4CHXA

Crystal structure of mltc in complex with disaccharide pentapeptide dhl89
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
327
structure length
327
Chain Sequence
DTNGFDILMGQFAHNIENIWGFKEVVIAGPKDYVKYTDQYQTRSHINFDDGTITIETIAGTEPAAHLRRAIIKTLLMGDDPSSVDLYSDVDDITISKEPFLYGQVVDNTGQPIRWEGRASNFADYLLKNRLKSRSNGLRIIYSVTINMVPNHLDKRAHKYLGMVRQASRKYGVDESLILAIMQTQSSFNPYAVSRSDALGLMQVVQHTAGKDVFRSQGKSGTPSRSFLFDPASNIDTGTAYLAMLNNVYLGGIDNPTSRRYAVITAYNGGAGSVLRVFSNDKIQAANIINTMTPGDVYQTLTTRHPSAESRRYLYKVNTAQKSYRRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and Cell Wall Cleavage by Modular Lytic Transglycosylase Mltc of Escherichia Coli.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE C
total genus 111
structure length 327
sequence length 327
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2013-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
A PF11873 Mltc_N Membrane-bound lytic murein transglycosylase C, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4chxA02
1B7SA 1C43A 4YEOA 3TMWA 3WUAA 1GB2A 1GBOA 4WLXA 4WM4A 3AZ5A 4TTDA 1OUBA 1QTKA 3CT0A 4TX7A 4YEMA 3A6BY 1IWTA 4BAPA 2Z37A 2DQAA 1DI4A 1VDTA 1I20A 1XGPC 4H9BA 1GAZA 1LKSA 5KXNA 4WOAA 3W6BA 4LT1A 4NGJA 1BB3A 1GF3A 4H90A 1VAUA 5B06A 4RW2A 1BWHA 1IY4A 1JKCA 4RW1A 4LT0A 1LSAA 1IP5A 1B5WA 3ATOA 4Z98A 1QSAA 1IIZA 4BADA 3WMKA 2BQAA 4HV1A 5FELA 1YKYX 4LYCA 1GBWA 1GE0A 1JSFA 2W1YA 1FKVA 4PJ2C 2DQJY 2MEIA 4DT3A 3GXKA 4QGZA 1GF4A 3W6DA 3B0KA 1YILA 4B0DA 4YM8A 1C46A 5KKJA 5APCA 2B5ZA 2DQEY 2YBMA 5B1FA 5HNLA 1LHKA 4ZIXA 5LAGA 4WM6A 1GB3A 4H9CA 1JTTL 1GFEA 1HSWA 1LAAA 4XJGA 2YBIA 1NWGA 1JISA 5LVKA 2ZYCA 3M3UA 1VDQA 1HEQA 4HTKA 4NGOA 2HU3A 3AGHA 3W6FA 3ATNA 3LZ2A 2IFFY 3WW6A 1W6ZA 4CFPA 2I25L 2BQLA 5LAFA 1DKJA 4UWUA 1IOTA 3A90A 3AZ4A 1LJFA 3WPLA 4H92A 1GBSA 1XGTC 4KXIA 4PRQA 4WG1A 5L3IA 2DQGY 5M1YA 1CJ6A 3WH1A 1UIBA 3B72A 4NEBA 5FSTA 1RCMA 3CSRA 1ZVYB 3FE0A 1UIAA 2HTXA 2MEBA 5DM9A 1DPXA 5C6IA 1HERA 1CKGA 2G4NA 1JITA 4DDCA 1GF6A 1LZ6A 1OUHA 1PZYA 1UBZA 5LA5A 1XGRC 1B7LA 4HJYA 1JUGA 1XEKA 4R0FA 1CJ8A 1DZBX 1GWDA 3LYOA 1IX0A 3LYTA 2D4IA 4OWBA 1LSYA 1QQYA 1NHEA 1GFTA 1KXYA 5L3HA 3D3DA 1IOCA 1GF9A 4HJVA 1LZNA 2BQDA 4NGLA 3QY4A 1GBYA 3G3BB 4QDNA 3LZTA 1GFHA 1F10A 1CJ7A 1QUTA 4H93A 1YL0X 3CSZA 4OW1A 1IR8A 1C10A 3A93A 5E4PA 1AM7A 4WO9A 1LKRA 4N8ZA 3EXDA 1BGIA 1B5ZA 1LZBA 1DI5A 1UIHA 2C8OA 3A96A 4ETBA 3IJVA 1LSCA 4GCBA 1IR9A 1NBYC 2HEBA 3HBHA 1LHLA 1TBYA 4HPEA 5I54A 1B5VA 3WULA 2BQEA 1JKAA 1LSDA 2ZWBA 2YBLA 3RZ4A 5F81A 2AUBA 1JTPL 4LFXA 1OUEA 4C5FA 2MECA 1H6MA 5I5QA 4FDYA 2Z2EA 208LA 3A6CY 1IEEA 2BQCA 1LZCA 1GB7A 4NGKA 1FDLY 1JJ0A 4PGJB 4DD9A 2DQFC 1LYYA 2FBDA 1D0KA 1IC7Y 2RSCA 4GCEA 4NHTA 4XJBA 4ETAA 3WL2A 4HTQA 3CT1A 5DN5A 2BPUA 4XJFA 1GB6A 3P4ZA 1WQMA 1INUA 1UIFA 4IATA 1B5UA 1IOSA 3IWRA 2ZYPA 1HSXA 2I6ZA 1B5YA 2W1MA 4WL6A 1I56A 3AGGG 4WG7A 4NY5A 1GFGA 4NGYA 1KIRC 2CGIA 5KKIA 2YBHA 1LZAA 4H8ZA 4XJDA 4WM2A 4DD7A 1BB6A 1GE4A 4NFVA 4B49A 5FCPA 4WM1A 4H1PA 4Z41A 5KJ9A 1IP4A 3CT5A 3CSQA 4J7VA 5KXRA 1DPWA 1QDRA 5L9JA 2DQHY 4ET9A 1V7TA 1KXWA 2DKVA 3WU7A 4XJIA 2ZNXY 1LMQA 4OOTA 3A34A 4WLDA 1LTMA 3ZEKA 3WPJA 1HFYA 1NBZC 1LMPA 1UCOA 1IWZA 1YL1X 2MEGA 3B6LA 4NWHA 3OJPA 1DQJC 2NWDX 4RDSA 2HEAA 1ALCA 2MEDA 1LJKA 3G3AB 3P64A 2YSSC 4YENA 5KXYA 3TMXA 1H87A 1LMTA 1AT5A 3HBEX 5EBHA 2D6BA 2G4PA 1JPOA 4NHPA 1VATA 4WMGA 3TXEA 2XJWA 1B7OA 4H9IA 193LA 2PC2A 1T6VL 132LA 1LJ4A 1LZ5A 3TXIA 3LHMA 4M4OA 1B7MA 1IWVA 3RT5X 4GLVA 4B4JA 2ZILA 1LHMA 1NF5A 5F9XA 1LZRA 4NG8A 4D9ZA 5LINA 3WVYA 4ETDA 1LZ9A 4XYYA 1FLUA 4NHIA 4CGEA 1BB5A 1TAYA 5JENB 4KT3A 1IWXA 1D6PA 1BVXA 3TXBA 1B7PA 1JIYA 1BWJA 1B7NA 5HQ1A 1LZDA 2LYMA 3W6EA 1LSPA 4PHIA 5B1GA 3K3TA 4LT2A 3HFMY 5AMYA 1GDWA 1JHLA 1QSWA 3N9EA 1O23A 2CJLA 5D5CA 1G7IC 4P2EA 4Z46A 3KAMA 2BQBA 3EBAB 2BAAA 4UWVA 5J7CA 1OUGA 1B9OA 1YAOA 4PPOA 4E3UA 2Z2FA 1LCNA 4GN5C 3WXTA 1NMMA 3WYHA 1IP6A 1LZ8A 3EMSA 1OUCA 133LA 4XN6A 5ILCA 4TUNA 2A7FA 1C08C 1REXA 2MEFA 4H9EA 1UICA 5KXWA 3AYQA 1IVMA 4G9SA 1HMKA 1QIOA 4N5RA 2H5ZA 4MR1A 1F6RA 5I4WA 4LYBA 1JSEA 2F30A 2Z18A 1XFPL 1UC0A 1DI3A 2D4JA 1LHHA 5DLAA 2W1XA 1SQ2L 3P65A 2MEHA 2BQJA 5LXWA 3ULRA 1XEIA 2A7DA 1CKFA 4DC4A 1LJ3A 2ZQ4A 5FEKA 3WUMA 2W1LA 1EQ5A 1GXXA 1LZ1A 3J4GA 4L41A 1LMOA 1IP3A 4PRUA 1LHJA 4A7DA 1OUAA 3TMVA 4NSHA 1GFJA 1WTMA 1YANA 1XGUC 5LIOA 3RU5A 1D0LA 3WU9A 2Q0MX 4WO6A 2HECA 1LYOA 1HF4A 4R6CA 1GBZA 1BWIA 2ZIJA 2CDSA 6LYTA 2BQFA 4DD1A 1QDTA 1RE2A 2Z12A 1IR7A 3WXUA 3P68A 134LA 1F0WA 1HENA 1VDSA 2DQDY 1MLCE 4G4BA 4NGWA 4ETCA 1KIQC 3AB6A 3W6AA 2IHLA 1BVKC 1KIPC 4WL7A 2BQKA 1GB9A 1IWYA 1RI8B 1C7PA 4WLTA 1HEMA 1NDMC 1BB7A 4IJ4A 1LZTA 1UIEA 1LSNA 5LVJA 1WQOA 4W96A 2GV0A 1J1XY 2XTHA 1LSGA 1LSZA 1WVVA 2XBSA 5II3A 1GB0A 1VEDA 3A92A 4LT3A 5ILFA 4OOOA 1I1ZA 1HC0A 1B5XA 1FKQA 2G4QA 4LYOA 5FDJA 1UIGA 5I4XA 3BKVA 3M18B 1CKDA 2I26L 2CWIA 4RLNA 5DN4A 3ZVQA 1G7MC 2N5ZA 2ZQ3A 4DD3A 2YVBA 4EOFA 1GAYA 4H8YA 1JTOL 2FBBA 1REYA 1WQNA 1LMCA 1JKDA 5KXPA 4B4IA 5A3EA 3WU8A 4BS7A 4XADA 8LYZA 4U3XB 1GFKA 3AGIA 1GPQC 4O34A 207LA 4II8A 4AXTA 5B59A 2BLYA 3EO5A 1LYSA 194LA 1P2CC 3CB7A 4NHSA 1UA6Y 1LSMA 5LVHA 1DKKA 1G7JC 3TXFA 4H94A 1A2YC 3A8ZA 1B7QA 3BKHA 1GF5A 4IASA 4J0LA 2ZNWY 2EKSC 1JKBA 1WVUA 2MEAA 1IC5Y 1C45A 1TEWA 1A4VA 1JJ3A 1JWRA 4DDBA 1LOZA 2EQLA 4DD0A 3E3DA 3AW7A 2F4GA 4G49A 2LZ2A 4J1AA 5LYMA 1WQQA 3TXGA 4LGKA 1VFBC 4B1AA 2YBNA 1N4FA 1XGQC 1WQPA 2DBTA 1OUFA 3D9AC 1OUIA 4I0CA 2XBRA 4TSCA 1WQRA 2FYDA 1EL1A 2D91A 3J6KA 4CHXA 1DXJA 4ML7A 5C6LA 2DQCY 5LA8A 1IY3A 1B7RA 1F6SA 4AGAA 3MGWA 5KXZA 4M6DA 1YKXX 1JJ1A 1GHLA 4CFOA 4OWAA 2WARA 4N1EI 4EMNA 1GB5A 5I4YA 1GFVA 4X3BA 5KXKA 3TXDA 2Z39A 1XSFA 1CJ9A 3WUNA 7LYZA 1LJEA 1CKCA 2BLXA 2LYOA 1TDYA 3A95A 3IJUA 1HMLA 2Z19A 1IOQA 2D4KA 1BQLY 4OWEA 1QTEA 5HMJA 4CJ2A 1HELA 1YQVY 1QUSA 1TCYA 4LYMA 3A3QA 3CQLA 1GB8A 5F16A 1JEFA 1VDPA 6LYZA 5LYTA 4OWHA 4GCFA 135LA 1ZV5L 1FLYA 1GF7A 1REZA 4LZTA 4N0JA 5B07A 2Y8PA 5LVGA 1HHLA 4NHQA 3RW8A 2BQIA 4LYZA 1GE3A 1LJNA 1LZ4A 1V7SA 3B0IA 1MELL 3LYZA 1LZGA 4DYGA 5IHGA 1IP7A 2BQOA 5KXLA 3GXRA 3TXHA 1EQ4A 1SLYA 5E9RA 154LA 3WVXA 4C3WA 4XENA 2EPEA 1HFXA 4H9AA 5F14A 1AT6A 2YDGA 4MSTA 1GEZA 5HNCA 4YF2A 4NWEA 1J1OY 1UIDA 1HFZA 1CNSA 4NSIA 4TSBA 1B2KA 2Z38A 1LJGA 1GD6A 3WW5A 2H9KA 3W3EA 4TWSA 2H9JA 4H91A 5HMVA 2X0AA 5HLLA 1YKZX 1UACY 1OUDA 1D0MA 1LPIA 4H8XA 1REMA 2C8PA 1GFAA 4DD2A 5F9UA 2BQGA 4NGVA 1IP2A 2BQHA 1GBXA 1LZSA 1LSFA 2LZTA 1GDXA 3T36A 2F2NA 1BHZA 4LFPA 3LYMA 5LYZA 3A67Y 1D9UA 4OWCA 1HEPA 1LYZA 1CKHA 4QY9A 4NIJA 1GFUA 1UUZC 1HEOA 2HUBA 4G4HA 1AKIA 1LZYA 1OUJA 4DWXA 4ET8A 4ZEEA 1LMNA 1LZEA 1Z55A 4QEQA 4KL7A 4NGIA 5KXOA 4DDAA 3T6UA 3ZVQB 3A91A 2HEDA 5DL9A 1FLQA 3B0OA 5D5FA 4MCKA 4ANRA 1IO5A 1KXXA 1RJCB 1GF8A 2BQNA 4HTNA 4NG1A 5LVIA 4G4CA 1YAMA 5C6JA 2VB1A 3N9CA 5IDDA 4WLYA 1B0DA 2MEEA 4GLAA 1LSEA 1W08A 1EQEA 1XEJA 4FJRA 1GE2A 1GFRA 1J1PY 3AJNA 4HV2A 1ZMYL 4B4EA 4HJZA 3AW6A 1AZFA 4WM5A 2FYCA 3VWOA 3WPKA 4XJHA 2HEEA 2LHMA 4N9RA 4NGZA 1HEWA 1BB4A 1GEVA 5KXMA 1ZVHL 5A3ZA 1OQMA 4RLMA 3TXKA 1GF0A 1NDGC 4GCCA 5APEA 2ZIKA 5KXSA 1NKHA 4KPMA 4UWNA 3SP3A 1FLWA 4GN4A 153LA 5IELA 4ETEA 1RFPA 1YAPA 4H9FA 1LJHA 4W94A 2DQIY 4HP0A 5APFA 1OP9B 3FI7A 3AZ6A 4GCDA 4J1BA 5APDA 2HEFA 1GXV2 4NSJA 5I53A 1HNLA 1PS5A 3QE8A 4BAFA 1LJIA 4ZFPA 2LYZA 4H9HA 4I8SA 4N1CC 9LYZA 5KY1A 2EIZC 5K7OA 3P66A 3F6ZA 1IWWA 1YIKA 4LYTA 4Z3MA 1IC4Y 1LMAA 1IWUA 1G7LC 1T3PA 1LHIA 2BQMA 4HSFA 1IORA 1FN5A 3TMUA 3HBDA 5T3FA 3N9AA 1YAQA 1IP1A 1GE1A 3A3RX 4WM3A 3QNGA 5B05A 3AZ7A 3OK0A 1G7HC 3A94A 3RNXA 3W6CA 1FBIX 1E8LA 1YROA 1LJJA 3TXJA 1D6QA 4GN3A 4HPIA 4YOPA 1WTNA 5KXXA 5KXTA 2YBJA 3LN2A 1NQIA 4NSGA 5FHWA 2HU1A 1LSBA 2F4AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B7SA 1GB2A 1GBOA 3AZ5A 1OUBA 3CT0A 2B75A 4YEMA 4BAPA 2Z37A 2DQAA 1L56A 1GAZA 1DYFA 1LKSA 2B74A 4WOAA 4LT1A 3OE9A 5B06A 4LDLA 223LA 4RW1A 4LT0A 4Z98A 3ATOA 3WMKA 1GBWA 4PJ2C 1JSFA 2W1YA 1B6IA 140LA 1L08A 227LA 3B0KA 1C46A 2YBMA 2RAZX 5B1FA 3GUIA 4H9CA 1L12A 126LA 1NWGA 4NGOA 2HU3A 3ATNA 1W6ZA 1DKJA 3A90A 4PRQA 2DQGY 1PQJA 3B72A 143LA 5FSTA 3FE0A 1CKGA 1PZYA 2LCBA 1XGRC 1B7LA 1CV6A 1XEKA 1LYGA 1IX0A 2D4IA 3HTDA 1GF9A 2BQDA 3QY4A 1GBYA 4QDNA 3LZTA 1D3NA 1GFHA 1L51A 190LA 4EKSA 1YL0X 1QT8A 4W51A 1C10A 231LA 3A93A 2B7XA 4WO9A 1B5ZA 1L0JA 261LA 1L47A 2OTYX 211LA 244LA 1L66A 252LA 3WULA 2Z6BA 3RZ4A 4LFXA 1LYHA 3V2YA 4I7RA 208LA 3A6CY 2BQCA 1GB7A 2DQFC 1IC7Y 4ETAA 3WL2A 2BPUA 4XJFA 1GB6A 2XQOA 1HSXA 1GFGA 1LZAA 4XJDA 4DD7A 4WM2A 4Z41A 1IP4A 3CSQA 3OE6A 5L9JA 4XJIA 2ZNXY 4OOTA 3A34A 4WLDA 1NBZC 1UCOA 1YL1X 180LA 3C81A 3G3AB 1LJKA 1L49A 2G4PA 3TXEA 1VATA 193LA 209LA 3TXIA 1G07A 3CDOA 3DN1A 1PQOA 120LA 1FLUA 4KT3A 5HQ1A 3FI5A 2LYMA 1L21A 3W6EA 1LSPA 115LA 1GDWA 1JHLA 1QSWA 4ARMA 1OUGA 4PPOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1B7S A;  1C43 A;  4YEO A;  3TMW A;  3WUA A;  1GB2 A;  1GBO A;  4WLX A;  4WM4 A;  3AZ5 A;  4TTD A;  1OUB A;  1QTK A;  3CT0 A;  4TX7 A;  4YEM A;  3A6B Y;  1IWT A;  4BAP A;  2Z37 A;  2DQA A;  1DI4 A;  1VDT A;  1I20 A;  1XGP C;  4H9B A;  1GAZ A;  1LKS A;  5KXN A;  4WOA A;  3W6B A;  4LT1 A;  4NGJ A;  1BB3 A;  1GF3 A;  4H90 A;  1VAU A;  5B06 A;  4RW2 A;  1BWH A;  1IY4 A;  1JKC A;  4RW1 A;  4LT0 A;  1LSA A;  1IP5 A;  1B5W A;  3ATO A;  4Z98 A;  1QSA A;  1IIZ A;  4BAD A;  3WMK A;  2BQA A;  4HV1 A;  5FEL A;  1YKY X;  4LYC A;  1GBW A;  1GE0 A;  1JSF A;  2W1Y A;  1FKV A;  4PJ2 C;  2DQJ Y;  2MEI A;  4DT3 A;  3GXK A;  4QGZ A;  1GF4 A;  3W6D A;  3B0K A;  1YIL A;  4B0D A;  4YM8 A;  1C46 A;  5KKJ A;  5APC A;  2B5Z A;  2DQE Y;  2YBM A;  5B1F A;  5HNL A;  1LHK A;  4ZIX A;  5LAG A;  4WM6 A;  1GB3 A;  4H9C A;  1JTT L;  1GFE A;  1HSW A;  1LAA A;  4XJG A;  2YBI A;  1NWG A;  1JIS A;  5LVK A;  2ZYC A;  3M3U A;  1VDQ A;  1HEQ A;  4HTK A;  4NGO A;  2HU3 A;  3AGH A;  3W6F A;  3ATN A;  3LZ2 A;  2IFF Y;  3WW6 A;  1W6Z A; 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 1GF8 A;  2BQN A;  4HTN A;  4NG1 A;  5LVI A;  4G4C A;  1YAM A;  5C6J A;  2VB1 A;  3N9C A;  5IDD A;  4WLY A;  1B0D A;  2MEE A;  4GLA A;  1LSE A;  1W08 A;  1EQE A;  1XEJ A;  4FJR A;  1GE2 A;  1GFR A;  1J1P Y;  3AJN A;  4HV2 A;  1ZMY L;  4B4E A;  4HJZ A;  3AW6 A;  1AZF A;  4WM5 A;  2FYC A;  3VWO A;  3WPK A;  4XJH A;  2HEE A;  2LHM A;  4N9R A;  4NGZ A;  1HEW A;  1BB4 A;  1GEV A;  5KXM A;  1ZVH L;  5A3Z A;  1OQM A;  4RLM A;  3TXK A;  1GF0 A;  1NDG C;  4GCC A;  5APE A;  2ZIK A;  5KXS A;  1NKH A;  4KPM A;  4UWN A;  3SP3 A;  1FLW A;  4GN4 A;  153L A;  5IEL A;  4ETE A;  1RFP A;  1YAP A;  4H9F A;  1LJH A;  4W94 A;  2DQI Y;  4HP0 A;  5APF A;  1OP9 B;  3FI7 A;  3AZ6 A;  4GCD A;  4J1B A;  5APD A;  2HEF A;  1GXV 2;  4NSJ A;  5I53 A;  1HNL A;  1PS5 A;  3QE8 A;  4BAF A;  1LJI A;  4ZFP A;  2LYZ A;  4H9H A;  4I8S A;  4N1C C;  9LYZ A;  5KY1 A;  2EIZ C;  5K7O A;  3P66 A;  3F6Z A;  1IWW A;  1YIK A;  4LYT A;  4Z3M A;  1IC4 Y;  1LMA A;  1IWU A;  1G7L C;  1T3P A;  1LHI A;  2BQM A;  4HSF A;  1IOR A;  1FN5 A;  3TMU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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