4A7DA

X-ray crystal structure of hewl flash-cooled at high pressure
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME C
publication title Fast High-Pressure Freezing of Protein Crystals in Their Mother Liquor
pubmed doi rcsb
total genus 41
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-11-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4a7dA00
3P64A 3TXKA 3FE0A 1IP1A 1OUFA 1D0MA 1QDRA 4OWBA 2HECA 1UIGA 5L3HA 3LYZA 1IP2A 2DQDY 4OW1A 1RE2A 1HEWA 5APFA 4GN5C 1XGRC 1JKDA 2ZYCA 4MCKA 2LZ2A 2DQHY 1CKHA 4XYYA 5I53A 1HMKA 3RW8A 2BQDA 1LSGA 3RU5A 4CGEA 2BQGA 3AJNA 1FLYA 3P4ZA 2BLYA 3A91A 1YAOA 4NGVA 1JTOL 4WOAA 4DD0A 3CSZA 4J0LA 5KXSA 1B2KA 1BWHA 1OUCA 1YIKA 2A7DA 1OUBA 1BGIA 2FYDA 1GF4A 2PC2A 3AW7A 3RT5X 6LYZA 1ZMYL 3HFMY 5FSTA 2MEDA 3TXIA 1NWGA 2YSSC 5HNCA 2MEAA 4ET9A 3HBHA 1CKDA 5LVKA 1WTMA 1B9OA 4PJ2C 1C10A 1B7QA 1LMCA 4C3WA 5IELA 4HJYA 3B0IA 1N4FA 4CHXA 1CKCA 1EQ4A 3F6ZA 1HHLA 3W6CA 3AZ7A 1WVVA 1LKRA 3A92A 5B1FA 3WXTA 1MELL 3D9AC 1REZA 2EKSC 1XEJA 4H9EA 1LZ6A 4TTDA 5LVIA 1GAYA 1OUDA 1LZTA 1UC0A 2Y8PA 3P65A 1YKZX 1LZNA 4H9BA 1BB3A 1IORA 3LHMA 1GB5A 2HEBA 2CWIA 4N9RA 4NSHA 3VWOA 1G7IC 3AGHA 4ZIXA 2C8OA 2FBDA 135LA 133LA 3B6LA 5FELA 4N1EI 1CKFA 2YVBA 4DD7A 7LYZA 1LTMA 2BQBA 4H90A 1F0WA 4LYMA 4XN6A 4YEMA 1XGTC 4H94A 1TDYA 2CDSA 2MEBA 2X0AA 2Z37A 1GB0A 1B5YA 1QIOA 1LSDA 4LZTA 1GEZA 4PPOA 5L9JA 1LHIA 3A3RX 5KXKA 1NDMC 4H91A 4N5RA 4KXIA 4NG8A 1GBOA 4OWHA 1XGQC 5LVHA 4B1AA 1LJIA 1WQNA 1WQOA 1GBXA 3P66A 5C6LA 4DC4A 1UCOA 1DI4A 1AZFA 1AKIA 4GLAA 4WM6A 2D6BA 3AZ5A 3OK0A 4YENA 2N5ZA 4WLDA 5LYMA 1DI3A 4GN3A 5FCPA 4WLXA 3WU9A 4A7DA 1LMNA 3CQLA 1IC5Y 1TAYA 4OWEA 3A90A 1GBYA 1LJJA 4FJRA 4BAPA 4LYZA 3M18B 2D4IA 1I20A 2MEFA 1LZ1A 4PGJB 3N9EA 5L3IA 3AGGG 4DD1A 1CJ6A 4X3BA 5HMVA 1HF4A 1OQMA 1LSAA 1ALCA 4RW2A 4NGLA 3BKVA 4XENA 1XGPC 4FDYA 3SP3A 1LZ5A 4HTQA 4HV2A 134LA 4RLNA 3WMKA 3WUMA 5KXTA 1GE0A 1GWDA 3WU8A 5KKIA 5KXRA 3WH1A 4Z46A 1H6MA 4II8A 1DPXA 1NF5A 3AGIA 1DPWA 1GBZA 1YL0X 4WM1A 4E3UA 3T6UA 1KIPC 4ZEEA 1LKSA 2YDGA 5LA5A 1IP6A 1GBWA 3M3UA 4EOFA 1HENA 1GB2A 1SQ2L 1BVXA 1JUGA 4NGZA 5KXYA 1GE1A 4W94A 2MEHA 2RSCA 4OWCA 1WQPA 3BKHA 1GF9A 5B05A 1LJHA 4CJ2A 1LYOA 2A7FA 2BQMA 1JIYA 3WPLA 1TBYA 4YF2A 1A4VA 1C7PA 3FI7A 1LYYA 1YROA 2HU1A 4B4IA 1B7NA 4Z3MA 1INUA 1EQ5A 5A3EA 2W1MA 5B59A 1O23A 2H9JA 1LZAA 4WLTA 3N9AA 3J4GA 5I4XA 3IJUA 4WM4A 5FHWA 1GFHA 1WVUA 1LMOA 4NY5A 3WL2A 5F9UA 4GCEA 1ZV5L 3TMWA 1FBIX 1GFTA 4NG1A 4KT3A 1BB6A 1LZEA 3GXKA 4HPIA 4U3XB 1LAAA 5KXPA 3A95A 1B7MA 1GF6A 1NHEA 3LYMA 2W1XA 4WO9A 5F9XA 5KXWA 1F10A 5I4WA 1GFAA 1LJKA 3TXBA 1IWYA 1B5WA 3LN2A 1AM7A 4NWEA 2IFFY 1GB3A 1LZSA 1C45A 5KXNA 5LVGA 4MSTA 1JKAA 1GFVA 2LYZA 3QE8A 5LVJA 2ZWBA 1YKXX 1IOCA 2Z19A 2MECA 2F4GA 1QUTA 4XJDA 3ZVQB 4MR1A 4LT3A 4R0FA 5LIOA 1JISA 1IEEA 5C6IA 1JJ0A 1FLQA 1IX0A 4NGKA 4UWUA 3RNXA 4ETCA 2I25L 1G7LC 2F30A 1G7MC 1V7SA 4M6DA 1XFPL 1GB7A 3B72A 3CSQA 1IY3A 1UA6Y 1T3PA 2F4AA 2MEIA 3TXFA 4RDSA 3WPKA 3WUNA 3RZ4A 193LA 1JITA 1UIEA 4NEBA 1AT5A 1LMAA 5KXZA 1HEMA 1LSZA 5KXMA 5HLLA 1JSEA 5M1YA 1B5XA 2BQEA 4HP0A 1GB9A 4N1CC 5HNLA 4ETAA 3WULA 4D9ZA 1DI5A 2XTHA 3TXDA 3P68A 3D3DA 1EL1A 1LHLA 1LSPA 2H9KA 3A93A 4XJBA 1LSMA 5LAGA 2Z2FA 1RJCB 5I54A 2LZTA 1BB5A 2BQJA 2C8PA 3QY4A 1FLWA 1GE3A 2HTXA 3W3EA 1V7TA 2LYOA 3A94A 1WTNA 1LYZA 3KAMA 2CJLA 4GCBA 3OJPA 1JJ1A 5AMYA 1GF3A 1HSXA 3A3QA 5DL9A 2ZQ4A 1HERA 1UUZC 1HSWA 1RI8B 1UIHA 2YBIA 3G3AB 3LYTA 4IATA 2BQOA 1F6SA 2W1LA 4B4EA 1IP7A 4LFXA 5DN4A 1IP4A 5T3FA 8LYZA 1LYSA 5F81A 2EQLA 1LJFA 1LZGA 4H9CA 4PRQA 1HEQA 2Q0MX 2YBNA 1C43A 4ETEA 3LZ2A 4NSGA 1GFRA 2BQIA 4CFOA 1I1ZA 1LSCA 154LA 1IOSA 1JTTL 4TUNA 1C08C 1IR8A 1GFUA 1LZ8A 3ZEKA 6LYTA 2F2NA 3A34A 4XJFA 1VATA 2I6ZA 1LZCA 3CB7A 1BWIA 1UICA 3W6DA 5KJ9A 1GHLA 1J1PY 3HBDA 4H9AA 1LHMA 5II3A 3ULRA 1NBZC 3IJVA 1D6PA 4WM2A 3WPJA 5EBHA 1QDTA 1LZDA 4NWHA 1W08A 5ILFA 1HFZA 1YQVY 1JPOA 1LMQA 5J7CA 4B4JA 3B0KA 4ML7A 1LOZA 4G9SA 1LSFA 3CT5A 5E4PA 1VFBC 4NIJA 4WL7A 5E9RA 1VDTA 1YANA 4B49A 4TSBA 3LYOA 2YBLA 4UWNA 1VDPA 4BS7A 1GF0A 2ZNWY 4N8ZA 1GFGA 4LT1A 1IWWA 1E8LA 2FYCA 4YOPA 1DXJA 4H1PA 4YM8A 4TWSA 3GXRA 1IR7A 3EMSA 1FN5A 5K7OA 4GCCA 4NHIA 2XBRA 2HUBA 2YBHA 1REMA 4DDBA 3AZ4A 4NFVA 4WM5A 1Z55A 1LSYA 153LA 3AW6A 2DBTA 1ZVHL 1XGUC 208LA 2ZIJA 1BB7A 1OUEA 1B5ZA 2XJWA 4PHIA 4G4HA 5A3ZA 1HEOA 4XJIA 4J7VA 1IC7Y 4DT3A 1QTKA 4WLYA 4G4CA 1A2YC 1GBSA 3HBEX 5D5CA 1H87A 4BADA 3CT1A 1GF5A 1IP5A 1QSWA 4IASA 3W6AA 2BQKA 5I4YA 1OUGA 3ATNA 132LA 4TSCA 1P2CC 1RCMA 1ZVYB 2Z39A 1GXV2 1B5VA 4DD2A 2LHMA 4J1BA 2EPEA 1JJ3A 1CNSA 3TMXA 4QEQA 3TMVA 1IY4A 4LYOA 4GLVA 4XJGA 3TXHA 2MEGA 1IC4Y 4GCDA 4LYTA 1KXYA 1YILA 4ETDA 3WW6A 4XADA 5ILCA 1IIZA 4OOOA 1YKYX 3TXEA 1T6VL 4P2EA 2Z38A 2NWDX 4YEOA 1VDQA 4NHTA 1LHHA 4RW1A 5APCA 1NQIA 3B0OA 1QUSA 1REYA 1G7JC 1NBYC 4NHQA 3CSRA 1GDWA 1SLYA 4ZFPA 3QNGA 1KXWA 1B7SA 2DQIY 5I5QA 1OUHA 1JTPL 1D9UA 2EIZC 4HV1A 1CJ9A 1LSNA 4I8SA 3WU7A 2HEDA 1LZ9A 1FKVA 3ZVQA 5IHGA 4ET8A 1IWZA 1CJ7A 1VDSA 3IWRA 2ZQ3A 1OP9B 1HELA 2HU3A 1LJ4A 1LZBA 1GFJA 2YBMA 4NGOA 1B7PA 4O34A 1LJNA 2BQCA 4WMGA 1GFKA 1OUJA 3W6EA 5APDA 3WUAA 4AXTA 1OUAA 1UIAA 3EO5A 3AB6A 1YL1X 4TX7A 5DLAA 1YAQA 1PZYA 3AYQA 4DD3A 1B7LA 2ZYPA 1LHKA 1NDGC 2H5ZA 1OUIA 1CJ8A 1RFPA 1B5UA 2W1YA 2XBSA 4H8XA 1DKJA 1LCNA 1FLUA 4NGWA 4WG1A 1BQLY 4WM3A 3WW5A 4DYGA 1LHJA 5HQ1A 2D4KA 1BHZA 4OOTA 4LGKA 1JKCA 4H92A 4HTKA 4CFPA 1UBZA 1LJ3A 2ZIKA 2AUBA 3TXGA 4NGYA 1GAZA 1GD6A 2Z2EA 5IDDA 1JSFA 1VAUA 4OWAA 2Z12A 1F6RA 1LZRA 3ATOA 1GFEA 5HMJA 4GCFA 2IHLA 2DQEY 5LINA 1GB6A 9LYZA 2BQNA 4LYCA 3A6BY 1TCYA 2WARA 4NHPA 4KL7A 2DQFC 3EBAB 1LMPA 1DKKA 5F16A 3G3BB 2YBJA 3EXDA 4H9FA 4NHSA 5KXOA 1GDXA 4M4OA 1HC0A 4AGAA 1YAPA 1IWVA 1B7RA 1BB4A 2B5ZA 2DQAA 2VB1A 4G49A 1QSAA 4QGZA 3AZ6A 4B0DA 3A67Y 1PS5A 1GEVA 3T36A 1DQJC 4DD9A 5F14A 2G4NA 4LYBA 1VEDA 3WYHA 1HEPA 1REXA 1KIRC 5FEKA 194LA 2HEFA 4H9HA 4G4BA 4NGJA 4NGIA 1KXXA 5DN5A 3MGWA 5APEA 1GF7A 2HEEA 1BVKC 2D4JA 4J1AA 1I56A 4WL6A 1BWJA 2G4PA 1EQEA 2BLXA 4NSJA 2DQJY 1D0LA 2DQCY 1IOTA 2HEAA 1HMLA 2ZILA 2BQLA 2CGIA 1IOQA 1UIFA 3A8ZA 4H8ZA 1GE2A 5FDJA 1D0KA 4LT0A 1NKHA 4H9IA 1D6QA 4R6CA 1LZYA 1MLCE 2D91A 1J1XY 4PRUA 1HFYA 3CT0A 1QTEA 1J1OY 1AT6A 4HJZA 1IWXA 3W6BA 1KIQC 3TXJA 2DQGY 1IR9A 2BQAA 1CKGA 2BQFA 3LZTA 3W6FA 1IVMA 1TEWA 4H93A 5D5FA 4DWXA 1B7OA 1IP3A 1JHLA 1GPQC 1NMMA 1IO5A 3K3TA 4LFPA 4NSIA 4LT2A 1LJGA 5DM9A 2G4QA 1JEFA 5C6JA 1IWUA 1UACY 1UIBA 1LPIA 4Z98A 1JKBA 4C5FA 2BAAA 4ANRA 2DKVA 1GB8A 3A96A 2BQHA 4HSFA 5JENB 5KY1A 3A6CY 4QDNA 3TMUA 5KKJA 5B1GA 4RLMA 2ZNXY 5B06A 1XEIA 1QQYA 5KXLA 2FBBA 2BPUA 1DZBX 4N0JA 5LYTA 1XEKA 2LYMA 4QY9A 4W96A 5LA8A 1YAMA 1B0DA 4HTNA 1GF8A 1LSEA 3WVXA 1GE4A 5LAFA 1IWTA 1JWRA 4GN4A 1HNLA 4UWVA 1LZ4A 5KXXA 1LMTA 4I0CA 4DDAA 4HPEA 4ETBA 207LA 1HFXA 1WQRA 5B07A 1WQQA 1LSBA 3WVYA 4BAFA 2Z18A 4L41A 1GXXA 1LJEA 1WQMA 1FKQA 5LXWA 3E3DA 1C46A 1UIDA 5LYZA 4IJ4A 4KPMA 4WO6A 4XJHA 3WXUA 4EMNA 3J6KA 4WG7A 2GV0A 4HJVA 1G7HC 2MEEA 4DDCA 4H8YA 3N9CA 4Z41A 1XSFA 1FDLY 2I26L 1W6ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OUFA 1D0MA 159LA 3CDTA 2DQDY 4OW1A 1HEWA 4EKRA 4GN5C 1L50A 2BQDA 2BQGA 1L47A 240LA 4EXMA 1OUBA 1QSBA 6LYZA 1L32A 3TXIA 1XJTA 5HNCA 7LZMA 2MEAA 1CKDA 5LVKA 1PQOA 1WTMA 6LZMA 1C6GA 1N4FA 3B0IA 1G0GA 3A92A 223LA 1REZA 5LVIA 4TTDA 1OUDA 4H9BA 1LZTA 1UC0A 1D3JA 1GB5A 4NSHA 3VWOA 1L05A 1L09A 1G7IC 3DN4A 2FBDA 156LA 135LA 3HH3A 150LA 3HUAA 1C66A 1L79A 4N1EI 4DD7A 7LYZA 2BQBA 1C65A 4YEMA 2MEBA 2Z37A 1GB0A 1B5YA 4LZTA 4PPOA 5L9JA 1CX6A 1GBOA 1WQNA 1L22A 4DC4A 1UCOA 5C6LA 1AZFA 1AKIA 125LA 1JTNA 2D6BA 1C6DA 200LA 1L59A 2N5ZA 1L04A 4WLXA 1SWYA 228LA 1L21A 1TAYA 1GBYA 1LJJA 4BAPA 3M18B 3N9EA 5L3IA 1CJ6A 195LA 5HMVA 1LSAA 4XENA 1XGPC 1SWZA 215LA 134LA 201LA 4HTQA 5KKIA 3WH1A 4Z46A 1QS9A 1NF5A 1GBZA 1YL0X 4E3UA 1B6IA 1KIPC 4I7NA 1IP6A 4EOFA 1C6TA 1HENA 4NGZA 5KXYA 3DN0A 2MEHA 2XQOA 5B05A 1LYIA 1JIYA 3WPLA 1TBYA 5LINA 1YROA 173LA 2W1MA 4WLTA 3V2YA 1LMOA 2CUUA 1G0LA 128LA 4GCEA 1FBIX 3GXKA 3OE9A 5KXWA 2W1XA 1GFAA 2HUMA 4GBRB 102LA 4NWEA 5LVGA 3HH5A 222LA 1OYUA 4YX7C 1IOCA 1L0KA 2MECA 3ZVQB 1QUTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3P64 A;  3TXK A;  3FE0 A;  1IP1 A;  1OUF A;  1D0M A;  1QDR A;  4OWB A;  2HEC A;  1UIG A;  5L3H A;  3LYZ A;  1IP2 A;  2DQD Y;  4OW1 A;  1RE2 A;  1HEW A;  5APF A;  4GN5 C;  1XGR C;  1JKD A;  2ZYC A;  4MCK A;  2LZ2 A;  2DQH Y;  1CKH A;  4XYY A;  5I53 A;  1HMK A;  3RW8 A;  2BQD A;  1LSG A;  3RU5 A;  4CGE A;  2BQG A;  3AJN A;  1FLY A;  3P4Z A;  2BLY A;  3A91 A;  1YAO A;  4NGV A;  1JTO L;  4WOA A;  4DD0 A;  3CSZ A;  4J0L A;  5KXS A;  1B2K A;  1BWH A;  1OUC A;  1YIK A;  2A7D A;  1OUB A;  1BGI A;  2FYD A;  1GF4 A;  2PC2 A;  3AW7 A;  3RT5 X;  6LYZ A;  1ZMY L;  3HFM Y;  5FST A;  2MED A;  3TXI A;  1NWG A;  2YSS C;  5HNC A;  2MEA A;  4ET9 A;  3HBH A;  1CKD A;  5LVK A;  1WTM A;  1B9O A;  4PJ2 C;  1C10 A;  1B7Q A;  1LMC A;  4C3W A;  5IEL A;  4HJY A;  3B0I A;  1N4F A;  4CHX A;  1CKC A;  1EQ4 A;  3F6Z A;  1HHL A;  3W6C A;  3AZ7 A;  1WVV A;  1LKR A;  3A92 A;  5B1F A;  3WXT A;  1MEL L;  3D9A C;  1REZ A;  2EKS C;  1XEJ A;  4H9E A;  1LZ6 A;  4TTD A;  5LVI A;  1GAY A;  1OUD A;  1LZT A;  1UC0 A;  2Y8P A;  3P65 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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