4DD1A

Eval processed hewl, cisplatin aqueous paratone
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Structural studies of the effect that dimethyl sulfoxide (DMSO) has on cisplatin and carboplatin binding to histidine in a protein.
pubmed doi rcsb
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dd1A00
2MEDA 1JEFA 1O23A 4HP0A 3WUNA 3CSRA 5DN5A 1W08A 1D6PA 1GE4A 2F4GA 4N1CC 4H94A 1N4FA 1D9UA 1LHLA 4OOOA 2Z19A 4ML7A 3TXFA 3CT1A 2YBMA 3SP3A 2A7FA 1JTTL 2GV0A 1MLCE 1WQRA 2X0AA 4LGKA 5HMJA 1BB7A 2H5ZA 1A2YC 2YVBA 3CQLA 194LA 3J4GA 4WM5A 4OWAA 3W6FA 1QDTA 4XADA 1LZYA 4ZIXA 5KKJA 2BLYA 5KXLA 5A3EA 1G7MC 133LA 1B0DA 2FYDA 4E3UA 2ZYCA 1HMKA 1HNLA 1AT6A 4KT3A 4XJHA 2HEEA 1LJ3A 4NGIA 5E9RA 1F6RA 2D6BA 5DL9A 4ETEA 3WU7A 1GBXA 1LPIA 3CT0A 4CJ2A 1LMNA 1IOSA 2EPEA 1XGPC 1OUFA 4NHQA 1C7PA 1RI8B 4WLDA 1GF6A 1HELA 1IEEA 1LZ4A 2WARA 4XJBA 4NEBA 3ATNA 2BQJA 3M3UA 9LYZA 1XSFA 4G49A 1LSAA 2DKVA 3AGHA 3HFMY 1LHMA 3WW6A 2XBSA 3N9CA 4WMGA 4LT0A 1LZ5A 4G4BA 3A3RX 1GFJA 2D4IA 5HQ1A 5KXSA 2D4KA 4GLVA 1OUGA 1JJ1A 1IO5A 4GLAA 4TWSA 1BB3A 4Z41A 4IJ4A 4LT2A 4DD2A 4HJZA 1LZ6A 4G4HA 4MSTA 5LXWA 1KXYA 1LMCA 207LA 1VDTA 4H9FA 2HEDA 4LFXA 4NFVA 4XN6A 1MELL 4MCKA 1BB4A 1UACY 5KXRA 1GF4A 2YSSC 3P64A 2G4NA 1D0KA 2BQLA 1LZTA 3WULA 5K7OA 1LHKA 3P65A 4A7DA 3ZVQB 1HFXA 1GEZA 3TXEA 1NHEA 4NSHA 5F9UA 1QTEA 2BQOA 1LHIA 1DZBX 1LYSA 4YF2A 1GF3A 5B59A 1HENA 1TAYA 5KKIA 154LA 1FLQA 4RDSA 1UIGA 5B06A 1A4VA 3A90A 2DQFC 1OUHA 132LA 1LZGA 4PJ2C 5ILCA 4H93A 1YAMA 1LJEA 1LZ9A 1IIZA 2BQDA 4H91A 1B7OA 2FBDA 2BQNA 2Z18A 4WG1A 1HC0A 2HU3A 4B0DA 1JHLA 4NWEA 4GN3A 3K3TA 4YM8A 1NMMA 1REZA 1LSNA 1WQQA 2XBRA 2W1XA 1V7SA 1IP4A 1QIOA 5B1FA 5B05A 3LYOA 5C6JA 1GXV2 1HEQA 5I53A 1XEKA 4GCDA 1GAZA 4NG1A 4ANRA 3A95A 1WQNA 4G9SA 1IOCA 1GB3A 4RW2A 3WL2A 2F4AA 3EMSA 1IWTA 4PPOA 5E4PA 2HU1A 1RJCB 1B7NA 1CKHA 1GFHA 3W6AA 2DQHY 3B0OA 1LSDA 4EOFA 3AZ4A 5DN4A 1LZCA 1GFRA 4FDYA 4WL6A 2BQHA 4WLYA 1F0WA 4KL7A 4GN5C 1LMOA 3EXDA 5IHGA 3CT5A 5KJ9A 1FLUA 4GN4A 5F81A 1DKJA 4BS7A 1GF0A 4NG8A 1GB0A 1RFPA 4YENA 2BQIA 2MEHA 1FDLY 5LVHA 1CKCA 1OUJA 3AW6A 4N0JA 4D9ZA 3A6BY 4HV2A 3A3QA 1UICA 4WLXA 1LZ1A 1T3PA 4W96A 1DI3A 2DQGY 4LYZA 3RNXA 4B4EA 2ZIJA 1W6ZA 1LYZA 2BQEA 2HTXA 1CJ6A 1G7LC 1IP5A 1JPOA 2YDGA 4WLTA 1JSEA 2C8PA 4IATA 1GBYA 4GCBA 2W1MA 2ZYPA 1GB5A 4DDAA 7LYZA 1Z55A 4NHPA 1GD6A 1REMA 5IDDA 4Z98A 2HEFA 3VWOA 3HBEX 5L9JA 1VDQA 2F30A 3CB7A 3FI7A 4PGJB 4B1AA 5KXOA 2W1LA 3RU5A 2EIZC 2EQLA 1GWDA 4WO6A 1GXXA 1GF5A 1B7RA 4NSIA 1LMAA 1PZYA 3OJPA 1GE3A 4QEQA 4BAPA 4DD7A 1UIFA 2BQAA 3A94A 4H8ZA 4CHXA 5F14A 2H9JA 1LJGA 1QSAA 4BADA 1DI5A 1GF7A 1QTKA 2BPUA 5LVJA 1J1PY 5L3IA 1HFZA 4QY9A 4YEMA 1FKVA 5KXMA 1UIEA 2IFFY 1B7SA 5KXXA 1IC5Y 1LJIA 135LA 5IELA 1LMPA 5KXTA 4C3WA 4BAFA 4HV1A 1GFEA 4GCFA 4ZFPA 3A93A 4WM3A 5LYTA 1NBZC 1GBOA 1NWGA 3E3DA 5LA8A 1CJ9A 4C5FA 1OQMA 2Z38A 1OUEA 1IP1A 1D0MA 3B6LA 3HBHA 4J7VA 5FDJA 5LAFA 1NQIA 1XGRC 1C45A 1OUIA 4Z46A 2CDSA 1QQYA 3TXHA 1GB7A 1IWUA 4NHTA 4WM6A 1GB8A 1DKKA 1WQOA 2Z2FA 1BB5A 3WPKA 4WG7A 3M18B 2EKSC 1WQPA 2ZQ4A 5II3A 5M1YA 2F2NA 4MR1A 5HNLA 1F6SA 1XEIA 1LJHA 2MEFA 4WM1A 1GB2A 1GFUA 4ZEEA 5KXNA 1B5VA 1HEOA 1HEMA 1LSFA 3A6CY 3W6EA 3OK0A 5D5CA 2Z39A 1LAAA 1GF8A 1C46A 4KPMA 1IP6A 1LZRA 1LJNA 3KAMA 5FEKA 3TXBA 1B5YA 1CKFA 4TSBA 4NGKA 3WH1A 1IR7A 1CNSA 1JSFA 2ZILA 3B0IA 3TMVA 1JJ0A 4I0CA 1GB9A 1IR9A 1B7LA 3A91A 1IC4Y 5APDA 4DD1A 1IWVA 3ZEKA 1YQVY 1IP7A 4LYMA 4R0FA 4NSJA 1G7JC 4UWNA 5EBHA 3BKVA 1REYA 4TSCA 4XYYA 4H9AA 1GFTA 2LHMA 1C08C 1CKDA 1AM7A 1NKHA 1TBYA 5C6LA 5I4WA 1JTOL 1VAUA 5APFA 4NHIA 1FBIX 1LSYA 1LCNA 1J1XY 1IOTA 8LYZA 1LZSA 1HSXA 4H9IA 2MEBA 4XENA 1F10A 1LSPA 1WTNA 1YKZX 4GCCA 1GAYA 4PHIA 4TUNA 1LHHA 1TCYA 2MEGA 3B72A 4XJFA 5D5FA 4LZTA 4H92A 2HECA 2Q0MX 1HEPA 1LJJA 4PRUA 5DM9A 4GCEA 3WPJA 1ZMYL 1G7HC 4NSGA 4ETAA 1I1ZA 3LZTA 2DQIY 4UWVA 1WTMA 3LZ2A 4LYTA 3T36A 2D4JA 3D9AC 1VEDA 3LHMA 5JENB 3AZ6A 1UC0A 1B5WA 4RLMA 4FJRA 4AXTA 1UUZC 1IP3A 4NHSA 5I4YA 1JJ3A 1YIKA 1INUA 1J1OY 4NGJA 4M6DA 4KXIA 4CFOA 1DPXA 2IHLA 1JKDA 1GPQC 3MGWA 1REXA 208LA 1YAOA 2C8OA 1IORA 4IASA 3WUMA 1YANA 2LZ2A 2BAAA 1LYYA 1GHLA 4TX7A 1OUDA 2BLXA 1JKBA 1HFYA 1AT5A 1EQEA 1LTMA 5FCPA 5I4XA 3LYZA 5LVGA 1GDWA 4PRQA 4LFPA 4HSFA 3IJVA 4LYCA 2DQDY 1B7PA 1IY4A 3CSQA 3TXDA 3AGIA 1DPWA 193LA 1D0LA 3T6UA 1NDGC 1GDXA 1B5ZA 1JKCA 3WVXA 1NDMC 2AUBA 2LZTA 1GFVA 1LMTA 2N5ZA 3J6KA 1P2CC 5F16A 1SLYA 1JUGA 4ETBA 4B4JA 1AZFA 1EQ4A 4II8A 1KXXA 4WL7A 4RW1A 2LYMA 2LYOA 1IWXA 3ULRA 4NGLA 3W6CA 3RW8A 1IWYA 4H9BA 2I25L 1IY3A 4AGAA 4NWHA 1ZVHL 1TDYA 3AJNA 4DDBA 1C43A 1DXJA 1IWWA 3A67Y 3QE8A 4ETDA 1UIAA 2BQKA 4M4OA 1LSZA 1KIRC 3P66A 4I8SA 2ZWBA 5HLLA 1IC7Y 1XFPL 1YILA 3GXKA 1IX0A 1LMQA 2MEEA 2MEAA 5LAGA 5LIOA 1BGIA 4N1EI 1LZDA 3RZ4A 1C10A 5FHWA 4H8XA 1B7QA 1LZBA 3W6BA 4DWXA 3A8ZA 4N9RA 1D6QA 1JISA 3A96A 4NIJA 1B2KA 4H9HA 3WVYA 1LJ4A 4TTDA 2CWIA 3AZ7A 2BQMA 3WMKA 1QDRA 1LYOA 1PS5A 4LT3A 1GFKA 4HPIA 4N8ZA 5FELA 153LA 1T6VL 5ILFA 4DYGA 4P2EA 3AB6A 1BVXA 4LT1A 3W3EA 1LSBA 2PC2A 1HEWA 5KXYA 1HF4A 1LSCA 4EMNA 5HNCA 1B7MA 4DDCA 1VDSA 1LZ8A 2HUBA 2Z12A 2XTHA 3G3AB 5LYMA 1HMLA 3BKHA 1IVMA 5I5QA 2Y8PA 2FBBA 1BQLY 4WM2A 4ET8A 1UIDA 3AGGG 1NF5A 3FE0A 1VDPA 4NGOA 4L41A 3TMWA 1E8LA 2DQAA 1JTPL 1RE2A 4HTNA 5C6IA 1UIHA 1EQ5A 4LYBA 4CFPA 4HPEA 5F9XA 3WXUA 1IP2A 4X3BA 5FSTA 1KIQC 5I54A 4H8YA 2H9KA 2YBJA 1OUBA 3F6ZA 4XJDA 3RT5X 1QSWA 4WM4A 1HERA 1I56A 2BQFA 1YAQA 4G4CA 1LSEA 3CSZA 3IJUA 1I20A 4H9EA 2I26L 2ZQ3A 3ZVQA 1FN5A 1BB6A 1V7TA 4W94A 1WQMA 4YOPA 4HTKA 3LYMA 4YEOA 1LKSA 4B4IA 4DD3A 1CJ7A 2YBIA 4OW1A 4R6CA 2A7DA 4OWBA 3WU9A 2BQBA 3QY4A 1KIPC 1CJ8A 1GFGA 4HTQA 1ALCA 1GB6A 1DQJC 3P4ZA 4N5RA 3AW7A 4WOAA 1YL1X 2CJLA 1QUTA 1H6MA 3TXGA 1KXWA 1WVUA 1TEWA 1GBWA 1LJFA 5LYZA 1BHZA 2FYCA 4XJIA 3ATOA 5L3HA 2LYZA 1CKGA 2I6ZA 2ZNXY 5APEA 3TMXA 4OWHA 1GE1A 2DQJY 4QGZA 1AKIA 2DQEY 1VATA 2NWDX 1VFBC 2XJWA 1XGQC 1JKAA 3TXIA 5KY1A 5LA5A 4RLNA 1UIBA 3W6DA 2YBHA 1HSWA 1LSGA 4NGZA 1GFAA 5HMVA 1XEJA 1ZVYB 3LYTA 2RSCA 3B0KA 1EL1A 4OOTA 1OUAA 5B1GA 5LVKA 3TXKA 5AMYA 2HEBA 4CGEA 5KXWA 4HJYA 5LINA 4DD0A 5B07A 1FLYA 3N9AA 4QDNA 5J7CA 2DBTA 4OWCA 1H87A 1SQ2L 3AZ5A 4NGWA 1ZV5L 3N9EA 1GE2A 1GBSA 1NBYC 3EBAB 3A34A 4H9CA 4XJGA 3D3DA 2CGIA 1B5XA 4NGYA 1UA6Y 4Z3MA 3WYHA 2G4PA 2MECA 3WU8A 5LVIA 4J0LA 4ET9A 1FKQA 2ZIKA 2W1YA 5A3ZA 4HJVA 1G7IC 5KXPA 1B9OA 1LSMA 3P68A 2DQCY 1YKYX 3TXJA 3WXTA 4UWUA 5APCA 3A92A 2YBLA 3EO5A 1LKRA 4H1PA 4H90A 4DD9A 4U3XB 2BQCA 1LZEA 1YL0X 1LJKA 1BWIA 1LZNA 3G3BB 1UBZA 4LYOA 1IR8A 5DLAA 4J1BA 1XGTC 3TMUA 3AYQA 3WPLA 1YKXX 2HEAA 1JIYA 1DI4A 1IOQA 1BVKC 4ETCA 2Z37A 4DT3A 1QUSA 1YAPA 1IWZA 1GBZA 5KXKA 1OUCA 1GEVA 2MEIA 3QNGA 4NGVA 3GXRA 2D91A 2G4QA 1XGUC 3WW5A 6LYTA 4O34A 1GE0A 1HHLA 1UCOA 4DC4A 4OWEA 134LA 1JWRA 1LHJA 1WVVA 4NY5A 2B5ZA 3IWRA 4WO9A 5KXZA 3WUAA 3LN2A 1YROA 1BWJA 1B5UA 1LOZA 1LZAA 2Z2EA 4B49A 4J1AA 1BWHA 1OP9B 2ZNWY 2YBNA 6LYZA 5T3FA 1RCMA 2BQGA 1GF9A 1FLWA 1JITA 2VB1A 3HBDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WUNA 1OWZA 2B6ZA 2F4GA 4H94A 218LA 1LHLA 2Z19A 1JTTL 2X0AA 2YVBA 3J4GA 1A2YC 4XADA 1LZYA 5A3EA 1QTDA 255LA 1L54A 2FYDA 2ZYCA 1HNLA 2HEEA 1T6HA 252LA 1GBXA 3L2XA 2EPEA 3CDOA 4K5YA 2WARA 4NEBA 4G49A 3WW6A 1CV6A 3OE6A 1C6DA 5HQ1A 4GLVA 1OUGA 145LA 4Z41A 1BB3A 209LA 5LXWA 207LA 4XN6A 1L69A 1UACY 3P64A 2OE7X 1LZTA 3WULA 3C82A 1LHKA 1GEZA 1NHEA 1DZBX 4YF2A 5KKIA 1UIGA 3HU9A 1A4VA 2DQFC 4H93A 1LZ9A 1NHBA 2BQDA 4B0DA 192LA 2QARC 4LDEA 1L43A 1LSNA 2XBRA 1QIOA 4GCDA 1GAZA 1IOCA 1IWTA 5E4PA 2B70A 3W6AA 1LSDA 1LWKA 1LZCA 4FDYA 1F0WA 3VW7A 3V2WA 3EXDA 3CT5A 4ARQA 1P64A 1GF0A 3NY9A 1GB0A 1RFPA 2MEHA 1L31A 1FDLY 1QUGA 1C6HA 4D9ZA 4HV2A 3A3QA 1UICA 1LZ1A 1W6ZA 1SWZA 161LA 2YDGA 4LDLA 2C8PA 1GBYA 3G3WA 4B1AA 4EPFA 4WO6A 1C60A 1QSQA 3OJPA 4W52A 128LA 3A94A 4BADA 4I7NA 228LA 1QTKA 157LA 3HTDA 1FKVA 1UIEA 1IC5Y 1L72A 221LA 4GCFA 1G0GA 5LYTA 1L33A 4S0WA 1NWGA 5LA8A 211LA 1L87A 1NQIA 5LAFA 1XGRC 1P6YA 3F8VA 1QQYA 1DYDA 1BB5A 241LA 1WQPA 112LA 5M1YA 1QTZA 1B5VA 1HEMA 1L01A 1L63A 3OK0A 5D5CA 1L45A 1LZRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2MED A;  1JEF A;  1O23 A;  4HP0 A;  3WUN A;  3CSR A;  5DN5 A;  1W08 A;  1D6P A;  1GE4 A;  2F4G A;  4N1C C;  4H94 A;  1N4F A;  1D9U A;  1LHL A;  4OOO A;  2Z19 A;  4ML7 A;  3TXF A;  3CT1 A;  2YBM A;  3SP3 A;  2A7F A;  1JTT L;  2GV0 A;  1MLC E;  1WQR A;  2X0A A;  4LGK A;  5HMJ A;  1BB7 A;  2H5Z A;  1A2Y C;  2YVB A;  3CQL A;  194L A;  3J4G A;  4WM5 A;  4OWA A;  3W6F A;  1QDT A;  4XAD A;  1LZY A;  4ZIX A;  5KKJ A;  2BLY A;  5KXL A;  5A3E A;  1G7M C;  133L A;  1B0D A;  2FYD A;  4E3U A;  2ZYC A;  1HMK A;  1HNL A;  1AT6 A;  4KT3 A;  4XJH A;  2HEE A;  1LJ3 A;  4NGI A;  5E9R A;  1F6R A;  2D6B A;  5DL9 A;  4ETE A;  3WU7 A;  1GBX A;  1LPI A;  3CT0 A;  4CJ2 A;  1LMN A;  1IOS A;  2EPE A;  1XGP C;  1OUF A;  4NHQ A;  1C7P A;  1RI8 B;  4WLD A;  1GF6 A;  1HEL A;  1IEE A;  1LZ4 A;  2WAR A;  4XJB A;  4NEB A;  3ATN A;  2BQJ A;  3M3U A;  9LYZ A;  1XSF A;  4G49 A;  1LSA A;  2DKV A;  3AGH A;  3HFM Y;  1LHM A;  3WW6 A;  2XBS A;  3N9C A;  4WMG A;  4LT0 A;  1LZ5 A;  4G4B A;  3A3R X;  1GFJ A;  2D4I A;  5HQ1 A;  5KXS A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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