4BAFA

Hen egg-white lysozyme structure in complex with the europium tris- hydroxyethyltriazoledipicolinate complex at 1.51 a resolution.
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME C
publication title Clicked Europium Dipicolinate Complexes for Protein X-Ray Structure Determination.
pubmed doi rcsb
total genus 49
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-09-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4bafA00
3M18B 4H91A 4OW1A 1CJ9A 4ETEA 4Z41A 1CJ7A 2D91A 1IO5A 1QTEA 3VWOA 4E3UA 1LZEA 3A6CY 3E3DA 4GCBA 2D6BA 1DKKA 2LYOA 2Z12A 4HTQA 3W3EA 1G7IC 1GD6A 3ZVQA 3ATNA 4FDYA 2BQBA 1B9OA 1DKJA 2HU1A 1UIAA 4DD3A 1LYYA 3W6FA 1B0DA 1UIDA 2ZQ3A 3WMKA 5KXRA 4WLXA 1HMLA 1KIQC 1JTOL 1QTKA 1UIFA 1B2KA 1LSGA 2D4IA 3AGHA 4GCCA 2BQDA 5KJ9A 4II8A 3LHMA 1AT5A 4WO6A 1GEVA 3B0IA 1WQNA 3B0OA 3CQLA 1LSNA 2HEAA 1IOQA 1JJ0A 1FDLY 4FJRA 3WU8A 1LSYA 4TTDA 4Z98A 5C6IA 1IP5A 1GHLA 5APFA 2DBTA 2I25L 1IR9A 1HNLA 1LSFA 5DLAA 4NGWA 1JISA 1GB7A 5LVKA 2I26L 3RT5X 132LA 4ETAA 1PS5A 1RI8B 4H94A 1GDWA 4WMGA 153LA 1LZBA 1LJ3A 1GBOA 1IWWA 1QQYA 4B1AA 4YEOA 2G4QA 1CKHA 4UWVA 4H9IA 1IP3A 1OUGA 4W96A 5KXZA 1RJCB 1CJ6A 4PJ2C 1FBIX 5KXWA 3A92A 4DWXA 5FSTA 1IP4A 4NGJA 1LZDA 4YENA 2YDGA 1B7QA 5F9UA 1P2CC 5ILCA 1LSEA 1LYOA 2D4KA 4RDSA 2DQCY 2ZYCA 4P2EA 5KXKA 2BQIA 1OUAA 3AW7A 2FYCA 1XFPL 1AT6A 1G7HC 1UIBA 2I6ZA 3A34A 1D9UA 1GBWA 3IJVA 1LMNA 5IDDA 2BQOA 1NBYC 5APEA 1G7JC 1REZA 1YROA 4IJ4A 1VDTA 4NHPA 1IY4A 1OUHA 4G9SA 2BQFA 4BS7A 3A67Y 3WYHA 1D6QA 1ALCA 4LYTA 1EQ5A 4XADA 5I54A 1LHLA 3HBHA 1C45A 4D9ZA 5I53A 3LN2A 1QDTA 4GCEA 1C08C 3AB6A 4LYMA 1HFZA 4XJHA 1OUDA 4XJFA 5FHWA 1HEQA 4H9BA 1HEWA 2IFFY 5FEKA 3MGWA 2RSCA 1VAUA 1GEZA 2N5ZA 4GCDA 4TX7A 4ET9A 2GV0A 2BAAA 1GE4A 3CT0A 1B5ZA 3CT1A 1LJ4A 1LPIA 1JPOA 5LA5A 4C3WA 3TXFA 1BWIA 1LJEA 2BQEA 5C6LA 2D4JA 1LHJA 5HMVA 1UIHA 4B4IA 1IWXA 1OUIA 3TMXA 3WU7A 2C8OA 4UWNA 1DZBX 2ZWBA 2MEDA 4B4EA 1DI4A 5LXWA 1B5WA 1LZSA 2C8PA 5F14A 2BLXA 1BB5A 4KT3A 1IVMA 3F6ZA 2DQGY 4PRQA 154LA 1Z55A 4LT2A 1LSMA 3WW5A 1YL0X 2LHMA 5APCA 1LSAA 1YANA 3LYOA 1JJ1A 5A3EA 1TDYA 2CJLA 1LYSA 4NSGA 1LAAA 4G4BA 4DDCA 1IWYA 1GF0A 1XEKA 5L9JA 1F0WA 1LZAA 4LYCA 1IY3A 3RU5A 4LYBA 1KXXA 1CNSA 1JKBA 4G4HA 4QEQA 1WVVA 5L3IA 1MELL 1GFAA 1GFUA 1QDRA 1JWRA 4QGZA 4H9FA 4H8ZA 3TMVA 1LSDA 4XENA 1YQVY 4ML7A 3A91A 1JITA 5AMYA 3P64A 2BQLA 1H87A 4H90A 5B05A 1CJ8A 3LYTA 1GXV2 4N0JA 1LZCA 1IP6A 1XEJA 4WG7A 5LVGA 1D0LA 1OUCA 1BB6A 4NGVA 3N9EA 1J1XY 4GN5C 1QSAA 1B5XA 4LFXA 2YBNA 1GBZA 2YBJA 3QY4A 1LCNA 4KL7A 4LGKA 4H92A 3ZVQB 5HNCA 2MECA 1IR7A 2YBLA 2ZNWY 4YM8A 4RW2A 1TEWA 3WPKA 4HJYA 4J1AA 1NHEA 1WTMA 3TXGA 1VDPA 1WQRA 4LYOA 4NGYA 1D6PA 1LHIA 2BQHA 4OWHA 4WL6A 3AGIA 1GFGA 1BB3A 1LZ8A 5LAFA 5B59A 5KKJA 2XJWA 3A3RX 1BQLY 1HEPA 4HTKA 4H9AA 2DQFC 4YF2A 2Z18A 5KXYA 5L3HA 4H9HA 5LVIA 1CKDA 1LZ1A 1YAPA 1LSPA 1LSZA 4N9RA 4X3BA 1LHHA 3WUNA 3TXHA 5I4YA 4NY5A 1BB7A 1GFJA 2EKSC 1IEEA 2H5ZA 2W1YA 3AJNA 4U3XB 4B4JA 1HF4A 1NF5A 3A90A 4OOTA 1SQ2L 4RLMA 4WM6A 5F9XA 5B1GA 1I56A 4BAPA 4M4OA 1JEFA 1JTTL 4EMNA 5II3A 1XGUC 2DQDY 1LMQA 5T3FA 1ZV5L 3WPLA 5KKIA 1VDQA 5I4WA 2CWIA 5FDJA 4WL7A 4XJGA 3TXEA 1NDGC 1BWJA 2EQLA 3G3AB 1UICA 3RNXA 1LJGA 2BQKA 4NGZA 1WQQA 3HFMY 4ETDA 4IASA 135LA 5IELA 3TXKA 1HSWA 2HEFA 134LA 1YILA 3FE0A 4HSFA 1LJNA 2MEFA 4XJBA 1TBYA 1GB0A 1GBYA 4NIJA 5EBHA 1XGQC 5LIOA 193LA 3OJPA 3P68A 1FLQA 1GE3A 5KXNA 1LSCA 9LYZA 3P4ZA 1JSEA 1FLYA 1GWDA 2HEEA 2A7FA 5I5QA 1FLUA 1G7MC 5HMJA 1GPQC 1GB2A 1YIKA 4DC4A 3WUAA 1B5UA 5LA8A 3RW8A 1OUFA 208LA 1GF7A 1A2YC 1NWGA 2PC2A 2ZQ4A 1GB5A 1TCYA 3GXRA 5F81A 3K3TA 4ZEEA 4NSHA 1HFXA 2DKVA 1B7RA 2F30A 3WVYA 3WXUA 1B7SA 3EBAB 1HEOA 4NFVA 3AZ4A 1YKXX 5K7OA 1V7SA 3A3QA 1N4FA 3M3UA 4ZIXA 3CT5A 7LYZA 2ZNXY 4NG1A 1GB8A 1BHZA 1LSBA 1LMOA 2BLYA 2DQAA 2YBIA 3A6BY 3SP3A 1BGIA 4W94A 1LHKA 4WLYA 1WQPA 1GE2A 1OUJA 5HNLA 3WU9A 1YKYX 1J1PY 2IHLA 1IOTA 4RW1A 4DT3A 3RZ4A 2W1MA 3CB7A 1ZMYL 2ZIJA 1UIGA 4HV1A 1UC0A 1KXYA 1C46A 5LVJA 3A93A 4NGOA 2YSSC 2VB1A 1GF6A 3ATOA 4WM4A 2HEBA 4H9CA 4PRUA 5KXTA 4YOPA 2BQGA 2BPUA 4KXIA 4ZFPA 8LYZA 1T6VL 4LYZA 1AZFA 1LZYA 5I4XA 4ANRA 1LMCA 3AZ7A 4R6CA 3EXDA 4NGIA 4WLDA 3N9AA 2HEDA 1XGRC 1C10A 3BKHA 3N9CA 3OK0A 1GFHA 3WXTA 5HQ1A 5KXOA 4NEBA 5LAGA 4DDAA 4NSIA 1LTMA 1UA6Y 1V7TA 1GF4A 4AXTA 4Z3MA 4TUNA 4HPIA 1H6MA 1WQMA 2LYZA 4GN4A 5DL9A 1YAMA 1GBXA 1B7MA 1HMKA 1IWUA 1LZTA 1MLCE 3P65A 1JJ3A 2BQJA 1CKCA 3QE8A 4HV2A 1OUEA 4XYYA 4DD7A 4B49A 4GN3A 1KIRC 1LMTA 1IIZA 1ZVHL 1GBSA 2BQMA 4NWEA 1I1ZA 1QIOA 4HJVA 4YEMA 1IWVA 5E9RA 4GLAA 2EPEA 4NWHA 2Y8PA 4J0LA 4ETBA 1W6ZA 5HLLA 3LZ2A 1IR8A 2ZIKA 3WW6A 1DPWA 1T3PA 1J1OY 4R0FA 4PGJB 1CKFA 2Z38A 2B5ZA 4OWCA 1HFYA 2HU3A 4N1EI 4WOAA 2Z19A 2MEHA 2MEBA 3WH1A 1XGTC 4G4CA 3W6CA 3CSZA 1BWHA 1RE2A 1B7PA 1LJJA 3AYQA 3WPJA 1C43A 1GAZA 4O34A 5JENB 1REYA 1DI5A 1REMA 5KXSA 1F6SA 3A8ZA 4MSTA 1REXA 2HUBA 5KXXA 4HP0A 1AKIA 3J6KA 3KAMA 1UUZC 1VATA 1AM7A 1JIYA 2FBDA 2XBSA 2Z39A 3G3BB 194LA 4WG1A 1GE0A 4XJDA 3TXJA 4DYGA 1LJIA 4CJ2A 3EO5A 1GF3A 1UCOA 3AGGG 1LMAA 3LYMA 2EIZC 4ETCA 1G7LC 4KPMA 1IWTA 2BQCA 1VFBC 1LJHA 4HTNA 1DXJA 6LYTA 3IJUA 1LKSA 4I0CA 4MCKA 3ULRA 5M1YA 3CSQA 3HBEX 1WTNA 4XN6A 1GE1A 4WLTA 5F16A 1B5VA 1DI3A 1GFRA 3J4GA 3TXDA 1QUTA 3LZTA 2G4NA 4HPEA 1SLYA 4G49A 4GLVA 4WM3A 4NHIA 1HERA 1LZ5A 1B7LA 1A4VA 3A95A 3B6LA 2F2NA 1FLWA 4J1BA 4N5RA 4CHXA 5DN5A 4CFPA 1NMMA 1JKAA 4A7DA 1EQ4A 1RCMA 4NSJA 4BAFA 1YKZX 1NBZC 4LFPA 4NHQA 1XSFA 3TMUA 4H9EA 3WULA 1HHLA 1VEDA 3CSRA 2DQEY 4I8SA 1IX0A 3W6EA 1UBZA 3AZ5A 1EQEA 1FN5A 2MEAA 2DQHY 4MR1A 4EOFA 3AW6A 4AGAA 1I20A 1LYZA 2Z37A 4NHSA 5DM9A 2LZ2A 4NG8A 3B72A 4QDNA 4H93A 1LZ4A 1B7NA 2AUBA 4PPOA 3D3DA 1IOCA 3WL2A 4NHTA 1LOZA 1GXXA 2XTHA 1GFVA 2F4GA 4LT1A 1GFEA 1QUSA 5E4PA 1LJFA 4M6DA 4J7VA 5A3ZA 1F10A 4WM1A 3IWRA 4RLNA 1WVUA 1LJKA 1PZYA 2YVBA 4PHIA 1DQJC 4CGEA 1UIEA 4DDBA 1FKQA 5LINA 4Z46A 5LYTA 1OP9B 3ZEKA 2Z2EA 5LYZA 1DPXA 133LA 3A94A 2BQNA 1OQMA 4TWSA 1GFKA 1YAQA 1NQIA 1VDSA 2FBBA 1WQOA 1QSWA 2XBRA 1LZ9A 4DD0A 3WUMA 5D5CA 4ET8A 4TSBA 1JSFA 3T36A 1IC4Y 1GAYA 1OUBA 1XEIA 1YL1X 1LMPA 1GB3A 2HECA 3GXKA 4LT0A 4C5FA 2CDSA 1GF5A 1IP1A 5C6JA 1GDXA 3B0KA 1HC0A 1INUA 2A7DA 4DD1A 1B5YA 4WM2A 1NKHA 3QNGA 1HENA 4IATA 2X0AA 4L41A 4XJIA 1LZRA 2FYDA 3P66A 5FCPA 1BVKC 2ZYPA 1C7PA 3TXBA 1IP7A 1F6RA 1GF8A 1LZNA 3LYZA 4CFOA 4NGKA 2CGIA 1IORA 5KXPA 207LA 4OWEA 1GB6A 3WVXA 5KXMA 3W6BA 4UWUA 1YAOA 2MEEA 1GFTA 2MEIA 5B07A 3T6UA 1B7OA 5KY1A 2LYMA 3EMSA 2W1LA 1W08A 1HEMA 2ZILA 1KXWA 4OWBA 3TMWA 2LZTA 4QY9A 1IC7Y 1ZVYB 4LT3A 2YBMA 1JKCA 5LYMA 1IWZA 4DD9A 1LZGA 1JUGA 4GCFA 4DD2A 5D5FA 1JKDA 5DN4A 2Z2FA 1LKRA 1GB9A 4H8XA 2H9KA 1LZ6A 4LZTA 2HTXA 1E8LA 1HSXA 5IHGA 1D0KA 1KIPC 1CKGA 2G4PA 3AZ6A 3W6DA 3BKVA 1BVXA 4N1CC 2MEGA 3TXIA 5ILFA 2W1XA 4B0DA 3D9AC 5KXLA 1IC5Y 4NGLA 1GF9A 1EL1A 1TAYA 2WARA 2NWDX 4WM5A 4TSCA 5FELA 1JTPL 5B06A 1JHLA 2DQJY 3W6AA 2Q0MX 1BB4A 4H8YA 1FKVA 1LHMA 1RFPA 3A96A 3HBDA 4N8ZA 4OOOA 5J7CA 1NDMC 5B1FA 4HJZA 1HELA 3FI7A 4WO9A 1XGPC 5APDA 1UACY 1D0MA 2F4AA 6LYZA 2BQAA 1O23A 4OWAA 1IP2A 2H9JA 2DQIY 4H1PA 4BADA 1IOSA 5LVHA 2YBHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L95A 1L67A 2D91A 1L90A 248LA 161LA 1D3MA 1DKKA 2Z12A 1G7IC 1L89A 2RAYX 4DD3A 4ARMA 1L30A 3W6FA 4WLXA 1KIQC 4GCCA 4ARJA 1LSGA 3HH3A 4WO6A 3F9LA 3CQLA 1LSNA 2HEAA 3WU8A 5C6IA 2F47A 1GHLA 2I25L 5LVKA 210LA 4ETAA 1D9WA 1IWWA 4UWVA 4H9IA 1JTNA 4W96A 1FBIX 1LZDA 3DN3A 4RDSA 1L50A 1XFPL 1AT6A 115LA 3IJVA 1G7JC 1YROA 1L24A 4G9SA 1QT7A 1LYGA 1D6QA 1ALCA 4LYTA 1L47A 4XADA 2QARC 1QDTA 4LYMA 2B75A 3V2WA 4H9BA 1HEWA 5FEKA 3CT0A 1GE4A 1L00A 1B5ZA 1LJ4A 1LPIA 1QT3A 4C3WA 168LA 1BWIA 1LJEA 2BQEA 1L70A 3TMXA 3C7WA 2DQGY 4PRQA 4LT2A 2OE7X 3LYOA 1JJ1A 2CJLA 111LA 1L60A 4NSGA 146LA 5L9JA 1F0WA 1LZAA 130LA 3RU5A 1JKBA 3DMVA 1L62A 1WVVA 5L3IA 1GFUA 1QDRA 4QGZA 1LSDA 5AMYA 199LA 232LA 1H87A 1PQJA 3LYTA 1GXV2 4NGVA 1QSAA 4AQNA 2YBNA 2YBJA 3QY4A 1LCNA 2O7AA 3OE9A 2YBLA 2ZNWY 3WPKA 4HJYA 3TXGA 1WQRA 4LYOA 4OWHA 4NGYA 1D6PA 1LHIA 3AGIA 3JR6A 5LAFA 2XJWA 4YF2A 4H9AA 2Z18A 261LA 170LA 1G07A 4EKPA 3WUNA 5I4YA 3CDTA 3K2RA 1BB7A 157LA 1IEEA 3OE6A 1HF4A 1NF5A 1CX6A 258LA 3L64A 1SQ2L 1I56A 4BAPA 1JEFA 3C80A 1XGUC 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3M18 B;  4H91 A;  4OW1 A;  1CJ9 A;  4ETE A;  4Z41 A;  1CJ7 A;  2D91 A;  1IO5 A;  1QTE A;  3VWO A;  4E3U A;  1LZE A;  3A6C Y;  3E3D A;  4GCB A;  2D6B A;  1DKK A;  2LYO A;  2Z12 A;  4HTQ A;  3W3E A;  1G7I C;  1GD6 A;  3ZVQ A;  3ATN A;  4FDY A;  2BQB A;  1B9O A;  1DKJ A;  2HU1 A;  1UIA A;  4DD3 A;  1LYY A;  3W6F A;  1B0D A;  1UID A;  2ZQ3 A;  3WMK A;  5KXR A;  4WLX A;  1HML A;  1KIQ C;  1JTO L;  1QTK A;  1UIF A;  1B2K A;  1LSG A;  2D4I A;  3AGH A;  4GCC A;  2BQD A;  5KJ9 A;  4II8 A;  3LHM A;  1AT5 A;  4WO6 A;  1GEV A;  3B0I A;  1WQN A;  3B0O A;  3CQL A;  1LSN A;  2HEA A;  1IOQ A;  1JJ0 A;  1FDL Y;  4FJR A;  3WU8 A;  1LSY A;  4TTD A;  4Z98 A;  5C6I A;  1IP5 A;  1GHL A;  5APF A;  2DBT A;  2I25 L;  1IR9 A;  1HNL A;  1LSF A;  5DLA A;  4NGW A;  1JIS A;  1GB7 A;  5LVK A;  2I26 L;  3RT5 X;  132L A;  4ETA A;  1PS5 A;  1RI8 B;  4H94 A;  1GDW A;  4WMG A;  153L A;  1LZB A;  1LJ3 A;  1GBO A;  1IWW A;  1QQY A;  4B1A A;  4YEO A;  2G4Q A;  1CKH A;  4UWV A;  4H9I A;  1IP3 A;  1OUG A;  4W96 A;  5KXZ A;  1RJC B; 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 1HC0 A;  1INU A;  2A7D A;  4DD1 A;  1B5Y A;  4WM2 A;  1NKH A;  3QNG A;  1HEN A;  4IAT A;  2X0A A;  4L41 A;  4XJI A;  1LZR A;  2FYD A;  3P66 A;  5FCP A;  1BVK C;  2ZYP A;  1C7P A;  3TXB A;  1IP7 A;  1F6R A;  1GF8 A;  1LZN A;  3LYZ A;  4CFO A;  4NGK A;  2CGI A;  1IOR A;  5KXP A;  207L A;  4OWE A;  1GB6 A;  3WVX A;  5KXM A;  3W6B A;  4UWU A;  1YAO A;  2MEE A;  1GFT A;  2MEI A;  5B07 A;  3T6U A;  1B7O A;  5KY1 A;  2LYM A;  3EMS A;  2W1L A;  1W08 A;  1HEM A;  2ZIL A;  1KXW A;  4OWB A;  3TMW A;  2LZT A;  4QY9 A;  1IC7 Y;  1ZVY B;  4LT3 A;  2YBM A;  1JKC A;  5LYM A;  1IWZ A;  4DD9 A;  1LZG A;  1JUG A;  4GCF A;  4DD2 A;  5D5F A;  1JKD A;  5DN4 A;  2Z2F A;  1LKR A;  1GB9 A;  4H8X A;  2H9K A;  1LZ6 A;  4LZT A;  2HTX A;  1E8L A;  1HSX A;  5IHG A;  1D0K A;  1KIP C;  1CKG A;  2G4P A;  3AZ6 A;  3W6D A;  3BKV A;  1BVX A;  4N1C C;  2MEG A;  3TXI A;  5ILF A;  2W1X A;  4B0D A;  3D9A C;  5KXL A;  1IC5 Y;  4NGL A;  1GF9 A;  1EL1 A;  1TAY A;  2WAR A;  2NWD X;  4WM5 A;  4TSC A;  5FEL A;  1JTP L;  5B06 A;  1JHL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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