4BAPA

Hen egg-white lysozyme structure in complex with the europium tris- hydroxyethylcholinetriazoledipicolinate complex at 1.21 a resolution.
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME C
publication title Clicked Europium Dipicolinate Complexes for Protein X-Ray Structure Determination.
pubmed doi rcsb
total genus 50
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-09-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4bapA00
2MEBA 1EQ4A 1YKZX 5M1YA 1CNSA 2CGIA 1JIYA 1IEEA 4E3UA 3CT1A 3GXRA 5KXXA 1V7TA 5A3EA 3RZ4A 1T3PA 3MGWA 1GB9A 1KIQC 4WM3A 1LSFA 4NHPA 4TTDA 2BQBA 2Z18A 4LT1A 1GF4A 1B7QA 1LSBA 4HTNA 2DQAA 4M6DA 4XYYA 2HEDA 4H9HA 4G49A 1KXYA 4PGJB 5APCA 2ZILA 3TXIA 5L9JA 4LYMA 3B72A 2BQJA 3WUMA 1GFHA 2HEEA 3ULRA 1UC0A 4WLDA 2X0AA 1LJ3A 3WU9A 5D5CA 4WMGA 5FHWA 4XENA 4AGAA 135LA 3HBDA 1B5VA 1DI5A 1C10A 3D9AC 2MEAA 1GB3A 1UIBA 3QNGA 1JKBA 1INUA 1LJKA 2FBDA 2DQFC 4MCKA 2ZIJA 2Z2FA 5ILCA 1IWYA 1EQ5A 4NG8A 4P2EA 2ZWBA 2LYOA 3SP3A 5LVHA 1XEKA 4QGZA 3TXFA 1AZFA 2DQJY 1GB8A 1J1OY 5I4YA 1FDLY 3FE0A 4NEBA 1MLCE 4PHIA 4WM2A 1C43A 1UIFA 2Z12A 3LZ2A 4ET9A 5LVJA 4H92A 1GF5A 3WPJA 1IO5A 1XSFA 3CB7A 1NKHA 5I4WA 3AGGG 4W94A 1T6VL 5C6LA 1V7SA 1HFZA 1YKXX 1YQVY 4NIJA 1G7MC 4TSCA 2WARA 2EPEA 4ZEEA 1GF3A 1GF6A 1FBIX 1I56A 1GBOA 1BWIA 2ZNXY 3A67Y 3M18B 4RDSA 5B06A 4BAPA 3N9AA 153LA 1LMOA 5J7CA 2A7FA 1BB7A 5APEA 1IOSA 3TXHA 3AZ7A 2G4QA 1LZ1A 3CSRA 4BADA 5KKIA 4WL6A 1QDTA 4H9EA 1XGTC 1B7RA 4MSTA 1IIZA 2FBBA 1B5XA 4II8A 3A34A 5E4PA 5L3HA 4ETAA 5B59A 2YBIA 3A91A 1LHKA 1OUBA 3A90A 1SQ2L 4IJ4A 3W6BA 1LHHA 1IP7A 2Z19A 1JEFA 4HJVA 1D0LA 1VAUA 1CJ6A 1LSCA 1NF5A 1LJFA 3EO5A 1UIEA 1ZMYL 1DKJA 1LMPA 3B0OA 208LA 2BLYA 4N5RA 2YSSC 1IWWA 2BQHA 4HTQA 4ZFPA 4LYZA 5FSTA 2GV0A 1IC4Y 4TWSA 5KXRA 1GBZA 1QIOA 2DKVA 5HMVA 1VATA 4N1CC 2C8PA 1B7PA 3W6AA 1LZ9A 1HSXA 3G3BB 1HENA 1JTOL 2Z39A 4I8SA 3A96A 1GBYA 1IR7A 1HHLA 2H9JA 5LA8A 5LAFA 4HPEA 3OK0A 1BHZA 4H93A 4X3BA 2F2NA 194LA 1RE2A 4LFXA 4XJHA 1B5YA 1I20A 4YEOA 4KL7A 5F81A 1DQJC 1B5UA 2DBTA 4NGLA 2MEEA 1GFAA 3QE8A 1HEQA 1TAYA 1VDPA 3A3QA 1N4FA 3TXGA 3W6CA 4GN3A 1HFXA 1QTKA 1IX0A 1LZEA 1F10A 2YBHA 2ZIKA 2BQFA 4NHIA 3TXEA 1GXXA 4NY5A 4H90A 1VDTA 1PZYA 4ETBA 3WVXA 1FLUA 3BKVA 4B49A 4WG1A 1LJ4A 2CWIA 1IC5Y 2PC2A 1LYOA 4GCFA 1KXWA 4OOTA 4UWVA 3AGIA 1F6RA 1C7PA 4XADA 2YVBA 1LJNA 3WH1A 4ZIXA 1CKFA 1QSAA 1B7LA 3IJVA 5KJ9A 2AUBA 5HNCA 1LYSA 4B0DA 3P66A 3LYTA 4CFOA 4QDNA 1C08C 1GDWA 2VB1A 4H8XA 4NGJA 4CFPA 5EBHA 1JSEA 1LMAA 1XGUC 1ZVHL 2F4AA 1B7SA 4WM1A 4XJFA 5D5FA 1H87A 2LHMA 1HFYA 1GF8A 1GAZA 1DPWA 3WPLA 4G4BA 5I5QA 1GFRA 132LA 1HSWA 3LN2A 1JWRA 3TMWA 1C46A 1IP2A 1HELA 3B6LA 3LHMA 4I0CA 1GD6A 3RW8A 1I1ZA 4LYTA 3ZVQB 4LYOA 4PJ2C 4LT2A 1IR8A 2DQGY 1IWZA 6LYTA 5LYMA 4OOOA 3ZEKA 4NHQA 4WLTA 1LSDA 4DD3A 4OWAA 3AZ4A 5LVGA 4H1PA 1LZ4A 2BQAA 4BAFA 4XN6A 1FKQA 4J7VA 5I54A 1LZAA 1WVVA 1GPQC 3WUNA 4EMNA 2D4JA 1HC0A 1QSWA 4H9IA 3LYMA 4NFVA 1IR9A 1JPOA 1LJGA 4LYBA 5KXYA 1GB2A 1UCOA 2IFFY 3HBHA 2YBJA 6LYZA 1LMQA 1REMA 1BVKC 1P2CC 4XJIA 1IP1A 1HMKA 3ATOA 3T36A 1WVUA 4KPMA 1BB4A 1LSZA 1YROA 4J1AA 2Z37A 5LIOA 3CSQA 1AKIA 3A3RX 4RLNA 4TUNA 1OUEA 5B07A 1LAAA 1QQYA 2HEAA 4GCBA 2BQOA 4C3WA 5HLLA 4DDAA 4DYGA 1CJ7A 3AGHA 1RFPA 4WO6A 1IC7Y 4HPIA 5KXKA 1KIPC 1TCYA 1WTMA 2D6BA 5KXZA 5IELA 1LZ5A 1JITA 4CJ2A 1LJIA 1GWDA 4OWCA 134LA 2EKSC 3P68A 1KXXA 4CGEA 1HEOA 3EMSA 5KXOA 1BWJA 1GDXA 4PPOA 3TMUA 4ML7A 2YDGA 1UICA 2BPUA 5DLAA 1GFEA 1QUSA 3WVYA 5LXWA 1H6MA 3TXBA 1B9OA 2F4GA 4TX7A 154LA 1BWHA 4GN5C 5B1FA 1YKYX 3N9CA 1LJHA 4IATA 1LZRA 1QUTA 4ET8A 2H5ZA 2F30A 4R0FA 1LSNA 4YF2A 3G3AB 4YM8A 5C6JA 1CKCA 1CJ9A 1XFPL 1UIDA 2W1XA 1GB7A 3WXTA 5LA5A 1RJCB 1CJ8A 1LMCA 3GXKA 4NHTA 5I4XA 4N1EI 1WTNA 4AXTA 1RI8B 1NHEA 2MEDA 1OUHA 4HV1A 4LFPA 2ZQ4A 4G4HA 2ZNWY 1LHIA 4HP0A 2BQNA 3J6KA 1O23A 3FI7A 5KXNA 4IASA 3AJNA 1IWUA 2BQIA 5FCPA 4KT3A 2W1MA 4HTKA 5DN4A 3IWRA 4WOAA 4GN4A 1JKCA 5KXLA 4NGWA 5KXWA 3CT0A 1HMLA 3AW7A 4DDCA 2HEBA 1F6SA 1LZCA 4OWHA 1B7OA 4DC4A 1XGPC 2Z38A 3EXDA 4H94A 1GXV2 4NSIA 1W6ZA 1GB0A 1LSGA 1UACY 2LYMA 3AW6A 5F14A 1HF4A 1LSYA 1ALCA 2CDSA 4PRUA 4H8ZA 4QEQA 3WMKA 4LT3A 1JTPL 1GFTA 1LHLA 1D9UA 3EBAB 4G9SA 3TXDA 4B4IA 5LINA 1C45A 4H9CA 4NHSA 4TSBA 1A2YC 1HNLA 1REZA 1LYZA 207LA 1GFGA 4DD1A 4DWXA 1OUGA 1GFVA 1KIRC 4OWEA 4J0LA 1TDYA 2XBSA 2CJLA 1IWTA 5APFA 2IHLA 4M4OA 1BGIA 1DI4A 1LSPA 3A95A 3KAMA 1ZVYB 4B4JA 1IOTA 1LMNA 4YENA 1IOQA 1GF0A 2DQDY 3T6UA 1YL0X 1YL1X 1G7LC 5AMYA 1DPXA 1LJEA 1EQEA 2XBRA 4NGVA 2HEFA 3CT5A 3A6CY 2YBNA 5KY1A 1DI3A 4XJBA 4UWUA 4R6CA 4ANRA 1LZTA 4NSJA 2B5ZA 1LTMA 2C8OA 5FELA 8LYZA 1GE0A 1GB5A 2HU1A 1LZGA 4C5FA 4Z3MA 1YIKA 2BQCA 2H9KA 3E3DA 4CHXA 4N0JA 2W1LA 3IJUA 1LZYA 2HTXA 1IP5A 5HMJA 1WQNA 3AZ5A 1XEJA 1VFBC 1UA6Y 1OUJA 4DD9A 1LZBA 2YBMA 4NGIA 2I25L 1AT6A 4FDYA 4NWHA 4NGZA 1LCNA 3P64A 2LZTA 1OUIA 2BQGA 1OUDA 3A6BY 1OP9B 3RT5X 5IDDA 1XGRC 4GCCA 1HEMA 1GF9A 1LSMA 1J1PY 4YEMA 1GAYA 1NMMA 2BQEA 2Y8PA 1D0MA 3W6EA 9LYZA 2Z2EA 1BVXA 1UBZA 4WM6A 4MR1A 5C6IA 4U3XB 5E9RA 1LZNA 1W08A 3P65A 5LVKA 3WL2A 5KKJA 1JHLA 4OWBA 2MEGA 3WXUA 1NQIA 4G4CA 1IP3A 3W3EA 3RU5A 1LMTA 2BLXA 2HECA 3B0IA 4XJDA 1LHJA 2ZYCA 2I6ZA 1HEWA 1IOCA 5F9XA 1AM7A 4ETDA 1IP6A 1LSAA 1WQMA 3WU8A 4L41A 2BAAA 2MEIA 3B0KA 4RW2A 1MELL 4LT0A 1DZBX 1CKGA 1IP4A 1LJJA 1IORA 1JSFA 4HJYA 4RW1A 1LYYA 5T3FA 4UWNA 5FDJA 1GFJA 1LZ6A 4A7DA 4GLAA 1GBWA 4NG1A 4H8YA 1PS5A 1GFUA 133LA 1WQRA 5K7OA 1VDSA 4B1AA 3A94A 5DM9A 3WPKA 1GE2A 2BQDA 1GF7A 5KXSA 3AYQA 4NSGA 2EQLA 3VWOA 3TMVA 1UIHA 4FJRA 4KXIA 4DDBA 4WG7A 4EOFA 5JENB 4DD2A 2FYDA 1YAPA 1FLYA 1JTTL 2RSCA 3ZVQA 1GEVA 3WUAA 1G7JC 3AB6A 3D3DA 2DQHY 4LZTA 4N8ZA 4O34A 4WM5A 4H91A 5DL9A 5LAGA 2DQIY 1TEWA 2NWDX 4HSFA 2EIZC 2W1YA 3AZ6A 1GHLA 2XJWA 3P4ZA 3WU7A 1D0KA 1ZV5L 5F16A 3RNXA 4B4EA 1IY4A 1GBSA 4NGOA 1YILA 2HUBA 1JKAA 5DN5A 1LZ8A 5KXMA 1NBZC 1D6PA 4J1BA 1FLWA 4NSHA 3WW5A 3CQLA 3W6FA 5FEKA 1GE3A 2LYZA 5HNLA 1B5WA 2XTHA 4LYCA 4H9FA 1DKKA 1J1XY 1LZDA 4Z41A 1JJ3A 1TBYA 2MEFA 3A92A 2YBLA 4W96A 2I26L 5LYTA 3F6ZA 1B2KA 4LGKA 4XJGA 1GEZA 4QY9A 1E8LA 4WLXA 2D4IA 3LZTA 5HQ1A 4NGYA 1JKDA 5I53A 7LYZA 1REXA 4NGKA 1BQLY 1OQMA 2A7DA 3M3UA 1XGQC 1SLYA 3OJPA 1NBYC 1VDQA 1YAMA 3A93A 1NWGA 1UUZC 5A3ZA 1UIAA 2BQMA 1OUCA 4NWEA 1GFKA 1JISA 3J4GA 2D4KA 4ETEA 4OW1A 1G7HC 4Z46A 1D6QA 2BQLA 2FYCA 2HU3A 4WL7A 4H9AA 1BB3A 1DXJA 3K3TA 1GE1A 1B7NA 1YAOA 2Q0MX 1LKRA 3BKHA 1LSEA 1LZSA 2MECA 4PRQA 5LVIA 1OUFA 3WW6A 5ILFA 3HFMY 1YAQA 3LYZA 1FN5A 1REYA 2ZYPA 1BB5A 4YOPA 1AT5A 3TXKA 2G4PA 1OUAA 1B5ZA 2LZ2A 3CSZA 1GBXA 1WQQA 1BB6A 1JUGA 2D91A 3N9EA 1WQPA 4DT3A 5F9UA 3HBEX 193LA 2BQKA 1Z55A 3TXJA 5B05A 1FKVA 1LOZA 1NDMC 1B7MA 1IWXA 4GLVA 1JJ0A 4DD7A 1UIGA 1CKHA 1A4VA 1LKSA 3A8ZA 3WULA 4H9BA 2DQEY 5LYZA 5KXTA 4WLYA 1LHMA 5APDA 3WYHA 5KXPA 5B1GA 1F0WA 1QDRA 2N5ZA 4D9ZA 5L3IA 1IWVA 1IVMA 1YANA 1GE4A 3ATNA 4Z98A 4GCDA 2ZQ3A 1B0DA 4RLMA 4WM4A 1FLQA 4ETCA 2MEHA 1JJ1A 4BS7A 1CKDA 4HJZA 1LPIA 1XEIA 4GCEA 1NDGC 2DQCY 4WO9A 1GB6A 1VEDA 1WQOA 3QY4A 3TMXA 1EL1A 1RCMA 4DD0A 5IHGA 3LYOA 1IY3A 1HERA 4HV2A 1HEPA 5II3A 1G7IC 1QTEA 4N9RA 3W6DA 2G4NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
242LA 1OVHA 2MEBA 1L04A 1YKZX 2CGIA 191LA 1LYHA 1L06A 5A3EA 3RZ4A 102LA 3DN8A 2B75A 4HTNA 4M6DA 4XYYA 4AQNA 1C6KA 1GFHA 2HEEA 3DN6A 1L59A 4WLDA 1LJ3A 1TLAA 1L82A 4WMGA 5FHWA 4XENA 1PQIA 3HBDA 1DI5A 4ARMA 4I7PA 4MCKA 3GUOA 1EQ5A 1L43A 5LVHA 1G1WA 1GB8A 3FE0A 4ARQB 163LA 1D2YA 1CX7A 3WPJA 3CB7A 1QT7A 2RBOA 4W94A 5C6LA 1G7MC 4TSCA 2EPEA 3SB6A 4ZEEA 1I56A 2ZNXY 3M18B 1L62A 4EPIA 1LMOA 2A7FA 3TXHA 1L19A 1QDTA 1XGTC 1B7RA 1IIZA 2FBBA 1B5XA 3A91A 1QUHA 3A90A 2B72A 2OU9A 4HJVA 1D0LA 1P2RA 1LJFA 1DKJA 2BQHA 4LYZA 1QTHA 1L77A 119LA 2GV0A 5KXRA 1L00A 1QIOA 2NTGA 1QTVA 3W6AA 4I8SA 1C63A 1L46A 1D9WA 2F2NA 3GUMA 4YEOA 169LA 1P36A 1L20A 1L95A 3W6CA 3A3QA 1HFXA 184LA 239LA 3C8QA 254LA 1F10A 1C62A 1L50A 1SX7A 4NHIA 3TXEA 1GXXA 1VDTA 1FLUA 3BKVA 3G3XA 4B49A 2B6ZA 1LJ4A 2CWIA 4OOTA 4GCFA 1DYGA 115LA 1L55A 1LJNA 2AUBA 1QTDA 122LA 1C08C 1ZVHL 4WM1A 1B7SA 1HFYA 1DPWA 1GFRA 4I7KA 1LYIA 1JWRA 1HELA 4LT2A 2DQGY 5LYMA 1IWZA 2LZMA 1L14A 4EJ4A 3AZ4A 1L57A 5I54A 1GPQC 186LA 1L88A 3LYMA 4LYBA 1LGXA 1UCOA 3HBHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2MEB A;  1EQ4 A;  1YKZ X;  5M1Y A;  1CNS A;  2CGI A;  1JIY A;  1IEE A;  4E3U A;  3CT1 A;  3GXR A;  5KXX A;  1V7T A;  5A3E A;  3RZ4 A;  1T3P A;  3MGW A;  1GB9 A;  1KIQ C;  4WM3 A;  1LSF A;  4NHP A;  4TTD A;  2BQB A;  2Z18 A;  4LT1 A;  1GF4 A;  1B7Q A;  1LSB A;  4HTN A;  2DQA A;  4M6D A;  4XYY A;  2HED A;  4H9H A;  4G49 A;  1KXY A;  4PGJ B;  5APC A;  2ZIL A;  3TXI A;  5L9J A;  4LYM A;  3B72 A;  2BQJ A;  3WUM A;  1GFH A;  2HEE A;  3ULR A;  1UC0 A;  4WLD A;  2X0A A;  1LJ3 A;  3WU9 A;  5D5C A;  4WMG A;  5FHW A;  4XEN A;  4AGA A;  135L A;  3HBD A;  1B5V A;  1DI5 A;  1C10 A;  3D9A C;  2MEA A;  1GB3 A;  1UIB A;  3QNG A;  1JKB A;  1INU A;  1LJK A;  2FBD A;  2DQF C;  4MCK A;  2ZIJ A;  2Z2F A;  5ILC A;  1IWY A;  1EQ5 A;  4NG8 A;  4P2E A;  2ZWB A;  2LYO A;  3SP3 A;  5LVH A;  1XEK A;  4QGZ A;  3TXF A;  1AZF A;  2DQJ Y;  1GB8 A;  1J1O Y;  5I4Y A;  1FDL Y;  3FE0 A;  4NEB A;  1MLC E;  4PHI A;  4WM2 A;  1C43 A;  1UIF A;  2Z12 A;  3LZ2 A;  4ET9 A;  5LVJ A;  4H92 A;  1GF5 A;  3WPJ A;  1IO5 A;  1XSF A;  3CB7 A; 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 1XGQ C;  1SLY A;  3OJP A;  1NBY C;  1VDQ A;  1YAM A;  3A93 A;  1NWG A;  1UUZ C;  5A3Z A;  1UIA A;  2BQM A;  1OUC A;  4NWE A;  1GFK A;  1JIS A;  3J4G A;  2D4K A;  4ETE A;  4OW1 A;  1G7H C;  4Z46 A;  1D6Q A;  2BQL A;  2FYC A;  2HU3 A;  4WL7 A;  4H9A A;  1BB3 A;  1DXJ A;  3K3T A;  1GE1 A;  1B7N A;  1YAO A;  2Q0M X;  1LKR A;  3BKH A;  1LSE A;  1LZS A;  2MEC A;  4PRQ A;  5LVI A;  1OUF A;  3WW6 A;  5ILF A;  3HFM Y;  1YAQ A;  3LYZ A;  1FN5 A;  1REY A;  2ZYP A;  1BB5 A;  4YOP A;  1AT5 A;  3TXK A;  2G4P A;  1OUA A;  1B5Z A;  2LZ2 A;  3CSZ A;  1GBX A;  1WQQ A;  1BB6 A;  1JUG A;  2D91 A;  3N9E A;  1WQP A;  4DT3 A;  5F9U A;  3HBE X;  193L A;  2BQK A;  1Z55 A;  3TXJ A;  5B05 A;  1FKV A;  1LOZ A;  1NDM C;  1B7M A;  1IWX A;  4GLV A;  1JJ0 A;  4DD7 A;  1UIG A;  1CKH A;  1A4V A;  1LKS A;  3A8Z A;  3WUL A;  4H9B A;  2DQE Y;  5LYZ A;  5KXT A;  4WLY A;  1LHM A;  5APD A;  3WYH A;  5KXP A;  5B1G A;  1F0W A;  1QDR A;  2N5Z A;  4D9Z A;  5L3I A;  1IWV A;  1IVM A;  1YAN A;  1GE4 A;  3ATN A;  4Z98 A;  4GCD A;  2ZQ3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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