4ZEEA

X-ray structure of the bis-platinum lysozyme adduct formed in the reaction between the protein and the two drugs cisplatin and oxaliplatin (preparation 2)
Total Genus 47

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTI'1 (36-39)3H4 (120-124)AH1 (5-15)TII4 (124-127)TII1 (17-20)AH3 (88-100)AH2 (25-36)3H1 (20-22)AH4 (109-115)TI3 (54-57)S1 (43-45)S2 (51-53)TI2 (46-49)TI4 (59-62)S3 (58-59)TIV1 (60-63)TI5 (74-77)TII2 (69-72)TIV2 (66-69)3H2 (80-83)TVIII1 (85-88)TIV3 (101-104)3H3 (104-107)TII3 (115-118)O1 (118-120)TI1 (39-42)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
publication title Oxaliplatin vs. cisplatin: competition experiments on their binding to lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2015-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4zeeA00
1CJ8A 3P4ZA 2BQBA 1HERA 1JJ3A 1GPQC 2B5ZA 1LZEA 4J1AA 1CKDA 1GFUA 1JTTL 1WQOA 1B7MA 1C10A 1GB5A 3WW6A 1SQ2L 1YAMA 4LGKA 1FKVA 1HMKA 2LYOA 3P68A 1V7TA 1J1XY 2BPUA 2HU3A 5APDA 2LZTA 1H87A 4ZFPA 3G3BB 3KAMA 1VFBC 1DPWA 5I4XA 3AW7A 4QDNA 4XJIA 1GFAA 1LSFA 3W6FA 4YF2A 1LTMA 1LHHA 4NHQA 3N9AA 3HBHA 4OOOA 2DQHY 3WU8A 1GXXA 1XEJA 2BQIA 1JSEA 1LOZA 4XJBA 5FSTA 3CT1A 1NBZC 3TMXA 1IP1A 4MSTA 5II3A 2Z37A 2N5ZA 5LYMA 1XGTC 3W6CA 3AGHA 1CNSA 5KJ9A 1LMNA 1OUAA 3LZTA 1LSGA 4BADA 1D9UA 4N5RA 1HEPA 1GFJA 1LKSA 1B2KA 6LYTA 1B7RA 1B0DA 5KY1A 1N4FA 4R6CA 1SLYA 2FBDA 1GFEA 3CSZA 2MEAA 3CT0A 1AM7A 1LMQA 4YEOA 2X0AA 4LYZA 4ETBA 1GF8A 3J6KA 3AYQA 1REMA 5FCPA 2FYCA 1WTMA 5KXMA 4HV2A 3AW6A 3CSQA 4B49A 1O23A 4OWCA 1OUDA 1ZMYL 1WQQA 4ET9A 1GFVA 4HPIA 5HMJA 2IHLA 5D5CA 4WLXA 4GCBA 4UWVA 5KXTA 1JJ1A 2H5ZA 1B5WA 1YANA 5ILCA 3A90A 3TXJA 1LZTA 2ZQ3A 1LHLA 5LVJA 1CKGA 1OUEA 1GXV2 1I1ZA 1UC0A 3MGWA 1JJ0A 4OWBA 1LYSA 2MEIA 4I0CA 1H6MA 1LJ4A 1LJKA 3WYHA 1LZBA 1KXWA 3P64A 5HQ1A 3WUNA 1UUZC 1IR8A 4LFPA 4AXTA 4TX7A 1LAAA 1GE3A 1GEZA 1LHKA 3A8ZA 1NWGA 1KIPC 1UIDA 1OP9B 1RE2A 1LJIA 4YOPA 1YKZX 4NGIA 2ZWBA 4B4JA 2ZIKA 1RFPA 1OUGA 2XJWA 4B4EA 1W08A 4LYCA 4B4IA 1YKYX 4ZIXA 1DKKA 3RZ4A 3WULA 5A3EA 2BQJA 4QEQA 4YEMA 1JWRA 3CQLA 1LSEA 1B5XA 1WQPA 4Z46A 1YILA 4C3WA 1IORA 207LA 3N9CA 5LVKA 1AT5A 1FLQA 4HTQA 1GFGA 1QTEA 1LJGA 2HEFA 5F81A 5HNCA 4WLTA 1B5VA 1JKCA 1UBZA 1ZVHL 1P2CC 1D6QA 1LHIA 1QIOA 1F0WA 1DXJA 5KXWA 2Z19A 1IR7A 1UA6Y 1G7IC 1GE0A 2DQGY 4G49A 4NFVA 1DZBX 3G3AB 1BVKC 1GFRA 5K7OA 5KXOA 1IP6A 1IP2A 4LYMA 5DM9A 1XEKA 2XBRA 4WMGA 1UIHA 4HJVA 4D9ZA 9LYZA 4NGYA 3A6CY 4XYYA 3W6EA 1B7PA 4ETDA 1RJCB 1GBOA 3IJVA 5LA8A 4OW1A 4ETAA 4H1PA 1JKBA 5FEKA 2DQDY 4OWEA 135LA 4N8ZA 1CKHA 2CJLA 4Z3MA 4GN3A 5LAFA 5DN5A 1XGQC 1GFHA 5B1FA 2EKSC 208LA 1OQMA 4LT3A 1B5ZA 5L9JA 1LZ1A 1BB3A 1OUFA 1UACY 5J7CA 3ATNA 1G7JC 1TDYA 1PZYA 3AZ6A 5I4YA 2C8OA 4Z98A 1IY3A 2LHMA 4CFPA 5LXWA 2BQLA 1KIQC 5LINA 1BB4A 1BHZA 4HP0A 5APFA 1LYYA 1GB9A 1GAZA 2BQKA 1LHJA 1Z55A 2BQHA 2D6BA 2Y8PA 5B07A 4H8YA 4LFXA 3T36A 3WVXA 3BKVA 1NHEA 4DD3A 4DD0A 6LYZA 4GCFA 1GBXA 4N1CC 1TAYA 1RI8B 3LYOA 3WUAA 1HFYA 132LA 1IWWA 1VDQA 4O34A 1IWXA 4NGVA 1BVXA 3RU5A 1LSDA 5LYTA 3A92A 3IWRA 1UIGA 1DI5A 5APEA 3RW8A 1IC5Y 3M18B 4U3XB 5JENB 4NGOA 1HENA 1LZNA 2DBTA 2YBHA 134LA 5DL9A 3A3QA 1BB5A 1ZVYB 1QUTA 2CWIA 3D3DA 2BLYA 2DQIY 3HBDA 4HJZA 4DWXA 2G4QA 1BB7A 5F14A 1HFZA 2Z39A 4GCDA 4PRUA 1QQYA 1IWYA 2F30A 2I25L 5E4PA 1PS5A 2ZQ4A 4OWAA 5HLLA 5F9XA 4NGWA 2ZYPA 1C7PA 1BWIA 5FELA 4KT3A 2ZYCA 1LZ6A 5KXLA 2W1MA 5B06A 1BQLY 3AZ7A 4DDAA 1LHMA 4NHPA 1GBZA 1VDPA 4N9RA 1IOCA 3A3RX 2XTHA 4HTKA 2DQAA 4DD9A 4TSCA 1CKFA 1GDWA 1KIRC 1RCMA 4Z41A 5KKIA 5L3IA 1JKDA 2BQGA 2MEBA 4ML7A 4WL7A 3WUMA 4GCCA 1GB7A 4L41A 1INUA 7LYZA 1GBSA 1LCNA 1T6VL 2HEBA 4UWNA 3WMKA 3LN2A 3QY4A 4HV1A 3TXKA 2D4KA 3ULRA 1DPXA 3ZVQB 1FLYA 4H9EA 1WVUA 1HEOA 1BGIA 4H8ZA 4H9IA 1XGUC 2Z12A 4NHSA 2AUBA 4XJGA 5KXPA 1NBYC 2CDSA 4J7VA 1QSAA 3A91A 3EO5A 1DKJA 2FYDA 1LJNA 4WG7A 194LA 5EBHA 5I54A 4XN6A 154LA 1LYOA 1C08C 5LVIA 1VATA 1GF3A 1CJ7A 1GB3A 4PGJB 1D6PA 1JUGA 2DQEY 1F6SA 1HF4A 3CB7A 4NSHA 1IIZA 4G4CA 4H90A 3AJNA 4W94A 3A34A 1GF4A 1LJFA 1TCYA 3AGGG 5L3HA 2Z2EA 4IJ4A 4J0LA 1LSNA 2G4PA 1HEQA 5B1GA 3TXHA 1FKQA 2H9JA 1GBWA 4DDCA 4HSFA 1YKXX 2ZNWY 1LZ8A 3WL2A 2HEDA 1IR9A 4NG8A 2IFFY 1REXA 5KXKA 1V7SA 2PC2A 3WPLA 4XJDA 4YENA 1UIBA 3RT5X 1OUHA 1B7NA 193LA 1IWTA 1GAYA 1IOTA 1GE4A 2EQLA 1B7QA 2W1YA 4GLVA 3TMVA 4B1AA 4QY9A 4CJ2A 4BAPA 4DC4A 2NWDX 3QE8A 133LA 4H91A 5KXSA 1LJHA 1OUCA 2CGIA 4WM5A 4M6DA 2I26L 2Q0MX 3TMWA 3F6ZA 1LSPA 4H9HA 3SP3A 5I53A 5LVGA 3W6DA 1IVMA 1B5UA 2VB1A 3EXDA 1BB6A 2ZILA 3W3EA 2LYZA 4N1EI 4MCKA 4WM6A 1VAUA 4WM2A 1D0LA 4GN5C 4NHIA 4ET8A 5C6JA 4G9SA 1IC4Y 2C8PA 1YIKA 4WO9A 4DD2A 2MEEA 1QDRA 1LZSA 1A2YC 1UIAA 4LZTA 4H9BA 3LYTA 4TUNA 4R0FA 5HNLA 4EOFA 5D5FA 4AGAA 2W1LA 4NSGA 1B7LA 3WPKA 3A6BY 1LZAA 3WH1A 1B7OA 1BWHA 1HEMA 1LPIA 4CHXA 1HC0A 3B72A 1JEFA 3A94A 1LMOA 2DKVA 2HUBA 3VWOA 1I20A 1DI3A 1LZDA 2HU1A 4DD7A 5F16A 5LIOA 2BQFA 1D0MA 4H9CA 1YL0X 4NG1A 1LJJA 1A4VA 1IWVA 1C46A 3D9AC 1ZV5L 2ZNXY 5E9RA 3GXKA 1KXYA 3J4GA 4KL7A 4NHTA 8LYZA 2F4GA 5C6LA 4NWHA 5APCA 1QSWA 1LMTA 2LZ2A 1EQEA 2I6ZA 2Z2FA 1CJ9A 2BQNA 1GFKA 1DQJC 1QDTA 4PJ2C 4WL6A 4RW2A 1UIEA 1LSZA 153LA 1B7SA 4G4HA 1J1OY 1GB6A 2F4AA 4H92A 2YDGA 4RDSA 1NMMA 3OK0A 4H94A 4DDBA 4DYGA 1NDGC 4WLDA 3TXDA 1B5YA 4IATA 1GWDA 5M1YA 2D4JA 1JISA 2DQFC 2BLXA 1FDLY 4NSJA 3W6BA 2A7DA 1YAPA 1I56A 1FN5A 3WXUA 1IOQA 1HMLA 3A96A 3TXBA 2G4NA 3WU9A 3B0KA 1GB8A 1XGPC 3LYMA 3T6UA 5KXZA 1GBYA 1LJEA 1NDMC 1EL1A 1JIYA 4XJHA 4YM8A 1BWJA 2F2NA 1B9OA 2YBIA 4NSIA 5LA5A 5IDDA 1LMCA 1IP4A 1YROA 4ZEEA 4H9FA 5KKJA 1AKIA 1LZ4A 1VDTA 4GCEA 5DN4A 1FBIX 3WPJA 2XBSA 2MEGA 1OUJA 1IP7A 1LSYA 3E3DA 3ZEKA 2HTXA 1QTKA 2MEHA 2DQCY 4MR1A 4NGJA 1ALCA 1LZRA 4WM4A 1YL1X 1LKRA 1GEVA 1IP5A 1GF0A 2H9KA 3EBAB 4KPMA 1C43A 1KXXA 4P2EA 4I8SA 3WXTA 2A7FA 3ZVQA 4HJYA 4GN4A 4NIJA 4ETEA 1GFTA 1HEWA 1LSBA 1XSFA 2YBNA 1OUIA 3BKHA 1IWUA 1J1PY 1XEIA 1XGRC 2D91A 2MECA 1WQRA 1WQMA 1JTPL 4WG1A 4GLAA 4TWSA 1C45A 2BQDA 1IWZA 3FE0A 4LYTA 5DLAA 1JTOL 4NGKA 5IELA 5KXNA 4M4OA 3RNXA 2MEDA 4FDYA 4WO6A 4WM1A 1FLUA 1GF9A 1GB2A 2Z18A 3AZ4A 1HNLA 1YQVY 1GE1A 3TXEA 1GB0A 4H9AA 4N0JA 4E3UA 1YAOA 2W1XA 3A67Y 3IJUA 1GHLA 4X3BA 3CSRA 2BQCA 1GDXA 2YBJA 3TXGA 2YSSC 1T3PA 5LYZA 3AZ5A 1LSAA 4OOTA 5KXXA 3HBEX 5ILFA 5C6IA 1IP3A 4BAFA 1LMAA 3P65A 2HEAA 3EMSA 3LYZA 4PPOA 1LZCA 1AT6A 1JHLA 5I5QA 4J1BA 1LZ5A 2MEFA 1GE2A 3A93A 4BS7A 2BQMA 4HTNA 4NY5A 4A7DA 1GF7A 4DD1A 2YBLA 3TMUA 1VDSA 1CJ6A 1LZ9A 3ATOA 1IX0A 4KXIA 3B0OA 1EQ4A 1MELL 1OUBA 4XENA 5I4WA 3OJPA 4B0DA 1IOSA 1IY4A 5B59A 5B05A 1W6ZA 1JPOA 4CGEA 2HECA 4RW1A 3WVYA 3WU7A 1AZFA 1JKAA 1QUSA 2EPEA 2D4IA 3AB6A 4HPEA 1F10A 1LZGA 2Z38A 4H8XA 4NEBA 4NWEA 5A3ZA 2EIZC 4RLMA 1IO5A 4TSBA 4WLYA 1JITA 1TEWA 1REZA 5FHWA 1LJ3A 4OWHA 5F9UA 1D0KA 2FBBA 5T3FA 4EMNA 2BAAA 1NF5A 2RSCA 3N9EA 4LYBA 1HSXA 1HFXA 4FJRA 1GD6A 1IEEA 1UICA 4II8A 4CFOA 4WOAA 3TXFA 1MLCE 1CKCA 1WVVA 4LYOA 4PHIA 1HSWA 1G7MC 3B0IA 1LYZA 1JSFA 3M3UA 4NGLA 1WTNA 4NGZA 5KXYA 4WM3A 1WQNA 3AGIA 1EQ5A 1VEDA 4LT2A 1TBYA 4DT3A 1DI4A 1REYA 1HHLA 3GXRA 2HEEA 3WW5A 1YAQA 1LZYA 2BQEA 1LSCA 1G7LC 3A95A 5AMYA 1UCOA 5KXRA 3TXIA 4LT1A 5IHGA 3P66A 3CT5A 4PRQA 4QGZA 4UWUA 4XJFA 5LAGA 3LZ2A 4G4BA 2GV0A 2YBMA 3B6LA 5HMVA 1G7HC 4C5FA 2DQJY 4RLNA 2BQAA 4IASA 1F6RA 3W6AA 1GF6A 1NQIA 2YVBA 3FI7A 1GF5A 1LSMA 2WARA 1E8LA 4ANRA 1XFPL 3QNGA 4XADA 3HFMY 1HELA 1IC7Y 1NKHA 2BQOA 2ZIJA 3LHMA 4W96A 4LT0A 1UIFA 3K3TA 5FDJA 4ETCA 5LVHA 4H93A 1LMPA 2LYMA 1FLWA 4TTDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OV5A 2BQBA 1JJ3A 2OU9A 4J1AA 1CKDA 1GFUA 1QTVA 1WQOA 1B7MA 1YAMA 2LYOA 1L43A 5APDA 3KAMA 1L37A 1TLAA 3AW7A 2IGCA 1L41A 4OOOA 2DQHY 210LA 5FSTA 1LOZA 1IP1A 2Z37A 3W6CA 3AGHA 167LA 178LA 4N5RA 180LA 1N4FA 1G0JA 103LA 1DYBA 4W56A 5FCPA 1CV0A 4HV2A 3AW6A 3CSQA 1O23A 1ZMYL 2NTGA 2F47A 2IHLA 260LA 5KXTA 1B5WA 5ILCA 1D2YA 1CKGA 1QT5A 1L16A 1GXV2 1JJ0A 4DQ7A 1UUZC 4LFPA 1OP9B 4YOPA 1RFPA 1W08A 4W52A 1YKYX 2BQJA 4QEQA 1LSEA 1B5XA 4I7JA 4YXAC 1L28A 5LVKA 1AT5A 4HTQA 1L36A 1GFGA 3DN2A 231LA 4WLTA 107LA 146LA 1LHIA 1T8GA 1KNIA 1UA6Y 4NFVA 1DZBX 1GFRA 4LYMA 1KW5A 4WMGA 4D9ZA 1LYEA 3A6CY 4XYYA 1C69A 3IJVA 4H1PA 1JKBA 2OU8A 135LA 1L02A 1L57A 4Z3MA 5LAFA 5DN5A 5B1FA 2EKSC 1B5ZA 214LA 1PZYA 1IY3A 1L64A 188LA 1GB9A 1QS5A 1L26A 4GRVA 4H8YA 3WVXA 127LA 6LYZA 4N1CC 3WUAA 1HFYA 1C6TA 4O34A 1BVXA 1L97A 1L74A 4U3XB 3M18B 4S0WA 196LA 2DBTA 3HDFA 2YBHA 1T6HA 2BLYA 4HJZA 4DWXA 4PRUA 1QQYA 2I25L 1OVKA 1DYDA 5F9XA 2ZYPA 1PQDA 1C63A 1QT7A 4W53A 1BWIA 1LZ6A 168LA 1BQLY 238LA 4DDAA 4NHPA 3A3RX 1B6IA 4DD9A 4TSCA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1CJ8 A;  3P4Z A;  2BQB A;  1HER A;  1JJ3 A;  1GPQ C;  2B5Z A;  1LZE A;  4J1A A;  1CKD A;  1GFU A;  1JTT L;  1WQO A;  1B7M A;  1C10 A;  1GB5 A;  3WW6 A;  1SQ2 L;  1YAM A;  4LGK A;  1FKV A;  1HMK A;  2LYO A;  3P68 A;  1V7T A;  1J1X Y;  2BPU A;  2HU3 A;  5APD A;  2LZT A;  1H87 A;  4ZFP A;  3G3B B;  3KAM A;  1VFB C;  1DPW A;  5I4X A;  3AW7 A;  4QDN A;  4XJI A;  1GFA A;  1LSF A;  3W6F A;  4YF2 A;  1LTM A;  1LHH A;  4NHQ A;  3N9A A;  3HBH A;  4OOO A;  2DQH Y;  3WU8 A;  1GXX A;  1XEJ A;  2BQI A;  1JSE A;  1LOZ A;  4XJB A;  5FST A;  3CT1 A;  1NBZ C;  3TMX A;  1IP1 A;  4MST A;  5II3 A;  2Z37 A;  2N5Z A;  5LYM A;  1XGT C;  3W6C A;  3AGH A;  1CNS A;  5KJ9 A;  1LMN A;  1OUA A;  3LZT A;  1LSG A;  4BAD A;  1D9U A;  4N5R A;  1HEP A;  1GFJ A;  1LKS A;  1B2K A;  6LYT A;  1B7R A;  1B0D A;  5KY1 A;  1N4F A;  4R6C A;  1SLY A;  2FBD A;  1GFE A;  3CSZ A;  2MEA A;  3CT0 A;  1AM7 A;  1LMQ A;  4YEO A;  2X0A A;  4LYZ A;  4ETB A;  1GF8 A;  3J6K A;  3AYQ A;  1REM A;  5FCP A;  2FYC A;  1WTM A;  5KXM A;  4HV2 A;  3AW6 A; 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 1IY4 A;  5B59 A;  5B05 A;  1W6Z A;  1JPO A;  4CGE A;  2HEC A;  4RW1 A;  3WVY A;  3WU7 A;  1AZF A;  1JKA A;  1QUS A;  2EPE A;  2D4I A;  3AB6 A;  4HPE A;  1F10 A;  1LZG A;  2Z38 A;  4H8X A;  4NEB A;  4NWE A;  5A3Z A;  2EIZ C;  4RLM A;  1IO5 A;  4TSB A;  4WLY A;  1JIT A;  1TEW A;  1REZ A;  5FHW A;  1LJ3 A;  4OWH A;  5F9U A;  1D0K A;  2FBB A;  5T3F A;  4EMN A;  2BAA A;  1NF5 A;  2RSC A;  3N9E A;  4LYB A;  1HSX A;  1HFX A;  4FJR A;  1GD6 A;  1IEE A;  1UIC A;  4II8 A;  4CFO A;  4WOA A;  3TXF A;  1MLC E;  1CKC A;  1WVV A;  4LYO A;  4PHI A;  1HSW A;  1G7M C;  3B0I A;  1LYZ A;  1JSF A;  3M3U A;  4NGL A;  1WTN A;  4NGZ A;  5KXY A;  4WM3 A;  1WQN A;  3AGI A;  1EQ5 A;  1VED A;  4LT2 A;  1TBY A;  4DT3 A;  1DI4 A;  1REY A;  1HHL A;  3GXR A;  2HEE A;  3WW5 A;  1YAQ A;  1LZY A;  2BQE A;  1LSC A;  1G7L C;  3A95 A;  5AMY A;  1UCO A;  5KXR A;  3TXI A;  4LT1 A;  5IHG A;  3P66 A;  3CT5 A;  4PRQ A;  4QGZ A;  4UWU A;  4XJF A;  5LAG A;  3LZ2 A;  4G4B A;  2GV0 A;  2YBM A;  3B6L A;  5HMV A;  1G7H C;  4C5F A;  2DQJ Y; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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