RA 4HJZA 5KXKA 1YILA 1WTMA 4E3UA 4NHSA 1UIEA 2PC2A 1DI3A 1WQNA 1JKCA 1UIHA 2YBMA 3AZ6A 4QDNA 3RW8A 2F4GA 1IP7A 1OUIA 3WUMA 4LZTA 1GF5A 4ZIXA 3A3QA 4G4HA 5KY1A 1NQIA 2I6ZA 2LYZA 1OUCA 1G7JC 4LYTA 1B9OA 5B07A 2IFFY 1BWHA 1F6RA 5IHGA 1LJ4A 4HV2A 3A3RX 1JKAA 1F6SA 1NDMC 2F4AA 3P64A 4PRQA 4NGZA 3FI7A 3B6LA 1I20A 1IWTA 5LAFA 4WG7A 3LN2A 5F81A 4OW1A 4H1PA 4IASA 5KXLA 1DXJA 4NGIA 5C6JA 5LYMA 1LZAA 4GLVA 4PPOA 4XN6A 4ETEA 1D9UA 4ZEEA 3QNGA 1XGUC 4U3XB 2BLYA 4XADA 4H9IA 4GN5C 3WH1A 4B1AA 3BKVA 1B2KA 1GDXA 1LSPA 1TAYA 1FKVA 4LT0A 1JIYA 2ZIJA 1TEWA 4TX7A 3TXFA 2CWIA 1HFXA 3ATNA 3AW6A 1LPIA 5APFA 2YBHA 3ULRA 1IIZA 4NGKA 5APDA 4ET8A 2FYCA 3TMXA 4HV1A 1IY4A 3A34A 1LKRA 1DKJA 1IP4A 1GB6A 4LYCA 4NGLA 1PZYA 1IEEA 4R0FA 4P2EA 4PHIA 1HSWA 1BHZA 2AUBA 3ZVQA 1D0KA 1D0MA 1OUHA 5LVHA 2W1MA 2EKSC 1QSWA 4XJBA 5HNCA 1B5WA 1JPOA 3HBDA 5F16A 4BAFA 2BQGA 2HECA 1WQMA 3A93A 4G9SA 1LZCA 5K7OA 1UBZA 2D4KA 4XENA 8LYZA 4WG1A 3WUAA 1B5UA 4H9FA 4H8YA 5II3A 1IP5A 5HMVA 4WO6A 1IORA 5DL9A 1IP6A 1CKHA 1HHLA 4NHTA 2BQFA 4UWUA 3WUNA 1I1ZA 1OUJA 1NBYC 4H9BA 1B7NA 1UIAA 3AJNA 5APEA 4N8ZA 3W6CA 1XGTC 3WVXA 4WM4A 1GF4A 2YVBA 1SLYA 3P66A 4J0LA 4LYMA 2BQEA 4HTQA 1IWXA 2HTXA 1LJNA 4OOTA 3N9EA 3ZVQB 1GEVA 5L3IA 5AMYA 2Z37A 4B4EA 1XGQC 3BKHA 2RSCA 3GXRA 5KXNA 2FYDA 3T36A 4NGYA 4DDCA 2Z38A 4OWCA 2EPEA 1QQYA 1RJCB 4WM5A 1LZ4A 5APCA 1CKGA 4GN4A 3RT5X 3P4ZA 4TUNA 4XJIA 4ETAA 1GE1A 1QTEA 1G7HC 1OUBA 1QUTA 2CJLA 5LA5A 1LZDA 4N5RA 2ZYPA 2DBTA 1GFRA 4NGWA 1C46A 1OUAA 2YBIA 4CFPA 3P68A 1LSYA 1LSFA 1JKDA 1HEMA 4KL7A 2HU3A 4PGJB 4M6DA 2B5ZA 4RW2A 3AB6A 1GD6A 1YL1X 4H9AA 1B7SA 1OUDA 2A7DA 1IOSA 1WQPA 1IP1A 4WOAA 3M3UA 3IWRA 1GBZA 1JTOL 1HMKA 4WO9A 3P65A 2ZQ3A 2XBRA 1AT6A 4UWNA 3RU5A 2IHLA 1LYSA 1XEIA 2Z12A 1EL1A 2F30A 2Z19A 1GF7A 1KIPC 1NF5A 2MEBA 2ZIKA 1RFPA 1NWGA 4FDYA 4LFXA 1IP3A 2Z18A 3QY4A 1IX0A 4WL6A 1REMA 3EO5A 5T3FA 3TXKA 3K3TA 1VDTA 2YBLA 2C8PA 134LA 3G3AB 4XJDA 4ZFPA 1C10A 1LTMA 1LHLA 1GFTA 1DI4A 2HU1A 1INUA 4QEQA 4XJHA 4J1BA 5IDDA 5LA8A 1LZBA 4QY9A 5A3EA 1LZ6A 1YKZX 2F2NA 3HFMY 1LJGA 3IJVA 4GCFA 3AGHA 5KXZA 2ZYCA 4Z3MA 3TXDA 5KXTA 3RZ4A 2HEBA 5I4XA 2W1LA 1D6QA 2ZNXY 1GFJA 1XEKA 5JENB 1B7OA 4I8SA 1XSFA 1LSMA 1ZVYB 4H90A 4X3BA 1REZA 1JWRA 1GF0A 4BS7A 4LFPA 5B05A 1BB5A 4G49A 1A2YC 1MELL 4GCCA 4YM8A 1JJ1A 1RE2A 2CDSA 3D9AC 1JTPL 1CJ7A 1HENA 3LYMA 1IR8A 5E4PA 1C08C 1IVMA 1FLQA 1LMCA 2LZTA 3EBAB 3WU8A 4J1AA 1WQRA 4OWAA 4NSHA 2DQFC 4RLMA 5D5FA 5F9UA 3TMVA 1GFKA 1B0DA 1ZVHL 5FELA 1DZBX 4OWHA 1CKDA 1QSAA 4NGOA 1HELA 2CGIA 1LSBA 3WULA 4DC4A 1HF4A 1CKCA 4CFOA 2LYOA 1ZV5L 1E8LA 1LMNA 1BB6A 1LHIA 2BQKA 1LJ3A 2BQHA 4HPIA 1WQOA 1T6VL 2EQLA 2DQHY 4EOFA 3CQLA 1W08A 1UC0A 1YKYX 2I26L 4DD9A 1B7MA 5HQ1A 2W1YA 3CB7A 1LHJA 3J4GA 1YIKA 4HJVA 3W6BA 3W6FA 2W1XA 1GAYA 4TSBA 4G4CA 1O23A 1V7TA 1JSEA 2BQOA 4OWEA 4HPEA 4ANRA 5LYTA 3WPLA 5B06A 1D6PA 3WU9A 3AZ4A 1GBYA 1LSAA 1IC4Y 1LSDA 4DD2A 4Z41A 3WPJA 4NY5A 1HEQA 4XJGA 2DQCY 2ZWBA 1LAAA 1NDGC 4NSJA 1GDWA 3TMUA 5HLLA 1CJ9A 1DI5A 1H6MA 1DKKA 4I0CA 5DLAA 1VEDA 4G4BA 5LVJA 1UACY 4YENA 1CNSA 3HBHA 4KPMA 1B7QA 1GE3A 3RNXA 4EMNA 4M4OA 1IY3A 1JKBA 1FBIX 5KXSA 4WL7A 4DD3A 7LYZA 2Z2EA 4TSCA 3A91A 1GXXA 1TBYA 3EXDA 3LZ2A 1BB7A 1GB7A 2DQDY 1LZ8A 2H9KA 1LMPA 1B5XA 1F0WA 1TCYA 1LMOA 2DQJY 2MECA 5KXXA 2ZILA 3WL2A 4YOPA 1JITA 4LT3A 1FDLY 1UIDA 1HC0A 3W6EA 1KIQC 1XEJA 4H93A 4B4JA 4MR1A 1UIGA 4AGAA 4D9ZA 1KXWA 3AZ7A 4NGJA 1GF3A 2XTHA 4N1EI 3WMKA 3WPKA 1JEFA 4XYYA 2G4NA 2BQBA 4HSFA 1IC5Y 4N0JA 3TMWA 5A3ZA 1GB5A 1W6ZA 1JTTL 1GF9A 4B0DA 1GAZA 1DPXA 3OJPA 4N1CC 5C6LA 1HNLA 3LYZA 3TXIA 1MLCE 4II8A 1JSFA 5LVKA 4H9HA 1B5VA 4KXIA 1KIRC 153LA 1G7MC 1LKSA 4YEOA 4PJ2C 3MGWA 1QTKA 3FE0A 3D3DA 5KKIA 1FLUA 1LZTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NG8A 4HTNA 4Z98A 9LYZA 1IR9A 3TXHA 222LA 4EKRA 1J1XY 1OUGA 161LA 5LZMA 1P2LA 4EXMA 2MEAA 1BB4A 1LZGA 1XGRC 4J7VA 1AZFA 1PQOA 1GF8A 4ML7A 212LA 1QIOA 3ZEKA 1L18A 3TXBA 2FBBA 1L59A 2BAAA 1AKIA 3WU7A 192LA 1PQMA 4W54A 1CJ6A 4YEMA 1EQ4A 3SB9A 1UCOA 2OU8A 4C3WA 4ETCA 3TXJA 1G1WA 1LJHA 4GCBA 4GCDA 1CJ8A 1LSCA 1QS9A 1YANA 3E3DA 2D4JA 5I5QA 164LA 1L67A 4TTDA 3EMSA 1L32A 2X0AA 3DN4A 4NIJA 169LA 133LA 1H87A 3HUQA 2B73A 1SQ2L 5FEKA 3CT0A 1L73A 186LA 2Q0MX 1L70A 3LHMA 4H9EA 3B0OA 3C7ZA 155LA 1CKFA 3A95A 4I7RA 5KXYA 1N4FA 1FLWA 3J6KA 1DYEA 4NSIA 1EQ5A 4KT3A 3CSZA 2O79A 1LMTA 4DT3A 4EKPA 3N9CA 4HTKA 5I4WA 4GCEA 1UICA 1LCNA 151LA 1L98A 3WW5A 1GF6A 4W94A 4QGZA 3FA0A 131LA 237LA 4ARJA 4OWBA 1G0PA 1L23A 1FKQA 4IAPA 1LYFA 1NHEA 1SX2A 4BADA 2QARC 1B6IA 4NWEA 5C6IA 3C81A 104LA 4WM1A 2MEHA 3HH5A 1GB2A 2YBNA 4YX7C 2HEDA 109LA 4NHPA 223LA 2BQNA 4NHIA 1BWJA 1VDQA 3HT7A 1CV6A 1QDRA 3G3BB 5LYZA 1OP9B 2XJWA 5B1FA 1IO5A 4RW1A 1J1PY 5HNLA 1VAUA 4CGEA 162LA 2HUBA 211LA 1GXV2 2RBRA 2YSSC 3OK0A 4NWHA 2MEDA 3GXKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1BQL Y;  4NG8 A;  1JHL A;  4HTN A;  4WLT A;  3W6D A;  2DQG Y;  2DQA A;  4Z98 A;  3VWO A;  9LYZ A;  1GE0 A;  3N9A A;  2D4I A;  2Z39 A;  1IR9 A;  2FBD A;  1AT5 A;  3LYT A;  3TXH A;  1VFB C;  2BPU A;  2C8O A;  1QUS A;  5LIO A;  1DQJ C;  1J1X Y;  2WAR A;  1IWY A;  2LZ2 A;  1G7I C;  5HMJ A;  4HJY A;  4XJF A;  4DDA A;  1NKH A;  1OUG A;  1IWV A;  1KXY A;  2MEA A;  1BB4 A;  3F6Z A;  1FN5 A;  4GLA A;  3A6C Y;  1LZG A;  1XGR C;  1GPQ C;  5KJ9 A;  4H91 A;  4J7V A;  4CJ2 A;  1AZF A;  1UIF A;  1GF8 A;  1HEO A;  1IOC A;  1LSG A;  2BQL A;  2ZQ4 A;  4ML7 A;  4DYG A;  194L A;  1QIO A;  1RCM A;  1OQM A;  3ZEK A;  1GBX A;  1YAM A;  1HSX A;  5KXO A;  1GWD A;  2FBB A;  5FST A;  3TXB A;  5B59 A;  1GBO A;  2BAA A;  1AKI A;  3WU7 A;  1NBZ C;  5D5C A;  5KKJ A;  2DQI Y;  3A92 A;  1XFP L;  1GFH A;  1IOT A;  1CJ6 A;  1GE2 A;  3WXU A;  2DQE Y;  2Y8P A;  4YEM A;  2HEA A;  1EQ4 A;  5KXP A;  5M1Y A;  1IWU A;  1UCO A;  1WQQ A;  4C3W A;  5J7C A;  3TXE A;  4ETC A;  1IP2 A;  4H8Z A;  3TXJ A;  4NGV A;  1LJH A;  1YQV Y;  4GCB A; 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 2W1X A;  1GAY A;  4TSB A;  4G4C A;  1O23 A;  1V7T A;  1JSE A;  2BQO A;  4OWE A;  4HPE A;  4ANR A;  5LYT A;  3WPL A;  5B06 A;  1D6P A;  3WU9 A;  3AZ4 A;  1GBY A;  1LSA A;  1IC4 Y;  1LSD A;  4DD2 A;  4Z41 A;  3WPJ A;  4NY5 A;  1HEQ A;  4XJG A;  2DQC Y;  2ZWB A;  1LAA A;  1NDG C;  4NSJ A;  1GDW A;  3TMU A;  5HLL A;  1CJ9 A;  1DI5 A;  1H6M A;  1DKK A;  4I0C A;  5DLA A;  1VED A;  4G4B A;  5LVJ A;  1UAC Y;  4YEN A;  1CNS A;  3HBH A;  4KPM A;  1B7Q A;  1GE3 A;  3RNX A;  4EMN A;  4M4O A;  1IY3 A;  1JKB A;  1FBI X;  5KXS A;  4WL7 A;  4DD3 A;  7LYZ A;  2Z2E A;  4TSC A;  3A91 A;  1GXX A;  1TBY A;  3EXD A;  3LZ2 A;  1BB7 A;  1GB7 A;  2DQD Y;  1LZ8 A;  2H9K A;  1LMP A;  1B5X A;  1F0W A;  1TCY A;  1LMO A;  2DQJ Y;  2MEC A;  5KXX A;  2ZIL A;  3WL2 A;  4YOP A;  1JIT A;  4LT3 A;  1FDL Y;  1UID A;  1HC0 A;  3W6E A;  1KIQ C;  1XEJ A;  4H93 A;  4B4J A;  4MR1 A;  1UIG A;  4AGA A;  4D9Z A;  1KXW A;  3AZ7 A;  4NGJ A;  1GF3 A;  2XTH A;  4N1E I;  3WMK A;  3WPK A;  1JEF A;  4XYY A;  2G4N A;  2BQB A;  4HSF A;  1IC5 Y; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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