4CFOA

Structure of lytic transglycosylase mltc from escherichia coli in complex with tetrasaccharide at 2.9 a resolution.
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
327
structure length
327
Chain Sequence
DTNGFDILMGQFAHNIENIWGFKEVVIAGPKDYVKYTDQYQTRSHINFDDGTITIETIAGTEPAAHLRRAIIKTLLMGDDPSSVDLYSDVDDITISKEPFLYGQVVDNTGQPIRWEGRASNFADYLLKNRLKSRSNGLRIIYSVTINMVPNHLDKRAHKYLGMVRQASRKYGVDESLILAIMQTQSSFNPYAVSRSDALGLMQVVQHTAGKDVFRSQGKSGTPSRSFLFDPASNIDTGTAYLAMLNNVYLGGIDNPTSRRYAVITAYNGGAGSVLRVFSNDKIQAANIINTMTPGDVYQTLTTRHPSAESRRYLYKVNTAQKSYRRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure and Cell Wall Cleavage by Modular Lytic Transglycosylase Mltc of Escherichia Coli.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Escherichia coli
molecule keywords MLTC
total genus 103
structure length 327
sequence length 327
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2013-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
A PF11873 Mltc_N Membrane-bound lytic murein transglycosylase C, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4cfoA02
3M18B 1RCMA 4WG1A 4WLYA 4XENA 2HU3A 5I4WA 1LHKA 2I6ZA 5FSTA 1JISA 2A7DA 2BQEA 3WPKA 1F6SA 3BKHA 1IO5A 1D0LA 1LSYA 4ML7A 2BQMA 2ZYCA 4CJ2A 4CFOA 1LZ4A 5DL9A 3AZ6A 4ANRA 3LZTA 3M3UA 4KT3A 1LHIA 4B4EA 1OUGA 2BAAA 1IR8A 1B7LA 4OW1A 4X3BA 1TAYA 4NGWA 5K7OA 1LJGA 1JKBA 1GDWA 1NHEA 2HEAA 3WVXA 1HEOA 1LJEA 1UIAA 4RW2A 1XGRC 4XJGA 2F4GA 2DQJY 1GF3A 3J6KA 4GCBA 4II8A 1LSEA 5LINA 3WXTA 3B0IA 4N8ZA 5KXPA 1GB6A 1OQMA 1OUAA 1T6VL 2FBBA 3HBHA 5FEKA 1LSBA 3W6AA 3WL2A 1I1ZA 4H9BA 4WM4A 4YEMA 1HENA 9LYZA 1AT6A 2A7FA 4WLXA 3LYMA 1LHHA 3P4ZA 5F9XA 2BQAA 193LA 3WPLA 2Z39A 1BWHA 1JJ1A 3TMVA 1LJNA 1LMCA 5DN5A 1YAPA 2ZIKA 3TXHA 2FBDA 4ZIXA 1P2CC 1QDRA 6LYZA 1B7MA 3RT5X 1UICA 2Z38A 1GB8A 5B1FA 4XYYA 2BLYA 1WQPA 2BQCA 2ZILA 3LZ2A 133LA 4DD1A 4YM8A 1OUJA 1XSFA 1A4VA 2YBHA 3W6BA 3MGWA 1IP3A 1GXXA 1LAAA 1LZEA 4LYZA 1UIEA 4UWNA 1WQOA 1IY4A 1JHLA 3G3AB 4H1PA 3CSQA 4LYBA 1GFKA 4LYCA 3AGGG 1IWWA 4NHTA 1REZA 3A93A 1B7OA 1XGUC 3IJUA 1LSPA 5KXZA 1GEZA 3WUMA 4TX7A 3CSZA 5I53A 2YVBA 1LZGA 2HUBA 1YAOA 2ZNWY 1EQ5A 1HNLA 1HFYA 1V7SA 2WARA 4ETBA 2YBMA 4H9HA 5LVHA 4RW1A 3ATNA 5KXSA 1CKHA 4QDNA 5D5CA 1IOSA 1QIOA 4GCFA 1UA6Y 1IOQA 1B9OA 1XGPC 4WG7A 1GBXA 5B59A 1TEWA 1LKRA 1LMQA 1DXJA 1CJ8A 4J0LA 4B49A 2Z2FA 3HFMY 4J7VA 4GN3A 3G3BB 1QSWA 4WL6A 1DI4A 3W6CA 4XJIA 4EOFA 2MEDA 4NHIA 1DPWA 1FKQA 4GLAA 4KXIA 2MEEA 3A6BY 1XGQC 4HTQA 2CWIA 1HFXA 1IR7A 1HERA 4DWXA 4I8SA 5KXRA 1VFBC 5I4YA 4ET9A 1J1PY 3E3DA 2H5ZA 1JSFA 1JPOA 3HBEX 1HEQA 1XEKA 2YBIA 1NDMC 4H92A 4WO9A 2DQGY 5LAGA 4DD7A 4DD0A 2BQJA 3CT0A 4R0FA 2D4JA 5DM9A 3ZVQA 1DZBX 3LN2A 3WU9A 3D9AC 1BB5A 1GB2A 1UIGA 1UIFA 4LZTA 5T3FA 1GE4A 4PHIA 1WTMA 4LT3A 1F0WA 2ZWBA 1EQEA 4W94A 3TXDA 4IJ4A 4XJHA 4NG1A 1IWYA 3WMKA 5KXKA 3WW5A 1F6RA 4DD2A 3CT5A 1NDGC 4TTDA 2HECA 5LYTA 5AMYA 2YBLA 4NSIA 4G4BA 1SLYA 4GLVA 1LJ4A 4WM1A 1LMTA 1VDPA 1GBWA 4H8ZA 4ETAA 4Z41A 1FKVA 1LZBA 4OWHA 1IP2A 1NMMA 2D4KA 2D4IA 4WOAA 1B7RA 4W96A 1LCNA 4LFPA 5EBHA 1IY3A 2G4NA 1ZMYL 4MR1A 1LYOA 4TWSA 1RE2A 4HPEA 1D9UA 5LVJA 2Z18A 2DQCY 3K3TA 5KJ9A 1GEVA 1VEDA 2ZIJA 1QSAA 4HJYA 1HFZA 3QNGA 2LHMA 5APCA 1IP5A 4NFVA 2I25L 5ILCA 194LA 1C46A 3GXRA 2VB1A 1G7IC 1GFGA 2BQHA 5B1GA 1JUGA 3OJPA 1GBOA 2BQKA 3QE8A 5DN4A 1GF8A 1JKDA 1UIDA 2W1MA 4NGOA 1YILA 2DQFC 5KKIA 1ZV5L 1HSWA 3WW6A 1B5YA 5ILFA 1LHJA 1GB7A 1LKSA 1LZSA 1QTKA 1W6ZA 3P68A 1GF0A 1LSGA 2Q0MX 1YANA 1CJ9A 4U3XB 1YL1X 3TXJA 1GF6A 4BS7A 4HV1A 4G4CA 2DQEY 132LA 2LZTA 3CSRA 4NGLA 4QY9A 4YF2A 2DQHY 1LZ6A 1KIRC 1OUBA 2FYCA 1FLYA 4NIJA 3TXGA 1GFHA 4UWUA 1WVUA 4WLDA 4N1CC 2Y8PA 5IELA 1LMOA 3CT1A 1B7QA 1HEPA 2LYZA 1SQ2L 1D0MA 2YBJA 1FLUA 4LT1A 4MCKA 4NWHA 4EMNA 1XFPL 1LMNA 2YBNA 1JJ3A 3AZ4A 3A90A 4PPOA 3TMUA 4NSHA 2MEIA 1LJIA 1BVKC 1FDLY 4H9EA 1LMPA 5F9UA 2FYDA 1XEJA 4DC4A 2W1LA 1C10A 1BWIA 1CJ6A 1IWXA 1CKDA 2ZYPA 3B6LA 1MELL 1KXWA 1LSAA 3N9EA 4H91A 1EL1A 2HEDA 4O34A 4DDBA 135LA 1JEFA 2BQFA 4WLTA 3TXEA 4H9AA 4GCDA 2BQLA 5LA5A 3A92A 3D3DA 1QUTA 5A3EA 153LA 2B5ZA 1IWTA 4TUNA 5KY1A 5M1YA 1KIPC 1NQIA 2YSSC 1D6QA 1B5VA 1KXYA 3VWOA 4WM2A 5LVIA 4DDAA 2X0AA 1DPXA 1BVXA 1JKAA 1GBSA 4A7DA 4LT0A 3AGHA 2PC2A 5C6LA 4CGEA 1N4FA 1LZ1A 3N9AA 1I56A 1F10A 4HJVA 3WYHA 4XADA 3AJNA 4H9CA 4HTNA 5I54A 3A3RX 2Z2EA 1CKFA 2AUBA 4M6DA 2HU1A 3A6CY 1W08A 3LHMA 1LZ9A 1BWJA 3J4GA 1HEWA 1IP4A 1GXV2 1XGTC 1LYYA 4L41A 1A2YC 4LT2A 1JJ0A 4KL7A 4NEBA 4XJFA 1YQVY 2ZQ3A 5KXYA 5I4XA 1HC0A 1LZDA 1WVVA 1LJ3A 3T6UA 4G49A 4C5FA 2H9JA 1BB3A 5FDJA 4IASA 4ETEA 1DKKA 2Z37A 3W6DA 1YKXX 1JWRA 5KXXA 1IC7Y 1GD6A 1KXXA 1NKHA 2HEFA 1AKIA 4OOOA 1LSNA 4WM6A 4DT3A 4RLMA 1DKJA 2ZNXY 1OUFA 1YKYX 1DQJC 1GHLA 1GBYA 4FJRA 1LJHA 5HMVA 4NY5A 1GFEA 4PJ2C 5B05A 1LZ8A 1AT5A 1JIYA 5APEA 4B0DA 4GN5C 1LJKA 1YROA 3SP3A 1UACY 1B7PA 2D91A 5II3A 1LYZA 1G7JC 4YENA 4YEOA 2Z12A 1VDQA 3TXKA 1ZVHL 2I26L 4N0JA 4YOPA 2YDGA 4H9FA 4Z98A 3P65A 4NG8A 5KKJA 4HP0A 5B07A 1IIZA 5D5FA 1LZRA 2BQDA 2C8OA 2RSCA 3RW8A 1LSDA 1LSZA 1IWZA 1LYSA 3AZ7A 4P2EA 3WUNA 1CKGA 1BGIA 2LYMA 1GF9A 4NGZA 4NGIA 2EKSC 1GE2A 3TXBA 2BLXA 1TBYA 1B5WA 4H8YA 1LZNA 4LYMA 2D6BA 2HEEA 4LYTA 1IOCA 2EIZC 1IX0A 4H94A 1OUHA 1LJJA 1E8LA 1FLWA 1C43A 1JSEA 3B72A 1C7PA 1G7HC 5J7CA 2W1YA 4LGKA 4WM5A 1GFTA 4C3WA 5L3HA 1DI3A 1GFAA 5HNCA 1LHLA 5F81A 1B5XA 4N9RA 1HHLA 4B4IA 1WQQA 2IHLA 2W1XA 1REMA 1NBYC 1VDTA 1NBZC 2DBTA 3LYOA 4OWEA 2MEGA 4QEQA 3EO5A 3WU8A 5LXWA 3A96A 1DI5A 3LYZA 2G4QA 2C8PA 3P66A 2BQNA 2MEHA 3AGIA 1J1XY 5LAFA 8LYZA 4BAPA 1IC5Y 4NSGA 4G9SA 1QTEA 4LFXA 1REXA 1ALCA 4XJBA 1J1OY 3TXFA 4DD3A 4TSBA 2XTHA 1WQMA 5LVGA 2F30A 1BB7A 5LIOA 1FBIX 1UC0A 2F2NA 4OWAA 4H93A 4NGYA 5IHGA 1GFVA 4BAFA 1GB9A 3HBDA 4ET8A 3WH1A 2DQIY 2H9KA 1GFJA 3CB7A 4H8XA 4BADA 1VAUA 5FHWA 1JTOL 4WMGA 4NGKA 4UWVA 4Z46A 5E9RA 3ZEKA 1OUEA 4ETCA 1EQ4A 1RI8B 1LZCA 1JKCA 1MLCE 1Z55A 1GFUA 3TMXA 2CDSA 1GFRA 2Z19A 4HJZA 5LYZA 1YKZX 3A8ZA 3OK0A 4TSCA 4CFPA 1GB0A 1REYA 208LA 3W6FA 3WUAA 1JITA 4B1AA 4RLNA 1B7SA 1GF4A 5KXLA 4DD9A 1B7NA 1HF4A 1G7MC 5HQ1A 1VDSA 2XBRA 4AXTA 3B0OA 3LYTA 1YL0X 1RFPA 1VATA 1GPQC 1OUDA 2DQDY 2MEAA 4GCCA 5KXNA 4NHQA 1IP1A 4NSJA 5HNLA 2XJWA 5F16A 2ZQ4A 4E3UA 2CJLA 1NF5A 1GAYA 4B4JA 5DLAA 4ETDA 3ATOA 1UUZC 4RDSA 5A3ZA 1LZAA 1YIKA 134LA 1LSCA 1INUA 3EBAB 1PZYA 3T36A 1LSMA 2XBSA 4WO6A 1GE1A 1B0DA 1LZYA 4H9IA 4QGZA 1BB4A 4MSTA 2EPEA 2G4PA 2LYOA 5HMJA 4HPIA 3A34A 1TCYA 1WQNA 4FDYA 4NGJA 1GB3A 3WVYA 1GBZA 2BPUA 1IC4Y 3AB6A 1CKCA 2BQBA 1HMKA 1I20A 4J1BA 3ULRA 7LYZA 4D9ZA 1GF7A 1B2KA 1LMAA 1LHMA 1HMLA 1GAZA 1LPIA 1AZFA 1C08C 5I5QA 1IVMA 3WU7A 5APFA 1RJCB 4N1EI 2EQLA 3BKVA 1JTTL 3WXUA 1LOZA 5FCPA 1XEIA 3CQLA 1OP9B 1OUIA 1QUSA 5L9JA 5C6IA 1GE0A 3A67Y 3RZ4A 1FLQA 1B5UA 1LZTA 4N5RA 3IWRA 3A95A 1PS5A 4LYOA 1O23A 3W6EA 1C45A 1T3PA 5KXOA 3TMWA 1IP7A 1IP6A 2BQGA 1HSXA 2N5ZA 3EMSA 3RU5A 3QY4A 4OWBA 6LYTA 5KXWA 4M4OA 2NWDX 5L3IA 1NWGA 1H6MA 4PRQA 1AM7A 1YAQA 3AYQA 1JTPL 4XJDA 1TDYA 1QQYA 1GWDA 154LA 1UIHA 5HLLA 2MEFA 3N9CA 2HTXA 4NHSA 4KPMA 4GN4A 207LA 4R6CA 3AW7A 1UIBA 1BB6A 4CHXA 4DDCA 4OOTA 1GF5A 3IJVA 1GE3A 3A3QA 1GDXA 1CNSA 1FN5A 1QDTA 2HEBA 4PRUA 2DQAA 5APDA 2GV0A 1LZ5A 1GB5A 3P64A 3TXIA 1HEMA 2DKVA 5E4PA 5F14A 4ZEEA 3AW6A 4G4HA 1LJFA 4XN6A 1IR9A 4ZFPA 4Z3MA 3AZ5A 1WTNA 1OUCA 3FE0A 4WM3A 3WULA 1LSFA 3A94A 2IFFY 1G7LC 2CGIA 2LZ2A 3F6ZA 5IDDA 3ZVQB 1D0KA 5LA8A 3EXDA 5KXMA 3A91A 2MEBA 4HSFA 1CJ7A 1KIQC 4IATA 4HTKA 3RNXA 1V7TA 5JENB 1BQLY 3FI7A 1ZVYB 3WPJA 1B5ZA 1LTMA 4HV2A 5KXTA 4NWEA 2BQIA 1IEEA 1YAMA 3GXKA 1IORA 4H90A 4NHPA 3KAMA 1H87A 1UCOA 4NGVA 5FELA 5C6JA 5LYMA 3W3EA 4J1AA 1HELA 4WL7A 1IWVA 1WQRA 2MECA 4PGJB 2F4AA 4AGAA 1UBZA 3B0KA 1BHZA 4I0CA 4OWCA 5LVKA 1IWUA 4DYGA 4GCEA 1IOTA 1D6PA 5B06A 2BQOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3M18B 1RCMA 4WG1A 4I7PA 192LA 1JISA 2A7DA 3WPKA 1F6SA 4CJ2A 155LA 1DYGA 5DL9A 3M3UA 236LA 2LZMA 1LHIA 1G0MA 1OUGA 2BAAA 4OW1A 1TAYA 5K7OA 2HEAA 125LA 4RW2A 138LA 223LA 2DQJY 3SN6R 5KXPA 1GB6A 5FEKA 250LA 1AT6A 4WLXA 3LYMA 1P2CC 6LYZA 5B1FA 1A4VA 119LA 1C60A 2RBOA 1IY4A 2B74A 1QTDA 3A93A 1B7OA 1QSBA 4TX7A 1EQ5A 1HNLA 4H9HA 1CKHA 5D5CA 1IOSA 1UA6Y 2OTZX 1XGPC 120LA 5B59A 1TEWA 1CJ8A 2Z2FA 3HFMY 4J7VA 2RH1A 3W6CA 2F47A 4ARMA 1HFXA 130LA 2B7XA 4I8SA 189LA 5KXRA 1VFBC 1JQUA 1XEKA 200LA 5LAGA 4DD0A 3K2RA 1T97A 163LA 1GB2A 1T8GA 1GE4A 128LA 1F0WA 1L65A 1L26A 1IWYA 1DYFA 3WW5A 157LA 249LA 1TLAA 1SLYA 4WM1A 1GBWA 4ETAA 1CTWA 4OWHA 1LCNA 4LFPA 2G4NA 4HPEA 4I7SA 1QUOA 1GEVA 1VEDA 1QSAA 1HFZA 3QNGA 1IP5A 2VB1A 1GFGA 4W55A 3QE8A 4NGOA 1YILA 1LWKA 3WW6A 5ILFA 1LHJA 1LZSA 4EPIA 261LA 4G4CA 132LA 2LZTA 162LA 1KIRC 2FYCA 1FLYA 1GFHA 4WLDA 4N1CC 3DMZA 2LYZA 4E97A 3RUNA 4EMNA 1LMNA 1JJ3A 3A90A 1CV6A 4PPOA 3TMUA 4YXCA 2MEIA 4H9EA 1QT4A 2W1LA 1IWXA 3N9EA 1LSAA 2RBRA 1EL1A 4DDBA 2BQFA 3TXEA 1P2RA 4H9AA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3M18 B;  1RCM A;  4WG1 A;  4WLY A;  4XEN A;  2HU3 A;  5I4W A;  1LHK A;  2I6Z A;  5FST A;  1JIS A;  2A7D A;  2BQE A;  3WPK A;  1F6S A;  3BKH A;  1IO5 A;  1D0L A;  1LSY A;  4ML7 A;  2BQM A;  2ZYC A;  4CJ2 A;  4CFO A;  1LZ4 A;  5DL9 A;  3AZ6 A;  4ANR A;  3LZT A;  3M3U A;  4KT3 A;  1LHI A;  4B4E A;  1OUG A;  2BAA A;  1IR8 A;  1B7L A;  4OW1 A;  4X3B A;  1TAY A;  4NGW A;  5K7O A;  1LJG A;  1JKB A;  1GDW A;  1NHE A;  2HEA A;  3WVX A;  1HEO A;  1LJE A;  1UIA A;  4RW2 A;  1XGR C;  4XJG A;  2F4G A;  2DQJ Y;  1GF3 A;  3J6K A;  4GCB A;  4II8 A;  1LSE A;  5LIN A;  3WXT A;  3B0I A;  4N8Z A;  5KXP A;  1GB6 A;  1OQM A;  1OUA A;  1T6V L;  2FBB A;  3HBH A;  5FEK A;  1LSB A;  3W6A A;  3WL2 A;  1I1Z A;  4H9B A;  4WM4 A;  4YEM A;  1HEN A;  9LYZ A;  1AT6 A;  2A7F A;  4WLX A;  3LYM A;  1LHH A;  3P4Z A;  5F9X A;  2BQA A;  193L A;  3WPL A;  2Z39 A;  1BWH A;  1JJ1 A;  3TMV A;  1LJN A;  1LMC A;  5DN5 A;  1YAP A;  2ZIK A;  3TXH A;  2FBD A;  4ZIX A;  1P2C C;  1QDR A;  6LYZ A;  1B7M A;  3RT5 X;  1UIC A;  2Z38 A;  1GB8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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