4C3WA

Vanadium(iv)-picolinate complexed with lysozyme
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME C
publication title Vanadium Complexes as Prospective Therapeutics: Structural Characterization of a V(Iv) Lysozyme Adduct
doi rcsb
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4c3wA00
4BAPA 1LJNA 2DQGY 2BQOA 1HERA 3D3DA 1NDGC 1UC0A 4WO6A 2MEHA 5LVJA 2HEAA 4LYTA 5LVGA 1WQMA 2G4PA 2F30A 1RCMA 1ZVHL 3BKVA 1F6SA 4M4OA 3A93A 3EMSA 4YOPA 4HTQA 2IFFY 5APDA 8LYZA 1LYSA 1T3PA 1GPQC 1LZAA 1LCNA 3AYQA 3RU5A 1LMPA 4KXIA 4QGZA 3B72A 1DXJA 2DQHY 2G4NA 3AGHA 4LYMA 5HMJA 4WM2A 4DT3A 1LZYA 2XTHA 5KXOA 1REMA 3A34A 2YBJA 3OJPA 4LT0A 2DQDY 5L9JA 2Y8PA 3AJNA 3WYHA 1KIQC 135LA 4J1BA 4WM3A 1OUAA 4C3WA 4NGWA 1QQYA 3B0KA 4W96A 3TMXA 1G7HC 1NMMA 1OP9B 1C45A 1A4VA 2F2NA 1GF7A 4NG1A 1IP6A 1YAOA 3LN2A 1DQJC 2FYDA 2ZIJA 1BWIA 1QTEA 1B7OA 1MELL 1SLYA 4UWUA 3WPLA 4WM4A 2BQCA 2ZYPA 1A2YC 3HBHA 5D5CA 1D6QA 1VATA 4LT2A 4CFPA 3AGIA 1B0DA 1LSFA 2BQDA 4XN6A 1AT6A 193LA 1HF4A 2HEFA 4H94A 5KXZA 4NGOA 1HNLA 1B5WA 2LYMA 5APFA 4DDAA 2ZILA 2FBDA 1DI5A 3P4ZA 4RLNA 1D0KA 1LYOA 1LJGA 1NQIA 1TDYA 1DPXA 3QY4A 4GCDA 2BLXA 1C46A 1IWXA 3G3AB 1GE0A 3E3DA 5A3ZA 1BB4A 1B9OA 2DQIY 4H9EA 3TXJA 5KXMA 1LMQA 2C8OA 4XJGA 3RZ4A 3QE8A 1GDWA 1BB5A 5KXNA 154LA 3W3EA 1LJHA 1LJ4A 6LYTA 4G49A 3J4GA 1VFBC 1KIPC 1WVUA 1GFRA 4GLVA 4CFOA 1H6MA 4NGVA 2FBBA 1AZFA 5I53A 1GFHA 4HJZA 3ATNA 3J6KA 1IWWA 4IATA 1B7QA 4FJRA 1JHLA 1JISA 4HTNA 208LA 1WQNA 3A6CY 2EPEA 2HTXA 4NWEA 1GWDA 1FKQA 1YL0X 4TSBA 1LZ6A 4DC4A 3WU9A 1JITA 1LSMA 1B7PA 3AZ4A 1LSCA 4NSJA 5B1FA 4QY9A 134LA 2BQIA 1GBWA 2D6BA 1B7SA 1JKAA 2Z2EA 3ULRA 1NKHA 1G7LC 1LZ5A 3WXTA 1YAQA 4LGKA 4NIJA 4B4JA 4E3UA 3A6BY 1UIAA 5KJ9A 3LZTA 2ZQ4A 3OK0A 1JKCA 3WW5A 4DD9A 1GB6A 1MLCE 2DKVA 1UICA 3A91A 1GE1A 3EO5A 4LYBA 4IJ4A 3B0IA 2MEIA 2PC2A 1IOTA 1BVXA 1NDMC 1GFGA 1GB8A 1JKDA 1IWYA 4LT3A 4OWHA 2HEDA 1LZ1A 5KXPA 1LMNA 5DM9A 1G7IC 4UWVA 4YEOA 1B7RA 3P64A 1GF6A 3MGWA 9LYZA 4TSCA 1GFJA 1LSEA 1LJJA 1HSXA 1GBSA 1GB2A 3BKHA 4PPOA 194LA 1HEPA 4NHSA 1IP4A 1CKCA 4QEQA 4XENA 5HNLA 1WQOA 3RT5X 5DL9A 1D9UA 3FI7A 2HUBA 1NHEA 2MEAA 2BPUA 1XGPC 2CJLA 4U3XB 2MEBA 1HMLA 2X0AA 2YBHA 2BQLA 4TWSA 2D4KA 3WU8A 4DDBA 4OOOA 1LZSA 1OUJA 4NWHA 1GB3A 1JJ3A 1UIEA 4EOFA 1GF9A 1WQRA 4GN4A 1JSEA 1CJ9A 2HECA 1LOZA 1WQPA 5LAFA 3W6EA 6LYZA 1ZMYL 2H5ZA 1CJ8A 2VB1A 3CQLA 4UWNA 3ZEKA 5KKIA 1TBYA 1GXV2 1YKXX 1LMCA 3TXBA 4CJ2A 1UIBA 1KXXA 1LZ9A 4PJ2C 3QNGA 2RSCA 2Z39A 3CSQA 2Z38A 1IP2A 5LA5A 1QDRA 1QDTA 4ZIXA 4AXTA 4NHPA 1ZVYB 1B5UA 1IC4Y 4Z41A 1IR9A 3A67Y 1LZ4A 2FYCA 3AZ7A 1LZCA 3WPJA 1GE2A 4OWBA 5FELA 1GE3A 4ANRA 2MEEA 1HHLA 3CSZA 1UIFA 5DN5A 1GBXA 4CHXA 1IX0A 1IEEA 1OQMA 2F4GA 1E8LA 3WVYA 1JSFA 1O23A 4IASA 1LJEA 1LHJA 1P2CC 1GB9A 2ZIKA 5DLAA 2BQAA 2DQEY 1YAPA 3LZ2A 4HPIA 4NGJA 1C08C 3WULA 1GFTA 4OWCA 4TUNA 1QUTA 1YKZX 5ILFA 4H9HA 5LAGA 1I20A 3WL2A 3G3BB 5F81A 1GE4A 1XFPL 4XJHA 3CT1A 4WM5A 1Z55A 5B59A 1CKHA 1JUGA 1T6VL 2A7DA 3K3TA 3WPKA 1GXXA 1LZTA 2HU1A 1JWRA 2DBTA 1B5XA 1JEFA 1EQ5A 1IOSA 1GFAA 1NBZC 3CB7A 4RW1A 1LHLA 4WLTA 1IIZA 1FKVA 1IP5A 3W6FA 5HLLA 2D4IA 5A3EA 132LA 3IJUA 5F14A 3WW6A 1B7NA 2DQAA 3A3RX 5KXKA 4YM8A 1DI3A 1LHMA 2BQEA 1JKBA 1HFZA 4G4HA 1VDQA 1LPIA 3AB6A 4Z46A 3HBEX 3LYZA 2W1LA 4GCFA 4YENA 3AGGG 1N4FA 1GFKA 4RW2A 4O34A 1CKFA 1C43A 2NWDX 1UBZA 5C6JA 4BAFA 4DDCA 4NGIA 2HEEA 5ILCA 1IP7A 1FBIX 2ZWBA 5IDDA 3WMKA 5KXXA 5LVKA 1XGUC 4ETAA 1OUIA 1D0LA 4NGZA 4GCEA 5LA8A 5APEA 4N0JA 3TMUA 4TTDA 3T36A 4RLMA 5I4XA 1NF5A 4H8XA 1UA6Y 2ZYCA 3ZVQB 1LSGA 1LHHA 1CKDA 4I0CA 4RDSA 1RJCB 7LYZA 4H8YA 1XGQC 4H9FA 1IC7Y 2BQMA 2LZ2A 2XJWA 133LA 4XADA 1JPOA 4H90A 1XEJA 4L41A 1AKIA 4N5RA 5EBHA 1DI4A 2WARA 2BLYA 1G7MC 1OUBA 3HBDA 1GBZA 3AW7A 1DKKA 2XBSA 4HP0A 1VDPA 1FLWA 4H9AA 3WVXA 4DD2A 3WH1A 3CT5A 1FDLY 5KXLA 5B06A 3WXUA 1LYZA 1BB6A 5B1GA 4B4EA 4YF2A 2Z37A 3LYMA 3P68A 5FEKA 1GBYA 1IY3A 3A8ZA 4NHQA 1IWUA 1F10A 1GFVA 5JENB 4WL7A 3P66A 3N9EA 4NHIA 1B5YA 5E9RA 4B1AA 5LYTA 4R6CA 1IP3A 4OWEA 5DN4A 1I56A 1OUGA 1NBYC 2BQHA 1IVMA 1IOQA 1OUDA 2B5ZA 3D9AC 5II3A 1BHZA 1B5ZA 1W08A 2EKSC 4N9RA 1B2KA 1KXWA 1LJKA 4X3BA 1FLUA 4HSFA 1LAAA 1AM7A 4XJBA 5I4YA 4MSTA 5KXYA 2LHMA 3GXKA 3AW6A 4ET9A 2LYOA 1HC0A 1LSDA 4H91A 5LXWA 4AGAA 2ZNWY 1I1ZA 4P2EA 1LMOA 4KPMA 2YVBA 4WG1A 1JJ1A 1PS5A 3TXIA 1FLYA 2YBLA 1QUSA 4B49A 1YILA 4NSIA 2A7FA 1LZDA 1HSWA 1TCYA 2C8PA 1OUFA 1REZA 2BQFA 5LINA 2CWIA 1ZV5L 3N9CA 4WO9A 1HMKA 1IR7A 3ZVQA 5HNCA 1UCOA 5FDJA 2Z19A 4H9BA 1UACY 2MECA 4XYYA 5I5QA 1DZBX 3F6ZA 4WM6A 1BGIA 2Z2FA 4GN3A 2G4QA 1YAMA 4DD7A 2D91A 2LYZA 1QTKA 1VDSA 1SQ2L 5L3HA 1HFXA 1UIDA 3A3QA 3TXKA 1HEWA 1LZRA 1GAZA 3N9AA 3EBAB 2DQJY 2AUBA 2BQJA 1D0MA 1IWTA 3WUNA 4WMGA 2BQGA 4WLDA 2YSSC 1CNSA 1HFYA 2BQKA 2DQCY 2YBNA 4B4IA 3VWOA 1INUA 1IY4A 2YBMA 5KY1A 1GB0A 1H87A 5LYZA 1BVKC 1LHIA 1F0WA 1LHKA 1OUEA 1TAYA 4J0LA 5D5FA 5F9XA 3TXGA 5HMVA 1LTMA 1QSWA 1WQQA 2Q0MX 2D4JA 1TEWA 4G9SA 1GF0A 1HELA 5FCPA 2H9KA 3TXEA 1EQ4A 1GF5A 1EQEA 1RFPA 1PZYA 1LSYA 1RI8B 1LSNA 2XBRA 1LJ3A 4H92A 4Z3MA 2I26L 1LZBA 1GEVA 4DWXA 3TXDA 5B07A 4GCBA 2Z18A 1JTTL 1AT5A 5KXRA 4NG8A 3SP3A 2W1YA 1C10A 3A95A 5J7CA 1CKGA 4WG7A 3WU7A 4DD0A 5LVHA 3B0OA 4HTKA 4DD3A 1LZ8A 1C7PA 2EIZC 1CJ7A 2GV0A 5I4WA 1XSFA 1LKRA 5E4PA 1V7TA 2MEDA 1BWHA 1OUCA 2W1MA 5KKJA 5F9UA 153LA 4ETCA 4ETDA 1VEDA 3AZ5A 1LSAA 1V7SA 4NEBA 1YIKA 4II8A 4YEMA 1XEKA 3TXHA 3EXDA 4H93A 4D9ZA 3W6CA 3TMWA 3RW8A 1VAUA 3A90A 1B7LA 1DPWA 4N1CC 4B0DA 1IR8A 1IC5Y 2ZNXY 1NWGA 4NFVA 2I25L 1YQVY 5IHGA 4PHIA 1GD6A 1WTNA 2EQLA 2BQNA 5HQ1A 3FE0A 2Z12A 2MEFA 5C6IA 5LYMA 1JIYA 4NGLA 1LKSA 1LZEA 3A96A 4C5FA 4GCCA 4CGEA 5IELA 5M1YA 1BB3A 4QDNA 1D6PA 2BQBA 1F6RA 2F4AA 5LVIA 3KAMA 1GHLA 1XGRC 4FDYA 1GF8A 5T3FA 3RNXA 4HJVA 1YANA 1LJIA 1LMTA 1XGTC 4ZFPA 1IP1A 1YL1X 4WM1A 1IOCA 4A7DA 4XJIA 4GLAA 3B6LA 3W6BA 4EMNA 5KXTA 5F16A 1KIRC 1LMAA 4H8ZA 2BAAA 3IJVA 2LZTA 3ATOA 4PRQA 4DYGA 1J1OY 1GB5A 2HU3A 4WLXA 1OUHA 2CDSA 3P65A 4ETEA 4ETBA 1BWJA 5B05A 1UUZC 1LZGA 5APCA 1JTPL 4I8SA 4BS7A 4H9IA 4WLYA 3GXRA 1REYA 1G7JC 2YBIA 4N1EI 3TMVA 1GF4A 1UIGA 1YROA 4R0FA 3WUMA 4OWAA 4ET8A 4OW1A 4XJFA 4H1PA 4HV2A 1XEIA 4HPEA 3W6AA 4J1AA 1B5VA 1YKYX 3IWRA 1EL1A 1HEQA 4WL6A 1BB7A 3M3UA 4LYZA 4GN5C 2CGIA 4NHTA 3T6UA 1CJ6A 1LSZA 1UIHA 4LYOA 4W94A 4LYCA 4G4BA 4J7VA 1IWZA 1FN5A 1GAYA 1B7MA 4TX7A 1GF3A 1GB7A 207LA 4MR1A 1IWVA 1LSBA 1DKJA 1GBOA 2MEGA 4HJYA 1IORA 4M6DA 1ALCA 3TXFA 3WUAA 4XJDA 2DQFC 1GFEA 4LZTA 5AMYA 1WVVA 1W6ZA 4PGJB 3A92A 5KXWA 4KT3A 2W1XA 4KL7A 4BADA 3LYTA 1KXYA 5I54A 4H9CA 4NGKA 1VDTA 5KXSA 3LHMA 4ZEEA 1HEOA 3A94A 4PRUA 5K7OA 1JTOL 4LFPA 1REXA 4ML7A 5L3IA 4WOAA 1IO5A 5FSTA 1J1XY 3CT0A 4LFXA 2HEBA 2IHLA 4OOTA 4NSGA 2ZQ3A 1GDXA 2H9JA 1HEMA 1LSPA 2YDGA 5LIOA 4NY5A 1QSAA 3HFMY 4NGYA 4DD1A 5C6LA 1LZNA 3M18B 4HV1A 1FLQA 3AZ6A 1BQLY 4NSHA 1RE2A 1GEZA 2N5ZA 1LJFA 2I6ZA 3CSRA 4LT1A 4Z98A 3W6DA 4MCKA 1J1PY 1LYYA 1GFUA 4N8ZA 5FHWA 1HENA 1QIOA 1WTMA 3LYOA 4G4CA 1JJ0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1C6GA 173LA 1L03A 4BAPA 2BQOA 5LVJA 2HEAA 2G4PA 2F30A 1F6SA 4HTQA 2IFFY 1L82A 4DJHA 1LYSA 4WM2A 4I7SA 3OJPA 149LA 1QQYA 1G7HC 1LGWA 4NG1A 1YAOA 3D4SA 1L27A 4YXAC 3HU8A 1B7OA 4UWUA 3WPLA 1L76A 1DYFA 1C6LA 2BQCA 5D5CA 1D6QA 1XEPA 4CFPA 1LSFA 2OEAX 1AT6A 193LA 5KXZA 4NGOA 5APFA 1CTWA 4DDAA 2ZILA 1C46A 128LA 2HUKA 1IWXA 1T8AA 3G3AB 5A3ZA 3QE8A 154LA 3SBBC 2FBBA 4HJZA 3J6KA 2EPEA 1GWDA 1FKQA 3WU9A 3AZ4A 1LSMA 1LSCA 4QY9A 1SX2A 4I7OA 2D6BA 1JKAA 1NKHA 4I7QA 4DAJA 3LZTA 1JKCA 1L04A 1L22A 2DKVA 237LA 1QSBA 4LYBA 1IOTA 4OWHA 4LT3A 1IWYA 3K2RA 5DM9A 184LA 1D3NA 158LA 4UWVA 3P64A 1JTNA 3RZEA 1C6JA 4PPOA 194LA 1IP4A 1PQIA 234LA 252LA 3RT5X 3C7ZA 1L42A 2BPUA 1XGPC 4U3XB 2BQLA 1C66A 226LA 4EKSA 1OUJA 4NWHA 1JJ3A 1GF9A 4W58A 2Q9EA 1ZMYL 2H5ZA 5KKIA 1YKXX 1LMCA 4NHPA 1B5UA 1IC4Y 4Z41A 1L88A 162LA 3A67Y 3AZ7A 4OWBA 5I14A 3DN2A 2MEEA 3CSZA 1IEEA 1OQMA 1DYCA 1LJEA 110LA 3LZ2A 1GFTA 2OU8A 113LA 5F81A 1XFPL 4XJHA 2RBOA 3WPKA 221LA 3W3EA 6LYTA 1GFAA 1IOSA 1P7SA 1NBZC 4I7TA 1P46A 4WLTA 3W6FA 1FKVA 3IJUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4BAP A;  1LJN A;  2DQG Y;  2BQO A;  1HER A;  3D3D A;  1NDG C;  1UC0 A;  4WO6 A;  2MEH A;  5LVJ A;  2HEA A;  4LYT A;  5LVG A;  1WQM A;  2G4P A;  2F30 A;  1RCM A;  1ZVH L;  3BKV A;  1F6S A;  4M4O A;  3A93 A;  3EMS A;  4YOP A;  4HTQ A;  2IFF Y;  5APD A;  8LYZ A;  1LYS A;  1T3P A;  1GPQ C;  1LZA A;  1LCN A;  3AYQ A;  3RU5 A;  1LMP A;  4KXI A;  4QGZ A;  3B72 A;  1DXJ A;  2DQH Y;  2G4N A;  3AGH A;  4LYM A;  5HMJ A;  4WM2 A;  4DT3 A;  1LZY A;  2XTH A;  5KXO A;  1REM A;  3A34 A;  2YBJ A;  3OJP A;  4LT0 A;  2DQD Y;  5L9J A;  2Y8P A;  3AJN A;  3WYH A;  1KIQ C;  135L A;  4J1B A;  4WM3 A;  1OUA A;  4C3W A;  4NGW A;  1QQY A;  3B0K A;  4W96 A;  3TMX A;  1G7H C;  1NMM A;  1OP9 B;  1C45 A;  1A4V A;  2F2N A;  1GF7 A;  4NG1 A;  1IP6 A;  1YAO A;  3LN2 A;  1DQJ C;  2FYD A;  2ZIJ A;  1BWI A;  1QTE A;  1B7O A;  1MEL L;  1SLY A;  4UWU A;  3WPL A;  4WM4 A;  2BQC A;  2ZYP A;  1A2Y C;  3HBH A;  5D5C A;  1D6Q A;  1VAT A;  4LT2 A;  4CFP A;  3AGI A;  1B0D A;  1LSF A;  2BQD A;  4XN6 A;  1AT6 A;  193L A;  1HF4 A;  2HEF A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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