4DD1A

Eval processed hewl, cisplatin aqueous paratone
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies of the effect that dimethyl sulfoxide (DMSO) has on cisplatin and carboplatin binding to histidine in a protein.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dd1A00
1BQLY 4OWHA 1BWHA 5IHGA 1REYA 2BQHA 2HEAA 2C8OA 1XGRC 2I25L 2H9JA 1GB0A 2W1XA 3RT5X 4YEMA 4I8SA 6LYZA 3LN2A 5II3A 3LYTA 4U3XB 5LA5A 2ZNWY 1FN5A 2MECA 1XGQC 2XJWA 4M6DA 2YBIA 3IJVA 2D91A 3EXDA 1TCYA 1CKHA 2DQCY 2I26L 2FBBA 4NHPA 5KKJA 3A3RX 1GF4A 4HPIA 4BS7A 3WPLA 1UBZA 2WARA 1GB6A 1IP6A 4J1AA 1IY3A 2BQMA 4N0JA 2YSSC 5L3HA 2BLYA 1LSYA 3WU9A 1OUJA 1LHHA 3K3TA 4H8ZA 4HTNA 4LT3A 3A34A 1IC4Y 1LJEA 1VAUA 2Z12A 1B7LA 1IWXA 1GF9A 1HELA 1V7TA 1NF5A 3AJNA 4WLYA 4DD7A 132LA 1YQVY 1LJFA 4OWCA 4LT1A 4Z98A 1GWDA 2DQFC 1LSMA 4H9BA 4EMNA 1GF0A 2Z2FA 1LYOA 1I20A 2YVBA 4NY5A 4Z3MA 8LYZA 5FELA 2X0AA 1GD6A 2DBTA 4L41A 4ZEEA 1FLQA 5HMJA 4ETDA 3N9CA 1HEOA 5A3ZA 2ZQ4A 2BQNA 1WQOA 4UWNA 5J7CA 4W96A 3CT5A 4J7VA 1DXJA 3OK0A 3WXUA 4H9FA 3EMSA 3A94A 5JENB 5LYTA 1IY4A 1GB2A 4HTQA 1J1PY 3HFMY 4PHIA 1CKCA 3WPKA 1HERA 4DWXA 1GFRA 5ILCA 1GFEA 2BQAA 5KXLA 3T6UA 3ZVQA 4NWEA 2DQJY 3WH1A 4IJ4A 4TTDA 1XSFA 4MCKA 3WU8A 5L9JA 4NG8A 3CT0A 1LJIA 2Q0MX 1LZBA 1T6VL 1DKJA 1KIPC 1NDGC 2BQCA 3BKVA 153LA 2EKSC 5HQ1A 1LZYA 3A95A 4RW2A 3W6BA 2XBRA 2ZYPA 6LYTA 4WLDA 5KY1A 1LSEA 1OUGA 1GFAA 2MEFA 3TMWA 9LYZA 2F4GA 4HV1A 2NWDX 4H93A 1F6SA 1HEQA 2Z38A 4N9RA 1QIOA 4LYTA 4DD9A 4GCFA 1D0LA 3A3QA 4LZTA 3AGIA 1RI8B 4I0CA 4R6CA 1H6MA 2ZYCA 4H90A 3TXEA 4FDYA 1OUEA 1GE2A 3MGWA 2D6BA 3TXGA 4AGAA 2BQOA 1GB5A 1RCMA 1GPQC 2Z39A 1BWJA 1LMAA 4KPMA 3SP3A 1AM7A 5LVIA 4H1PA 1HFXA 3KAMA 2LZ2A 4NGYA 1KXYA 1REZA 2MEDA 1HEMA 3LYMA 1G7LC 1XGUC 2LZTA 4FJRA 4PPOA 2CJLA 3WW5A 4ANRA 4H91A 1JJ0A 1XEIA 1EQ4A 1SQ2L 1YIKA 4PRQA 1ZMYL 1KIQC 4RW1A 4H9HA 134LA 1B5ZA 1INUA 1B7SA 4DD2A 2BAAA 4ETEA 1O23A 1VFBC 1B5XA 4HPEA 1WTNA 1WQNA 1LSDA 3RZ4A 3ATOA 1WQMA 3LYZA 4DDBA 5APCA 4GN4A 1GFKA 2BLXA 1AZFA 2FYDA 2YBMA 3AGHA 4HSFA 1YAQA 5KXRA 1IP3A 1GEZA 1LZ6A 133LA 4GN3A 4GN5C 1GAYA 5B05A 1KIRC 1YILA 5HLLA 4WL7A 1GE1A 1LSNA 1XGTC 3CB7A 5LIOA 1UC0A 3HBEX 3AZ7A 1F0WA 4NEBA 1FDLY 1D0KA 2HEDA 2A7DA 1CJ7A 3B72A 1LHIA 4H9EA 1NBZC 2DQAA 4R0FA 4XADA 3F6ZA 4NGIA 1H87A 4NSJA 5KXMA 4B4IA 5APDA 4QEQA 1BB3A 1D0MA 1FLUA 1LMPA 1ALCA 207LA 4NGOA 4WG1A 1IR9A 3AZ5A 4J0LA 4HP0A 1GBZA 1D6QA 3AB6A 1FKVA 1MELL 2DQIY 5IELA 4OWEA 1LJKA 4H8YA 3WVXA 5F14A 5I5QA 2HEEA 135LA 1MLCE 1JIYA 2D4JA 4XN6A 2HUBA 3A92A 4XJGA 4ETBA 1LZRA 3A90A 3GXKA 4YEOA 1YAMA 3P68A 4QY9A 1IC5Y 1LSBA 1VDSA 1BB6A 1EL1A 1GB3A 4RLMA 4BAPA 1B7MA 3D3DA 2DQEY 4TX7A 5C6JA 5M1YA 1A2YC 1DI5A 1LAAA 4BAFA 3RW8A 1EQ5A 2MEAA 1CKDA 4LT0A 3WYHA 2D4KA 2PC2A 1DI3A 3IJUA 1QTEA 3QY4A 1BB7A 1LJ4A 4NGZA 4UWVA 3TXFA 1HC0A 1GXXA 4WM3A 5KXXA 4LYMA 1GF7A 3HBDA 1ZV5L 1C43A 4NGWA 5FHWA 5HMVA 1GBSA 1B7RA 1YKZX 2EQLA 4ML7A 5FCPA 1QUSA 4WM5A 5E4PA 5KXZA 5LYMA 3LZ2A 4GCCA 4NGVA 1LYYA 4XYYA 1RJCB 1VEDA 1LZ8A 1LKRA 1QTKA 4NSGA 1FKQA 1LZ9A 1WQPA 1WVUA 4XENA 1YROA 1DZBX 1YL1X 3TMUA 2ZILA 1VDTA 5KKIA 1OUIA 3A8ZA 4WMGA 1CNSA 4NHQA 1LZTA 1LJGA 1VDQA 1QDTA 1XEKA 1WTMA 4G4CA 2EPEA 1GXV2 4D9ZA 1GB8A 4H9IA 1LJ3A 5DN4A 4ETAA 4X3BA 5D5CA 1DI4A 1LJNA 2LYOA 2FBDA 3AGGG 1IWWA 4NSIA 1LHJA 1DPWA 1OP9B 1JHLA 1F6RA 1JUGA 2RSCA 3HBHA 4GLVA 4QDNA 4WM6A 5LYZA 2H5ZA 1RE2A 1ZVHL 1NHEA 1YAPA 5B06A 3VWOA 4OW1A 5KXPA 1IWTA 1J1XY 1UUZC 1YANA 4KT3A 3WL2A 5A3EA 7LYZA 3B6LA 2BQGA 1C46A 194LA 1IEEA 1LZCA 1G7HC 1LHLA 1NWGA 1JJ1A 3M3UA 3B0KA 2MEEA 1IR7A 2LHMA 4H9AA 1JJ3A 4TWSA 1CKGA 1CKFA 4DD3A 2A7FA 1GDXA 3WUNA 5I4YA 1DQJC 1GFTA 1CJ6A 1JKAA 1WQQA 1G7MC 4WO9A 1LZ4A 1QQYA 4NFVA 4NSHA 2CGIA 4PGJB 1GF8A 1GF5A 1LZ5A 1IOSA 4LGKA 3J4GA 3CSRA 1IP4A 1GF6A 2MEBA 5D5FA 5F81A 2D4IA 2F30A 1OUBA 2Z18A 1BVKC 1GFVA 2ZWBA 1C10A 3A67Y 1B5WA 1GE4A 1BB4A 1LZSA 2CWIA 4DD1A 3B0OA 1LZ1A 5APFA 2XTHA 4II8A 1LSFA 2F2NA 4WO6A 5KXNA 1LKSA 1GFUA 2Z2EA 4LYCA 4NIJA 4O34A 5HNLA 4IASA 2HEFA 1LHKA 1LHMA 5E9RA 5B07A 1LMQA 4ETCA 1IOQA 1GHLA 4J1BA 1GFGA 1QDRA 4NHTA 1TDYA 4LYBA 1JEFA 5K7OA 1HEWA 1LZGA 2HEBA 3J6KA 4WM1A 5KXSA 3RNXA 4WLTA 1IOTA 3P65A 5I4XA 4AXTA 4G9SA 3CQLA 5DLAA 3AYQA 2DQHY 1G7IC 2ZNXY 4XJBA 5C6IA 4N1EI 4DYGA 1GFHA 4XJHA 3RU5A 2BQEA 1HFZA 1LTMA 5LAGA 3TMXA 5I4WA 2G4QA 1TEWA 1HENA 4LYOA 1OUAA 1LJJA 4M4OA 2F4AA 193LA 5KXYA 4DT3A 2H9KA 4TSBA 1GB9A 4CGEA 1GE0A 1NDMC 1LMCA 4LT2A 5KXTA 1UIBA 2MEHA 5LVHA 4ZIXA 2HU3A 4QGZA 2YBNA 4B4EA 4NG1A 4H92A 3B0IA 4WM4A 3W6EA 1YKXX 1UCOA 5ILFA 4OOTA 4WOAA 1P2CC 4NWHA 4G49A 1UIDA 1PS5A 4B1AA 1OUFA 1UIHA 1B5UA 4KXIA 1B7OA 2ZIKA 1DKKA 4OWAA 4HJVA 1IO5A 5IDDA 4B49A 4DC4A 1GF3A 1TAYA 1GDWA 3BKHA 1T3PA 2YDGA 3W3EA 4XJDA 5KJ9A 2HTXA 1IP1A 1OUCA 3N9AA 4RLNA 1JITA 3AW6A 2YBLA 3A91A 3CT1A 5LA8A 5LXWA 1B0DA 4HJZA 3CSQA 1W08A 4PJ2C 1IVMA 5T3FA 1GE3A 2YBJA 5LVGA 1HMKA 1BHZA 4HTKA 1I56A 154LA 5FEKA 1REXA 2BQJA 3TXHA 1FBIX 1LYZA 1JKCA 1V7SA 2W1LA 1IP5A 1JTTL 4H8XA 4KL7A 4MSTA 1NMMA 2BPUA 1YL0X 4UWUA 3TXIA 2BQBA 3FI7A 2DKVA 2Z37A 3ATNA 4BADA 1QUTA 3WW6A 2G4PA 1C45A 5AMYA 1IOCA 1GBYA 4WL6A 5DN5A 5LVKA 1D6PA 4G4BA 4Z46A 1PZYA 4MR1A 1LMNA 3TXKA 2MEGA 2LYMA 1TBYA 1UICA 4WLXA 4N5RA 4NHSA 4TSCA 3D9AC 4W94A 1KXWA 3P4ZA 1JKDA 1IORA 1W6ZA 5I53A 4GCBA 1Z55A 1B5VA 4WG7A 1AT5A 1B5YA 4OOOA 4DDCA 2DQDY 3WMKA 1SLYA 2G4NA 3A6CY 5B1GA 1C08C 3ZVQB 1GAZA 1B7NA 2ZQ3A 4GLAA 3WPJA 1B9OA 5L3IA 1LMOA 4CFPA 3G3BB 1JKBA 1LZDA 3WUMA 4CFOA 1LZEA 2HECA 3W6FA 1UA6Y 3LHMA 2BQLA 1XGPC 5EBHA 1JSEA 4YF2A 1A4VA 3P64A 1VATA 1LSAA 3CSZA 1HFYA 3A93A 3TXBA 4DDAA 4LYZA 5KXOA 4B4JA 1RFPA 1WQRA 1ZVYB 3OJPA 1UIFA 1LSGA 3FE0A 4H9CA 3WUAA 3AZ4A 1KXXA 2BQDA 2BQFA 4P2EA 4GCDA 4EOFA 1HSXA 1B7PA 4XJIA 1OUDA 1LOZA 1LZNA 2B5ZA 4OWBA 2I6ZA 2W1YA 5APEA 4YM8A 4ET9A 5HNCA 3GXRA 5I54A 1HMLA 3T36A 1J1OY 1NQIA 4NGJA 2EIZC 3TXDA 1IC7Y 1JPOA 3W6AA 4ZFPA 5F9UA 4LFXA 3WULA 3N9EA 2XBSA 1IWUA 4E3UA 5LVJA 1G7JC 1GFJA 1BVXA 3IWRA 1EQEA 4N8ZA 1FLWA 3TXJA 5FSTA 5LAFA 4G4HA 4C3WA 4Z41A 1GBWA 2IFFY 5KXWA 1WVVA 2BQIA 4GCEA 1UACY 1LZAA 1GBOA 4PRUA 1JTOL 1UIGA 1LYSA 2FYCA 3W6CA 5DL9A 3WVYA 2DQGY 2N5ZA 1IWZA 5LINA 3A96A 1YKYX 4NHIA 4ET8A 5KXKA 2VB1A 4HJYA 1E8LA 1IP2A 1HNLA 1HF4A 1IWVA 1I1ZA 4XJFA 208LA 3QE8A 5B59A 4YENA 1REMA 3A6BY 2GV0A 4RDSA 1IIZA 1CJ9A 2W1MA 4CHXA 4TUNA 2MEIA 1HEPA 1N4FA 1VDPA 2Y8PA 1XFPL 1LCNA 3AZ6A 1GBXA 1AKIA 1QSAA 1AT6A 2BQKA 2LYZA 1LSPA 2AUBA 3AW7A 4NGKA 1XEJA 1HSWA 3EBAB 2CDSA 3W6DA 1IR8A 1BGIA 1B7QA 1JSFA 5F16A 4DD0A 4CJ2A 1LJHA 1QSWA 1GB7A 4H94A 3LYOA 4N1CC 4A7DA 5FDJA 1UIAA 1BWIA 2IHLA 4LFPA 1OQMA 1FLYA 3EO5A 1JTPL 1UIEA 4HV2A 3WXTA 4B0DA 5C6LA 1LSZA 1C7PA 2HU1A 1BB5A 1IWYA 1GEVA 2C8PA 3ULRA 1F10A 3WU7A 2YBHA 5F9XA 1LPIA 1DPXA 1LMTA 3QNGA 1LSCA 1HHLA 4YOPA 4NGLA 4WM2A 1NBYC 5B1FA 4IATA 1IX0A 3LZTA 1D9UA 3M18B 1NKHA 1OUHA 3TMVA 3E3DA 2ZIJA 3P66A 1YAOA 2Z19A 1CJ8A 1JISA 1IP7A 4C5FA 5DM9A 1B2KA 3G3AB 1JWRA 3ZEKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
246LA 2C8OA 2I25L 2H9JA 2B6WA 4W54A 1L07A 3LYTA 2MECA 1C6JA 2XJWA 3EXDA 162LA 3A3RX 1L47A 1UBZA 1LI2A 3WU9A 2BQMA 4N0JA 2YSSC 5L3HA 3K3TA 4H8ZA 4HTNA 3DKEX 2B6YA 1LI3A 1IC4Y 1LJEA 2Z12A 132LA 2B75A 2YVBA 5FELA 245LA 4GRVA 5HMJA 2ZQ4A 4UWNA 4W96A 3WXUA 4H9FA 3A94A 5LYTA 1C6GA 235LA 4HTQA 3HFMY 1CKCA 3CDOA 3T6UA 2DQJY 4ARQB 3C83A 142LA 3HH5A 2BQCA 3BKVA 2EKSC 3W6BA 2ZYPA 1LYEA 4WLDA 5KY1A 1L19A 4E97A 2NWDX 1F6SA 4DD9A 2LZMA 1ZURA 3A3QA 4LZTA 1RI8B 4YXAC 137LA 4I0CA 3TXEA 222LA 249LA 3JR6A 5LVIA 1P5CA 1KXYA 1REZA 241LA 2LZTA 4FJRA 1PQDA 4ANRA 4H91A 1JJ0A 1EQ4A 1CU3A 4PRQA 118LA 4H9HA 134LA 2BAAA 1O23A 2B6ZA 1WTNA 2XQOA 1D3NA 3DN0A 1LSDA 3LYZA 5APCA 4GN4A 1GFKA 2FYDA 1AZFA 1YAQA 1IP3A 1G1VA 1GAYA 5B05A 1YILA 5HLLA 1UC0A 3HBEX 174LA 1F0WA 3C8SA 3C8RA 4H9EA 1NBZC 2DQAA 4XADA 4NGIA 2RBRA 4NSJA 4ARMB 4QEQA 4I7NA 1BB3A 207LA 4YXCA 4WG1A 4J0LA 1QSQA 1FKVA 4EKQA 140LA 1LJKA 4H8YA 135LA 1QUDA 2RB2X 4QY9A 4BAPA 5C6JA 1A2YC 1EQ5A 1CKDA 2D4KA 2PC2A 3TXFA 4DJHA 216LA 1GF7A 1L34A 3HBDA 1C43A 5FHWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1BQL Y;  4OWH A;  1BWH A;  5IHG A;  1REY A;  2BQH A;  2HEA A;  2C8O A;  1XGR C;  2I25 L;  2H9J A;  1GB0 A;  2W1X A;  3RT5 X;  4YEM A;  4I8S A;  6LYZ A;  3LN2 A;  5II3 A;  3LYT A;  4U3X B;  5LA5 A;  2ZNW Y;  1FN5 A;  2MEC A;  1XGQ C;  2XJW A;  4M6D A;  2YBI A;  3IJV A;  2D91 A;  3EXD A;  1TCY A;  1CKH A;  2DQC Y;  2I26 L;  2FBB A;  4NHP A;  5KKJ A;  3A3R X;  1GF4 A;  4HPI A;  4BS7 A;  3WPL A;  1UBZ A;  2WAR A;  1GB6 A;  1IP6 A;  4J1A A;  1IY3 A;  2BQM A;  4N0J A;  2YSS C;  5L3H A;  2BLY A;  1LSY A;  3WU9 A;  1OUJ A;  1LHH A;  3K3T A;  4H8Z A;  4HTN A;  4LT3 A;  3A34 A;  1IC4 Y;  1LJE A;  1VAU A;  2Z12 A;  1B7L A;  1IWX A;  1GF9 A;  1HEL A;  1V7T A;  1NF5 A;  3AJN A;  4WLY A;  4DD7 A;  132L A;  1YQV Y;  1LJF A;  4OWC A;  4LT1 A;  4Z98 A;  1GWD A;  2DQF C;  1LSM A;  4H9B A;  4EMN A;  1GF0 A;  2Z2F A;  1LYO A;  1I20 A;  2YVB A;  4NY5 A;  4Z3M A;  8LYZ A;  5FEL A;  2X0A A;  1GD6 A;  2DBT A;  4L41 A;  4ZEE A;  1FLQ A;  5HMJ A;  4ETD A;  3N9C A;  1HEO A;  5A3Z A;  2ZQ4 A;  2BQN A;  1WQO A;  4UWN A; 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 5LAF A;  4G4H A;  4C3W A;  4Z41 A;  1GBW A;  2IFF Y;  5KXW A;  1WVV A;  2BQI A;  4GCE A;  1UAC Y;  1LZA A;  1GBO A;  4PRU A;  1JTO L;  1UIG A;  1LYS A;  2FYC A;  3W6C A;  5DL9 A;  3WVY A;  2DQG Y;  2N5Z A;  1IWZ A;  5LIN A;  3A96 A;  1YKY X;  4NHI A;  4ET8 A;  5KXK A;  2VB1 A;  4HJY A;  1E8L A;  1IP2 A;  1HNL A;  1HF4 A;  1IWV A;  1I1Z A;  4XJF A;  208L A;  3QE8 A;  5B59 A;  4YEN A;  1REM A;  3A6B Y;  2GV0 A;  4RDS A;  1IIZ A;  1CJ9 A;  2W1M A;  4CHX A;  4TUN A;  2MEI A;  1HEP A;  1N4F A;  1VDP A;  2Y8P A;  1XFP L;  1LCN A;  3AZ6 A;  1GBX A;  1AKI A;  1QSA A;  1AT6 A;  2BQK A;  2LYZ A;  1LSP A;  2AUB A;  3AW7 A;  4NGK A;  1XEJ A;  1HSW A;  3EBA B;  2CDS A;  3W6D A;  1IR8 A;  1BGI A;  1B7Q A;  1JSF A;  5F16 A;  4DD0 A;  4CJ2 A;  1LJH A;  1QSW A;  1GB7 A;  4H94 A;  3LYO A;  4N1C C;  4A7D A;  5FDJ A;  1UIA A;  1BWI A;  2IHL A;  4LFP A;  1OQM A;  1FLY A;  3EO5 A;  1JTP L;  1UIE A;  4HV2 A;  3WXT A;  4B0D A;  5C6L A;  1LSZ A;  1C7P A;  2HU1 A;  1BB5 A;  1IWY A;  1GEV A;  2C8P A;  3ULR A;  1F10 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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